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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000159_pilon:456918..466311+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_011472 ID=XLOC_011472|Name=XLOC_011472|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9394bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000159_pilon:456918..466311+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAACGTAAGCAATGGAAAAAAGTATTATATGAGGACCAAGAATTTCC
AACAAATTATACAGAcgatacatttttggaatcaatGAAGAAAAATGGTA
TGGTATTTGAATGACTTTGACTTTCTGATTCTGTTtaattttgttattaa
ttttcttcataaggatactttttataagaacctgaAGTCTCAAAGCTCAT
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AACACCAGGATGCATGATCTTAGAACAGTTATCTTTGAGTCTGGTATTGT
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TGGCCATAATTTCATTGCcagttgaaaatattcttcaattTACCCAGCTG
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atccccattaagatttttgattgaaattgtcATCCCTACTGTGGGaaaaa
aaTTCACTGGGGCTGTTTTTAGATGAATGGGGTGTTTTAAATAATAATCA
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gcttatattttctttttattttaatgctattttttagtatttgcattttg
gtttgtgttttCATCAACCTGGAAAACTGTCGTCTTGATCCAGAAACATT
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TTCTCTACCAGTTACATCCaggtaattacatttttttagGAGCCCCATgg
tggttttttttatttctgggTCTATGGAAAGGATTGATCataaaatttgc
caaaagttaGTTCAAAATTGTAAGGATTTTATTGGTGTATTAATAAGGAC
TCTCAGCAGTTTGCATGAATGTATGTGAATACattattataatatatttt
tcaattaaccaacaacgagcaattattttattttttgacaatatatttcg
atcTATTGATCATCTTCAGgtctaaaattcaataaaaacaagattataaa
aatctcCGATATAAAATGTATATGTTCACATATCTACAGTAAAAACAACC
ATAAGCTTACagaaaaaagtgagaaatgaaaatgctactgcaaaaaaaaa
tataatatgtaATAAAATTGTTGCTACTAAGGATAATCCCATGTGAGACT
ACTAATGTACGGCTTCTATACTCGTCTTTTGTGTTCAGTTGAGGCTTTAA
TTGATTAATAAAAAGTGCCTCTAGTGTCATTAAATGGCTTGCCGAACGAG
AACTACCTTTCAAAATGGCTACGTCATCCATTGTTAATGAGTGCTGACAT
GACGTTATGTGAATGGTAACGGGTGCGTTTTTCCTACCGTGCTCCTTAAT
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GTGGACAGGTAATTTTATAAACTACACCACTATTTAAGGATTTTTCCACG
GAGGACTTCAATGATGGTAGcactgtttttaactttttcaaagtaaatat
cACACGACAAGGGGCTTTCAACTTTCCAAGGTTATGTTTCAATTCCTCAG
ATAATTAGTAGCAAcaattttattatatattatatttatttttttgcagt
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tttattgaattttagacCTGAagtagcctgttagacgaaaaccgcttttt
tatcgcgatttaacgtcTGTTACTTTTTGCCGTGGAATCGAATGTTCTTG
GACGGGAAAGTCCGTCCAAGATTTTCTCTTCGGCGCAGCTCATTTTGCCG
TGACTTTGGACAAGCTGCACTCCATCGCGTgtgcttttttcgttttttaa
gaagtcgctgcattgcTTCGATCGGTAAAgttcaaatagattttcgaact
ttcgaattttgtaattcgaattttgtgattcgaattttgaatattttttt
gagagaaccaaaatcatttgttttgaaaagttgaaaccgAGCGAAAAAGA
AACAGTATCAGTGGATGGAGgagaaaagaagatggaaatcCtttttttGC
ATCAACAGCAGCAGAGTTGTTGGGTTATTTCCATAACAGGATTGAAGAAT
CCCAGAGACTGTAAACATTGagaatgaaaattatcaaatcagaTTAGATC
CTATCCTACCTAGAACCATAAGTGCTGCAATCCAATGATGATTGAAGACG
AACTTGTACTTTTTGTATGCTTTGGGATGGCAACGAATATCTTTTGGATA
TGGCATGaaacctggaagaatttatcTTGTTTATTCCTGGCCTATTCCAG
TGgaaagaagaactgtttgtttgttattgtttttattggctgttcGATGT
GGTCTCTATCTGGTcgctagtttgaaaatattccattaataaaatggtgg
aaagtaaATTGACatatgattgaaagtaaagtaaaatttgattgtattcg
attcgaAAGTTTGCTGGGAatggaaatgaaaaactttcttcacaGCTGTC
TTCACCAGTGACATAGACAAGTCTTGACAATTCTGGACAATTGCCAAAAC
TTGACACTATTTTTATGATAATATTCtagaatttttacattttaatgtgA
AGAGTTTGGTCCTGTATAATCAGAGTTAAAACTACTAATTAATTTTGAGA
TCTCGAGCAGATTTTAGATTTGAatttctcaactttggaaactaGATAAT
GAGCCAGTAAAAGGTGGAGGTTTTGCTTCGAATTGTGAGAGGAATCTACc
taaattttattagttttatcTAACTTTcctataaatttatatttttaaga
tgTTATAGTCATTGAGTTTTATTACAACTTTAGAACTTTGctaaattttt
tggtaaatacattaatgatatatttctattatttgtaccTCTTAATCCTG
AAATTGCACGAGATCGACTCATTTCCATCAAATGATAGTCTTGGAATCCT
CATTATACGATGGCCTCGAGGTTTCTCCACTTCTagaaaaagacaattca
agaagagaagtaaaaaatgaagaaggggagtaaaaattttaagaagagaa
gtaatttttttgtattacttcactgaaaattttgcttttcttcttgattt
ttttacttctctttcaagctttgaaaaatgaagaagagaagtaaaaaatg
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TGTTATTACAGAGAGACCCCTTACCAGACTCCAGAGGATGTTTGTAATGG
CAATTATGTTGATTAGTGTGATTAAACGTTTAAAGCTATCCCTTAAGCAA
AAGTTATaaagcttttcataaattataaaaacactttgtGAGAGTACTTA
TATTTATATAATCTTTGTTGTAGGATCACGTGTTTTAGACGTTGTCTTGT
gctttaaacaatttaaaaagggTTAAAACCATTTTGGCAGCTCGCCAATG
TAGAAATTTTATCACCATTTCGATACTTAAAGACATTTTACttccctttt
taaaatttttacttcccttCTCGATATATTTACTTcccttctttaaattt
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TGGCTATGGCTagtgttgagagttttcttttatttgattttggttgcttt
tctctacaaggaagaaaaccttttgaagaaGTGGGATTATCTCATTACCT
TTCTAAATTAAGAGCCTGTTGACAATACCATTAATTGGAGCTGCTTGAAg
acttttggaaacttttttgcttctgtAGTTCTTTCGTTATAATAGGGgtg
tatcaaaataatttcaaaaaaaaacattttcaccaaACTCCATCCCGATC
ccgaggattcttttgttttgattttaatgcaCGGAACTAAAAAATTGAGA
CTAGATTGAACATCAACGCACATCCTCTCCTACCTATTCGATTGTCCGTT
CCAGTCTTTATTTTCGAGTTCCGTGTTTTCCCGCCCTTATGCACTCCGCA
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AGAATAATTGCTCGTTGTTggttaattgaaaaatatattgctcATGCCAC
AATGTTTTTGCCATATCCattattataatgtaacaaagttctaggcgcac
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GTTGGTATAGTTCGATAAGATAAGGAATTCGTTTGTACAACACGGAGTCC
ATTGCTTCCAAAGTTTGGAATCATCTCAAAGTTGTGCCTTCTGTTTGGTC
GCGTTCGACGGGCTATCTTGTTTGGGATGGTATCTTTTTCGTAATAGTTG
ATGTGCTTGTAAAGTTGGACCATGTCTAAAAAGTGTCTTCTAAACTCGAG
CGTAGGAAGATCTAATTCACGCAATCGTTCTTCATAAGACATATTACgac
atttttgaacaagttttgtTGCCTGTCTTTGTACTCCTTCAATCAGATTT
ACGTGTTTACGTATAAACGGAGACCACTGACTGAGCGTACTCCAGATGCG
GGCGAAAAAACGTACAATACAATGTTTTGAATGTACTTGTACTCATGTTT
ACAAATCCTCGATTGATTATGCCAAGTATCGCGTTTGCTTTTTTGACTTG
CTTTGCAATGTGTTCTTcaaatgtaagttctgagtcaatgaggattccaa
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GGATGAGCATGTTTGATGTTTCCAAACTTTCCTAGCGTCAGAACGTGACA
CTTTTCAGGATGGAATAGTAATAGCCAGTCTTTCGACCATTCTACAAGTG
TGTCTATAATCATTCTGAAGGGAAACAGAGTCTTCGATGCAGTTGACTTC
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tttcaggaagatcattgatgtatagCACAAACAGTATTGGTCCCAGTACA
CTACCCTGTGGAATACCACTCACTACAGGGTCTGTAGTCGAGAaggactg
gttcacttttactgATTGTGTTCGACCTGTTAGAAATGACGTTATCCATT
TTAAGATTGAACCGTTTATTCCATATGTTGATAGTTTCTTGCATAGTCGC
CGGTGGGATACAGTGTCGAAAGCCTTAGCAAAATCGAAGTAGATACTATA
AACAACGTTTCCTTTCGAGATGCTCTCATAACATTTATCCAGATAGTACA
AAAGCTGTGTCATGGTTGAACGGTTGTTAATAAAGCCATATTGTTTCTTC
GATAAAATATTATGATCAGAAAGGTTCTTCATGATGTGTTTCCTCAGTAT
TGATTCCATTAATTTGCACACTACCGATGTCAAACTAACAGGTCGATAAT
TGACTGCCAAATTCTGAGGTCCTTTGTTTTTGTAGATAGGTGTGACATAT
TCGTAATCTTGTGGTAATGATCCTTCAACTAAAGATTTGTTCATGATTAC
AGCTAAGGGTAGAGACAGATAGTCAGATAATTCCGCTAGTATTCTAGGGT
GTATTTCGTCTGGACCGAATGACTTATTATGGTTGAGCTTATTTTGGTTC
AATTCAATTCCATTGATTTTGTACCATCTCCTCAGAGATATGAATATCTC
CGATGGATGAATCAGTTCTCTTTTCAAATGCAGGAAGTTCAACTACTGct
tcttttgtgaatacacTGCAGAACTGTCGTTGAAGTATATTGGCTTTTTC
GTGATCTTCATGATCTACATGTAGCGGCTTTTTGCGTCAATGCCTGAATA
CTTTTTAGAAACACTACGTTAATGTGTGAATCAGAGAACTTTGCAATCGc
tgttagtgtaaaacgcaggtcacaggtcgcaggtcgcaggtcacaggtca
gtgatgacaggttgactctaatcaatgtcattgcagaggaaaatgtttgg
aaaacacaaagaattatcaaaaacataattttcaagcaatttcatccata
taagaccatttcaaacatcaaaatttaaccatgtgcttttatcgatcttt
cgcagtttgcgccgtgtataacgcagaccagaaaatatttgaaaccatat
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TCAAATTCAGTATGCTAAATAGTCATAGCTTCACTTCTCTACTAATACTT
TACCTTTGAAAGGATTGGACAGTCTTTTGATTGATTACAAACCGTGGTAT
GCACTATCACCAACCacgaaaaaagtaatttttcaatcaaatttgaagaa
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AGACATCTCCAGTTTTCTTGTTGTTTCAATTCTGATATTTGGGTTTTCAC
CTATCTTGAAAACATTGATGAAAACAATCAGCACAGATACAATTTATGCG
ATGACggtatgaaatttttttgagtagTTGTTACCAAGCCCGACTCGTGC
ACAAGTTTCTTAGTTGATTTCAATAATAAGTTCTACTGTCTCAGCAAAAT
ATAAAGTCTAAGGAAATAAATGAAATTCTCCAAAAATCTTGGTCAAACTG
TTGTGAAAAGCTTTTTCTGCCTGAAATGCATACTTCAAAAATATAGTGTA
AACAACGTTATTTTGGTGTTTTACCAACAGGTCTTCATGTTTATGTGCAA
TATGCTGTTTCATGATTATGGAGTAGATGTTGCTATGTAAGTTTGTCATT
ATCAAAATATCGCtggattgtaattttttttgtcctAGACTTTTTAGAAG
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TTGCTCTGCAATCTAATCCCCGGTCACTGCCAACTCATTGAATGAGTAGC
TTAGGTTAGGTAATCTGATATGGGCGTTGAGTTACtaggagctgagagta
ggtgtagCATTCAATTCCCCAGGTTTAGTAGTGGTCAAAATGCTAATCCT
TGCAAAATgcggaaattcccttatttgcTCATTTATAACACATCTTTCAG
CACAAGACCCTCCCCAAAAGAAGTTCATGATCGCTATATTTTCTTCTCAT
AAAAAGGTGATCCTTAGCCCTCaaccaataaatttttttttaatttgtaa
acGTTTTTAGTGTTTCAAAAGCTATTTCACTGAATGCTGGTGTTTTCGGT
GCAGTGTGTTTGTCTTCACGTCTTCAGACCACCATTCATGTCTATGCATG
TGTTTACTTTGCTGTCATGTTGTTTGCCATACTTCCTGAATTCAGAAAAG
CTGTCAAGGTATGTCGCGCTTTATAAATTGTTTCACATATTTCGTACAAC
ACTCCTCTAAAATTGTGCGTCAGTTTGTTCTATGCTTAAAATCTGTTTTT
AAAAATGCGATTATGTTTTTATGATCTataaatacacttttaaaaaattg
tttaaataatttttctaagtgtttttgataataaaatGTTGCTGAAGTCG
AAATTCTTAAAGTTATTCTTTGTTTTAGAAATTCCATCGTAAAGCGTACA
TACTCCAAACAGAGGGGATGGTCTTGCTAGCTATTTCAATGTTAAACTCC
ATCAATCAAGTTGGTGCCCTTGCCTTGTTCATCTCACATGTTGCTATCAC
CTTTTTATTTCCACTGTGGATGATCCGATTACAAGCTTTGAAAAAGTAAG
AGTTTAATTTGGAaataaattgcttgaaattaactttaaaaaaaaaatgg
ttataGTTTGTATTGGGGCCCAAAAGGAATCACTGGCCAACAAAAGCGAG
ATTTTCTACATTCACCACCATGACTAAATACCTTATTAcgcgaatattac
taggcaagtatttaacggccttgaatTTTGCATGATCTGAAATAAACACA
AATtgttctgctttttcaaggacgcatcagctggttttaattaaaggTCC
CTTAAGGGttttttttAGTAAAACGAAATTTTTTCAgtttgtgttaataa
aatgactagtaatattcgtgtaataaggctactacatttttattttactt
ttagtAATATCTATGGACCATGGGATGAGGCAATGATTGAATGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000159_pilon:456918..466311+ >XLOC_011472 ID=XLOC_011472|Name=XLOC_011472|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1632bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000159_pilon:456918..466311+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAACGTAAGCAATGGAAAAAAGTATTATATGAGGACCAAGAATTTCC
AACAAATTATACAGAcgatacatttttggaatcaatGAAGAAAAATGATG
GAACGTAAGCAATGGAAAAAAGTATTATATGAGGACCAAGAATTTCCAAC
AAATTATACAGAcgatacatttttggaatcaatGAAGAAAAATGTAAACA
CCAGGATGCATGATCTTAGAACAGTTATCTTTGAGTCTGGTATTGTTTCA
CAGCAATTAGCAAGTAAACACCAGGATGCATGATCTTAGAACAGTTATCT
TTGAGTCTGGTATTGTTTCACAGCAATTAGCAAGtatttgcattttggtt
tgtgttttCATCAACCTGGAAAACTGTCGTCTTGATCCAGAAACATTGAT
CTTATTGGTCTCCTGTTTGCTGTTGGTCGGATTCCTTGTGCATCATCTTC
TCTACCAGTTACATCCagtatttgcattttggtttgtgttttCATCAACC
TGGAAAACTGTCGTCTTGATCCAGAAACATTGATCTTATTGGTCTCCTGT
TTGCTGTTGGTCGGATTCCTTGTGCATCATCTTCTCTACCAGTTACATCC
agACATCTCCAGTTTTCTTGTTGTTTCAATTCTGATATTTGGGTTTTCAC
CTATCTTGAAAACATTGATGAAAACAATCAGCACAGATACAATTTATGCG
ATGACgACATCTCCAGTTTTCTTGTTGTTTCAATTCTGATATTTGGGTTT
TCACCTATCTTGAAAACATTGATGAAAACAATCAGCACAGATACAATTTA
TGCGATGACgGTCTTCATGTTTATGTGCAATATGCTGTTTCATGATTATG
GAGTAGATGTTGCTATGTCTTCATGTTTATGTGCAATATGCTGTTTCATG
ATTATGGAGTAGATGTTGCTATTGTTTCAAAAGCTATTTCACTGAATGCT
GGTGTTTTCGGTGCAGTGTGTTTGTCTTCACGTCTTCAGACCACCATTCA
TGTCTATGCATGTGTTTACTTTGCTGTCATGTTGTTTGCCATACTTCCTG
AATTCAGAAAAGCTGTCAAGTGTTTCAAAAGCTATTTCACTGAATGCTGG
TGTTTTCGGTGCAGTGTGTTTGTCTTCACGTCTTCAGACCACCATTCATG
TCTATGCATGTGTTTACTTTGCTGTCATGTTGTTTGCCATACTTCCTGAA
TTCAGAAAAGCTGTCAAGAAATTCCATCGTAAAGCGTACATACTCCAAAC
AGAGGGGATGGTCTTGCTAGCTATTTCAATGTTAAACTCCATCAATCAAG
TTGGTGCCCTTGCCTTGTTCATCTCACATGTTGCTATCACCTTTTTATTT
CCACTGTGGATGATCCGATTACAAGCTTTGAAAAAAAATTCCATCGTAAA
GCGTACATACTCCAAACAGAGGGGATGGTCTTGCTAGCTATTTCAATGTT
AAACTCCATCAATCAAGTTGGTGCCCTTGCCTTGTTCATCTCACATGTTG
CTATCACCTTTTTATTTCCACTGTGGATGATCCGATTACAAGCTTTGAAA
AAtAATATCTATGGACCATGGGATGAGGCAATGATTGAATGAtAATATCT
ATGGACCATGGGATGAGGCAATGATTGAATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000159_pilon | genome | sc0000159_pilon:456918..466311 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 778-816:9356 |
| Aaloc | 610-774:8829 |
| Aaloc | 463-609:8462 |
| Aaloc | 406-459:7981 |
| Aaloc | 304-405:7655 |
| Aaloc | 169-300:1489 |
| Aaloc | 100-165:951 |
| Aaloc | 1-96:1 |
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