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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000366_pilon:250726..254880- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_011832 ID=XLOC_011832|Name=XLOC_011832|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4155bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000366_pilon:250726..254880- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGTATTCTTATGATTGTTTCATGGGTTATTTTTGCAACCATTGGTATTTT
CATGGCTCGCTACATGAAACAAGCAACCAAAGATCAAAAGATCAATGGAA
AACAAGCGTGGTTCCCAGTAAGATTTCTGTTACTGTAGGCAATTTCACAG
TCGAAATGAATCATGGGTAATCAGAACAGTTTCCCGTTGGTTAGATGCTA
AAAAATATCCAAAAATTTAGACCAACAGAAGCGTATTGGTCCTGATTACG
CATGATTCATTTTGACTGTGAAATGCCCTATTGCTCTAAAATAAAAAGTT
TTTAAGCATTGCCCACTCTAAAGCATCAGCTGGCATCCTCTTGTGGCTTC
GTTGTATTTATACAGTGCAGTTTCTTTAGCTCGAATGTCTCCTTAACTCA
ACAAGGTCCCTTTCAGTTAACAATTCCCTATAAACATTACTCCATAGTTG
AACAAATTTGTATTCCCCGTGCTTGTTCGAGTTATGGAGACTCCACTTTA
TTACCTTCCGTTTTATGACCTACCAGAGTTCTACAATTCAGACTTCATCA
GGATAGCATTATCTACTTCGGATGTAAAAGAACGAAATGATCATTAACTT
TCGATTCTTTTCTTCTTTCTCAGATTCATCAAATGTTTATGTTATTGTGT
GTCATCTGTTTTCTGATTGGTTTCATCTTGATCTTTGTGGAAAAAGCAGG
CTGGGTCGTAAGTAGTAGTACTCTTTTTTCCCGGGAATTTTATTCTTGCC
ATAACCTAAGAACAAATTTAAGAACATCAAAAAATGTCAGAATATTATTA
AAAAAACACTGATTTCAAGCCCATTTAAGTCAATAAATTAAGCTTAGTAT
TCAGAATATTTTATTACTAATTGATTTTAAAATTTTGTTTTGTGATTTTA
GGAATCGGCAGGAACACACGGACAACTTGGGCTGGTTGTCGTTATTCTAG
GATTAATACAGGTTTGAAAGTTTTTGAAATTTTATGAGCTCATCGAATTT
AAGGTGTCTCTTCATGATCTTTGAGAGATGATGAGTTTTTAGAAATATAG
ATAGTTTTTTTTAGATCGGAGAGGAAAAAGAGAAAAAACTGCTAGTGTCA
AGCAAGTACCCATTTTCCGGTTAGTGTTGGCCATCTCGTTCAGAATATGG
CCCCAGTGTATTGTACACGAAGATCGGTTTGCTAACAATTTTACCTTTGA
TATTTCAGCCACTGATGGCAATGGTCAGATGTGCACCAGATAGTGAAAAG
TATGTGATGTTAAGATTTTTAAATATTAGTTGGTCTCAAATTTAGATCTC
AAAGAACGTATAAAACAATTGGATTGGTTTGTGTGGGATTATCTTGATTT
CAGTTAAGTGCTCTCAGGCTCTGCGAAAAGGGCTTTCAAAAGGGCCTTTC
TTTCTAAGAGCCATTTTTTAAGGCTTAGAGGTTTGGGACGCATATAGCTA
AGCCTAGTACGCCTCCCTGGAATTTGACCTACTCATTGAATTCTTCTTTT
TTCAGGCGTTTCATTTTCAACTGGTTCCATCGAACTTTTGGAATGTCAGC
ATGGATTATCGGAGGTTTGTTTTTCACCTCTAGTAGTTTAGTTAATTCTT
CCTCTAGTAACATCTCGCACTTGATCGATGATGGTGAGGAAAATATCTTT
ATTTATATTTAAATCTGTCAAGTGCTAAGCATCTAAAAAGGCAATAATCA
TTCATGATCAATTGTTAAGGATGTATCAAATAAAATTCATTTATCTACAA
TCATCAACATAATATTTGAGACAAAGGGGATTTCCCTGCGAAATTTTAAA
CACCACAAATGATTTTTAAGCGCTATAAACTACAGTTTTAACTCTGAGTT
TTAACTCTGAGTTTTAACTCTGAGTTTTAACTCTGAGTTTTAACTCTGAG
TTTTAACTCTGAGTTTTAACTCTGAGTTTTAACTCTGAGTTTTAACTCTG
AGTTTTAACTCTGAGTTTTAACTCTGAGTTTTAACTCTGAGTTTTAACTC
TGAGTTTTAACTCTGAGTTTTAACTCTGAGTTTTAACTCTGAGTTTTAAC
TCTGAGTTTTAACTCTGAGTTTTAGCATTTGCTCGAATAAGGCTCGGAAT
ATAGCCTAAAAGCCACCGAACCCCTCTAAAATCGAAATATTCAATGAAAG
AAAGTGGAAGTGCTAAAATAGCAATTCTCGCCCGAACTTTAAATTCTGAA
AAACGTTAAAGTACATTAAAATGTCAATATATTTCGACCATGATTGTAGC
ACTAAGAATTCACAATTTTCTTCAACTTTTTACCCCTAAAGATATTAAAG
GCAAGTTTCGTAATGAAATATTTTAAAATTTATCATTAAACTATCCAAAA
TTTATCTTGTCCTTTCTCCAGGTGTATGTATCATATTTGCATTCGATAAG
ATTTTACAAGAAAGTTACACAGAGATGTTGGTATTCATGATAGTAGTCGT
TGTTTTGTTCATTTTATTGGACATCGTTATTTGTGCTTCCTCGAAGAATT
CCGCCTCAGCTGATGGTAAGGTGTCTTTTTACATTAATATAAAAGTTTTC
AAAGACATTGCACCTCAACCTATCGCACTATCCTTTCATGATTGTATCCT
TTTACTCTTGATTGATCAGCTCAGTTACCGAGTGTCCCAGAAAAAAGTCC
CCTTCTTTGAAGTTAATTTTCTTGAGTTCTATGAACTTCTAAAGAGTCAA
TTTTTTTGCATTGGACAGAGGAAGGAGAAACTTAAATTTTGAGGGGTCAT
TTGTCAAATTTGGTCGACTAGATCAAAAGTTATGGTCTAATGGCTAAGAT
TACTTTTCAAAAAAGTCGAAAAAAGGAGAAAAATGAAGGTATTAAATATT
TACCAAGATAAAGATAAATAATGATTGACATTCTGGTTTTGTATTATACC
ATTTGTTTGCCACGCTGATCACTTAGTTAACCGGTGAGAACTTTTCAGCC
TGTAAGGATACTGTAAAATGAAGGAGCTAAATGCTAAGTGGTTGGCATTT
CAAATCCTTTTGTTTACAGCCCTCGAATTCATCTGGGGTTCTCAGAATTA
CAATGTCTTTCACATAGGTACCGTACTTACCAATAACAATCCAAACGCTC
TCTTAACAATCAAAAGCGCCAAAATCGTCAAAAAGGCGTTTTACCACAGA
ATAACCGAATTTTTGCGATTTTGGCGCTTTTGATTATTAAGGGATCGTTA
AGAGATTTGGATTGTTATAGGTAAGTACGGTACTGAGTGTGTTCGGGGTA
TTTTCTTACTGGGCACGATAGCGGATATTTCACAGTGGGATGCGGTGTTT
TTATAGAAATTATGAAAGTTAAATCTATACTTATTTCTTTTCAGTTGCCT
ATCGAGCCAAGAGTGATTCAGTTGATGTTCAAAATACGTCGTCTGCCAGT
GTAAGTATTTTGTCCTAAAACCTTTTTTCTGTTTCTTGTTCATCATGTAA
GAGTCCTAGTGTAAGAAACCGAACGGCCTCAGTTTTTTGGATTCAAAAAG
AAAACTTGGAATGGATAACCTGATAACAGCTGTGGATCTTTCTTAACGCG
ATACACTGAAGCTCTAAAGATCGCTGAAACTAACTGTATATTTTCGCCCA
CGTCTTTAGAGCTTCAGCGTACTGGGTCAGAAAATGGGCCATTTCATTTT
ATATCTATGTTGACGAACATATCCAGGAGGTAATTGGAGAAGAATTTCAA
GGGGGTATTTTTTCATATTTCTAGTAGGTCAAAGGTTATTCTAAAATTTC
TAGGGGGTAATAGACTAATTTTTGTTCGTCCACCCTTACTTTTAAGGTAT
GAAAATAATTTTTCCGAGACTTCTTTCTCAAATTTTGCTATTTTCAAAGG
GGTATTATTACATTTCTAAAAATCTTTTTTGCCTTAAGAAGGATCGTCCA
CCCCCCTGTATGGAAATTTAATGGAACAGCCCATACGCAATCTGTTATCA
GGTTAGGAATGGTTTGCTCGATTATTTCGATGTTTAAAGAGGTGCATGTC
CGATACGTGAATTATTTTCCTATATTTTTCTTCCGATCTCTATCTTTTAG
AACACGACGATTCCAACCATCTTCTGTGTGGTGGTTGCATTATTTGCGGC
AGCCATGGGTATTTATCATGTTTATATAATTGGTACTTACAATGATGGTA
ATTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000366_pilon:250726..254880- >XLOC_011832 ID=XLOC_011832|Name=XLOC_011832|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1332bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000366_pilon:250726..254880- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGTATTCTTATGATTGTTTCATGGGTTATTTTTGCAACCATTGGTATTTT
CATGGCTCGCTACATGAAACAAGCAACCAAAGATCAAAAGATCAATGGAA
AACAAGCGTGGTTCCCAGGTATTCTTATGATTGTTTCATGGGTTATTTTT
GCAACCATTGGTATTTTCATGGCTCGCTACATGAAACAAGCAACCAAAGA
TCAAAAGATCAATGGAAAACAAGCGTGGTTCCCAATTCATCAAATGTTTA
TGTTATTGTGTGTCATCTGTTTTCTGATTGGTTTCATCTTGATCTTTGTG
GAAAAAGCAGGCTGGGTCATTCATCAAATGTTTATGTTATTGTGTGTCAT
CTGTTTTCTGATTGGTTTCATCTTGATCTTTGTGGAAAAAGCAGGCTGGG
TCGAATCGGCAGGAACACACGGACAACTTGGGCTGGTTGTCGTTATTCTA
GGATTAATACAGGAATCGGCAGGAACACACGGACAACTTGGGCTGGTTGT
CGTTATTCTAGGATTAATACAGCCACTGATGGCAATGGTCAGATGTGCAC
CAGATAGTGAAAACCACTGATGGCAATGGTCAGATGTGCACCAGATAGTG
AAAAGCGTTTCATTTTCAACTGGTTCCATCGAACTTTTGGAATGTCAGCA
TGGATTATCGGAGGCGTTTCATTTTCAACTGGTTCCATCGAACTTTTGGA
ATGTCAGCATGGATTATCGGAGGTGTATGTATCATATTTGCATTCGATAA
GATTTTACAAGAAAGTTACACAGAGATGTTGGTATTCATGATAGTAGTCG
TTGTTTTGTTCATTTTATTGGACATCGTTATTTGTGCTTCCTCGAAGAAT
TCCGCCTCAGCTGATGGTGTATGTATCATATTTGCATTCGATAAGATTTT
ACAAGAAAGTTACACAGAGATGTTGGTATTCATGATAGTAGTCGTTGTTT
TGTTCATTTTATTGGACATCGTTATTTGTGCTTCCTCGAAGAATTCCGCC
TCAGCTGATGTTGCCTATCGAGCCAAGAGTGATTCAGTTGATGTTCAAAA
TACGTCGTCTGCCAGTTTGCCTATCGAGCCAAGAGTGATTCAGTTGATGT
TCAAAATACGTCGTCTGCCAGTAACACGACGATTCCAACCATCTTCTGTG
TGGTGGTTGCATTATTTGCGGCAGCCATGGGTATTTATCATGTTTATATA
ATTGGTACTTACAATGATGGTAATTGAAACACGACGATTCCAACCATCTT
CTGTGTGGTGGTTGCATTATTTGCGGCAGCCATGGGTATTTATCATGTTT
ATATAATTGGTACTTACAATGATGGTAATTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000366_pilon | genome | sc0000366_pilon:250726..254880 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 562-666:106 |
| Aaloc | 508-561:810 |
| Aaloc | 364-504:1783 |
| Aaloc | 304-360:2650 |
| Aaloc | 262-300:2948 |
| Aaloc | 202-261:3255 |
| Aaloc | 118-201:3533 |
| Aaloc | 1-117:4156 |
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