XLOC_010851 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_010851
Unique NameXLOC_010851
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000049_pilon:1862683..1873927-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_010851 ID=XLOC_010851|Name=XLOC_010851|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11245bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000049_pilon:1862683..1873927- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TCGATTTTCTAAATGCCAGTTCCAAAGACTTCAATCGTCAGAATAGTGAA GACTCGGTCGAGACAATCCCACCGTCAACAGCTCCGAGTGAGGAAATTTC TACCGATGAAAATATTGAAACTTATAATGAGGGAGGAACAAGCAAACCTA TAACTCGAGATCTAAACACAGTCAGTATTAACCAGGAGAGTGATTCTGTA AATGATTTGTTGACCCCAACAATAAGCTCCATCACTACAAAGAAAACAAC GAACCATAGAGATTCCACAACTGTAATATCTTCACTACTGGTACTGCGAA AAACAAAATTTAATTCACTGGAAGAGACTATTACTTCAAGACTATTACTA TTACCTACGACTACAAAAGCACCGATAATTATAACAAAACAAACAAAAAC GGAGTCTTCGATAAAATTTGGAAAGCTCTCGACCGTAAAATTACCGCATA GGCCTTCCAGAAGACATTTAACTTCATTTCCTGATGAGAAAAAATTTGAC CGATCTCAGAAATTGATGGACGTTGATAATAAAGATGATTCTTATTGCCC AAGACAGTTTCAAGACTGGATAACAAAGTCCAATGATGAAAAACTATTTT CAAATGACCAAGGACTATCTATTTTCAAAAGAACATGGTGTAAGCGTGAT ATACAGGATCATTGTCGGCCAAAGAATCTCGAAGGACAATTAATAGTTAG AAGACAAATCATGAACCTAGACTGGATTTATAAAAACGAATTAAGATTCG TTCAAAAAGGAGGCTGGTTCATGCCAGCAAATTGCCGTACAGACCATCAT ACGGCAATCTTGATTCCATTCCGTAAACGGGAACATCATCTCCCCGTATT GCTACGTCAGTTGCACGCCATCTTACGTCGTCAGCAGATTCACTACCGCA TATTCGTAATCGAACAGTCAGACACGCATTCTTTTAACCGTGCCAAATTA TTCAACGTTGGATTCAAAGAGGCGTTACGTTACTTCCCGTACAACTGTTA CGTATTTCATGACGTAGATCTTGTACCAGAGAATGACCGTATCTCGTATA ATTGCCGTCAATCTCCATCACATTTATCCGTAGCCGTTGATACAATGGCA TACGAGCTGCCGTACAAAAAAATATTTGGGGGAGTAGCTTCAATGAGTAA AGATCATTTCGAACTTTTAAACGGTTATTCGAACGCCTTTTGGACGTGGG GCGGAGAAGACGATAACATGTCTCACAGAATTCGAACGGAAGGTCTGACG ATATATCGGCAATCAGCAAATATTGCTCGATATACTATGTTAACTCATAA AGAAGCTGAGCGGGAAGACGTAGATGATCGAGTTTCCTTTTTAGAGAAAT CATATGAATATTTAAAAACTGACGGACTGAATTCATTACGTTATAACGTT TTACGCCGGGCTGACGGTCAACTTTTCACACGGATCAAAGTTGATTTGTT AAAGGATGAAGAAAAAACTTTTGAATAAAATTGTGGGTCGAAAGATTATT AAAATTACAGTTGATGCTCTATAATTCGAGGTTCTACTATTATATAGGCT CCCTTCGATGAAATTTAACTCCCTGTCAACAAGAAACTGTTATAAACGAC GCCCCCTTATTCGATGAAAATCCAATTATTCCCCTTGAAGATCGAATTAA AGAGTGTCAACTGTATTTCTTTATGAATATCTTTGGGGCCTTAAAATTTA TTTTATTTATATAAATCGACATATTATAGATAGGATTTCTTGAAATTTTT TGATAAAATGCATTGAGCCGACTCTCTATCAGAACGTTTAAATAAAACGT TTTATTTTACTTGTTACACTTCTGTTTCTAAAAGCTGGCGTGTTTATACA ATTATGGTCATAATATTTGGGGAAAAAGGGAAATTCCCATGAACTTATTG 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AACAAAAAATATGGGAATATCAATCCTCATTGAGTTTCAGTCCATTATTC TCATCCCCACTGGCTGAAAAAGTCCTACCGAGTCTGTGAGAAGGGGTGTA TTTTAAGGGGGTCTCAAAAGTCCTCCCCCCTCCACGCAAAGATGCTTCCC ATATTAAAATTGTTTTCAAACTCAAAATTCTCCTTGTTTTCAAACTTACA TTGTTCTTTTGGCAGGACGGTCAGATAAATCGAGATGGTGATTTTTCTTC GAAAATTATCCAAGGTCTACAAGAAGGATGGTATTGGGCTTTTATTACTC AAGGAACTCACGGGTAAGATTCTTAAATTTTTATACCAAAAAAAATTCTT GAGATGAGAGTTTTCATTTGGCTACATATAGATCTTGGTACCAGCTAAAT AACGATCGCAATAATTAATTTCTTTTTTATAAACAATCAGGTTAGGTTCA TAAGTAGCTGATTTTTTTTCACGGCAAACGATATCCCTTGATCCAATGAG CATGAATATGTTATAATACTAGGGGTGGTCAAAGAATTCTTCAGAAATGA GCTAATATGCCAAGAAGACCCAGGCTTAACCTGAAAATTGACCAAAATGT TTAAAGGCCAATCCCACTATTTTTTCGAGTTAATAAACAGCCTGGATCAG TTTTCGTAGTTTTATGTAGAAGATTAAATAAGATAAAACTTAAGATTTGT TATATTTACAGATACGGTGATTTCAAGCCAGTTCACTTTCATTCTCGATT GGTTGCTGTCCTCTATATTGTTGTTGCCATGGTGATGAACTCACTTCTGG TTGGTGCAATCGTTGCGAATTTGACGGCAACCGAAGAGAAAGCGACAAAC ATCAAAATTTATGGGACTAAGGTGATGATTTGAATGAAATTATATATTTC GATGACCAACAGATATCTAAACTCGTGAGGCTACTGTAATGTATTTCGCA GATACAAACAAGCCTTGACATCTTGTTGTAAAATCAGATCTACTCCCATC TGGCATATAGCGTTGTTTCAACGTTTATATAATATTCACAACGTCCATAT AGCGTTAGATAAACGTCAAAAAAATCTAAAGCGACAAAAAGCTTAGGGCT CCAATTTTTCTTGTTTGGGAATAATGTGACGATTCCTCTGAACTCAATGA TTACTACGCAGGCAGAATGTTAGCTAACATAGGTAACTTTTAGCCTCGAC ACCGCTACCCTTAGCGGTGATATCATTTGGTTTTGATTCTTTTTTCTTTT TTTTTTTTATAAATGGTAGAAATGTTTCCTCTGGTGTTGCTTGGTGCAAA CGATGTGATATTCTGTTGTCATCGGTGTTCGTCTTAAAGTTTTAACATGA GAAACTACAAAAACCATCTCTAAATATCAATTAAGCTTAAAACACCTTTT CGACCGTTGTCGCGCGGTATTGTGCGTTCCACTTTATTACTTAATCATCC CACTAAACTCGATTCAATCCTTTTTTTAAACCTTTTTCTACTACCTGTAG GAGTGAAAAGACTGAGATGGTTTTAGGGTGGTAAAACGGACAATGGTCGA AAATGTGTATACTTATCATAATCTCAAGTGGGTTGATGCTTTATTCATTA TATCCATGACGAAATTTATTCTACGGCAATCTGTTCTCTTTAGCTTAAAT TTACCACTACTGGCAAAAATCGGGGTGTAACTGTAGAAAACATTGCGTCA TGAATATCGTGAATAGCTTGGTGGAGTGTGTCAAAAAGAGCTTGTAATCT AATGTTTTTTTTTCAGCTCGGTGCAATAAATGGCTCATTTGAAGAACATA TCGGTTTGCTAAGGAATGGAAAAATGAACACAGGTTATATACGTGTTATA TAATATCCAACTATATAAGGATATAAGGTTTTCAATGGCCAAAATATTAG ATACAAGTTATAAGAACAATTTAAGACTTCACGGACTCTAAATTTCTTAA GAAATCCCACAAAAATTTTCATAAAATGTTGAAAATAAGAGCATTTAAAA AAAATCTTTAGGCTTAAAATTTAATTTGATTTAAGTTGTGAACATTCGAA GGCTTAAAATTTATGGATTTTCTTATTTTACTCATTTTTGATAATATTTC ACTCTTGACTATCTTTCCAACAAGCATTGAGCCACTACTTGAATTAAAAT TCAAAAGTTACAGCATTTTCTTTAATTCCTCTGCAGATCAAATAAAGACA GGCATTTGCAATTATGGGTCAATATAGCCAGTAGAAAAAAAATTTAATCG TTAAATTCGTCATCTTCATGACGTAAAGACTAGAAAACTAGTCTGTTAAT TAATCATGTCAGAGGGCGGGAACATATAGGTGGTGGGCGTTTGCTAGAAG AGGAGCTGCGTAGGAGAATGATTAAAAGTTGGTGAGAGGCTGTTGATTAA CAATGACTTTCAGCCCTTGCCACCGATAAAATTTCTTTCTACGCTTACCT AACTCCTGGGCTCACTTTTCCCGCGTGATACCGTTCCAGCCCAACTGGCG TGCCAGTCTACATGACGTAATGTTTTAAATGGAAGCACCCAAAAAACACC CGATGTTTGCCACCGGCACTAATTTTGAGCCTAATCAACGTTCGGTATGC TACCGTATAAATACTACTTCATGAATGATTTTATTTATAGAAATTTTATT TTCACTTCTTTAGAAAGGAATTATACTTCTGCGGAAGAGCTTCGCCAAGC GTTACTCTCTCATCAAGTCGAAGGCATCCTAGTGGACGCATATTCAGCTG GACACAACAACTCTATCTTTCATCATCCGCTGTTCAGAGTATCCGATGTC CTTTACTATCCGCGATCCTATGGGTTTGTATTTGCAGGACAAATGTCCAA TATGGCGACAGAGGCACGTGACTATATTGCAGCCAACCAACAAGACATTT TGAACTATGTAGCACAGCACACATCTAAAAGCAAGGTATATTCATCACAT ACAACCTCAAGGTCAAATCAGTTTTCTGTTATAGCTTTCGCACTGGAATC TCTAAATGAAGAATCTCTTAACAGTAAGTTATATTCTTCCCCAGACGGCA CACAACGTCAAAACAACGTCCATTTGACATTCATGACGTCCAAATAACGT TATTTGAACGTTAAAACAACGTTATGGGTCAGCTGGGGCGGGAAATTTGA AAACATAAACTCCTTAAAATGATAACAATGCTCCAATCCTAAATATCTTT TCAACAAGCACAAAACTCCTATTTGATTATATTTCTATCAGAAGTTATAG CCTTTGTTGTCTCCGCTCAACATTATTTCGAGTACAGAATTTGTGGATAG GTAGGCCAGGGATATGACCCATACCGCACGCATCTCCATCACAGATATCT TATATAAAACACTAGATAGGGCTACTCTGTTCCTATTTGAATCAAAATAA TCCCCCATTTTTGATAAGTAGACCATAGTTCGGCGTCGGCAATTTGATCG ATCAAGCCTATATTTCACCTCGTCGCTTCACGTCATTCAGTTTTTTTTCC TTGGTTGAACAAATTGCCGGTACCGAACTATGAACTTCTGTGACCTACTA CAAAGATCTACAAAAATGGCGCATTATTTTGCTTCACCTACTGTTGCTTG AGAAATACAGAGAAGCTCCATTTAGTGTTTTATATAAGGTATCTATGATA TCTATTGGCGGGATCATCCTATTCCTTCCAATGTCACTTGAAGGTTTTAC AGTCAGATTAAGGTTTCTTATTTCATTTTTCATGAATGTTTCATCTAGAA ACAAGAACAGCAACAACCAAAATCCATTTTTGATTCAAACACGACTGTTT ACCAGACCTCCTTACGTATTATGGGAAGTTTAATCCTTTGTGCAACAGTG GGCGGTTTGTTCTTCCAATATTTTGTCATCGTTAAGAAGAAGAGAAAAAT ATCTCAATTAGGTGAGTGAGTGATGTAGCAATTACTTCTAGTGTTATGAG CAGCCTAACAGATAAATTTGACTAAGACCCTGTGGGACCCCAGCCTCACT GAAAATTTTGGGCAAAAAATTTCGTCCCCAACGAAAAAATACCCTACAAT TTCAGCTCCATTGAAAAAAATGACTTTGTTTTCATCCCTATTTTAAAACT AAATGGAAAAAAAAGTGCATCCATATAACCATAACAATGATTTGGTCGCG TAAATATTTTTGAATATAATTGTTGTAGACACCTTGTAACAACTCGTTTT TCTCATCGTTTATTTTCTACTTTTTTCCATCTTCAGTGGACACCAAGCAT CGCTATCAAGAAATGAACAATCTTGTGACGTCATTCCAACAAGGAATCAT CCAATCAATGAACACATACGAGCAGAACAATAAAAGCATTTGTGTTAACT ATTATCTGAGAAAAATGAAAACGAAATCTAATTGGCTAGCTAGGAAAATA TACAAATACGAGCATAAAGATGAACGCCGTAGAAGAATTTTAAAACACCG CGATGGAGAGCTGGGATCTGTTACAGCGACACTCCAACGTAGAGTATTTG TAGTTTCGAACGCACCTCCATGTTGCTCTAATGAGGAGCGACAAGATTCG ATGTTGACTTTGACTACAGATGTCGATGGTTGTAAAGAATATTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000049_pilon:1862683..1873927-

>XLOC_010851 ID=XLOC_010851|Name=XLOC_010851|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2772bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000049_pilon:1862683..1873927- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAGCAGAAAACAGTCGGAGAAACCGTAAAACAAATCGATCAATTTACAGA
CATTATTTTCCCGATCGCTGCCTCTACACATGCAGAACTTTTTATGAACA
GCAGAAAACAGTCGGAGAAACCGTAAAACAAATCGATCAATTTACAGACA
TTATTTTCCCGATCGCTGCCTCTACACATGCAGAACTTTTTATGAACTAT
CCGTTCATTCGACTGATCGAACACCCTGGTATTGTTTTGATAACACGTGA
CAAGCTCCTTCATGAAGTGGTCGTTAACAAGATTGTTTCTATACTCAACT
TATGGCCATTGGTCATACTCGATATCTTGATCATGCTGGTATCTGGTTTC
TTCGTATGGCTATTGCTATCCGTTCATTCGACTGATCGAACACCCTGGTA
TTGTTTTGATAACACGTGACAAGCTCCTTCATGAAGTGGTCGTTAACAAG
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TATTGGGCTTTTATTACTCAAGGAACTCACGGGACGGTCAGATAAATCGA
GATGGTGATTTTTCTTCGAAAATTATCCAAGGTCTACAAGAAGGATGGTA
TTGGGCTTTTATTACTCAAGGAACTCACGGATACGGTGATTTCAAGCCAG
TTCACTTTCATTCTCGATTGGTTGCTGTCCTCTATATTGTTGTTGCCATG
GTGATGAACTCACTTCTGGTTGGTGCAATCGTTGCGAATTTGACGGCAAC
CGAAGAGAAAGCGACAAACATCAAAATTTATGGGACTAAGATACGGTGAT
TTCAAGCCAGTTCACTTTCATTCTCGATTGGTTGCTGTCCTCTATATTGT
TGTTGCCATGGTGATGAACTCACTTCTGGTTGGTGCAATCGTTGCGAATT
TGACGGCAACCGAAGAGAAAGCGACAAACATCAAAATTTATGGGACTAAG
CTCGGTGCAATAAATGGCTCATTTGAAGAACATATCGGTTTGCTAAGGAA
TGGAAAAATGAACACAGCTCGGTGCAATAAATGGCTCATTTGAAGAACAT
ATCGGTTTGCTAAGGAATGGAAAAATGAACACAGAAAGGAATTATACTTC
TGCGGAAGAGCTTCGCCAAGCGTTACTCTCTCATCAAGTCGAAGGCATCC
TAGTGGACGCATATTCAGCTGGACACAACAACTCTATCTTTCATCATCCG
CTGTTCAGAGTATCCGATGTCCTTTACTATCCGCGATCCTATGGGTTTGT
ATTTGCAGGACAAATGTCCAATATGGCGACAGAGGCACGTGACTATATTG
CAGCCAACCAACAAGACATTTTGAACTATGTAGCACAGCACACATCTAAA
AGCAAGAAAGGAATTATACTTCTGCGGAAGAGCTTCGCCAAGCGTTACTC
TCTCATCAAGTCGAAGGCATCCTAGTGGACGCATATTCAGCTGGACACAA
CAACTCTATCTTTCATCATCCGCTGTTCAGAGTATCCGATGTCCTTTACT
ATCCGCGATCCTATGGGTTTGTATTTGCAGGACAAATGTCCAATATGGCG
ACAGAGGCACGTGACTATATTGCAGCCAACCAACAAGACATTTTGAACTA
TGTAGCACAGCACACATCTAAAAGCAAGAAACAAGAACAGCAACAACCAA
AATCCATTTTTGATTCAAACACGACTGTTTACCAGACCTCCTTACGTATT
ATGGGAAGTTTAATCCTTTGTGCAACAGTGGGCGGTTTGTTCTTCCAATA
TTTTGTCATCGTTAAGAAGAAGAGAAAAATATCTCAATTAGAAACAAGAA
CAGCAACAACCAAAATCCATTTTTGATTCAAACACGACTGTTTACCAGAC
CTCCTTACGTATTATGGGAAGTTTAATCCTTTGTGCAACAGTGGGCGGTT
TGTTCTTCCAATATTTTGTCATCGTTAAGAAGAAGAGAAAAATATCTCAA
TTAGTGGACACCAAGCATCGCTATCAAGAAATGAACAATCTTGTGACGTC
ATTCCAACAAGGAATCATCCAATCAATGAACACATACGAGCAGAACAATA
AAAGCATTTGTGTTAACTATTATCTGAGAAAAATGAAAACGAAATCTAAT
TGGCTAGCTAGGAAAATATACAAATACGAGCATAAAGATGAACGCCGTAG
AAGAATTTTAAAACACCGCGATGGAGAGCTGGGATCTGTTACAGCGACAC
TCCAACGTAGAGTATTTGTAGTTTCGAACGCACCTCCATGTTGCTCTAAT
GAGGAGCGACAAGATTCGATGTTGACTTTGACTACAGATGTCGATGGTTG
TAAAGAATATTGATGGACACCAAGCATCGCTATCAAGAAATGAACAATCT
TGTGACGTCATTCCAACAAGGAATCATCCAATCAATGAACACATACGAGC
AGAACAATAAAAGCATTTGTGTTAACTATTATCTGAGAAAAATGAAAACG
AAATCTAATTGGCTAGCTAGGAAAATATACAAATACGAGCATAAAGATGA
ACGCCGTAGAAGAATTTTAAAACACCGCGATGGAGAGCTGGGATCTGTTA
CAGCGACACTCCAACGTAGAGTATTTGTAGTTTCGAACGCACCTCCATGT
TGCTCTAATGAGGAGCGACAAGATTCGATGTTGACTTTGACTACAGATGT
CGATGGTTGTAAAGAATATTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_010851XLOC_010851-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000049_pilongenomesc0000049_pilon:1862683..1873927 -
Properties
Property NameValue
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