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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000366_pilon:263486..270880- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_011833 ID=XLOC_011833|Name=XLOC_011833|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7395bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000366_pilon:263486..270880- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGTTTGGCAAACCTATAAACAACATTATAATGAGGGCAAAAGACATTCT
ACTATCATCACTTTTAGTGGTATTCCTGCTGAATTCGGTGATTGCAAATG
AGGTAACTTTCGTCGTTTGTGTTGTACTCCCGGGGGGGGGTACTAGGACA
AAATGGGCTACGGGGATGCGCCGCTGGTCAGGGTACCTTTCTTGACCTCC
ATGAGTTCCAGCTAGGGTTGCAAAAACACCAAAATAGAAAAAACAGTTCC
TCATGGCTGCCTTTTTGGGAAAATTAGAACATTTTAGAAAATTTTGGAAT
TTCAGTCCCATTCAGGGTCACTTTTTTCGCAAATTTCGGCAAAAATTTTG
AAAAAACAAGTCCCACGTAGGGTCCATTTTTCGAACCTCAGTGGAGCACC
CCCGTCGGTCAGCAAGGGTAGTACCCCCCGGGGTTGTACTGTTTACCTAC
AGTTGACTCTCGCTAATTTAAACTTGAACGGGAAATTTTATTTGTTTGGA
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ATAGGGAACTGGGAATTAATTCGTATTGAAGAAAGATTCGAGTCATAGAA
GTTCGAATAAGCGAGAGTCCATTGTTTGTCCGAAGATTCATCTTGATAAA
ACGCATTTATAATCACCAATTCCTTTTATCTAAGCTCTTTGACATTTTTT
TTTCAGTATTTAGAACCTGTTGAATTTCTTAGTTTTAACTAAAAAGGCGA
ATAAAATTGATACACCCTTATAATGGGCTGTTCTATTAAAAATTCATACA
GGGAGTGGACGAACCTTTTCAAGTCAAAAAAGAAATATTGAAAATGCGTC
ATACCCCCTGGAAAATTTTGCAAAAATACCATTGAAAAAATTCTTTTCAT
ACCTTAAAGTTAGGGTGGACGAACTAAAATCAGTCTTTTACCCCTGGAAA
TTTTAGAGTAACTTTTTACCCACTTGAAAAAATGAAAAGACATCCCCTGG
GAGTTTTTCTCGGATTACCCTCTAGAAAGGTTCGTCCACCCCCTGTGGGT
ATAAAATGGCTACTGGTTTTTGCATCATTTACATTTACGTTCTCTCAAGT
TTTAAACGTGTTACTGACCATAATAAACATACATGAGGAAAATTTTGCGT
TTTTTAATAAATTCTTCTGTTTTCAGGAGGTTACAACAGCGGAGTGCGGC
AAATCGTTGACTTGTTATAAGCAACCAAACGATGCAACGTGTACCTCAAG
TGATACTTGTAATGTTCTAGTTATGTGGAAACATAATAAAAATGCAAATA
CCATTGATGTGATTTTGGCTACAAAAGCAGACAATGCTTACATCGGCTGG
GCGCAAAACGAGAATTTAACTCTTTCAAATGCTATGGTAAAAATCCAAGT
TATTTTTTCAGCTTTTAAATTAAGTCCATTTATGGCATCTTCATTTGGCA
ATGAAATATGTATATTCACAATATACCATACCATAAATCCAGTCAAAAAG
TTTTAAAAAGTTTATTTGTACCTTTTGGTTGATACGTTTACACGTTGCTT
TTTCTTTTCACGGTGTTAGGAACCTTCTTCAATTGTTTAACTTCTTGCGG
GTTAGATTGCTTTAGTTATCAAATTTAAATGAACCATGAACCTAAAATTT
AATTCTTATAAATTTTAAAGCTACTTTCAAACTAACGGACACAAGAAAAG
GTTAATATTTCATTCTTTTTCTACTTTAGGCAGGAGGTAAAGGTGTTGTT
TGTTACTTCATGGGATCAAAGGTCAAACTGGAAAGCTTTCATACAACCAA
CAACGAGCCCCCGAGCCTCAAACCCCTACCTACAGTGTACAATTTGAACA
ATGCTTATAAAACATCTAAAAACAGTGTAATTTGTAAATTCGATCGTAAA
GTTACAGTCGAAACTACCAGCCAGTCTTTAATGTATGATCTTACTGATGG
TTTACATCAAATGTATGCTTTTGGTAGCCTAAACGATGCTGGTATTGCCA
TACATTACCATGGTTTGAAAGGAGGAGATGCGTACATTACAAGTGAAAAA
GTCGATTTGACACCACCAGAAATGGTAGAGGTATGTTACTCAAATTCTTA
AAGGAAAACTTTATGTCTACCATAGTTGTAATGTAACCATAATTCTTTTA
AAACAAAATAAACTCTTCTTCATTTCAAAATCTATCCCAAAAAAATAAAA
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ACCGAGTTACACATTAATTGATTGTACATGTAACCTATAACGAGTTATGG
AATTTTAACATTTTTTGAAATAATTTTCCAAATGTCTGTCATAGGACTTT
TTAATATGACTAGACGCTATATATGCATTTCATCCGCTCTTAAATACGGT
TCCTTTGCAGGAAGTTGGGACAGACGAGTGTGGCAAATCATTGACTTGTT
ATAAACAACCAAATGATGCAACGTGTACCTCAAGTGATACTTGTAATGTT
CTAGTTACTTGGAAACATAATAAAAATGCAAATACCATTGATGTGACTTT
GGCTACAAAAGCAGATAATGCTTACATTAGTTGGGCGCAAACTAATCCAT
TAAACCCTACAGCAAAAATGGTATTCTTATTTTTAATCTACTTGTTTTCA
TTCATTTTAAGATAATTTGATCAGCAAAAAGGGAAAATCAGTGTTAATAC
CAATTTATAGCAAGTATAATTTCATTTTTTTTATTTTTAAGGCCGGAGCG
AAAGGAGTTGTTTGTTATTTCGACGGCTCTACTGTCAAACTTGAAAGTTT
TCAAACTACCAAGAACACAAGACCTACGTTACAAGCAACACCCACTGGAT
ACACTTTGAACGGAGCCCACAAAACGAATAAAAACAGTATCATTTGTAAA
TTCACGCGAATCGTAACAGTCCCAAGTGGAAGTGAGAATTTAATGTATGA
TGTTACAAACGGACTTTATCAATTATATGCCCATGGCGGTTTCAAAGATG
ATTTGATTGAATACCATGGTCTGAATGGTGCAGCTTTTTCCACAGATGAG
AAGGTTGATTTGACTTCGCCAGAAAAAACAGTACAGGTAAGGACATTCTT
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AATTTATCTTCCAAATTTTGACAGGCTGAAGTTACGACAGACGAATGTGG
CAAATCGTTGACTTGTTATAAACAACCAAATGATGCAACGTGTACCTCAA
GTGATACTTGTAATATTCTAGTTATGTGGAAACATAATAAAAATGCAAAT
ACCATTGATGTGACTTTGGCTACAAAAGCAGATAATGCATACATTAGTTG
GGCGCAAACTAATCCATTAAACCCTACAGCAAAAATGGTATTCTTATTTT
TAATCTACTTTTTTTCATTAATTTTAAGATAATTTGATCAGCAAAAAGGG
AAAATCAGTGTTAATACCAATTTATAGCAAGTATAATTTCATTTTTTTTA
TTTTTAAGGCCGGAGCGAAAGGAGTTGTTTGTTATTTCGACGGCTCTACT
GTCAAACTTGAAAGTTTTCAAACTACCAAGAACACAAGACCTACGTTACA
AGCAACACCCACTGGATATACTTTGAACGGAGCCCACAAAACGAGTAAAA
ACAGTATTATTTGTAAATTCACTCGAATTGTAACAGTACCAAGTGGAAGT
GAGAATTTAATGTATGATATTACAGATGGACTTTATCAATTATATGCACA
TGGTGGTTTTAAAGATGATTTGATTGAATACCATGGTCTAAATGGTGCAG
CTTTTTCCACAGATGAGAAGGTTGATTTGACTTCGCCGAAAAAATGAACT
CAGAAAATCAGTACGGTAAGGACATTCTTACTCTACTTACTGAACGATAA
AAACATTATTTCCAAACATTTTAACTTCCAATTTATCTTTCAAATTCGGA
CAGGCTGAAGTTACGACAGACGAATGTGGCAAATCGTTGACTTGTTATAA
GCAACCAAATGATGCAACGTGTACCTCAAGTGATACTTGTAATGTTCTAG
TTACTTGGAAACATAATAAAAATGCAAATACCATTGATGTGACTTTGGCT
ACAAAAGCAGACAATGCTTACATTAGTTGGGCGCAAACTAATCCATTAAA
CCCTACAACAAAAATGGTATTCTTATTTTTAGTCTACATGTTTTCATTCA
TTTTAAGATAATTTAATCAGCAAAAAGGGAAAATCAGTGTTAATACCAAT
TTATAGCAAGTATAATTTTTTTTTTTTTGAGGCCGGAGCGAAAGGAGTTG
TTTGTTATTTCGACGGTTCCGCTGTCAAATTCGAAAGTTTTCAAACTACC
AAGAACACAAGACCTACGTTACAAGCAACACCCACTGGATATACTTTGAA
CGGAGCCCACAAAACGAGTGAAAACAGTATTATTTGTAAATTCACTCGAA
TTGTAACAGTACCAAGTGGAAGTGAGAATTTAATGTATGATATTACAGAT
GGACTTTATCAATTATATGCACATGGTGGTTTTAAAGATGATTTGATTGA
ATACCATGGTCTGAATGGTGCAGCTTTTTCCACAGATGAGAAGGTTGATT
TGACTTCGCCAGAAAAATCAGCAGAGGTAAGGACATTCTTACTCTACTTA
CTGAACGATAAAAACATTATTTCCAAACATTATAACTTCCAACTTATCTT
CCAAATTCTGACAGGCTGAAGTTACGACAGACGAATGTGGCAAATCGTTG
ACTTGTTATAAACAACCAAATGATGCAACGTGTACCTCAAGTGATACTTG
TAATGTTCTAGTTACTTGGAAACATAATAAAAATGCAAATACCATTGATG
TGACTTTGGCTACAAAAGCAGACAATGCTTACATTAGTTGGGCGCAAACT
AATCCATTAAACCCTACAGCAAAAATGGTATTCTTATTTTTAATCTACTT
GTTTTCATTCATTTTAAGATAATTTGATCAGCAAAAAGGGAAAATTAGTG
TTAATACCAATTTATAGCAAGTATAATTTCATTTTTTTTTATTTTTAAGG
CCGGAGCGAAAGGGGTTGTTTGTTATTTCGACGGCTCTACTGTCAAACTC
GAAAGTTTTCAAACTACCAAGAACACAAGACCTACGTTACAAGCAACACC
CACTGGATACAATTTGAACGGAGCCCACAAAACGAATAAAAACAGTATCA
TTTGTAAATTCACTCGAATTGTAACAGTACCAAGTGGAAGTGAGAATTTA
ATGTATGATATTACAGATGAACTTTATCAATTATATGCCCATGGTGGTTT
TAAAGATGATTTGATTGAATACCATGGTCTAAATGGTGCAGCTTTTTCCA
CAGATGAGAAGGTTGATTTGACTTCGCCAGAAAAATCAGCAGAGGTAAGG
ACATTCTTACTCTACTTACTGAACGATAAAAACATTATTTCCAAACATTT
TAACTTCCAACTTATCTTCCAAATTCTGACAGGCTGAAGTTACGACAGAC
GAATGTGGCAAATCGTTGACTTGTTATAAGCAACCAAATGATGCAACGTG
TACCTCAAGTGATACTTGTAATGTTCTAGTTATGTGGAAACATGATAAAA
GTGCAAATACCATTGATGTGACTTTGGCTACAAAAGCAGACAATGCATAC
ATTAGTTGGGCGCAAACAGATCCTTTAAATCCTACAGCAAAGATGGTATA
TATGATCATTTGTAGTTTTTTCTTTAGATGTTTAAGAGTTTCTTTGAAAT
GTAATGAGAAATGCAATTTCCCTTATTCTTAGGCTCATTTTTATTTCCGA
AATTCTTTCAATGTTTTGTAGACTGGAGCAAAAGGAGTTGTGTGTTACTT
TGATGGATCAACTGTCAAACTCGAAAGTTTCCAAACTACCAAGAACACGA
GACCTACGTTACAAGCAACACCTACTGGATACACTTTGAACGGAGCCCAC
AAAACGAATAAAAACAGTATCATTTGTAAATTGACTCGAATTGTAACAGT
GCCAAGTGGAAGTGAGAATTTAATGTATGATATTACAGATGGACTTTATC
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CTGAATGGTGCAGCTTTTTCCACAGATGAGAAGGTTGATTTGACTTCGCC
AGAAAAATCAGTTGAGGTAAGGGTATTGCAAAATCTTACTTCACTTGCCG
AAGGATAAAACATTTATTCCAAATCTTTTAGATCCTAAAATTTGAGCCTG
GTTTGCAACCCTATAAATCACCTAGAAACCTTAAACTCCTCAGTTTCAAT
ATTTTTATGGAAAATCTTTTTGACTCCTTCATGAAGTCTTTAATCTGCAA
TTTTATCTTCCAAATTCTGACAGGATGAAGTTACGACAACGGAGTGTGGC
AAATCATTGACTTGTTATAAACAACCAAATGATGCAACGTGTACCTCAAG
TGATACTTGTGATGTTCTAGTTATGTGGAAACATGATGAAAATGCAAATA
CCATTGATGTAACTTTGACTACAAAAGCAGACAATGCATACATTAGTTGG
GCGCAAACTGATCCTTTAAATCCTACAGCAAAGATGGTATGTATGATCAT
TTGTATTTTTTTCTTTAGATGTTTAAGAGTTTCTTTGAAATGTAATGAGA
AATGCAATTTCCCTTATTCTTAGGCTCATTTTTATTTCCGAAATTCTTTC
AATGTTTTGTAGACTGGAGCAAAAGGAGTTGTGTGTTACTTTGATGGATC
AACTGTCAAACTCGAAAGTTTCCAAACTACCAAGAACACGAGACCTACGT
TGCAAGCAACACCTACTGGATACACTTTGAACGGAGCCCACAAAACGAAT
AAAAACAGTATCATTTGTAAATTGACTCGAATTGTAACAGTGCCAATTGG
AAGTGAGAATTTAATGTATGATATTACAGATGGACTTTATCAATTATATG
CCCATGGTGGTTTTAAAGATGATTTGATTGAATACCATGGTCTGAATGGT
GCAGCTTTTTTCACAGATGAGAAGGTTGATTTGACTTCGCCAGAAAAATC
AGTTGAGGTAAGAGTATTGCAAAATCTTACTTCACTTGCCGAAGGATAAA
ACATTTATTCCAAATCTTTTAGATCCTAAAATTTGAGCCTGGTTTGCAAC
CCTATAAATCACCTAGAAACCTTAAACTCCTCAGTTTCATTGTTTAATTA
TAGAAAATCTTTTTGACTCGTTCATGAAGTCTTTGATCTGCAATTTTATC
TTTCAAATTCTGACAGGCTGAAGTTACGACAACGGAGTGTGGCAAATCGT
TGACTTGTTATAAACAACCAAATGATGCAACGTGTACCTCAAGTGATACT
TGTAATGTTCTAGTTACGTGGAAACATGATAAAAATGCAAATACC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000366_pilon:263486..270880- >XLOC_011833 ID=XLOC_011833|Name=XLOC_011833|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=6042bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000366_pilon:263486..270880- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGTTTGGCAAACCTATAAACAACATTATAATGAGGGCAAAAGACATTCT ACTATCATCACTTTTAGTGGTATTCCTGCTGAATTCGGTGATTGCAAATG AGATGTTTGGCAAACCTATAAACAACATTATAATGAGGGCAAAAGACATT CTACTATCATCACTTTTAGTGGTATTCCTGCTGAATTCGGTGATTGCAAA TGAGGAGGTTACAACAGCGGAGTGCGGCAAATCGTTGACTTGTTATAAGC AACCAAACGATGCAACGTGTACCTCAAGTGATACTTGTAATGTTCTAGTT ATGTGGAAACATAATAAAAATGCAAATACCATTGATGTGATTTTGGCTAC AAAAGCAGACAATGCTTACATCGGCTGGGCGCAAAACGAGAATTTAACTC TTTCAAATGCTATGGAGGTTACAACAGCGGAGTGCGGCAAATCGTTGACT TGTTATAAGCAACCAAACGATGCAACGTGTACCTCAAGTGATACTTGTAA TGTTCTAGTTATGTGGAAACATAATAAAAATGCAAATACCATTGATGTGA TTTTGGCTACAAAAGCAGACAATGCTTACATCGGCTGGGCGCAAAACGAG AATTTAACTCTTTCAAATGCTATGGCAGGAGGTAAAGGTGTTGTTTGTTA CTTCATGGGATCAAAGGTCAAACTGGAAAGCTTTCATACAACCAACAACG AGCCCCCGAGCCTCAAACCCCTACCTACAGTGTACAATTTGAACAATGCT TATAAAACATCTAAAAACAGTGTAATTTGTAAATTCGATCGTAAAGTTAC AGTCGAAACTACCAGCCAGTCTTTAATGTATGATCTTACTGATGGTTTAC ATCAAATGTATGCTTTTGGTAGCCTAAACGATGCTGGTATTGCCATACAT TACCATGGTTTGAAAGGAGGAGATGCGTACATTACAAGTGAAAAAGTCGA TTTGACACCACCAGAAATGGTAGAGGCAGGAGGTAAAGGTGTTGTTTGTT ACTTCATGGGATCAAAGGTCAAACTGGAAAGCTTTCATACAACCAACAAC GAGCCCCCGAGCCTCAAACCCCTACCTACAGTGTACAATTTGAACAATGC TTATAAAACATCTAAAAACAGTGTAATTTGTAAATTCGATCGTAAAGTTA CAGTCGAAACTACCAGCCAGTCTTTAATGTATGATCTTACTGATGGTTTA CATCAAATGTATGCTTTTGGTAGCCTAAACGATGCTGGTATTGCCATACA TTACCATGGTTTGAAAGGAGGAGATGCGTACATTACAAGTGAAAAAGTCG ATTTGACACCACCAGAAATGGTAGAGGAAGTTGGGACAGACGAGTGTGGC AAATCATTGACTTGTTATAAACAACCAAATGATGCAACGTGTACCTCAAG TGATACTTGTAATGTTCTAGTTACTTGGAAACATAATAAAAATGCAAATA CCATTGATGTGACTTTGGCTACAAAAGCAGATAATGCTTACATTAGTTGG GCGCAAACTAATCCATTAAACCCTACAGCAAAAATGGAAGTTGGGACAGA 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GGTGGTTTTAAAGATGATTTGATTGAATACCATGGTCTAAATGGTGCAGC TTTTTCCACAGATGAGAAGGTTGATTTGACTTCGCCAGAAAAATCAGCAG AGGCTGAAGTTACGACAGACGAATGTGGCAAATCGTTGACTTGTTATAAG CAACCAAATGATGCAACGTGTACCTCAAGTGATACTTGTAATGTTCTAGT TATGTGGAAACATGATAAAAGTGCAAATACCATTGATGTGACTTTGGCTA CAAAAGCAGACAATGCATACATTAGTTGGGCGCAAACAGATCCTTTAAAT CCTACAGCAAAGATGGCTGAAGTTACGACAGACGAATGTGGCAAATCGTT GACTTGTTATAAGCAACCAAATGATGCAACGTGTACCTCAAGTGATACTT GTAATGTTCTAGTTATGTGGAAACATGATAAAAGTGCAAATACCATTGAT GTGACTTTGGCTACAAAAGCAGACAATGCATACATTAGTTGGGCGCAAAC AGATCCTTTAAATCCTACAGCAAAGATGACTGGAGCAAAAGGAGTTGTGT GTTACTTTGATGGATCAACTGTCAAACTCGAAAGTTTCCAAACTACCAAG AACACGAGACCTACGTTACAAGCAACACCTACTGGATACACTTTGAACGG AGCCCACAAAACGAATAAAAACAGTATCATTTGTAAATTGACTCGAATTG TAACAGTGCCAAGTGGAAGTGAGAATTTAATGTATGATATTACAGATGGA CTTTATCAATTATATGCCCATGGTGGTTTTAAAGATGATTTGATTGAATA CCATGGTCTGAATGGTGCAGCTTTTTCCACAGATGAGAAGGTTGATTTGA CTTCGCCAGAAAAATCAGTTGAGACTGGAGCAAAAGGAGTTGTGTGTTAC TTTGATGGATCAACTGTCAAACTCGAAAGTTTCCAAACTACCAAGAACAC 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ATGATTTGATTGAATACCATGGTCTGAATGGTGCAGCTTTTTTCACAGAT GAGAAGGTTGATTTGACTTCGCCAGAAAAATCAGTTGAGACTGGAGCAAA AGGAGTTGTGTGTTACTTTGATGGATCAACTGTCAAACTCGAAAGTTTCC AAACTACCAAGAACACGAGACCTACGTTGCAAGCAACACCTACTGGATAC ACTTTGAACGGAGCCCACAAAACGAATAAAAACAGTATCATTTGTAAATT GACTCGAATTGTAACAGTGCCAATTGGAAGTGAGAATTTAATGTATGATA TTACAGATGGACTTTATCAATTATATGCCCATGGTGGTTTTAAAGATGAT TTGATTGAATACCATGGTCTGAATGGTGCAGCTTTTTTCACAGATGAGAA GGTTGATTTGACTTCGCCAGAAAAATCAGTTGAGGCTGAAGTTACGACAA CGGAGTGTGGCAAATCGTTGACTTGTTATAAACAACCAAATGATGCAACG TGTACCTCAAGTGATACTTGTAATGTTCTAGTTACGTGGAAACATGATAA AAATGCAAATACCGCTGAAGTTACGACAACGGAGTGTGGCAAATCGTTGA CTTGTTATAAACAACCAAATGATGCAACGTGTACCTCAAGTGATACTTGT AATGTTCTAGTTACGTGGAAACATGATAAAAATGCAAATACC
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000366_pilon | genome | sc0000366_pilon:263486..270880 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 2893-3021:130 |
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| Aaloc | 1432-1776:2347 |
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| Aaloc | 874-1218:4655 |
| Aaloc | 664-873:4986 |
| Aaloc | 313-663:5667 |
| Aaloc | 103-312:6220 |
| Aaloc | 1-102:7396 |
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