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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000243_pilon:406823..409387+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_007716 ID=XLOC_007716|Name=XLOC_007716|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2565bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000243_pilon:406823..409387+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ctAATATTGATAGCAGCTCTGGTGTCTAGGAGGATTGATAATATACCCAT
ATATTTTATTTCCagactaaaaaacaaaaaatatcaacaaaaaaggCATC
ACTGGGAATTCAAAATGCTTGGATACCTGCATGTGAGCATTACTTGGTCA
TCACAAAAATCGATTTTCTACTGGAGTATTATTGATTCACTtgataaatt
gaaagaaaacattgagtTAAGATATCATATTCCACCAAATTGTCAGAAAT
TATTTCTAATTGAAGATGAGGAGTGCAACTCGTTAACTGATGCCAAGTTT
CAAGATTTGTATAACAAACGCTTTGATATTGGCGTTTTGAATTTGAACCT
TAAAATAACAGATACGTCTATTGATCCGAGAATCGTTGAAGCGAGGCGAC
AATTTGCAGCTCAACGATTATCAATTATAAGAATCCATTTGAAAGATTCT
GGTCAATCTAACATTTTAGACATTGATTTTAAGAAAGAACTGAACATCAA
TTCAACCATCttagatttgaaaaattatgacaaatatTTCATGTTTAGAA
GAATAAACAAACGTTTCATGTATTTTGTATATGAGAATTTGATATTATCT
GAAGAACAGTCATTGGTGGATCTCTATCTTGATAATATTATCCAGAATGG
TGATTTCGTTGATAAGTTGGAATTAAGATTCATGATACCAAATCACTTTG
ATTGCGATGAAGAGTTTAACTTTGGAGTTTGTACCCACGGATCATATTTC
CTGTCTCCACATATTCGTTTATTTTCCCCTGGTATTGAGGCGCAAGTAAA
CGATTCTACCACAAACATGAAAATTGTACCCCCGAAAACTGTAGACCATG
AACATTACATAATGGAATGCTTAGATTCGATAGGATACACTAAAGTAGCG
TATCCATTGCTGGAGATGTATTCATTTGATGTCTGGACAATGAAATGTTG
GATTAAGCATTTATTTGATGTTTCTTATGAGAACCAAGTGATCTTGTATG
ATGCTTACAATGACTTGGTTATCGCCGATAATGTGATTCTTGAAGATTGG
GGGACAAGAGCTGGTTTCTAtcgattttattttttcctaCTCCCAACATC
GTTGTCAAACCAGCGTTTAAAACCGTTCACCGACAACGATAAGCTCAATG
CAATGAAAAGGATAGATTCAATTCCTGTGAATGTCACTTTGTATAAGAAT
gaagaagattttcaaaaagaatccTTTTCAATCGATCCCAATAATGGTGA
GACTATCCATGAATGTATTTCACGAAAATATAATATACCACTTGAAAAAC
AACTATTATTTTTGAACGATAGAAAGATCAATAACCAGGATTTAATGGCG
ATACAAGCGCAACgagttttggctgaaaatttgaGGGACCTTAGAGAAAA
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TACATCTTTACCATGTATCAGCTAATGATGAGAAAGAGCCTTCGGTAATC
ATCAACCATGGCTTTGGAGAATCAATATTTTGCCAGTTCCCTATGTCTTC
ACTAAGTATTCTTGAGTCTAAGGAACAATACCGAACTTTGTGCAGACTTA
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ACTATTAGCAAATTGTTTGAAAACCAACAAAGATCTTGCTTTGAATTTAT
TTCTCAACCCTTTAAATCTTCATACCAATGAAGAAGAGATTTGTCAAAAA
TATGATTTATCGCCAgagattcgaatcaattttttgactggTCAATTTAA
AGTTGACTTATCCTGTGATGTTGATCAAAATCTTGGTTCCGTTCAAGATT
TAAAAGACCATATTTACAAAATCAAAGGTATTTTACCACAACTTCAATCC
CTATACCACAACAATACAGATTTGTCCAACGATGtcaaattatttcaact
tttgcACTTGCCGTCCAATGTTTTAAATCTGATCGTCAAACAGCCACAAG
AAATTGAAATCAAGTTAAGCTGTACTTTTTTACCTAACAACCCTTtagtt
ttgaatattttggagACGTTAACCGTATTGGATATTAAAGTGAGTATTAG
AGAGCTTTCCAACAACATACCAGTCGAACGAATGATAATAAAACACAATT
GCCAAGCAGTACCATTCCAGGTTAATAAGCCTGAAACCCTAGTTAATGAT
GACACACCAGTCTGGACTTTACTAAGAGACGAAATATACTTATGTGTATC
AAGATCAGTGGACTATTTGATCCGAAACCCAAACAGTAAAGTAATCGAAA
GAAATACTTATGAAATAAGATTTTACTCTGCTCCCTTGGAGAACCTAAAC
ACCTATTTACAGGGACGCTATCGAAATTCTGGTAATCTGGTTCATTTTGT
TCAGAAACCAAATAtgaatttggaaacttttttaagTGATATTGGAAATG
ATGAAGTTGTTGAATTTATACTTTCCCCTTTTCAAGCAAGTCATAACGAA
CGTCGCTGTAACATC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000243_pilon:406823..409387+ >XLOC_007716 ID=XLOC_007716|Name=XLOC_007716|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5130bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000243_pilon:406823..409387+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ctAATATTGATAGCAGCTCTGGTGTCTAGGAGGATTGATAATATACCCAT
ATATTTTATTTCCagactaaaaaacaaaaaatatcaacaaaaaaggCATC
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gaaagaaaacattgagtTAAGATATCATATTCCACCAAATTGTCAGAAAT
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CAAGATTTGTATAACAAACGCTTTGATATTGGCGTTTTGAATTTGAACCT
TAAAATAACAGATACGTCTATTGATCCGAGAATCGTTGAAGCGAGGCGAC
AATTTGCAGCTCAACGATTATCAATTATAAGAATCCATTTGAAAGATTCT
GGTCAATCTAACATTTTAGACATTGATTTTAAGAAAGAACTGAACATCAA
TTCAACCATCttagatttgaaaaattatgacaaatatTTCATGTTTAGAA
GAATAAACAAACGTTTCATGTATTTTGTATATGAGAATTTGATATTATCT
GAAGAACAGTCATTGGTGGATCTCTATCTTGATAATATTATCCAGAATGG
TGATTTCGTTGATAAGTTGGAATTAAGATTCATGATACCAAATCACTTTG
ATTGCGATGAAGAGTTTAACTTTGGAGTTTGTACCCACGGATCATATTTC
CTGTCTCCACATATTCGTTTATTTTCCCCTGGTATTGAGGCGCAAGTAAA
CGATTCTACCACAAACATGAAAATTGTACCCCCGAAAACTGTAGACCATG
AACATTACATAATGGAATGCTTAGATTCGATAGGATACACTAAAGTAGCG
TATCCATTGCTGGAGATGTATTCATTTGATGTCTGGACAATGAAATGTTG
GATTAAGCATTTATTTGATGTTTCTTATGAGAACCAAGTGATCTTGTATG
ATGCTTACAATGACTTGGTTATCGCCGATAATGTGATTCTTGAAGATTGG
GGGACAAGAGCTGGTTTCTAtcgattttattttttcctaCTCCCAACATC
GTTGTCAAACCAGCGTTTAAAACCGTTCACCGACAACGATAAGCTCAATG
CAATGAAAAGGATAGATTCAATTCCTGTGAATGTCACTTTGTATAAGAAT
gaagaagattttcaaaaagaatccTTTTCAATCGATCCCAATAATGGTGA
GACTATCCATGAATGTATTTCACGAAAATATAATATACCACTTGAAAAAC
AACTATTATTTTTGAACGATAGAAAGATCAATAACCAGGATTTAATGGCG
ATACAAGCGCAACgagttttggctgaaaatttgaGGGACCTTAGAGAAAA
TGACAGAGACAACCAAATATACATACCAAGTCCAGAAACGCCTTTTGAGT
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ACTAAGTATTCTTGAGTCTAAGGAACAATACCGAACTTTGTGCAGACTTA
TTAAAGAAACACATCCAGAACTAGTTCCTGAAGTCATTTATTTGACTCAT
GACACCAAACATGATCAAACAATCAAACTATCAAAACAGAATTTGGGGAA
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TATGATTTATCGCCAgagattcgaatcaattttttgactggTCAATTTAA
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CTATACCACAACAATACAGATTTGTCCAACGATGtcaaattatttcaact
tttgcACTTGCCGTCCAATGTTTTAAATCTGATCGTCAAACAGCCACAAG
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ttgaatattttggagACGTTAACCGTATTGGATATTAAAGTGAGTATTAG
AGAGCTTTCCAACAACATACCAGTCGAACGAATGATAATAAAACACAATT
GCCAAGCAGTACCATTCCAGGTTAATAAGCCTGAAACCCTAGTTAATGAT
GACACACCAGTCTGGACTTTACTAAGAGACGAAATATACTTATGTGTATC
AAGATCAGTGGACTATTTGATCCGAAACCCAAACAGTAAAGTAATCGAAA
GAAATACTTATGAAATAAGATTTTACTCTGCTCCCTTGGAGAACCTAAAC
ACCTATTTACAGGGACGCTATCGAAATTCTGGTAATCTGGTTCATTTTGT
TCAGAAACCAAATAtgaatttggaaacttttttaagTGATATTGGAAATG
ATGAAGTTGTTGAATTTATACTTTCCCCTTTTCAAGCAAGTCATAACGAA
CGTCGCTGTAACATCctAATATTGATAGCAGCTCTGGTGTCTAGGAGGAT
TGATAATATACCCATATATTTTATTTCCagactaaaaaacaaaaaatatc
aacaaaaaaggCATCACTGGGAATTCAAAATGCTTGGATACCTGCATGTG
AGCATTACTTGGTCATCACAAAAATCGATTTTCTACTGGAGTATTATTGA
TTCACTtgataaattgaaagaaaacattgagtTAAGATATCATATTCCAC
CAAATTGTCAGAAATTATTTCTAATTGAAGATGAGGAGTGCAACTCGTTA
ACTGATGCCAAGTTTCAAGATTTGTATAACAAACGCTTTGATATTGGCGT
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TTGAAGCGAGGCGACAATTTGCAGCTCAACGATTATCAATTATAAGAATC
CATTTGAAAGATTCTGGTCAATCTAACATTTTAGACATTGATTTTAAGAA
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AATTTGATATTATCTGAAGAACAGTCATTGGTGGATCTCTATCTTGATAA
TATTATCCAGAATGGTGATTTCGTTGATAAGTTGGAATTAAGATTCATGA
TACCAAATCACTTTGATTGCGATGAAGAGTTTAACTTTGGAGTTTGTACC
CACGGATCATATTTCCTGTCTCCACATATTCGTTTATTTTCCCCTGGTAT
TGAGGCGCAAGTAAACGATTCTACCACAAACATGAAAATTGTACCCCCGA
AAACTGTAGACCATGAACATTACATAATGGAATGCTTAGATTCGATAGGA
TACACTAAAGTAGCGTATCCATTGCTGGAGATGTATTCATTTGATGTCTG
GACAATGAAATGTTGGATTAAGCATTTATTTGATGTTTCTTATGAGAACC
AAGTGATCTTGTATGATGCTTACAATGACTTGGTTATCGCCGATAATGTG
ATTCTTGAAGATTGGGGGACAAGAGCTGGTTTCTAtcgattttatttttt
cctaCTCCCAACATCGTTGTCAAACCAGCGTTTAAAACCGTTCACCGACA
ACGATAAGCTCAATGCAATGAAAAGGATAGATTCAATTCCTGTGAATGTC
ACTTTGTATAAGAATgaagaagattttcaaaaagaatccTTTTCAATCGA
TCCCAATAATGGTGAGACTATCCATGAATGTATTTCACGAAAATATAATA
TACCACTTGAAAAACAACTATTATTTTTGAACGATAGAAAGATCAATAAC
CAGGATTTAATGGCGATACAAGCGCAACgagttttggctgaaaatttgaG
GGACCTTAGAGAAAATGACAGAGACAACCAAATATACATACCAAGTCCAG
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GAGCCTTCGGTAATCATCAACCATGGCTTTGGAGAATCAATATTTTGCCA
GTTCCCTATGTCTTCACTAAGTATTCTTGAGTCTAAGGAACAATACCGAA
CTTTGTGCAGACTTATTAAAGAAACACATCCAGAACTAGTTCCTGAAGTC
ATTTATTTGACTCATGACACCAAACATGATCAAACAATCAAACTATCAAA
ACAGAATTTGGGGAAACTATTAGCAAATTGTTTGAAAACCAACAAAGATC
TTGCTTTGAATTTATTTCTCAACCCTTTAAATCTTCATACCAATGAAGAA
GAGATTTGTCAAAAATATGATTTATCGCCAgagattcgaatcaatttttt
gactggTCAATTTAAAGTTGACTTATCCTGTGATGTTGATCAAAATCTTG
GTTCCGTTCAAGATTTAAAAGACCATATTTACAAAATCAAAGGTATTTTA
CCACAACTTCAATCCCTATACCACAACAATACAGATTTGTCCAACGATGt
caaattatttcaacttttgcACTTGCCGTCCAATGTTTTAAATCTGATCG
TCAAACAGCCACAAGAAATTGAAATCAAGTTAAGCTGTACTTTTTTACCT
AACAACCCTTtagttttgaatattttggagACGTTAACCGTATTGGATAT
TAAAGTGAGTATTAGAGAGCTTTCCAACAACATACCAGTCGAACGAATGA
TAATAAAACACAATTGCCAAGCAGTACCATTCCAGGTTAATAAGCCTGAA
ACCCTAGTTAATGATGACACACCAGTCTGGACTTTACTAAGAGACGAAAT
ATACTTATGTGTATCAAGATCAGTGGACTATTTGATCCGAAACCCAAACA
GTAAAGTAATCGAAAGAAATACTTATGAAATAAGATTTTACTCTGCTCCC
TTGGAGAACCTAAACACCTATTTACAGGGACGCTATCGAAATTCTGGTAA
TCTGGTTCATTTTGTTCAGAAACCAAATAtgaatttggaaacttttttaa
gTGATATTGGAAATGATGAAGTTGTTGAATTTATACTTTCCCCTTTTCAA
GCAAGTCATAACGAACGTCGCTGTAACATC
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000243_pilon | genome | sc0000243_pilon:406823..409387 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1-2565:1 |
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