XLOC_010608 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_010608
Unique NameXLOC_010608
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000255_pilon:149829..162956-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_010608 ID=XLOC_010608|Name=XLOC_010608|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13128bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000255_pilon:149829..162956- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CAACGACAAAATAACAGCCTATTGTCAATCAACCAATAACAAACTTTGTG TGTTTGGTGAAATGGGTGCCGAATTGTTGTCCCTTGTTTTGATAGAATGG TCCCAATTTAGAGCCATTGATGAGACAATTCTAATTATGAATATTTGAAA ATGCGGGACACACAGATGATGCGGGTGTATAGCTGGACAAAAGGGTGATT TGCATACGTGTCCCGCAGGATGAGGGATACTTGGTAACTATGCAATTGAT AGCTAGTCCCTGTGTAACCTATGGTAAGTAAGTATATTCATCTGGTGGCT GTCGGTGGAGCCGGGAGTGAGGGAGTCTATCTCCTTTTCTATTTGCGCCA GACCTGGGAGATAGAATGCTGAGGTGGAGCGCCGCACCTACTCTCAGCTC CCAGTAACTTACCGCCTAGATCAGATTACCCAATCTAAGCTACTCATCCG CTGAGTTGGCGGTGACTGGGGATCGAACCCACAAACCTTAGATTTTAAGG TGCTATACTTAGAAACAAATATTAAGCTTTTAAAATCAGGGAGTCCTGAC TATTCCTTAAGAACATGCTGAGAACGCCTTATATTCTTCAAGTGTAGAAG TGATCTTGTGATTGCGATACATGACTTTGTGGATCCAGAGCTATCCAGGC TATTTCTTTACGTTCGTTGTTGGATTCCAGGATTGTGCAATTGCTTGAGG AATGAAGTCAAAAATTGAGGTTTTTCAGTGGGAAAATGAAAAAGGTTCCA ATTTTAGCTTCACCAATCGACCGGTTCATTTTTTAAAAGCTTCTATTGGG CCTGGAAAATTTTGGGAGCAAAGGTGGCGAAAACTGAAGGGGGATGCAAA ATTTTGATTTTAGGTATAGGGGAATAAATTATGGAATAAATGACCTTCCC CCTTCGAAATTTGGCACCACTTCAAGTATACTCCATGTGTATATAATTCG ACATCTTTCACGCCTTCTCTCGAGACTGTACATGTTCAGATGTTTAAGTT GTTCCCAATAATTGAGGTTCAATCGAAGAGGAGAAAAAAATGCAAAATCT ACCTACCTTCTGAGAAAACCGCCATTTTTCATTATAATTCAATACACTTT TGAACTGAAGGGGGTCAAACTTCCTTTGGAAAAGTGGAGGCTTACTAAAT GTGTTGTTCGATTTTTTTAGGTCGAAAATTAAAAGGAGGGAGTTTTTTGG ATATGGATAACATATTCTCAAGCCCAGTTGAGCTAGAATCTGAGAATGTG TCTGTGTGTCTGTCAAAAATGGTCGGATCTGGCTGAAATTTGGCACACTT GTTCCATGGGTGAATATCTGAGGGTGCTTTTTTTTACTTTTCAAAATTTT TGATTTTCAAGGCCTGCGCAGTTATCTTTTAGGTCTTTTTTTTTGCTATT ATTGACCGTATGAATAATTTGAAGCATCTGAAGTTGAGCCCAGTGCGCTG CACACATTCGACTTTATATATCGGTAAATGAATTGACCTCGTTCACATAA AAACACTTTCTTATCAGACCTTTCTTCTTCTTTATTGTCACTTTTTTGTC TAACCAAATTGCTCATTTCCCTTGACAGGCACCTGATCTCAATCATCCAA TAGACAGACGAACATACAAAGGTCCCATACCAACATGTCACGATATCAAC TTGATGACAAGGACACCGCAATCAATCGATCTACTCATCGGGTTTACAGC TGGCCAAATTCAATTGATGGATCCCATCCAGCACGAATGCCGAAAATGTT TCAATGATGAGGTTTGATGGTCTATGTTGTCTTTTCTTTGCCACTTAAAT TATAAGGGTGTCCTTCCTGTTTTTGCTCTAGGGGAAGTGTTTATAATTTA GTCTCCCTCCAAAAAGGATGATATTATAAAATTTTGACTTTCTGGTCGGT CGGGCTTATAGAACATACACTGAATTAATTTGGTCTTGCTTAAAGTGAGC AGTTCACGATTAGGATGCTACTAAGATTTTCTGGTCGGTCGGGCCTATAC TTGGCCTTAGCAACCTAGCCATGAAACTAAGCTTGAACCGGGAAAGCAAA CAAAAATACCTAAAAGAGGCATTTTCGGCATTATTTAGGATTAAATTGTG TTACAGATTGTATTTGAATACCAAATTTGAGGTATTTTTGACGTAAAATG AGATAAAAAAGCCAAGATTTTTGAAGTTGCTAGGCATTTTTGGCTCAAAC TCCATAGGCAACTTTTTGGCTGAAATCGGGGAAACCCTTAGCAACTGCAG CCCTGAGCCGGAAATTAGGGTTGCTTATAAAAGAAATATGTACTCATCAT TTTGTTTGGCTTTCTTTTAACAGAGATTGATCGAAAAGGGCGCAGTGACT TGTGTCAAATGGTTACCTGGTAGCGAATCCAAATTCTTAGTCTCTTATAA CAATCCGAACATTTACATATACGATAAAAATTTACCTTCACTCATTACTG AACCACAATTAGCCGTCTCCAAACGAGGCAACGGATATACTGTAGAAGTA TGTAAAAATAAACAAGACTATAATCCTTTATGCCGCTGGAAAGTTGGTCA TGGAGGTGTCAATGAATTAGCTTTTTCACCGGACTGTAAACATTTAGCGA TAGCCAGCCAGGACGGGTATTTACGTATATTTGATTTCGAGAAACAAGAA CTGATAAGTAGCATGCGATCATATTTTGGTGGCATTCTATGCGTTTGTTG GAGCCCGGATGGTAAATACGTCGTTACTGGAGGTGAAGATGATTTGGTGA CCATCTGGTCGTTTTACGAGCAGCGTGTGGTCGCGCGTGGCGAGGGACAT CGTTCCTGGGTGAATGTGGTCTCTTTTGATGCATACACGACACAAATAAA TGATCGATTCTCACTCGATAACAGTGAAGACGAAGAAACAAATGAATCAT CGAATGCATCGTTGAATCATTCTCAGAGTCGTAATAAGGACGTTCTTTCG TACAGGATTGGATCCGTAGGTGACGATACGCAGTTATTATTATGGGACAT TGATGAAGAAATCCTGAAACCACAGCGTGTTCGAACGAGGAGTGCGCGCG TGCCAACTTCGGTTAGTTCGAGTTCGGTGAACGTTCAACCTTCATGGACT TTCTCGAGTAATACGATGAAACCATCTAGTCGATATGATAAAAACGATGA GATGCCATCTAGCGGTAAATTTCATACACTTAATAGACTGACTTCTAAAA ATCAAAACTCTGTTTCTAGTTATACACCGCCACACGTGGAAATGGACGAT CTGTTATTAGGTAGTAAAATATGTCCACGGATGACAGAGACTTCTAAACT TGAACCGTTAGTGGCGAAAAAGATTGCTTACGACAGGATTAGTTCGTTGG TTTTTCGTGAAGATTGTATTGTCACGTCTACGTATGAAGGCTACATCAAC GTGTGGGCAAGACCTGATGACCCGGTAAGAATACAATTTTTAAATGTGTA GTCCCGTTCTAAGACAAAGAAATTTAGTGCGTTCTCAAAGCGTGTTGGTT AATTCCGAGAATTGGGCTTTTCCAGAAATTTTCCGTACCCCCACTGTTGA GGATATCCACAGCCCCCTGGATATCCAACCTAAAACAGAATCACCCCCTG GATATACAGGTATTTTGTCCTGTACCCCTTGGATATCCAAGCATTTTGTC CTGTACCCCCTGGATATACAGGTATTTTGTCCTGTACCCCTTGGATATCC AAGCATTTTGTCCTGTACCCCTTGGATATCCAACCATTTTGTCCTGTACC CCCTGGATATACAGGTATTTTGTCCTGTACCCCTTGGATATCCAAGCATT TTGTCCTGTACCCCCTGGATATACAGGTATTTTGTCCTGTACCACCTTGG ATATCCAAGCATTTTGTCCTGTACCCCTTGGATATCCAACCATTTTGTCC TGTACCCCCTGGATATACAGGTATTTTGTCCTGTACCCCTTGGATATCCA AGCATTTTGTCCTGTACCCCCTGGATATACAGGTATTTTGTCCTGTACCC CTCGGATATCCATGCATTTTGTCCTGTACCCCTCGGATATCCAGGCATTT TGTCCTGTACCCCTCGGATATCCAAGCATTTTGTCCTGTACCCCTTGGAT ATCCAACCATTTTGTCCTGTACCCCCTGGATATACAGGTATTTTGTCCTG TACCCCTTGGATATCCAAGCATTTTGTCCTGTACCCCCTGGATATACAGG TATTTTGTCCTGTACCCCTTGGATATCCAAGCATTTTGTCCTGTACCCCT TGGATATCCAAGCATTTTGTCCTGTACCCCCTGGATATACAGGTATTTTG TCCTGTACCCCTTGGATATCCAAGCATTTTGTCCTGTACCCCTTGGATAT CCAACCATTTTGTCCTGTACCCCCTGGATATACAGGTATTTTGTCCTGTA CCCCTTGGATATCCAAGCATTTTGTCCTGTACCCCTTGGATATCAAGGCT TTCTGTCTTACACCCCATGAATATCCTCTCCCTCTTATAAAATCTTACCC CCTGCATTCAAAATATATTGTTCTCCTTCATTCCAGGGCGTTACTGATGG CGGTGGAGGCGGAACATTAATACAATAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000255_pilon:149829..162956-

>XLOC_010608 ID=XLOC_010608|Name=XLOC_010608|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3168bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000255_pilon:149829..162956- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TTTGTAACATTGAAAGGAGGAGGAGATTCTGATGGTGATAACGAAGACAA
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TAAAAAAGATGGCGGCAGCTGCTGCTGGTAAAACCCACCATGGAAATGAA
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AGCTGTCTTTTGTAACATTGAAAGGAGGAGGAGATTCTGATGGTGATAAC
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TCGTGGCGTAAAAAAGGCACCTGATCTCAATCATCCAATAGACAGACGAA
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ACACCGCAATCAATCGATCTACTCATCGGGTTTACAGCTGGCCAAATTCA
ATTGATGGATCCCATCCAGCACGAATGCCGAAAATGTTTCAATGATGAGG
CACCTGATCTCAATCATCCAATAGACAGACGAACATACAAAGGTCCCATA
CCAACATGTCACGATATCAACTTGATGACAAGGACACCGCAATCAATCGA
TCTACTCATCGGGTTTACAGCTGGCCAAATTCAATTGATGGATCCCATCC
AGCACGAATGCCGAAAATGTTTCAATGATGAGAGATTGATCGAAAAGGGC
GCAGTGACTTGTGTCAAATGGTTACCTGGTAGCGAATCCAAATTCTTAGT
CTCTTATAACAATCCGAACATTTACATATACGATAAAAATTTACCTTCAC
TCATTACTGAACCACAATTAGCCGTCTCCAAACGAGGCAACGGATATACT
GTAGAAGTATGTAAAAATAAACAAGACTATAATCCTTTATGCCGCTGGAA
AGTTGGTCATGGAGGTGTCAATGAATTAGCTTTTTCACCGGACTGTAAAC
ATTTAGCGATAGCCAGCCAGGACGGGTATTTACGTATATTTGATTTCGAG
AAACAAGAACTGATAAGTAGCATGCGATCATATTTTGGTGGCATTCTATG
CGTTTGTTGGAGCCCGGATGGTAAATACGTCGTTACTGGAGGTGAAGATG
ATTTGGTGACCATCTGGTCGTTTTACGAGCAGCGTGTGGTCGCGCGTGGC
GAGGGACATCGTTCCTGGGTGAATGTGGTCTCTTTTGATGCATACACGAC
ACAAATAAATGATCGATTCTCACTCGATAACAGTGAAGACGAAGAAACAA
ATGAATCATCGAATGCATCGTTGAATCATTCTCAGAGTCGTAATAAGGAC
GTTCTTTCGTACAGGATTGGATCCGTAGGTGACGATACGCAGTTATTATT
ATGGGACATTGATGAAGAAATCCTGAAACCACAGCGTGTTCGAACGAGGA
GTGCGCGCGTGCCAACTTCGGTTAGTTCGAGTTCGGTGAACGTTCAACCT
TCATGGACTTTCTCGAGTAATACGATGAAACCATCTAGTCGATATGATAA
AAACGATGAGATGCCATCTAGCGGTAAATTTCATACACTTAATAGACTGA
CTTCTAAAAATCAAAACTCTGTTTCTAGTTATACACCGCCACACGTGGAA
ATGGACGATCTGTTATTAGGTAGTAAAATATGTCCACGGATGACAGAGAC
TTCTAAACTTGAACCGTTAGTGGCGAAAAAGATTGCTTACGACAGGATTA
GTTCGTTGGTTTTTCGTGAAGATTGTATTGTCACGTCTACGTATGAAGGC
TACATCAACGTGTGGGCAAGACCTGATGACCCGAGATTGATCGAAAAGGG
CGCAGTGACTTGTGTCAAATGGTTACCTGGTAGCGAATCCAAATTCTTAG
TCTCTTATAACAATCCGAACATTTACATATACGATAAAAATTTACCTTCA
CTCATTACTGAACCACAATTAGCCGTCTCCAAACGAGGCAACGGATATAC
TGTAGAAGTATGTAAAAATAAACAAGACTATAATCCTTTATGCCGCTGGA
AAGTTGGTCATGGAGGTGTCAATGAATTAGCTTTTTCACCGGACTGTAAA
CATTTAGCGATAGCCAGCCAGGACGGGTATTTACGTATATTTGATTTCGA
GAAACAAGAACTGATAAGTAGCATGCGATCATATTTTGGTGGCATTCTAT
GCGTTTGTTGGAGCCCGGATGGTAAATACGTCGTTACTGGAGGTGAAGAT
GATTTGGTGACCATCTGGTCGTTTTACGAGCAGCGTGTGGTCGCGCGTGG
CGAGGGACATCGTTCCTGGGTGAATGTGGTCTCTTTTGATGCATACACGA
CACAAATAAATGATCGATTCTCACTCGATAACAGTGAAGACGAAGAAACA
AATGAATCATCGAATGCATCGTTGAATCATTCTCAGAGTCGTAATAAGGA
CGTTCTTTCGTACAGGATTGGATCCGTAGGTGACGATACGCAGTTATTAT
TATGGGACATTGATGAAGAAATCCTGAAACCACAGCGTGTTCGAACGAGG
AGTGCGCGCGTGCCAACTTCGGTTAGTTCGAGTTCGGTGAACGTTCAACC
TTCATGGACTTTCTCGAGTAATACGATGAAACCATCTAGTCGATATGATA
AAAACGATGAGATGCCATCTAGCGGTAAATTTCATACACTTAATAGACTG
ACTTCTAAAAATCAAAACTCTGTTTCTAGTTATACACCGCCACACGTGGA
AATGGACGATCTGTTATTAGGTAGTAAAATATGTCCACGGATGACAGAGA
CTTCTAAACTTGAACCGTTAGTGGCGAAAAAGATTGCTTACGACAGGATT
AGTTCGTTGGTTTTTCGTGAAGATTGTATTGTCACGTCTACGTATGAAGG
CTACATCAACGTGTGGGCAAGACCTGATGACCCGGGCGTTACTGATGGCG
GTGGAGGCGGAACATTAATACAATAGGGCGTTACTGATGGCGGTGGAGGC
GGAACATTAATACAATAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_010608XLOC_010608-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000255_pilongenomesc0000255_pilon:149829..162956 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1543-1584:43
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Aaloc1-258:13129