XLOC_009935 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_009935
Unique NameXLOC_009935
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000338_pilon:62693..72551+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_009935 ID=XLOC_009935|Name=XLOC_009935|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9859bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000338_pilon:62693..72551+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTGTTCAAGGAATTTCTTTATCCTGGCATCATGCATATTTTTGTCTAT GGTTCATCAAATGTCATCGGTTGAAGTTGATGCTACGAGCAATGGTAAGA AGATATTCTTGATTTTCGGGACTGGGACCTAGGGGGTCTGCGCTAAAATA ggttgtattcatgatatgtaccacTGGAGAGCTTTCCaagaattttataa aatttcctcccaatacgtcacttaaaaattaggaaaagtgacgtattggg tggtacattttaaaagttctcagaagactctccggtgatgcatatcatga ataaagacCtttttttAACCATAACATTCAATTTCCAGGGTTTAGGGGCA ATAAGCGTCTTCCATCCATCCCTTCATGATGTAAATTTTGTCAAGAAATT CTTTATAAAAGCTGGAGGTTTGATAggctggagtcgtttataatgcgtgt aatacattagtataggcgttatatacgggatttgatttataaaattgttc cctcccattactttttggtttatttctactatgtttgaatttttcgtcta gcttgctagactagcgGTTTAAAAGAAACGCACTATGAGGGCGATAAGAA AAACTGTCCTTTGAGTGGCGGAAAGAAAGAATTTTACTTTGGGCAGCAGT ACACTGTCAATTTTCGCATGAAACGATCTCGAAGAAAAACCGCAACACCA CAAGCCactaaaaagtaaataaataggTTGTTGGAATGTTAATGAGAGTT GACCGCCGAAATTAAATGGAATTTCCGTTAAGTGGTAAAGATCTCTGAAT GTCGGCAGGCTTAATATGGTTTTGTCTACTGGATGGAAATAATCGATACA TGTGCCACTAATTGTAATGAAATTCTCAAGTGTGTTGGCTCGTGTTCCAT TCATTTCTGTTCCCCCACAGATACCTTACGTCGTTTTATGGTTTTTCTTA 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CATTTGCTGCGACTGCAGTGCACACTGAACAAAATACAGCGCACAATTGT TAGGGGAAACGGGGGTAtatttctcaaatatttctatccATGGTtacagt caatttttttttcgatttccacAGTTCCAAAGGAATGCATGGACGATTTG ATTTACGGAGAATTCTGCAACTCATGGAAGGAGCGTGGACAATGTTCAAA ACAACCGCTCATCATGAAAACATACTGTAAGAAAACATGTGGTTTCTGCA ACGACAgtagcaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacgacaacaac aacacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaatgtttctaaa aaaacataa

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000338_pilon:62693..72551+

>XLOC_009935 ID=XLOC_009935|Name=XLOC_009935|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2152bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000338_pilon:62693..72551+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTGTTCAAGGAATTTCTTTATCCTGGCATCATGCATATTTTTGTCTAT
GGTTCATCAAATGTCATCGGTTGAAGTTGATGCTACGAGCAATGATGTGT
TCAAGGAATTTCTTTATCCTGGCATCATGCATATTTTTGTCTATGGTTCA
TCAAATGTCATCGGTTGAAGTTGATGCTACGAGCAATGAGATCGATTTAC
GTCCGCAATGCAAAGATTCACACGATTTATATTACGCCAATTGTTTTAAC
TTAAAGCGAGCAAAACTTTGTGACTtggagaaaaataaaatgagatTTTA
CTGTCCCCTCACTTGTCGCCAGTGTaaagAGATCGATTTACGTCCGCAAT
GCAAAGATTCACACGATTTATATTACGCCAATTGTTTTAACTTAAAGCGA
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CACTTGTCGCCAGTGTaaagGACCAATCGATGAGAATAGGGTGAGTAGGC
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TCGGATGTTGCAACGATAACGAAACAGCTGCTCAAGGAAAAGACTTTCTC
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CGGTTACTGTACGGTATTGAAATACGAGAAACGACTCACGAAGAATTGTC
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GGGATCGCTCGAAACCTTTCAATGGTCGATGCCCAgACTGTGCTGATCGT
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CTCATCATGAAAACATACTGTAAGAAAACATGTGGTTTCTGCAACGACAg
tagcaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacgacaacaacaacacaa
caacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaatgtttctaaaaaaacat
aa
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_009935XLOC_009935-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000338_pilongenomesc0000338_pilon:62693..72551 +
Properties
Property NameValue
Aaloc1021-1074:9806
Aaloc844-1020:9627
Aaloc721-840:8663
Aaloc358-717:7752
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Aaloc97-234:6477
Aaloc1-93:1