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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000255_pilon:120488..126556+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_010618 ID=XLOC_010618|Name=XLOC_010618|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6069bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000255_pilon:120488..126556+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aTGACAATGGGCTCAATTGGAAGTATCAAAGATATTCTAtccatcaaaat
aaaacatcgGCATGATTCATATACGGATCAATTTTGTCGTATTTTTATGT
CGAAAATGTTTATTATCAGTGCTCTAGTGATGGGTGTGGACTTTTTCAAT
GATAAAGTATCATGCATTGTACCCAAAGAGAGTGGATTAGGTATGGATGG
TTCTTAATGGTCGTTTGGATTTGTTCTCTGTATAACTGATTCCTTCTCCG
GACGATTTTAGATTTGCGAAACTCTTTTCCTTACTTTACATAAGTTTTGT
GTCCTACCTTAGAAATTTCACTCAAATGTTCATTCATTGTTGGCAAGGAA
TTTTACGAATTCAAAATTAGCGATTTTTGTGTGTAAGAACTTTAGGTCCA
ATTTTCAGCTTCAAGGAGACTTATTGTCATGAGTAAAATAAAGGGAACTA
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AACCCTActgatgaaatttcaaaactttctcAAGACCCCGTTGATTTTCA
ACACACGCGAACTTTCTAGTATAttagtcaaatattttttaaactaaCAT
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TTTGAGGCCAAAGAGAGAACATTCCCCTTAAAAAATCGCGGTTCCTtcat
tttaaaatatatatttaagttCGTTTGTCTCGAGCCATCTTGCACACGAA
AGTATTATATTTTCTAGCTTCCTTTCTTACTCATGCAATACATTATCTAA
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TACCACGGGTCTTCGATATTTATCTGAATCTAAAAACCTTTAGGACCaga
tttttaggctgaaaaatGTTCCCTTTGATAAGCGTGCTAATTAATGGTTT
TTAAACTTGATCCCAAAAACATCGTAATAAAACAGTTCAGCGTCTGCAGT
AAACGACCCCTCTTGTCATTATAGAATACTCTCAAAGAATCATGCCTTGC
TAGTCTTATAGGTATCAAAGGTTTCTCTTAGTTTTTCCAGGTACTAAGTG
CATAGTGTGTGTCTCGTAAACCATTCCTTGACATATCATTAATTCCTATT
CTTCCTTTTTCTTGTTACTAGGTAGCGATTTCGTGCACAGTGCTTGTTGG
ATACAGGGTTTTTACATCTACACGGAGATGATGGACCGTATCGAACAATC
AGGTTATTATGGTATTCCCAAAGATATTGATATGGATGGACTGACCGATG
ATGGTCGGTTATGCAGATCAGTACCTAGAGGATCTAGACGTAAGTTAGCA
CATTTCTCTTCCGAAATTTATCCCCGCGATTTTATTAGTGAGTTTTATGT
atcagtctttttctttgaaGGAGACAGTTAATAGCTTCTGATTTATCTAG
ATTTTTATTTCCTGGGGACGACGGTCAGCACTTTTACTGTCCTCCATTTT
GCAGGTCAGAGCTGCGGTTTGTTCCAAATCTTTTCAGTCATtccaccgtc
ctcaaaagtgcagatacataaactcgctattacgCTACTGTTGTATGTAT
AGAAAGTCTTATCTAGCGCCAttatagtctgaatcgcagacctctacaaa
aaccttataaaaaagcataggtctgcttaatgctatataaggagcacgaa
tccattagtggatgccagcagcctagcaCCATTATTGAATATCGAAAAGC
CATTAATCCGCTTTGGCtaaggttggattgtttaaacATATCATGATTAT
TTAGAATTGGTTCTGATCTATCCGAATCCAGGGGGTCAACAGATTTAAAG
GATTAAAACCCAAAAGGTCTATTGTCCTCGAGGTAGGAAAATCCCTGGGA
TTCTTAGTGAACATTTTTATCTATATTAAAAGatgagaattatttttata
gaGGTGACCTTATCAAGGTCGCGTTCACGTTTTTCTATCAAAACCCTATG
ATCAACTGGTGAAATATTTAACCTCAAATTCAAGAAATTTATAAACCCTC
TATGGCCACAAAACATAAggcaaaacaattttcaatattctcGTCTGATA
TCTtcattttatgatttatttttttaatcaggACCTCGGAAAAGATTTAT
ATTCGGGAATTTGATGAAAGCTTTACAGAATGactgatattttcaaattt
acaagTTCATTTTCAAGATAAAATGACCCTTTTATATTGAGTATGTTCAA
CCTTTTCCCTAAATTATTTCCATTCGGTAACACCTTCTGCATATTGGAAC
AATCGCTAACAATAAGGATGTTAAATAAAGGTGTGTTCACCACTATAATG
AGATTCGAAATGATCCACTTCCATGGCCATAGTTTTCCCTGGTGTAATCT
ATTAATTCCAAGCCCTAAAATGTTAGGTCAATATTAACTGTCCTTaaaaa
aaCCAGTGGGAATTTAAACGaacaaaaatgctaaaaatcaTTTACTTCAA
AGACAAATCAACAATTTTCATCATATAAAGTATCACAAAAACTATTTTAC
GTAATAGTTCTCGGTAACAGTTACGAGTAcgatatgagaaatattttatg
agtTCCGAGAtctttccgtacaatattttccttAGGCTTTAGGcatactc
tttttaaccaatcaaattgcagATATTTTTGGATCGCCGAATAAACATAC
ATTTTATTCCGCTTTTTGTCCACAAAGACGTTAAGTATAATAAAGGTTGT
TTTCCCATACAGTATTATAACTTTTTCGCTCTCTTCTTTTCATCCAACAG
ATAAAGATCCACGTTGCAACATCATGCACAAGACGTTCTTCTTACAATTT
CAATGGATGCCTTTCTTCATTTCCAGTCTGGCGTTACTTCAATACTTTCC
ATACCTCATATTCAGAATCGTCAACACTGACATTATATCACTTAAAACAA
CACTTAAAAGTGAAATAGATACTGACTCCATTGTCAAAAATTACTTCAAC
TATAAAATCAATTCAATCCTCAAGATGAGAATACGTATTATATTGaatgt
tttcattaaaatggcTTACGTCTGTGTCACTGTCATGGGCTTCTGGTTGT
GTGACATGTTACTAAATGGTAATTTTTATAGTTATGGCACCAATTGGATT
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TATCCGGCAATACTTTgtcaaaaataggtgctggtaTGTGTGGGGGTTAG
GgccaaaatctttctttctagGTTATTTAAGGACGAAAACCATGAATATT
CTAGAAAATCTCTCTAAGGTTAGGAAATATTcgaaagtctctctaagggt
tacaattGTATTACAACCATGATATGATTTAACTATTTTTGTTGAGGCCC
GACTGTTCtcatttttggcactttctttcATAGGATTAAGTTGTTCTAAA
ATCATGTTTGTAATTTTAGGCTAGAtctgatacatgttttttttataagc
ataacgcttataagcataagaaggctcagatttgccgAATTCCTAAGCAT
AGCATAAGCATatgtgtcagcctgaaatatttttcaagttgccatttttt
atctgtttaaaaaggtttggtaaaggtcaagtaaaaaattccacggctag
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aatttcactaaaaacttggctcggggtgaatcataagcatgattcataag
catataataagcataaactatgcctggatgctagagaacttaagcatact
cgagcctgaccaaggggcatacacttgcttagaaaaaaaaaacatgtata
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tatcgttcttataaaaaagagggtagaaTTTGTCCACGTTTCTCGTTCGA
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CGTTTGGTATTTAGAATTATATCGCAAAATATCACACTTTCAAAAGTTAA
TTTAATTGTAGCGATGATTCACTTTATGGTGTGaagcctttcaaagcagt
gctTGATATTGCTTTGCAAATTAATATCACAGGAAAATCTAGTAGCATAA
ATCTCGTGGCGCTTTCAAAAGATATATTGCGGTGAGATCTTTCTGTGCCA
TGATATTTATTGAAGGTTctatttttacacaagtgttcctgtttcatatc
aaacacatatttcatatcaggacagtgtcagTCTATTgctatattatgct
gatataagcaaaaaatgtttttcttttcttctttctgtccaatcttgctc
cacatccgtgtcaatccaatgtgaaaaagcttgtgaagtaaaagtgatga
gtaagcaaactatatcactcttatttgaaaacaaaacctttaaataccta
ctatgaaaatttgagaattttccaaaaatttacctattctttcatatatt
ttttctaaGAAGAAATGTATTAGATTATTTAGGCTTTAAGAATCCTACTT
TAAGATagaaaaagtcaagaacatttaaggctcgaAAAGCTAAATCAAGC
TAGTTCCttgatgttcttgtaaaaaatatgTAACATGGTAACGAGACTTT
CAAAGACATGGCCTTGTTGAGTAAAATATGATGCTCATTTTTCGAATTAT
CTGGAATCAGGAGTTTTAGCATTAGATCgtgaaaattcttctttttgaat
AGAACTTCTAAAACTATGTACATTTACTCACTACTCATTGCTAGTAGGTC
ACATTCAaacaatacacttttttataagaattatataACTCCTCTGAGAT
GAGctttaaaaattcttataaaacattTAGTATTTTGAGAACGCATCTAC
GACAGTTTGTATAATTATACGAACTTTTAACCAATCGATGATCCTTGTTT
TTGCTCGACATTTCATTCGTTATTGTTCATTATATGAATCAACTTCGATA
TAGCTCCTTTGAATCGATAAAAGCTTCGATTCAGCATCttttttttGTAT
TAGAAATTTAGCCGTTATCGTCAGTTAACAATAGTATATACCGACCCTGG
GGGAACTGACCTTGACAGCCGACGGTGGCGTGCCGCTGGAATTCGAAAAG
TttaccctgtcagatatgagtttttgataaaatggtGACCCTGTCagaga
gaaaaattgaaaatttttccaatttttccaatggcaaaaatgactaaaag
tagaccaaaaaactgaaaaaaattctaatttttaccctgaaaaattgtcc
aaataaccaaaagtggaccctgtctcAACCCAATCGCCAATTATTAAATA
CAGTAGATTTGAGAAATGAACTAttcgtatttttttctttctagggAATG
TGTTATTGCCACCCATGGGTTTCTGTGAAATCCACGAGAGCTCACGAGAC
GTTCGTCAAACCTTCACCAATACCAATAAATTCGTTTGTGAAATCTCTCC
AAACATCTTATATCAATACGTATTAATTATCTTATGGTTCTTAATCGTCT
TCAGTATCATCATAAGTATTAGCGGACTTTTGATCAATTTAGTCGGACAT
TTAGTAACCGTCACCTGTTTCTTACGTCACGATAATCCGTCAAAAGAGAT
TTATCAACGTCTGACGTTCCGAGAAGTCGAATATTTGGAAATGATTCGTC
GCCATAATATACCAGTTTTTGGTGAGATTGTCCGTAAATTACAAGTGTCT
CGTGTTGATTGTCGGACAATGTCGACTTTTGATGATAATACCCATGAACT
GGAATCCTTAAAACATGACATGATGAAAAATGATTTGTCTACCATCATGA
ATCACAACCATAACAATACGGTCGCCCATAACAACGCTGTCAACAACAAT
AAACATAACCCATTGGCTAAAGCGAATGCACCGGACAAAAGCCCTGAAAC
AGGCTACATTACAACTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000255_pilon:120488..126556+ >XLOC_010618 ID=XLOC_010618|Name=XLOC_010618|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2694bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000255_pilon:120488..126556+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aTGACAATGGGCTCAATTGGAAGTATCAAAGATATTCTAtccatcaaaat
aaaacatcgGCATGATTCATATACGGATCAATTTTGTCGTATTTTTATGT
CGAAAATGTTTATTATCAGTGCTCTAGTGATGGGTGTGGACTTTTTCAAT
GATAAAGTATCATGCATTGTACCCAAAGAGAGTGGATTAGaTGACAATGG
GCTCAATTGGAAGTATCAAAGATATTCTAtccatcaaaataaaacatcgG
CATGATTCATATACGGATCAATTTTGTCGTATTTTTATGTCGAAAATGTT
TATTATCAGTGCTCTAGTGATGGGTGTGGACTTTTTCAATGATAAAGTAT
CATGCATTGTACCCAAAGAGAGTGGATTAGGTAGCGATTTCGTGCACAGT
GCTTGTTGGATACAGGGTTTTTACATCTACACGGAGATGATGGACCGTAT
CGAACAATCAGGTTATTATGGTATTCCCAAAGATATTGATATGGATGGAC
TGACCGATGATGGTCGGTTATGCAGATCAGTACCTAGAGGATCTAGACGT
AGCGATTTCGTGCACAGTGCTTGTTGGATACAGGGTTTTTACATCTACAC
GGAGATGATGGACCGTATCGAACAATCAGGTTATTATGGTATTCCCAAAG
ATATTGATATGGATGGACTGACCGATGATGGTCGGTTATGCAGATCAGTA
CCTAGAGGATCTAGACATAAAGATCCACGTTGCAACATCATGCACAAGAC
GTTCTTCTTACAATTTCAATGGATGCCTTTCTTCATTTCCAGTCTGGCGT
TACTTCAATACTTTCCATACCTCATATTCAGAATCGTCAACACTGACATT
ATATCACTTAAAACAACACTTAAAAGTGAAATAGATACTGACTCCATTGT
CAAAAATTACTTCAACTATAAAATCAATTCAATCCTCAAGATGAGAATAC
GTATTATATTGaatgttttcattaaaatggcTTACGTCTGTGTCACTGTC
ATGGGCTTCTGGTTGTGTGACATGTTACTAAATGGTAATTTTTATAGTTA
TGGCACCAATTGGATTAAATGGACCAAATATAATAATAGCATGTCACATG
ATATCAAAGTCAGGAACCATCCAAAACCCGATAAAGATCCACGTTGCAAC
ATCATGCACAAGACGTTCTTCTTACAATTTCAATGGATGCCTTTCTTCAT
TTCCAGTCTGGCGTTACTTCAATACTTTCCATACCTCATATTCAGAATCG
TCAACACTGACATTATATCACTTAAAACAACACTTAAAAGTGAAATAGAT
ACTGACTCCATTGTCAAAAATTACTTCAACTATAAAATCAATTCAATCCT
CAAGATGAGAATACGTATTATATTGaatgttttcattaaaatggcTTACG
TCTGTGTCACTGTCATGGGCTTCTGGTTGTGTGACATGTTACTAAATGGT
AATTTTTATAGTTATGGCACCAATTGGATTAAATGGACCAAATATAATAA
TAGCATGTCACATGATATCAAAGTCAGGAACCATCCAAAACCCGggAATG
TGTTATTGCCACCCATGGGTTTCTGTGAAATCCACGAGAGCTCACGAGAC
GTTCGTCAAACCTTCACCAATACCAATAAATTCGTTTGTGAAATCTCTCC
AAACATCTTATATCAATACGTATTAATTATCTTATGGTTCTTAATCGTCT
TCAGTATCATCATAAGTATTAGCGGACTTTTGATCAATTTAGTCGGACAT
TTAGTAACCGTCACCTGTTTCTTACGTCACGATAATCCGTCAAAAGAGAT
TTATCAACGTCTGACGTTCCGAGAAGTCGAATATTTGGAAATGATTCGTC
GCCATAATATACCAGTTTTTGGTGAGATTGTCCGTAAATTACAAGTGTCT
CGTGTTGATTGTCGGACAATGTCGACTTTTGATGATAATACCCATGAACT
GGAATCCTTAAAACATGACATGATGAAAAATGATTTGTCTACCATCATGA
ATCACAACCATAACAATACGGTCGCCCATAACAACGCTGTCAACAACAAT
AAACATAACCCATTGGCTAAAGCGAATGCACCGGACAAAAGCCCTGAAAC
AGGCTACATTACAACTTGAggAATGTGTTATTGCCACCCATGGGTTTCTG
TGAAATCCACGAGAGCTCACGAGACGTTCGTCAAACCTTCACCAATACCA
ATAAATTCGTTTGTGAAATCTCTCCAAACATCTTATATCAATACGTATTA
ATTATCTTATGGTTCTTAATCGTCTTCAGTATCATCATAAGTATTAGCGG
ACTTTTGATCAATTTAGTCGGACATTTAGTAACCGTCACCTGTTTCTTAC
GTCACGATAATCCGTCAAAAGAGATTTATCAACGTCTGACGTTCCGAGAA
GTCGAATATTTGGAAATGATTCGTCGCCATAATATACCAGTTTTTGGTGA
GATTGTCCGTAAATTACAAGTGTCTCGTGTTGATTGTCGGACAATGTCGA
CTTTTGATGATAATACCCATGAACTGGAATCCTTAAAACATGACATGATG
AAAAATGATTTGTCTACCATCATGAATCACAACCATAACAATACGGTCGC
CCATAACAACGCTGTCAACAACAATAAACATAACCCATTGGCTAAAGCGA
ATGCACCGGACAAAAGCCCTGAAACAGGCTACATTACAACTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000255_pilon | genome | sc0000255_pilon:120488..126556 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 775-1347:5497 |
| Aaloc | 361-771:2853 |
| Aaloc | 193-357:1224 |
| Aaloc | 1-189:1 |
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