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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000059_pilon:37161..46959+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_011827 ID=XLOC_011827|Name=XLOC_011827|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9799bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000059_pilon:37161..46959+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) atggCTTTGTTGTTGACAATTATTGGTCGTCTTGTAGATGGCCTCCCATT
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TTTTGAATAACGtcataaattctttttttctcccTGGAAATTTGTGTTAA
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ATATTTGTAACCTATTTTTGGGGTCAGGAGTTTTGCCTATAACGTCAGTT
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ATATGTGGCCTGAAACCCCCATTTGGTCTTCTCCCCCACCTACCCTTTTT
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tctgCCTACTTGCCTATTTTAACAATTAGAATGGGCAGGggagaaagtcg
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GGATTCCCCCTGACTCAACAGGgtatttcagagaaaaaatcaaaaaaacc
ttttttttgaacCAGACCCTCAGGACACATCTATCTTACGCAGAATTTAT
CGTAGAATCAGAATATCACATCCATTTGGTCTCAAATTTAATTGCTTTTT
CGGAAATTGATTTTTCCGAGGCATGgtatataaaatttttgaaaaaaaaa
tcaacgttTTTTGTCATTTGCCCCTGGGAAGGCAAAGCGCAATTGCCGAC
CGTTTCCGTACGCCCAAGCGCCCATTTCGCGCCCCTAAAGCCTCCTTTTC
GTGCAGATCCAATTTCGTGACTTTTCACACgggattgttttcaaaaatcg
ctCTTAGAAAGCTCAACAGTCAGACCAAGCTGTATAATATTAGTGACTGA
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GCTCTACTAAACGTGAAAGAGCTTCTGGTAATGCAGGTCGTTGCACAAAA
GCAAGATCAAAGGCTCTTTATGCTCCAAAGAAGAAAACTTACAACTTCGA
GAAGAAGCGACCGACTGCGACTACGGCTTCAAAATCGTCAATCGACAACA
CTTCAAACAAGGAAAGTGAACTTCCAGAGACTGCATCTAGCTCTAAAATT
GGAAGTACAACTATACCTGAGACTCCTGAAAAATCAAGACCAACTGAAAA
TAACAGCAGTACTACAAACCCTGGTCCAAAAATGATTCACGGCTACCGTT
TTGTGGATATGACGATATTAGCGTCAATCTTCACCGTCCTTAGTTGCCCT
GGATGTAATGGTGTACGTTGTCTAAACCTCCATGAAAAtgatgttaaaaa
gaaaggactAGCAAGCCATCTTGTTCTTCAATGCTCTGTGTGTCTTTATG
AGCAATCATTTTTCACTTCGAAGCAAGTGCAATACCCGAATGAAGGACGC
GGTGGTGCTAAATTCTTCGATGTGAATGCTCGGTCAATTTATGCTTCACG
ACAAATAGGTGGAGGCCatgaacatttgaaaaagttttgcacTTACATGA
ATATGCCTCCACCAGCTCTTGAAGGAAGCTGTAGCAAAATGACAAAGAAA
TTGAAGGAAGCGGCAAAAACTGTTGCTGAAAAAAGCATGTCTGATGCTGC
CGCTGAACTGCGCGGGGAAGCAGAATCAGCTGACGTTGGCGTTTCTATTG
ACGGGACATGGCAGAGAAAGGGATATACTTCCATGAATGGTGTTGTGACT
GCTATATCAGTGGATAATGGAAAGGTTCTTGACACAGCTATCATGTCAAA
GAATTGTAAAGGCTGTACCAAAATGAAGTCTGTTAAAACCACTGATCCGC
AACGATATGACGCGTGGAAAGCTTCTCACAAATGTGGGCTCAATTTCAAA
GGATCTTCCCCAGCAATGGAAAAAGAGGGAGCAATAAACATTTACAATAA
CTCTACTAAGAAACATGGGCTATATTACACTTCATTTTATGGTGACGGTG
ATTCAAAATCGTTTACGGCGGTACAAAATACCTATGGTCCGCGCAAGCCT
GTAAAGAAACATGAATGTATTGGCCACTATCAAAAAAGAGTCGGAACTCG
TCTTCGGAAATTGAAGAAGTTAAACAAACGCCTAGGAGGTGCAGGAAGAT
TGACTGATGCCAAGATAGATTGTCTCCAAAATTATTTTGGCATCGCACTG
CGTCAGAATGTGAATAATCTTGACGAAATGGTGAAATCAACCAAAGCGTC
AATGTTTCATGTTGCGGGATACCATGACAACTGCCCCAATCATAAAGATA
GCTGGTGTCAATACAATCTTGACAAATTAAATGGCAccaatttctacaaa
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TGATTTATGCACACGcgaaaaactcgaaaaatgCTTACACGGTCGTACTC
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GCCAACCATGTGGGTTTACACATCCTCAGCTTTGCTGTCTATGATGCTAT
TTCTCATTTCAACAATGGTGGTATAGCAGCCTACAACATCTTAACTAAAA
TGAACATGGAAGCAGGAAAGTACACGGTCAAAGGTCTAAACCTTCAGGAT
TTGATCCGTAAACGACGGTCAGCTTACCGAATGTCTTCTCCCCAAACaaa
gagaagaaaagttatcagacacctgagaaaaacaaaacaagacaaattaa
ttgaaaaagaaGGGAAAACTTATGAATATGGTGGCTTTGAATGTTGATTT
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aatttttagcgcgttttcttatttttgcaagttttttcAACACGGGTCGG
GGCATAATTTCTGAACCGCTTTCTCAATCAAGCTAATTTTTTCAGTGAAT
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GTGTTTGACCTATTTTGGCACTTTTCGGTGCACGGCTCcggccgccatta
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cTAGCCAGGGGGAATCCACCTAAGAATAATCATTTCATTTCTAGATACAT
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CGTAATTTGGGTCGTTTGAATGATGAGTTACAAGGCGTACAGAAAATCAT
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taaaattgaggaTGAAGCAagcgatatcactcttatttaaaacgAAACCT
TTCCTTATTGTAAAAagttgaacttttaaatttgttcttcaAAAACAATA
TTCATAATTTATGACTGTCATCTTTAAGACTTAGGGGTGTACAAGCGTTT
CTTTGTTTGAGACAGAATTCGGCATGTGTTTCTCTATATGGGCTATATGT
AATCTTCAAATCTAAGTTATTTTGTCACACTCATATCGTAACACGCttta
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ACGACAAAGCTGGTCAACTTCGTTTCCAaagtgaaaaatacaaaaaggat
gcaaaatttctgaatttaaGAACGGTTTATGCAAAATATGCAGTGATTGG
TGTATTGTGTCTTGTATTTTTAATCTACATACGTTATTGGTGGCTATGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000059_pilon:37161..46959+ >XLOC_011827 ID=XLOC_011827|Name=XLOC_011827|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1326bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000059_pilon:37161..46959+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) atggCTTTGTTGTTGACAATTATTGGTCGTCTTGTAGATGGCCTCCCATT GGCAGCTTCTATGCCTTCTGATGAGCAGatggCTTTGTTGTTGACAATTA TTGGTCGTCTTGTAGATGGCCTCCCATTGGCAGCTTCTATGCCTTCTGAT GAGCAGGGTAACAGAAACATTCAGGAATATCAATCTCAAGCTAAAAACCT GTTCAAGAAACTCAACGAAAGATCACCTGCCAAATGCAGTATCGAATCAG AACCTTACATTTTTCAGGTAACAGAAACATTCAGGAATATCAATCTCAAG CTAAAAACCTGTTCAAGAAACTCAACGAAAGATCACCTGCCAAATGCAGT ATCGAATCAGAACCTTACATTTTTCACTATTCGTTGGATATCCACAATGG TGTGTGTTATTTGGTGATGACAGAGAAGACATTCAGTAAACGACAAGCAT TTAGTTATTTAGATGatattcaaaaagaatttgCTTTGCAATACGGTGGT TATGTACCGACTGCTCGGCGACCCTACTGTTTCATCGAATTCGCTATTCG TTGGATATCCACAATGGTGTGTGTTATTTGGTGATGACAGAGAAGACATT CAGTAAACGACAAGCATTTAGTTATTTAGATGatattcaaaaagaatttg CTTTGCAATACGGTGGTTATGTACCGACTGCTCGGCGACCCTACTGTTTC ATCGAATTCGATACATATATGCAAAAAGCGAAGAAGAATTTTTCAGATGG GAGAAGTGGACGAAATCGTAATTTGGGTCGTTTGAATGATGAGTTACAAG GCGTACAGAAAATCATGATACAAAACATTGATGATGTGTTACAACGTGGT GAGAATTTGTCAGATACATATATGCAAAAAGCGAAGAAGAATTTTTCAGA TGGGAGAAGTGGACGAAATCGTAATTTGGGTCGTTTGAATGATGAGTTAC AAGGCGTACAGAAAATCATGATACAAAACATTGATGATGTGTTACAACGT GGTGAGAATTTGTCAGTTCTCGACGACAAAGCTGGTCAACTTCGTTTCCA aagtgaaaaatacaaaaaggatgcaaaatttctgaatttaaGAACGGTTT ATGCAAAATATGCAGTGATTGGTGTATTGTGTCTTGTATTTTTAATCTAC ATACGTTATTGGTGGCTATGATTCTCGACGACAAAGCTGGTCAACTTCGT TTCCAaagtgaaaaatacaaaaaggatgcaaaatttctgaatttaaGAAC GGTTTATGCAAAATATGCAGTGATTGGTGTATTGTGTCTTGTATTTTTAA TCTACATACGTTATTGGTGGCTATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000059_pilon | genome | sc0000059_pilon:37161..46959 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 511-663:9647 |
| Aaloc | 358-507:8997 |
| Aaloc | 190-354:4861 |
| Aaloc | 79-186:3617 |
| Aaloc | 1-78:1 |
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