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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000308_pilon:241189..248806- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_007597 ID=XLOC_007597|Name=XLOC_007597|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7618bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000308_pilon:241189..248806- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGAATTTATTTTTATTTTGGATATTTGCTATATCCATATGTGGAAATTT
AGTGGTGATGGTTGAATCCCAAGGGGATAGTGATTTCCCTATCGATGATT
TTAAGGATATTTCTGGTGATTCAAATGATTTTGAAGACCAGAATATCAGA
CTCGGTGGAACGCTGTAAGTCATTGCGCGTTTACATATTTTTATAATGAT
CTGAAACATAGGATGTTCAGAACATTGTAAGAGCATTCTAAAAAAACTTT
GACAATTCTAAAACAAAAAAATTAATAAAAAATCCCCCCCCCCCATATAA
GAAAAAAAAAACTAAAAAAAAGCATATGCAGTACACTCTCGATTACTCGA
ACTTCTAATATTCAATTCTTTCTATAATTCGAAACATATTCCCAGTCCCC
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AAGTTGAACAAATAAGTTTAGAGTTCGAATTAGCGTGAATCAACTGTAGT
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GAAGGCAAATGCAGCTAACGGCTATCACTGAAATCCCTCAAAACTTGATG
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TACATCTGGCAAAGGATGTTGTTTCAACGTTCATTTAACGTTATTAAGAC
GTTCTATAATAACGTTGAAATGGACGTTGTTCTAACATTTTTGTCTTATT
TCTGTCCCTCTGCATGCATTGAACCAAATAGTCAAGTCATTCAACTTATA
ATCTATTAATTTTAGCGTTTCATTTTTAATAGGTTACGAGTCCTGAAGGT
TCGACCAATTTCTGGTCTAGGTAGATTCTCTTATTAAAAATTGTACCTCC
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TGTCTCTTTTGCACACCAGGCAAATGGCTCATAACAAGATCAAACGAATT
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AGTAGAGCCTTGCAAAATCTGAAGCTAATGTTTAAAAACCTGATGTACAG
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AAAAATCTAAAATTTTTCTTTTAGAAAGAAACTTTTAAGGACCTTAAGAG
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GGAAGGGAAGACTTATCGCTCGGATATACCAGGTTTACATAGTTGTCCCC
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AATCTAGCAAGCTAGACGACTAATTCAGACATAGTAGAAATAAAGCAATG
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AATAATCGTATTATCATTATAAACGCCTATACTACTGTATTAAACGCATT
ATAAACGACTCCAGTCTATCAAAACTAGGGTTAATATGAATGAGGAATGA
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TGGAGTTTTTGAACATTTACCAAAACTTGTTCGAGTGTAAGTTCCATTTA
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TTTTAAATCTAGTACAATGAAGCCTAACCTGAAGTTCGATTTTCAGAAAC
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GGCTTGACAAGAAATTATTGCTTCATTCAGTATGTTCTATGTATTGAAGA
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AATCCAAACGAGTTACTCGTTTCAGAGAGGAAATAACTGACCACATTCTA
TTACCCAAGTGATTCTTCTCTAGCCTTTCGGCCTTTAAATTCAATGGTTT
ACACAATATATTCTTTTTAATTTCAGTGATTTGTCAGACAATTTAATTCA
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ATTGAAGATTGTAAATTTGTTTGAAATTGAAAGATATGTTTCGAGCCGAA
CAAGCAATGTACATTCTGAATTTTTTTGCTTAAGGCTTGGTAGGAACTTT
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TTCTCAATGGAGAAATCCAGTGAAATGAGGCTTTTTCAACCCTCCACAAC
GAAGCATGTGAGAATTAGGTAAGTCAAATATGAAAGAGAGTAAGATCCAT
CATATAATTCATGATATGCATCACTGGAATGTCTTCCAGGCCCGGAGGAA
CAACCGTTAAAGTGGTTGAGATTTGCTCATTTGCTCTAAAGCGGGGAAGC
TGAAGTTTCCCCCAGTCTCCCAGCTTCCGCCGGGCCTGTCTTCGACATCA
CACCATAGACCTAACAGCTGATTGTTTGTAAGGGACGTAAAATCAGTCAA
TATGTCAGTTGTAACCAATCAGCTGTTGGCTCCGTGATGTAATGTTAAAA
GACATTACAATGGTGCATATCATAAATAAGGAAGAATAGCAATGTTTCTT
GATTCGATTTCAGGGACTTACAAACCAACATTATTGAGAAAATTGATAAA
CGGGCAATGGATCATTATAAAGTTATTTGGCATTTGTAAGTAAATTATTT
TAAAATTATCTCCATCCTCTCCTATCCTGTTTTCATTTTTCATCTCTCAT
TTTTATAATATATACCGGCATACAGTCAACCCTCTCTAATTCGAAACTCT
ATTATCCAGTCCCCTAGTTTGAGTACTCAAAGTTGATATTGTCTAGAACA
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TTCGAACTTCTATTATTCGAATCTTTCTGTAAGTCGAACTAAAATATTGG
TCCGCTCAGCTGAAAAGTGATTTAAATTACTCTATGTAATTAGAATCGTT
CTCTAATTCGAAGAAAATTCCTGGTCCCCTGAAGATCGAATTAGAGAGAG
TTGACTGCAGATCGAAGCTACCTTACACCATTTCTTTTGAATTCCCCTGA
ATTGACTGTGAAAACCAAGAAATTTTTTCAACTGAAGCTGTATGAATTAT
TCCTACTTTTCTAATTTCAACAGAGACATGAGATGGAATAAAGTACACCA
TGTGGTAGAACATACCTTTGAGGAAAACAAGAAACTCATTTATCTGTAAG
TTCCTATCATTAGGGATGCAAAGCTCCCAATAATTTTACGTAAAGTGAAG
TTAGGGGTTGGGTTATTTTGAGCTTTAGGGTAGACGATTCTATCGTCCGT
TAGAGGGATAGTGAACTTGGGAAAAAATATATGCATACAGCCATCACGGC
GGTTCAAGGGGAAAATAGTGGCGGTAGAGTTTAGAACAAACACTGTAAAC
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TAAATTATCTTAAATTATTCCTTTTTTAGTGACCTTGTGCCTTTATTGTC
TATAGGATCGTCTAGCTTTAAAGCTATTCCTCGAAAATCTGATTTCACTC
CGACCAATTTTGTCCCATGTATCCCGGCTTTATTTGCGTTACTGATGAAC
GCCAGAAAATACCCATCTTACTGGCGTGCTATCAGTTACCATCAAAAAGT
CGATAATACAAAGGGAACAAAGTTGCTCTCTGATAACAAAAATTTACCGG
GAAATTGTACAGAGAAATGTGACCGGATTATCTGAAATAATTTTCTTCTT
GGAAGTGAAACGTTTCTCTTAACCGTCACTCTATGAAACATGACTCTAAG
ATACGTTGGAAAAATACTGTCAGTATTACTGACATTAGGAAAACATGTTT
TTGTTATATTTTTGAATGAATTGTCTTGTACACAAAATACTCATTAATAA
ATCAATAAAAGTCAGGAAAATATGGCACCGGCGCTCGAATAACGGCTCCC
AGATACCGGGTCTCTAATTTGACGTCACACATTATTATCACGTTGATTCT
GACATTGTTTATGAGTCATAAGAGTAACGTTATAGATTCTTGAAAGCACG
TATCATGCATAACAAATCAAAGCTTGAAAAAGACATTGATAAATATTAGA
TCAGGGAAATTATGTTTCATATATGAAACAGCTTATTCACCATTCAAAAG
ATTTTAAGACAATATAAAGACGCGTAAAATTTTTATAGTCATTTTTTAAA
CATGTTTCCCCACTATGAAATAAATATGAAGCATTATGTCGCATGTAACT
TGGACCTAGTCCCCTTTTTTATAAAAACATAAAGAGTCATGCGATAGGAG
CGAAAAAAACTTTAACAAAATGCCTAGAAAAAAATGCAAGAAAAAAAACA
AAACAATCAGACTATATGATAATTAAAATATGCCCGTAACAAGCAGATCA
AATTAGAGAACAACTTTATAAACATACCTTTCATAAGCGTTTGATTATGC
GGTGGAAACTCTTTAACTTGAAGTTTGATCCTATTTTTTGGGCCAAAGGA
TAAGCTGTTCATACAAGTTGTGCTCATACCTAAAATAAAACAGTAACTCT
AATTTAATATCCAAGTTCTTTGATCCCCATCTCATCTAAATATTTTTATA
ATTTTACTAATTTTCAGTTATTGACAAGAGGAAACCCTCATAAATGCTCT
CTATAATTCAAATCCTTCTAAAATTCGAAATTAGACTCCCCCTTCCAGCT
CTAATTAGCGAAAATTAACTGTGCTTTAACTGTACCCACCTTTATTGAAC
CATCCAAATTTCAGAGTTTTTTTAATCCTGATCAATTTAGATTTGGAATT
GTCAGCTGAAACAAAAAGAGGAACACTTCTTAAAATTAAAATATACGTTT
TTATAAAAACAAAATATAAGAGCACATGGCTTCGATGGTCAAAACATTAA
GACCAAGTTAAGAACACTCTAAAAAACCGATGTCTCAGGAAAATGGACAA
AAATAATCACAAAACGGTAAAAATAAGAACATGTTAAGAAAATTTTTAAG
ACTTAAAACTCAAAAAGCTGAGAACATCCGAAGGCTTCATAGAATAAGAT
TTTGGATGTTCTTATAAAAATTACATGCACACTTCTCAGTTTTTGCGCAA
AGTTCACGAAAATGAATTAAGAAGAGCCAGGGCCTCAAATTTGAATCGGG
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CTAAAAAGGGTACCTTTTTCATGACAAATGTTATCCTTTTCATTATTCAG
GAATATCGGACACAATCCATTGAAGAAAGTTGATGAATATGGGCTGCCAG
CATCCTTGGAAAACTTGTAAGCATTTCTGCATACTTCCAGCACTTCCAGA
GGCACACTATTATTAGTTGTTTATTGTTTATTAATTTTTTGTTTTGTTAA
AATCTGTCAAAAAACAAATAGAAGGAACCAGGATTAACAAGTAGAAAATA
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GATTGAACCACTCCCCTCCACTGGTCATAAGAAATTCTTAAGTTTCTTTA
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CAAACGTTTATCGATCAAAAAAGTACCACTACTTTTTACGATCCCCGATC
CGAAGAAATTCGAAAATCTCGATCGAATCGATGTGACGTACAGTATGCAC
TGTTGCGCGTTCGAACAGCGCGAGTTGGAACGGAAAAACGAGTATTTGGC
CAATAAGAATCCTGCTGATACTGGTAAGCAATGCAACAACACCATCGGAG
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GATGGCTTTGGCAATGAAAATGATACTATGTCTGGTGATTCAGAAGATTT
CTTCAGGGATGACTTGATGCATAAGTATCTAGATGCTGTTTTTGGTCCTG
AACCTGAAGAATCTACAATCACCAATCTTTCAGTTTGTGATTATGGTGAA
GGTATCAAATACAAGGCGAATCCTGTTAAATGCAATCCAAAACCTGATGC
ATTCAATCCATGTCAAGATGTAATGGGTACAACAGCTTTGCGTCTCTTCT
CCTGGTTGATATCCATCTTTGCTATCCTTGGCAATCTGTTTCAGTTGATC
ATTTTGTTTTACAGTCGCCAAGAGTTGAGCGTGTACAAACTATTGATGTA
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GCTGTGTGGATACATACACGTTCGGTGAATATTACAATTACGTCCAGATG
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TACACAACTCTCGTTCTGCAGTTTGGTTTTAATCACTGTTGAGCGATTCC
TTTTGATCATCTTTGCATTGAAAGTCGGCAAACAGATGAAATTGAATCAT
GCAAAGATTGCTGTCGCTGCCGTATGGTTTTACTCCTTCATTGTGGCAAT
CTTACCAGTCACTGGTAAAGTCAGCTCCTATTCCAAGATTGCAATCTGTT
TACCAGTTGATATCCCTAACATCATTGCTATTGGTTATATCGTATGGTTA
CTGTTGGCTTACGTCATCGCATTCATTGTTATTGTCGTTTGCTACGTTAA
AATGTACGCAAGCATCAGCCAATCACGACCAGGTACACCAGGAAGTACCA
GTAATCAAATTGATGTCCAAGTTGCCAAGCGAATGGCTATGATCATTTTC
TCCAATTTCTTATGCTGGTTACCGATCAGTATTGTTGGATTTGTTGCCTT
GTGGAGTGGATTGAGAATGAATGTGGATGTTGCCAAGTTTTTGTTGGTCT
TCATTTTCCCATTGAATGCTTGCACCAATCCCTTCCTTTACGCTATCTTC
ACCAGAGTCTTCCGTGGTGACACATTGGCTCTCCTCAGCTCCTGTGGATT
ATGCAAAAAAGCTGAACAAAATTACCGAAATCGTGCACCTACCAATTACA
TGAAATCTCAACAACGCCCGAAACACCCTTCCGCAGGGGGCGGTGATCAA
CGCCATTTCATGCATTACGAACCACCCGTCAGAGCTATCGATCGCTTCGA
ACGAAACATCGAAAACCAAACCGAATTTGATTCACCTGAAACACCAATCA
AAGCAATGATTGACCCCAACCGACGCCAAATTTACGACGAAACAAAGCCA
AGGTCCGATTCAACACGTGGTTTATTGGAAGATAAAGATCCCCGATTTCG
ATCGGCATCATCGGATACCTGCTCCACCGGAATGTCAGTCCAGTCTACCG
ATTCTGAAGTTTATGATGAATTTTCGCGAATGATTGGTTCGGTGAAAACG
GAGAATTATCTAGCGTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000308_pilon:241189..248806- >XLOC_007597 ID=XLOC_007597|Name=XLOC_007597|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4974bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000308_pilon:241189..248806- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGAATTTATTTTTATTTTGGATATTTGCTATATCCATATGTGGAAATTT AGTGGTGATGGTTGAATCCCAAGGGGATAGTGATTTCCCTATCGATGATT TTAAGGATATTTCTGGTGATTCAAATGATTTTGAAGACCAGAATATCAGA CTCGGTGGAACGCTATGAATTTATTTTTATTTTGGATATTTGCTATATCC ATATGTGGAAATTTAGTGGTGATGGTTGAATCCCAAGGGGATAGTGATTT CCCTATCGATGATTTTAAGGATATTTCTGGTGATTCAAATGATTTTGAAG ACCAGAATATCAGACTCGGTGGAACGCTGCAAATGCAGCTAACGGCTATC ACTGAAATCCCTCAAAACTTGATGCGAGAAATGGCCCAAAATGTGGACAG CGTGCAAATGCAGCTAACGGCTATCACTGAAATCCCTCAAAACTTGATGC GAGAAATGGCCCAAAATGTGGACAGCGTGCAAATGGCTCATAACAAGATC AAACGAATTTCAAAGAAAGATTTCCCACGAGGATGTTGTTTGAATGTCAT CTACATGCAAATGGCTCATAACAAGATCAAACGAATTTCAAAGAAAGATT TCCCACGAGGATGTTGTTTGAATGTCATCTACATCAACCTACATGATAAT TTTATCGAGGAAATCGAAGATGGAGTTTTTGAACATTTACCAAAACTTGT TCGAGTCAACCTACATGATAATTTTATCGAGGAAATCGAAGATGGAGTTT TTGAACATTTACCAAAACTTGTTCGAGTTGATTTGTCAGACAATTTAATT CACAAATTCCCAAATCTGAAAGCAAAGAAGTTGCAAAGATTTGATTTGTC AGACAATTTAATTCACAAATTCCCAAATCTGAAAGCAAAGAAGTTGCAAA GATTGGACTTACAAACCAACATTATTGAGAAAATTGATAAACGGGCAATG GATCATTATAAAGTTATTTGGCATTTGGACTTACAAACCAACATTATTGA GAAAATTGATAAACGGGCAATGGATCATTATAAAGTTATTTGGCATTTAG ACATGAGATGGAATAAAGTACACCATGTGGTAGAACATACCTTTGAGGAA AACAAGAAACTCATTTATCTAGACATGAGATGGAATAAAGTACACCATGT GGTAGAACATACCTTTGAGGAAAACAAGAAACTCATTTATCTGAATATCG GACACAATCCATTGAAGAAAGTTGATGAATATGGGCTGCCAGCATCCTTG GAAAACTTGAATATCGGACACAATCCATTGAAGAAAGTTGATGAATATGG GCTGCCAGCATCCTTGGAAAACTTGCATTTGGATGATACCAAGCTGAGTA GACTACCATCAGCACATGGCATCAAGAACCTCAAACGTTTATCGATCAAA AAAGTACCACTACTTTTTACGATCCCCGATCCGAAGAAATTCGAAAATCT CGATCGAATCGATGTGACGTACAGTATGCACTGTTGCGCGTTCGAACAGC GCGAGTTGGAACGGAAAAACGAGTATTTGGCCAATAAGAATCCTGCTGAT ACTGGTAAGCAATGCAACAACACCATCGGAGAGCTGTCAGATTTTGGTGA 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TACCGATCAGTATTGTTGGATTTGTTGCCTTGTGGAGTGGATTGAGAATG AATGTGGATGTTGCCAAGTTTTTGTTGGTCTTCATTTTCCCATTGAATGC TTGCACCAATCCCTTCCTTTACGCTATCTTCACCAGAGTCTTCCGTGGTG ACACATTGGCTCTCCTCAGCTCCTGTGGATTATGCAAAAAAGCTGAACAA AATTACCGAAATCGTGCACCTACCAATTACATGAAATCTCAACAACGCCC GAAACACCCTTCCGCAGGGGGCGGTGATCAACGCCATTTCATGCATTACG AACCACCCGTCAGAGCTATCGATCGCTTCGAACGAAACATCGAAAACCAA ACCGAATTTGATTCACCTGAAACACCAATCAAAGCAATGATTGACCCCAA CCGACGCCAAATTTACGACGAAACAAAGCCAAGGTCCGATTCAACACGTG GTTTATTGGAAGATAAAGATCCCCGATTTCGATCGGCATCATCGGATACC TGCTCCACCGGAATGTCAGTCCAGTCTACCGATTCTGAAGTTTATGATGA ATTTTCGCGAATGATTGGTTCGGTGAAAACGGAGAATTATCTAGCGTAGG CATTTGGATGATACCAAGCTGAGTAGACTACCATCAGCACATGGCATCAA GAACCTCAAACGTTTATCGATCAAAAAAGTACCACTACTTTTTACGATCC CCGATCCGAAGAAATTCGAAAATCTCGATCGAATCGATGTGACGTACAGT ATGCACTGTTGCGCGTTCGAACAGCGCGAGTTGGAACGGAAAAACGAGTA TTTGGCCAATAAGAATCCTGCTGATACTGGTAAGCAATGCAACAACACCA TCGGAGAGCTGTCAGATTTTGGTGATATCGATACACCTGATTTTACAGGT GGAGATGATGGCTTTGGCAATGAAAATGATACTATGTCTGGTGATTCAGA AGATTTCTTCAGGGATGACTTGATGCATAAGTATCTAGATGCTGTTTTTG GTCCTGAACCTGAAGAATCTACAATCACCAATCTTTCAGTTTGTGATTAT GGTGAAGGTATCAAATACAAGGCGAATCCTGTTAAATGCAATCCAAAACC TGATGCATTCAATCCATGTCAAGATGTAATGGGTACAACAGCTTTGCGTC TCTTCTCCTGGTTGATATCCATCTTTGCTATCCTTGGCAATCTGTTTCAG TTGATCATTTTGTTTTACAGTCGCCAAGAGTTGAGCGTGTACAAACTATT GATGTATAATTTGGGATTCTCAAATCTGATGATGGGAATGTATCTATTGG TGCTTTGCTGTGTGGATACATACACGTTCGGTGAATATTACAATTACGTC CAGATGTGGCAATATTCTGGTGGTTGCCAAGCGTTTGGATTTATTGCGTT GTTTGCTACACAACTCTCGTTCTGCAGTTTGGTTTTAATCACTGTTGAGC GATTCCTTTTGATCATCTTTGCATTGAAAGTCGGCAAACAGATGAAATTG AATCATGCAAAGATTGCTGTCGCTGCCGTATGGTTTTACTCCTTCATTGT GGCAATCTTACCAGTCACTGGTAAAGTCAGCTCCTATTCCAAGATTGCAA TCTGTTTACCAGTTGATATCCCTAACATCATTGCTATTGGTTATATCGTA TGGTTACTGTTGGCTTACGTCATCGCATTCATTGTTATTGTCGTTTGCTA CGTTAAAATGTACGCAAGCATCAGCCAATCACGACCAGGTACACCAGGAA GTACCAGTAATCAAATTGATGTCCAAGTTGCCAAGCGAATGGCTATGATC ATTTTCTCCAATTTCTTATGCTGGTTACCGATCAGTATTGTTGGATTTGT TGCCTTGTGGAGTGGATTGAGAATGAATGTGGATGTTGCCAAGTTTTTGT TGGTCTTCATTTTCCCATTGAATGCTTGCACCAATCCCTTCCTTTACGCT ATCTTCACCAGAGTCTTCCGTGGTGACACATTGGCTCTCCTCAGCTCCTG TGGATTATGCAAAAAAGCTGAACAAAATTACCGAAATCGTGCACCTACCA ATTACATGAAATCTCAACAACGCCCGAAACACCCTTCCGCAGGGGGCGGT GATCAACGCCATTTCATGCATTACGAACCACCCGTCAGAGCTATCGATCG CTTCGAACGAAACATCGAAAACCAAACCGAATTTGATTCACCTGAAACAC CAATCAAAGCAATGATTGACCCCAACCGACGCCAAATTTACGACGAAACA AAGCCAAGGTCCGATTCAACACGTGGTTTATTGGAAGATAAAGATCCCCG ATTTCGATCGGCATCATCGGATACCTGCTCCACCGGAATGTCAGTCCAGT CTACCGATTCTGAAGTTTATGATGAATTTTCGCGAATGATTGGTTCGGTG AAAACGGAGAATTATCTAGCGTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000308_pilon | genome | sc0000308_pilon:241189..248806 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 664-2487:1825 |
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| Aaloc | 526-594:4395 |
| Aaloc | 454-522:4955 |
| Aaloc | 391-450:5592 |
| Aaloc | 319-387:6054 |
| Aaloc | 241-315:6649 |
| Aaloc | 166-237:7064 |
| Aaloc | 1-162:7619 |
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