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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000372_pilon:167762..174943+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_009452 ID=XLOC_009452|Name=XLOC_009452|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7182bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000372_pilon:167762..174943+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAACCAGATAAAAGCGTCAATACAGCATATTTCGAGTTAGCACATAC
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AACGAAAGAACTATAGAATCAAAAAAGTCTCCAAGCAGCTCCAATTAATG
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ACAGGCTAGCTTTATTATGgcaatttgtaaattttgaattttaaaaaatg
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TCCAATAATTGTGATATTGACCTTAATACCAACACCTTTGAATATGATCC
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ATTGATATATACATTAGATTAAATTAGTTAAAAGCGAATAATAAGAGGCA
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AAGTGTGAAAAGATCCTCAAAATCGACGAATCTAAGGAGtactttaaatt
caaatttagcgtagcctgtttcaattttcttaaaaacgtTTAGAAATCTA
ATAATTGTATTCACCTGAGTCTGCTAAAGGCAGAGGTCGCAGCTTACGCG
TCTCTGCGCCCTCATTTTGTTTCCACACCTCCGCGCCCTACGCACCTCCT
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GATTTTTTCACCCTTCTTTAAATTTTCCATGCGCTTTCACATATTTTCAC
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AATacgaatatatttatttttcttataaacatctactttataagaatcaa
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aaattaggtgtacgagattttgatttctttttgatttttgatttcttttt
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TGGCATTTCTGGGTATTTCAGcattttactgaatttaagtTTCTTGTGAT
AACGACATTCACTTAAAAGCTACCTacgtttttaaattttacaggGAAAT
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ATTGTCCCGTCACTAAAGTGTAAATTTCAAATCTCGACTTTTATTATAGG
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TAGTCAAAGGGGTTTCATGGTttgcggaggagcggaatcggtcctttttt
cggacggagtggcggaatttggcgaaaatttagacgaaattacggaaatt
gggttctctgacggagacggaaaattagataattttagtgcggaaaaacg
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TGAGGgaaaaaaagtttccttttgtACGGTATGAcggaatttgacaaaaa
attggaCGGAGTGACGGAATTCGGGACCccttgaaccccccccccccgtc
aaaAAGGGGCGAAATTAATTTCGAAATTaaatctctcaaagggtcaattT
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CACATGAAGAAAGTCAGATGAAAGTTAATGAGCTTGTGACCCAATCTATT
TCGTTGTCAATTTTAGAGGGATAGAGattgtgaaaaaattttcaaccggA
TAGATTTAACTTTGAAATTTACTATGTtacaatttaattttatttcattt
taggcGGTCTTTCTCTGTTTCTCTTCCTTGTTTAGTCGTTCTTTAAAGTT
TAATGCACTAAACTTTATACCCTAGAGGCAGTTTCTCGATCTTGGCCAAG
TAAAATCAGCGGATCggaatatttttttggaaaaatgtacTCAATCCCCT
CAATGGTAACACAACTCAATAGCAGTGcatgtaaatgcatcgagagtaAA
AGATCTTTTATCtttatacttttacttgaatatatttgatgatgtagcgc
cgtttgacgTTAATGTCAACAATGCAATTGCTTCTCTGaaggtaccactt
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ATTTACCGTTTTAGCAAAGCCACCTGTTAAAGTGACTGTCTTCACAAATA
TCGGAGTTCATTCCACTATGGATTCTGTACTTGCTCATACTAAAATCGTA
AACAACAATTACGATCGAATCGGATATTCAGATGGTTTTGTACAACAAAC
ATGGGGTGAAACTTACTTTTTACGTATGGAAGCTCTTTTTGTTGCCCCTG
ACACAGGATCGTTCAAATTCAAGGTACATATTATTGAGGGTTTAGACCAC
GTGCAAACGCTAGGGTTTTGTTTCGTTCTCTGAAACAAAaagaagccatt
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TATTTAGTTTTGGAGCAATAACGGAACCATTATCTGCGAGAATATGGTCT
CTAAAACTTCTATTCTAAACCTTCAAGGGTAATAAATTCATGTTTGTtca
cttcatttttcatcttgaCAAGCTCTACTCATTTCGTGACTTtagataaa
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GCTGTGAAACAGTATAGCATTTTTGGCTAAAGAATCGCTtttttgctctt
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TCTTTGTTTTTCGGCGCCCATAAAAAATGAGCGGGTGACTGCCACGCAAC
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GGGAGCACCCCCAGCTGGCACtcaacgttgtttaaacgttcaaataacgt
tatttggacgttatggaatgtcacatggacgttattttgacgttgtgtgc
agACTGGGCCACAATTTAGCTTTCTCTAAAATTAAACTTGTTGCCACGAA
GAACaagaattttatcgcgcatgtctcGATCCCATTACTTTTGTTTGTAT
ACGCTGTAAGGGCAAATCccgattttttcactgaatgAGGACCGTACCAA
TCAGAGCCCGTAAGAAGTGTAGAAAATAATCAATGAAAAAGAGAGCTATC
TAGCAAAAGGCGTGATATAACCTCCGCCCAACAAGTTTTCTCACACTCAT
TGCAGTCATTTAATCTCACCCAATCGGATTCCAGTATAATCTCTcgcaat
caaaacaacaatttttcgtttctgattgttttgataaaatagaaCGTTCT
TAATAAAGAGAATACAAAAAGTCTTCGGCAAAGGCAAACATGTTTTTACT
GAGTTTCTTTGCAACTAAGATAATAGTATACATCTTTTTAATTTATACTA
TTAGCATAGAACCTTGGCTAAATATAATCttacatattcttttttctgCA
GTGGTAAAGAATCAACAGCTGTAAGTTTGACAAAAGGAATGAGATATTAC
ATTGAAGTGTTAATGTATGAATGGGGAGGCGCTGATTTTATACAAATGGC
CATGCTATGTCCTTCAAGTACGGAATATGAATTTGTGGAGACCAATTATC
TGAACCTCATCGAATCAGAATGGGAGACATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000372_pilon:167762..174943+ >XLOC_009452 ID=XLOC_009452|Name=XLOC_009452|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2454bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000372_pilon:167762..174943+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAACCAGATAAAAGCGTCAATACAGCATATTTCGAGTTAGCACATAC
CAATAAAGTGCACGGTAGGACTCCATTCCATGATCAACATGTTTTGGATA
AAATGGAATGTGTCCATCTTTGTACGGACTTCCCGAATTGTAGATCTTTC
AATTGGAACGAGGATGACCAAAGATGTCAGCTGGTTGCATATGACCGACT
GACTGCACCAACATACACCGACAAGATGAAACCAGATAAAAGCGTCAATA
CAGCATATTTCGAGTTAGCACATACCAATAAAGTGCACGGTAGGACTCCA
TTCCATGATCAACATGTTTTGGATAAAATGGAATGTGTCCATCTTTGTAC
GGACTTCCCGAATTGTAGATCTTTCAATTGGAACGAGGATGACCAAAGAT
GTCAGCTGGTTGCATATGACCGACTGACTGCACCAACATACACCGACAAG
ACTGGATGGAATAATTATGATGGTGGAAATCAATACTACGTACATATCGA
AACACACAGCGTCTCACACATAGCTTGTTACAGAGGTACAGGTGGCTCGT
GTAGTCGAGATCAGGTAATACAAACCTATTCGTCCAATAATTGTGATATT
GACCTTAATACCAACACCTTTGAATATGATCCAGTGTTAGGAGTAATACG
ACAAATGTGCGGCACAAAGTATTTACTGGCACCTGAACAAAATGTATGGG
AGGATTCGAATTCTGACTGGATGGAATAATTATGATGGTGGAAATCAATA
CTACGTACATATCGAAACACACAGCGTCTCACACATAGCTTGTTACAGAG
GTACAGGTGGCTCGTGTAGTCGAGATCAGGTAATACAAACCTATTCGTCC
AATAATTGTGATATTGACCTTAATACCAACACCTTTGAATATGATCCAGT
GTTAGGAGTAATACGACAAATGTGCGGCACAAAGTATTTACTGGCACCTG
AACAAAATGTATGGGAGGATTCGAATTCTGGAAATCCAAAGGTCATTCTA
CAAGGACCAGCAGCGTGGTCGAGTGACGTCAGAATGCGTTGGAGAAGAGT
GCACTGAAATCCAAAGGTCATTCTACAAGGACCAGCAGCGTGGTCGAGTG
ACGTCAGAATGCGTTGGAGAAGAGTGCACTACGGAATCTCGTATTGGCAT
TACTGTTTATATATGTGGGGCGATGGAGCAACAGGTTCTGACCAATCCTT
GGAAATTGGAGATTGTCATCATAATCACCATGCTATTCAAATCCACTTCG
TACATGCTCACGGAATCTCGTATTGGCATTACTGTTTATATATGTGGGGC
GATGGAGCAACAGGTTCTGACCAATCCTTGGAAATTGGAGATTGTCATCA
TAATCACCATGCTATTCAAATCCACTTCGTACATGCTCCAAAGCCACCTG
TTAAAGTGACTGTCTTCACAAATATCGGAGTTCATTCCACTATGGATTCT
GTACTTGCTCATACTAAAATCGTAAACAACAATTACGATCGAATCGGATA
TTCAGATGGTTTTGTACAACAAACATGGGGTGAAACTTACTTTTTACGTA
TGGAAGCTCTTTTTGTTGCCCCTGACACAGGATCGTTCAAATTCAAGCAA
AGCCACCTGTTAAAGTGACTGTCTTCACAAATATCGGAGTTCATTCCACT
ATGGATTCTGTACTTGCTCATACTAAAATCGTAAACAACAATTACGATCG
AATCGGATATTCAGATGGTTTTGTACAACAAACATGGGGTGAAACTTACT
TTTTACGTATGGAAGCTCTTTTTGTTGCCCCTGACACAGGATCGTTCAAA
TTCAAGTTGAACGTGGATGACATTGGTCGGGTTTCAATCAGTACTGATGA
AAATGCAGccaacaaaaacatcattttggATGACGCAGGCACCAATCCAG
ATACTGCTCCTCGTGAAATTCATATCCACGGATGGGATTTTGTTAACTAT
TGAACGTGGATGACATTGGTCGGGTTTCAATCAGTACTGATGAAAATGCA
GccaacaaaaacatcattttggATGACGCAGGCACCAATCCAGATACTGC
TCCTCGTGAAATTCATATCCACGGATGGGATTTTGTTAACTATGGTAAAG
AATCAACAGCTGTAAGTTTGACAAAAGGAATGAGATATTACATTGAAGTG
TTAATGTATGAATGGGGAGGCGCTGATTTTATACAAATGGCCATGCTATG
TCCTTCAAGTACGGAATATGAATTTGTGGAGACCAATTATCTGAACCTCA
TCGAATCAGAATGGGAGACATAATGGTAAAGAATCAACAGCTGTAAGTTT
GACAAAAGGAATGAGATATTACATTGAAGTGTTAATGTATGAATGGGGAG
GCGCTGATTTTATACAAATGGCCATGCTATGTCCTTCAAGTACGGAATAT
GAATTTGTGGAGACCAATTATCTGAACCTCATCGAATCAGAATGGGAGAC
ATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000372_pilon | genome | sc0000372_pilon:167762..174943 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1048-1227:7003 |
| Aaloc | 904-1044:6162 |
| Aaloc | 697-903:5167 |
| Aaloc | 568-693:3693 |
| Aaloc | 493-564:1652 |
| Aaloc | 226-489:969 |
| Aaloc | 1-225:1 |
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