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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000159_pilon:386259..404197+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_011476 ID=XLOC_011476|Name=XLOC_011476|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=17939bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000159_pilon:386259..404197+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAGGACAATGCTGGTAATGATGAAGTAAGTATTTGTCTAAATCTTTC
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AAGTAATCCGTTGACTTTTTATGTGGTGTAAGGTAACAGCAAAGAGCTTA
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GCACTACTAAAAAACACTCTCGCCCCAAACTTCCCGTgcagatttttttg
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TTTTCTGCTCATCAAGGTATTTTCCTTAACAGTGCCTTGTTTATTTTGAG
GAGCAGAGAGCAAAATCTTGGCCGGACCATGATCATGTCTAAAACAAATT
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TGTTTAATGATTGACACagcctttgaaattttgctgctatTATAATTTGT
AGAGAGAGGAATTTACCTGAAAAAGTTAGTAAattatctattatttttca
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AACAATGAAATTTTGTTCAATATCTGGAGAGTTTTATTGCCATGGCAGAA
ATGTTATGTTATTCGTTCATAAACGAATTCTCCCACCAATCTTTTTCGTG
GCAAGTTTGAGTTTGGATTGCTCCCCTTATTTATATCAGGCTGTATATGG
AGCTTGTCTTATACCATGAATAATGGTTATCTCGTTATCTCGGATCACGA
TCatgatttatgaaaattttgcttGTGACCTGTAAGATTTTGGGTAGTGG
TTCATAACATTTTGAATCGTGATTTTGGATCATCAGCTTTGAAATATAGC
TAAGGATCATAATAATGATCAAAATATGGATTATCCATCCTGGAGATAAG
GCTCACGCTAGATATTTTATAGCTCATGAGCTGAAAAGTGATGTAATTTG
CAGTATAGTTGATGTCATGCTAGAAAATTATTGTGCTACTGCCAATCTAT
TCTTCATTATGAGGGGTACCGTCAACTGGTCTAACTTGGGACtgttggtc
gaaacatgggattgATATATTGActgtatttttacttactgttaaatcat
TTTGAcgacaaatttgttttgatacttccatagaggtaataaaaatagat
ggagagtcaatgccttttgttctattctgactTATCATCGggagcaaaca
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GTCTAGAATAGAAAAGCTGCATCTGACAAAAGTAATTATAACCATTTACG
TCATCTTTGAATGTCTTCCTCTCTCAAGGGGATTTTATCTAACAGCCCGT
GCAATGAGATGAatatatgtgactccccaagtgatttaaagtacctgaaa
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GCGGCCACGAACATCCAGAAGCGGTCAGGACCGTTAGAGATTACATTTCT
AGAAGGTCTGGAAGCcgatctaaaataaaaattttaccaTATACCTGTCG
TAATACCACACCAAGTCTGTtctgattttcaggtactttaaatcgcttaG
GAAGTCACATATGTCAGCAAGAGCCTAGTTTCTATGATTTAGTTGATGTA
CATGGAGAAAATAGCTATGAGCACATACGCACGCATAGAAACCACCCCCA
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TTTCACTacagaaatttttaaatatttcaattcattcattttattttttg
atttctctcTTTACCAGACTGACGGAGGGAAGTTGATGATCTACGCTCAA
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CCGGTTATTTGTTGCATACTTTGTAACCTTTTGCAACTTTCTGATTTATG
CTGAAGATCCTGTGGCTCATAGTTATTCAAAATGCGAAATTCCAATAATT
GGTAATGCATTCTCCTTTGTAGTAACAAAGtaagttttctttattttaag
tttCTCTGCTTAAAATGTACACTTTTTGCCATGTGTATGAGTGATTGGGC
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GTTTTCTGTTTATAGATGGCCGCCAAATGCATTTTCATTGTTAAAAGTGT
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ATTCATCATCTCCTTTTAAAACGTTGCTTCAAATTATCCATGTTTTCGAA
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TAAACACTGCACACATCAAATTTGacattccaaaatgtttgaagagAGAA
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TATTGTCATGTTGTTAGACTTAAATATGTGGAAGAACCAGATTTTTTACA
ACCCCCTTGATTTTGGTCAATATACTGGCCCTGAAGATAAAATCTATTCA
GTCATGGATGATTGGAGTTTGGATCGATACAAGAACGAGACTGTTTATTC
TTATGAGTGGAGACTGAACAACATTGATCCAATAACTAATCAAACCTACA
TTACTGCTGATTTTAGAACCAATTCTAGATTCAGAGGTAAGCCACTTTCC
ATTAGAGGTTTGGCTTTCATCCCTTCCATACTCGTTTTGCTCATGTTTgg
tgttttgatttacatttttgGTCGTGAAGGCACTTCGCAGTTCGAATCAC
CAAAGAAGAAACGTCAACAAAATTTGAGTGAGCGTGTGACAGGTGTACGC
ATATCACAAATCGACCCTGACCATACAGATGGAACGGTGATTGAACTTGA
TCCTAATAATGATGAAAAACAAACATCGATACAAGAtgaacagaaaaatg
aaacagaTAATGTTGCTGACAGCGGCCATGCAAATTATGGATCAACTGCA
AGCTCACCTCCTGTCCAAAGGGATAATCCTGTGGTttaa Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000159_pilon:386259..404197+ >XLOC_011476 ID=XLOC_011476|Name=XLOC_011476|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3156bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000159_pilon:386259..404197+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAGGACAATGCTGGTAATGATGAAATGGAGGACAATGCTGGTAATGA
TGAAACTGACGGAGGGAAGTTGATGATCTACGCTCAACAAAGTAGCCGTT
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GGCTCATAGTTATTCAAAATGCGAAATTCCAATAATTGGTAATGCATTCT
CCTTTGTAGTAACAAAACTGACGGAGGGAAGTTGATGATCTACGCTCAAC
AAAGTAGCCGTTTACAAAAGTTTCGACATTATTACCAGTATCCTTACTTC
CGGTTATTTGTTGCATACTTTGTAACCTTTTGCAACTTTCTGATTTATGC
TGAAGATCCTGTGGCTCATAGTTATTCAAAATGCGAAATTCCAATAATTG
GTAATGCATTCTCCTTTGTAGTAACAAAATGGCCGCCAAATGCATTTTCA
TTGTTAAAAGTGTTGTTATGTTTGACTGCCATTGTAATTGGTATCTTGGT
TGGAAAGCTTGTTATTCATCATCTCCTTTTAAAACGTTGCTTCAAATTAT
CCATGTTTTCGAATGATCAGGGTTCATGGATGATATGCTTTCTTTTTACC
ATGATATGTCTAGTGATTCTATCATTTGTTTATAATGGCTTTCTATCACT
TAATGACGATATGGAACCATATAAGATAACAGGATATATTGGAGCTAAGA
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CTGACATCTTGGATGGTCACTGATATGATGCTTCAGATGGCCGCCAAATG
CATTTTCATTGTTAAAAGTGTTGTTATGTTTGACTGCCATTGTAATTGGT
ATCTTGGTTGGAAAGCTTGTTATTCATCATCTCCTTTTAAAACGTTGCTT
CAAATTATCCATGTTTTCGAATGATCAGGGTTCATGGATGATATGCTTTC
TTTTTACCATGATATGTCTAGTGATTCTATCATTTGTTTATAATGGCTTT
CTATCACTTAATGACGATATGGAACCATATAAGATAACAGGATATATTGG
AGCTAAGAACCATGTCTTTATGAGAGCAGCAGCAATTGGAACTTGGTTTG
GAGATTTTCTGACATCTTGGATGGTCACTGATATGATGCTTCAGgacaat
caaaaatatgtgaAATGGGCAACCAAAATACGTGTCTGGTGGAAAGAAGG
CTTGAGACGTGTTTATTTGTTTTGGGTTTTCTTTATTGTTCTGACTGTGA
TGGTCATTGTGATTGTATCAACCGATATTTTGAATTGGGATACCTTCAAC
AGGGATGTTTTCTATACAAATGAAGTCGGGCGTTCATTCTTAGCCTCCTT
TATTCTTGTCATGGATTTCACTATTGTGATGCAGgacaatcaaaaatatg
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GTTTATTTGTTTTGGGTTTTCTTTATTGTTCTGACTGTGATGGTCATTGT
GATTGTATCAACCGATATTTTGAATTGGGATACCTTCAACAGGGATGTTT
TCTATACAAATGAAGTCGGGCGTTCATTCTTAGCCTCCTTTATTCTTGTC
ATGGATTTCACTATTGTGATGCAGgatTGGGATTTCCCATTGTTTCAATC
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TGATCCAATAACTAATCAAACCTACATTACTGCTGATTTTAGAACCAATT
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TCCATACTCGTTTTGCTCATGTTTggtgttttgatttacatttttgGTCG
TGAAGGCACTTCGCAGTTCGAATCACCAAAGAAGAAACGTCAACAAAATT
TGAGTGAGCGTGTGACAGGTGTACGCATATCACAAATCGACCCTGACCAT
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CGTCAAACTACCTGGTGTAAACACTGCACACATCAAATTTGacattccaa
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GAACCAGATTTTTTACAACCCCCTTGATTTTGGTCAATATACTGGCCCTG
AAGATAAAATCTATTCAGTCATGGATGATTGGAGTTTGGATCGATACAAG
AACGAGACTGTTTATTCTTATGAGTGGAGACTGAACAACATTGATCCAAT
AACTAATCAAACCTACATTACTGCTGATTTTAGAACCAATTCTAGATTCA
GAGGTAAGCCACTTTCCATTAGAGGTTTGGCTTTCATCCCTTCCATACTC
GTTTTGCTCATGTTTggtgttttgatttacatttttgGTCGTGAAGGCAC
TTCGCAGTTCGAATCACCAAAGAAGAAACGTCAACAAAATTTGAGTGAGC
GTGTGACAGGTGTACGCATATCACAAATCGACCCTGACCATACAGATGGA
ACGGTGATTGAACTTGATCCTAATAATGATGAAAAACAAACATCGATACA
AGAtgaacagaaaaatgaaacagaTAATGTTGCTGACAGCGGCCATGCAA
ATTATGGATCAACTGCAAGCTCACCTCCTGTCCAAAGGGATAATCCTGTG
GTttaa
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000159_pilon | genome | sc0000159_pilon:386259..404197 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 838-1578:17199 |
| Aaloc | 598-837:16790 |
| Aaloc | 241-597:16217 |
| Aaloc | 28-237:15718 |
| Aaloc | 1-27:1 |
|
