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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000112_pilon:129635..135918- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_010673 ID=XLOC_010673|Name=XLOC_010673|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6284bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:129635..135918- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTGTTCATTTCCGTAGCTTTTGCTTATGAAACAGGTGAGATGGTTTG
CCATATTTTTTTCGTAATTTGGGACTGCTGCATTAAAGCCACAATCTTTT
CGTGCACCTTGCTCGATTGGTATTAAGGTGCTTTTAAAATTGACCGGATG
CCAACCAAAAGGTTTTTAATTTTCAATTTTGTGAGAAAAATCTTGTAGCC
GGTGGAAATCAGGTTTTCCCTAGACACCAGATCATGATTCAGAAACTGGT
AGGTTGTTTTTTTTTTACTGACAAACTTTGCCTCCGTTGGACTTTTAACA
TTTTAAACTGTACTTCCTTATCTCAGTCAGTTCCTGATAAGGGCTGTATT
TCTTCAACTGTATTTAGCATCGTGTATAACTTCTTCATTAGCTTAAAAAT
CTTTCCCGACACTTTTCCCTGTTAGATTTTTCCCCTTATCAGGTATTGTA
AATTAACTTTTCAGGAGATGCTCACAGTGACTGTATCAAAGGCGTTGTAG
CGCCTTCATGTAAACCCTACTATTACGTCACAAAGAGTTATCGAAGATAT
GATGGTTTATGTAATAATCTGAGGTTTCCACATGTTGGTGCAGGTCGTAC
ACCACTTCGGCGATTAATATGTAAGTACCGGCGAGCTGTTCGAATTGATT
GATCAATCGATTGTTTCATTGAGTTGAAGTTTTGAAAGTGTAAACAAAAC
TCATTGAGTGATCAAAGTCTCCCTTCACACCACTGCCATAAACACTCCCT
GCTCACAGACCCACTGGAAACCCTTCCCACTGGAAAAATTCTCCAAAATA
TCATCCCCGGTGGAAAATTATCCTCCAATTTTTGTCCCAACTGAAAATAA
TCATATAAACCAATCCTCACTGCAAAGTATTTACTATTTTTCCAATCTCC
ACTGAATTTTCTGACTTTAAAACAAAAGAATTGAAATCCCCATTCATAAA
GAATATGTGAATATCAATCCCCATCGATTTTCAGTCCGTTAATTCTATCC
CCACTGGTTGAAAAAAATCCTATCGGGTCTGTGAGAAGCCGGGGTGTTCA
TAATCAACCTTTTGTAACTCTGTGATAGGTTTGTTTGGGTAAAGTTTCAA
GTGTATATACATATACGCGCAAAAATATTCTCCTGGTCTTGTTACTTCAA
ATACAGTGCAATCTCCATAACTCGAACACGCACCCGGGGAACACGAATTT
GTTCGATTTAATGAAATTTTTAGATATTGAGTATTGTTTGTAATTGTTAA
TTGAAGAGACTAGGAAAACTTTTCGAGTTAAGAAGACATTTGAGTTACAA
AGATTCAAATAATGGAGAGAATTTCTTTTTTTCCACAGGGGCAAATTACG
TTGATCAACGTCAGGTGGACACGCCCAGAGGATTCCCTGGTACCAAACCA
CGTGTACCGCCCGCCAACAAAGTCTCACTTGCTGTATTTCACGCCAAACA
AAATGACGATGGAAATAGATGGAAATTATCCACTTTGTTCATGACCATGG
GACAATTCCTCGATCACGATTTTGCATTAGTCGGGCATTCGAAATGCAAA
GCTCAAAGGTATTATGAACGCCCTTATTCAAAAGTGATTTAAGCCTTAAA
TTCAACAATATAAACTCCATTAAAAGGGGATGATTTTCATTTTCATAACA
TGGCTAATGTTTTGCCATCTGTGGTACCATATTCATGCTCTTGTCCATGT
ATTTCATAGACCGGCTTAGAATCGACATATTTACCTTTAAAATGCCTCAA
GTCATAGGATCAAAAAATCCTTTTGACTTCAAATTTGGACCACAACATAT
GGAGGAAATTTCATACATAGTTTTAGGTGGTAACTCCTACCTTGTTCATT
TGTAGCATTTGTTCATCTTGAAATATGAGGAGGGGGAGGTAGCACTCACA
TATAAAAACATACAGAGTACTATCGAGGGGTAACCTTAGCGCCTTTTTTG
ACTTGGGAATTCTTGGAGAACAATATTAGAACCCAATAATATCAGCTGCT
TGTGAGAGAGATAAAACTGCTATGGAACTTCTCATGAATAATCAGTGAAT
CACCATAAAAAGAAAAAAAAACAATGAATCACCATGTCCCCTTTTCCCTA
AAATGACCAAGGACTTCCTTGTGGTTTCAACCAATTTGCTGCCTCGACCA
CCAAAAAATTTGGGTGATGTCGAGAATTGTGTTTTTTCATGGTTAGATTA
TGGTTACCCTTAATCGGCTTTTTTGTAAATTATATCACGCCAGACTAGGA
AGTTTTGTATCATTATTTTATTACATATTGTCTGTCGCCAAACTTGTATC
CAGTCTCTTTACTCCTAGCCTATACCAGACGTCGCCCTTGTACGCAATTA
ACGTCTGTTCCACTTTGCGACTTTTTCGAATGTTTGGAGCCCAGGTTTTC
GGGCTCCGATTTTGTTCTTGGCAATCGCGATTTTGCCGTAGCTTTTAACA
GTCGTGGTGGCGGGAGCTTGGCACACACTCAGTCGCAGCTCAAGTCTATA
TGAATATATGCACCATGTCCCTACTGGAATTATGTAACTATGCGAGCTGT
TGGCGATGGAGAATTTTTTCACATAGTTTGTTTACCTTTTTCCCTTAACA
GAGATAATTATTCTAACTCTTTGAAAATCCTGGTTTTTAGTGAGGTGCTC
GCTACTTTACTCCCTTATTTTACGATTTTAATTATGAGCGCATGTCCTAC
CAAGTTCCTTGGTCAAACTGAAAAATTAAATTAACTATTGCTAAAGATAA
ACACAATATATCCTGCTCTACCGTCGTGCCATGGCAAAGAATAGCTTTTA
AAAGTCGTTTCTTTCAAGCCTTTCTTTAAATGAAGCGATATAGTCTACCC
TTTGTCAGACTTTGTATATGCATATAAAGCATTCCATTGTTTATAAACAT
TAGAGCTATTGTTTTAGGTATCACCAAATGAGTCAGGGTTTGCTTATAAG
TGTTATGTTTCTAGAAAATAAAATGAATCTCATAGTAAGTAGTCTAATAA
ACGGGGGTTGGAGGCACTTAGAGTAAATAGCAGATAGAAAAGAGATCGGA
TAATAAAAGAGGATAAAATCTTGACATAAGAATCAGCTTTCTACCACGCA
TAAAGAGGAGAGGATCGTTTTCAAATGATCAACAACCACTTAATATCCTT
GATTGTTCTTTCTGTGTGCAAATATAGTTCAACCCCACGCGAGATTCACA
ATTAAAGAATACGGTACACAGAATTTTCGATGGTTCTTAGAAAAAGTAAA
TGCTGAAAGATTGAAACCGCATTTGCTAACTGACCTATCAAATTATCCCA
AAAATTCGAAAGGGAAAATCCTTAGTGGTTTGTATCAACAATCGATTAGC
TGCTACCTACTGCACTCAAAAGGGCTAGCTAAGACTCTTGTTCCTAAACC
CCAAGACTAAAAAAACACCAAACCTTTTTGAAATGGTCGATTCACCATCA
ATTTTTTTTCAACTCTAATGGGACTAATAGTCCAGGATAGCATTATCGAA
ACCCCTACAAATCAAGCATTCCCAAAAAGTAACAAAAACTAATTCGGTTC
CGTGATTCTCTTTATACCTATCATCCTTTAAAAACCTATGGAGGCTAGGT
TAGAGATTACCAAGATGGATTGACGTCAAATTTTTTAAGGTGATGTAATG
ATTCCATTGATATAGACGCAGCCATTTTGGCATTTTCCTTCCTTGTATAA
TCGATCCAATTCCCTTGTGTCGTTCAAAGATCGAGAGGTGTATTATTTTA
TTTGGAGATTTAGAATTCATAAGTGACATACTGAATTCAAATAACATTTT
TTTGTTTGACAGAAAACATTTATAATGGGCTATTCCAGAAAAAGTTTGTA
CCCCTTATGTTGAGGAGACCCCCTGGATTTTTTCTAATTTTTCAGGACCC
ACCTTGGATTTTTTCTCTCCTTTCTTCGGACAACCCTGGATTTTCGACCT
CATTATCGGATTTATAATTCAAAAGACCAGACCTGACCCTGGATTCTTTA
TTTTCCAGACCACCCTGGACGTCACATCTGCTCAATATAGGGGGTACAGA
CTCTGGAATAGCCCAATTTTGAAAACAGCAAGAGTGAGTTTGTCGTCCAT
CTTCTATTTGGATCAGAAGATATCTCAGTTTTTCTTCTATGTGTGTAAAC
TAACGCAGATCCGTATTACGACAAATGATTTTCTGTCTACTTTTATAGCT
GTAACTCGAAAGATGCATACAAGTACCCTTGCTTTCCGATCAAGTTTACA
GACTATGGCTCCAAATGTACTCCTTTCACTCGTTCACAACCTATTTGTCA
AAAAGCACCAGCGGGTAGACGCACAGACAGACAGATAGCCAACTTGATTA
CATCTTTTGTTGATCTATCACAAGTTTATGGAGCTTCTATTGAACATGCC
AAGAAATTGAGGAAAAACGATGGTATGTACTTAGTCATTTAGTTAAAAGT
TAAATGCTTGTTATGAAACCTTTCAAATTTCAAAAGCGTGGACTACCAGT
TTTTTTGGAACAGACTTTAGTTTAGAATGTTACAATCATCGACAAAATAT
TTGAGACAAAGGGGAGCTCCCGGTGAAATTTTAAACACCACAAATGATTT
TGAAGCGCCTTAAACTACAGTTGGAAAGTAGAGTTGTAACTCTGAGTTTT
AACATGAGACTTAAGACTTAGTATCCTTAGGATCTCAGGATTTAAAAGCT
CAAATTTGCTCGAATAAGGCTTGGAATATAGCCTAGAAGCCAGCAAACCC
CTCTAAAATCGAAATATTCAATGAAAGAAAGTGGAAGTGCTAAAATAGCA
ATTCTCGCCCGAACTTTAAATTCTGAAAAACGTTAAAATGCACTAAACTC
TCAATATATTTCGACGATGATCGTAGATCAAAGAATTAAATGGATCCTTT
GTTCTATAGGTTCCGGTGAAATGGCCATGCGGTCTGGTAATCTTCTTCCA
TTATCAAACGAACCATGTGACACAATTGGAGGCTGTTCAATGGCCGGTGA
TCCGAGAGCTGATGAAAACATTGCATTATATTCTATGCATACAGTATGGA
TTCGAGAACACAATCGTGTTGTTAAGAAGCTGAGAAAAAATCATAAGACA
TGGTCCGGTGAAAAACTTTATCAGGTATAGGTCCTTTTGACTGGCTCGGT
TTACCTACAAATCAAAGGCTAAGATGTTGAAAGAAACCCTCATTTAAGTT
TGAAATTTTGGTGGATTTATGGCATTTAACGGATTCGGTACATTCTGCCA
AATCAAGCACGGGTTTTACCATCGTCTGCTGAATTAAATCTCTCGACATC
ATGCTTTTCCATTCCTTAAACGGATTTTTGTTTGTCAAATATTGATTTTA
GGCTACCAAATTAAATTTCCACAAGCTTAAATTTTTCCAGCTATTCGCCA
AATTTACCTTCCACAAAAATCTCTTGAGTTAAGGTATTTTTTACTTTATT
TTTCTGGTTTACCTGATTCGCTCTAGAAACGAATTTCAACCTCGAAAGTC
ATTTCTTTACATTTTCCACATTTAGGAAGCACGAAAGATTGTGATTGCTG
AATATCAACATATCATTTTCAACGACTGGGTCCCACGTATCGTTGATATA
GGACCTTACACTGGGTACAGCTCACGTTATGACGCAACCCTTATTAATGC
TTTCTCAACTGCTGCTTTCCGGTTCGGACACAGTTTAGTACCAAACGAAT
GGCAACAATGCAACTCAAATTATGATAAAATCGCAAAAGATATAAGTTTA
CAAAGTTCATTTTTCAATATTGGCAGTATCAATCAAAGAGGAATAGAACC
AACTGTGTATGGTCTCATGGCAAACCAATCAAATCAAATGGATACTAACT
TTGCTTTTGATCTTGTTCGCCGTTTGTTTGTACCACCAGGCCATCATGAA
CATCACGATTTGACAGCTTTGAATATCCAACGAGGGCGTGATCACGGGTT
ACCGACTTATGGTGCGTGGCGTAAATATTGCCGCCTACCGCCCATCTCTA
GCTACAAGGATCTGGAACAATACATGTCAATAGAGAGTGTGAAAAGCTTC
CAAAAGTTATACAGTCATCCGAATGATATTGATCTTTTTGCCGCTGGTAT
TGCTGAGCACAATGTACCAAGATTCCAAACTGGACCGATATTCAGATGTT
TGTTCTGGCACCAATTCAAACGATTAAGGGAAGGAGATCGATACTATTAT
CTCAATCCTGGTGTCTTCACGCATGCTCAACGACGTGAATTGACCAAAAC
ATCCATGGCGAAAATCTTGTGTAATAATTTGAAT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000112_pilon:129635..135918- >XLOC_010673 ID=XLOC_010673|Name=XLOC_010673|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3222bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:129635..135918- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTGTTCATTTCCGTAGCTTTTGCTTATGAAACAGATGTTGTTCATTT
CCGTAGCTTTTGCTTATGAAACAGGAGATGCTCACAGTGACTGTATCAAA
GGCGTTGTAGCGCCTTCATGTAAACCCTACTATTACGTCACAAAGAGTTA
TCGAAGATATGATGGTTTATGTAATAATCTGAGGTTTCCACATGTTGGTG
CAGGTCGTACACCACTTCGGCGATTAATATGAGATGCTCACAGTGACTGT
ATCAAAGGCGTTGTAGCGCCTTCATGTAAACCCTACTATTACGTCACAAA
GAGTTATCGAAGATATGATGGTTTATGTAATAATCTGAGGTTTCCACATG
TTGGTGCAGGTCGTACACCACTTCGGCGATTAATATGGGCAAATTACGTT
GATCAACGTCAGGTGGACACGCCCAGAGGATTCCCTGGTACCAAACCACG
TGTACCGCCCGCCAACAAAGTCTCACTTGCTGTATTTCACGCCAAACAAA
ATGACGATGGAAATAGATGGAAATTATCCACTTTGTTCATGACCATGGGA
CAATTCCTCGATCACGATTTTGCATTAGTCGGGCATTCGAAATGCAAAGC
TCAAAGGGGCAAATTACGTTGATCAACGTCAGGTGGACACGCCCAGAGGA
TTCCCTGGTACCAAACCACGTGTACCGCCCGCCAACAAAGTCTCACTTGC
TGTATTTCACGCCAAACAAAATGACGATGGAAATAGATGGAAATTATCCA
CTTTGTTCATGACCATGGGACAATTCCTCGATCACGATTTTGCATTAGTC
GGGCATTCGAAATGCAAAGCTCAAAGCTGTAACTCGAAAGATGCATACAA
GTACCCTTGCTTTCCGATCAAGTTTACAGACTATGGCTCCAAATGTACTC
CTTTCACTCGTTCACAACCTATTTGTCAAAAAGCACCAGCGGGTAGACGC
ACAGACAGACAGATAGCCAACTTGATTACATCTTTTGTTGATCTATCACA
AGTTTATGGAGCTTCTATTGAACATGCCAAGAAATTGAGGAAAAACGATG
CTGTAACTCGAAAGATGCATACAAGTACCCTTGCTTTCCGATCAAGTTTA
CAGACTATGGCTCCAAATGTACTCCTTTCACTCGTTCACAACCTATTTGT
CAAAAAGCACCAGCGGGTAGACGCACAGACAGACAGATAGCCAACTTGAT
TACATCTTTTGTTGATCTATCACAAGTTTATGGAGCTTCTATTGAACATG
CCAAGAAATTGAGGAAAAACGATGGTTCCGGTGAAATGGCCATGCGGTCT
GGTAATCTTCTTCCATTATCAAACGAACCATGTGACACAATTGGAGGCTG
TTCAATGGCCGGTGATCCGAGAGCTGATGAAAACATTGCATTATATTCTA
TGCATACAGTATGGATTCGAGAACACAATCGTGTTGTTAAGAAGCTGAGA
AAAAATCATAAGACATGGTCCGGTGAAAAACTTTATCAGGTTCCGGTGAA
ATGGCCATGCGGTCTGGTAATCTTCTTCCATTATCAAACGAACCATGTGA
CACAATTGGAGGCTGTTCAATGGCCGGTGATCCGAGAGCTGATGAAAACA
TTGCATTATATTCTATGCATACAGTATGGATTCGAGAACACAATCGTGTT
GTTAAGAAGCTGAGAAAAAATCATAAGACATGGTCCGGTGAAAAACTTTA
TCAGGAAGCACGAAAGATTGTGATTGCTGAATATCAACATATCATTTTCA
ACGACTGGGTCCCACGTATCGTTGATATAGGACCTTACACTGGGTACAGC
TCACGTTATGACGCAACCCTTATTAATGCTTTCTCAACTGCTGCTTTCCG
GTTCGGACACAGTTTAGTACCAAACGAATGGCAACAATGCAACTCAAATT
ATGATAAAATCGCAAAAGATATAAGTTTACAAAGTTCATTTTTCAATATT
GGCAGTATCAATCAAAGAGGAATAGAACCAACTGTGTATGGTCTCATGGC
AAACCAATCAAATCAAATGGATACTAACTTTGCTTTTGATCTTGTTCGCC
GTTTGTTTGTACCACCAGGCCATCATGAACATCACGATTTGACAGCTTTG
AATATCCAACGAGGGCGTGATCACGGGTTACCGACTTATGGTGCGTGGCG
TAAATATTGCCGCCTACCGCCCATCTCTAGCTACAAGGATCTGGAACAAT
ACATGTCAATAGAGAGTGTGAAAAGCTTCCAAAAGTTATACAGTCATCCG
AATGATATTGATCTTTTTGCCGCTGGTATTGCTGAGCACAATGTACCAAG
ATTCCAAACTGGACCGATATTCAGATGTTTGTTCTGGCACCAATTCAAAC
GATTAAGGGAAGGAGATCGATACTATTATCTCAATCCTGGTGTCTTCACG
CATGCTCAACGACGTGAATTGACCAAAACATCCATGGCGAAAATCTTGTG
TAATAATTTGAATGAAGCACGAAAGATTGTGATTGCTGAATATCAACATA
TCATTTTCAACGACTGGGTCCCACGTATCGTTGATATAGGACCTTACACT
GGGTACAGCTCACGTTATGACGCAACCCTTATTAATGCTTTCTCAACTGC
TGCTTTCCGGTTCGGACACAGTTTAGTACCAAACGAATGGCAACAATGCA
ACTCAAATTATGATAAAATCGCAAAAGATATAAGTTTACAAAGTTCATTT
TTCAATATTGGCAGTATCAATCAAAGAGGAATAGAACCAACTGTGTATGG
TCTCATGGCAAACCAATCAAATCAAATGGATACTAACTTTGCTTTTGATC
TTGTTCGCCGTTTGTTTGTACCACCAGGCCATCATGAACATCACGATTTG
ACAGCTTTGAATATCCAACGAGGGCGTGATCACGGGTTACCGACTTATGG
TGCGTGGCGTAAATATTGCCGCCTACCGCCCATCTCTAGCTACAAGGATC
TGGAACAATACATGTCAATAGAGAGTGTGAAAAGCTTCCAAAAGTTATAC
AGTCATCCGAATGATATTGATCTTTTTGCCGCTGGTATTGCTGAGCACAA
TGTACCAAGATTCCAAACTGGACCGATATTCAGATGTTTGTTCTGGCACC
AATTCAAACGATTAAGGGAAGGAGATCGATACTATTATCTCAATCCTGGT
GTCTTCACGCATGCTCAACGACGTGAATTGACCAAAACATCCATGGCGAA
AATCTTGTGTAATAATTTGAAT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000112_pilon | genome | sc0000112_pilon:129635..135918 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 853-1611:760 |
| Aaloc | 640-852:1374 |
| Aaloc | 415-636:2086 |
| Aaloc | 196-411:4945 |
| Aaloc | 40-192:5819 |
| Aaloc | 1-36:6285 |
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