XLOC_007485 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_007485
Unique NameXLOC_007485
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000130_pilon:624733..636909-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_007485 ID=XLOC_007485|Name=XLOC_007485|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12177bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:624733..636909- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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ATTCTGAATTTTTGTACAATTATTGTCACTTTTTTCTTATTTTCATCTGA TGTTAATCATTAGGTAGGTCCATTCAGCATGTTGCTTGTTGTTTTATAAA TGTCCGGTGTTCAAAATTCCCTGTATGCAACACCGGACTTATTGCGTCTG GTGTAGCGAAAGGATACTTTTTGCCACCGGACAAATACACTGGACAGTCC GGTGCGTCGTCATGGTCCTGCCATACTCTGCAAACTGGAAAATACTAGGG TTGGCAAAATTTTAGCTTTGCACAATATATATTTAAATAGACAGCTAGTC ACACTAGGAAATCATGCTTTCAGAAAAAACAACATCAGTCATCTACAGGA TGTAATTGCAACAACAAGGATATGAGAGTTACCCAAGACAGTTAAAATTT GAAAACTTAAAAGGAGACTAAATGACCAATTGCAAACGTGCAACAGCCAG GATATCAACCAACCAAATTTGTCATTCAATTCCCGAGACAGCTCTTCAAT TTTCAAGGCCTTGTTTATATGCTAAAGTAAAAATAATTCCCCACATGTAA ATGGGTCAGTGTTTGAGGTCCGGCAAAATTTCCAGGAAATAGCCTTTCCG GGGGTGCTCGGATCTTGGTGCGTTTCGTCTCCCCCGTGGATCTTTTTCTT GGGAAGTTGATCTTCAAATTAGTTGGCTTGGCTCAAATCTTTTCATTTAT GGCTCAAATTTTAGGCTAATTCTTATAGTTTTTGAAAATGTTAATTTCAT TAAAAAGCGCCGGGTTATTTTTTCATGAATTCCTTTAGAAGTTTTGCGGC GCACTTGTTTGCTTGCAAGTCAAGTGAACGACATAGCGCTTTCGCAGCAT TAATCTTTGATGCACATTTTGGTGGGACGCTAGTGTGACTAACTGATAGA TGTTTTGGCAAACCCGACAGTCTTTTGAATAACTAATTACTCCACAGCAG TTACCTAGAGACAAGATAATTTATCATGTTTTTATTGGCTGGGGGAAAGT AATGTATGTGGAGTAATTACCGTGAATGGTCCTAAATCCATAGCTGTCAA CTCTCCCGCATTGAGCGGGAGACTCCCGCATGTCAACGATTTCTCCCGCG TGAAGAAAATTCTGCCAAATCTCCCGCATTTTTGGGATTTTCTCCCGCAT CTCCCGCATTTCCAAAAATTTTCCGATTTTGGAAAAACCAAACGGCGAAA TTTCTGGATTTTGAAAGATCGGAACAAAAATTCCCCAATTTCCCGAAAAA AATTTCCAAGAAAATCGGATTTTACAAGAAAATTTCCCCGATTTCCCGAT TTTCCGATTTTGAAAAATCGGATTATTGGGGAAAATTTTTCCGACTTTGA GCTCTCCCGCATTTTTGTGAGGCGAAGTTGACAGCTATGTAAATCCGACA GTCTTGCCTAAATCCGACCCCCAAATAACTGCTATGAAAAAAAATTCTAT GTTTACCAACATCCCCTCTCCAAGTTGAACAATAAACTATTGCAAGGACT CTCAAAACAAAATATCTAACAAGATAACTATAATGTTAAGATATCAATTA ATGTGATCAAAAAATTGTGAGTTGTAAAAATAATCCAAAGTTGCTCGTGT TTAAAACGTTAACAATTTATGTAATGAAAAATTATGTTTTGTATAAGAAG CAATTATTGTTATTTGGTTCAATTGGTTCATTGTATCAAATCTCTCAGTT TAGTTGACACTTTGGTATCTTCATCGCGTCACAGCGAAAGGTTTGTTTTT ATTTTAGTTTGTATCTTTGAAAGACTTAGGACCACTCACGGTAGTTATTC AAAAGACCGTCGCGTTGGCCAAAACAACTATTAAAAAAGAAGTGCACACC ACAGTCCACACGTGCGTGCGCTGCATCACTGGGGCTCTTCAGTTAATTAA AGTCCATTACAGACAGGGGATGAACGACAGTAGAATTCCAAGGCAAATTC CTGGATTTCCAATACCAAAGCAATTGAAACGCCTGTCTGGATTTCTATAG TAATATAAAATCATTTTTTTGGTTGCAAAATTTGGAATTTATATATACTG TATTTTTTCTGACTGAGCTTTGATTTGATGCTCTTTTGCCGGTATTTGCA GGTGAGGACTGTGCTATTTTTTTAGTTCAATATTCAATGAGGTTGGAACT TCGATATTTGAGGATTACGATTTTACCAGCTTTTTAGCCATTTTTGCCAC GCCTAAACCCAAATCTTGCAACCTTTTACCTAGAGTAGAGGAAGATCGTA AATTTTTCATCTTCAAGAGTTGATTTTCAACAACAATATATATACCGTCA ACTGCTCTTCTAACTTGGGACTATCTAACAAAACATGGGACCAGGGAGGT CAAGCAATTAGTTAATACACAACACCTATGACACTTAATACCGTGGTGGG TCCTTTTCTGAAATTAGCAAAATGCAGTTAATACACCAGTGTATTAACTG TCAAAGGGGGTGGTGTTAAGACAATTTTAGAACTCAAAATTGTATTAAAT GTCCATAGTTATAGTTCATTATGTTTGATATTTAGAGGGATACTCTTTTG AGATTTATTGGAGTAGTATTTAGTATTTGTTTGCATTAATTGTTTGAGGA ACACTTTTGAATAAGAACCTGTAAGAACAACAAATCATTCTTGATATTTG AAGCTTCTGAATTGAACTGAGAATTTTCTGATGCTATAGCAGGCTGTAGG ACACTGTTATACACTTTGTTTTTATTATATTCTATCAAAGTTAGTTTTAT CTAGTTTCATTACTGTTACCTATTTACGTAACGATCTTGAAACTTTTCCC AAGTTTTATTCAGTTAAAAGATGACATAAAACCAAAACAAATTCCATGAC TCTTCATATTATGGCCTATTATGGGTTCAAGATTTTGTAAGCGGCCTACC AGACCATAGTTTGGCACTTCAAAACTAAGCAACCATGCAACTGGAAAACC TCAAAATCTTTTTCATTTTACTCAAAATCTAAAAATTTTAACTGCCAGAC AGTTACCTAAGCAATGTAGGCACCCTGACTTACAAAAACTTAATTTAAAT TTTCTAATGACATAAATCTGTGACATAAGTAGTCTCAAAACAGTTAAAAC CTCTTGTATTGCATCAAATTAACGAGAAAATACGGTTGAGAGAGCAGTTA ATACACATAGTGTTGTGTATTGTTATGTATTAACTGCTTGCCCCTTGTTA TAAAGCAATAAAAAATGAAACTTTTCCATTTCGCACCAATTCTTCAAAAT AAAAATATTCAAGATTTTAAGTTCTTCTTTTATTCAATGATTTTATGCAG CACTTTGTAGACTTTTCCTTCCACTTTCTTCAGATGATTGAAGATGAGAA ATAGTCTTAGGACCTTAGGATTGCGGATTGAAACAAATAGAAATCACGGA TTGAAACAAATAAAAGAGGTGTTATGAAGGGTGAGATTTTAAAGCTGTCT CTCGTGCAAGGCACTGAAAGGCCACAGGCATAAAAAAGAAGGGCCGTGTG AAATGTGGCAATGTTATTGGTTGACATAAAAACAAACAGTCTGCGAAGGA GCGCCACAAAGCAATCAGTAGAAGAGACCAGATTGTTGCAGATTTAGATA TAAACTTCTCACAGGGATTACTTGTCAATGTGTTGTGTCAATTTGTCAGC ATTATATTGTTGTAAATGGAAAGTTTAAAGAGGTAAGACTAGCCTAGTTT CTAATGATAATGATATTTTATTCTTCTCTCTGGAAATGTGGCTAGGTGAC AACATAAAAAAATCTCACCTGGTCACCCGAAAAACTTTTTTTCTTTTTTA TATACATGATATTATACTCTTTAAACACAAAAGAGGTCTTAAAATTGTTT ATACTTATTTGTCAGAAATCTTCAGTTTAAAACTAGATAATTAGATAATT AGTGTATTAGTTCAACCTTTTCTTTTGCCCATGGTGAAAAGTTTTGACAT CGGTAGTACGCATTTCCTCACCAGACACATGTGGGTAGAATGCTTCTAAG AGCTAGAATTTCTAAAGTTGTCAGTATTATTTGAAAGATGTTTTCCTAAT ACCTATTTTTTTCAACCTGAGATGATTCTCCAATGTGATGGTTGATTCTT ATTCTTTAGATTCTTTCATTCTTATTATTTGGGATTTTCTAGTAAGCATG AATTGAATGAAAACAAGAAAAACAAGAGTTAAATTTTTACAAAAAGATGA AAAAATATTTGGGTGTTCTAGTTTGGGTTTTTATCCTATATACCCTTTAA TCCATTTGATCCATTGTATTCTCTTTTTTTTGTCTTTGATGAAAGTTTTC ATCAGCGTAGGTTCAATCAGTACCTAAATAGTTTTATCAGAGCCAATATT CTTGGAATAGTAATCACTAAACCCAGTATACCTCCCTAATTTAAATCTGA TAGTGTTATTTTAGAGTTTGAAAAGCATTTTTGCTATGGATAAAGTTCTC TGGTTTTTTATTAGAAAGGGAATATCCATTAGAGCCAGGGAAAATTAATT TCAGTCAAATGTCAGGTAAGATAATTTTGAAGAAAAGCAGGGAATAATGT CTTTACCCTCAGATAATTATAATATATTATGCTTTCATCTTTTGTATCCA GCTTCTTTCATAAGGTCAGGCTAGCCTTTACTCTATACTTATGGCAGAGG GCTAACTAAAACAATTTCCTTGTAGCAAATTAACATGTATAAAAAGGTGC CCAATATTGAGCTTCCTTTAAGTCATCAAAATAATGAATTATTGACATGG TGTCGTGTCATTTTACTTCCTTATGCTTTGTTATGGAAAGATAATTAAGT GGCTAAATGATCTAAATTAACATTTTTCATTGTTGTTTAATTAGTTAAGA GAAAAATTAATATAAGGATCATCGTTTTGTTACTTTTTTGAGTGGGTTAT GATTAAAAAGACACTAGGCTTGATAGATAGACTTTTTTCTTTATCAATGA AAGTTTCAAGTTGAATTTTTTAATAAGCTGTGTCAACATGCTGCATTATA TTCATTTTACACATGTGAATTCGAATGAAGACTTTCTTGTGCAAATATTA TACAATATTTTAGCGTTAATTTAATATTGCTATGTTGAAAAATTCAAAGC TTCGATTTCGCAAGTTTTTTCTTTTTACAGTTTAATCCTTATCTTTTCAT TTTTGATGTCGATGTTAGAAATCCACGTGAACAGTGTTAAATAAAGTTGA AGAAGAAATTTCTTGTTTAAAGTAAAGTATGTTTCATTCAAGATTACTTC AAAGGCAAGTCAGGTGAATCGTTCGGTCGTAACATTTTGTAATACTGTAG TATTTTTAAGTACACGTTTTCTTTTTTATAAGAACATTCAAAAATCTTTG AAGCCTTAGGATGTTCTTAACTTTTTGAGTTTCAAGCCTAAAAATGTTTT TAACATGTTCTTATTTTCCCATTTTGTGGGTATTTTTGTCAATTTTCCGA AAAAGTTGGCTATTTTCGAATCTGCGAAGCCTTAAGATGTTCTTAACTTG TTCTTAACATTTTGGCCATCAAAGCCTTTCGTTCTTATATAGTTTGCTCT TATAAAAAACGTGTAAGATTAGCGAGTGCCAGATTTAAATGATTATTCTG CTTTGATGCAATTCTTAGTTTGACCTCGATTATGTCATGTCTTGATGATT TTTTATTCGATCATTGATCTTGGATATTCTACAGAAAAGCAGACGATTCA ATTTTTAAATCCTTCAATGTTTAATTTTCTAGCAAAAAAAAAATGAGACA GAAAATAAATTCAATATTACTGACATGTCTATTGGTGATATGCTTAATAC AAACTGTTCATGGAATTGTTGAAGGTATCTACTGTGGCAAAGAAAACTGT TATGATGTGCTAGGAGTTAACAGGGAGACGACTACCAAGAAAGAAATCTC AAGGGCGTACCGTAAATTAGCCCGGAAGTTCCATCCGGATACTTCTAAAG AAGAAGATGCGGCTGTGAAGTTTCGTAAAGTTGCAACGGCTTATGAAATA TTGAAGGAAGATGATTCAAGGAAAGATTATGACTACATGTTGGACAACCC TGAAGAAGCCTACTACCATTACTACCAATACTACCGTCGCCGATTGACAC CAAAGGTCGATGTCCGTTATGTTCTCTTCGTTACCATCACCATTATCTCC ATAATCCAATATCTCCATAAGGCAAACCGATACGAAGATGCCATCTCTTA TGCTATGCAGAATCCGAAATTCCGGAACCAAGCCATGCAGATTATTCATC AAGAGGGGCTTTTGGAGCACAACAAAAAATCTTCAAAGAACAAGAAGAGC AAGGAGGACCGGAAGAAAGAAGAAGAACGTGTTTTAAGAGAAGTCGTTGA AGATTCCATTGATATCCGTGGTGGCTATAGTAAACCAACTTATAGAGACA TCTTATGGGTAAGCTTGTTTTTACGTCCTATGCCATACTTTTCGAATTGT TTATTCTTAAGAATTTTCATTGACACTATATATTTCAAAATTTAGCTCAA GGATATTTGGTATGCAGTCTTCTTTCTAAGCTCTATACCTTTCGTACCTT GCTTGATCTCATACTCGGTTATTCCACGAGGTATCATAGAACAACTGCAA CCTCCTTGAGTCTTAAATGTCCTTTTAAATTGCAAACTTACACTTTTTTT CGCCTACTAACGTTTAGTAGGCAAATTCCACTTCCCCATCCAACGATGTT ACTTTGTAGCTCATCAAAATGTTATTAAAGTGAATTAGTAGCAAACTTCT GTAGCTCACTGAGGTTGATATTGAAATTAACGAGTCGTTGTCATATTGCC TTGATCATTCCGTTATGAAGAGGTTTCCAACACAATACACAGGTTGCAAA ATTAAAAAAGTCTGAAGACAAATCACGCTTTTACTCGAAATTTTCATGTG CTTGTTATACATGACATTTATTTCTGATTGGTTCGAATTTATTGACACTA ATAAAGTTATCAGCTGTAAGTTGTAAAGCAAGCGACATGGGAATAAAATC ACGTGAACTTTTTCGAGTAATCGCATGTTTTGACTGCACTGATATAATTT TGCAACCCGTGTATTTGTCATTCTTCCAATAGGTTCAACTGTCATGTCTA CCTTACCAAACGTTTAATTACGTGAAATGGTACGCCTGTTGGGTTCTCAA GTTCAACATACGCAAAGAAGAATACGGGGAGGAAGAAAAAGAATACCTTA CGTACAGTGGCCTCAATATGACGGAACAATACTGGGCCGCCCTTGATGAA TACACACGAGAAGAAATCATGCACAAGGAATTATGGGTACCTGAGAAATT GAAAGCTTATAAAGAGGCTCAAGAAGAAGAAATGCGGGTTAAGATGGCGG AAAGCGGCCGCCATAAAATGTGGCGCCGCTATATGAAAAAAGGTGGACCA GGGCAAATGACTTTCGCAGAGGATTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000130_pilon:624733..636909-

>XLOC_007485 ID=XLOC_007485|Name=XLOC_007485|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2082bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:624733..636909- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTAACCAAAAGGTAAGAAGTTTAACCAAAAGGTAAGAAGCAAAAAAAAA
ATGAGACAGAAAATAAATTCAATATTACTGACATGTCTATTGGTGATATG
CTTAATACAAACTGTTCATGGAATTGTTGAAGGTATCTACTGTGGCAAAG
AAAACTGTTATGATGTGCTAGGAGTTAACAGGGAGACGACTACCAAGAAA
GAAATCTCAAGGGCGTACCGTAAATTAGCCCGGAAGTTCCATCCGGATAC
TTCTAAAGAAGAAGATGCGGCTGTGAAGTTTCGTAAAGTTGCAACGGCTT
ATGAAATATTGAAGGAAGATGATTCAAGGAAAGATTATGACTACATGTTG
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ATTGACACCAAAGGTCGATGTCCGTTATGTTCTCTTCGTTACCATCACCA
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ATCTCTTATGCTATGCAGAATCCGAAATTCCGGAACCAAGCCATGCAGAT
TATTCATCAAGAGGGGCTTTTGGAGCACAACAAAAAATCTTCAAAGAACA
AGAAGAGCAAGGAGGACCGGAAGAAAGAAGAAGAACGTGTTTTAAGAGAA
GTCGTTGAAGATTCCATTGATATCCGTGGTGGCTATAGTAAACCAACTTA
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TGTTGAAGGTATCTACTGTGGCAAAGAAAACTGTTATGATGTGCTAGGAG
TTAACAGGGAGACGACTACCAAGAAAGAAATCTCAAGGGCGTACCGTAAA
TTAGCCCGGAAGTTCCATCCGGATACTTCTAAAGAAGAAGATGCGGCTGT
GAAGTTTCGTAAAGTTGCAACGGCTTATGAAATATTGAAGGAAGATGATT
CAAGGAAAGATTATGACTACATGTTGGACAACCCTGAAGAAGCCTACTAC
CATTACTACCAATACTACCGTCGCCGATTGACACCAAAGGTCGATGTCCG
TTATGTTCTCTTCGTTACCATCACCATTATCTCCATAATCCAATATCTCC
ATAAGGCAAACCGATACGAAGATGCCATCTCTTATGCTATGCAGAATCCG
AAATTCCGGAACCAAGCCATGCAGATTATTCATCAAGAGGGGCTTTTGGA
GCACAACAAAAAATCTTCAAAGAACAAGAAGAGCAAGGAGGACCGGAAGA
AAGAAGAAGAACGTGTTTTAAGAGAAGTCGTTGAAGATTCCATTGATATC
CGTGGTGGCTATAGTAAACCAACTTATAGAGACATCTTATGGGTTCAACT
GTCATGTCTACCTTACCAAACGTTTAATTACGTGAAATGGTACGCCTGTT
GGGTTCTCAAGTTCAACATACGCAAAGAAGAATACGGGGAGGAAGAAAAA
GAATACCTTACGTACAGTGGCCTCAATATGACGGAACAATACTGGGCCGC
CCTTGATGAATACACACGAGAAGAAATCATGCACAAGGAATTATGGGTAC
CTGAGAAATTGAAAGCTTATAAAGAGGCTCAAGAAGAAGAAATGCGGGTT
AAGATGGCGGAAAGCGGCCGCCATAAAATGTGGCGCCGCTATATGAAAAA
AGGTGGACCAGGGCAAATGACTTTCGCAGAGGATTAAGTTCAACTGTCAT
GTCTACCTTACCAAACGTTTAATTACGTGAAATGGTACGCCTGTTGGGTT
CTCAAGTTCAACATACGCAAAGAAGAATACGGGGAGGAAGAAAAAGAATA
CCTTACGTACAGTGGCCTCAATATGACGGAACAATACTGGGCCGCCCTTG
ATGAATACACACGAGAAGAAATCATGCACAAGGAATTATGGGTACCTGAG
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GGCGGAAAGCGGCCGCCATAAAATGTGGCGCCGCTATATGAAAAAAGGTG
GACCAGGGCAAATGACTTTCGCAGAGGATTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_007485XLOC_007485-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000130_pilongenomesc0000130_pilon:624733..636909 -
Properties
Property NameValue
Aaloc697-1041:346
Aaloc22-696:1695
Aaloc1-18:12178