XLOC_006418 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_006418
Unique NameXLOC_006418
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000322_pilon:296655..312288-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_006418 ID=XLOC_006418|Name=XLOC_006418|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=15634bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000322_pilon:296655..312288- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GGGGGATCCTGGTGACGAAGGAATCATACCAAGAGCCCTGAAAGATCTCT TTCATAATATTCACAAGGTATCAATAATTGTTAGGATTTCCATGATCATG AAAATAATGTAATTATTTGTCTCCTTTTTAAGAAATAAGCCTCTGTCAGT CAAAACCAAGGGGAATCAAAATTGCATTACTTTTTTTACCTATCAGCGAA ACTAAAATGACTTTTCAGGTGTGGAGAAGCCGGACACAAACTCTGTATCT TCTATAACCCATCAAAGACAAAAACCCTGGCTACCCGCCATCTCATTAAC ATTCCTAACAACAACAAAAAATATCCTAATATTTCAAATGTAGCAGTGAT TTAAAAGTTATCTTATTTTTATTTTAGTGTGAAAATCGTGAATTTCTCAT TAGAGCATCCTACTTGGAAATCTATAATGAGGTA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000322_pilon:296655..312288-

>XLOC_006418 ID=XLOC_006418|Name=XLOC_006418|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1066bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000322_pilon:296655..312288- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAAATTGCAACCGAAAGTGGCGGCAGACGAAAATTTTCAAAAAAGCTATC
GTTGTATCGAGCACATTCTCGTTCCCTTCTTCTGGTCTGAAAATTGCAAC
CGAAAGTGGCGGCAGACGAAAATTTTCAAAAAAGCTATCGTTGTATCGAG
CACATTCTCGTTCCCTTCTTCTGGTCTGTCTTCCAAAAAAATGGCAGATG
CAAGGAAAGATGAAAAAACTAACATTCAAGTTGGTATACGTGTTCGTCCA
TGTATCAAAAGTCTTCCAAAAAAATGGCAGATGCAAGGAAAGATGAAAAA
ACTAACATTCAAGTTGGTATACGTGTTCGTCCATGTATCAAAAGGGAACT
TGAAAGCCACAAAAAGATTGTGATGAAAACCAATGAAAATAGAATTTTCA
GTACAGCAAATGATAAACCAGCTATCTCTTATCAATTTGGGAACTTGAAA
GCCACAAAAAGATTGTGATGAAAACCAATGAAAATAGAATTTTCAGTACA
GCAAATGATAAACCAGCTATCTCTTATCAATTTGATAAAGTATTTGGAGA
AGCTATATCAACTGAGCAGATTTATGAAACACTTGGTAGTCCAATCGTGG
AATATGTAGTGGCTGGTTTTCATGATAAAGTATTTGGAGAAGCTATATCA
ACTGAGCAGATTTATGAAACACTTGGTAGTCCAATCGTGGAATATGTAGT
GGCTGGTTTTCATGGGACACTATTGGCTTATGGGCAAACAGCTTCAGGGA
AGACCCATACCATCATGGGGGATCCTGGTGACGAAGGAATCATACCAAGA
GCCCTGAAAGATCTCTTTCATAATATTCACAAGGGACACTATTGGCTTAT
GGGCAAACAGCTTCAGGGAAGACCCATACCATCATGGGGGATCCTGGTGA
CGAAGGAATCATACCAAGAGCCCTGAAAGATCTCTTTCATAATATTCACA
AGTGTGAAAATCGTGAATTTCTCATTAGAGCATCCTACTTGGAAATCTAT
AATGAGGTATGTGAAAATCGTGAATTTCTCATTAGAGCATCCTACTTGGA
AATCTATAATGAGGTA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_006418XLOC_006418-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000322_pilongenomesc0000322_pilon:296655..312288 -
Properties
Property NameValue
Aaloc484-540:58
Aaloc367-483:485
Aaloc277-363:1004
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Aaloc4-42:15635