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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000292_pilon:222461..227791- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_006273 ID=XLOC_006273|Name=XLOC_006273|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5331bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000292_pilon:222461..227791- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTAACCATGCAAGAAATTATCAACGAAGAAATGGAAGGTATGAATTT
GATGATTTTGATTTTTCTGAACGTCCGGGACATCCATAAGACGTTTGATG
AATGTTCAAATAATGTAGTGTCTCGGTTGACGAAATTTCGCAAAATTCAC
CAAAACCAGTTCCCTTTAGGTAGTCGTTATGTTATAACTTATCAGGGAAA
ACTTCGTCAGGGAAATTTTTCGTTGGGGAAAAATATTCATCACTTAGCCA
AAATGACGTCACTTTTTCCAGACGAAGATTTTCCCGATTGGGTATTCGCT
TTAAAGTAAGGATTCCCAAATTAAAAGGATTCATTCAGTTAGCACCATCA
TGGTGTTATAAAAAGTGATTAAGAACATCATACGTTTGACTTTATGGTTT
GGCTTCTTCTTTTTTGAATCTTCTGAATTGATAGATTGGAAAAGTTTGAA
CGTGTTAGCGGGAAAGTGTTCGTCTTCATGTCCAAGGCTACTCGTAAATT
TTTCTCTTTGCTTTTGTCAAAACATATCATTAAACGTTTGAGATTAATTC
CATTAATATTTGTAATTGGCTTGTAATATATGTACGCTGGAAAATAGATT
TTTATATGGAGTATAATACGCTTCAACAGCTTATCAACGATTTAGAGTAT
GTAACAGAATTTAACAAGCGCTTTTATGCCTGGCGAGAGACGAGATTTAT
CTATTTGCACATATATCAAGATTTTGCTGGCAATTTCCATCTCATTAAAT
TAGTAACTCAAAAACATATCAAGATTTCCGGATACAATGTGATGTTTTTA
CGGTACGATTGAGATCAAGGATGTAGATTATTAAGAACTACAGCAGTCTT
GACTCAACATGGAAATTGAAAATTATGTAAAATTTAATCACCGCCTGCAA
AAGCAAAAATAGTAGAATTTTTCATTATGAAAATGTCACATATAAAGTTT
GTTAGGGAGCTATGGTACATACTGATATAGACTGCTGTTCTAGTGGAAAG
GTTATAAACTAAAATTTGAACCTAAAATATTTGATTGATGTTTAAATTTT
TCACATCTGATATACAGTACTTCTATCGGAGGTGACAGAAAGCTAGTAAA
GACAAACTTTTACTGGTTTTTAGACTAGATCAGGTCAAAGTTATTATTTC
GGCCACGATAAATTGTGTAAAAAGAGTGGTCAACTGATTGGCATTCTCCA
ATAACATCTGCTGGAAACAATTTTTTAGTTTCTTTTCAACTTTAGAGAAT
TCCAAGATGGGATGGGACACACATTTTGATGGTGTCATCTTACTGTCAAA
AGGAGTTTTACTATTTGTGTGAGAAGTATGTCGAAAAAATGACAAATCTC
TGTTTCTCTTTTCTTTGGGAACACTTTGAAATTATTTTGTCCCATTTTTT
AGTACTTTGTATTGAAGCTGACTCTGATTTTACCACAGTCCGGTTTTGAT
TTCCCTCAAATTAAAGATTTGATCTTGTAGAAATTTGCCATCTGCCTTAA
TTGCTTTAAGCTTTTCTAATGACTCCTTCAATGTTTTTAAAGCATGTTCT
TATAAAAGATTATATACGTTCTAGTCTTTTCAGTGATATGTAGTGTCAGT
TTAACATCTAGGTTATAACTTTCTTTTGATGGGTTTTAAAACCCTCAAAG
AAAAAGATAGTATAGATTTTTAACGGTGATTAAAGTCTACATGCGACATA
ATGAAATGAACTCATAAATCCTTAAAGTTTATAATTTGGGACAATTTTCA
CGAGTCTTAAAAGATTAAAAAACAAATTCTAAAGAAGGGGTCCTTTTAGT
ACACTTTTGCGTGTTGGTAGAGTAAGATCATAACATTAAACTTGATTGAA
ATTTGGATAGTGTCGATGGTGCCATACATGAAAACTTATACATAGGGAGA
CAATGCCTTTCTTTGGAGAACGCCCTGAAAGTGCTATAACTATCTCATCC
ACCGTATCGAACATCCAAGGTACAATTGACTGAACGGTTGAATTAATGAT
AAGCGTCTCCAGGACATTACATTGTTTTAACGATATATTAGGATTATATT
TTTAATTTGTGCATGATTTACGGTTGTATTTCAATAGATCTTTTATTAGA
GTTTTAGAGTCTTTGATTTTTCTAAAACACCTATGCGTTGTGGGATTGTT
TCGGGGGTATTACAAAAGAAATCTCTTAGGAATTCCTCGAGAGAATTCTT
CCCACAATGCATCGCTGTTCTAGAAAAATCAAAAACTCTGATAAGGTCTA
TTGAAGCTATGACTTGGGAAATTTAACTATTTCTTTAATTGACTCGGTTA
ACAGTGAACTTCTCCATAGTTTATAACCTCTTAATCCCCATTTATTTCCT
TAGAAATTCTTTCTTCTCTTTAGAAATTGCCAATGCAGATGTGGAGAGCA
ATCCTGAACGTGTCGTTGCTAAGGGTTACGGTAAGAAAGTAAACATTCTC
GATGACAAGGACAATTTATGAATACCATTGAATTTGATTTGATGCTCAAT
GCTCTTTTCTTATTGTTCTGTCATATCCTTTTTCAAAATATTCTCTCAAA
ATGTTGACTTTACCTATAGGTTTTAAGAGGCTTAAAGTTGAGTCATTTTA
TAAGCAATTTGGGAGGCTTAGATTGTTCTTAATTTGTTCTCAAATTTAGA
ACAGAAATGCGAATTGTGAATTTTGAATTTACTAGTGGATTTGGAAACTT
CTTTTTTTCATTAAACTGTTTACATTCTCTATACAGAATTTTTGCTTTTC
AATTATTCTTTCTTCAGTTTGGTGAAGGTCTGCTATTCAGACTAGGTTTT
ATCGTTTGGTATATCTTACTAAGTACATACAAAGTTTATTGGTATTCTTC
CTTGTAATAAAATTCCAATGGTTTGCATGCAGTGCTCGCAATAACTTTAA
CTTGATTCCCCACAGGCCTTGTTACGGGGATTGCAAGTCAACCAAACAGT
TTCAAATTAGATGCACGTGAAGCTGGCTATGGTGATTTCGACGTCGTCAT
TAAAGGAGCCTCACGCGCGTCCATTGAGTACATCGAAGAAGAAGAAGCTC
TATACAAAATTAAATATTTTGTCGAGCTTCCTGGTCTTTACCAGATTGAA
ATCAAATATGATTTGAAACATATCCCAGGTAAGTGGAGTGGAAACCAGTT
GGTACACAACGTTGTTTCAACGTTAATAAAACGTTATACGGGCGTTGTGA
ACGTTAGATAAACGTTGAAACAACTTTGACTTGTGCCTGCTGGGGATACC
ATCAATTATCATAACTTGCAAAAACAACTTATTAATAGCAAGGTTAAGCA
AATGTTTATTTAGACCGTTCAATGCGATACTGTAGGCCTGTACATAAGAT
TTCACTTGCATGGTTTGCTTTTATGTAATGGCCTACGGTATCGCACTTTA
CGGTCAAAATAAACCCGTGATTAACCTTGCTAATGCACCTTTAGTGGGGA
GATTTTACAAGCTCTTATTTGATTTGGTTGGTCGTTAACCAGTAATAAAA
CAATTTTGTTAATTTTTTAAAAAGAACGCGTCATTTTTATTATTTCGAAT
GACCAATTATTAAAGTATCTTATAAAAACTCCATCTAATCTCGTATAGTG
CCCTTGGAAGGAACACATCACTTTTACCACCAGCATCTGCAAACCTCAAA
AGATATGCGTAACAAATTAGGATCAGCCTCAATTGACTTTAAAAAATGTA
GTGCTTTTGCTTATCTTGGAAAGTGCTTGAATCCTTAACAGCACTATTTG
GTACCCCTATCATCTTAACTTTAATTTTTAGGGAGTCCTTTTACAGCCAA
AGTGATTGATGGAAGTACCATGGAAAACCAGAGTATTTGCAAGACAGAGG
GGACCAACAGTACAGAATCATTCTCAACCATCAATGAGACAGCTCCAAGC
GATGAAGAACCACCCACAGCTAACAACAATGGAAAATCTTTACCAATATT
TGCGGATATCAAGCTCCCGAGCGGTAAAACAATCATTGGAACCTGCGTTC
AAAACGCGGCTGGAAAGGTCACTGTTAATTTCCCGCGGGAAGAGACTGGA
ACTTACACAGTGACTCTCAAACATAAAAAGAGCGGGAAAATACTACCCGG
TTCTCCTTATGAAGTAAGCGTCCAGGCTAAACCACAAAAAACAACCATGA
CAGCTTACGGAACGGGGCTAAAGGAAGCTTCTATTGATAAAACAAATTGC
TTCACTGTTTTCGGATCAAAAGGGGTCGAGATAACCGATGTTTGTATCTT
AGTATTCGGGCCTTATTCGTGCAAACTCAAAGTAGTACAAAATGACTGGG
ATTCGTTTGATATTCTATACGAAGTCAAACGAAGTGGTTCTTATCAATTC
TACATCCATGAAAATGGTCGTGATATCCCTGGTAGCCCTTTTATCGTTAT
TGCTAAGGGAACTTCGCAGAATTCAACACAAATCTTATCCTCGTACGTGG
CTACAGTTTGGCACGGACAACCTTCAACTAACTTGAAAACAATCACTGAT
ATGACGTCACCGAGTGGACAAAAAGTATCCCATTCGCTCGCGCGGAAAGG
TAAACATGTAATGGAGATACGCTTTCTGCCCTCGCAGAACGGTATCTTTA
TATTGGATTTGTTTAAAGGACAACGTGACATGGAACAAGTTTTCAACATT
CGTGTTGAAGCTCTACCCTCTTCCAACGAAAGTGTTTTTCAAATATCGGG
AGATGGCCTTCACACGGCTACGGTTAATAAACCATCAAGTGTTAAAATCC
ATTCCGTTCTACCATCTTTGAAATCGTTTTCCATAGAATTTGACGGTCCT
GGTGCCGTAGATATTGTCCAACAGAAATCGGATAAATCATCTTCAGGATG
CGCTATTGAATATGTTGGGCGTGTGCCTGGATCTTATGCTATGTCTATCA
AATATGACGGATTCCATGTCGAGGGAAGCCCTTTTGATGTGACTATTTTG
CCGGCACACGGAATGATCAGTGACGTTCCATTTAATATGAACTCCGTGAA
GCAACAAAAATCTTCGAAACCAAATGCTAAAGCTTGTATCGTTCAAGGTG
ATCAGCTCCATAGAGCCTATTTAGATAAAGCAAAGACTTTCACTATCGAT
ACTTCGAAGGCGGGAGAAGGTGTTTTGATGGCGGGGTTTCACACCTCACT
TTCCGCCACTGAAGTCAAATGTAAACACTTGGGTAATTCTGTTTATGAGG
TACAATACATGATCGGGGAAATCGGATTACATAAGTTATCCGTATTTTGG
AGCGGGGAAAATATCGTTGGTAGCCCGTTTGAGATAATTGTGATTGATGA
GAACAATAACGCAGAAAGTTCGTCGTGTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000292_pilon:222461..227791- >XLOC_006273 ID=XLOC_006273|Name=XLOC_006273|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3720bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000292_pilon:222461..227791- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTAACCATGCAAGAAATTATCAACGAAGAAATGGAAGATGGTAACCA
TGCAAGAAATTATCAACGAAGAAATGGAAGAAATTGCCAATGCAGATGTG
GAGAGCAATCCTGAACGTGTCGTTGCTAAGGGTTACGAAATTGCCAATGC
AGATGTGGAGAGCAATCCTGAACGTGTCGTTGCTAAGGGTTACGGCCTTG
TTACGGGGATTGCAAGTCAACCAAACAGTTTCAAATTAGATGCACGTGAA
GCTGGCTATGGTGATTTCGACGTCGTCATTAAAGGAGCCTCACGCGCGTC
CATTGAGTACATCGAAGAAGAAGAAGCTCTATACAAAATTAAATATTTTG
TCGAGCTTCCTGGTCTTTACCAGATTGAAATCAAATATGATTTGAAACAT
ATCCCAGGCCTTGTTACGGGGATTGCAAGTCAACCAAACAGTTTCAAATT
AGATGCACGTGAAGCTGGCTATGGTGATTTCGACGTCGTCATTAAAGGAG
CCTCACGCGCGTCCATTGAGTACATCGAAGAAGAAGAAGCTCTATACAAA
ATTAAATATTTTGTCGAGCTTCCTGGTCTTTACCAGATTGAAATCAAATA
TGATTTGAAACATATCCCAGGGAGTCCTTTTACAGCCAAAGTGATTGATG
GAAGTACCATGGAAAACCAGAGTATTTGCAAGACAGAGGGGACCAACAGT
ACAGAATCATTCTCAACCATCAATGAGACAGCTCCAAGCGATGAAGAACC
ACCCACAGCTAACAACAATGGAAAATCTTTACCAATATTTGCGGATATCA
AGCTCCCGAGCGGTAAAACAATCATTGGAACCTGCGTTCAAAACGCGGCT
GGAAAGGTCACTGTTAATTTCCCGCGGGAAGAGACTGGAACTTACACAGT
GACTCTCAAACATAAAAAGAGCGGGAAAATACTACCCGGTTCTCCTTATG
AAGTAAGCGTCCAGGCTAAACCACAAAAAACAACCATGACAGCTTACGGA
ACGGGGCTAAAGGAAGCTTCTATTGATAAAACAAATTGCTTCACTGTTTT
CGGATCAAAAGGGGTCGAGATAACCGATGTTTGTATCTTAGTATTCGGGC
CTTATTCGTGCAAACTCAAAGTAGTACAAAATGACTGGGATTCGTTTGAT
ATTCTATACGAAGTCAAACGAAGTGGTTCTTATCAATTCTACATCCATGA
AAATGGTCGTGATATCCCTGGTAGCCCTTTTATCGTTATTGCTAAGGGAA
CTTCGCAGAATTCAACACAAATCTTATCCTCGTACGTGGCTACAGTTTGG
CACGGACAACCTTCAACTAACTTGAAAACAATCACTGATATGACGTCACC
GAGTGGACAAAAAGTATCCCATTCGCTCGCGCGGAAAGGTAAACATGTAA
TGGAGATACGCTTTCTGCCCTCGCAGAACGGTATCTTTATATTGGATTTG
TTTAAAGGACAACGTGACATGGAACAAGTTTTCAACATTCGTGTTGAAGC
TCTACCCTCTTCCAACGAAAGTGTTTTTCAAATATCGGGAGATGGCCTTC
ACACGGCTACGGTTAATAAACCATCAAGTGTTAAAATCCATTCCGTTCTA
CCATCTTTGAAATCGTTTTCCATAGAATTTGACGGTCCTGGTGCCGTAGA
TATTGTCCAACAGAAATCGGATAAATCATCTTCAGGATGCGCTATTGAAT
ATGTTGGGCGTGTGCCTGGATCTTATGCTATGTCTATCAAATATGACGGA
TTCCATGTCGAGGGAAGCCCTTTTGATGTGACTATTTTGCCGGCACACGG
AATGATCAGTGACGTTCCATTTAATATGAACTCCGTGAAGCAACAAAAAT
CTTCGAAACCAAATGCTAAAGCTTGTATCGTTCAAGGTGATCAGCTCCAT
AGAGCCTATTTAGATAAAGCAAAGACTTTCACTATCGATACTTCGAAGGC
GGGAGAAGGTGTTTTGATGGCGGGGTTTCACACCTCACTTTCCGCCACTG
AAGTCAAATGTAAACACTTGGGTAATTCTGTTTATGAGGTACAATACATG
ATCGGGGAAATCGGATTACATAAGTTATCCGTATTTTGGAGCGGGGAAAA
TATCGTTGGTAGCCCGTTTGAGATAATTGTGATTGATGAGAACAATAACG
CAGAAAGTTCGTCGTGTTAAGGAGTCCTTTTACAGCCAAAGTGATTGATG
GAAGTACCATGGAAAACCAGAGTATTTGCAAGACAGAGGGGACCAACAGT
ACAGAATCATTCTCAACCATCAATGAGACAGCTCCAAGCGATGAAGAACC
ACCCACAGCTAACAACAATGGAAAATCTTTACCAATATTTGCGGATATCA
AGCTCCCGAGCGGTAAAACAATCATTGGAACCTGCGTTCAAAACGCGGCT
GGAAAGGTCACTGTTAATTTCCCGCGGGAAGAGACTGGAACTTACACAGT
GACTCTCAAACATAAAAAGAGCGGGAAAATACTACCCGGTTCTCCTTATG
AAGTAAGCGTCCAGGCTAAACCACAAAAAACAACCATGACAGCTTACGGA
ACGGGGCTAAAGGAAGCTTCTATTGATAAAACAAATTGCTTCACTGTTTT
CGGATCAAAAGGGGTCGAGATAACCGATGTTTGTATCTTAGTATTCGGGC
CTTATTCGTGCAAACTCAAAGTAGTACAAAATGACTGGGATTCGTTTGAT
ATTCTATACGAAGTCAAACGAAGTGGTTCTTATCAATTCTACATCCATGA
AAATGGTCGTGATATCCCTGGTAGCCCTTTTATCGTTATTGCTAAGGGAA
CTTCGCAGAATTCAACACAAATCTTATCCTCGTACGTGGCTACAGTTTGG
CACGGACAACCTTCAACTAACTTGAAAACAATCACTGATATGACGTCACC
GAGTGGACAAAAAGTATCCCATTCGCTCGCGCGGAAAGGTAAACATGTAA
TGGAGATACGCTTTCTGCCCTCGCAGAACGGTATCTTTATATTGGATTTG
TTTAAAGGACAACGTGACATGGAACAAGTTTTCAACATTCGTGTTGAAGC
TCTACCCTCTTCCAACGAAAGTGTTTTTCAAATATCGGGAGATGGCCTTC
ACACGGCTACGGTTAATAAACCATCAAGTGTTAAAATCCATTCCGTTCTA
CCATCTTTGAAATCGTTTTCCATAGAATTTGACGGTCCTGGTGCCGTAGA
TATTGTCCAACAGAAATCGGATAAATCATCTTCAGGATGCGCTATTGAAT
ATGTTGGGCGTGTGCCTGGATCTTATGCTATGTCTATCAAATATGACGGA
TTCCATGTCGAGGGAAGCCCTTTTGATGTGACTATTTTGCCGGCACACGG
AATGATCAGTGACGTTCCATTTAATATGAACTCCGTGAAGCAACAAAAAT
CTTCGAAACCAAATGCTAAAGCTTGTATCGTTCAAGGTGATCAGCTCCAT
AGAGCCTATTTAGATAAAGCAAAGACTTTCACTATCGATACTTCGAAGGC
GGGAGAAGGTGTTTTGATGGCGGGGTTTCACACCTCACTTTCCGCCACTG
AAGTCAAATGTAAACACTTGGGTAATTCTGTTTATGAGGTACAATACATG
ATCGGGGAAATCGGATTACATAAGTTATCCGTATTTTGGAGCGGGGAAAA
TATCGTTGGTAGCCCGTTTGAGATAATTGTGATTGATGAGAACAATAACG
CAGAAAGTTCGTCGTGTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000292_pilon | genome | sc0000292_pilon:222461..227791 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 313-1860:1549 |
| Aaloc | 100-309:2415 |
| Aaloc | 43-96:2957 |
| Aaloc | 1-39:5332 |
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