XLOC_006421 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_006421
Unique NameXLOC_006421
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000322_pilon:218933..233352-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_006421 ID=XLOC_006421|Name=XLOC_006421|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14420bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000322_pilon:218933..233352- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CACCAAGGGTTCAGAAAAAAGACTCACAGACAATCGACAGAGATAAAAAG TTGATATCAAAATTAGCATTGGATAGCCTTTTCTGTTCTAGGAAAAATAT ATCTTATATAGGTATATACAGTAATAAACTTTCAGGTGAGAGCAGTACTG AGCGATCTTTTTGGTATAAAACAAAGAAAATAGATAAAGAATTTCATCAA TTGTTGGCTGCAATCAGTTCCATTAAAATGCCAAAGAAATTTGTTTAGTC ATCCTCATACACTATGAACTTCTTTTGCTAATTAAGAACTTATGTTAATT AATTATGAACTTCTGTTGCTAATCAAGATGCCGTACAGTATTGAATAATT AATGATGATGAAAAAAATTAACACTTAAAATAATTATGCATTTAATGTAT TTTTCTTTTATTAATGCTGAAGTCTTTAATTGTTCAACAAACATCCTGAT TAGCAATCCTGATCTTAGATTTTTCAAGGTGATTTTGTTCATTTTACAGA ATTTCCTCTGGGGTCATTGAAGGTTTCCAGGGGAAACTTATAGATTGACA TCAAAATTATTTTTAAGTCCTTTTATCAAAAAATTTCAAATTCCAGGGGT TTCTAACCCTATATTTCCCTGAAATAAATAGGGCCAGGTTGGTGAAAAAT TCTGTCCATACCCATGTATGATTTTTTCTTGGAATAGCCCATTGATGTAT GCGATTTTTATAAACTTCTTATCTACAAAAGTTGGAAAATTGTTCATACA GTATGTGGCCCCCAAAACGGCGATCAAATTTAAAATTTCTCTCAAATCTA GAGGAAAAAAGGTTTTACAAAGATTTTTGCTGCATGAAAAACTTTAACAT CTCTACTTCATTTCCCAGAAGTTCTTTTTCAAAATTTTCAATTTTAACAA TATTTTTCAATCGCTTAAAGATAGGTAGCTTTTTTCTAATGGCCCCCAAA 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TTTCTTTCAAAATAAACAAAAATCTACAAGTCAGAATCTTCATTTTAATG ACGACCTCCGTTTTGGGGGCCGTCTCCGTTTTGGGGGCCATATACTGTAG TACATTTTGTTTCAGTCTAAAAATGCTAATTAGGATGTTATTATGAAAAA CTCCTTATTTTTGGTTGTTTTTTTGTTTTGTGATAGTCAATATGATAAGA ATGATATTAATAAATTTATAATAGAAGATAAGAGCTGCAAGGAAAAAACA TGGAGCCAGCGACAAGGCTTTTTTGGTTGAGCTTCTCGATGCTGATTGGT TGTTATATATTTGGAAGCATACCGCTCACATTGTCTTTCACTGAGGTTAG AGAGTCTTGATTTTAATATCTTTTATAAGTATTTTTAACATTGAACTATA CCTCAAACCTTGTGGACTAAGTTCCTTCAACTATCTTTAATCCAATTTTC AAAAATGATAACCAGTTCCACTCCCAGCACTTATTAATGCACCCCTGCCC TGCTTTCATACTGTAGTATAACCTTCTACTCCTTTAAAATGAGGGGTCAA TGGCAACTCTTGTATGGTCTCATTTTCCTAATAATCTAAGAAATCCATCT CCTGTTGGATCTATCTACAATTCCAGATGCAACTAGTATCCTATTTATCC TTTAAAGATTCCAAAATAAATATAGTTATTTTGCCAATAAATTGTTATTT GGTTACTGTTGAATGATTATGTACCAACGCTTTATTTTTTTTCTTATATT CTTTTTCAGAGAAATATGAGAAGTGTATCAATTGGAGGTGCAGGACTAAT TGTTGGAACAGCCTTATCAGTCATTATTCCAGAGGGTGTTCACGCTATGT ATGATTCAGGTATTAGCCAATCTTTCCAAACTTTTTTCTCAAAAAAAGGT TAGCTTGTCATACAAAATTAACAAAGGCCAATGATTTTTTTTCCCTTTTG GTTGAATGAGTATTTTCTAAAGATTTCAGACTCAAGATGGGGTCGACCCA ACAACCGTTCTTAACTTCAGTTGAACTAGAATCTGTGAAGAAGTTAAGCC CAGTTTAATGCACATGCTCAACTATTTGTAAATATAGAACGGTATTAGAT ATCCAAGATTTTGAATTCTCTCTAATAGTCCTACCACACAATCATGGCCA CGGTCACGAATCACATGCACACGGGCATGCGCACACTCATCAGAAGAGGT CGTTACAACAAACAAACGAACAAAAACAACTCATCATTGATAACAATTCA CCAAGTGGCGCTTGGGAGAATTTCAATTCACGGTTACCAGGGCTACCAGA GGTGGAACTTCATTCTATGATTGGCATTTCATTGAGTTTAGGGTTCATTT TCATGCTACTGGTTGATCAGCTGTTTGGTGGTGGCCATTCACATGGTGGC TCTGGTGAGTTTTTAAGGGCCATATTCTCTATGAACCAGCCAGGTTCAGA AAATTTTATTTGCCTTCATTTTTGGATATTTTTAGTGACAAATTCAGAAT ATCAAAATTTCAGGTCCTAAAAATTGCTTAAAAGTGGCTTAGGGCCTTTT CCAGGCCTTTTTCCCCTAAGTGTGAAAGTCAGACTTTTTTATTATTACTT TAATTATTTCGAGTTGCAATAAGGTCACATTGGTTACTTTGAATTCATTT AGTACTTTTAGGAAAGTGTAAAAAATGTTAACCTTGATATCACTTTCCAT AGTGGTGGCGTAGTTATGGCTCAGTTTTAAATGTAGTAGTTTAGTTTTGT GACTTTTTTATATTATAAATATTTCAATTGATTTCTCTACTTACAAAATG TTTTTAAAATAAAAAAGAATTCTCAAGATGAGACGTTGTCTGTCTTAAAA AACACTTCAACTGAACTTTCAATTTCGAAATATCGTCACTGTCATATTTC 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TATCAATTAAATGTTTAATTGAGTGTGTTAAGTGTTGATTTTATAACTAA CCATCAAATACCCATCGACATTAATTTTCTTTTGTATAGAATATGGAACG TAACCGGATACGAAAACATTTATTGGCATTTTCACTGGCAGCGCCTATAT TTTCTATGCTGACGTACTATGGTTTAAGTGCAGTAAGTCTATCACTTTGG ACCTTATCAGGATACGCCATTGATAGTGTAACGGTGTCGTTGGTTCTGAA TGTTTCTATGTTTGTGAAAGTACTCGCGTCCTTCACACATTTCATTTATG CTTCGTTCAAAAACTATTGATTTAGTTTGGAGATTTGTGCATCAATTCAA ACTAATATAATGGCTTCGTTAACTTTCAGAGGAGTGTAGTGAACATCTTT GCATCGTAATACAGTAGAGTCTCTAGAACTCGAACAGATTTTATTCGAAA ATTTTCATGGTGTCAACGAATTCGTTCGAGTTATGGAGAATCTACTGCAT TTCATTTTCACTAATCTTTTCTGTTTGTAAAACAATTCTTAAGGTTTTTC ATGAGTACTTAAGGGAACTAATTTTCATGAGATAAAACAAATTTTGCAAG AACTTAAGATTTCGGCAAGTAATTTAGAACTAGAACTTATCTTGGCGATT CAGTAATTATTTTTATTTTGGCAAGAACTTATTTTGTTGAAGGCAGCAAG TAATTTAATTTTGGCCAGAGTTTTAGAATCTTCCACAATCTCTCGCTAAA ATTAGATATTTATTTACTTTTACTTGTCCATAATCTCAGACGTTCAGAAT GCAAACTAGTTTGAGATAATAGTAAGAGGAATAAAATTAAACTAAAAAGT ATTTATTTGTTATTTGTTTCTTTCTTTTCTTCATAGAGTGGTAAACAAAC ATTTACATCATATAACGGTACAGGACTTGCCATGTTGTTTTCTGCTGGTA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000322_pilon:218933..233352-

>XLOC_006421 ID=XLOC_006421|Name=XLOC_006421|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2238bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000322_pilon:218933..233352- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTAAAAACTTGGTATTTTTTCAGCAAAATGCGGCAAAATTGCACTAC
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ATTTTTAGGCTCGTGTGTGGTGGTGGAGCAAGACCCACAAACACATTTGA
CATGAAGCTGTTGTGGAGCGGAGCCAGCAAGATGGTAAAAACTTGGTATT
TTTTCAGCAAAATGCGGCAAAATTGCACTACCACGTCTTCAAAAATAAAT
CTACCATCTTTGTTATGTCTCGCTTATTGTTTACTTTTGAGCTCGTTTAC
ATTGAAATTTCCGGGTCAGCGAAGCAAAAACATTTTTAGGCTCGTGTGTG
GTGGTGGAGCAAGACCCACAAACACATTTGACATGAAGCTGTTGTGGAGC
GGAGCCAGCAAGAGAAATATGAGAAGTGTATCAATTGGAGGTGCAGGACT
AATTGTTGGAACAGCCTTATCAGTCATTATTCCAGAGGGTGTTCACGCTA
TGTATGATTCAGAGAAATATGAGAAGTGTATCAATTGGAGGTGCAGGACT
AATTGTTGGAACAGCCTTATCAGTCATTATTCCAGAGGGTGTTCACGCTA
TGTATGATTCAGTCCTACCACACAATCATGGCCACGGTCACGAATCACAT
GCACACGGGCATGCGCACACTCATCAGAAGAGGTCGTTACAACAAACAAA
CGAACAAAAACAACTCATCATTGATAACAATTCACCAAGTGGCGCTTGGG
AGAATTTCAATTCACGGTTACCAGGGCTACCAGAGGTGGAACTTCATTCT
ATGATTGGCATTTCATTGAGTTTAGGGTTCATTTTCATGCTACTGGTTGA
TCAGCTGTTTGGTGGTGGCCATTCACATGGTGGCTCTGTCCTACCACACA
ATCATGGCCACGGTCACGAATCACATGCACACGGGCATGCGCACACTCAT
CAGAAGAGGTCGTTACAACAAACAAACGAACAAAAACAACTCATCATTGA
TAACAATTCACCAAGTGGCGCTTGGGAGAATTTCAATTCACGGTTACCAG
GGCTACCAGAGGTGGAACTTCATTCTATGATTGGCATTTCATTGAGTTTA
GGGTTCATTTTCATGCTACTGGTTGATCAGCTGTTTGGTGGTGGCCATTC
ACATGGTGGCTCTGACGGTGGCAACAGGAAGTCAGCCACTGCAACTTTGG
GGCTCTTGGTACATGCTGCTGACGGTGGCAACAGGAAGTCAGCCACTGCA
ACTTTGGGGCTCTTGGTACATGCTGCTGCTGATGGTATAGCACTGGGAGC
GGCAGCTTCGACGACAAGATCAGATATCGAAATGATTGTTTTCTTTGCCA
TTATGTTACATAAACTGATGGTATAGCACTGGGAGCGGCAGCTTCGACGA
CAAGATCAGATATCGAAATGATTGTTTTCTTTGCCATTATGTTACATAAA
GCGCCGGCTGCTTTTGGATTGTCTTCTTTTCTTCTTCATGAGGCGCCGGC
TGCTTTTGGATTGTCTTCTTTTCTTCTTCATGAGAATATGGAACGTAACC
GGATACGAAAACATTTATTGGCATTTTCACTGGCAGCGCCTATATTTTCT
ATGCTGACGTACTATGGTTTAAGTGCAAATATGGAACGTAACCGGATACG
AAAACATTTATTGGCATTTTCACTGGCAGCGCCTATATTTTCTATGCTGA
CGTACTATGGTTTAAGTGCAAGTGGTAAACAAACATTTACATCATATAAC
GGTACAGGACTTGCCATGTTGTTTTCTGCTGGTACTTTTCTATACGTTGC
CACCGTTCATATATTACCTGAACTTTTATCGCAACCTTCCAATTCATTAG
ATAACTCATCACAGACTCATGGGAAATTAACGCGCAAAGAATTATGTTAT
TTGGTTATAGGTATTTTTACACCTGTCATACTGGGTCTTTATCATAAACA
TTGAAGTGGTAAACAAACATTTACATCATATAACGGTACAGGACTTGCCA
TGTTGTTTTCTGCTGGTACTTTTCTATACGTTGCCACCGTTCATATATTA
CCTGAACTTTTATCGCAACCTTCCAATTCATTAGATAACTCATCACAGAC
TCATGGGAAATTAACGCGCAAAGAATTATGTTATTTGGTTATAGGTATTT
TTACACCTGTCATACTGGGTCTTTATCATAAACATTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_006421XLOC_006421-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000322_pilongenomesc0000322_pilon:218933..233352 -
Properties
Property NameValue
Aaloc886-1119:235
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