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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000322_pilon:344067..351648+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_006431 ID=XLOC_006431|Name=XLOC_006431|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7582bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000322_pilon:344067..351648+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTCGACCAAGACGGTATAGGGAATGTATGTGATAATTGTCCGTCAAATGC
TAATCCTTTACAGCGTGATATTGATGGCGACTCGTATGGAGATTTTTGTG
ATGTCGATAATGATAATGACGGtaagaatgatgacgtcacgatgacgtca
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gattcaattaaagtgacatttccataattaatagtttagtaattactgtt
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tcaattacacttggaggtttctggggaatttgtaaatagtaaactgcata
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gattctttctacagtgattagattgacacatgcgcgataaaatttctatt
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TGATTGGTTGATCGATCGATCCACTTTGTGAAATTCAGTAATGAAATAAC
TAGAAATAAGCAACGTTTCTTTTATAGGTGTGGTGAACGGGTTTGATAAT
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GTGTAAACAGTGAAGTTGATGTTTAGCTTGTCCCAAATTCTACGACTGCT
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aacggacgatagcatcctTTAGTTAATGCTAGATGATGTTAATATTAAGT
TAAACACATTACTTTCAATCAATTCCTGGtctgtcaaaaatttaaattgg
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TTTTTAACTTCTTTACTGGGGATCTATCTTCAATAAAAATCATATCGTTA
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GATGTTTGTGATAACCAAAATGACAGGTGACTATGACGTTTTATTTGAAC
CATATTTCTTCCCTAGATTTTTGAGGCTTGCTTACATACAGTCATTTTTC
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CTTTATTAAAATTACCTTGGttataaattatttaataaacttccccttct
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gtgcgGCTAAAAAGTGAAactggacccttacagtgcagtgaaaatttagc
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tagagtgcccttttctcatctttgctcatttcgacccttacagtgcactt
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GAgtgaaaaattgacaatttgactaaataaatgaaaactaggaaaatgac
caattagtgaaaaaaatgactaatttaaatgaaaatggctaattaatgaa
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atgaaaatggctaattagttaaaaatgactaattaatgaaaatggctaat
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AATTAGTGAAAATGTGCTTAATTAGTGAAAATGCTTAATTAGTGAAAATG
CCTAATTAATGAAAATGGCTAATTAGTGAAAATGCTTAATTAGTGAAAAT
ATCTAATTAGTGAAAATGCTTAATTAGTGAAAATGCTTGATTAGTGAAAA
TGCTTTTTAGTGAAAATGGCTAATTAGTGAAAATGGCTAACTAGTGAAAA
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tgaaaaaatgactaataatcaaacaaaaaaggcaCGAAACGGGAACAAGG
TGAGAACCAAAGCTGTGACCGCCTAGAGGCCTGAGCACGAACGTGCGAAT
GAAAATGAGGGCGAAACGAGTTTGAAAAAGACCATGAAACCTGGGCATGA
ACATgcaattgcaatgaaaaaaatgaaggtcagaAAATGAACTGAACTga
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aaattctaaaatagtaagactgaatcttgtgttctctgtgttcttgtgtc
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AGCATGAAGacgataaataaaaaatatggcggtaaggcgttatggcggta
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tgggttTATTTCTTATATgtatagtgatttgtcttagactatagcatagt
ttATACACTATGTCTCTGTAATAAACAACCAGCCAATTGGTTCCTCACAT
AAAGGTATGAAAgagcctttttttttttttttcaataatccATTCTCTCT
CTCATTTCAGGTGATACTTGCGATACAGATGATGATAACGATGGGTTTGT
CGATCAAGCAGACAATTGTCCCCTTATGCATAACTTATTACAATTTGATA
TCGATGGTGAGTGagacccattgagtttaaagtacAAAGTGCTAGATGcg
aatcttcaaattttatctttaccttccctaccttcgggtaaaACAGATCA
AGAAAAGGAGACCTTTTTGTCATCCtcaactgcggtcgcaaacttactta
ctataactgttgactctctctaactcGATCTTCAAACGAccaaaaatttc
attcaaattagagaaagtttCGAATTACGaaagtaatttaaaccacttcc
agctaaggggaccaatatttcaattttaatttcgaattacagaaaaattc
gaataatagagattcgaattagaaagGGTTACGAGACTGTATTACCATTC
CTTTTTAGATAACCAACGTGGCGATGTCTGTGAGTATGATTACGATGATG
ATGGTTACGACAGTCGTGTGGATTCCTGTCCACTTAACAACGCTATCTGG
AGGACGAGCTTCCTCAAGCATCGAACCATACTTCTTAATAATCCTCGAGA
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GTGGAGTTGGATTCTTGGTAACGTGGTTCGTTATATATATAGTAGTGTCt
tttatgaatattttcaaatttcggaTATTTGCGGCGGCTAGCAAAATGCT
AGTGTACCGGGCTCAGAATCACTGACAAACTACTTTgatggttcgagccg
gggtcaaatccacagttttgaaaaatgttctatGTTGTGAGGCGTTCTGA
GCATTTAGATACATGTCCATAGGGTGCAAGGGAAGGAAATATCCACAATA
TTCCTCCAAGAAATTAACAACCAGAACTTATTTTAAACTCTCAATAACTC
GACTGATTCCTTGCTTCTTTTGAAGTGTTCGAGTTGCAGAAAACACTATC
ATAGAAAGATCTTTCTTCTTCTAGGGACAGGAAGTGGAATTGAATAGCTA
TATCAACGGAAGTGTTGTCTTACTAGGTAAGTGCCTGGCAGCCTACATTG
CAGTTCATGCagtctattccactttgtgactttttcgaatgtttagagtC
CAAGCTTTTCGTGTTTTTACGTTTGAAGACTTTCTAGTAGCAAGCAAGTT
AAACGCCCTCATCGAATAAACTCCCCTTCGAATAAACGACTCTCCTGCTC
TAGGAAGGGCATTTTGGAACAGGATTTAGTCTATTCCGACCTGTGAACCA
TCAATGTTACATTTCCGCCGTAACATTTACCATTTACTTCCAGGCGATGA
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AAGGGAAAGTCATGAACACTTTCTATGAAGTTGGTATCGCCTTCGATTAT
CAGTCACTAAAGAAGTATTATCTGTTGTCACTACAAAATATCAACGGATT
GAAGAGAGTGGCAGTCTATGTATGTATTTCTAGTCACATTTTGTTTTGGC
CGGCTGAATGGAGAATTTTGCCGGTTCTACGCACGACAAATAGGAGATAA
TTTTTCATTATCCAGCTTATAAAAACATAGCAAAACCATTGAGTCTTCTA
GAGATTTGTCTTCCTATACATTgtcttccaagaattttctgCAAATGTCG
ACATCGACGGAAATGAATATGTAGTCTGATAGAAATTTAGAGGAGTTTTA
AACACGCTATTTCCATCTGGAACCTTATGTGACTGTTAGGCCCCATTTTG
ATAACCAAAAGGGCTCTATAAAAATCAGATGTTTTTAAATCACAATTGGA
ATTTTTTAGGTCAGTCGAAATAATGGGCGAAACCCAGCCAATGAGAAGGT
TTgacgaatttttattttgtgatttaTCGGCTCACTTAGACACTCATATA
GAGGTTTTGCCAGCTCTAAGCCCCATAGAATCACTGATGCTACACTTAAT
ATTTAAAACTTATTTCAATGGTAGAAATAGTCATTTTGAGAATATGGTTG
TTCTATTTAAGTTTTAGCAAGGTTTTTAAACACTTATAAATAACACAAAT
ACCCATATTCAAAATGTTGGTTTTTAACGAGTCAcaatgagagaattttt
tcttATCAGGTTCTGAAATGGAGTTCGCCATTTGACTGGCAACCTGGAAG
CtcttataatttgaaaatacaCAGAAGACCATTAACAAATCAGTTAAGGT
ATGAATGTTTCAATTATATCACACATTTTCAGtaaaaagaatttccaaag
CAAAACCTTCGAAGAGACAACTTTCATGGTTGGGATCCTTTATAAGCATA
CCTTTTTACCtgatattctctggcgtcagcAGGCCcagcggaagcgggga
gactggggagacttcagccttctcaatgagattttttttctcaaattcct
agcgagtTTTATCTCATtatgagccttcagcctccccaatTTTAAGGTGG
TTCCGCCTGGCCTGGTCAGTCAGTAATGTTTAATAAAGCTCTGGATACAC
GTGGACGAGGCTGGAAATACGACAGCTCTTCTCTTCAGTCAACTTTCTCT
TAtttgaacctctataattcgatgtttttgtaattcgaactaaaacttTG
GTCCCTTCAGCTGAAAAAATGGTATATAatatactctctgtaattcgaat
ctttctctaattcgaggaAGACTTTGTGTCCCTTTAacatcgaattaaag
agacaactgtatgttttttttcttaaagaataCAAGTCAAAGGCGTGGAT
GGTGGTGCAACAGTAGACAGTGGTGTTCTTGAAGTTGACCAACAGAAAGG
TGGCAAGATTGGTTTGTACGCAACATATACCAAAAATGTGATCTGGAGTT
CATTGACCATCGAATGTAATGGTAAGAGGATG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000322_pilon:344067..351648+ >XLOC_006431 ID=XLOC_006431|Name=XLOC_006431|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2322bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000322_pilon:344067..351648+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTCGACCAAGACGGTATAGGGAATGTATGTGATAATTGTCCGTCAAATGC
TAATCCTTTACAGCGTGATATTGATGGCGACTCGTATGGAGATTTTTGTG
ATGTCGATAATGATAATGACGGTCGACCAAGACGGTATAGGGAATGTATG
TGATAATTGTCCGTCAAATGCTAATCCTTTACAGCGTGATATTGATGGCG
ACTCGTATGGAGATTTTTGTGATGTCGATAATGATAATGACGGTGTGGTG
AACGGGTTTGATAATTGCCCCTTTGTAAAGAACGAACAGCAATGGGATGG
GGACGGCGATGGAATTGGTGATCTGTGTGATAATTGTCCTTCTGTTCCAA
ATAACGACCAGGTGTGGTGAACGGGTTTGATAATTGCCCCTTTGTAAAGA
ACGAACAGCAATGGGATGGGGACGGCGATGGAATTGGTGATCTGTGTGAT
AATTGTCCTTCTGTTCCAAATAACGACCAGCTCGATGTTGATTTGAACGG
TGTGGGTGATGTTTGTGATAACCAAAATGACAGCTCGATGTTGATTTGAA
CGGTGTGGGTGATGTTTGTGATAACCAAAATGACAGAGATTATGATGGAA
TAGCTGACGGGAGAGACAATTGTCCATATTTCCCAAACGCAGCACAAGTT
GACACTGATGGTGACAATATAGAGATTATGATGGAATAGCTGACGGGAGA
GACAATTGTCCATATTTCCCAAACGCAGCACAAGTTGACACTGATGGTGA
CAATATAGGTGATACTTGCGATACAGATGATGATAACGATGGGTTTGTCG
ATCAAGCAGACAATTGTCCCCTTATGCATAACTTATTACAATTTGATATC
GATGGTGATACTTGCGATACAGATGATGATAACGATGGGTTTGTCGATCA
AGCAGACAATTGTCCCCTTATGCATAACTTATTACAATTTGATATCGATG
ATAACCAACGTGGCGATGTCTGTGAGTATGATTACGATGATGATGGTTAC
GACAGTCGTGTGGATTCCTGTCCACTTAACAACGCTATCTGGAGGACGAG
CTTCCTCAAGCATCGAACCATACTTCTTAATAATCCTCGAGAACCAGCAA
ATCTATTGTGGAAAATTCATGACAAGATAACCAACGTGGCGATGTCTGTG
AGTATGATTACGATGATGATGGTTACGACAGTCGTGTGGATTCCTGTCCA
CTTAACAACGCTATCTGGAGGACGAGCTTCCTCAAGCATCGAACCATACT
TCTTAATAATCCTCGAGAACCAGCAAATCTATTGTGGAAAATTCATGACA
AGGGACAGGAAGTGGAATTGAATAGCTATATCAACGGAAGTGTTGTCTTA
CTAGGGACAGGAAGTGGAATTGAATAGCTATATCAACGGAAGTGTTGTCT
TACTAGGCGATGACTTGTACGAAGGTTTCGATTTCAATGGTGTGATTCAC
ATTCTCCAACAAGAAGGGAAAGTCATGAACACTTTCTATGAAGTTGGTAT
CGCCTTCGATTATCAGTCACTAAAGAAGTATTATCTGTTGTCACTACAAA
ATATCAACGGATTGAAGAGAGTGGCAGTCTATGCGATGACTTGTACGAAG
GTTTCGATTTCAATGGTGTGATTCACATTCTCCAACAAGAAGGGAAAGTC
ATGAACACTTTCTATGAAGTTGGTATCGCCTTCGATTATCAGTCACTAAA
GAAGTATTATCTGTTGTCACTACAAAATATCAACGGATTGAAGAGAGTGG
CAGTCTATGTCAGTCGAAATAATGGGCGAAACCCAGCCAATGAGAAGGTC
AGTCGAAATAATGGGCGAAACCCAGCCAATGAGAAGGTTCTGAAATGGAG
TTCGCCATTTGACTGGCAACCTGGAAGCtcttataatttgaaaatacaCA
GAAGACCATTAACAAATCAGTTAAGGTTCTGAAATGGAGTTCGCCATTTG
ACTGGCAACCTGGAAGCtcttataatttgaaaatacaCAGAAGACCATTA
ACAAATCAGTTAAGaataCAAGTCAAAGGCGTGGATGGTGGTGCAACAGT
AGACAGTGGTGTTCTTGAAGTTGACCAACAGAAAGGTGGCAAGATTGGTT
TGTACGCAACATATACCAAAAATGTGATCTGGAGTTCATTGACCATCGAA
TGTAATGGTAAGAGGATGaataCAAGTCAAAGGCGTGGATGGTGGTGCAA
CAGTAGACAGTGGTGTTCTTGAAGTTGACCAACAGAAAGGTGGCAAGATT
GGTTTGTACGCAACATATACCAAAAATGTGATCTGGAGTTCATTGACCAT
CGAATGTAATGGTAAGAGGATG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000322_pilon | genome | sc0000322_pilon:344067..351648 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1009-1161:7430 |
| Aaloc | 919-1005:6810 |
| Aaloc | 880-918:6510 |
| Aaloc | 706-879:5996 |
| Aaloc | 652-702:5675 |
| Aaloc | 478-651:5111 |
| Aaloc | 382-474:4663 |
| Aaloc | 295-378:3504 |
| Aaloc | 241-291:1724 |
| Aaloc | 124-240:1180 |
| Aaloc | 1-120:1 |
|
