XLOC_010901 (mRNA) -

Overview


Name	XLOC_010901
Unique Name	XLOC_010901
Type	mRNA
Organism	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000063_pilon:1375733..1387199+
coding sequence from alignment at sc0000063_pilon:1375733..1387199+

mRNA from alignment at sc0000063_pilon:1375733..1387199+

Legend: polypeptideCDS

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>XLOC_010901 ID=XLOC_010901|Name=XLOC_010901|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11467bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000063_pilon:1375733..1387199+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AAGGTCGAAACAATGTTGTATGCCAGCTAGGGTACTTACATAGAAATATC
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ttttgcggtttttcgcgaaaataagggcgtaaacaattaggtaacacccc
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cattttctgccggctaatggccttcaaaaattatggtaattttcaggttt
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aaaaaTCCCTGAAAACTGGCACGGTTCTTACCTCGAAATTCTATTGGTTT
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GACTCCGGAGAATTGAGACAGAcaaaaagatttagaaattttgctAAGAA
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TCATGCCAATATATTAgattgaattagagaaagattagaataaagttatc
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TTTAAATCTTTCCCAGGCCCGGCGGAAAACTGTATAAAAGTGGgtaggct
gaaggctcaaatgagataaaattatcaaggaatttaagaaaaaaatatca
ttttctgcTGAGCTTTTTTCCCAGTGAGCAAAAAAGATCTACCATATTTC
AGACGTAGAATCTAGCGCATTGAGCGGTAAATGTGTCTCTTTCTTTGATC
GAGCGTAATTATGGCCTGAGAGATAATTGTAGGGCAAAATCCCTTCTACC
CTGGGGCATATCTCCTTATTTCTAATCCTTTCAGCCAAAGAGCCCTGTAc
tttttgggacaagctggagtttttacaagctcttatttgatttggttggt
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AGGTCCTCTTTCTACTagatttatattaaaaaaaaaggatcCATGGAGGC
ACCCTCAAACTAAAGGCTTATATTACCCCTTTACGACATTGATGATTCTG
AAagacgcgttgacgggggatatcAACGACTCCTTTAAATTTACAAGTCA
GCTTCGTTCCAAATCAAATCATTTAGTGGCCCTGGCCCGAAAAAGTGCCA
TCTCTTTGCACTGGTAAAAacatttcgtttttttttcgataGACGCATAC
GATAAAGATCATGTTGATCTTCAATGGGAGAAATCGAATTCGACTCATTT
TCAAACTGTCTTTGGTCCTCAAAATACAAACATGATCAGAATGCGAATGA
AAAGTTATTCCTTGAAAAGCACTGTCAGAACTTCAATGCTCGGAAAAGGT
AAGTGTCTTCCGGTCCTCAAAATACAAACATGATCAGAATGCGAATGAAA
AGTTATTCCTTGAAAAGCACTGTCTGAACTTCAATGCTCGGAAAAGGTAA
GTGTCTTCCGATCCTCAAAATACAAACATGATCAGAATGAGAATGAAAAG
TTATTCCTTGAAAAGCACTGTCAGAACTTCAATGCTTGGAAAAGGTAAGT
GTCTTCTGGTCCCGAAAATAGAAACATGATCAGAATGCAGATCGTTGAAT
AGCACTATCAGAACTTAATGCTCCGAAAAGGTAAGAAAGCGACTTCGGAT
CCTGAAAATACAAACATGATTAGAATGACAACGTCCACATAACGTTAGAC
AATCGTCCTGAGAATATTAACATAATCTGAATACTAattaaaagtcattt
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TTCTCAATTCCGGCCAAGAAAAATCTTTgttcggagttttttgaaaagtg
gtaccctaatggcggcactactcaatagtggtgtaaatgcatcgataGCG
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ttaatttttaacactgcaacgGCTCgtgggtaccaattcaaaagcggata
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GGTgctagagtttggaacaaaaaCTACAGTaaccagtagcgtggtgggcc
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GGCGCCTTCTATGAAATCTAAATATATTTGTAAAGATTACGCGTGCGAAG
CGAGCACGAAAATTTtaggatatttttttctcttttagaatGAAGTGACT
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TGACAGAAACTTATCTCTATCTCTGGGTTGTAAACTTTCTTTCCAGATCA
CCACGTTCTTATCGCTACATGGAAGTTTTCGCGGAATGTCAATTATTACA
TCTTACAGCTTTATCTTCCTTGCATGCTCATCGTTGTCCTCTCATGGGTC
GGTTTCTGGATTGACTATCGTTCGGTTCCGGCAAGAACGGCTTTGGGAAT
TGTAACAGTTCTAAGCATGATTACTTTCAGTACGTGTTTCCGACatattt
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tttttgttgaaaaaaaaagaacttttttcaaTGGACAAATATAGACacca
gggggtactagggtagGAGAATATTGGTACCGGCAAGAACGACTTTGGGA
ATTGTAACAAGTTCTAACCTTTAGTAAGGCTTATATAtaccatatttcaa
aatctaGTCCTAAGAATTCACCATCAGAGGATCCCaaccggcacacaacg
tcaaaacaacgtcaaaTCAACgtccataacgtccatataacgttgtgtga
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AGTAATCTAACCGGGTAACTGCTTTCAAATAAATTACCAAGCAACAAATT
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TGTTTGAACCCCAGAAACTTCCAGGTAGGGTATCAAGGATGCATCTATTT
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tttttaaCCGTTTCTCATTTTAGCGAACACTGTGCATGCAGAATCTCCAC
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gataaatgaaaatacattaaccctttaagtgtcaATGtggtatatatcag
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agagaacaaactataaataagaacataaggctttgatgtcaaaatattaa
gatcaggttaagaacattttaagtctttgcggactcgaaaacgCCCGATT
TCATCAtctttagaacatttttagacttaaaacttaaaaaagattaagaa
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TAATACAGACCTGTTTTTAGTGGGTGGAATATCATTAATTGGCTCTTCCT
AGCTTATCCCCCTTGTCTAACGTTACCGATGAATTCTAAATTTATATCAT
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TAGAGTGTCGTTTATCAGTTCCTTGTTGACGttaactttcaatattatct
aaTAATGGAGCGTGTTGAACAGCAGAATGTCAATTAAGAACGCTAACATT
AAGAAAAACACTCAAAGCAAcatcaagtttcaaaataatttttatttctt
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CAAACGCCATGTGAAAGCGATCATGTCGACGATTTGAACGTCATTTTTAA
ACGACAATTACAACAGACGGATTCGACAGCTCGTGTAAATGATCTACAAC
CACAAATGAATCGACGGAATCCAAGATCTAACGGTATGTTTTTGGCACCT
ACAGGAGTTGCCTTGCAAGAACTAACTAAGGTacatttttacatcttttt
gtttttaatacaTTCTGCAATGTgcttttccagaagaaaaaacttaccaa
atactgttgaggatattgatttttcaaagtatcaaaccccctggatatcc
tctcttataaagatgcttaagtacccctggatatcgtattttttacttga
atagACACTTTACGGACTATTTTCGGAAAAGCCCAATATCAGAAAGATAG
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CGAAAATTGAACCCTTAAGAGAGACTTAGAATTTTGTGAAAGTGTTACCC
TAGCAGAGACAAAAGAGGAGAGGAAAGCTAACCCTGACCCTTAGAAAAAC
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ATTTTTACACAGAAGGTCTTGAGAAAAAGGTGGTGTCAATTTCTCTCTGT
GATTTGAATTTTTcctaatttgaagaaatttcttgaagattgaattagag
agacaattgtatttaaccctattcgtactcgGCCtaggggggctgtttct
gttcggaggtcaaattattggtaatagctcctgaaataatagagctttcg
tcatgaaattttctgtaaattcctaactattatttttagtttcaaaataa
ataaaaatttgacacctaaatattttcacaccttgtgCATGATGACATTT
CCGACAggaaaattgacacttttccaatacaaatttatttttaatgtcat
aTATCgattaaaccgtaatttattgaatatctaagatgaaataagcattt
taaactcgggcaacttttttctagaaagcctttgttagaagacaatagct
atttataagaacaaaggaaattttcggtttttgctcacttttggcatgat
gagtgacgtcatcaaaaaaattttttgtcaaaccttatgtgacaaggatc
ttgtgtgccaaatttcatcaaaaaagacccactagatcaaaagttaaggg
gtgaaacaggaaaagcccccccccccccctagttctgaaccaccCATAAA
AgtctaggttgaatagggtatACTAGGTTAAGAAatgtgtttttctattt
ttctcaaAGGTGCATGAGTATACACAAAAATGGAAAGCCAAGGCTGGTCT
CAAAGAGAAAGTCCATGCTCGACTTTACGAGAAACAAAAGTTCGGTAAAG
ACGATGCACACGTGCTTGACCAATTAGCAAGAGTTATTTTCCCTGTATGT
TTCGTCTTGTTCAATATCATTTATGGCGTCGCTGTGTATTTTCATCGACA
GAAGGATAATTTGGCAAGTGAAGGTTTTATTGCTCCAAAGAGACTACAAT
GGCAAGATCAGAATTAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000063_pilon:1375733..1387199+

>XLOC_010901 ID=XLOC_010901|Name=XLOC_010901|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3138bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000063_pilon:1375733..1387199+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ACAAACACCATGGGATTGAGGATTTCGATGCTCATATTGACGCTTTTGCT
TTACATCGAGGTTTCTATAGCAACCGGAGGATCGTCACACaacaaaacca
aaatatttcgacaacttttgcaaaaagACAAACACCATGGGATTGAGGAT
TTCGATGCTCATATTGACGCTTTTGCTTTACATCGAGGTTTCTATAGCAA
CCGGAGGATCGTCACACaacaaaaccaaaatatttcgacaacttttgcaa
aaagGTTATAACAAGCATGTGCTACCATCAGAGCATGGGGAACCAGTCAA
GGTTGAAGTCAACATGGTCATTCATGATTTTGTACCCAGGTCTCCTCTCA
GCGCAGTTATAACAAGCATGTGCTACCATCAGAGCATGGGGAACCAGTCA
AGGTTGAAGTCAACATGGTCATTCATGATTTTGTACCCAGGTCTCCTCTC
AGCGCAAATTCCTACAGCATGGATTTTCTTTATCGATCAAGATGGAAAGA
TCACAGGCTAGCTTTTAAGCATCTACTGGAACCAGGAGATGATTTTGTTC
TTGAGTTTGGAATACAAAGCGTAGTTGATAAAATTTGGAATTCCTACAGC
ATGGATTTTCTTTATCGATCAAGATGGAAAGATCACAGGCTAGCTTTTAA
GCATCTACTGGAACCAGGAGATGATTTTGTTCTTGAGTTTGGAATACAAA
GCGTAGTTGATAAAATTTGGGTACCCGGAATATCATTCGACAACCAGATT
ATGAACATCGAAACGAAAGTTCCACAAGCCAACATTCGAATGCAATTTTT
CAGCGATGGCGGAATCAGATTGTCACAAAGGTACCCGGAATATCATTCGA
CAACCAGATTATGAACATCGAAACGAAAGTTCCACAAGCCAACATTCGAA
TGCAATTTTTCAGCGATGGCGGAATCAGATTGTCACAAAGACATCAAGTT
GAGTTGGCTTGTAAAATGGATACCGGAGACTTCCCGTTTGATCGACAGTT
CTGTGATATGCGAATGTTGTCTTACATCAAGTTGAGTTGGCTTGTAAAAT
GGATACCGGAGACTTCCCGTTTGATCGACAGTTCTGTGATATGCGAATGT
TGTCTTACGCATACGATAAAGATCATGTTGATCTTCAATGGGAGAAATCG
AATTCGACTCATTTTCAAACTGTCTTTGGTCCTCAAAATACAAACATGAT
CAGAATGCGAATGAAAAGTTATTCCTTGAAAAGCACTGTCAGAACTTCAA
TGCTCGGAAAAGACGCATACGATAAAGATCATGTTGATCTTCAATGGGAG
AAATCGAATTCGACTCATTTTCAAACTGTCTTTGGTCCTCAAAATACAAA
CATGATCAGAATGCGAATGAAAAGTTATTCCTTGAAAAGCACTGTCAGAA
CTTCAATGCTCGGAAAAGATCACCACGTTCTTATCGCTACATGGAAGTTT
TCGCGGAATGTCAATTATTACATCTTACAGCTTTATCTTCCTTGCATGCT
CATCGTTGTCCTCTCATGGGTCGGTTTCTGGATTGACTATCGTTCGGTTC
CGGCAAGAACGGCTTTGGGAATTGTAACAGTTCTAAGCATGATTACTTTC
AATCACCACGTTCTTATCGCTACATGGAAGTTTTCGCGGAATGTCAATTA
TTACATCTTACAGCTTTATCTTCCTTGCATGCTCATCGTTGTCCTCTCAT
GGGTCGGTTTCTGGATTGACTATCGTTCGGTTCCGGCAAGAACGGCTTTG
GGAATTGTAACAGTTCTAAGCATGATTACTTTCACGAACACTGTGCATGC
AGAATCTCCACCAAATGGCAAATCAACTCTGGTTAATTGGTATGTCTTGG
TTAGTTTCATCTTTGTCTTTTTGGGGATTGTTGAATTTGCAATCGTTGGG
ATCACTGATAAAATTTGGAAACAGAGAATTCAGCGAACACTGTGCATGCA
GAATCTCCACCAAATGGCAAATCAACTCTGGTTAATTGGTATGTCTTGGT
TAGTTTCATCTTTGTCTTTTTGGGGATTGTTGAATTTGCAATCGTTGGGA
TCACTGATAAAATTTGGAAACAGAGAATTCAGAGAACAATCAAGGAATCA
TCAAATGTGTCACAGCATCGAAAAAACAACCACGGTTTGTCGCCACGGAG
TCGCCGTCAATCTGCATATTCTCAAACGCCATGTGAAAGCGATCATGTCG
ACGATTTGAACGTCATTTTTAAACGACAATTACAACAGACGGATTCGACA
GCTCGTGTAAATGATCTACAACCACAAATGAATCGACGGAATCCAAGATC
TAACGGTATGTTTTTGGCACCTACAGGAGTTGCCTTGCAAGAACTAACTA
AGAGAACAATCAAGGAATCATCAAATGTGTCACAGCATCGAAAAAACAAC
CACGGTTTGTCGCCACGGAGTCGCCGTCAATCTGCATATTCTCAAACGCC
ATGTGAAAGCGATCATGTCGACGATTTGAACGTCATTTTTAAACGACAAT
TACAACAGACGGATTCGACAGCTCGTGTAAATGATCTACAACCACAAATG
AATCGACGGAATCCAAGATCTAACGGTATGTTTTTGGCACCTACAGGAGT
TGCCTTGCAAGAACTAACTAAGGTGCATGAGTATACACAAAAATGGAAAG
CCAAGGCTGGTCTCAAAGAGAAAGTCCATGCTCGACTTTACGAGAAACAA
AAGTTCGGTAAAGACGATGCACACGTGCTTGACCAATTAGCAAGAGTTAT
TTTCCCTGTATGTTTCGTCTTGTTCAATATCATTTATGGCGTCGCTGTGT
ATTTTCATCGACAGAAGGATAATTTGGCAAGTGAAGGTTTTATTGCTCCA
AAGAGACTACAATGGCAAGATCAGAATTAGGTGCATGAGTATACACAAAA
ATGGAAAGCCAAGGCTGGTCTCAAAGAGAAAGTCCATGCTCGACTTTACG
AGAAACAAAAGTTCGGTAAAGACGATGCACACGTGCTTGACCAATTAGCA
AGAGTTATTTTCCCTGTATGTTTCGTCTTGTTCAATATCATTTATGGCGT
CGCTGTGTATTTTCATCGACAGAAGGATAATTTGGCAAGTGAAGGTTTTA
TTGCTCCAAAGAGACTACAATGGCAAGATCAGAATTAG

Gene-mRNA-Prot

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_010901	XLOC_010901-protein	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000063_pilon	genome	sc0000063_pilon:1375733..1387199 +

Properties


Property Name	Value
Aaloc	1312-1569:11210
Aaloc	1042-1311:9711
Aaloc	895-1041:8226
Aaloc	712-891:7349
Aaloc	556-708:6195
Aaloc	472-552:5331
Aaloc	361-468:4575
Aaloc	229-360:2132
Aaloc	130-228:1665
Aaloc	1-126:1

You are here

XLOC_010901 (mRNA) -