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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000124_pilon:222124..225932- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_008471 ID=XLOC_008471|Name=XLOC_008471|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3809bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000124_pilon:222124..225932- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTGGAAAGGATTAAGTCACAACAACAAGGCTCAAGGGGTAAGAATTACTT
TGGAAGCTATTCATATAATGCAGGGGGAGAGGGGGCATAGTAAAAGTGTA
TGTCTATTGTTTGAATGGCGTTATTTCTATTGATCTCTGTTTACAAGGGG
GAGTGGGTATCAAATTTTTGCGAACATAATAAATATTTTTTATAGTCAAC
TGAGCTGCTTAGGGTCCAGCCTTGAAAATGGCCGAAAAATTAAGCAACTT
GGTCTTAGCAACCTAGCTCGAAAACTAAGCATTAACCAGAAAAATTGCCA
AAAATACTTAAAAAAGGATTTTCGGCATTATTTGGCATCAAAATGTGTAT
TTGAATATCAAATTTAAAAAGGTATTTTGGATATTATACACCCATTTCAA
TGTTTTCTTGTCCTTAAAAGTGTATGAATGTTTGACTTTTGAGTGAATTT
TTAAAAAGTTATAACTAAACTCTCTGCCGCAGTAGCTTTCTGAAATATCC
AGAATGCTATTCTTCTCTTGCTATTAGGATTACTACTTTTCATTTGGATG
TTCTTCCTTTCTTTTTTTAACTTCAAGAACGTTTTGCTTCTTTTTAGAAA
TTTTTAAATTGATAATGAAGTCCCTAGGGCTTCTAACATTATGCACATTT
TTGCTGCTAGCAGAGGGAAAGCAATACCATCCTATACCCACCTTCTTTCA
GTAAGTATCACCTATTCAAAATGGTTTGAACTTTTGATAAATAATTGAAT
TTTTACTGAAATTCAATAGCATTTTTAAATACTTCAAATGAATGTTTTTC
AACATGAATGGTTTCGTTCTTTCTTGTAACATGAACCTTTTCTTGAGTTC
TTAATCAAAATATTTTATTTCGGGAAATCATATGATAAACGTAACTGAAA
GAGTTATAAAATCAAAGACTTGCCTTGTCAAATTTCACTGTTTGTTATTG
TATAATCATTTCCCTTTGACTTCCTCATTTAAATCACCTTTCTTTTATCT
TAGCCAACGTGATTCCCATGGTAAACCACTTGATGCCAATAGAACTGATT
TTCATCTGAAAGGACCCTTTGTCAATCAAATTGATATTAAGAACAATCTA
GAGGCATCTTTAAAAGTTTGGCCAGAGGAAGTAGAAAATGCAGGACAAGT
TACAATTCTTTGGGAAGGAATTCCTAATCCCACAAGTGGAGACCGAATTG
GATATTATTGTCCTTATTATGACAACCCTGCACATGGACTTGATTATATC
GATGTCACCAAATCACCAACTTGGCAAGAAGGATATGGTTATTACACAGT
CAAATTATACAACATGCGATCTCCTTGTGCATTCAGATATTACAGTGGTG
GCAAAACTTTGGTTGCCATTAGCAACAAAGTGAGGTTTACAAATGGCGAT
GCTTTTGCTCCACTTCAAGTTCACTTGGCCATGACAATTAAACCTACTGA
GATGAGAGTTATGTGGGTTGCTGCCAAAGGTATGATTTGAATTAGAAAAT
CTTATGTTCTTACAAATATATTGTCAGGAAAATTAAAACCAACAACTGGT
CTTTATTTGACCTTAATCCATATATTAGCTGTAAAATTAAGTCAAGCTAC
ATCTACATTTTGCATCTTTCTCAATTATAAATTTTGTAAATTTTAGTTGA
TAGTGGTATCAAAGTGAGTTATGGTAAAACCAAAGCTTTGGGTACGACAC
AAACAAAGTTCACTGCAAACACATACAAAGCCTCAGACATGTGTGAAGCA
AATGCTAACACAACTGGATTTTGGGATCCTGGATATATTTATGATGTTTT
GTTGACCGACTTGGAACCCAACACAAGATACTATTACTCGTGTGGTACGG
AAGAGGTAAAACAAGCTTATTCAAGATCCCACTCAAGAAGATCTACTGAA
TGAGTGACAGTCAACGTGGCTTTGATCAACCTTTAAGACAGCTTGACCTT
TCTTTTCCAAAAGGGTTCATTGGTATGAGGCAAAATATCAGTATGTTACC
TACACCCCAATACTAAGATTGCCTAAAGAGCATTTTTTTGAAAGTTACTG
GGGCATTGGCTTTCTTTTGATGTATCTGACGTCAAAACAAGTCGTTTAGT
TTTGAAAAACCCTCAGTCCATATGAAATATTTTAAAAAGGCCTATCCCGT
AAGTTTTATAAAGCTATCCATGCCAGTCAAACAAATTAACTACTTTCTAA
CATGGCTTCTTTAATTGAATATATAAGTTTTATCTATGGCCTTCAGAATG
AAGGAAAAACTTTGATTTTAATTTTTTCAAAATATAAGGCTCACAAAACT
TTAAAAATTCCCCTTTAAAATTGAGGCTCTAGAACTCAGGCCCTTAATAA
ATAAAGTAGCAAGTGATTCATCCATAAATAGTTGATCTCCATAAGATATT
CCTTTTCGTGTAAGATGATTCCTTGACCTTTTTTTTGCAGTTCATGAGCC
CAGTGGCCAATTTCACAACCCCTATGGCAGCAGGTGACAAAACACCTTTC
AATTACATTGTTTACGGTGATATGGGATTAGAGCCTTTCCCAGAAGGAAT
CGAGACAGCGAAATTGGTACGCCAAGAAATTGATGATAATGATGTTCGCT
TTGTTTATCACCATGGAGATATCTCTTATGCACGCGGATATGTAAGTAAG
ATGAAACTATGAAATTAACACTTTGGTTATTGAGTTATTTTCCATTTTGT
CTCGTTTTGTCTTCATTTATATAATTGATTTCTTCTTCAGGCATGTTTGC
AAAGTATTTTTAAATGGCTTATATTGCATAAAATCATAGATTTCTAAAAA
CCAATCTTATTAAAATTTATCTTCAAAGGCTTATATTTGGGACCAATGGT
TTGACCTGATCCAACCTTATGCATCTTTGATCCCTTACATGGTCGGTGTT
GGAAACCATGAGCAAGATCATATGAATGGACATGAACACGACCCATCCAA
CCAACCAAACTTCCATCCTACATGGTTCAATGGATACACTGACTCTGGCG
GCGAATGTGGTGTTCCAACTGTTCATCGATTCCACATGCCTGATAATGGC
CTCAAACTTTACTGGTCAGTAAAATTATCAGCTGTAAATTCGTCACATTT
TTTATTACAATGATTCAAGTTTGAAAACACCATTTTCACATTTATTTATG
TTTGCCTGAGTAATGCCCGAATTTCTTTTGTACATTTACAGGTACAGTTA
CGATTATGGCATGGTTCACATGGTGATGTTAAGTACAGAACACGATTATC
GCCCAGGATCACCTCAATATGTTTGGTTGGAGAATGATTTGAAGAGTGTG
GACAGAACGAAAACTCCTTTTGTCCTGGTTGGAGGACACAGACCAATGTA
TTGCAGTGAATCCGTTTATCGTAAGTTGGCCTTCTTTGGTTATATTATGC
TTGTAAGGGGTGAATTTTCACCAAAATTTCTATTCCATTTTTCAAAATCA
ATATCATTTCACATTTTCTAGCTGATTATGTTGTGGCTCTTCGAATGCAA
CAATATTTTGAAGATTTGCTGTACAAATACAAAGTGGATGTTGGCTTGTG
GGCTCACTACCATTCATATGAAAGAACTTGCAAGGTCTACCGTAATGAAT
GTCGGGATGATGGTATCTTGCATCTCGTTATTGGATCTGGAGGTCAAACA
TTAGATGTGGACAAATGGTATCCAAAAGAATGGTCAGTCTTCCACAAAGA
TGATTATGGTTATGGTAGATTCTCTGTCAAAAATTCAACTCATATTTTCT
TTGAGTTTGTTCAAAACAGAAGTCAGAAGGTGATTGACTCTGTCTGGATC
TCCAAGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000124_pilon:222124..225932- >XLOC_008471 ID=XLOC_008471|Name=XLOC_008471|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3558bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000124_pilon:222124..225932- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTGGAAAGGATTAAGTCACAACAACAAGGCTCAAGGGCTGGAAAGGATTA
AGTCACAACAACAAGGCTCAAGGGAAATTTTTAAATTGATAATGAAGTCC
CTAGGGCTTCTAACATTATGCACATTTTTGCTGCTAGCAGAGGGAAAGCA
ATACCATCCTATACCCACCTTCTTTCAAAATTTTTAAATTGATAATGAAG
TCCCTAGGGCTTCTAACATTATGCACATTTTTGCTGCTAGCAGAGGGAAA
GCAATACCATCCTATACCCACCTTCTTTCACCAACGTGATTCCCATGGTA
AACCACTTGATGCCAATAGAACTGATTTTCATCTGAAAGGACCCTTTGTC
AATCAAATTGATATTAAGAACAATCTAGAGGCATCTTTAAAAGTTTGGCC
AGAGGAAGTAGAAAATGCAGGACAAGTTACAATTCTTTGGGAAGGAATTC
CTAATCCCACAAGTGGAGACCGAATTGGATATTATTGTCCTTATTATGAC
AACCCTGCACATGGACTTGATTATATCGATGTCACCAAATCACCAACTTG
GCAAGAAGGATATGGTTATTACACAGTCAAATTATACAACATGCGATCTC
CTTGTGCATTCAGATATTACAGTGGTGGCAAAACTTTGGTTGCCATTAGC
AACAAAGTGAGGTTTACAAATGGCGATGCTTTTGCTCCACTTCAAGTTCA
CTTGGCCATGACAATTAAACCTACTGAGATGAGAGTTATGTGGGTTGCTG
CCAAAGCCAACGTGATTCCCATGGTAAACCACTTGATGCCAATAGAACTG
ATTTTCATCTGAAAGGACCCTTTGTCAATCAAATTGATATTAAGAACAAT
CTAGAGGCATCTTTAAAAGTTTGGCCAGAGGAAGTAGAAAATGCAGGACA
AGTTACAATTCTTTGGGAAGGAATTCCTAATCCCACAAGTGGAGACCGAA
TTGGATATTATTGTCCTTATTATGACAACCCTGCACATGGACTTGATTAT
ATCGATGTCACCAAATCACCAACTTGGCAAGAAGGATATGGTTATTACAC
AGTCAAATTATACAACATGCGATCTCCTTGTGCATTCAGATATTACAGTG
GTGGCAAAACTTTGGTTGCCATTAGCAACAAAGTGAGGTTTACAAATGGC
GATGCTTTTGCTCCACTTCAAGTTCACTTGGCCATGACAATTAAACCTAC
TGAGATGAGAGTTATGTGGGTTGCTGCCAAAGTTGATAGTGGTATCAAAG
TGAGTTATGGTAAAACCAAAGCTTTGGGTACGACACAAACAAAGTTCACT
GCAAACACATACAAAGCCTCAGACATGTGTGAAGCAAATGCTAACACAAC
TGGATTTTGGGATCCTGGATATATTTATGATGTTTTGTTGACCGACTTGG
AACCCAACACAAGATACTATTACTCGTGTGGTACGGAAGAGTTGATAGTG
GTATCAAAGTGAGTTATGGTAAAACCAAAGCTTTGGGTACGACACAAACA
AAGTTCACTGCAAACACATACAAAGCCTCAGACATGTGTGAAGCAAATGC
TAACACAACTGGATTTTGGGATCCTGGATATATTTATGATGTTTTGTTGA
CCGACTTGGAACCCAACACAAGATACTATTACTCGTGTGGTACGGAAGAG
TTCATGAGCCCAGTGGCCAATTTCACAACCCCTATGGCAGCAGGTGACAA
AACACCTTTCAATTACATTGTTTACGGTGATATGGGATTAGAGCCTTTCC
CAGAAGGAATCGAGACAGCGAAATTGGTACGCCAAGAAATTGATGATAAT
GATGTTCGCTTTGTTTATCACCATGGAGATATCTCTTATGCACGCGGATA
TTTCATGAGCCCAGTGGCCAATTTCACAACCCCTATGGCAGCAGGTGACA
AAACACCTTTCAATTACATTGTTTACGGTGATATGGGATTAGAGCCTTTC
CCAGAAGGAATCGAGACAGCGAAATTGGTACGCCAAGAAATTGATGATAA
TGATGTTCGCTTTGTTTATCACCATGGAGATATCTCTTATGCACGCGGAT
ATGCTTATATTTGGGACCAATGGTTTGACCTGATCCAACCTTATGCATCT
TTGATCCCTTACATGGTCGGTGTTGGAAACCATGAGCAAGATCATATGAA
TGGACATGAACACGACCCATCCAACCAACCAAACTTCCATCCTACATGGT
TCAATGGATACACTGACTCTGGCGGCGAATGTGGTGTTCCAACTGTTCAT
CGATTCCACATGCCTGATAATGGCCTCAAACTTTACTGGCTTATATTTGG
GACCAATGGTTTGACCTGATCCAACCTTATGCATCTTTGATCCCTTACAT
GGTCGGTGTTGGAAACCATGAGCAAGATCATATGAATGGACATGAACACG
ACCCATCCAACCAACCAAACTTCCATCCTACATGGTTCAATGGATACACT
GACTCTGGCGGCGAATGTGGTGTTCCAACTGTTCATCGATTCCACATGCC
TGATAATGGCCTCAAACTTTACTGGTACAGTTACGATTATGGCATGGTTC
ACATGGTGATGTTAAGTACAGAACACGATTATCGCCCAGGATCACCTCAA
TATGTTTGGTTGGAGAATGATTTGAAGAGTGTGGACAGAACGAAAACTCC
TTTTGTCCTGGTTGGAGGACACAGACCAATGTATTGCAGTGAATCCGTTT
ATCGTACAGTTACGATTATGGCATGGTTCACATGGTGATGTTAAGTACAG
AACACGATTATCGCCCAGGATCACCTCAATATGTTTGGTTGGAGAATGAT
TTGAAGAGTGTGGACAGAACGAAAACTCCTTTTGTCCTGGTTGGAGGACA
CAGACCAATGTATTGCAGTGAATCCGTTTATCCTGATTATGTTGTGGCTC
TTCGAATGCAACAATATTTTGAAGATTTGCTGTACAAATACAAAGTGGAT
GTTGGCTTGTGGGCTCACTACCATTCATATGAAAGAACTTGCAAGGTCTA
CCGTAATGAATGTCGGGATGATGGTATCTTGCATCTCGTTATTGGATCTG
GAGGTCAAACATTAGATGTGGACAAATGGTATCCAAAAGAATGGTCAGTC
TTCCACAAAGATGATTATGGTTATGGTAGATTCTCTGTCAAAAATTCAAC
TCATATTTTCTTTGAGTTTGTTCAAAACAGAAGTCAGAAGGTGATTGACT
CTGTCTGGATCTCCAAGTAACTGATTATGTTGTGGCTCTTCGAATGCAAC
AATATTTTGAAGATTTGCTGTACAAATACAAAGTGGATGTTGGCTTGTGG
GCTCACTACCATTCATATGAAAGAACTTGCAAGGTCTACCGTAATGAATG
TCGGGATGATGGTATCTTGCATCTCGTTATTGGATCTGGAGGTCAAACAT
TAGATGTGGACAAATGGTATCCAAAAGAATGGTCAGTCTTCCACAAAGAT
GATTATGGTTATGGTAGATTCTCTGTCAAAAATTCAACTCATATTTTCTT
TGAGTTTGTTCAAAACAGAAGTCAGAAGGTGATTGACTCTGTCTGGATCT
CCAAGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000124_pilon | genome | sc0000124_pilon:222124..225932 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1444-1779:337 |
| Aaloc | 1264-1440:618 |
| Aaloc | 1027-1260:982 |
| Aaloc | 826-1026:1370 |
| Aaloc | 619-825:2162 |
| Aaloc | 142-615:2806 |
| Aaloc | 40-138:3211 |
| Aaloc | 1-36:3810 |
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