|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000353_pilon:20068..27846- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_011865 ID=XLOC_011865|Name=XLOC_011865|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7779bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000353_pilon:20068..27846- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAGGTTTGATTGCAAAGAAAAATCAAGCCAAACTTGCTGAAAAAAT
ATACAGGTCAACGCATTGTAAGTATTATAAATTATGATATGAACCACTGC
GACGAGTATGCAAAATTTGAGCAATTTTTCTTAGAACCCAATACGTCATT
TACAATTGTTGTAAAAGTGATGTATTTTCAAGATCTTGTATAGGTACAGA
TTCTGAATTGCATATTGAAGGTTCTTTGCCACAATATCAAAAGTTACAGC
CATCAATGACAAAGTTATAGTTATTGGTTCTTACTGGACACTGAGAACTA
TGCCTCCACCTCCTACCTCGTTGCTATTTTACAGTGATTTTTACATGTGA
AAAAAACGATATGGAATCTGACTCAGGCCTGGCGGAAGCGGGGAGAATGG
AGAGACTTCAGCCTCCCCACTTTTGAGCAAATGAGATTTTTTTCTCAAAT
TCCTAGCGGCTTTTATCTCATTTTGAGCCTTCAGTCTCCCCTTTAATGGT
TGTTCCGCCGGGCCTTTGATTAAAAGCAAAGATTTGCTTCAGCTGGCCTA
TATCAAATAGTTAAATCATAGTTGAATCATATAAGATTTGACGATTATTT
TGACCAATAAGCTTTTGTCCTCTTGTTTATATATGCCTTTGATATTCAAC
CCTCATTTGATTCAAAATATCTCCTATATCCCCTATAAACTTCTCTTCAT
TGCATTCTTTTCTTCCTGTATTTTCCTTTAGTTTCAAGATGTGAAGTTGA
AAATCTGCTAAATGTCTTTCGAGTTCATGGAGCGAATCAGAAAACTAATA
AAATGGATCGAACTAAATTTCGAACAGTTCTTCACAACACCTTTCAAATG
ACCGATGATATTCTAATGGATAGAAGTAAGAAAATGCTGTTTTCTTGACC
CTACTAGGCTTTTAACGGCCCTTCAAAACTAGGGGGCGGGGCAGTTCCTG
GACCACCCCTTAACTTTTGATCTAGTAGGCCTTTTTGGATGAAATTTGGC
ACACAAGATCCTTGTCATATAAGGTGATTTTTGACAAAAATGATGGGTCA
CTCATGCCCAGAGTGAGCGAAAACCAAAAAATTCCTTTGTTCTTATAAAT
AGCTATTGTATTCTACCAAAAGCTTTAGAAAACAGTTCCCTGAGTCTAAA
ATGCTTATTTTATCCTAAATATTCAATAAATTACGGTTTAAACGGTATAT
TTGACATGAAAAATAAATTTGTATTGGAAATGTGTCAATTTTTGTGACAC
CTTAATGTCAGAAATGTCATCATGCTCAAGGTTTGAGAATTTTTAGGTGT
CGAACTTTTTTTATTTTGAAGCTAAATAAAAATTTCATGCCAAAAGCTCT
ATTATTTCTTGAGCTATTACCATTAATTTGACCCCCGAACAGAAACAGCC
CCCCCCCCTTGTACGAATAGGGTTTTAACCCTTGTTAACCTTTCGAGCAT
CTTCCTAGCATCTTTGGGGGAGGGCTCGAGGCCCCCCTTAAATCTCAAGA
TTGACAGTTGCTATGACGTTGAAATTATGACCAGTGATAGATATTGACTA
TTTAAGACAGTATACGAGCTTGTATCATCAATACCTAACACTTGTCAATT
GCATCTTCCAATCACTAGGTACAGTATCCTTGGGCTGTTTAGGCAAAACA
GGGCAATTTTGGGTCGGTCTGTAAAATACACGGTACCAACAGGTGCCAAA
AAGTTTACCCTCTGCCCCGTCACGTGGAGTTGCCTCACAAAATTAGAGCA
AAAGAAATAAAGTAAAAGAAAATTAGAGAGCACGGATCCTATTGTATTCG
TATTGTCGGTATTTTCAAAAGACGATGGCGTCATCACATGACAATGACGT
CATCAATGATGCCAAAATTTTCACCAAAGATGACAATTTATATTTGGTGC
ACACTTTCAAAATTTCAAGTCAATTGAATAAAGATTTCAAAAGTTATCGA
AAATTTTTATTTTGGGAGGGGACCTCTTTGCCTCGAACAAGTTTTCTCGT
CCCTTCAGTTAATGATACCTTATAAATTGATCTCCATAACTCTAAATTTC
CACTATTCGAACCAATTTGTGTGCCGTGCAGGTTCGAGTTTTGAAGACTC
CACTGTATTTCTGAAATCTGCAAAATCGTAAAACCCTACACGAAACTTTT
AAGTCATACATGGTAGTCTAGCAAGCTAGACGACTAATTTATACATAGTA
GAAATAAAGCAAAAAATAGTGAATGGAACAATTTTAGTCGTCTAGAAACC
TTTGTGCATTAACTCCAAACAAAAGAAAAGTGTCAATATTGCAATTATAA
TTTTTTCCTGCTCAAAATAATTCTTGAGAAAAAAAATATGTGTGGATTTG
TGTATTGAAAGTTTTTCATTTGAGTTGATTTCGTTTTGAGAGTTTGTTGT
TGCTTGATAAATTGTTTTCTCGCTACGCAAGTTTCTGCGTAGCTAGCCCC
TGTATCTATAAGGCTGGAACACCGGATTCTTCCAGTCGTTTATACAAACT
AAATCCCGTATTATTATTATTATTAGTATTGGTATTATTAGTATTACACG
CATTATAAACGACTCCAGTCTACATACATGGTGGAAAGTAACCTTAAAGT
TATTTTTTTAAAGTCTTTAAAGTCAGCCGTATTTAAATACCTTTTTCATA
AGGAAGTAAGTGTTGTTTTTTTCTTCGTGAAAATTATATTAAGGAAAGAG
CGAGAACGTTTGATAAAATCTCAAATTTATTGCCAAATTGTGGCCCGTGA
CCTCCCCCCCCCTTGATTTCAGCTTCCTTGTGTTTTGGGATCCAGCATTT
GGAGTTATAATAGCCTTCTATTAAAAGGAATTTTCAATGTCAAAAAGAGT
TAATAATAATTTTTAAAATGTATTTTTTTCGCATGGTATGACACGTTTTT
TTAATAAGAACATCCAACAATTTTGAAGCCTTCGGATGTTCTTAACTTTT
TGAGTTTTAAGCCTAAAAATGTTCATAACATCTTCTTATTTTCACCATTT
TGTCAGCATTTTCGGCCATTTTTCTAAGAAATCGGGTATTTTAGAACCCG
CGAAGCCTTAAAATGTTCTTAACTTTTTGGACCTACCTCGGAGGTCCTAT
AAATTAACCGATGTCCGTCCGTCCGTCCGTCCGTCCGTCTGTTACCAACT
TTTCTCAGGATTGGCTTATTAGTTTTTTCTGATTTTTTGCTCAAAGATGC
GTATCAACAATGCCCAAAACATGGTCGAGTCCGATTTTGAGAAAAAAATT
TTTCCGGCCGAAAATGCCGCAAATATGCCGGAAATCGCCGTTTTTCTAGG
TTTTCATTGGACTTTTTCCTTATAATTAGTTGTTTTTTCATTCAAAAACA
TTATTGATAGCAATGCCCACCGTCAAGCATGTTTCAATTTTCAATAAAAT
TGATTTTTGAAGCCGGAACTATTTAAAAATCGCCGGAACAACCTATTTTC
GCCGGAAAGACAGTATTTCTTGAATTTCTCGAGCTGTACTTTATATTTCT
TTATGAAATTATCCACACTTATGCAAAATGACAATACCTAAAATGTGACG
GAGCCCGATTTTCGATAAACATTTTTTTCCGGCCGAAAATGCCGGAAATA
TGCCGGAAAAACTGTTTTTTTGGCATTTTCTCGAGATTTTATCATTAGTT
TTTTCAGATTTTTTGCTCAAAGATGCATATTAACAATGCCCAAAACATGG
TCGAGTCCGATTTTTGAGAAAGATTTTTTTCCGGCCGAAAATGCCGGAAA
TATACCGGAATCGCCGTTTTGTAGATTTTCATTTGACTTTGTTCTAATAT
TTCTTTGTTTTTTTCACACAAAAACATTATTGATAACAATGCCCACCATC
AAGCATGATTCATTTGTCGATAAAACTGATTTTTGCAACCGGAACTTTCT
ATTTCTTTTTTTCTCTACTCCCCTTCCCTCTCCCCTATCAACAATCAATG
ATGAAATTAATACGTTATGCACTTTTGCTAAACGCTATGTTTTCTGACTG
ATTGTTTTCATTTTTCTCTTTATTGGTATCTAACTTTCATCATCAGGTAG
GTCCATTCAGCATGTAGCTTGTTCTTTATATATTGGCCATTGAAGCCTTA
TGTTTTTATATAGTTTGTTCTTATAAAAAACGTGTAATTGTTTAATTTTT
TATTACTCAGTCTTCAGAGCTTTCGATACAGACAACGACAGCAATATAAG
TATGGAAGAGTGGATTATGGGACTTTCTGTTTTCCTTCGTGGAACACTCG
ATGAACAAGCTCGCTGTGAGTGAATTTATTTGTATTATGTAGCTATCTTT
GATTTGAACATTTACACCCCCTTCTAACCCCCGGGTGTTTGTTTCCAACT
GGAAAAATTGGCCAAAATATCGTCCCCGATGGAAAATTATCCTCAAATTT
TTGTACCCACTGAAAATGACAATCAATCAAATAAACCAATCCTCACTACA
AAATATTTATTATATTTTCCATCCCCACTGAATTTTCTGACTCAAAAACA
AAAGAATTGAAATCCCCTCTTATAAAGATATGGAATTATCAATCCTCGTC
GAGTTTCAGTCCCTTATTTTTATCCCAAACTGGCTGAAAAAATTCTACCG
GGTCTGTGAGAAGGGGGTGTTATTATCTTTTTCATAGTTTGAACTACAAT
GATGATCAATCTGCTTTATTAAAAAATCTCCAACCTCCTTTAGATAGAAC
CTTTCAATTTATGAATCTATCAATAAATATGACTATTTGAGACTTTTCTT
AAGGAGTGGCATTTTCTCGAGGTTACACTGTCTGAAAAAAAGCGAAGCCG
AAAGTTTTCCCAAGGTGTAGAGCAAGAGGTAGGGGTCAGTAAAGCTCTGT
GTCTTCTGTACTTTGTACCTTTAAAGGGGAAATTTTACCAAATTACAATT
AACTTAAGTCATTATTAGGGTGTCATTTTAGAGTGGTAAACAATCAAAAC
AAAGCGGAAGTTTTCAAGTTGGAAGATCTTAAAGGGACAAAAAAGTATTG
ACAAAATTTGTAAACAAACCGTTTGTCAAAATAAAAAATGAAACCAAATA
TGGCTGATTTTGATTGTTTCAATTGTTTTACAAGTTTGTTTTGGACACGT
TATTTTAATTGTTCTCTTTAATGACACGTGGTTCGCGCAATGTGTACATT
TTACTACTTTTATGTCCCTTTAATCCTAACAGACCCCCTTCCGCACTATG
CATGACTTCGATTCCTTTGTAATTCAAAAATGTATGTTTTTTTCTATTCG
CCAGATTGTTTCAATGTTTATGATTTGAATTCAGACGGTTACATAACACG
TGAAGAGATGTATCATATGCTTAAACATTCGCTCATTAAGGTAGGTATAA
AACCCCCCTCAAACCGTGGTGCACTGGTAGAGCATCCGGCTACGGTTCGC
AAGGTTGTGGGTTCAACCCCCAGCCGGGTCATACCAAAGATTCACAAAAT
GGTACTTGATACCTCTCTGCTTGATGCTCAACAATTGGGAGAAGGATCAA
GGGTAAGTGGATAAATCCAGGGAAAGGAGTGGCGCCCTCCCCTACCTTCA
GGTAGATAGCTATCGAAAGAGGAGCCTTCGGGTCGCTTAGGACTGCGGGC
GCAGACTTATAAAACCCCCTTGTAAACCTTCTCTTAAATATTCGTTCATT
AATGCTGGTTGCCCACTGGAAAAAAAAAGTTTGTCGCAAAAAATAAATCC
AGATATATGTCTGGAATTAAAAATCTATTGTTTTCTTTGCGATAAAGAGG
AAAAAATAAGAAATAAAAAAGGCTTACGGACCCCGCTTAAACATTCGCTC
GTTACTGTAAGGTCTGTTACTGTAAGGTATGTTAAACCCCCTTGTCTCAG
ACCAGTTTGGAGCATCTAGATCCACTGGAAAAATATCAATCTAAAATTCG
TCCCCTTTAAGAAAAATCCCCTGGAACTTTATCTATATTGGAAAATGTTC
GCTTAACTTTGTGGATGATACTAAAGTCTGTCCAGATATAATTGGCAGTG
GAAACAAGAATGCCTGTAACTTTTGATAGTCAAATATAATTATGGAAATA
TTTTTTGCTTGTTTTAGAGAATCAAAAGCGCTATATTTGAATGTATTTTT
GCTTAAAAAATTCGCGATTTTTAGTGGTCAAATTTGAGATTGCAAAAATT
GAGCTTTTTTTCTACTTATGCTATAACGTTCATTTTTACATCAGTGGTAG
TTCAACCTTAGGTTAATAAGTTTGTTAAATTTCAAGGCAAACAGAAAAGT
CCTTCGGAAGATATGGGACCCGAAATACCCCTTGGTAGCACTTTTCTGTG
AAATATCAAATCTCCAACTTATTACTAAAAACGGGGGTAGTGATATGATT
GATAAAACAGTTTTTCGATCATAACACATTTTACGATCTTTTTAATGACC
TCATAGCCAAACTGTGTTTAGTGTTTTGGGAATTAGCAAAGTTCTTTAAT
GACTTTGAAATAACAAAGGCAATATAAGTTCATGCTTATCTTTTCAATAA
AAACAATTATACTGTGATTTCACTTCGTTTCGAAATAATCAATGATACCA
ATAATACCAATGTACCAACACTTAACATTTTCCAACTTTTAATTGCACTG
TTCAAAAAAGATCCCCCGTTTTTAGTAATAAGTTGGAGATTTGATATTTC
ACAGAAAAGTGCTACCAAGGGGTATTTCGGGTCCCATATCTTCCGAAGGA
CTTTTCTGTTTGCCTTGAAATTTAACAAACTTATTAACCTAAGGTTGAAC
TACCACTGATGTAAAAATGAACGTTATAGCATAAGTAGAAAAAAAGCTCA
ATTTTTGCAATCTCAAATTTGACCACTAAAAATCGCGAATTTTTTAACCA
AAAATACATTCAAATATAGCGCTTTTGATTCTCTAAAACAAGCAAAAAAT
ATTTCCATAATTATATTTGACTATCAAAAGTTACAGGCATTCTTGTTTCC
ACTGCCAATTATATCTGGACAGACTTTAAAAAGTACTTCATGCACAGAAG
AAGTACAATTGAAAACTTTAAAAAACTTGAAAACTGAAAAATGGTAGAAA
ATGGTTATTTTTTTAGAAACTTTTCCCCGGTAAAGATCACTGAAATCGCC
ACCCAATGAAACAAGTGATCGTCCATCACCAACGTTATTTATTTGAAAGT
TCTAATATTACCTTTGGGAAGAAATTTTGGCGAGAATTTAATTTGGCGAA
TTTTAGATTTTTCTAATTCGCCAAAATTAGTTTTCTTAAGGTATATGTAA
ACAGCCTCTCTCTAAGGTTTTTCTGTTGAACCCCTTGACTTGAAAAGGTA
TTTGATGTCTCTCTATCTGTTTAATGCTCGGTATATATTGATGCTTTCCC
TTTCTTCGGGTAAACAGCTAGTTGAAATCAGATACATTCCGTCTTTAAAA
ATTATTAATACTAGTATTCAACGAATTCTTAAAAGAATCTGAACCCATTC
GTTGCGCAAAGCCCCGTCTCGGTCGGAAAAAAGAATTTGTTACGACCACT
CCCCCTACCGCTTCCCCGAGGATTTGAATAAACTGTAGACGATCCTATTG
TCTACACAAACTCTACCGCCACTATTTTTTTTGCGAAAACCGCCCTGACG
CCCTGACTCTGCGCATATACATTTTCCCGCGTTTACTGACTCTCTAAATA
AACTGTCGTGGGTACTGTTAATTAATGGTCTTAGAAATCTTTTTCTGTGT
TTCTATTCAGCAACCAACAGAAGAGGACCCTGATGAAGGGGTTAAAGACC
TGGTCGAAATCATTCTCAAGAAAATGGTA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000353_pilon:20068..27846- >XLOC_011865 ID=XLOC_011865|Name=XLOC_011865|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=942bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000353_pilon:20068..27846- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAGGTTTGATTGCAAAGAAAAATCAAGCCAAACTTGCTGAAAAAAT
ATACAGGTCAACGCATTATGGCAGGTTTGATTGCAAAGAAAAATCAAGCC
AAACTTGCTGAAAAAATATACAGGTCAACGCATTTTTCAAGATGTGAAGT
TGAAAATCTGCTAAATGTCTTTCGAGTTCATGGAGCGAATCAGAAAACTA
ATAAAATGGATCGAACTAAATTTCGAACAGTTCTTCACAACACCTTTCAA
ATGACCGATGATATTCTAATGGATAGAATTTCAAGATGTGAAGTTGAAAA
TCTGCTAAATGTCTTTCGAGTTCATGGAGCGAATCAGAAAACTAATAAAA
TGGATCGAACTAAATTTCGAACAGTTCTTCACAACACCTTTCAAATGACC
GATGATATTCTAATGGATAGAATCTTCAGAGCTTTCGATACAGACAACGA
CAGCAATATAAGTATGGAAGAGTGGATTATGGGACTTTCTGTTTTCCTTC
GTGGAACACTCGATGAACAAGCTCGCTTCTTCAGAGCTTTCGATACAGAC
AACGACAGCAATATAAGTATGGAAGAGTGGATTATGGGACTTTCTGTTTT
CCTTCGTGGAACACTCGATGAACAAGCTCGCTATTGTTTCAATGTTTATG
ATTTGAATTCAGACGGTTACATAACACGTGAAGAGATGTATCATATGCTT
AAACATTCGCTCATTAAGATTGTTTCAATGTTTATGATTTGAATTCAGAC
GGTTACATAACACGTGAAGAGATGTATCATATGCTTAAACATTCGCTCAT
TAAGCAACCAACAGAAGAGGACCCTGATGAAGGGGTTAAAGACCTGGTCG
AAATCATTCTCAAGAAAATGGTACAACCAACAGAAGAGGACCCTGATGAA
GGGGTTAAAGACCTGGTCGAAATCATTCTCAAGAAAATGGTA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000353_pilon | genome | sc0000353_pilon:20068..27846 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 403-471:70 |
| Aaloc | 319-402:2524 |
| Aaloc | 214-315:3618 |
| Aaloc | 70-210:7047 |
| Aaloc | 1-66:7780 |
|
