XLOC_008464 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_008464
Unique NameXLOC_008464
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000124_pilon:377763..394492+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_008464 ID=XLOC_008464|Name=XLOC_008464|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=16730bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000124_pilon:377763..394492+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCGGCCATGAGTTTAGCATGTGGATTTAGAAATTTTGCTTTTCGAAG TTCTGTTCCAGAGCTACAAATAGTTGCTGGCTTGAATACGTCTGTTCCAG GTacctttcaatgttttttttataatatacttATACATACCTCTGTTCTG ATTTTGCATTGGACAGCTCATCCAGCCAACTtgtaccatcaactgctcta aaacTGTTGCAGTtcgcttcgttggaataccggttgaaacacttgtgagt tagtcacactagcaaatttagctttcagaaaaaacaacatcagtcatcta caggatgtatttcaacaacaaggatgagagttacctgaatcaagttaaAG ATCCCAAGAcgacaatcaattaaaacttgaaaacttaaattcagacaaaa tgaccgattgcgaaaacgtgcagcagccaaatatcaaccaaccaaatttt gtcattcaattcccaagacagcacttcgatttttaaggccttgtttatac gctacagtaaaaataattccgcacatgtaaatgggtcattgtttcagccc tgtgaatccaggtcggcattcggcaatgccgacctgaaagccgacgtaac ttgagctgaagtcggcttttatttgccgacgtaatttacactctaggtcg gcgtgccgtcaaaagaaatgttttgggtcgACAAAGCCGACCtaagagga aaaatattatttgttaggttaacctaattgtgttatcatttgataacaca tgatAATCGAGCCTCGTTCCattctttttataaaacataaaacttaataa cacaattaccgtagagtcgtttaatctcgacatacgtcttgcaatctcga catagctgtaggctggtcttcgaaataaaaaatcaaacataaacaaatac ataccaaagttatcaatcaatcactaaaatgtactctctctctatcacgt cacagattgttaatataatatgagaaatgtgaagtgttattacttatact tatatttgaaaagaaaactttaacgatgtagtaatcgctaaaaactaatt agcatgctttcaacgaagatgtctaaatcacaacaacacaacattttgca cgcgatgAATTTTTTAGTACCGTaaacggccataacttgcaaCACGGACT TAACTTGCAACAGCTTTGTTTATTTACGTTTTCTCCACGTTGATTGCttc gttttctttcattttttcagggaATGTTTGAAATGGTAAACTACACGTTA ATCAAGCAAAACAAGCCCGATTGAATAATTTTTcgcgaagatgaagatga aaaagtgaaaataattagGTCACTCCAATAAACCCCCACGCTTGGGCGAT TGACGTTCTCTTACGATGCGATTTCTAGAAAGTTCGAAAGAAGAAAGACG AGGCCTTGCTGGGTCGAAATCCGCAGCTCGTACAGTTTTTCGTTCTTCCG TATTCTTCTATTGAAGTTGCTAAATTACATTTCACAACGAAGAGACGTTT CGATGCATAAATTGGATAATTACCAATGCTTACATGTTAAATCAATCAAC CATGTAACTGAAGGATCTCAGCTGAAGTTCTGCTTCCTAATGTCCCATAC GAAAACTAATCATGTTAATAACAAGACTGGTGTCATAAAAGTGCctcaaa agaaatcaataaaatcattcGTCGTTAAACTGTAATCATCAATTTTACGA TCAGGGGGTCAAGGATGTTCAAGtgcgtttctttataagaaaaatttaat tgaataaGTTCTCCAATTCGTTGGATTTACGGAAAAAAGAATGACCAAAA GACAGGACGGATaaaaaaaGCAACAACCAGGAATGAGGAGTAAATTCAGA GCCAATTTTGTAAAGTATAGAAATGCAAGAAGGATAAGAGCttcggaaaa gaaaaacacaccCTGTACacgctaattttgaatttttcttaagaactttt ttaatcaaaagcgattatttttccttcaaacCTGTTCCGAATTTAGTTaa gatacaggggtgtaaaagaaagtatatGTAACACTGTATATGGACGTTTC ATCGATCGATATagattgtgagacaggggtgtgtgcaAAGTCAACGTCAA ATGAGCGTTATGAGTATTCTGATGAAGATGAGATGAGTATTCTGATGAAT ATAACGGTATCTCGTCAATGGGAACCAGAGAAGGAGTAGCGTATTAAACA ATCATTTCTCAGTCTAAGAGGGGTCACTCTTTGCGAACGCAGAACTCCGG GCAAACAGTGACGGGATACAtggtaaaaagtaaatatccgTTTTCTTCTC GAATTTTAACAAATCTCCTATATATATACGGTAAATCATGTCATGCCGAA ACATCTGTCTCAgagccccggtggaattttttcccACAACGGGGCcaata atttctatcaaaatctctATGGGGataggaattctattgttccaagcttt aaaatacacaatgtagatggttttggagtgcaattttttacattggatgg atttcaaatggggatgaaatcaacgGGGACGAACTTTTTTGTATCTATTC AACGattcaatgcaaaaattagATTCTGTAATTATATAATACATAAGCTC GAAAACActctctctcctctctcACCCCGGAAGTAAAGTTCAATAGCAAA ACGATGAATGAATTTGGCATACTATGACGAGGATCGGGGATTCCAACGGT AGAAGACGAAAGACTTAAAACAAATAATATATTAAACCGTTATTTATACG TATAAGCTTTCCCGAGCCTATTCTCTTCCtcgaatgtcttcattttgtgt tttatcaccaccaaaaaaatgtgtcaaacttaaaatttgaaagagcaAGG TGGTTGtttttttGTGGAAACACGCAAATAGTGATACCCAATAATATTCG CTAAAGATTCTTCCCGAGAAAAATTTACGCGTTTTTAGTGTTCCATCCCT ATGAAagtatatattatatatgatTGAATCTCTCCAGTCAAAAACATCTA GTACTATATTTCGAtaaaactttccattttgttaaGGGAAGACTTCTTGC CTTACAAATTTGGCGAATTCGgcaaaatttctctctcaaaaattttcatg gaaatccaTCTATAcgctatttccaaattttgagtcCCATAAGATGGTAA ATCACAATAAGGTACGGATGATGGTCCTTGATTTGTTACCGTAACCTGCC GTCGTAATTCGTTTTCATCTCAGCATACTTTAATTGAATTAATTTTCGTA AGCTGTAATTTTGCGAGGCAAAAGgttcgtttttttgaatttatattcAC TAATCGGCGattgcaaaacaaaagttttgcgAGTATTGAATTTCGCAACT CAGTTTTCTCTCGCAATTtagcaagattttattttcgtgaATGAAAGGCA AGCATTtgcaaaaaagcgaaaatataaattcgcgaaaattaatccaatta aagtagactttattttgctttaatTGAGATGGGGGTGTAGAAGAATCATT CAACTCGTCGAAGGTACGAAATCCCAGACCTTCGTTACACTGAGTTTCTC CGCTTAGTAATGCCCCCCGTCTTTCTATCGATGTTTTTGCAAATGTTCCC TTATCGTCATAAAAAAGCCAAACCAATTATGAATTTGCATGTGTGAAAAG TAATCGTAATTCACAAATTGATCCGTCTTTTGTCTACAACAACGCACTCC ATCGTTGTGCCATTTTTTAATTATGCtattaaaatttgttgaaatcaaat ttttttcatgtgatAGAGTTGGCGCGTGCTCAGTATGTTGTTGTTATGAA ATTAGCACCGTTGCAAGTTGTggactttgaagaaaattttttggtcatCT TTGGATTAACGACGTTTTCGATTGAAGTTTCTGTTTGGATCAATGTATGG TAATCTAAAAAGGAATAAGGTAGAAGcttattttgtgaaagtttcattgC TATAACTTTTCTAggttaaaagatatagcatcgttTAGTCAAAAAACGCT GTTTTTCGttgcaagttatggccgtttacggtagacatttttaccgtgaa ccgaaaataataaaaagaacccggtttccttttgaaTttaatgtgaccgc catactggccatcacagcgtgcggcctgttagcgcctagagcgtgtgttt ttatatataaggaaggggaaaccaggctaagcgcgcgaattatttttatc acgtgacttgaagcgtaataaagttgtaaaattttaatgatggacacgag aaagttacgaggaagtttgcatgcgtttcgtgtgttgtgtaaaactgctt ataatttggctttctttttaattgaaaggattgcaatgtttactgaactt ctagtttgatggatgaacttgttcataagaatgataccaagaatttcatt caaggtttgttttgattattttacagatccggtgtcgagattgcaagacg tatgtcgagattaaacgactctacggtatagAGCAGCTGAATTTGTTAGT TGGTTAATTTTCTTCCTATTttgtctttgccgacctaaacaagctactta ggacggctttgccgacctaaaatgacctctaggtcggcaaaattttgctg GCCTACGGCCGGTTTTGGTCGGCACTTACGTGCCGATgtgattttgtctg aattcacagggctgttgtttgaggtccggcaaaatttccgggaaatagcc tatccgacggtgcgcggatctaggtgggttccgcctcccccgtagatctt tttcttgggaagttgatcttcaaattagttttcaaggttggcttggctca aattttttcatctatggctcaaattttaggcaatttcttaaagtttttga aaattttaatttcattaaaaattaatgaatccctctagaagttttgcggc gcatttttttgcttgagagtcaagtgaTCGATAAAGCGCTTTtaattaat ctttgatacgcattttggcgggacgctagtgtgactaactgtttgggagg attggttgaaacatgctgcatatatctggtctgtattttcacttattgta aaatcgaaagagagatccgtgtatttttaaattcgccgttccttaactca aatcaaatgactttggaggtttgataaaatggtggccaaattgccgtccc atgttttgtcagtaATGTTGTAAAGTCGTCCCAACAGAGCAACATTTATG GAAAAAACTCTTGTCtaatgctcattccgacattttaaattttccagggg ttttgctgtttgggattgtttaggtcagggttgctaatagcggcttgtca ctgtgccgggtgcatactcggcgccctgagccccgcagggttgctagtaa cggctcgaatttcagtcaggttaaaaaaggggcaattttacccatattat aataacattacccccgtctttttattcattcaataagtatttccaaattt ggTGTTCTGCTgagcgagtgtggctcaacggatagcgcgctgggtttctg atcagaaactctttcatttggtgggttcgaatccctgTCGAGTCAATATT TCAAGGTCagttaaaacactttaaaatagtcagaaaacatagtaaataag tcAGAAAGGTCACCAGGGGGTCAGAAAAGAGCCTCAGAGAAGAtaggcag aaataaaaagtcgatgtcggaacGAGCAATAGACAAGAGTTCTTTCCAAC ATTTATATGTATAATTGAGTCAGCTTACCTAAGGTGGAAATAGTTGGCAA GCAGTGACTCGTCTGGTCAGGCTAGCTGCTAAAGCTCtacacaagtgtta cgcgtaagccaaatcgcgtattacgaacaacctctaaattgccgagtaca ggagaaaaaaaatcgaaattcaaaatggcagccaagcccacgctgataac tataaaatactttgtttttcatgttaatgaacttgttacttaaaatatca cttacttacataatttatttatgatataacacccctttcttaaatatata aatggcctcttaaagtcttttatgtttaatCAATTAATTAAATACCGATT AAAAACGATAATCGATAGCTGAtcgatactcacaattttttagcactcaa ttaaattatcatagtagatttttaatcgataatatcGTTTACAGTGTTGA TAATTGATAATATCAATTAATATTGATATATAATCGATACCCCGACCTTA TCGATTtttaacacgtttttttttaagaaactagttttaccaagcagcct caatgtttctttagAAATctgccttttgagccttaaatgtttcttacatg cttctaaactttttgacataatcagcctcatggaaggctggattggaagg ttgttaaaaaaaacgaataagaaatgttattttctcattctcagcctcag catgtttcttagtttttaggcattctgagcctcgtgtttcttaaaagtgt gtttcttaaaaaaaaaacgtgttcaaAATCGATAATATATGAAACTTGGA TCGATATCTaattaatataattgatatcttaTGTTATATCtgatcgatat aatcgatactcacaatttttttattatttatcgattatcgcttttaatcg atatttaatcaattgactaattatcgattaGCTATCAATTTgtattcgaa aattgcactcgtgattgttttgtttagaattttcctcgtcctttcggact tggaaaattaataacaaaaaaatcacttgtgcaattattctcaaattgta ctcgttatcatgtgattacaagCTAATCGCGCTACTTTTTCCCTGTTAGG GAAAGTAAATTCCactaaaagtcatattttttgtcttctctctatgttat tcttttattgttgtttataaattttctttctctctaaatgaatttcgaat gcaattaaaacattcgatgaaaaaaatgtaagaaaaaaacattaaattta aattcaattttgtaaacattggcgcgacatcgaagagtgtgattaacgat taattgctctctacaggatgcaattaacaattaattgctctctttgaagg agcgccaaataagaaaaaataactcatcgtgcgattataaTTGTAGCTGC CGTTCAGGTCGAAATAGGGTCAAAATAGGTAGCGAACGACATAAAAATTA ACACGTAGCCAAAGGTTTTCTTGAACGCATCTTCACGGtagaaaatggct aaaaatgaataaaataacacATTTTAGCTAGCGAAATATAAATACAGTAC AAGTCAAAATATAAAGATAAATCAGTTAGATTACAAAGACAAGTCAAAGA TATAACATAtaaagaagaaatagaaacttACTAAAAACACTGTGACTGAA CATACACGTACACGTCGACAGATAATTGCAACTGACACTCACAATTCCAA CACGCAGATTTATAACACATCACAACAACTCATACAACAACTAGACGATC CACAAGGGACGAACACGTAACTatacacacaatacagtactatacaataa aatacacaactctctagacacataataataaacaatacacaTGGGACTAA TACATATTATATAGTAATCATTTATATTTCACTACAAAAGTCCtatcaaa taataaatctaaGAACAAAGGAAACGATGAAAACAAACATAAAACTAAAA GACAAATTAGCTGCATTTTGGCAGTTACACTCCCAACTGTCAAGAATACT AATTCTTGACACaccaaaataaaatcctaaCATCACGTATAGAACAATCA AAAAGTATAACATAAGACCGACAAGCAACacaatgaaattaaaatcaagA AACGAAAAATACATCCAAAAGAATCGTAGAAAGATTCTATTATATAACAA TCTTGATGACATCATGTCATACAATTCAAGTTCCTTGTTTTGCCGTCTTA ATTCCTCTGACCAAGTCTTTAACAGTTTGAAGGAGTGCAATATCGATTGT GCGAAACCTTTATGATTTTCCTCAAAATAAACTGCTGATTCTTCGGATGG TTCAGTAGAATCGTTGGGTTCTAAATATGAGTACTTAATTCGAACGAAct tgaatttccttttttcaataGCAGCAGTTGAAACTTTGTCGCAATGATGT GCAACTTCTTGCACAGACGGGGGTGAGACAATGCTCGCATTTCTCAATTT CTCGACGTTCAAAACTTTGTCAAAAATATGTGCAACTTCTTGCACAGACG GGGTGAGACTACGCTCACATTTCTCAATGGAACTTCTTCCAAGACTGGAT TGACAAAGTAATGATCTTTCAAATGATCAGGAGCAGAATCTAAGAGTTTG TAGGCGTTTTCAATTAAGTTCTTACCATATACATCTTCATCTGGGCAGTT TGACAGTAAACATTCGTAATCTGAGTAAAACTTTAGGAAATCATTCAAAA GTTTTAATAGTGCGTTGTGTTCACCACGAAACATCCAAACGACCAATTCA ATATCGTCATTACTTTTGAAGATGTATTCTAGAGTTCGACAGGAGTGAGA AATTGCTTCGATAAATTTAATCCTCTGAGTACCAAACTGGTAGGCCAATT CAAGCGACATATcgttttcaagttaaataaaTAGAAATCATATTTCGACA AACCATACGAGTGTTCTTTCATCAACTTTTAAAACTGTAACTAAGATTCC ATTGGTTGAGTCCATCAAACAATTTACTGCCATCGTTGCACGAGCTTGTT CATAGTGTTTTTACTGTAGCTGCCGTTCGGGTCGAAATAGGGTCAAAATA GGTAGCGAACGACATAAAAATTAACACGTAGCCAAAAGTTTTCTTGAACG CATCTTCACGGtagaaaatggctaaaaatgaataaaataacacATTTTAG CTAGCGAAATATAAATACAGTACAAGTCAAaatataaagatacatcagtT AGATTACAAAGACAAGTCAAAGATATAACATAtaaagaagaaatagaaac ttACTAAAAACACTGTGACTGAACATACACGTACACGTCGACAGATACTT TCAACTGACACTCAAAATTCCAACACGCAGATTTATAACACATCACAACA ACTCATACAACAACTAGACGATCCACAAGGGACGAACACGTAACTataca cacaatacagtactatacaataaaatacacaactctctagacacataata ataaacaatacacGTGGGACTAATACAAATTATATAGTAATCATTTATAT TTCACTGCAAAAGTCCtatcaaataataaatctaagaacaaaggaaaaga tgaaaacaaacgtaaaactaaaagacaaatTAGCTGCATTTTGGCAGTTA CAATAATCGATAATCGATTTTATTGATTAGTAACGTCTGGATTCCAGCCA AgccatattttatcattctacagaaatccctgcttgaaaaatcaagtcgA GCCAAAATGGTTGAGTTTACTAAACTTTGCCAAATTGAAACGCAGGAAAA TATCATATGACGTATGACCAGCTTCTGTTCACTCTGATCATGATTCTGAT CACGTGATATAGcttgatgttttgacttttttaaaccattgaaatcattt gtttatactGCACTAAAGGTCTTTCTAGATTACCGCGCaaaaaaaCCAAG GGTTaacatgaactttaaagcctgctgcgggaaagggaaatggttttgaa aaACCAAATATACACAAAAAGTTTTAATATTATCAAACTATCATGAAAAC AAGTGACATTTACATGgttgatctttataaagtttgatcTGAAGGTTTGT TGTAAAGAAAGTTGACCCCCGTGTTGGTTTTATAACCTATATTTTGAGAT TTGTGAGAagacaaatgttattgtaaaaaaaaagtcatttggtTAAGTGT AATCATACCCTTTTCAGGGAACTGGACCAACATTTTTAAAGTCAGAATTC ATTGCACGTAATGCAGCGTGGTTTGAAACCTTGCTGGTGGTTGTTGTAGG TCTGGTAGTaaatggatttatttctgaatgtaaacattactgcagctaga atattttctttattttgacaaacaaaaggttcaaggtttgtttacttttt attttatatactgcATTTCTCTGTTTTATTCTGCTGTAGTAggcaattga aaatttttgtttttgtttttgtcagtgttcgctcagcagccattttgaat ttttttcgacgTCTAAACTCTGCAATTTTGTGACCTCTACAGAATCAATG ATTTTGCCTGAGGGGAACAACAGTGTGCAATCACAAACATCTAacgacac tgtcatcattgacaataaaacaaaggattcaAATGTGAAGAGtgttgtaa acattccaacaaccttccatcgaaatgatctgtcacagctgagtctacca tttttaacacagaaaaattttatctgttaatcattttctcaagcaaacaG TACgtgaagcgattctagctttaagATAGTGCTgtggatcatcagtggat agtattcaattatcattatccctttattttcattcctagaacttttcaaa aaaaaggaaaaacagaaaagttatattttttactgctctattcaaaGATC TTCTATgaggcgtttttttgcaaacttaaaaaaaagtgattttgtcctgc ttttgcgggactttggcgtaagtgcttgcgtgcagcatagggtacaaagt ccaaatatgtgtttccaGTAGTTTTTGTATAAAGAGTAAGGTCTATACTG CTGGTACAGTTGCTAGGAAGGTGTTAACTTCTTTTTATAGTTTCTGTCCT AGACAAGTCAGATCAATTTTCAGTTGAGAACAGCAGACAACCATCAAGCG ATTTTTTGGGAGAAAATGTGGGAAACAAAAAGCTTTCTTTTCATACTCGT TGTGGTCTACTGGCCCTTGTTTCCTTTTTGGCAATATTTCAACTTTATGT GGAAATCTTGAGTTTTCACCactgaaataaaaactttttacctGCTACTT TTTCTAAGATGCTTTCAAGCATTGGCttagtaaattttgttttgcacCAT TTTAATCAGGACCCTCCCGGTGCTCCATAAACGCCCAGGGCAAAAAGTGC CGTTTTGCCATTCTGGATCACTTCCAGTGTTCCCGAGCACGATATCTGCG ATATAATTACGATAGCGCATTCGCTGTGCTAATCATATGAGAACTAACTG CGCACGCAGTCGCACACACCTATCTTaaaaaaaTCAGCCAACTCATGGAA GTGAAACctcatgttttttaattttttcaatatttcaaccagtgatgctt tcgaatataatgtgacaaattcaatttcattaatggctGAACCATCATAT CAATGTTTTTTGTAACCATGTTTAAACAGTTTTTTAGGACGTGTTGAAAA TCACTTGCCCCGGAACTTTCCGGAGAgtaaaaatagtgtttttttagccG GAAGTTTCCAGAGCGCCGGGAGGGTTCTTTTTAATCACTTCAATAGCGGT TGCTACTTAAAAGATGATGTTTGAGACCACGTGTGTGTGATATCATCTTT TTAGTCTACTTTCACGCACCATTTTATgtatattttgaaaagataggACA CAGTTTGACCaaaaaaaGTGagtaccttattacacgaatattactagaag tcattttattaaaatgaagtgaaaaatttcgtgttaacaaaaccccctta attaaaaccagccgctgttaccttgaaaaagcagaaaaattcatgttaat ttcagatcgtcCAAATCTCTGCTTGCTTAGATGCTCAGGCCTGAACAGGC CCCTTGCTCCTCATGACCAGGGCTTTCCAAGCATGACTGTCCATGGCAAC TTCTTCTAGTTGAGCCAGTGCAGAACCAGTATCAACATACATTTGGTCTT TCCATCTCTTTGGAGGTCTTCCATGCGGTCTGGGGTTTGTGAAGTCGTCT TCGAGGGCAATTTTGACGGGATTATCCAGGTCTCTGCGAATAACATGGCC AAACCAGGAGAGACATCTCTTCCTAACGATGTCAACAATGGTGGTGGTGA CTCCAAGCCGGTTTCTGATTTCAACATTACGAACACGGTCCATTAAATGT AAGGCCAAGAAGTGATCTGAAACATCTCATTTCGAAAACTAGCAGTAACT GTGTATCTGATTTTTTCAGTGTCCAGGTTTCCGAGGCATAAATTGCTATG GGGACGATGAGCGCGTTGTAGAGTCGTAATTTCAGCTTCAGCCTTATGTT ACGCCATATTTGATCTCTTAAGCGTCCAAAGCTGGAAGATGCTAAGCCCA GTCTTCGTTTGATGTCATTTGTAGTGCCTAGAACGTTACTTCCCAGGAAA ACAAAGTCACTGACATTCTCAACGCTCTCATTGTTGATTTGAATGGGTAC TGGCGAGTTACTGATGGTTTTGCATTTAGATGCGTTGATCTTCATTCCCC ATTTGGAACAAGCGGTCTCAAGTTCAGCTGTcgatatttctaatttttca aagattgccgTCACAAGTGTAGTGTCATCAGCATACCTAAGCTCCATGGA CATATTTTCTTTTAGTTCAAGGTGGTCATCGAGACTCTTCAGCTCATCCA TAACGAATTCCAGAAATATGTTAAATAGGACTGGAGGTAGCAGACAACCT TGTCGTACaccaaatttcaaggccgttgaatacttttaagcctagtaata tttgtatttactcttattggaactaattttcgcaggcGCTAATTTTCGTG GTcgaaaaaatatccgaaaaattgcatttcacgggttttaatttttgcat ttttttttcattctggaattttcgctggttttaattttcatatttttgcc cttttttgaacaaatttctttcattttcctagggatttttcctatttttt gataaaacaaaaaacgctaaaattaattcccgcgaaaattagttccaata aggtacaaTAAGGTAGTTTTTCACaatccatttttcttttgaagtaCTTT ACCAATTCTCAAAAGTTACCCTCATTTTTTCTCTTGTGCTTAGGTCTATC AGATGAGCCTACTTTTATTTCTTCTGCTTAATTTTGGTTGACTCCCCTAC CTAAAATCTCCATACAAAATTTATGGAAAATGCATATTTGGGCTTTGTAT CCAATGCTGCATCCAAGCACTTCAAACTAAAGTCCTGCAAAAGTAGGACA ACAATCAGTtctttgaagtttgcaaaaaaaaaaagctacATTGAAGATCT TCCAAATTCAGTAtcccagacgtaattaatcgagcTTTGTTGTCCAATTA ATGTTCTACTAAGTGAACTTTAatcaaatactcacaaattcttcaaaata aaaattttgattaaagaaATCGAACTAAAATAGAACTCTTTAAAAATAGA GACCTTTaatagttcgattagtttgattacatTAAACAACCTTAATCGAA CTTAGTCTCACTTAAtatgttttgtcgaacttaactgaatactcacaatt tttgcggcttttaaagattttaattaAAGAATGTAATCAAACTTTTGTAG TTCCAGTAAGTTCGAccaagttcgattagttcggtagtCGAACTGTTCta ttaattacgtctggattATTGTGAATAAAAATTGTATATAGAAGTTATCT CTGTTATTTTTTAAGTAAAACTATGCCATTGCAGAAATAATGTAATTTTC ATGAGCACAAGACTCAATAAATCAAACAATTTAAACACAAAACTAGCATT ACACAAGTGACAATAAAATTGTGAATATACAAAATAGACAATAATTACCT AGGGAGTAAAGTGTTAGTATATATAAGTTATaagtattattattatcatg atatgtacaaaagaaaaagaaaatttaattgcaATGAGTTATATAACAAA GAGTGAAGGGTTGAATATCATGATATTAAGTTTGATTGTCACGGCGATGT TATGGAAGGGGGTGGGGGTTTGTAAATAAAATCAGCATTTTTCGTGGCAT GTTTGAGTTTGGATGGCTCCCCTTAGTGTGTAATTTTGTTGAAGAATGAT TAATTTATCTTCTCTTGAAAACCAAAATTATATCATATCCTCTCATCTCT TAAAACCATCctttcaaaaaaccttttaatgtTTGgacataaaaaaactt ttaatttcttAGAAGTGACAGCTAGCGAAATGAGCTTAATTATCTTTGAT ACTTGctaacaaaatttcaatttgactAGCAAAGGTTTTGTTTCACTTTG CACCCTTTTACTTTAGAAATTTTACACTGTTTGCACATTAAACGGTTCAT AAGCTACCGCTGTAATTAGTGTGGGTTATAGTTATTTACatttattaaaa agaaaaactggtTATCAGACCTCACACTATGGTCTCAACCAGGAATGGAT ACTTGTAAAATTATTATAAGTTACTAAAGGAGGGGCAACTTTCCCAGGAC GTTGTCTTCTCAGGCATATTATTGTTCGTTATTTTAAGgagaaaatcttt aattttgagaTATTATGTTGGACTGTTTGTATGCTGCGTGTTGATCTTTC AAGATGCTTAAGATGAagcacaaagaaaaaaaatttggcaaGTTATCCAG ATAATTGTAAACAATGACAACTTGGTAGGGCAGGATTTCATAAAATAAGA GGCTCAAAATATATGGGGAATGTTATGtttttttGAGGCTACTATATACG GGGATGAATATCtcagaaaaaaagtaaacatttcACCAGGGTGTGAAACA TGGTCCTGTGCCAAGATAAAGGAAAGTGAGTTTTCAAATACCGTGATACA GACCTTCAGACCCTTGCCACAAAAAATTGATGGCTCTCCTTACTCACTAT ATTTTTCTCTAATCAAGGAACAGACACAGAAAGTAAGTAAGATGTGccgg taaaaaaattattattatacaaTAGATTGGatgttgtgaattttttttat tctttcttttcttctgtaGCTTGTTTTCCAAAGTATCACAATGTTAAGAA GAAAGTGCGCATTCACCGCGAGAAAATGGATGCCATGAAACTCAAATTTG ACGTAAGTAATAATTAATTAAAgttctttcaatttttatcatttttatag gCTACTATGTATTGTCTTTCCAAAAGCGCTTTTAACGGCtaatacatccc tgtctcacaaccctgGTGGAAtttttttCCCCAGTTAGAATGCTAATTTC TATCGTAATACCAACGGGgataaaaattgctaaaaaaaatacatggtttt ggagtgcatttttttcattatatttcaaATAGGAATACAGTCAAAGTTAA TTTCCGAGTGAGAAAATGCTTATGAGTTatgaagcatttttaaacaaatg aaaaacaactggTGCTCCTTCTCGCCCCGTGCGAGCAcagatttgaagaa aaaaaatgtgatgCGCCTGCTTTTTACATCAGAGACAATATTTACAAGTT TAAGAAATTTGTCGGCTGTTTACTTTCAGAGACTTGACGTTGAAGACAAA CCAACAGGATGCATTTTGTGTCCACATAAGAACACAGATATTCAGATTGA TTATAAGGTAATCTTCAAAATAAGCTCTAATATTCTATAAAACTTGTCTG TTTCTCTGAGATTTAACCTTATTCTAAATTCACTCAACCTTGCCCAATCA AAAATTGCTATGCTTGCATCGTACAATTCATCAGACTTTTCGATACAGTT AAATGGATTTTTGTTAAtcccatttttttatttatcctCCTTTCACAGAA TGTGCGCCTATTGTCTCAATTCGTTTCACCCAACACCGGAAGAATATACG GCAGAAAAATCACAGGTTTGGTGACATATTTAACTTATATCCTCAAATAA GTGTTGCGGCGTTCTTCAAATCTTTGCGATTCTGGGTGTGGCGCTCTTTA GGGTGGAACTTATGAGAGGGCGACTCTTTTCAGTAATTGAAATATCCATT GTATTTAAGAAGCcctcaaaagattaaaaaaataacgCGAATTTTACTAC TATGATTGTTGATAGTTTCAAAAGGGGTAAGGGGTTGTCAAAAACCTCGA ATAATGGCTAATGTCTATGAAATTCTAATGAGTATTTTAGAGGGCGATTT CTACTTAAGGTCTAAAAAGGGGAAATACAgtatttgaaaattatattttg aacaTATTAATTTGAAGACTTttcaaaattgggaaaatatAACTATAGAA AAGAAATGTTCAGTTaacaccccccccccagttCGATCAATACAGAGAAT AAAAAGATCAAGTCTatttttttagatgagcagaaattttagacttgatt ttatttttattttctttcttcaggtttaTgtgacaaaaaacaaaaagaag tgACGAATGCAATCAACCGTGCAAGAAGGATAGGTAATATTAATTATGTA CTATTAATTATTGATTCTGCAACTACATTTACATGGGGCTAGTCAACGGG GGACATGGCCCCTCACTTTTTTGCAGACCATACTTATGTTATACGTTAGA ACAACTTTAAACAGACCAAATCAAGTCATAAAGACTGTTTTTCTCCCCAA TTGAATAACGTTTTagggtgttttgagggtgtaaaaattaATCTGAATAT TAGACCCCCCACTCCAAGTGGCTCGCCATGCCCATGATTTATGAGTCGGT AATTTTGGTACAGTTTTTCTTTCATGCGCTCGAATGCTCTGTTAAAACGA ATCCTTTACATTTATTTTTAGGGTTAATGCCAATTACgatgaaatatttt gactttCACGAAGACCCAAAGCTATTCTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000124_pilon:377763..394492+

>XLOC_008464 ID=XLOC_008464|Name=XLOC_008464|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=894bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000124_pilon:377763..394492+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCGGCCATGAGTTTAGCATGTGGATTTAGAAATTTTGCTTTTCGAAG
TTCTGTTCCAGAGCTACAAATAGTTGCTGGCTTGAATACGTCTGTTCCAG
ATGGCGGCCATGAGTTTAGCATGTGGATTTAGAAATTTTGCTTTTCGAAG
TTCTGTTCCAGAGCTACAAATAGTTGCTGGCTTGAATACGTCTGTTCCAG
CTTGTTTTCCAAAGTATCACAATGTTAAGAAGAAAGTGCGCATTCACCGC
GAGAAAATGGATGCCATGAAACTCAAATTTGACCTTGTTTTCCAAAGTAT
CACAATGTTAAGAAGAAAGTGCGCATTCACCGCGAGAAAATGGATGCCAT
GAAACTCAAATTTGACAGACTTGACGTTGAAGACAAACCAACAGGATGCA
TTTTGTGTCCACATAAGAACACAGATATTCAGATTGATTATAAGAGACTT
GACGTTGAAGACAAACCAACAGGATGCATTTTGTGTCCACATAAGAACAC
AGATATTCAGATTGATTATAAGAATGTGCGCCTATTGTCTCAATTCGTTT
CACCCAACACCGGAAGAATATACGGCAGAAAAATCACAGAATGTGCGCCT
ATTGTCTCAATTCGTTTCACCCAACACCGGAAGAATATACGGCAGAAAAA
TCACAGgtttaTgtgacaaaaaacaaaaagaagtgACGAATGCAATCAAC
CGTGCAAGAAGGATAGgtttaTgtgacaaaaaacaaaaagaagtgACGAA
TGCAATCAACCGTGCAAGAAGGATAGGGTTAATGCCAATTACgatgaaat
attttgactttCACGAAGACCCAAAGCTATTCTGAGGTTAATGCCAATTA
CgatgaaatattttgactttCACGAAGACCCAAAGCTATTCTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_008464XLOC_008464-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000124_pilongenomesc0000124_pilon:377763..394492 +
Properties
Property NameValue
Aaloc391-447:16674
Aaloc331-387:16276
Aaloc262-327:15699
Aaloc184-261:15430
Aaloc103-183:14922
Aaloc1-99:1