XLOC_009578 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_009578
Unique NameXLOC_009578
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000083_pilon:675617..688644-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_009578 ID=XLOC_009578|Name=XLOC_009578|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13028bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000083_pilon:675617..688644- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GCACTTTGCAATAAACACTGACGCACTTTGTAATAAAGGGAAATTTCCAC CTAAACTTTTACAATTTTACGGTTCCACATGGTGTTCAAATGTTGAGAAA GTCGTGCTTTTGGTAAATTTCACTGACCTTAATATACCCTGGACCAAGTT TCTCAATCCTGGTCAGGCAAAATCTTTGATCGGAGTTTTTTGAAAAGCTG TATCCTAATGGCGGCACTACTCAATAGCGGTGTAAATGCATCGAGAGCGC TAGATCAACTTTCCTTCGAAAACTTTTCATGATGTAGCGCCGTTAGACGT TAATTTTTAACACTACAATTCAAAAAAACCTTTGATCAAAGATGGCAGAT ATAGCTTGGTCCAGGGATATATAAAGGTCAGTAGTAAATTTAGATTCTGG AAAATCCAGATAGCTCGATGTGGGTTTCGCAATCCATAAATTTCACCCAA AAAGTTCGATGGCCCTTTGTATACATCTAGAATGTTTGTGTGTTATATCA AACAACCTAAACCGTTTTAGAATAGTTTAGATGAAATTAATAGACTTGAC GAAATTTATTTCATATTCAGCTTGTAGCTAACCCACAACCGGAAACTCAA ACTTACCAAAGTGTTGGATATCGGTACAAACTGAAAGACGATGATTACAC CGACACTGAGGATACCATGGTTATCATGCAAGTAAAAGAGGATGTTGATA CCTCGTCTGAAGATGCCATATTCGATGGTGGTGTGGATGCCGTTTACCTC AATCGCTTTGGTTTGAAATACCCAGGGTATTCATATTTTGATTTCATTCT CTCTGCAACTCGAAACTTTATAACTCGGATGTCTCTTTAACAAGTTTGCT GATCCGCTCAGCTAACAATGACTTCTAAAATAGTCTCTTTAATCCGAATT TTTCATATATCTCGAACAAATAACTCTTACTTTTCATTGGTTCATTTTCT TAGGAGAAATGCATACTTCCAACCAAGGGTAACAGCAATCTTTGGTAATC GAAGAATTTTCAACGTCGTAGCCACCACTCGTCTCTCCAACTCCAATGTT TATTTCGATGGAAATTTTGATCTTGCTGTACTCAACACGAACCCGGACTT CTACCGTTTTATCAAGCACGATGCAAGCAGGTTAAACGAAGGATACTTCA AATTCTATGTAAGATTGTTTGTTCTTCTTCTTTTTGTTCACAATGTAGAA CCATTCGGGAAGAACGTGCCGATGGCTTAAATGAAATGAAAGCCTTTTGA TCTTATACCAAATCTATTCGACAGTATGATTACAACGCGGAATCTTACAA AAACCTCTATAAAGAGCATAATTTTCATTGGAGGGTGACGCACGTTAGAG TTGTTAGTCGATATCTTATTTAAAGAAGGTGAATAAAAAATTTGAAAATG TGATTTCTTGGTGTTTTCAGCCTGCCTTTTTGAGTGATTTTAGGCCAAAA AATGAGTATTTTAGAAAAGAATTATTTTTGCTATTTTTCTTTAACCTTTT AAGTGCCACGGGAATTTTTTTCTAAGTTTTTTTAAATAAAATCGCTAGTT CAAACTTTAAAGGCTTATATCTCCATATCTAGAAGGATTTAGAAGCTTGT TCATAGCTCGTTGGATAGCTTAGAGTCTCTTCTTTCTTTTTAAGCGCCTC GATCGGCGCTGCCCGATCTGCACAGACCTGCCTGAATAATAGAAAAGTGC CCACCAGTAAAACTCCAAATTAATTCGCTGGAAGACAGAATCAAGTAAAG CAGGGCCAAATTTGGAGGTTCTTTGATCACTCGTTGATCAAAAATGGTCA AAAAACGGTCAAAATCTGGATTTTTTTGCATTTTTTTGACTTTATGGTTT AAAATCTCGCTAAAAAGACTCACTTTTTTTTCTTTGCTCGACCATGAAGC 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TCTTAATTCTTCATTTTTTCTCCCTCGGAAAAGGTAGAAGATTCTCTCCT GGAAAGTCCTTTATACTTTGAACTCAATGCATCAAAACAAGCAGTATCTC CCAATAATGAAAAACATAATAAGCTCGGAGAATCGAATTTTTTTTCTTGT CGCGGATGTAAGAAGTGCTTGCATTCCATTTCGCATTATACAAACGATCA TTCATTGAAATTTATTTTTTTTATTTTTTTTGTTTACATCTTTTTTTGAA CTTATGTTTTTCTTAAAACTGTTAAGATTATATTTCAAAATCAATTTCTA GGTAAATTTCGTATCAAGCAACGTGAAAGCGGTCTTTGTTGGGCTAAAGA TGCAATTGAAAACAAAATCGTTCTTTCTTCAAGATGTCGTGATACATTCT TGATCACAGATAGTTCTACTTTAATGCACGTGGAGAGCTCAAAATATATG GACCGCACGATGACACTCGTTGACGCTTCCGAAGACATTTTTCATTTTTT CAACAGCTCTGGTATTCATTGGTCTCAGACAAGTACCGCTACATTTTGTT ACGAAGAGAACCCTGTCGAGAACAAAGTCAATAAAGGAACGACCGTGCGA GGACCAAGCCCGCCTGATTGTGCAGAAAATCCGACCTGTCACTTGGCTTT GCTACCAGGTAATGGGATTTTCTAGAAAAAATTTGAATATGGGGGGTGGA GGATTTAACAATTTCCAGTGATTTACCCCCCGGACAAAGTGACTTTCGGC CCCCTGGACAACGGGTTTTACCCCCGGACAAGCATCAGTTGACCCCTCGG ACAAGACACATTTTGATTAATTAATTCATGATTTGAATCTTTCTCTAATT TGAAGAAACATTTGTTCCTTTGAAGATCGAATTATCGTTATAAACAAAGT CAACTATAATATTTTCAGGGTAGGTACAATATTTCTTAAAAGTATTAAGA ATTTCTTCATTTCACTTTCATAGATTTCTCAACTTTTTACACCAAACTAA ACGGAAAAAGTATTTCCGTGGTCACACATGATTCAATCAAACTTCAAGTG GTTTGTCAACTTGTCGCAGACCTGTAAGTGTGACCAATATAGATACACTG ATTTAAACGAAGTGAAAGGTCATTCAGATTTTGTTAAATTAGTGTATTTA GCCAAAATCTGACATTATGGAAAGAAAACGTTCCAATTGCTGAAATGTTC ATGCATATCAGATGTTTTTGTTTATAATAGCAGCCCAGCTGGCCGTTTCA ACGTTCATCTAATGTTTACAACGTCCATATAACGTTGTAACAACGTTGTG TGCCAGCTGGGAGAAGTTACGTATTGTTATTAAACGTCACAAATTGAAAA ATCTCTATTACAAAAGCATATGTAATTCATCTAAGACATCTAAGGGTATG ACTTTTTTCAAAAATCGAAAAAATCTAATAAATGTAATAAATAAAGTCTC TCTAAGGGTCCCCTTTTTCAGCAAAAATCAGTCTCTCTAAGGGTCTGTTT TCGGAGGTCCCGTCTGCATATACCCCTCATTCGCCAACCCTTTTACCCCC CCCCCCCCCGGGACCTTAGAAAGCTACGAGCCATGCACCCATAGAGGCGG TTCAATCGGGCATAGATATGATCTCTAATCGTGGTTGACAATTTGCTGGA ATGGCCCAGTATCGTTTAAGATTAATCAAATCACGTAATTTTATCATCAA GTCTTCGAACATTTATACGGATTTCCTTTCTAGATCTGAAAAAGGGAATT GTCATTATACAGTCAATAATGGCGTCGAATACAAAGGTAATATATTTATT TCCATTAAATTGCAACATCCTTACCACAAGAAGAGTGTTCCACGCCCTTT GATGAGCCGCCGGGATCAACTACCCCAAAGTGAGGGTCGTGTTACAGATT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000083_pilon:675617..688644-

>XLOC_009578 ID=XLOC_009578|Name=XLOC_009578|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4692bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000083_pilon:675617..688644- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AAGAAAAGAAGAATCAGACAATGCACCACAACATGTGACGTTGGAGAAAC
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ATGGTGGTGTGGATGCCGTTTACCTCAATCGCTTTGGTTTGAAATACCCA
GGGAGAAATGCATACTTCCAACCAAGGGTAACAGCAATCTTTGGTAATCG
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ATTTCGATGGAAATTTTGATCTTGCTGTACTCAACACGAACCCGGACTTC
TACCGTTTTATCAAGCACGATGCAAGCAGGTTAAACGAAGGATACTTCAA
ATTCTATGAGAAATGCATACTTCCAACCAAGGGTAACAGCAATCTTTGGT
AATCGAAGAATTTTCAACGTCGTAGCCACCACTCGTCTCTCCAACTCCAA
TGTTTATTTCGATGGAAATTTTGATCTTGCTGTACTCAACACGAACCCGG
ACTTCTACCGTTTTATCAAGCACGATGCAAGCAGGTTAAACGAAGGATAC
TTCAAATTCTATATGCCATACGTTGATCCAACTGTCGGGAGTCTTGCGTA
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GTCTGTGTGAAAGCTGGATGTGAGAATAGTAATGATCAAAGTGTTATGGT
CCCAAAAAGAGGGGTAGAACTGCATTATTCAAGAAGAGGTGCAAGAACTC
CTGTCGATGCCATACGTTGATCCAACTGTCGGGAGTCTTGCGTACAGTGT
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GTGAAAGCTGGATGTGAGAATAGTAATGATCAAAGTGTTATGGTCCCAAA
AAGAGGGGTAGAACTGCATTATTCAAGAAGAGGTGCAAGAACTCCTGTCG
GTAAATTTCGTATCAAGCAACGTGAAAGCGGTCTTTGTTGGGCTAAAGAT
GCAATTGAAAACAAAATCGTTCTTTCTTCAAGATGTCGTGATACATTCTT
GATCACAGATAGTTCTACTTTAATGCACGTGGAGAGCTCAAAATATATGG
ACCGCACGATGACACTCGTTGACGCTTCCGAAGACATTTTTCATTTTTTC
AACAGCTCTGGTATTCATTGGTCTCAGACAAGTACCGCTACATTTTGTTA
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GACCAAGCCCGCCTGATTGTGCAGAAAATCCGACCTGTCACTTGGCTTTG
CTACCAGGTAAATTTCGTATCAAGCAACGTGAAAGCGGTCTTTGTTGGGC
TAAAGATGCAATTGAAAACAAAATCGTTCTTTCTTCAAGATGTCGTGATA
CATTCTTGATCACAGATAGTTCTACTTTAATGCACGTGGAGAGCTCAAAA
TATATGGACCGCACGATGACACTCGTTGACGCTTCCGAAGACATTTTTCA
TTTTTTCAACAGCTCTGGTATTCATTGGTCTCAGACAAGTACCGCTACAT
TTTGTTACGAAGAGAACCCTGTCGAGAACAAAGTCAATAAAGGAACGACC
GTGCGAGGACCAAGCCCGCCTGATTGTGCAGAAAATCCGACCTGTCACTT
GGCTTTGCTACCAGATTTCTCAACTTTTTACACCAAACTAAACGGAAAAA
GTATTTCCGTGGTCACACATGATTCAATCAAACTTCAAGTGGTTTGTCAA
CTTGTCGCAGACCTATTTCTCAACTTTTTACACCAAACTAAACGGAAAAA
GTATTTCCGTGGTCACACATGATTCAATCAAACTTCAAGTGGTTTGTCAA
CTTGTCGCAGACCTATCTGAAAAAGGGAATTGTCATTATACAGTCAATAA
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TTTTCTATCCATCGGACGGTTTTTTCTACGGATACTGTCATAAAGCGGAA
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GATTGGATGATATGGCGTTGGGTGGAACGCCTGAGGTTACAGACGATGCT
TCAGTCGCCCCCATTTCACCGGTAGTAACACAATTACGGTTTTTCTATCC
ATCGGACGGTTTTTTCTACGGATACTGTCATAAAGCGGAAAATTTTTGCT
CATGGAACCATCAAAATGAACGTGTGAAATATTTGGATGAAACGGAATAT
CTGAGCAAACAAAATGATGTCAACAGTATTGCTGCTTCCGGATTGGATGA
TATGGCGTTGGGTGGAACGCCTGAGGTTACAGACGATGCTTCAGTCGCCC
TAACATCAAGTGGAATATTCCAAGCGACATCTGGAGGAGGATGGGAACAA
ACTTTCTTTTTCTCAACGTGATAACATCAAGTGGAATATTCCAAGCGACA
TCTGGAGGAGGATGGGAACAAACTTTCTTTTTCTCAACGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_009578XLOC_009578-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
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