XLOC_010605 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_010605
Unique NameXLOC_010605
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000255_pilon:230571..242318-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_010605 ID=XLOC_010605|Name=XLOC_010605|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11748bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000255_pilon:230571..242318- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TTTGATATTCTGAAAAAATAGGAAGTGTAAGATTATATGTTAAGGTTTAA AATTTTAACACGAAAATAGAGGCATAGATATGCTCTCGTTTAATTCAAGA ATTCTCATCCTCGCATGTCATTTATAAAATATAAAGACAAGTCGCAGAAA TACAAAACTACATACACTGTTGTTCTACATAATCTACATGTATAAAAACT TAAACCATAAGAGCATAGGAAGAGCTTTGACTGTTTGAAGTAATATGATC TTAAAACATCACTCTTATACTTAGATATAAGACGTCCACAGTAGAGGAAA ATAATGCAATTTTCCTGCTTCTGTCAACAGAGATTTTTAATAATGATGTT TGTCTTCGTCTTTTACCCCTATAATAGCACAAATTATTAATGATAATAAA GCAAAAGTCTTCGTTGCGTCATAGTTAGGTGATGCCATTTAATTGATTTT CCTGTGCGACTTCTTAGCGAAAACTTAGTTTCTACTCACTAAAGCAGAAA ACTGAGAAAGATAGCATTAGCCTTGAACTTTGTAATAATAATATTCATCT CTTTTAACTAGAAGATCGTTTTTGACCAACGGAGTAAAATACTAAAAAAA AAAACAAAGAAAAGTCTTTTCAACAAGCACATTCTATTTGTAGAAGTAAA GGGCTACTTAGACTACACAATAATAAGATTTGCTCTAAATATTGACCTTG CTCGGACCAGCTCAATTTATAGCATTATTTTTTCTCTAAAAGTCTCTTCG AGAATTAAGAATGAAACAGACACTAGCCAGACAGTCTTTAGATTTGTTTT GCGGGGTCCTATCTATAAACTGAACGGAACATATAGAATTGAGCAGGAGA CCACTGGTTAGGCTCTGGCGCCTTGAACACTCGACGATAGCTCCTGACGA GGTGCCCTCGAAAGACATTGAAAATTCAAGAGATTGGGGTATTTCTCAAA CACGTATTTACCAAAAACTCGATTTAAAGTCTGTCCAGATATAATTGGCA GTGGAAACAAGAATGCCTGTAACTTTTGATAGTCAAATATAATTATGGAA TTTTTATTTGCTTGTGTCAGAGAATCAAAAGCGCTATATTTGAATGTATT TTTGGTTGAAAAATTCGCGATTTTAGCGGTTAAATTTGCGATTGTAAAAA TTGAGCTTTTTTTCTACTTATGCTATAACGTTCATTTTTACACCAGTGGT AGTTCAACCTTAGGTTAAGAAGTTTGTTAAATTTCAAGGCGAACAGAAAA GTCCTTCGGAAGATATGGGACCCGAAATACCCCTTGGTAGCACTTTTCTG TGAAATATCGTATCTCCAACTTATTACTAAAAACGGGGGTTTTGTTATCT TTTTTGAACAGTGCAATTAAAAGTTGGAAAGTGTTTGTGCATTGGTATTA TTGATATCATTGATTATTTCGAAACGAAGTGAAATCACAGTATAATTGTT TTTATTGAAAAGATAAGCATGAACTTATATTGCCTTTGTTATTTTTAAGT CATTAAAGAATTTTGCTAATTCCCAAAACACTAAATACAGTTTGGCTATG AGGTCAATAAAGAGATCGTAAAATGTGTTATGATCAAACAACTGTTTTAT CATGTCACTACCCCCGTTTTAGTAATAAGTTGGAGATTTGATATTTCACA GAAAAGTGCTACCAAGGAGTATTTCGGGTCCCATATCTTCCAAAGGAATT TTTTGTTCGCCTTGAAATTTAACTAACTTCTTGACCAAAGGTTGAACTAC CACTGGTGTAAAAATGAACGTTATAGCATAAGTAGAAAAAAGGCTCAATT TTTGCAATCGCAAATTTAACCGCTAAAAATCGCGAATTTTTCAACCAAAA ATACATTCAAATATAGCGCTTTTGATTCTCTGAAACAAGCAAAAAAAAAT TCCATAATTATATTTGACTATCAAAAGTTACAGGCATTCTTGTTTCCACT GCCAATTATATCTGGACAGACTTTAAAATTGAATTTTCAAACTCAAGAAG TAAACAATGATAAAGTTTAAAAAATGCAAAGTAGAGAATTCACGGTATTT AAGGATTCAAAAACTTAAAGGGAAATCAATTAAGATGAGGATCAACACCA TCCACCATTAAAAAAGAGTATTTCAAATAAAAGTTTATTGATTTTCATAA TCAATGTAAAAGTTTTAGGCTAAGATGCATGGTAGCACTTATTTAGGGTG TTTTAGAGGGTGATAATTTTCTTTGTCGTCCAACCATGGTGGGTAACAAT TAATAGTGGTATACATTTAAACTAAATTTTCAGAAACACCAAAACGTTGG TAAGGAGACGAGCTTGAAAATTACCCAGGGAGGGTTTAACAAGCAACATT CAAGGGGAGGTCGTTAAAATTCCCGCAAAAATCCAAGAGGTTTGAAATTC CAAAAATAATGACCTCGTCGACATAGGGCGTAAAATTTTTGAAAATTGTT CTTCTCACTTCACTAGGATTTGAGAAAATGGATTCAGGATTGACAGTGAA ATGGGATGATCGAATACATCCATCTCAACGACATTTTGATCGTATGGAAG AATGTGGTGTACCGAAAGGCTCTGTTACTCCAACCCTGTCTCATTTTACT TCGGAAGTTATGAAGGTAAAATACTCGTAATCATTACTCTCACTACACAG CCCTGTCTCAACGATTTAGAATGGAGTTTAAGAGTTTTTCCCCTTTTTGA CCAACTTTCGATTAAGACCCCTTCTTTGACACACGGAAGTTTACTCAAAA AGTAACCAGTGATATCTTTTCACCAATCAAATTTTTAATTCTTCATACTC AAACTCACTCATTACTCCTTTTCATATTTATTGATGCTCGTTAGATTTTA TCTCTGTAACAAAATATTTAGGGTCGGCCAGCTTAATTATACCTCAACTT CATCGGCGATCCAAAATATCAGCAATCTGATTGGTTAAAAAGAGTACAGT ACAATATATCTTGTATTTTCCATGCATAAATATAAATTGACGAAAAGATG TTGTTGCATTGTAGCGGTAGCAACGATATTTTCCGAGCCTATATTGTACA GAAAAATCTCGTAACAATATTTCTCATATTGTACTCGCAACTGTCCGATA ATTATTAATACGTATTCATCGGAACCCCTCGAATAAAATAAAAAGGACCT GATTGATCTATATATCTGTCTTTGCTCTTTAATTTTATTTATTTTAAACC TCTTCCTTCAGATATACGCTTACAGTGCTCGCGAGCATGAGAAGCGGTAT GGGACAACCAAAGAACACTCTGCTAAAATCGCATACAAGAACCACTTCCA CAGTCAATACAACCCCAATGCTTCCTTACAAAAAGTTTTACCCATGGAAG CAATAAACGCTCGTGAAATCGTTTATCCGCTCACGCTCGCCATGTGCGCT CTGACGGCCGACGGTGGTGCAGCGGCCGTGGTGTGTAATAAGGATTTCAT GATCAAGCATAAACTACAAGTATGTGTTTTCTTTGAATCTCACCATAGGG CGTACTTCATTGTACATGCTAAATTTTCTCTGTGGTTAATTGGTTAATAG TAAATTTCATTAGAGGGAAACTCATAGACCACCCATATTTAAAAATCTCA TGAAAGCCTTCCTTTATGTGCAATGAATTTATAATCCTATTAAAGTCTAT TCCAAATTAGATGGCAGTGTTTTTTCAAACCTCAATAACTTTTGATAGAA TTTGAATTAGTTAGCGGTTTTGTGCTTGTTAAAAAGATAATCCGGAGTGG AATAATCAAAATAAAAAAAAATTTAAACAATGGAAAAACGAAAAATTAAG AAGAAAATCAACTTAAAAATAATGCTATGATCTTCATTTTTGTATCAGAA ACTCTTCAATCTTAGAACGTCACAAATGTGAAACAGCTTTCTTCTTCTTC ATTTTCAATCTTCATTTTCCGATCTTTTTTGAGTTTTTTCTTTATGACAA TATCCCACTCCTGTTTGTCTTTTCAACGAGCACAAAATTGCTACTTAATC CAAATTCTATCAAAAGTTATAGAGGTTTGAAAAAACAATGCAAGCTAATT TGAAATAGACTTTAATCAAGGAGAAAGTCAGTTTAAGAACATAGTCAAGA GCACAGCGTTGCACAAATATTTTAGAAAATTTCCTTGAGGGTTATATGGT AAGCAGTGGTAAGCATTATTTTTAAATAAGTTTATTCTATGTAGCCTAGT TAACTAAGCCCGTATTCACAAGGTTAGGACACACGGCTTATGGTAATATA GCGGCTTCGGGGCTTTAAAGATTTTTTATATTTGCGAATTTTAAGTTTGC TTTGAAATACTAGTTATTCAGTCCCAACTTACTATCAGATTTATCCTGGT GACTGAATCAAACTAGCTTAGATTTCTAGCTATATTCTATGACGGTTTTA AAGGGATTATGGCGATGGTTTCAGCTATTTTACCTGTAGATTCCTTACAT GATCTTGAGCAAAATCTAGTATGAATTTCAAAAAAATCTCAAACCACCTG ATTATCCCTTTAAATTCACAGAACAAAGCGGTAGAAATCATAGCTCAACA AATGACCACCGACCTTCCTTCATCTTTCAATACTGATGTCACCAATGTTG GTGGATTGGAAATGGCGCGTCAAGCTGCCAATTATTGCTATGAAAAATCA GGGTATACGGCGCGCGATGTTGATGTTATTGAGTTACATGATTGCTTCGC CCCAACTGAGGTTTGTATGCAGTTTTTTCAACGAGTGATAGATGTTAATA CATTTGCTCCCGAACTAGAGGCATCAAAATACGAGAGGAACCTCCAATGG CAATAACTTTTGATACAAACATTTTACTTATTTATTGCGCATTTTTGAAA TGTATATGAAACCTTGCGTTCATTTCCGTTCAAATTGAAGCCTTTTCAAG CCTCTAAAAGTCAACTTGCGTTGGAACTCCTTTTTTTTTCCTCGTGAAAC GGACTGTGTTTACCCTACTAATGAATTGGGGAAGATTTGTAATAAATTCA TATGTTTATAAAGCAAAAACTTCCCATCACAAATTCTCATTTCTTACGAC AGCAAGAAGTAAAATAACGTCATGAATCTGTTTACGCGACCTCGATACTC GTATTTATGTAAAATTTCATGGGTCGCGATGCTACAGTAAAACCTCTAAT TAACGGACACTCTAAAAGGCGGACACCTCTGATTAGCGGACACCTCTGAT TAGCGGACAATTTCATTTTCCCCAGCCGTTTCCTAGTCAAATTCTCATAA AAAATTTCTAAAAGGCGGACACTCAATTAGCGGACCCTCTGGTTAGCGGA CAATTTTTTTCGCACGAAATGGCCAAAACCCCCTATTTTAGCTCTCCAAT TAGCGGACGTTGAATATCAAACGGGTCACAGACGTCCAAAATTGAAAAAA AAAAATTTAGGTATTTTTATTTCAAGCACTTACTAGTCTTATTATTCAAA TTATTTCTACAAATTTCCAGTTTTCCCTTGACCCATTCAACGAATTTAGG TGGGCCAAAGAAATCATAAATCACTGGTACTTCAAGTTCGTACCTCGATT TAACCTCTTGCCAGTCACTCGAGCTCTTCTATGGCCTAATGTCTGCAGAT AAGTACTTCAGATCCCAATTTTGTATTTTCGACACCCTGGGATGGCCTAA TTTCAAAATTGGAGCTCCGAGATCAAAAGTTTCTAAAAGGCGGACCCCTT TCCCCGATGGTGTCCGCTAATTAGAGGTTCCACTGTACTATGTTTAAGCG TTAAACCTTATCGGTGCAGAGTCGTATAAATCATTATTCAATATCACATG ATAATGGGTTATATTAAAAAGAACCTCCAATGAAGGATTAAAAGTCTACT CTTTTTTCTCAGTTACTTCTGTATGAAGCACTTGGTTTGTGTGAAACTGG CAAAGCTGGAGAATTGATCGATAACGCGAAATGGATTGAGAATAAACAAG GTATAGCTATTTATTTTGTATGACAACATGAACCAAGCTTTGATACTTGA ATATTGTCCTTCATAATTATCTTTTATTTTCATAAAATCTCCGATTAACC TTCCAACTAGTTTGAAAAATAATGAAGTTTAGCCAGCTTCAAGGAGATTG AGATTGATTTTCCTGGTAATAAACTTGGCTAGGTACCATATGATCAAATA TGGTTGAAGATTCACGTAATCGTAATTGCTCCGGTTAATAAGCTAAGTTT CTTTTTTGAAATGCTTTGCCTGGGGACAAGCGTTTCATGAAAATTACATC CTTGGTCTTTAAATAGTTGGAGAAATGAAATGCTGCACGATTGTCGGTTT GCAAGTTCAATTAAATTTTAAGATGGGGGAAAGAAATCAGACGTTAAACA AAATGTTATGATATTTTTCAGGTGGTAAACTTTGTCAACTCGGTAACAAA TGGGTGGTGAACACAGATGGTGGATTAGAATCTAAAGGTCATCCAATTGG TGCTACTGGTATCGCACAATGCGCCGAAATTGTATATCAGGTTAAGATGT TATGAAACCTAATTCCCTATATCCGTTATACAGTACGGTCTCCATAACTG TAAATAATTATTTATGATTATGTCTTACTAAATTCAAGAAAGAGATGTAA TTTTAGGTTTTTTTACATAAATACCTTATACATACATATCTTTTGAATAT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000255_pilon:230571..242318-

>XLOC_010605 ID=XLOC_010605|Name=XLOC_010605|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2460bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000255_pilon:230571..242318- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTGTTTGTTGTTGGTGTTGGATTAACAAAATGGTGTTTGTTGTTGGT
GTTGGATTAACAAAATTTTCAAAACCTCATGCAAGAAAATGGGACTATCC
AGATTTTCAAAACCTCATGCAAGAAAATGGGACTATCCAGACATTGGCAG
AGAAGCTGCATCCAATGCACTGAATGATGCTGGTATTGACTACAGTCAAA
TCGATGCAGCTGTTGTCAGCCATGTTTATGGCGAATCTACCTCAGACATT
GGCAGAGAAGCTGCATCCAATGCACTGAATGATGCTGGTATTGACTACAG
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AACTTGGTTTGACTGGCATTCCAATCTTCAACACCAACAATAACTGCTCA
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TCAACACCAACAATAACTGCTCATCAGCATCCTGTGCTTTAATGTTGAGT
CGTCTCTTGGTGATGAGCGGTGAATATTCCTGTGTTCTGGCTCTTGGATT
TGAGAAAATGGATTCAGGATTGACAGTGAAATGGGATGATCGAATACATC
CATCTCAACGACATTTTGATCGTATGGAAGAATGTGGTGTACCGAAAGGC
TCTGTTACTCCAACCCTGTCTCATTTTACTTCGGAAGTTATGAAGGATTT
GAGAAAATGGATTCAGGATTGACAGTGAAATGGGATGATCGAATACATCC
ATCTCAACGACATTTTGATCGTATGGAAGAATGTGGTGTACCGAAAGGCT
CTGTTACTCCAACCCTGTCTCATTTTACTTCGGAAGTTATGAAGATATAC
GCTTACAGTGCTCGCGAGCATGAGAAGCGGTATGGGACAACCAAAGAACA
CTCTGCTAAAATCGCATACAAGAACCACTTCCACAGTCAATACAACCCCA
ATGCTTCCTTACAAAAAGTTTTACCCATGGAAGCAATAAACGCTCGTGAA
ATCGTTTATCCGCTCACGCTCGCCATGTGCGCTCTGACGGCCGACGGTGG
TGCAGCGGCCGTGGTGTGTAATAAGGATTTCATGATCAAGCATAAACTAC
AAATATACGCTTACAGTGCTCGCGAGCATGAGAAGCGGTATGGGACAACC
AAAGAACACTCTGCTAAAATCGCATACAAGAACCACTTCCACAGTCAATA
CAACCCCAATGCTTCCTTACAAAAAGTTTTACCCATGGAAGCAATAAACG
CTCGTGAAATCGTTTATCCGCTCACGCTCGCCATGTGCGCTCTGACGGCC
GACGGTGGTGCAGCGGCCGTGGTGTGTAATAAGGATTTCATGATCAAGCA
TAAACTACAAAACAAAGCGGTAGAAATCATAGCTCAACAAATGACCACCG
ACCTTCCTTCATCTTTCAATACTGATGTCACCAATGTTGGTGGATTGGAA
ATGGCGCGTCAAGCTGCCAATTATTGCTATGAAAAATCAGGGTATACGGC
GCGCGATGTTGATGTTATTGAGTTACATGATTGCTTCGCCCCAACTGAGA
ACAAAGCGGTAGAAATCATAGCTCAACAAATGACCACCGACCTTCCTTCA
TCTTTCAATACTGATGTCACCAATGTTGGTGGATTGGAAATGGCGCGTCA
AGCTGCCAATTATTGCTATGAAAAATCAGGGTATACGGCGCGCGATGTTG
ATGTTATTGAGTTACATGATTGCTTCGCCCCAACTGAGTTACTTCTGTAT
GAAGCACTTGGTTTGTGTGAAACTGGCAAAGCTGGAGAATTGATCGATAA
CGCGAAATGGATTGAGAATAAACAAGTTACTTCTGTATGAAGCACTTGGT
TTGTGTGAAACTGGCAAAGCTGGAGAATTGATCGATAACGCGAAATGGAT
TGAGAATAAACAAGGTGGTAAACTTTGTCAACTCGGTAACAAATGGGTGG
TGAACACAGATGGTGGATTAGAATCTAAAGGTCATCCAATTGGTGCTACT
GGTATCGCACAATGCGCCGAAATTGTATATCAGGTGGTAAACTTTGTCAA
CTCGGTAACAAATGGGTGGTGAACACAGATGGTGGATTAGAATCTAAAGG
TCATCCAATTGGTGCTACTGGTATCGCACAATGCGCCGAAATTGTATATC
AGCTTCGTGGTGAAGCTGGCAAGCGTCAAGTGGAAGGAGCTCAGATTGGT
TTGCAACATAATTTTGGAATCGGTGGTGCTGCAGTAGTCACTATGTACAG
AAGGATAGGCGTACGCCCGTCAAAACTTTAACTTCGTGGTGAAGCTGGCA
AGCGTCAAGTGGAAGGAGCTCAGATTGGTTTGCAACATAATTTTGGAATC
GGTGGTGCTGCAGTAGTCACTATGTACAGAAGGATAGGCGTACGCCCGTC
AAAACTTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_010605XLOC_010605-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000255_pilongenomesc0000255_pilon:230571..242318 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1102-1230:130
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