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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000263_pilon:255109..261323- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_006981 ID=XLOC_006981|Name=XLOC_006981|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6215bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000263_pilon:255109..261323- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAAAATAAAGGAAAAACAGAAGAAATGAAGGCACTAAAATCACGACA
CGGTACAGCCTCGATGATTCTTAAATGGACCTTGACTATCTTATTTTCAA
CTGTTGTAAGGTGGCTGTTGATTTATTTTGATTTTGGTGAAGTCTTCAAA
CGAAGGGTGGAGATATCAAGCCCCATAACATCTTGGTTCAGAGGTAATCA
ACTTTTCATTTCAAATTTCTAAGGGCCGAAATCTTTGAAGTCTTTGAAAT
CTTTGAAATCTTTGAAACTGCAACCCTAATGAACTACAATAACAAGTTTG
AGTTAGGAGAAGAGTTCATTAAAATAATTTCTCGATTTTTTTTAAAAACC
CCCCGGGGGGTACTAGGGTTGGCGAATGAGGGGTATGTGCGGACGAGACC
TCCGAAAACCGACCCTTAGAGAGACTGATTTTTAATGAAAAGGTGACCCT
TAGAGAAAATTTTTGAATTTTTTTTTTCGATTTTTGAAAAAAGTCATACC
CTTAGAGAGACTTTATTACAATTTTTTTCTGGAAATCAAAAAATTTCCTA
AAAATCCTGAATTTTCTTACCCTGAGAGAGACTAATTTAAAACTTTCTGA
TTTTTCCGACCCTTAGAGAGACTTTGAAAGGTGAAAAAACCGACCCTTAC
CGTCCGCACATACCCATCATCCATTTTTGCCTAAGTGCCCCTCCCCCCGG
GTAAAAACCCATTTAAATTGCCTTGGAAATTAAACATTTTTTAAAAATTC
CTACAGTACTCAATGAAAAATGGAAGCTTTTTAATATGATCTGCCAAAAC
TTCTTACGCAATTGAACAAATAAATTAAATTGTTTTGTAATTATGCTAAA
TTCCATAGAGAAGTTTTGAGTATTTTAATTTATATTCCACATTATGTAAG
TTTTGGCACAGTAATAATAATTTGGCAGACGTCGAACATGACTATGCCCT
TCTCTGCATCGGACCTTCATTGTATGATTCTGACGTCATCCGAGATGCAC
TGCAAAGATCTACACAAATGCCAAAATTTATATTCTAACCGATGTGAAGG
TTTAGTTAAAATCACTTTAGCGGCGATTTTTGTCGATTATGTAATGGTCT
GGAAGGGTGCGGGTGTTTGAAGCCAATTTTTCGTTGTATATACCCTTGGT
CAGCAAACCTAGAACTGAGAGAAACAATGCAACGATTTTTCAAGCTATAA
CCTTCAGATTTTACACATGGGCAAATTTAATATGAAAATATTTTAATGGC
GATGGGGATGAAATTCTATAGAAGTGGTATTTTTTTTCGTTTTAGTTGAA
GAATGTATCACGTTGTCACAGTTGGGACTTTCACCGTACTCTGGAGATGT
GTGTCATCAGGTTTGTTGCCAACTTTTTCCAGTGCACTTCACTTCGTTCG
AAGTACTATCAGTTTAATTTAATGTAAATCTAGTCATTCAATAATATGTT
TTTTCATTTATAGCCACCACTGATCGTAGAGATGTTCAAGTTACTTCCAT
CAAAGTGGACTGTCCCCTTCTTTGTGGTGAGAACATTTAAAAAATAAATT
TTTGTGTTTTGAAAAGCACTCTTCATTTTCAAAGAAAAAGTCAATAAGAA
AGTTCACGATAAAGATTGAAGGACGTCTTTTGAGAAGGTGACAGATGAAT
CGACCAATGCGTGGATGTGTCTTCCCTTTTTGTTCGAAAATCTCATAACC
GATATTATTTGTATCAAATGCCTTCATAGATGGCTGATTTAGCAACTGGA
ATCATGTTGTCCAAGTTGTGTCAATGTTATACTGCTTCTCAGGTACGCTC
TTATTTATTATTTATTCGCCCGTATTATTATGCAATACCATCCTTCCTGG
AATTCTTTCCTATTTAAATCGATTAAATTTCCTGGTACACAAAATGGCTA
TTCATTAATAAGTTTTAATTTAATTCATGGCCTTTTTCAGCTTTCAGCAC
AAGATTCCGAGAAGAAGGAGTATGCCGCAGACACAAAGAGTATTTGGATC
AAAGAGAATTCTATTGTTCACTTTATTGTTTTAAATTTGTAAGTCTCCGT
CTGTCATTGGTCAAGTTTCAGCTGATTTAAATATTTCAATTATACTTGTA
ATGAAGAAAGGTGTTGTTGAACTACGTTATATTTGGGTTGAATTATAACT
AACTTAGGCATGGTGCGGCGGCGGCGATATCGGACGAAAATTTAGAAAAC
GAAAGTACTTGATACGGTGGACGAACTCATAAAAATCAATTTACAAATTA
CACGCTCGTATAACCACGGAAGATCTTCGCAGGTTTTCTTTGGATTACGT
CATTATATCTTTGTGTCTTTAGCTTCACAGTTTTGATTTTTCTTTATTTT
CTTATAAGCATATACTTTATAAGAATCAAATCAATAACTCTTGATAGACG
GTGATATACCTTTCGGTAATTAGTTCTTACAAAGTAAACAAGGGATGGGG
CACAATATGAGCATATATATTTTCTTATAAGCATATACTTTATAAGAATC
AAATCAATAACTCTTGATAGACGGTGATATACCTTTCGGTAATTAGTTCT
TACGAAGTGAACAAGGGATGGGGCACAATATGAGCATATTCGTTTTTCTT
ATAAGCATATACTTTATAAGAATCAAATCACTAAGTCTTGATAGACGGTG
ATATACCTTCCGGTAATAAGTTCTTACAAAGTAAACAAGGGACGGCGCAC
AATATGAGCATATTTATTTTTTACAAGCATTTACTCTATGAGAGTTTTTA
AAAATTAAACAACAATTGTTCTTAAATTGGTATTATTTTTTTAGCGATTT
TAAGCCTCGTTGTTCTTGTTGTAAAATTGTTTCATTAAGGCTCGATGTAA
AGTAGATTTCAGATTAGCTTCATCTACTTCTTGTTTTTCCCATGTAGTTC
AAATTCTAGGTGAAATTTTCGACTTCAAGTCGTCTTGTTTATTTTGCAGA
CTTGTAAGGTCGTTAGCTGAAAGATTTGTTAATAATATTGCTTCCACCTT
TCCTTTCCAGATATCTGCTAAATCCATTCACCATTTTGACTTGCGTGGCC
CAATCTACAAATGTTATTAACAATTTTGTCATTTCACTCTTATTGTTTTC
CATGTCTAAAGGTATTCATTCATCCTCCAATTTTGTAGAAAATAATCTCT
TTTACTGAATCTATGTATATCCTGTCTGTGAGCCTCACACATTGAATTTC
TGGACCTACCTAGAGGTCCTCCTATAAATTAACCGCTGTCCGTTCGTCCG
TCCGTCCGTTCGTCTGTTACCAGCTTTTCTCGAGATTGGCTCATTAGTTT
TTCTGATTTTTGGCACAAAGATGCAAAATGGCAATGCCCAAAATGTGACG
GAGTCCGATTTTCGGGCCGAAAATGTCCGAAAAACTGTTTTTTGGCATTT
TCTCGAGATTTTATCATTAATTCTTTCTGATTGTTTGCTCAAAGATGCGT
ATTAGCAATGCCGAAAACATTGCCGAGTCCGATTTTTGAGAAAATTTTTT
TTTCCGGCCGAAAATGCTGGAAATCGCCGTTTTTCTGGATTTTCATTGGA
CTTTTTCCTTATAATTGGTTGTTTTTTCATTCAAAAACATTATTAATAGC
AATGTCCACCATCAAGTATGCTTCAATTTTCAATTATATTGATTTTTGAA
GCCGGAACTATTTAAAAATCGCCGGAACGACCTATTTTCGCCGGAAAGAC
AGTATTTCTTGAATTTCTTCAGCTGTACTTCATATTTTTTTATGAAATTT
TGCACGCTGAAGCAAAATAACAATACCTAAAATGTGACGGAGCCCGATTT
TTTTTCCGGCCGAAAATGCCGGAAATATGCCGGAAAAACCGGTTTTTTGA
CATTTTCTCGAATTTTCATCCAACATCTAGCTTGCTACATTTAGTGTACA
ATCAAAACTTTTTCATTCGATTTAATAGGTTGCAAAACATCAAATGCTAT
ACTTCCGTAATACTACGCCTTTTCAAAGAATAAAAATTCGGCTGATGGTG
AACATTATTCCCATCATTTCTTTATTATTTCAAAACTTTATTTTGCTTTA
AGTCACCGAAACAAGTCGTGCGTATCACAAAGTTATTGCTTCAAAAATAA
TGAATATCGATATCTAAAAACAGAATTTTCACTTTTCAGGATATTGGTCA
ATGGCGAGCATTTGTGTTGCTTTTGTTTCATACATCTCACTTTATCCAAT
CATGCTCATTGTTCCTGTCATTCTCTCCGTGAAAAAGGTGAGAGGGAAAA
AAGGATTTTTTATTCTGGTGAACAGTTAAAGCATGATGATAAACTTTTGA
GACTTTGTTTTCATTCAGTCAAATTCAGTCATCAAAGCACACCAACAGAT
AACATCTTATTTCTTATCAACCTTTCTCGGTTAATGATTGATAGTCAACC
TTTGAAAAAAAACATTGTCTCAGATGGCTTTTTCTCAAGTGAAATATTTG
ATGCTCCTCTATTATGTCAAAATAAAAGTCCATTACTCTAGCTTGATATT
ATACCTTATTCGACGTAAGTCACGATCAATTTCTTTTTTGTTTCAGGGAG
CTAATGGTAATATGTTGAAGATATTTGCGTGTCTGACTTGGTTTTTCCTG
ACATTGTTTGCTTTATTGTATGGTTCGTATGTAGTAAATCATTCATGGGA
CTATATCGATGCTGTATATGGCTTTATGTGAGTTTTTCAATGTTCTAATG
CTGCGTTCTAAAGGTGCAGCAGTTATCATAACTGACTGTATTGTACTAGC
CTTGCTCGATCTATTTCAACCTGTATAAACCATCACGTAGATGGTTCAAC
TCTTAGACTGCTCTCAGCCATCATCAATAAAGAGAAGCCGGTCATTATCA
GAGTTCTAAAGCTAGAAGGTATCATTTCCTAGCCATATTCTAATTTAAGA
TATCTTGAATTATGAAGTACAACATTTTTTTTTTGTTTGGACAGATTGCA
AGCACCTGATTTGACGCCAAACATGGGCTTGTTTTGGTACTTCTTCTTAG
AAATGTTCGATCACTTTCGATTGTTCTTTCTTGTGGTGTATCAAATCAAT
GTCTTCATCTATGCCATCCCTCTTGCTATCGTATTCAGGTGGGTCTTCTT
TTCCTTTTCCTGCCTTTCAATTATGAAAGTGTCATATAGTGTCCCTTTTT
TCGAATTTTTTTTTTGACCCTTGTAGAAACTATTTTGACTTTTTGTTGTT
TTTGTAGTAACACTTGGAGTGACATTTATTTAGGGACATACCATGCCTCC
CTGGGTATTTTTACAGCTAGCAATGATGAGTAACAGTCTTCATTTTTTCA
TTCCAGAAATCGACCCATGATTTTATCATACGCTTTGCTGTCTTTGATGG
TTCTATTTCAATCCTATTCAAACATGGGAAATTTATCGCTGCCCTTCGCG
TTGATCCCTCTGTGGAGTCATCTTTATCCATGTAAGCTTTCTTATCAACC
TTTCAGTTTTTTTAACAATACCTCAATTGCTTTTCGTGGAGTATACACAC
AATAGATTTGCGGCACTCGATCCTTATGCTAATAATGATCAGATATTTTT
TCACCAGACTAGTTCCCAATCAACTAGAATGGATGTTGATAATGATTTTT
CAACTTTGTAAAGAATTCCTTCTGAAAATTTTAATGACAGTCAAAGTATA
ATATACATGCTCGCTCTCTCCTTTTCAGACATGCGTAACTTTCTGTTGAT
AGCCGGTATGTTTTTCTTCACTTCACTGTTGGCCCCTTCCATGTGGTATT
TGTGGATTTATGCTGGCATGGGAAACGCTAACTTCTTTTATGCAGTGACA
CTCGCCTACAACACTGCTCAGGTATTAAATGATAATACCTGATAAGTTTT
TCCGGTTTGCTATGTTAGGGTAGAAGAGGCGCCTGGATATGCTTTAAAAT
GAATTCTGATTTTACCGTTAAGTTCTTAAAGAAAGTAACTGGATCCGAGA
GAGCCAATTCTGTTGAGCTAAGACAGAGATCAACGATCGAGCGTTTTTTT
AAAGATATAGTGCGTACAGCACTATTTTGGTGAAATATTACATACTCTGG
AATAATGGAAGGCCGGCACCACCAAGCTTATAATTTTGGATTCGTTTCCA
GGTGTTTCTACTGTCGGATGTGCTGTATGCATTTCTACGTCATCGATTTC
ACTTGAAGAACGGCCTCTCACCGAAGACCAAAGATGGAAAAGAAGGGATT
GTCATCATGAAGTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000263_pilon:255109..261323- >XLOC_006981 ID=XLOC_006981|Name=XLOC_006981|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2676bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000263_pilon:255109..261323- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAAAATAAAGGAAAAACAGAAGAAATGAAGGCACTAAAATCACGACA
CGGTACAGCCTCGATGATTCTTAAATGGACCTTGACTATCTTATTTTCAA
CTGTTGTAAGGTGGCTGTTGATTTATTTTGATTTTGGTGAAGTCTTCAAA
CGAAGGGTGGAGATATCAAGCCCCATAACATCTTGGTTCAGAGATGAAAA
ATAAAGGAAAAACAGAAGAAATGAAGGCACTAAAATCACGACACGGTACA
GCCTCGATGATTCTTAAATGGACCTTGACTATCTTATTTTCAACTGTTGT
AAGGTGGCTGTTGATTTATTTTGATTTTGGTGAAGTCTTCAAACGAAGGG
TGGAGATATCAAGCCCCATAACATCTTGGTTCAGAGTTGAAGAATGTATC
ACGTTGTCACAGTTGGGACTTTCACCGTACTCTGGAGATGTGTGTCATCA
GTTGAAGAATGTATCACGTTGTCACAGTTGGGACTTTCACCGTACTCTGG
AGATGTGTGTCATCAGCCACCACTGATCGTAGAGATGTTCAAGTTACTTC
CATCAAAGTGGACTGTCCCCTTCTTTGTGCCACCACTGATCGTAGAGATG
TTCAAGTTACTTCCATCAAAGTGGACTGTCCCCTTCTTTGTGATGGCTGA
TTTAGCAACTGGAATCATGTTGTCCAAGTTGTGTCAATGTTATACTGCTT
CTCAGATGGCTGATTTAGCAACTGGAATCATGTTGTCCAAGTTGTGTCAA
TGTTATACTGCTTCTCAGCTTTCAGCACAAGATTCCGAGAAGAAGGAGTA
TGCCGCAGACACAAAGAGTATTTGGATCAAAGAGAATTCTATTGTTCACT
TTATTGTTTTAAATTTCTTTCAGCACAAGATTCCGAGAAGAAGGAGTATG
CCGCAGACACAAAGAGTATTTGGATCAAAGAGAATTCTATTGTTCACTTT
ATTGTTTTAAATTTATATCTGCTAAATCCATTCACCATTTTGACTTGCGT
GGCCCAATCTACAAATGTTATTAACAATTTTGTCATTTCACTCTTATTGT
TTTCCATGTCTAAAGATATCTGCTAAATCCATTCACCATTTTGACTTGCG
TGGCCCAATCTACAAATGTTATTAACAATTTTGTCATTTCACTCTTATTG
TTTTCCATGTCTAAAGGATATTGGTCAATGGCGAGCATTTGTGTTGCTTT
TGTTTCATACATCTCACTTTATCCAATCATGCTCATTGTTCCTGTCATTC
TCTCCGTGAAAAAGGATATTGGTCAATGGCGAGCATTTGTGTTGCTTTTG
TTTCATACATCTCACTTTATCCAATCATGCTCATTGTTCCTGTCATTCTC
TCCGTGAAAAAGGGAGCTAATGGTAATATGTTGAAGATATTTGCGTGTCT
GACTTGGTTTTTCCTGACATTGTTTGCTTTATTGTATGGTTCGTATGTAG
TAAATCATTCATGGGACTATATCGATGCTGTATATGGCTTTATGGAGCTA
ATGGTAATATGTTGAAGATATTTGCGTGTCTGACTTGGTTTTTCCTGACA
TTGTTTGCTTTATTGTATGGTTCGTATGTAGTAAATCATTCATGGGACTA
TATCGATGCTGTATATGGCTTTATATTGCAAGCACCTGATTTGACGCCAA
ACATGGGCTTGTTTTGGTACTTCTTCTTAGAAATGTTCGATCACTTTCGA
TTGTTCTTTCTTGTGGTGTATCAAATCAATGTCTTCATCTATGCCATCCC
TCTTGCTATCGTATTCAGATTGCAAGCACCTGATTTGACGCCAAACATGG
GCTTGTTTTGGTACTTCTTCTTAGAAATGTTCGATCACTTTCGATTGTTC
TTTCTTGTGGTGTATCAAATCAATGTCTTCATCTATGCCATCCCTCTTGC
TATCGTATTCAGAAATCGACCCATGATTTTATCATACGCTTTGCTGTCTT
TGATGGTTCTATTTCAATCCTATTCAAACATGGGAAATTTATCGCTGCCC
TTCGCGTTGATCCCTCTGTGGAGTCATCTTTATCCATAAATCGACCCATG
ATTTTATCATACGCTTTGCTGTCTTTGATGGTTCTATTTCAATCCTATTC
AAACATGGGAAATTTATCGCTGCCCTTCGCGTTGATCCCTCTGTGGAGTC
ATCTTTATCCATACATGCGTAACTTTCTGTTGATAGCCGGTATGTTTTTC
TTCACTTCACTGTTGGCCCCTTCCATGTGGTATTTGTGGATTTATGCTGG
CATGGGAAACGCTAACTTCTTTTATGCAGTGACACTCGCCTACAACACTG
CTCAGACATGCGTAACTTTCTGTTGATAGCCGGTATGTTTTTCTTCACTT
CACTGTTGGCCCCTTCCATGTGGTATTTGTGGATTTATGCTGGCATGGGA
AACGCTAACTTCTTTTATGCAGTGACACTCGCCTACAACACTGCTCAGGT
GTTTCTACTGTCGGATGTGCTGTATGCATTTCTACGTCATCGATTTCACT
TGAAGAACGGCCTCTCACCGAAGACCAAAGATGGAAAAGAAGGGATTGTC
ATCATGAAGTGAGTGTTTCTACTGTCGGATGTGCTGTATGCATTTCTACG
TCATCGATTTCACTTGAAGAACGGCCTCTCACCGAAGACCAAAGATGGAA
AAGAAGGGATTGTCATCATGAAGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000263_pilon | genome | sc0000263_pilon:255109..261323 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1225-1338:115 |
| Aaloc | 1084-1224:536 |
| Aaloc | 958-1080:909 |
| Aaloc | 814-954:1271 |
| Aaloc | 682-810:1670 |
| Aaloc | 586-681:2075 |
| Aaloc | 484-582:3205 |
| Aaloc | 385-480:4276 |
| Aaloc | 322-384:4487 |
| Aaloc | 259-321:4753 |
| Aaloc | 196-258:4919 |
| Aaloc | 1-192:6216 |
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