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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000067_pilon:1252361..1257132+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_006748 ID=XLOC_006748|Name=XLOC_006748|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4772bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000067_pilon:1252361..1257132+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTTCTCAGCCCTCAACTAAGATATCGATGTCAGAAATGAATACTGG
TCAACGAATATTGAGGTATTTGATCATCAAGAAAGAGAATCTAAAAAGAA
TACTGTTCTTTGGTTTGGATATCTTGAAGAATACAAGTGTAGCTTCACCA
AATATTGCTCGTAAACATTTTAACCTCTCCAAATATGGTCATTGCTGTAA
ACTGGTCTTTCCAGAACGTCTAAATGGTACAGCAGTAAACGTAACAGAAT
CTTACTTTTATGATATGAAAGGGTTATTTTATGTTGTTTGTATTCAATTA
TTATAATTTCAAAGAGCAAATTGCGATTGTCAGGAGTTGTTTTGAGGAAT
GGTCAGCTATGGATATCACAGACAAGTtaccacaatttttgaaaattgat
atgGGGGATATATTGAATGAGAAGTTTGAACCTGAAGTTATTGGTGAAAA
CCGAACTATTTGCTGCTGTAAATGTATTGACAAACCAGGACAAACAACAT
AGTGATTTTCTTCTACAGGATGGTCAACCTGCATTAAATGCCAAGGAGGC
GATCATTTCTGATAAGTCCCATATATCCAAACATGTATTAATACCAACAT
TGGAAGACCTCAACAAAAGTGTATTTGAAATACCAGGAAAATCTCGCAGT
GATTCATTTAGCCGTAAACAAGGCAACATTCAGCCAGCAGAATATAcacc
agatttaattttaaagaagaataACCAAGAAATGTGGAAGAAACTTGATG
AAGTGATGCTCACTAGAAGTACACAGACATCTATTGCAACAAAGGATGCC
CACATTCAAACTGAATCTGATATTAAGATCTCGAAACCATTGGCTATGAG
CATGGCTACACAAAcagaaaacaagaaaagaaaattacagACAATACCTA
CCTTGGATTCCAACAACCACCATCAGAGTTCACTCAATCTTCTAGAATCC
ATGTCTAACATATTGCAAGAATATGTCAGTAAATATCTAGAcgatatttt
cttcttcaaagtgTACAGTCTAGTTGATTCCTTTCTCTATCTACTCAAGG
ATGAACTTAACCTGGTTATTTCCACAACCACAGGGATTTTCCCTTTTCAT
TTAATGCTGGATTATGCTAATATCAAGAAATCAAATATCCCAAAGAACCT
TCATAGTAACTTGAACCTCTATTACCAGGATGGCTTATTGAATTTGTTCA
GCAAATGGCTTGGCATGCAGTTCTGTAACTTTAGATCCACCATTTCCAAC
CAAATTGGTgaatataaaaaattgttaattCAGAGTAACCAATTTTTACC
ACctgctttaaaagttttgaacgaAGAAAAATTATTCCCAATTTGTATGG
TCATGTTTTTGAACCATTGGTTGAATAAGAGACTTGAGGATGAGGAGTTT
CaatattctaaaattttgttggttttgGAATTGATGAATGATGAATTGTT
AACAGGTGTTGGTCACGTGGTCTATGCTAAGTTAAAAAGTATTCGATCGA
TGTGATCATTTTGCATCACGTTTCATTGTAATTATACCTACTTTGTACAG
acaagtttttcaaatatttttggacctacctaaggtagtcctttaaatta
acccttgtccgttcgttcgttcgttcgttcgtctgttcgtctgttgccag
cttttctcgggattggctcattagttttttctaattttttgcacaatgat
gcaaaatggcaatgcccaaaatgtgacggagcacgattttcgaaaaaaaa
atttttccggccaaaaatggcggaaatatgctggaaaaactggtttttcg
gcattttctcgagatttcatcattagttttttctgattttttgctcaaag
atgcgtatcaacaatgcccaaaacatagcctagtccgatttttgagaaaa
aaatttttccggccgaaaatgccggaaatcgccgtttttctggattttcc
ttagacttttccttataattggttgttttttcattcaaaaagattattaa
tagcaatgcccaccatcaagcatgtttcaattttcaataaaattgatatt
tgaagccggaactttctaaaaatcgccggaacagccgattttcgccggaa
aaacggtatttcttgaatttcttgagctgtactttatattttttcatgaa
attttgcacactgatgcaaaatgtcaatacctaaattgtgacggagcccg
attttcgaaaaaattcatttccggcaaGGATTGTAAATTCACATTCTTTG
CTTAATataatatacaaaatatttagtCAATTATGATGTATCGGATGGAA
ATATGTAGCATTTTaacagagatttcatttccataagggtggatgtaaac
aaatctcagactgaaatgattttgtttttccaggaatattcacagaatac
tatcacttcaaaaaaatttgggtccatgtctattgtcattttagagcaat
ttttattcaaaaacggggtttttgcttgaaacgttgtattttagccagtt
ttaacacatatttcaattccataatggcggatatacccaaatcctaaacc
caaacaattttgatttccctggagtatttccagaagactatcactgcaaa
aagattttaggttcatgtctattgccatttttaagattttttgagtcaaa
aattggatttttgattgaaatattgcgttttagcaggaatttccattcca
aaatggtggatatacccaaatcccaagcccagatgactttgattttcctg
tagtatttccagaatactttcactgcaagaaaatttggactcatgtctat
tgacattttagagattttttcagtccaaatttgggtttttggcctgaaaa
atggctattagcagggattttatttccataatggcggacatagacccATC
CCAGacgcaaatgattttgatttccctggagtatctccagtatactatca
ctgcaaaaaaaatttcagtcagcatttaaactcagtttgtagaagcttgc
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gatttttgaagacgccattatgattttttgaaaaaagtgaaaaacttgaa
attcattttgcttaaagactttattgaagacttccatctctggaAATTTG
AGGCATGTGAATCGataagtttaaagtttatgagcttgcaaaattggcct
taaaaagcattttgctacccaaaattggcttaaaacggctcttttagggc
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aaaaaacactacatcttgaattttctgactttgacatttgacgccccacc
ctaGTTGTATTCAATTATTATAATTTCAAAGAGCAAATTGCGATTGTCAG
GAGTTGTTTTGAGGAATGGTCAGCTATGGATATCACAGACAAGTtaccac
aatttttgaaaattgatatgGGGGATATATTGAATGAGAAGTTTGAACCT
GAAGTTATTGGTGAAAACCGAACTATTTGCTGCTGTAAATGTATTGACAA
ACCAGGACAAACAACATAGTGATTTTCTTCTACAGGATGGTCAACCTGCA
TTAAATGCCAAGGAGGCGATCATTTCTGATAAGTCCCATATATCCAAACA
TGTATTAATACCAACATTGGAAGACCTCAACAAAAGTGTATTTGAAATAC
CAGGAAAATCTCGCAGTGATTCATTTAGCCGTAAACAAGGCAACATTCAG
CCAGCAGAATATAcaccagatttaattttaaagaagaataACCAAGAAAT
GTGGAAGAAACTTGATGAAGTGATGCTCACTAGAAGTACACAGACATCTA
TTGCAACAAAGGATGCCCACATTCAAACTGAATCTGATATTAAGATCTCG
AAACCATTGGCTATGAGCATGGCTACACAAAcagaaaacaagaaaagaaa
attacagACAATACCTACCTTGGATTCCAACAACCACCATCAGAGTTCAC
TCAATCTTCTAGAATCCATGTCTAACATATTGCAAGAATATGTCAGTAAA
TATCTAGAcgatattttcttcttcaaagtgTACAGTCTAGTTGATTCCTT
TCTCTATCTACTCAAGGATGAACTTAACCTGGTTATTTCCACAACCACAG
GGATTTTCCCTTTTCATTTAATGCTGGATTATGCTAATATCAAGAAATCA
AATATCCCAAAGAACCTTCATAGTAACTTGAACCTCTATTACCAGGATGG
CTTATTGAATTTGTTCAGCAAATGGCTTGGCATGCAGTTCTGTAACTTTA
GATCCACCATTTCCAACCAAATTGGTgaatataaaaaattgttaattCAG
AGTAACCAATTTTTACCACctgctttaaaagttttgaacgaAGAAAAATT
ATTCCCAATTTGTATGGTCATGTTTTTGAACCATTGGTTGAATAAGAGAC
TTGAGGATGAGGAGTTTCaatattctaaaattttgttggttttgGAATTG
ATGAATGATGAATTGTTAACAGGTGTTGGTCACGTGGTCTATGCTAAGTT
AAAAAGTATTCGATCGATGTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000067_pilon:1252361..1257132+ >XLOC_006748 ID=XLOC_006748|Name=XLOC_006748|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3154bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000067_pilon:1252361..1257132+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTTCTCAGCCCTCAACTAAGATATCGATGTCAGAAATGAATACTGG
TCAACGAATATTGAGGTATTTGATCATCAAGAAAGAGAATCTAAAAAGAA
TACTGTTCTTTGGTTTGGATATCTTGAAGAATACAAGTGTAGCTTCACCA
AATATTGCTCGTAAACATTTTAACCTCTCCAAATATGGTCATTGCTGTAA
ACTGGTCTTTCCAGAACGTCTAAATGGTACAGCAGTAAACGTAACAGAAT
CTTACTTTTATGATATGAAAGGGTTATTTTATGTTGTTTGTATTCAATTA
TTATAATTTCAAAGAGCAAATTGCGATTGTCAGGAGTTGTTTTGAGGAAT
GGTCAGCTATGGATATCACAGACAAGTtaccacaatttttgaaaattgat
atgGGGGATATATTGAATGAGAAGTTTGAACCTGAAGTTATTGGTGAAAA
CCGAACTATTTGCTGCTGTAAATGTATTGACAAACCAGGACAAACAACAT
AGTGATTTTCTTCTACAGGATGGTCAACCTGCATTAAATGCCAAGGAGGC
GATCATTTCTGATAAGTCCCATATATCCAAACATGTATTAATACCAACAT
TGGAAGACCTCAACAAAAGTGTATTTGAAATACCAGGAAAATCTCGCAGT
GATTCATTTAGCCGTAAACAAGGCAACATTCAGCCAGCAGAATATAcacc
agatttaattttaaagaagaataACCAAGAAATGTGGAAGAAACTTGATG
AAGTGATGCTCACTAGAAGTACACAGACATCTATTGCAACAAAGGATGCC
CACATTCAAACTGAATCTGATATTAAGATCTCGAAACCATTGGCTATGAG
CATGGCTACACAAAcagaaaacaagaaaagaaaattacagACAATACCTA
CCTTGGATTCCAACAACCACCATCAGAGTTCACTCAATCTTCTAGAATCC
ATGTCTAACATATTGCAAGAATATGTCAATGGCTTCTCAGCCCTCAACTA
AGATATCGATGTCAGAAATGAATACTGGTCAACGAATATTGAGGTATTTG
ATCATCAAGAAAGAGAATCTAAAAAGAATACTGTTCTTTGGTTTGGATAT
CTTGAAGAATACAAGTGTAGCTTCACCAAATATTGCTCGTAAACATTTTA
ACCTCTCCAAATATGGTCATTGCTGTAAACTGGTCTTTCCAGAACGTCTA
AATGGTACAGCAGTAAACGTAACAGAATCTTACTTTTATGATATGAAAGG
GTTATTTTATGTTGTTTGTATTCAATTATTATAATTTCAAAGAGCAAATT
GCGATTGTCAGGAGTTGTTTTGAGGAATGGTCAGCTATGGATATCACAGA
CAAGTtaccacaatttttgaaaattgatatgGGGGATATATTGAATGAGA
AGTTTGAACCTGAAGTTATTGGTGAAAACCGAACTATTTGCTGCTGTAAA
TGTATTGACAAACCAGGACAAACAACATAGTGATTTTCTTCTACAGGATG
GTCAACCTGCATTAAATGCCAAGGAGGCGATCATTTCTGATAAGTCCCAT
ATATCCAAACATGTATTAATACCAACATTGGAAGACCTCAACAAAAGTGT
ATTTGAAATACCAGGAAAATCTCGCAGTGATTCATTTAGCCGTAAACAAG
GCAACATTCAGCCAGCAGAATATAcaccagatttaattttaaagaagaat
aACCAAGAAATGTGGAAGAAACTTGATGAAGTGATGCTCACTAGAAGTAC
ACAGACATCTATTGCAACAAAGGATGCCCACATTCAAACTGAATCTGATA
TTAAGATCTCGAAACCATTGGCTATGAGCATGGCTACACAAAcagaaaac
aagaaaagaaaattacagACAATACCTACCTTGGATTCCAACAACCACCA
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ATGTCAATTCCAACAACCACCATCAGAGTTCACTCAATCTTCTAGAATCC
ATGTCTAACATATTGCAAGAATATGTCAGTAAATATCTAGAcgatatttt
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ATGAACTTAACCTGGTTATTTCCACAACCACAGGGATTTTCCCTTTTCAT
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GCAAATGGCTTGGCATGCAGTTCTGTAACTTTAGATCCACCATTTCCAAC
CAAATTGGTgaatataaaaaattgttaattCAGAGTAACCAATTTTTACC
ACctgctttaaaagttttgaacgaAGAAAAATTATTCCCAATTTGTATGG
TCATGTTTTTGAACCATTGGTTGAATAAGAGACTTGAGGATGAGGAGTTT
CaatattctaaaattttgttggttttgGAATTGATGAATGATGAATTGTT
AACAGGTGTTGGTCACGTGGTCTATGCTAAGTTAAAAAGTATTCGATCGA
TGTGAATTCCAACAACCACCATCAGAGTTCACTCAATCTTCTAGAATCCA
TGTCTAACATATTGCAAGAATATGTCAGTAAATATCTAGAcgatattttc
ttcttcaaagtgTACAGTCTAGTTGATTCCTTTCTCTATCTACTCAAGGA
TGAACTTAACCTGGTTATTTCCACAACCACAGGGATTTTCCCTTTTCATT
TAATGCTGGATTATGCTAATATCAAGAAATCAAATATCCCAAAGAACCTT
CATAGTAACTTGAACCTCTATTACCAGGATGGCTTATTGAATTTGTTCAG
CAAATGGCTTGGCATGCAGTTCTGTAACTTTAGATCCACCATTTCCAACC
AAATTGGTgaatataaaaaattgttaattCAGAGTAACCAATTTTTACCA
CctgctttaaaagttttgaacgaAGAAAAATTATTCCCAATTTGTATGGT
CATGTTTTTGAACCATTGGTTGAATAAGAGACTTGAGGATGAGGAGTTTC
aatattctaaaattttgttggttttgGAATTGATGAATGATGAATTGTTA
ACAGGTGTTGGTCACGTGGTCTATGCTAAGTTAAAAAGTATTCGATCGAT
GTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000067_pilon | genome | sc0000067_pilon:1252361..1257132 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 967-1563:4176 |
| Aaloc | 484-963:498 |
| Aaloc | 481-483:491 |
| Aaloc | 286-480:290 |
| Aaloc | 1-285:1 |
|
