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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000059_pilon:1681273..1684032- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_010488 ID=XLOC_010488|Name=XLOC_010488|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2760bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000059_pilon:1681273..1684032- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TCCGTTGCTGTCAGTGGTGAAACTTACGCCGAATTCCGCGAAGCTGATTG
GTTAAAAAAGCGTTGTTCTACTGCATGGATATGTATTGTGTACGCTCTAA
TCATCGGCATGGAATATTCCTGCATTTCAACATCACTTTTATATTACCTT
CAAGATGATTTGAAATTACAAAATCCTAAGCTTTACTACAGTCTCATAAT
GTGTTTGTCAGCTCTGTCTGCATCAGTTAGCGCTCTCATCAGTGGCAAAC
TATTCGATAAAACACGACGATTAAAGCTGTTTATGTTGGTTTTCACTTTA
CTGACGTTAGTTGGTAACCTTCTTTATACCATGCATGTTTCAGTTTGGTT
TTTGGTAGTGGGAAGATTTTTATGTGGATTGTGTGATGCAGCACAGCCAA
TTATATCTGGTAAGTTGTTTTAACATTTTCACAGGTCTCTTTCAATTGAC
TTCCAAAGCTGTACTCCCATCGAGAGATACTTATTCAAATGCTAAGAAAC
TGCTTCTTTATCCTAAAAAGAGAATTACATTTTTTCCAAGAAGTTGCCTT
CTTTCCCAGCTGGCACACAGCGTTGTTTTAACGTTTTTATAACGTTATAT
GAACGTTGTGAATATTAGATAAACGTTGAAAAGACGTATCGTGTCAGCTG
GGTAGCACACTCACTTCTCACAGACCCACTTGAAACCCTCCCACTAGAAA
GATTGGTAAGTTGTTTCAGCATTTTTACAGGTTTCTTTTCTTGATCTCCA
AAGCTGTACTGGCCAAAAATAAAGCGACTAAAAGAGGCGTAGCATTTGGT
TGCGCTGCACCGATTGGAGAAAATTTAGATTTTGATCCCCTGAGCTTTTT
CACACCCCTGTGTCTCACAGACCAGCTGGGACCTCAGCCCCACTGGAAAA
TTGGGCAAAAAATCTCGTCCCTGGTGGGAAAGTACCCTAATATTTTCCAC
TGGGAAATTGACTTTGATCTCAACCCCTTCGAAATTCAATGTTTAAAAAT
TGTGCTCCAAAACCATCCCCACTGGATTTTTAACCTTGGAACAATAGAAT
GGGATTTGAATAGGAATTTTTATCCCCACTAAGGAAAAAATTCCACCGGG
GCCGTGAGACAGTGGTGTTTTTTGAACCCTTAATCATTACCCCCTTCTCA
TCCCGCTGGAGCAGAACCAGTTTATATCCTAGCATGTATTACCCGAACTC
CTATGAGAAATACTCATTCAAATGCTAAAAATATACTCCTTTATCCTAAA
AAGAGAATTAAATATTTTTCCAAAAAGTGCCCTTCTTTCCCAGCTGGCAC
ACAACGTTGTTTCGACGTTTATCTCACGTTATATGGACGTTGTGAACATT
AGATAAACGTTAAAAAGACGTATTGTGCCAGCTGGGTTAGTACACTCGCT
TCTCACAGACCCACTTGGAACCCTTCGCACTGGAAGAATTGTCCAAAATA
TTGCCCCGGTGGAAAATTACCCTCCAATTTTTTCCCCCACTGAAAATCAT
CAAATAAATCAATCTTTCCCATTCCACTGAATTTTCTGACTTGAAACAAA
AGAATTTAGATCCCCGGCTATAAAAAATATGGCAATATCGATCCTTATCG
AGTTTCAGTCTGTTCGTTATTTCTACTCCCACTGGCTGAAAAATATCCTA
CTGGGTCTGTGAGACGTGGGTGTATAGCAAAGTTTATCAGAAGTTTTACT
GTCTCAAAATTAAATGCAATGAATTTGGGATGATTTTTAATGTAGCATTC
AAGGAGGAGTATTCAAATGATTCTTAAACTTAAATTTCTTGTTTATTCCA
GGTGAATTTTCGCGATTATACGAAGGACCAGAACTAACAAAAAAGCTATC
ACAATACCAAGCACTTTATGCGATTGGATTCCTTTCTGGACCTGCAGCTC
CAGTCATGTTTGGTAAAATTGATATCAAAATTTGTAGTTGGTGGACTTTG
AACCAAAATAACTTTGTTGGTATATTTATGGCACTCTTAACCTTGGTAAT
ACTACTTGCAATACTACTGGGTGTTCATGATCTAAGCATTCAAGATGTTG
CAGCGAATACTCAAAGTGAAATGCCAATAAATACGTCACAACCTCCGAGC
AACAGTAGTTTTAACCTAAAAAGCATTTTAAAGAATCTAGATTTGATGTT
GTTAATTCTTAGCTCATCGTTCACCAATGCACTTGCCGGTATGTTGGAAT
TGATGATCAATCTGACTGCCAGCGATTGGTTCAAATGGTCCTTGACTCGT
CTTGGCATTGTCACTTGTATTTGTGTGGTGATCTATACAGTTCTGATGTT
AACTGTAGCTCATAAAGTTATCCAACGCTACTTGAAGTTTTTGTTCCTAT
TATGTTTTCCAATACACGCGTTATGTGTAATCATTCTAATGCTGCCAAAG
ATAACCAATATTGATCACCTTTACTCCCAGGAAGCACATCTTGCTTTATG
CATTCTCACCAACACTTTTACTGGATTAACTATATCTGTTTTATCCAGGA
ATCTATTATTTCAAATGGTTCCAGCAGGCAGTGCTAGTTTTTCAGATGGT
TTTAGAAGCACAACCCAACGTATTATGGGTATTGTAACATTTTTCTTGGC
AGCATGGGCTTATGATACCAGTGTGGTTACATCACCTATATTGTCATTAG
TTTTGTTAATGATTGCAATTATCCTTGCAACACGACGGAAGTTTCGACCA
GAAGTTTGTGGCGTTAACCAAGAACATCGACTGTTGTTGGATGAAAATGA
TAATTTATAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000059_pilon:1681273..1684032- >XLOC_010488 ID=XLOC_010488|Name=XLOC_010488|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2736bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000059_pilon:1681273..1684032- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TCCGTTGCTGTCAGTGGTGAAACTTACGCCGAATTCCGCGAAGCTGATTG
GTTAAAAAAGCGTTGTTCTACTGCATGGATATGTATTGTGTACGCTCTAA
TCATCGGCATGGAATATTCCTGCATTTCAACATCACTTTTATATTACCTT
CAAGATGATTTGAAATTACAAAATCCTAAGCTTTACTACAGTCTCATAAT
GTGTTTGTCAGCTCTGTCTGCATCAGTTAGCGCTCTCATCAGTGGCAAAC
TATTCGATAAAACACGACGATTAAAGCTGTTTATGTTGGTTTTCACTTTA
CTGACGTTAGTTGGTAACCTTCTTTATACCATGCATGTTTCAGTTTGGTT
TTTGGTAGTGGGAAGATTTTTATGTGGATTGTGTGATGCAGCACAGCCAA
TTATATCTGTCCGTTGCTGTCAGTGGTGAAACTTACGCCGAATTCCGCGA
AGCTGATTGGTTAAAAAAGCGTTGTTCTACTGCATGGATATGTATTGTGT
ACGCTCTAATCATCGGCATGGAATATTCCTGCATTTCAACATCACTTTTA
TATTACCTTCAAGATGATTTGAAATTACAAAATCCTAAGCTTTACTACAG
TCTCATAATGTGTTTGTCAGCTCTGTCTGCATCAGTTAGCGCTCTCATCA
GTGGCAAACTATTCGATAAAACACGACGATTAAAGCTGTTTATGTTGGTT
TTCACTTTACTGACGTTAGTTGGTAACCTTCTTTATACCATGCATGTTTC
AGTTTGGTTTTTGGTAGTGGGAAGATTTTTATGTGGATTGTGTGATGCAG
CACAGCCAATTATATCTGGTGAATTTTCGCGATTATACGAAGGACCAGAA
CTAACAAAAAAGCTATCACAATACCAAGCACTTTATGCGATTGGATTCCT
TTCTGGACCTGCAGCTCCAGTCATGTTTGGTAAAATTGATATCAAAATTT
GTAGTTGGTGGACTTTGAACCAAAATAACTTTGTTGGTATATTTATGGCA
CTCTTAACCTTGGTAATACTACTTGCAATACTACTGGGTGTTCATGATCT
AAGCATTCAAGATGTTGCAGCGAATACTCAAAGTGAAATGCCAATAAATA
CGTCACAACCTCCGAGCAACAGTAGTTTTAACCTAAAAAGCATTTTAAAG
AATCTAGATTTGATGTTGTTAATTCTTAGCTCATCGTTCACCAATGCACT
TGCCGGTATGTTGGAATTGATGATCAATCTGACTGCCAGCGATTGGTTCA
AATGGTCCTTGACTCGTCTTGGCATTGTCACTTGTATTTGTGTGGTGATC
TATACAGTTCTGATGTTAACTGTAGCTCATAAAGTTATCCAACGCTACTT
GAAGTTTTTGTTCCTATTATGTTTTCCAATACACGCGTTATGTGTAATCA
TTCTAATGCTGCCAAAGATAACCAATATTGATCACCTTTACTCCCAGGAA
GCACATCTTGCTTTATGCATTCTCACCAACACTTTTACTGGATTAACTAT
ATCTGTTTTATCCAGGAATCTATTATTTCAAATGGTTCCAGCAGGCAGTG
CTAGTTTTTCAGATGGTTTTAGAAGCACAACCCAACGTATTATGGGTATT
GTAACATTTTTCTTGGCAGCATGGGCTTATGATACCAGTGTGGTTACATC
ACCTATATTGTCATTAGTTTTGTTAATGATTGCAATTATCCTTGCAACAC
GACGGAAGTTTCGACCAGAAGTTTGTGGCGTTAACCAAGAACATCGACTG
TTGTTGGATGAAAATGATAATTTATAGGTGAATTTTCGCGATTATACGAA
GGACCAGAACTAACAAAAAAGCTATCACAATACCAAGCACTTTATGCGAT
TGGATTCCTTTCTGGACCTGCAGCTCCAGTCATGTTTGGTAAAATTGATA
TCAAAATTTGTAGTTGGTGGACTTTGAACCAAAATAACTTTGTTGGTATA
TTTATGGCACTCTTAACCTTGGTAATACTACTTGCAATACTACTGGGTGT
TCATGATCTAAGCATTCAAGATGTTGCAGCGAATACTCAAAGTGAAATGC
CAATAAATACGTCACAACCTCCGAGCAACAGTAGTTTTAACCTAAAAAGC
ATTTTAAAGAATCTAGATTTGATGTTGTTAATTCTTAGCTCATCGTTCAC
CAATGCACTTGCCGGTATGTTGGAATTGATGATCAATCTGACTGCCAGCG
ATTGGTTCAAATGGTCCTTGACTCGTCTTGGCATTGTCACTTGTATTTGT
GTGGTGATCTATACAGTTCTGATGTTAACTGTAGCTCATAAAGTTATCCA
ACGCTACTTGAAGTTTTTGTTCCTATTATGTTTTCCAATACACGCGTTAT
GTGTAATCATTCTAATGCTGCCAAAGATAACCAATATTGATCACCTTTAC
TCCCAGGAAGCACATCTTGCTTTATGCATTCTCACCAACACTTTTACTGG
ATTAACTATATCTGTTTTATCCAGGAATCTATTATTTCAAATGGTTCCAG
CAGGCAGTGCTAGTTTTTCAGATGGTTTTAGAAGCACAACCCAACGTATT
ATGGGTATTGTAACATTTTTCTTGGCAGCATGGGCTTATGATACCAGTGT
GGTTACATCACCTATATTGTCATTAGTTTTGTTAATGATTGCAATTATCC
TTGCAACACGACGGAAGTTTCGACCAGAAGTTTGTGGCGTTAACCAAGAA
CATCGACTGTTGTTGGATGAAAATGATAATTTATAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000059_pilon | genome | sc0000059_pilon:1681273..1684032 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 412-1368:958 |
| Aaloc | 1-408:2761 |
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