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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000255_pilon:87179..91442- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_010610 ID=XLOC_010610|Name=XLOC_010610|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4264bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000255_pilon:87179..91442- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCACTTCAGAAATTGGACATCAATCCAAAGTACATTTCAATTCTTAA
ATCAGGTATTCTATTTGAGTATTTTACTCTGATTTTGTATCCATTTTGCT
TTGGATGAGCTATTTTCTGAATAGAATTATAGATTTTCCAGGATTACTTT
TTCTAAGATGCTCATTTACCGAGTGTGGCAGTGCCTGATTATAAAAAGTT
GACTCATTCAGCTTCTCCATTTAATTTATTCAAAATTGGTAAATTTTGAG
TGAATGCTAAAATAGTGATCTGGAGTTTTCTTTCTTTTTAGTTGGGATCT
TTACAGTTGATAAAGTACTTGTTTATTCAAATTTGGAATTGCAAAAGAAA
ACTAATTTGACCGAGTCAAAAATTAAAGAAGTGTTACATGCTGCAGCAAA
CTATGTTGTCACACAAAGAGTCAAGCAAGCATCAGTTTTAGATGTTTACA
CCAAGTCTTCAAGTGCTATTGATTTTCAGGTTATTATTTTTTTATGGCTA
TTAATAAACAATTAACCCAAATGATTCTGTTCCTCATTAAAGCAATGATG
GCTGTCTCACTCAAGCAAAATTAGTTCCTTGCAAATTTGTTGGTCTAAAA
AAGTTAGAGACAGCATGTCGGGAACCAAAAATTTTTGTTTTATTTGTGAT
AGAACCTAAATAATTAAAGGTTTTGTTTTTACTTAAGTGTTTCCATTTCA
TATCAGACACTTGTTTCATATCAGGACAGTGTCTACCTATTGTTATATTG
TGCCATGATATAAGTAAAAAAATATTTTTATTTTCCTCTTTCTGACCAAT
CTTGCGCCACATCCGTGTCAATTCAATATCAAAAAGCTAGTAAATCAAAA
TTGATGAGTAAGCAAACGATATCGCTCCTATTTAAAAACAAAATCTTTAA
GCCATGAAAATGAAACTTCTATCATTTATTATTTTTGCCCTGTCGTGAAA
AGGAACAAAAGATTTTTTCACTATTACAATAATCCAAAATAACCTAAAAT
AAGTAAAAAATAGAAGAATGTTTTTCCGTTTTCATTTTTAGTTGCATATG
GGGACAGAGACAGGGTAACATTTATTGCAGATTATTAACCTGTAGGTAGT
TTTTTGAAGTGGTACCCTAACGGTAGCACTACTCAATAGTAGTGAGGGTA
GCACTACTCAATAGTAGTGTAAAAAATTCATTGAGAGAGCTTTATCGACT
TCTCCTTAAATACCTGTAATGATTAGTGCCTTTTGATGTTAATTTTTAAC
ACTGCAATGGCTTCTTTGCGGGTACCACTTTAAAGAAATTCTGATCAAAT
ACGGCAGATACAGCTTGATACAGTGTTTCTACAATGCTTTTTTTAAATAC
ACTCATCTTTATAATTTTTATTTTATTTTCAAAGGTTGATAAACTGAAAA
CAGGATGTGATGATATTGACTCCATCCTTTCTGGTGGATTACTTATACCA
GGTGTCACTGAAGTTTCAGGTGAAAGTTCAAGTGGGAAAACACAATTTTG
TTTGCAAACATGCATTCTGACAAGTAGAGCATACAACGATTGTAGTAAGT
GTGGGATTTCAATTCAAATGATAAGAAATAGCATTGCATCCTTGCTTTGT
TTCAACTTACTTTACACATCTTTGTGATTAATTAAAAACGCAAATCCACC
TTATTAAGTGGATCAATTCACATGATGATCGTATTTTGCGAGCTCCAGGA
TTTATAAATTCTCCAGATTGAGAGTATACTTTTTTGTTAGAAACCTGGTA
GAGGATTTTGGAATAAAGGGGATTGTTTATTTAGGGGAGATTAGTGAACC
CAGTGATCCCAGCTGTGCTAATTTTATTCATTTGCATTTCAGAGTGTCTC
TACATTTGTACTGAAGATGCATTTCCAAACAAACGTCTGATACAGATGAC
AACATCACATTCTATGTCAAAAACTGAATCTCAAAGCATCACTGATCGTA
TCTTTGTAGAGCACGTTGAAGATTTAGTAATTTTTTTTTATCTTTACGCC
ATGATAAAATACGTTGTCGAAAGTGGTTTTGATATTAAACAAAACATTCG
AAAAGTATCAAAAATTCTCCTGGGTTTATCCTATAATCAATATACTTTGA
GATGTCAGCCTATTAGTATTACACAATATTGCTAATATTGTTTATTTGAG
TTGAATGATAACCTTGTAAAGTTAAGAGTTGTTTGAGTAATTATTGTTCT
TAAATTCATTATTAGGAAACGTTGATTTCATTTCTGGAAACAAGGATCAT
TAACCTTCTTTCCAATCATAAATTGAAGTTGATCATAATTGATTCCATCA
CTGCTTTGTTTCGTGTTGAATTTGAAAATTGGGAATTAGCAGCAAGAGCC
AAAACATTAGCTACCGTAGGAAAGCTGTTACATAAACTCAGTCATCAATA
CAAGATATGCGTCATTTGCGTCAACCAGGTGAGAGAGTATCATTTTGTTT
ATTATTCCTTAAATAAATGCAACTTGAAAATACCACCCATTTTAACTCCA
AGGCATCTGGAACTAATAAGTAAAGTATTATCAACTTTCAGAATGACATT
TGAAAGCCTTTATTAGAGGAAATACGATATTCAAGCAATTACTCCAATCA
TCAGTCTCTGACAAAGGAAAAAGGCTCCCAGGAATTCCTACTCATTTTTC
CAATTGTGCTAAAAAGACTATTGATCTCATAAAGTGAAATGAAGACTAAA
GAAATGAAAGTGAAAAACTCTTGAAAGGGAAAACTTTCTCAAAACATCAT
TTCTTTTACACAACTTGTTGTTTTCTGTGTGCTTTCATTTTAAGCATTAA
TTGTTTAATTTATTTCAAGTTAATTCCCTTTCTGTTTATTTGATAGGTAT
CTGCTGTGTTTGAGCCAGAATCATCTCTTAGTAAAAGGTATCTTTTTAGT
CAAGAACTCTTGGAATAATCAGTAATAATGGGGTAGTATTGTTTGGAAAT
TAAAAACTGAAGGCATGTTGAAAATTCAAGGTTTATTTGAAGTTTTTGAG
GGTCATGCACCAAATCAGTGCTAAAACTGCCAAGTAAGATGAAATCAAAG
AATTAATTATAAGCTCAAACAAATTGATAATTCTCAACTTCAGTTGAGCT
AGAATCTAAGAATGTCTATCTGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTGTCACAAAA
ACTTTGGGGCAGGCTGGAGACTTCAAAAATGGTCCGATTTGGCTGAAATG
TAGCACACTTGATCCTTGGGTGAATCCCTGGGGGTGATTTTTATCATTTT
CTGAAAATTTTCATTTTTAAGGGCGTGGTCACGAGTTTTAGTCCCAAAAC
GAGGCTAAAACTTTGGGGCAGGCTGGAAACGTCAAACATGGTCGGATTTG
ATTTGTTCCTTGGGTGAATATCTGGGGGTACATGTTTCATTTAAAAAAAA
AATTTCTTGTTGGGGCCTGGGGACTAGTTTTTAGCCTAAACGAGGCTAAA
CCCTATTTAAGAAATGCTAAAATTTTCCTTAAGCCATTAAGTTTACAATT
GGGCCTAGGAATGATTTCAAGATACTGAAGTTGAGCCAGTGCGGTTAGCA
CGTTCGATAGTTTGTTACGCTACCACCATGATTTCAGAGCGTCTTTAATG
AAGAACTTTAAAGAACGTTTAACCGTCATGGAAAATTAAACTATGCATAC
ATGTTTCATTCTTCTGTGCTAAAGTAAAAACGCTCAGAATGTATGTATGT
ATGCTACACTAATGGACCTATGTTACTGTTATTGCTATGGTTACTCTGAA
CTTCTAATCGCCCAACTTCAGTTGAGCAACAATCTGACAATGTCTGTGTG
TGTGTCTGTCTGTCTGTCACAAAAACTTTAGGGCAGTCTGGAGACTTTAA
AAATGCTTGGATTTGGCTGAAATCTGTCACACTTCCTTGGGTGAATATCT
GGGGGTGTTTTTTTCATTTTTTGAAAATTTTGATTTTTGGGGCCTGGGGA
CGAGTTTTTCGCCAAAACGAGGCTAAAACTTTAGGGCAGCCTGGTGACTT
CAAAAATGGTCGGATTTGGCTGAAATTTGGCACACTTGTCCCTTGGGTAA
ATATCTGGGGTCTACGATTGGGCCTATGAATAATTTGAAGCCACTGAAGT
TGAGCCCAGTGCGTTGCGCACGTTCGATTATACAACACAACTGATACAAA
AAAGACCATATTAATGCCGTCTTCAACGTTTGTCTTATTATGCTTTCATA
TTTCCAACACATTACTCAAGAAAACTAGTATTCGTTTAGGGAAGAAAAAT
TCGTGCCAGCCCTT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000255_pilon:87179..91442- >XLOC_010610 ID=XLOC_010610|Name=XLOC_010610|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1632bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000255_pilon:87179..91442- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCACTTCAGAAATTGGACATCAATCCAAAGTACATTTCAATTCTTAA
ATCAGATGTCACTTCAGAAATTGGACATCAATCCAAAGTACATTTCAATT
CTTAAATCAGTTGGGATCTTTACAGTTGATAAAGTACTTGTTTATTCAAA
TTTGGAATTGCAAAAGAAAACTAATTTGACCGAGTCAAAAATTAAAGAAG
TGTTACATGCTGCAGCAAACTATGTTGTCACACAAAGAGTCAAGCAAGCA
TCAGTTTTAGATGTTTACACCAAGTCTTCAAGTGCTATTGATTTTCAGTT
GGGATCTTTACAGTTGATAAAGTACTTGTTTATTCAAATTTGGAATTGCA
AAAGAAAACTAATTTGACCGAGTCAAAAATTAAAGAAGTGTTACATGCTG
CAGCAAACTATGTTGTCACACAAAGAGTCAAGCAAGCATCAGTTTTAGAT
GTTTACACCAAGTCTTCAAGTGCTATTGATTTTCAGGTTGATAAACTGAA
AACAGGATGTGATGATATTGACTCCATCCTTTCTGGTGGATTACTTATAC
CAGGTGTCACTGAAGTTTCAGGTGAAAGTTCAAGTGGGAAAACACAATTT
TGTTTGCAAACATGCATTCTGACAAGTAGAGCATACAACGATTGTAGTTG
ATAAACTGAAAACAGGATGTGATGATATTGACTCCATCCTTTCTGGTGGA
TTACTTATACCAGGTGTCACTGAAGTTTCAGGTGAAAGTTCAAGTGGGAA
AACACAATTTTGTTTGCAAACATGCATTCTGACAAGTAGAGCATACAACG
ATTGTAAGTGTCTCTACATTTGTACTGAAGATGCATTTCCAAACAAACGT
CTGATACAGATGACAACATCACATTCTATGTCAAAAACTGAATCTCAAAG
CATCACTGATCGTATCTTTGTAGAGCACGTTGAAGATTTAAGTGTCTCTA
CATTTGTACTGAAGATGCATTTCCAAACAAACGTCTGATACAGATGACAA
CATCACATTCTATGTCAAAAACTGAATCTCAAAGCATCACTGATCGTATC
TTTGTAGAGCACGTTGAAGATTTAGAAACGTTGATTTCATTTCTGGAAAC
AAGGATCATTAACCTTCTTTCCAATCATAAATTGAAGTTGATCATAATTG
ATTCCATCACTGCTTTGTTTCGTGTTGAATTTGAAAATTGGGAATTAGCA
GCAAGAGCCAAAACATTAGCTACCGTAGGAAAGCTGTTACATAAACTCAG
TCATCAATACAAGATATGCGTCATTTGCGTCAACCAGGAAACGTTGATTT
CATTTCTGGAAACAAGGATCATTAACCTTCTTTCCAATCATAAATTGAAG
TTGATCATAATTGATTCCATCACTGCTTTGTTTCGTGTTGAATTTGAAAA
TTGGGAATTAGCAGCAAGAGCCAAAACATTAGCTACCGTAGGAAAGCTGT
TACATAAACTCAGTCATCAATACAAGATATGCGTCATTTGCGTCAACCAG
GTATCTGCTGTGTTTGAGCCAGAATCATCTCTTAGTAAAAGGTATCTGCT
GTGTTTGAGCCAGAATCATCTCTTAGTAAAAGGGAAGAAAAATTCGTGCC
AGCCCTTGGAAGAAAAATTCGTGCCAGCCCTT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000255_pilon | genome | sc0000255_pilon:87179..91442 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 793-816:25 |
| Aaloc | 751-789:1419 |
| Aaloc | 538-750:2050 |
| Aaloc | 406-537:2421 |
| Aaloc | 244-402:2881 |
| Aaloc | 58-243:3972 |
| Aaloc | 1-54:4265 |
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