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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000373_pilon:230491..238628+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_008417 ID=XLOC_008417|Name=XLOC_008417|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8138bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000373_pilon:230491..238628+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTGAAACAATATCCAAAGAAAACCATTGAAATTGACAAGGAATCAGA
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TTTTTCGCCATTCATAAAATTATTCGTTGTTGAAATGGTAATCGTCTTTT
GCTGTTATGAACGATTAATAGCTTCACATAACCAGGCGTTACGATTTCCA
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CGTGGATATCAGTTTTAATGCTTTTAATTTCCTGATTGCCATATCAAAtg
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TAATGTTTTTGGTTTGAGAAACAGCTCATACCATTGAATTACCTCCACTT
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ttataagAAACAGTTGAAAACAGCACTTTCAATGTCTTCTTTAAGTTATA
CAAAGATCCATTCAATCGAGCTGGACTGTTCAACATTGGTTTTGTGGAAG
CTTTGAAATTGGATAAAGAATTCGATTGTTTTGTCTTCACTGATGTGGAC
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TTCTGTTATAAGCACCCGGATTACTAACCCAACTGGCacccaacgttgtt
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CATGACAGACGATATCCCTTGACCTACTAAGAATAATTATGGTTATAATG
TCAGGGCTGGTCAcaacaaattttacaaaaaaattgagcTAGATTGTTGT
TGTAATATTTATCTATTCAACCCGTTCAACATtaggctgttccattaaaa
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TTTTGGTTGGGGTGGGGAGGATGATGATCTCTATAAAAGGTTGgctaaat
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ATCGTCCAGCTACTTCCATCTGGGTAATGGGGTAACAACTTTTGAAACCA
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TTATGTACACGTTGTAGAGTGCGTTCTTATGACATGGAAATCACGCGACC
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CGATGGATTGAATTCTTTGAAATATGATGTCAAATCGGTGATCGAAGCAC
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GATGTTTGAGTCTGTAATTCTGTTGGTCTATTTTGCAACTGCTGTCATTT
CTATCCAataatcctcataaaaaagtttccaaaaggcggacacttaaTTA
GCGGACCTTCCAATTTGCGGACAAACtttttttgcacgaaatggccaaaa
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TCTGGTTTGATTAACCTCAAATTTTAACTAATGTTGATAACGCTGGACAA
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GCCTTTTAActcaaaacaataatttttgtctttcattttctttaggtTGC
TATCATTATCCCATATCGTAAACGATTTGAACagttga Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000373_pilon:230491..238628+ >XLOC_008417 ID=XLOC_008417|Name=XLOC_008417|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1830bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000373_pilon:230491..238628+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTGAAACAATATCCAAAGAAAACCATTGAAATTGACAAGGAATCAGA
CAAAGGAATCACCTTTCGTATACATAATAACAATTCTCATGTACAGACTG
TCAATGTAGAAAAGAACCCTACAAAAGGAGGTTCTTCAGATAATACTAAA
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GAGAAAGGTGGTAAATGGGCACCTACAACATGTAAACCCAAGCATAAGTT
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GGGCACCTACAACATGTAAACCCAAGCATAAGGTTGCCATCATCATTCCG
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GTTCCTTCAAAAACAACTCTTGGATTATCGTATATTTATTATTGAACAGG
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CTCAAACACATGCACCCGTTCCTTCAAAAACAACTCTTGGATTATCGTAT
ATTTATTATTGAACAGTTATACAAAGATCCATTCAATCGAGCTGGACTGT
TCAACATTGGTTTTGTGGAAGCTTTGAAATTGGATAAAGAATTCGATTGT
TTTGTCTTCACTGATGTGGACCTTCTACCAGAAGATGACAGAAACTTTTA
CAATTGTCCAACGTCACCAAGACATATGTCGGTCGCTATCGATAAGTTTC
ATTATCATTATACAAAGATCCATTCAATCGAGCTGGACTGTTCAACATTG
GTTTTGTGGAAGCTTTGAAATTGGATAAAGAATTCGATTGTTTTGTCTTC
ACTGATGTGGACCTTCTACCAGAAGATGACAGAAACTTTTACAATTGTCC
AACGTCACCAAGACATATGTCGGTCGCTATCGATAAGTTTCATTATCAGT
TACCATACGCGACCATCTTTGGAGGGTGTGGATCTTTCCTTCGCGATGAC
TTTGAGAAGATCAATGGATTTTCCAACCTCTTTTTTGGTTGGGGTGGGGA
GGATGATGATCTCTATAAAAGGTTACCATACGCGACCATCTTTGGAGGGT
GTGGATCTTTCCTTCGCGATGACTTTGAGAAGATCAATGGATTTTCCAAC
CTCTTTTTTGGTTGGGGTGGGGAGGATGATGATCTCTATAAAAGgtTGCT
ATCATTATCCCATATCGTAAACGATTTGAACagttgagtTGCTATCATTA
TCCCATATCGTAAACGATTTGAACagttga
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000373_pilon | genome | sc0000373_pilon:230491..238628 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 874-915:8097 |
| Aaloc | 751-870:6118 |
| Aaloc | 559-747:4846 |
| Aaloc | 442-558:4290 |
| Aaloc | 310-441:1561 |
| Aaloc | 1-306:1 |
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