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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000049_pilon:1775874..1780413- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_010855 ID=XLOC_010855|Name=XLOC_010855|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4540bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000049_pilon:1775874..1780413- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTAATGAATTTGGTTGACAATTGTCCGAAAATTGTGAATATTGATCAAAA
GGATTCGGACAGTGATGGATATGGTGATGTTTGCGATAATTGTCCAGATG
TGGCAAATCCCAAACAGGTATACAAAACTTCTCCCTATTAGTAGGTCCTC
TATATCGTTTTTTGAGAGCTTTGAGAGCGTTTTTCAATTGGTATTAGTGC
GTTTCGGGTTTCATTGACTTTCAAATCCAAAGAACTAGCTTAACTTTTGA
AACAGGGTAATAAGTCACTCGTTTAAGTACTGTAACTGTGAAGTCTATTA
ACTGAAAGCACGCTTAAACCTTCCACAAGACGTCAGAAAAATGTCCATCG
ATAAACGTTGAGAAAACGTTTGACGAAATTAACTGGGAAAAAATGCAAAA
ATATACACAGATTTCCCTTTAAGAAGGAACACCTCCTTCTCACAGACCCA
CTGGGATCCCTTTCCACTGGAAAAATTGGTCAAAATATCGTCCCCAGTGG
AAAATTATACTCTAATTTTTGTTCCCACTGAAAATAATCAAATATGCAAA
TCCTCACTACAAAATATTAGGCTACTTTTTCCTTCCCCACTGAATTTTCT
GACTCGAAAATAATGCAATTCAAATCCCCAGCTATGAAAACATGGGAGTA
TCAAACCCCATCGAGTTTTGATCTGTTTTTTTACCCCCACTGGCTGAAAA
AACCGGGTCTGTAAGAGGGGGTGTAAAGGACGTTGGACAACTGATTTTTT
TGTCACTTTTCAATAGCGACCTGCGAATTCAATAATTATTTTCATTGTGT
ACTAAATAACGAGTTAGAAAATAGAATAATGCTACTTGGCTGAGGGGTTG
GGTGTTTTGATATTTAATTCGATAAAATCTTGAAACCATTTGCTACACAA
GCTCTAGTTAAGACATGCACAATGATATTTTTTATTCATTTTTGTCCCAG
GAGAATACAGATGGTAACGCTTATGGTGATGTTTGTAATTCTGGCAACGA
TAGGTAAGGACTGTTCATTTCTCAGGCGTCTTCCTGAAACATGAAAGTAG
GGGTATGCCCGAGCCAACAAGTTTGAAAATTGACCCTTAGAGAGACTGCA
TATCGAAAATGTTGTCAATGTTTTGACGTCTTTGCCGCCCTTAGAGAGAC
GAGAGACTATTTCCCCAAAATTTCAGGCAATATTTTCAAATTCTGGTACA
ATTTTCAAGAAATTATGACCTTTTGACGAGGGAAACGATTTTTGATTTTC
GTAATTCTTGACACCTTACATAGACTTGATTTGGTTTCTATACCCCTTTG
AGAAACTTTCGAGTGTGTAAAAAAGGGACCCTTATGGCTGACACAATACC
TGGCAGTCGTTTCTCCCCCCCCCTCCCCGGAACATGAAGCGTGATCTTTA
GCTTATTATTTTCGTCCATACGCGTGACATAAAACTTTAAGTATTATAAA
TAAATACACCTGTATATCGTTAGTGGTGTGGTTGAGAAACATTATTTTGG
ACAGGGTATCTAAAAAACAAGCATAGGGACGATCTTGTGAAAAAAGATCT
CCTTATTTGCTACAACAAGAGCTTTAGAATTTTGACGGTGGAGTTTCCGT
TTCTCGAACAGGAAAAACCAGGGTAACTAAAATTTATGTTATGAAAAATT
CGATGAAAAAAGATATGAGCGAGTTCGAGGAGACATTCGATAGAGGTTCG
AGTTGTTGAGCTACTGTTAAAGGCTTTGTTTTTGTTTGTTTACTCATTAA
TTTTAATTCATAAACTTTTTGATTTTGAATTGAGACAGATGTGGAGCAAG
ATTGATCAGAAAGAGGAAAAGAAAAACATTTTTAGCTGATATCAGCATGG
TATAACAAAACAGACACCGTTCTGATATGAAATATGTGTCTGATATGAAA
CGGGAACACTTATATAAAAATAAAACCTTTAATTCTAGTTTTTGACAATT
TTTGAATATTTTCAGAGATCGTGATGGTATACCAGACGAATATGATAATT
GTCCACAACATTCTGATACGCAACATCTCGATTCTGATGGTGATGGCAAA
GGTAAGTAAGGCGTGGTTGATTGAGTGCAATGTTGGTTTATAGTTATTGC
ACCATAGGGATCGCGGAGGATTCTTAAAATAGATTTTTGACCACGTTCGC
ACGTTCACAAGTTATGTTCCGTTTCGTCAAAAAAGAAGACGTTACAAAGC
AAAACAAATTGAAACGATTTCGCTCCACTATTTTCATCGGAACGGAACTT
CTTCGTTTTCTTGCTCCGAAACGTTACGAAATGAAAATGAACACTTCCTA
TCCGTAATAAATACCACACCGAAGAGATACGAAACTGTAACGTCTGAACA
TGATTTTTATCATCTGATTCTAGGTTCATCTTTAAGAGGGTAATAACAGC
AAAAGAATGAGGGGCCATTTATTAATTTGGTTCATTCCTTGTTAAGATAT
ATCACATTTTGAATATCATCATTCTCCCGGGAAACTTGATTTTGTCACTT
TTCCAATCATTTTTCCCTCGTCTCACGCGGAAGATTAAAAGTTCGTAAAC
TTGCCGCCTGTTTCCAGCAGAAACGCAACATAAATCTCTTTTAGAGTTGT
AGCTTGACTTTTCTTTGCATAGAAACAAAATAAGAATCGTTCCTATCCCT
TTTTTAATATTTTTATTTGTGAAGTCTGCGACCGCAGTCGAGGGCGACCC
GAAGACTCCTCTTTCGATAGCTATTTACCCGAATGTAGGGGCCCTAGATT
GCTTCACTTACCCTTGATCCTTCTCTTAATTACTAAGCATCAAGTAGAGA
GGCCGGGGGGGCACCGTAGCCGGATGCTCTACCACTGCACTACGGTCGCT
ATACTCTTCTTAATTCCAGGTGATGTTTGTGATGATGACGATGATAATGA
TGGCGTGAAAGACGAAGATGATAATTGTCGTTTGATTTCTAATCAAGATC
AAAAGGATATCGACAGTGAGTCAGCTCATCATAAAAATTATAATTTAAGG
CTACCATCAGCATCACCATTTTAATCCAAATAGAAATTATTTAAACACCC
CCTCTCAGCTGTAAAACTGTTCAAAATTTCCTCTCTAATCTTCCTATCCC
GGGGGGGAGGTACTAGGTACTACCCTTGCCAACCGACGGGGTTTGCCACT
GAGTTTCGAAAAATGGACGCTCTGTTGGACTCATTTTTTTTTATATTTTA
CCAAAATTTCCGACAAAAGTGACCCTGAATTGGACTGAAATTCCAAAATT
TTCTAAATATTTTCTACCTCTTTCCCAAACTCCCCCAAAAAGGTTCGAGG
AACTGTGTTTTTTGATACCCTACCTGGGACTCACGGAGATGAAAAAGGTA
CCCCGACCGGCACATCCCTGTACCCCTTTTTGACCAAGTACCCCCGGGAC
TCCTATAGCTCCTTAGAATATTGGTTAGCCATTAAGAATATTATTTCATA
TTTAAACAATAGAGAACGGTATAGGGGACGTATGCGAAAGAGATTTTGAC
AAAGATGGTACCACACATGACGATGTATGTAAAATGAACGGACAAATACA
GCATGAAATCTTCTCAAGTCACAGTCCTTCCATCATTCTTGGCAATATGG
ATAAAGAATCACATCCTCCACCTGTTTGGACGACTAATGACAAGGTGATA
TTGGTGATAATTTCTCATAATTGGAACTTTATCGTGGCTTGGGTTACGAG
ATTTACGTTTGACTACGTTTCGAGAGGTTCTACTCCCATCATACATGGTG
CAATGTGAGGGATGTTTTCTCCACTATTTGTAATAAGACCTTCTATCCTC
CACATTGCCCGATGATGGGTGAGATAAAAAAAAAGAGGCTTCTGAAATTT
TTCGAAAATTATTAACAGGTTTGGGACGTTTTTCTTAAAAAAAGTAGAGT
ACTAAAATTTGTTCATTTCATTACTTTTTGCTTGAATTCTGCTCCGCTAT
CGATATAAATTAAGTCGTGTCAGCACGAGTCAATGAACCCTGGCTATTTT
ATTGAATTCTGTCATTCTTTAACTCCATCAAGCGAGTAATGCACAGTAGC
ATGGTGGCAGGGGGCAGTGCCCTCCCCCAGCGGCCGATTTTTTTGGGGGC
GCTAAAATACAAAGGGCCCCTTTGCTCTTTTACACCTTAGATACGGCAGT
TTTCGGCCAAAAAAAGAGAAAATACCACAAAGTTTTCGTGCTCGCTTTGT
CTGCGTAATCTTTACAAAGATATTTATATTTCATAGGGCGCGCCAAAATC
ATAATATTCGACCCACCACGCTACTGATAACACAGTATTTCTGATGATGA
TAGGGGAAAGAGTAGATTCTTTTCAAGGTTAGACTTTTAATTTTCATTTT
TTAAGAAAAGTTCTAATTTAAAAACTACGAATCTACCCTTTCCCCTATCA
TCATCAATTTCATCTACTGACTATAACGTAAGATACATGGATATGATAGG
GCAAAAGAATGATATCGTTAATTTATTCGTTTTTTTAAGGGAAGAGAAGT
TATTCAAGAAATAAATGCTGCACCGGCAATCCTATTGAGT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000049_pilon:1775874..1780413- >XLOC_010855 ID=XLOC_010855|Name=XLOC_010855|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1170bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000049_pilon:1775874..1780413- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTAATGAATTTGGTTGACAATTGTCCGAAAATTGTGAATATTGATCAAAA
GGATTCGGACAGTGATGGATATGGTGATGTTTGCGATAATTGTCCAGATG
TGGCAAATCCCAAACAGGTAATGAATTTGGTTGACAATTGTCCGAAAATT
GTGAATATTGATCAAAAGGATTCGGACAGTGATGGATATGGTGATGTTTG
CGATAATTGTCCAGATGTGGCAAATCCCAAACAGGAGAATACAGATGGTA
ACGCTTATGGTGATGTTTGTAATTCTGGCAACGATAGGAGAATACAGATG
GTAACGCTTATGGTGATGTTTGTAATTCTGGCAACGATAGAGATCGTGAT
GGTATACCAGACGAATATGATAATTGTCCACAACATTCTGATACGCAACA
TCTCGATTCTGATGGTGATGGCAAAGAGATCGTGATGGTATACCAGACGA
ATATGATAATTGTCCACAACATTCTGATACGCAACATCTCGATTCTGATG
GTGATGGCAAAGGTGATGTTTGTGATGATGACGATGATAATGATGGCGTG
AAAGACGAAGATGATAATTGTCGTTTGATTTCTAATCAAGATCAAAAGGA
TATCGACAGTGATGTTTGTGATGATGACGATGATAATGATGGCGTGAAAG
ACGAAGATGATAATTGTCGTTTGATTTCTAATCAAGATCAAAAGGATATC
GACAAGAACGGTATAGGGGACGTATGCGAAAGAGATTTTGACAAAGATGG
TACCACACATGACGATGTATGTAAAATGAACGGACAAATACAGCATGAAA
TCTTCTCAAGTCACAGTCCTTCCATCATTCTTGGCAATATGGATAAAGAA
TCACATCCTCCACCTGTTTGGACGACTAATGACAAGAGAACGGTATAGGG
GACGTATGCGAAAGAGATTTTGACAAAGATGGTACCACACATGACGATGT
ATGTAAAATGAACGGACAAATACAGCATGAAATCTTCTCAAGTCACAGTC
CTTCCATCATTCTTGGCAATATGGATAAAGAATCACATCCTCCACCTGTT
TGGACGACTAATGACAAGGGAAGAGAAGTTATTCAAGAAATAAATGCTGC
ACCGGCAATCCTATTGAGTGGAAGAGAAGTTATTCAAGAAATAAATGCTG
CACCGGCAATCCTATTGAGT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000049_pilon | genome | sc0000049_pilon:1775874..1780413 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 535-585:52 |
| Aaloc | 355-534:1077 |
| Aaloc | 259-351:1670 |
| Aaloc | 172-255:2575 |
| Aaloc | 118-168:3591 |
| Aaloc | 1-117:4541 |
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