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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000023_pilon:803100..812489- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_009856 ID=XLOC_009856|Name=XLOC_009856|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9390bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023_pilon:803100..812489- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) CACGTTTTCATCTTTCCAAAAGTAGTTGGTAAGTATAAATTGTATTAAAG
GGGTTACACACGAAACGAAAGTCTCGTGCTCGCAAGCGAAAGGTTTTTCA
AACACTATCAACCAAAGCGAAAAGCACCAATCGCAAAAATTTGGAAAAGC
CACTGTATTTTTGCTTTTGGATTGCTAGATTAGCTAGTTGGCTTAGGTTA
GGGGGCTTGTGGATTGTTATAGGTAAGTACGGTACCGTAGGATGGTCAGA
TGGTTAAAAACTCTCTCATTGTGGAAGAAAATTTCCGATTGCCAGTTTAC
AACGGAAAAAGACCAAAACTTATGAACTAACCCCAAAAAACGCTACAAAA
GTAGATTTAGCTTGTTAAGGCTTAAGCATAGCTGTCAACTTCGCATCACA
AAAATGCGGGAGAGCAAAAATCAAAGTCGGAAAAATTTTCCCCGATAATC
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ATCCGATTTTATTGGAATTTTTTTTCGGGAAATTGGGGAATTTTTCGTTC
CGATCTTTCAAAATCCAGAAATTTTGCTGCTTGGTTTTTCCAAAATCGGG
AAATTTTTGGAAATGCGGGAGATGCGGGAGAAAATCCCAAAAATGCGGGA
GATTTGGCAGAATTTTCTTCACGCGGGAGAAATCGTTGACATGCAGGAGT
CTCCCGCTCAATGCGGGAGAGTTGACAGCTATGGCTTAAGCGGGTTAGTA
AGTTGTGTGTTGTCTACTGTACTACTTACACATAACAATAATACGAACGC
TCCATTATCAAAAGTTCTGAAATCCCAAAAAAGCAACCTGAAATCAGATT
GCGGTTGTTTTTCTGCCCAAACAGTGTAGCTCTAAAGCTCTAAAAACGCA
TCTAATAACATGAAAACCAGAATATGATTCTTCAATGGGAATCAAAACTA
TAAAGTGGACTTACAAACATCAATTTGTCAGATCTAACAAAATTTATAAC
GGCACTGTCATCATTGACAATAAAACAAAAAATACTCTGTCAAGAGCCTT
GTAAACATTCCAACAACTTCCATCGAAATGATCTATCACAGCTCAGTCTA
CCATTTTTAGCGCAGTCCGAGGATTGAACCGAGAACTCTCGCAGAGCGCC
CGAGCTCCCGCGCGGCACGCACCTTGGGGATGAAAAACTTCAATCTGTCA
ATCCTTTTGTCTCAAGCGAAGAGTACGCAAAGCGATTCTAGCTTTACGAT
AGTGCCGCAGATCATCAATGGATAGTATTCAATTATCATTATCCCTTTAT
TTTCATTCCTAGAACTTTTGCAAAAAAAAGGAAAAATAGAAAAGTTGTAT
TTCCTACTGCTCAATTCACATACTGAATTTGAAAGATCTTCTATGTGGCG
TTTTTTTGCAAACTTCAAAAAACTGATTTTTGTCCCGCCTTTGCGGGATT
TTGGCTCAAGTGCTTGAGTGCAGCATAGGGTACAAAGTCCAAATATGCGT
TTCCCGTAATTTTTGTATGAAGAGTTAGGTCTACACTGCCAAAGGGAAGC
TCTAAAAAGGGATGAGTGAAAATATATAACAATCTGATGACAGATGCAGC
CAACGAGCCCATTTCTATGGTGGCCCATGAAGGCCAAATTATTTTTTTAA
ATTGAAATGATTATTTATTTCCTAAACTAACGAAAAAAGTCAAAACATAT
CCATTTTGATTTTCATTTTCAAAGTACTGTCCATTCTGGTCCATTTCGTA
GCCCATAGACCCGTTTCAATGTTTTGATTTTTCGCGTTTGTATGCGCATG
CGCCAAAATAGTTACGGTTTTTCAGAGGCAGAAAACACGAAGCGCTCGCT
GGAAAAAGGCAGTTTTGATTTTATTATTCAAAATCTCTTCATCAGAATTT
CATGAAATTTTAGAATAAGAATCCTATATATAGTTATTAGATAACATACT
AAAATTTCTATTCAAAATTCCTTCTAGATCCTGAGAAAATTGACATAGTG
TGCCTCCAGCTAATGTTGTTGTCTTTTTTGCCTCTGAAAGTAGGGCCGTT
TTGCGGGTCGTAACGAGCCGATGTAAACATGTGACGTCACATGAAACGGG
CCTATAGATAGGGTGCGCACTCGTCGGGATTTTTTGCATGGAACGAGGAA
GAATTTACAAAATTGCATTAGTACTTATCTTTAAATTATCCAAATCTGTT
CATTCTTTTTGCTCCGGCCTAGGAGCCTTTAATTCTCTCTTCCGACGGTC
AAGACATTTTTTGTTTGTTTATCTAATCCGATAATCTATTCTGATTTAAT
AAAAACGGATTATCTGGATTTCGATAATATTGCGAAAGTATTTAGAAAAA
GATGGCTGCCGAAAGTGGGCTTAGCTGCAAATCTCAGTGAAAGATAATGA
TCATTTTCATCATTATTCATGATGTTTTGGACATGATTTATGAGAATTCT
GATGCATACTGGTCTATAACAATGTGGAAAGACTTTGGAGAAATTTTGGC
CTTGAATTAAATCTTGAAAAATATGGCTAACTTCTCTAGTTTTATGGACG
CACAAAACAACCACAAAACCATAACACATAAAACTCTGTGAAACTTTCAA
ACACACATCCATTGGAATTCGAAAGAGAATACTAAAATTACAACATTACA
GTGCAAATTTGAAAACGATCTGAGCAGTTTTTGTGGTGTTATGTCATATG
TGTATGGCTGAAAATGATCCTGTTTTGTAGGTATTCATCATTTTTTGACT
GGGCGACCATTCCTTTTGATTTTTCAAACCCGACACAGATATTTTACAAA
CATATCACTATAAGAATTCAATAAAGGATACTAAAACACAATTCCTGTGT
GAATTTGAACAAGATTGGAAAAAATTTCACAGTATTATGGCTGAAAATGA
TCGTTTTTTAACTTTGTATGTTGTAATTTCATTGCGGCTGACGACCGTTC
CTTTTGATTTTTCAAACCCGACACAGATTTTTTATACAAACATATCACTA
TGAGAATTCAATAAAGGATACTAAAACACAATTCCTGTGTAAATTTGAAA
AAAATTGGAGAAATTTTCACAGTGTTATGGCTGAAAATGATCGTTTTTGG
ACTTTGTCGTAATTTCATCGCGGCTAGGCGACCGTTCCTTTAATTTTTCA
AACCCGACACAGATTTTTTACAAACATATCACTATGAGAATTCAGTAAAG
GATACTAAAACACAATTCCTGTGTAAATTTGAACAAGATCGGAGAAATTT
TCACAGTGTTATAACTGAAAATGATATTTTTTGGACTTTGTCGTAATTTC
ATTGGCTGGGGCGACCGTTCCTTTTGAAGATTTTTCAAACCCGAAACAGG
TTTTTTCCAAATATACCACTATTTATTACATACACACTATTGTACCATTT
TATTTGGTTTATCCTACTCTCCCCCAAGTATTATCCCAACAGAAAAAATA
ATGCTTAGCTAAAAGCCTGTGGCCTCTAATTTAGGCTATTTTTCTCCACG
AAATTTTATCTGGACAATCAAATCAAGAACTTGGAAATATTGACTTATAA
ATGTTTATCTCATTTAGCTCCAATGTTGAACTTTTTAGTCGAGAATGAGT
GGGCGGGGGATGGGTTGGTTCTTTAGGCGAGAAAGTGCATGTGTAATCAC
TTAGAAGAGCTAAACTTCCAGCTGGTTTATTTATTCGTTAAGATTATTTC
TCATACTCGCTCTGCAATAGAATTATTACTTGGCTTTCTGATCTGTTCTG
ATTAGCAGTTTGTGGGCAACGTTCTAACACAACTAATTCAACAAGCTCAT
CTTTCACATCTTTTAATCTCTTAAGCCGGAGCTTCCAGCGCAGCTGGTTT
ATTTTAAATCAATCACGAATTATCAGGGAAACAAGTAAAAAAAACTGCAT
CCATTATTTTCTTTCCAAAGATATTGATGTTTTTCGACATCAAGGTGAAA
ACACGACTTAGGCGAGGGGAATTTGATGTTCTGTTTACCGTCACGTTGTA
AAAAATATTTGATGCAGCAAAATTTTCATTATTCCTACCTAGTGCTTCCC
ATCTCCAACGAAGTTTAATTCCACAGTGAAATCGAGCTGCTTTCACTTTC
GGAATCAAAATGACCATGCGCGTGAATTCAAACGCGTTCGAGACGCGTCT
AAAACGCAAATTTTTAAAACGCCCTTGTAGCCGCCCACTGCTTAAAAAAA
TGCCTGCCCCATTCGCGGACGTGATTTGAACCATGTTTTTTACTCTAGGT
GCACATTTTGTTAGCGAAGATGTTATTTTTGATTCACTTTGAGTGTTTTG
GATAGCTTGGCACAGGAAAAGAAGAAAATAATGAGTCTTTAAGAAACAAT
GAACTTTTTTGAGCTGCAGCTCAAGAGCATGCTGGCGGTCGACGGTAAAC
AGAACATCAAATCCCCCTCGCCTTAGTGCTGACCACAGCACCGGAAAATT
CTCGACCCACATTGAAACAAATGGCTGTTGCTAATGAGCTGGTTCATCTT
TTCAATCGGGTTTTTTTTAGTAATCCCAGGGTAAGATTAGGCTACAATCT
ATCACAATACGCTTTATTTGAAAATCTACAGGCCGTCTGGAATTTTGAAA
AATGGAAGAAATTGCGATTTTTTAACAAGATTGCAGATTTTTTCATTTAA
ACACCATACACCATCTGAAAGCTGAGGATTTCAGCTTTATATATAGTGGT
GAAATTTGTTTTTAGCTATCATTTCCAGCTCATTAGCAATAAGCTAAAGT
TTACCAGACCAGATTTTCAGACCACACCGGCAAAACTCTCCACACCCTGC
CACACGGAAGACTAGATTTCATCCGCCATTTTTGGCGCGGTTTTGATGCT
TCAGAAAATTATTTCTTGCTGGCGTGGTAAGGAGGCGATTCTTTGAAAAG
GTGATTTTTTTGTGTTTTGAAAATAGAATAACTTAACCAATTTTAATAAA
TGACCCCTCATTTTTTTCAGAAAGGTAAGGACTTTCAAATAAAAATTAGT
TTGGTTTCTAAAAATTGAGGGGAAAATTTCGGTTAAGTCAAAAAAATCTA
CCTTGATTTCAATTTTTCAACCGCTTTTTAAATGTTGTGTCCTTCATGGT
CCATCGCGTGGTCAATTGAGGACACTAAAATTTTGGCTGCCGTAAGATTA
TATTGTTTTGATTTTTATTTCCAAAATGGTACCTCTACATGCATGCTCGT
ATTCTCATGAAAATGAAAGAAGTCTTTGTCAGTATGTTGAGTATGTGTTG
TTTTTGAACTTATGGAATCTTTTAAATGATTCGTTTTTATAATTACTATG
TAGTTGTGTACTTCATTTGTGCACCCACAAACTATTTGATGAGCATTATT
AATTTCAACACTGTAAAAAGAATGAATGAGGGGTGTGCTTGGTTACAACA
TATTTATTTTTTGCTTCAAACAGTTACATCAATATGTCAAAAACATTTTG
TTCAACTACTTTTATAGGATGAACCATATTCATGTGGCTTTCAGCCTTGC
ACTCCATCGCAGAGGCTAATCAATTTTAATGACTTTTTTTACTAATGACC
AAGCTTTCATAAGAAACTAAATCAGTCATCTACAGGATGTATTTGCAACA
ACAAGGATGAGAGTTACCTGAATCAAGTTCAAATTCCCCAGACAATTAAT
TAAAACTTGAAAACTTAAATGAGACAAAATGACCGGTTGTGAACGTCCAG
CAGCCAAAATATCAACCAACCAAATTTTGTTATTCGATTCCCGAGACAGC
GCTACAATTTTTAAGGCCTTGTTTATATGCTAAAGTAATTAAAAAAATTT
TGCATATGTAAATGGGTCAGTGTTTGAGGTCTGGCAAAATTTTCAAGAAA
TAGTCTATCCGGCGGTGCGCGGATCTATGTGGGTTCTGTCTCCCCCGTAG
ATCTTTTTCTTGGGAAGTTGATCTTCAAATTAGTTTTCAATGTTGCCTTG
GCTCAAGTCTTTTCATCTATGGCTAAAATTTTAGGCAATTTCTCATAGTT
TTTGAAAATATTAATTTCATTAAAAAGTGCCAGGTTATTTTTTCATGAAT
CCCTTTAGAAGTTTTGTGGCACATTTTTTTGCTTGCAACTTAAGTAAACG
ATATAGCGCTTTCGCAGCAACAATCTTTGATACGCATTTCGGCGGGACGC
TAGTGTGACTAACTGTTGCATTGGAAACAGATTGATGATTCTCGGTTCTG
ACTTCTGTAACTAGCTACCATGAAGTCGGGTAACTTGCATCAGTGGAGGG
AAACTTGCATAACCATCAAATGAATGACCAATCAAAGCTTCACAATTTCA
AAACAAATGAATTACGCAGCTCTGCTCACAGCTCTACTCTACCATTTTAG
AATCTCATATATGCTGTGCGAGTAATTTTGATAATAAAAAATCATGGGAG
ATCATAAATTTAAAGATGGCTGGATTTCAGACGTTTCTCGCTGGCTTCTG
GACGTGTAACCTCAAAGTTAAACATAATTATGCATGACATCACTTTTGAT
TAGGAGATATACATTTTACCACCTGCAAATTTTGTAAATCCGGTTTGTTT
TGATTTAACTTTTTATTTTAATGACTAGCCAAGTCATTCATTTGAGGGCT
ATGGAAGTTTCCCTCCACTGATATGCAAGTTACCTGACTTCACGGTATTA
ATCCTAGAGATCCGATCTTTTGATATTTTATTTATCATTGAAGTATGACT
TTTTGAAATTTAGTAGTTCCTAAAATTTCTTTTAAAGGTGTCCCGTAAAT
TTTGGGGTAATTACAGGACACCCTCGGGGAAAATATGGGACAGGTATGAC
ATGTTATTGAAAAATCCAGATATCATTCCAAAAGGTCGTGATATTTGAGA
TTTTGAATCCACTTGATGACTTAAAATCCAAGTGCTATCATTTAAAGATT
TAGAGTGTAGTTATAATTCCATCAAACTAGAAAATCAAGTTTGTAGTTTT
CTTATGGTTTTTTTGACTTTGTTGAAAACTGGATTTTTCCTGATTTTTTG
CATGGAAGTAGGGTACCATCAACGGAAAAAGATGGGTGAAGCAGATTTTC
TCAAAAAAACTTTTTCGCCATAAAAATTGAATCTTTATCCATAAGAATCA
CTATCTATAAGCATACATTAATGTTTTTAATTTTAGCCAAATTACTCAAT
TTATTCCAAATCCCTCCCTTTAAAAACCACCCCAATGTGCACGGGGGACT
AAACAATAATGAAAACAAATGACAAATTCTATTAAATTGTCACTATTTGT
GTTCCGAATGATTGTTTTAACGGTCACGCTCAAGTAGATATCAATTATAT
ATGTGTTAAATGCATAACCAGGTAGGTCCAGGTATCACTTGTTTGTGGAA
CAAATGGTCGAGAGTGGAAAGCCCTAGGGCTACCAAAAATGTCTTGAATC
TTTTGGGGGACTTAAAACTCAGAAGGGACCTAATTTTTGCCTGGGACCTA
AACCCAGGCTGACGCTATGTCAATGCTGCACGCAAGTATTTAAGCTAAAG
TCCCACTAAAGCTGGACAAAAATCACGTTTTTTAGTGTTTGCAAAAATAA
TGCCACATATTGTATTTTATGATTGACAGATTAAAGTTTTTTCACGCCCA
AGGGAGTTTGCTGTTCTGAAGGAGTGGCTATTTCAACTTGAGGCCAAATT
CTCTAACCATGCGAGTTGTTTTTAAAGTTTTTACAATATTAGAACTTAGA
TGCAGAAGATCTTACGGAACATTTTAAATGTGGTTCAGCAGTTCAAAAGT
TATAGTGTAAAAAAGTAGTGTAAAAAATCACTTTTGAAAAAGTACAAAAA
CACATGAAAAAAGGGAATCATCGAAACCCCATTGAAATTAATGTTTAAGA
TAGATCATATTCTACAGTACTTTTTATTTAAGATATAAGTACAAAATAAG
GAAATGCTAAATCTAGGCATACTCTTCATCACCATAAATGTCTTTATGTT
TGGGCAATCTTCAAAAGATGAAATTTATCTTGGTGTTGACCAATTTCAAG
AATATTATGATTTGCCAGAATTGCCATACAGTCTTGACTCTTTGGAACCA
TGGATAGATGCTGAGACAATGAATGTGCACTTTAAAGGACACCATGCAAG
CTATATGGCTAAGATGAATGCAGCTTTGACTGAGTGGCGAAAATCTGTAA
GTAATTTGTGTGACCTTTTAGTTTATATATTTATTAAGTATTATGAGAAG
TGAGAATTGGGATCAGAAATCCTTATTAAATTGAGTTTCTCCTGAAAATG
GTTTTTCCAGCTGACGAGCTCCCAAGCTATTTTTCCATATTTGATTTACT
TTCGAATTAAAAAAAGGAATTCTTGTGAAGTAAAGTAACAAATGAATTGT
TGATGTTGGTGAAAACTAGATATACTGTTTTCATGGTTTAAATTATGAAA
TTCATGCAAATAGCTTCAGCTTTCTCCCCACTTTTCTAGGAACCAGAGAA
TGAATTAGCAAAGAAATCATTGGTAGACATTTTGAAAGATGTGGATAGTA
TACCAGAAAAATGGAGGACTGCTATTCGAAACAATGGTGGCGGGTATTTA
ATTTTTTTTTCAGGCTCTCTTCGCATTGATAAAAAATAGGAGCAATTTGG
GATAAATAGCCAAAGGTTAATTAAAAGTTTTTCTGAAAGCTGTCTATGCA
AGCTATTTTTAACTGAATGCAGTATGGAAGAAGAATCTGAATCGAATTGG
TTTCCTTTTCTCCCAAAGTTGTTTAAATCTAATCTAAAGAATATTTTTTG
GTCTTATTTTCTAGGTATTTAAATCACATCTTTTATTTTGCTACAATGAG
TCCAAATCCAAAAGGAATGGAGCATACTATGCCATTAGGTATTTTAACAA
ATTTCCGCAAATCTTTTCACAATTTCACCCACTTCCAATCATGGATGAGT
AAAGAAGCAATGAATTTATTTGGATCTGGGTACGTTTGGCTTTGTCGTGA
ACCAAATGGTGGATTTTTTACCATTTATGCAACAAAAGATCAAGCTAGTC
CAATCACATATGGATTACAGCCTATCTTGGTCATTGACGTATGGGAACAT
GCTTATTATTTGAAACACAAAAATAAAAGGTAATTCTAATTTCTGGTATT
GTTGATTGTTTTAAAAATTGCTGTCTTGAAATGGAAAAAAGAAAGTTCAT
TTTGATTTTTTATAAAGAAATCATTATAGTGGTCTTGCTTTTTTAACATT
GTGTAGTCTGGTGAGGTTATTATGGATAAAAGTTGGGGGTGTGGATATTA
TTGCATGATAATGAACACGTTATTGGTTTTTTAGGAAAAACTACATCGAC
AATTGGTGGAAGATTGTAGATTTTTCAAAGGTAGAAGCACTTTTGAATTG
GTGGTTGAATTTTGAGAAGAAATCACATGATGAACTTTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000023_pilon:803100..812489- >XLOC_009856 ID=XLOC_009856|Name=XLOC_009856|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1362bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023_pilon:803100..812489- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) CACGTTTTCATCTTTCCAAAAGTAGTTGCACGTTTTCATCTTTCCAAAAG TAGTTGAATTGCCATACAGTCTTGACTCTTTGGAACCATGGATAGATGCT GAGACAATGAATGTGCACTTTAAAGGACACCATGCAAGCTATATGGCTAA GATGAATGCAGCTTTGACTGAGTGGCGAAAATCTAATTGCCATACAGTCT TGACTCTTTGGAACCATGGATAGATGCTGAGACAATGAATGTGCACTTTA AAGGACACCATGCAAGCTATATGGCTAAGATGAATGCAGCTTTGACTGAG TGGCGAAAATCTGAACCAGAGAATGAATTAGCAAAGAAATCATTGGTAGA CATTTTGAAAGATGTGGATAGTATACCAGAAAAATGGAGGACTGCTATTC GAAACAATGGTGGCGGGAACCAGAGAATGAATTAGCAAAGAAATCATTGG TAGACATTTTGAAAGATGTGGATAGTATACCAGAAAAATGGAGGACTGCT ATTCGAAACAATGGTGGCGGGTATTTAAATCACATCTTTTATTTTGCTAC AATGAGTCCAAATCCAAAAGGAATGGAGCATACTATGCCATTAGGTATTT TAACAAATTTCCGCAAATCTTTTCACAATTTCACCCACTTCCAATCATGG ATGAGTAAAGAAGCAATGAATTTATTTGGATCTGGGTACGTTTGGCTTTG TCGTGAACCAAATGGTGGATTTTTTACCATTTATGCAACAAAAGATCAAG CTAGTCCAATCACATATGGATTACAGCCTATCTTGGTCATTGACGTATGG GAACATGCTTATTATTTGAAACACAAAAATAAAAGGTATTTAAATCACAT CTTTTATTTTGCTACAATGAGTCCAAATCCAAAAGGAATGGAGCATACTA TGCCATTAGGTATTTTAACAAATTTCCGCAAATCTTTTCACAATTTCACC CACTTCCAATCATGGATGAGTAAAGAAGCAATGAATTTATTTGGATCTGG GTACGTTTGGCTTTGTCGTGAACCAAATGGTGGATTTTTTACCATTTATG CAACAAAAGATCAAGCTAGTCCAATCACATATGGATTACAGCCTATCTTG GTCATTGACGTATGGGAACATGCTTATTATTTGAAACACAAAAATAAAAG GAAAAACTACATCGACAATTGGTGGAAGATTGTAGATTTTTCAAAGGTAG AAGCACTTTTGAATTGGTGGTTGAATTTTGAGAAGAAATCACATGATGAA CTTTAGGAAAAACTACATCGACAATTGGTGGAAGATTGTAGATTTTTCAA AGGTAGAAGCACTTTTGAATTGGTGGTTGAATTTTGAGAAGAAATCACAT GATGAACTTTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000023_pilon | genome | sc0000023_pilon:803100..812489 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 577-681:106 |
| Aaloc | 262-573:626 |
| Aaloc | 157-258:952 |
| Aaloc | 31-156:1371 |
| Aaloc | 1-27:9391 |
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