XLOC_006275 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_006275
Unique NameXLOC_006275
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000292_pilon:198447..212583-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_006275 ID=XLOC_006275|Name=XLOC_006275|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14137bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000292_pilon:198447..212583- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TGCCTTTACTTTCACTTTCGCTTTTGTGTTACGCGATTCCAATTGGATGA ATACCGCTCGCTAACAAATTCTGATTGGCTGTAAGTCTTTAGCTTCAGGA TTCTGATTGGATCATTTCCCGCGTCACGGTTGAATTTTGATTGGTTGAAA GTTTCTGAGCGTGAATTCTGATTGGATGAATATCTGAAAAGTAAACAATA GTATGTAAGTATTTTGCTTATCAAAACCTAAAGATTTCCAGGGGGTTTAA TTTACTTTGCATGACGATAATTAAGCCTACAAAACATCGAGAAAAAAACC CAACATAGAACAGGTGTATTTTGTAATGTAGAATATGATAGCGTGAATCT TTTTGAAATTCTATGTCAGGATTTTTTCTCAATGCCCCGTAACTATGCCC GGGGTACCCGTTGCTAAGACCTTATGTTAAAAACAAAAGCGATGGCAAAA AGTAGCGATTTTCGTAATACCTCAAATATTGATACTTGACTGTACTGAAA TGGGCATATAAAGGCTACAAAGTAGTTTACCTTACCAAATGTTTTTAAAT ATAATTTGGAAGTTACTGAAGAGTTTAAGTCATTTTAGTTGTCCAATGAA GTTTTTTGGGGGTCTAAAATTTCGTTGCGCCATGACGGAAAATCATAATT AAAAAAAAAATTGAACAAAGCAGAATTTTTTCAGTTTTTAAATGTTTAAA ATATTAGACCTTTAGGGCTGTTGAGAATCACTAAAAAACACCAAGGTAAT CTTTTATAGTGCACTTTTAAGTTTGCGTTGCGCCGTGACGGAAAATCCAG GTCGGTGTTTTAAAATTATCTTTTCTCCAAAACTTGTTCATCAATCAACT TGATATTTATATGACATGTTCAAACAAGTCATCTGATGATATTTAGCTAT CAAACTTTAATTTTAGACTTAGTCATACCTTAGAAATAGTCAAGGGAAAA ATATTAACAGATTTTTTTTCAAAAATGTTTCATTCCAATTGTTTTCCAAA AATGTCTATTTTTTTAAAAACAGTGCTAATTTTTTAGTATATGATTTTTG ATCTTGGAAAGTACATGCCTTAGGAAAGATTTAATAACAATTTTGATGAC AACATGTTGAAATAAGATGAGAAAATATATTATTCATTTGTGATTTTCAC TGTTTCATCAAATTTTGGGCCAAAATGGGCCATTTATTGACCTTTCAAGA ACCAATATCTTTCCAGCACATTCACAAAACCCTGTGATGTTATATATCAT TGAAAGCAAAATTTTAAATAGATTCTAAATATCTAACTTTCAAAATTGAC AACTTTGTTGGGTGAGAGCTATAGTGCTTTAAGTAGTTTTTTCAACAGCT GGGACGAGCTTTTTGCTTATTGCTAAATGGTGGCCGAATTGCCGTCCCCC ATGTTTTCTCACATAGTCCCAAGTTAGACAGCTAATTACACTAGGAAATC TAGCTTTCAGAAAAATTGACATCAGTCATCTACAGGATGTAATTGCAACA ACAAAGATGAGAGTTACCTGAATCAAGCTCAAGTTCCCAAGACAATTAAT TAAAACTTGAAAACTTAAAATGAGACAAAATGAGACAAAATGACCGATTG CGAACGTGCAGCAGCCAGAATATCAACAAGCCAAATTTTGTCATTCAATT CCTGAGACAGCGCTTCAACTTTTAAGGCCTTGTTTATACGCTAAAGTAAA AATAATTCCGCAAGAAGTTTTGCGGCGCATTTTTTTGCTTGCGAGTCAAG TAAACGATATAGCGCTTTCGCAGCATTAATCTTTGATACGCATTTTGGCG GGAAGCTAGTGTGACTAACTGTTAGAGCAGTTGACTGTAGTTTCCCCCCT CTTTTTTGCTTTTCCCCCAGAAAATTCTGAAAATATCAGTTCCCCCATAT ACCCATATAAATTTCTCAAATTTCAACCTGACACAAACGTAAAATTTTGC TGCAATTTTTCAATCATGATCTAATCACATGATATCATTTTAGCTTGAGT AAACGGAGACCTGCTGTATATTTTTGGAAAGCTCTCAAAAAATTTTGAAA TTAGAGATATATTGCGAGTATAGGTAATTTCAGTACCCAACTCATGATAT TGAGCTTCAAAAAGCGTAAAAGCTGAAAAAAAAACAGTTGTTTCTGGCTG AAAACACTATTTTTAATTTGGACTTTAATTTCTTCTTTTAATTTTGACAC CCTTCTTTAAAGATAGGAATGATCAGAAGGTCTGGATCACTGATAGACAA AAGACTTTTTTCAATCTGATAGCTAAAAGCAATGGGGAAAGAGTTTCCAT CAGCAATTGCAACCTTCCTATTATTTCTTTCTGTAAAGAAGAGTTTCGAA ATTAGTAGAGGGATGTCGGCATTAGACCAACTTACAGTATCTGGTCTGCA AAGCTACGAGTAGATTTTTTAAACAGCTTATTTAGAAGCTTTTATTTGTA AACATTTTAAAGACCAGCTATGCCAGAATCAGACAAGGCATGCTGGCATT ACATGAAGTTACGATAAAATTTGTGTCCTGTCGTCAAGTCATCGAACCAA AAATTGGAAAAAACTGGTTTTGAACAGTTTCTGATCCTAAAGTAAAGAGC TATTTTTTGTAAAAGCTGTGCAATTCATGTGTGGATTGCATATCCAATCA GTTGCCTAGGTTTTCAGTAATACAAACAGGGACGGTTTCAAGTATTCTTT AAAGCCCTATGACCAATCCACCCCTTAATAATTAATTAAGATTGTAAAAA TTAATTGTTACTACTAATCAGATTGGTAAACTATGTCTATGACAGCAAAT CTTTTTTTTTACTTCAGAGTGGTCAATATAATGAAGATATGATTCCTACA 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TGATTCCTTTGTTAAATGCACTGAGCTTTATATAATATAGACCCTGGACA AAGTGACTCAATCCCGGCCAAGCAACAAAATAGAGTTTTTTAAAGTAGTA CCCTAATGGTATCACTACTAATCAATAGCGGTGTAAATGCATTGAGATCG CTAGATCTACTTTTCCTTGGATGCTTTTAATGATTGCAGCACCAATGTAA AATGTTTACCACTGCAATGGCTTCTTTGCGGGTACCACTTAGAAAAAACT CTGATCAAAAATGGCGGATGTAGCTTTGTCCAGGGTTTATAAAGGTCAGT GGTTAAATGTTTAGTGCAACAAGGTCAAAAGATTGAGGACTGAAGTGAGA TTTATTACCACTTTTGAGCCGTCAACTTTTGAAAAAATATTTGTTTCTAA ATGGGTTTTGGTAGGATTTCATTTGGTTTGTTTCAGATGCTACCAAAAGA GAATTCTGTGTTATCTTATCTCTGCCATTCCCCTCACATAGTTACCGGGA AGTAAAGGGGTTATATGCTTTTCGATGGCCAGCAATCAATTCTGTGATGA GGAAGGGCTTGAGAGATGAGAAATTAAACTCTCCCTCTACGTCGTCAAAT ACCAGGACTGATAGATTTAGCAATTATGTGCAATTTTCGTATCGTGAATC TTCAAAGAAATTTTCTTGCCTCTATTTAATCAATGAAATATTTATAATTT GTCTTAATACTTTTCTTTAGATGTTGGTATTGGGAAACAAGAGAGATTTA CCAAACGCATACACTGAAAAAGAACTCATCGAAAAATTGTAAGTATTTTT CAAGACACGTGTATTCTACTAGCAATGATTGTCCAAAACTTTTGTATGCA GTTAATTTGAACGAGGAATTTAATTTGTTCGAATTACAGAAAGATTCGAA TTATAGAAAGCATTTACTCTTTGACAGAGAATTACTTCGAACTATAGAGA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000292_pilon:198447..212583-

>XLOC_006275 ID=XLOC_006275|Name=XLOC_006275|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1110bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000292_pilon:198447..212583- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCCTTCGTTCAAAGGTTTATCGACTGGATCAAAAGTCTTTTTTGGAA
GGAAGAGATGGAGCTTACTCTTGTTGGTCTCCAGTTTTCCGGAAAAACTA
CATTTGTCAATGTTATTGCGATGGCCTTCGTTCAAAGGTTTATCGACTGG
ATCAAAAGTCTTTTTTGGAAGGAAGAGATGGAGCTTACTCTTGTTGGTCT
CCAGTTTTCCGGAAAAACTACATTTGTCAATGTTATTGCGAGTGGTCAAT
ATAATGAAGATATGATTCCTACAGTTGGTTTTAACATGCGTAAAGTTACA
AAAGGAAATGTTACAATAAAAAGTGGTCAATATAATGAAGATATGATTCC
TACAGTTGGTTTTAACATGCGTAAAGTTACAAAAGGAAATGTTACAATAA
AACTTTGGGATATTGGAGGTCAACCACGATTCCGAACCATGTGGGAACGA
TATTGTCGTGGAGTAAATTGCATAGTCTTTGGGATATTGGAGGTCAACCA
CGATTCCGAACCATGTGGGAACGATATTGTCGTGGAGTAAATTGCATAGT
ATATATGGTTGATGCAGCCGATCACGATAAAACAGAATTAGCAAAACAAG
AATTACATGGATTATTACAAAAACCACAACTCGCTGGAATCCCTATATAT
GGTTGATGCAGCCGATCACGATAAAACAGAATTAGCAAAACAAGAATTAC
ATGGATTATTACAAAAACCACAACTCGCTGGAATCCCTATGTTGGTATTG
GGAAACAAGAGAGATTTACCAAACGCATACACTGAAAAAGAACTCATCGA
AAAATTATGTTGGTATTGGGAAACAAGAGAGATTTACCAAACGCATACAC
TGAAAAAGAACTCATCGAAAAATTAAATTTGGGAACTGTGCAAGATCGCG
AGATTTGTTGCTACTCAATATCCTGTAAAGAACGAGATAATATCGAAATT
TGGGAACTGTGCAAGATCGCGAGATTTGTTGCTACTCAATATCCTGTAAA
GAACGAGATAATATCGATATCACATTGCAATGGTTAATCCAACACTCCAA
ATCGAGGACTTAGATATCACATTGCAATGGTTAATCCAACACTCCAAATC
GAGGACTTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_006275XLOC_006275-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000292_pilongenomesc0000292_pilon:198447..212583 -
Properties
Property NameValue
Aaloc511-555:46
Aaloc439-507:528
Aaloc370-435:1068
Aaloc277-369:1890
Aaloc202-273:2182
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Aaloc1-120:14138