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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000372_pilon:219604..225323+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_009437 ID=XLOC_009437|Name=XLOC_009437|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5720bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000372_pilon:219604..225323+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgtacaaaaaccTAGATAAAGAAGCAGTGAGTGACGGGCCTGTAGACAT
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AGTGTATCATGCTAGGTATGTTTTGAATCATAGAATACTGATTCGAATcc
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GACCGCACGCGTAAAGTACGTCAAATCTTCCTAATCTGCAACACCTTAGT
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CCTCCTCCTCATCATCGACATCCAGTGCTGAACAATCCAAAGCTGACCAT
ATCCTCTGTACCATCCTAACCAATGCAGATTCCCTCTTAATCCTCGCGCT
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TTATGGTGGTCGATGTTATGGAGATGAGCATTACAGAACTCAATGGCATT
GTCTTCGGTTTCGGTTGCATCTCAGCTGTTATTCTTGGTATAATGTCTTT
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TCTCTTTAGCTATAATGGAGCTCATCTTCATCTACATGCGATTCCAACAT
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TGCCATTGTGGTTATTATGGATGAAGTATTCCTGGTTGGTGTTATGGCAA
AGATGACCAGCTCTAAAGTACAAACATTCTCTGAGAGCCTTCGACTCTCA
ATGTCACGCTTCGGAGCTTTATTAgctttgctgacatcagcagcTTTGTT
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aaatcaaatgaaaccTATAGCTTCTGTCATTTGAATGTCCATTGATTGGT
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AAGAtaatcattgaaaaaataagttttttaaataacataTAGAACAAGGC
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AAATCACAAATTTAACCAAATACTGATAACTGATGAACTGATGTCCATTT
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AAATGATAATCCAACACCATATAAAAAGTTCAGAATATTCCAACAAAGAT
ACTTTCGACGTTAACTAAATCTTCTCCAAAGACGGTAAAAACAAGGATGT
TAAACTCGTGCTTCTCGGCGACTCTTGGTGTTTGTTGTTTTCGTATGTGt
ctccttctcttctcttctcttttcctctctAGGTCATATTTTTGGGTGAT
TTTATACCATTTGTCGGATAGGCAATTTCGTAAGTTATGGTCGTTAGGAC
CAGGACGGAAATCATTTTGTGTGTTATGTTATGTCGTTCTGGGGCCTAGC
GGAAGTGTCGTTAGCCCCAAATGGACCTCCTACGTTTAGCAGttaatgtt
aattaattgaaattaattgaaattaattgaaattaataaaatgaaaacgc
tGAATCACATATTTCTTAACAATAAAAGTCCGTTGATCTTAGTCAAACCA
GTTTGACAAGTCTGTCTGCCGTACCTCCGGATATCCTTATAAGGTGTTAA
GAACGTGTGTAGACACCTATAAAAAGTGCAAGGTCTGTTCGTTAGATTCA
ATATCAATCTTTCATGTGCTTTCATTTGAAACATTTATGACATGAAAACT
CATATATAGCTGGAAATTCtccatttaaaatttgaaactcGATACTGGAT
ACTGAATACTAGATACGTAGCTTTAATCTTAccaacaaaatgtacaaaaa
ccTAGATAAAGAAGCAGGGAGTGACGAGCCTGTAGACATCAAGCAATGGG
AACGCAAACGTTATTGGACAACCAAAGCTTTCACATTGGAGTGTATCATG
CTAGGTATGTTTTGAATCATAAAATACTGATTCGAATCCAGTTACTTTGT
TTTTCCTTACTCTGATAGCAATCCTTTTCTATGACGTTCATCAGTCAATA
TTAACCATCCCGAACAGTTTTTGAACAaatcaattcttcttttttgtagG
TATGGAATATTCGGTGACATTTCTCACACTCTGGCTGTACATCAAGGAAA
TGATCAACACAGATCAGCCAAAGCTATTCTACAGCTTAGTAGCTTCCTCG
TACCTGATTGCAGCTGTTATCTTATCAGTCTTCATCGGACGGTGGGTCGA
CCGCACGCGTAAAGTACGTCAAATCTTCCTGATCTGCAACACCTTAGTTA
TCATCGGTAACATAATGTATGCTTTCCATTTCTCGCCTTGGTTCTTGGTT
TTCGGCCGATTGGTGTCTGGCGCTGATGGGCCACTCAGGTCGGTGATTTC
TGGAGAGATTGCAAGATGTTATCCAGATTCAGAAGTCCTCAGTAGATTTT
CTTCCATGGGAATGGCATTTGCACTTGGTTTCATTGTTGGACCTGGAGTT
AATTTCATGTTTACGACGGTCGATTTCAACATTGGTGCTTGGCACGTAAC
TTATGTGAACATTCCTGGTGTTTATATggctttgtttttctttatcacTC
AGGTAATTGTCACATTATAT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000372_pilon:219604..225323+ >XLOC_009437 ID=XLOC_009437|Name=XLOC_009437|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1272bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000372_pilon:219604..225323+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgtacaaaaaccTAGATAAAGAAGCAGTGAGTGACGGGCCTGTAGACAT
CAAACAATGGGAACGCAAACGTTATTGGACAACCAAAGCTTTCACCTTGG
AGTGTATCATGCTAGatgtacaaaaaccTAGATAAAGAAGCAGTGAGTGA
CGGGCCTGTAGACATCAAACAATGGGAACGCAAACGTTATTGGACAACCA
AAGCTTTCACCTTGGAGTGTATCATGCTAGGTATGGAATATTCGGTGACA
TTTCTCACACTCTGGCTGTACATCAAGGAAATGATCAACACAGATCAGCC
AAAGCTATTCTACAGCTTAGTAGCTTCCTCGTACCTGATTGCAGCTGTTA
TCTTATCAGTCTTCATCGGACGGTGGGTCGACCGCACGCGTAAAGTACGT
CAAATCTTCCTGATCTGCAACACCTTAGTTATCATCGGTAACATAATGTA
TGCTTTCCATTTCTCGCCTTGGTTCTTGGTTTTCGGCCGATTGGTGTCTG
GCGCTGATGGGCCACTCAGGTCGGTGATTTCTGGAGAGATTGCAAGATGT
TATCCAGATTCAGAAGTCCTCAGTAGATTTTCTTCCATGGGAATGGCATT
TGCACTTGGTTTCATTGTTGGACCTGGAGTTAATTTCATGTTTACGACGG
TCGATTTCAACATTGGTGCTTGGCACGTAACTTATGTGAACATTCCTGGT
GTTTATATggctttgtttttctttatcacTCAGGTAATTGTCACATTATA
TGTATGGAATATTCGGTGACATTTCTCACACTCTGGCTGTACATCAAGGA
AATGATCAACACAGATCAGCCAAAGCTATTCTACAGCTTAGTAGCTTCCT
CGTACCTGATTGCAGCTGTTATCTTATCAGTCTTCATCGGACGGTGGGTC
GACCGCACGCGTAAAGTACGTCAAATCTTCCTGATCTGCAACACCTTAGT
TATCATCGGTAACATAATGTATGCTTTCCATTTCTCGCCTTGGTTCTTGG
TTTTCGGCCGATTGGTGTCTGGCGCTGATGGGCCACTCAGGTCGGTGATT
TCTGGAGAGATTGCAAGATGTTATCCAGATTCAGAAGTCCTCAGTAGATT
TTCTTCCATGGGAATGGCATTTGCACTTGGTTTCATTGTTGGACCTGGAG
TTAATTTCATGTTTACGACGGTCGATTTCAACATTGGTGCTTGGCACGTA
ACTTATGTGAACATTCCTGGTGTTTATATggctttgtttttctttatcac
TCAGGTAATTGTCACATTATAT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000372_pilon | genome | sc0000372_pilon:219604..225323 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 118-636:5202 |
| Aaloc | 1-114:1 |
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