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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000311_pilon:249863..252814+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_011013 ID=XLOC_011013|Name=XLOC_011013|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2952bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000311_pilon:249863..252814+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAGAACCAGAAAAGGTGCCACCAGTAAGCTATCAACAGCCAGGTGC
TCAACCTCACTATCAACCAACAGCACAATACCAACAACCTGTTGCTGGTG
GACCACCCGGTCAACCTCAATTTGGTGCTGCAGgtaatacttttttttta
attgtgtcattttaaaaaatgtcaaaaagttttttttaaattatagtTAA
CAAAAGTTATTGTTACCACTATTATTATaatctttttgctaaattttatt
atttatttctgTGCCAAACCTGTGTGTGCTACCTTCCCAATCTTCTTTTA
GCGGGTATGCAATGGATGCCACCTGTTCAACAAGCTCCTGTTGGGTGTCC
TCGTGGATTGGAATATTTAACACAACTTGATCAATTGATTGTTAAGCAAC
AAATAGAACTTTTAGAAGGTAAACCATGTAGTATATGCTTTTGCCAAATC
AATTATGAAAACAAGATTCTGAACAAACCATTTTGTTGATACAAACATTT
ACAAACACTTAATGATAATGCATACtttttttAGTATTCACTGGCTGGGA
AACAAATAACAAGTATCGTATTTTGAATTCTGTTGGTCAggatgtttatt
ttgctgtagAAGGTAaggaattttatgttcaaagcCGAAAGtttaatttg
aatttcgaagttcaatttattttttcacaGATATTTTCTGCACTGCTGCA
AGATTGTTATCAAATGAACATAACTGATAAATTTTAACTATAAAATCACA
TTCCAGCTTGGCAGGAAgatgttttaagaattttcatttctagaaccAAA
GAACCGACTTAAAGTTTTTGTAGGTGCTGCAAATCTTGCCATTGAAAAGG
TTATTGTCTATAAAGCCTTTATATTTCCTTCCTGCTGTTATATATACCTA
AGTAAAAGAGCTATTTATTGATCctaattttcagaagaaaatacATCAAC
TCTAAGAGTTATTTCACtctaaaagaaaatgtttttggtatCCCTGACAA
TGTTTTTAGTTGTTCGTGATTGTGAATCTcacatatttatcaaaattaac
TATTACAGATAATGATTGTTGCAACAGACAATGTTGTGGACCAGCTCGAT
CATTTAACATGAAGGTGTTGGACAACTATCAACAAGAAATTATTTCGTTG
TGGCGTCCCCTCAAATGTCAAGCCTGTTGCTGTTGGTGCTGCTTGCAAGA
AATGGAAATCAGATCTGGCGGTGAAATTTGTGGATATGTTGAACAGAAGT
ATCCTTAATTAATTGTATTTTACTCAGCTGATCTTAACTTGCTTGGCTAA
TCCTTTCCTCAATTTTATTGTCTTACCAGCGTAGAAGCATTTTACGTTTT
GAAGAtgttttttcatcattaaaattttaatctttCAGGTGGTCACTGTG
GGAttacaaatttgatttgatgGATGCTCAACGAAACACAGTGTTGAAAA
TAAGAGGACCGTGCTGCGTCATTCCATGTTGTGTTGATGTCAATTTTCaa
gtaagaatttttttcacttacaatgagcatgaaggtaataaaaatacaga
tggagagaaaacgtcttggtaatgacctaaatggtcgttgaaatctttta
taaatctattcaaagcggcttttctttaatgtaccatcattggaagcaaa
aaacatcaatttataactttataagaacagaaagaggctggttcgtttat
tttgaaaaacttaattttgcgagaaatcttagttaaaatgcgattcgaaa
tagtttcaactgatttaaggataaaagaatatattaatttcataaggata
taTTTCTGGGCTGGCATTTGTTAACATTGAGATTTACATCACATTATcct
tgaaagtttcttatcttaaaatcttcacgtctataagtgggcagcggttt
tcatactctgataaaatgatcgatacaaggttcctaatcgtaacacgtaa
ttcttttttaaatctatcgatggctttatagGCAGCTTCCCCTAaaagtt
tggagtattgtgcttattatgtgatttttttttcaatttttcatgacaag
gcttatatttcaatatacttgttaaaaatgtaatgtcttttcattcatct
taaatattcctacgagtatacccaaaattaatcatcttattcccaaagca
accaaacagctgtttgcttccgatgataaatcagaatagaacaaaaggca
ttgactctccatctatctttattaccttcatgcaATGAGCgagcaaagaa
aagtaaaaatagaGCCTCACCTTCTCTGTAAGTTTCTGGAGAAGAAAATT
GGCTGAAACTGACACAAATAATCGCGTCCCGTCATGTAAATTGTAATGAA
ATAATCGAGTTTAACATAAAATTATTTCTCTTTTAGTTGCTGGCATTAGA
TGAAACTACCCAAGTTGGAGAGATCATTCGGCAGTTCACTGGATGTGGCC
AAGAATGTTGGACTGATGCCAGTAACTTCTCCATAACATGTAAGCCTGTA
ACATTTGCCATCGTAGAATTGTCAATACTGATCAGATAAATCGATCTTTA
TTATCTTGAAAAGTTAATCTTCATACTCTCTGGTAGATTTTATTCGAATG
ACATTTTAATCCTATTTTGTTTCAAAGGTGTGCTTTCACTTAACCACttt
gtttattgaaaaaatGTGTATATTTTCTAACTTTTCAGTTCCCATGGACT
TGGATGTTAAAATGAAGGCTGTTGTTTTTGGAGCTACTATGCTTCtggta
tgtttttttcttaGTATCAAAActatatgtaaaaaataaatcattctTAA
GATAAGAAAATCCATAGAAAGACAATTGATTGAATGAGGAGGTAGATTCT
CTCATAGGAAAACTGCTACAGTTAAACTGTTTTTCACGATGTACCTTTTT
TCTCTCTTTACAGGACTTTATGTTCTTTGAGcaccaaaacaacaacaatt
ag Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000311_pilon:249863..252814+ >XLOC_011013 ID=XLOC_011013|Name=XLOC_011013|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1662bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000311_pilon:249863..252814+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAGAACCAGAAAAGGTGCCACCAGTAAGCTATCAACAGCCAGGTGC
TCAACCTCACTATCAACCAACAGCACAATACCAACAACCTGTTGCTGGTG
GACCACCCGGTCAACCTCAATTTGGTGCTGCAGATGGCAGAACCAGAAAA
GGTGCCACCAGTAAGCTATCAACAGCCAGGTGCTCAACCTCACTATCAAC
CAACAGCACAATACCAACAACCTGTTGCTGGTGGACCACCCGGTCAACCT
CAATTTGGTGCTGCAGCGGGTATGCAATGGATGCCACCTGTTCAACAAGC
TCCTGTTGGGTGTCCTCGTGGATTGGAATATTTAACACAACTTGATCAAT
TGATTGTTAAGCAACAAATAGAACTTTTAGAAGCGGGTATGCAATGGATG
CCACCTGTTCAACAAGCTCCTGTTGGGTGTCCTCGTGGATTGGAATATTT
AACACAACTTGATCAATTGATTGTTAAGCAACAAATAGAACTTTTAGAAG
TATTCACTGGCTGGGAAACAAATAACAAGTATCGTATTTTGAATTCTGTT
GGTCAggatgtttattttgctgtagAAGTATTCACTGGCTGGGAAACAAA
TAACAAGTATCGTATTTTGAATTCTGTTGGTCAggatgtttattttgctg
tagAAGATAATGATTGTTGCAACAGACAATGTTGTGGACCAGCTCGATCA
TTTAACATGAAGGTGTTGGACAACTATCAACAAGAAATTATTTCGTTGTG
GCGTCCCCTCAAATGTCAAGCCTGTTGCTGTTGGTGCTGCTTGCAAGAAA
TGGAAATCAGATCTGGCGGTGAAATTTGTGGATATGTTGAACAGAAATAA
TGATTGTTGCAACAGACAATGTTGTGGACCAGCTCGATCATTTAACATGA
AGGTGTTGGACAACTATCAACAAGAAATTATTTCGTTGTGGCGTCCCCTC
AAATGTCAAGCCTGTTGCTGTTGGTGCTGCTTGCAAGAAATGGAAATCAG
ATCTGGCGGTGAAATTTGTGGATATGTTGAACAGAAGTGGTCACTGTGGG
AttacaaatttgatttgatgGATGCTCAACGAAACACAGTGTTGAAAATA
AGAGGACCGTGCTGCGTCATTCCATGTTGTGTTGATGTCAATTTTCaaGT
GGTCACTGTGGGAttacaaatttgatttgatgGATGCTCAACGAAACACA
GTGTTGAAAATAAGAGGACCGTGCTGCGTCATTCCATGTTGTGTTGATGT
CAATTTTCaaTTGCTGGCATTAGATGAAACTACCCAAGTTGGAGAGATCA
TTCGGCAGTTCACTGGATGTGGCCAAGAATGTTGGACTGATGCCAGTAAC
TTCTCCATAACATTTGCTGGCATTAGATGAAACTACCCAAGTTGGAGAGA
TCATTCGGCAGTTCACTGGATGTGGCCAAGAATGTTGGACTGATGCCAGT
AACTTCTCCATAACATTTCCCATGGACTTGGATGTTAAAATGAAGGCTGT
TGTTTTTGGAGCTACTATGCTTCtgTTCCCATGGACTTGGATGTTAAAAT
GAAGGCTGTTGTTTTTGGAGCTACTATGCTTCtgGACTTTATGTTCTTTG
AGcaccaaaacaacaacaattagGACTTTATGTTCTTTGAGcaccaaaac
aacaacaattag
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000311_pilon | genome | sc0000311_pilon:249863..252814 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 793-831:2914 |
| Aaloc | 736-792:2691 |
| Aaloc | 631-732:2387 |
| Aaloc | 520-630:1390 |
| Aaloc | 331-516:1061 |
| Aaloc | 253-327:537 |
| Aaloc | 136-249:304 |
| Aaloc | 1-132:1 |
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