XLOC_006270 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_006270
Unique NameXLOC_006270
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000292_pilon:327428..341672-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_006270 ID=XLOC_006270|Name=XLOC_006270|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14245bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000292_pilon:327428..341672- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AAGTTAAGTTGTACTAGGTTTAAAGAATGGTTTTTAGAAATTTTCATTTT GTCCTCTAATACGAAAAGACCCTCGATATAATATTTTTCATAATTTTTCA AAAATTAAGTTAAATACTTTGTCTGTAATTGTGCCAAAATTTTCAATTTT TCATTCGATTCGTAATAGTAATGATATGACATTGAGGGAAATTAGGGATT AATACCCCGAGTTTCATTTTGAAATAGTTTGAAATAGCTCCAACGAACTG AAAAATAATCCATTATACAACAATATTATTGGAACGAGGATTCTTCATAA AAATTGTATTTTCGGCTCCTTTGCAAAGACGCCTGTATTATTATCAGCAA GTATCCAAGTTCATAATCAGTGCCATTATTCTTTCTTTCGTATCTCCACA CAAAATGGTCACAAATGAAGTGTTCAAATTAGCTATATGGTTCGTATTCG GATATGCTCTCCCATTCTATCTCCTCAAGTCCACGAAACTCATTTCTGAA AAGCATTTGTCTAAATGTTCGCGTTTTTGTTTTTAGAATTTTGCCATAAT AAAAGAACAACATCATCCAACAGCTTGACAAATTCAACAAATTCTTCTTT GTACTTTGTTCTTGTACTTTTCCTCCTTTGACCAGACAGCTATACTCAAA ATATTTTTGTATCAAATACTGTTTACTTTTTGTGATCGAATAATGCCAAA AATATTCGAATGTTTTGGAAATTCGAACGTTCATTTCGCGTGAAATTATG TCAGGAGAAAATGGTTTTGATCAAAAATATTCAGGCGGGAGCGGGGTATT ACAAATCAAGCGGGGTATTACGAAATAATACCCCGCCGAAGGATAAGGGC ACGCAACCTAAACAAAATCAGTCATATAATTATATTAGGAATAGGAAATT CTTCGTTTTCACATACAAAAATATAAATACCAAACAGTTTAAAGAAAATT 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TAAAGAATTAGAGAGCGTCAACTGTATCTAAATTATCTAATATAAGCTTT ATAGATATTTTCTAAGCTAAATTAAATATTCCATGCTGTTCATGAAATTA CATTATTCTTTTTACGCCGGCCTTGATTCCGCAACAGGCCGGAAAAAAAA ACGGCAATAAGAGCTGACGTAAAAGAGGCGATAAGGTAAAGAGAAGGAGT GGAAAAAGAGAATTATGATGCCAACCTGAAAGCATTATCAATAGCGGTCA TTCCAAACTCGGGAACAAGAGTGAGTTCATGTTGACAAGGGTCAAATTCC GCTTCAAATATTTCCGGCATGATTCCAATCTTGCGTAAATTTCTCATCGT ATCATAGACGATTGTTCTCGTTTCATTTTCAACAGATTAGAAGTTATTAT CATCGAAAAGAGGCTTCAATGTTTTTGCGTCCACCAAGTAGAACTCGTTT TCAAAAGTGCTATACAGTTGGTAACCCATCGCCTCCAGTTTCTGGAGTTG GTTTTTGCATTGCCATCGTGAAGATGCTTGTTGAATACCAGGAAGGGCGA CATCGCATAATACACTTGCTGTACTGTCTAGCCACGGCAAAACCTAGAAA AAATAAAAATGCTACAACTATCCACATTTTTATAAGAACCAACAAACTCT GGCTGAGACTCAGCTTTTGTTCTTATTAAACTCGGTTTTAAAACGGTTAA GGAGTTTCTTAAAATCAGTGTTTCAGTTCATTTGTAATTGTGCGTAAATC CGATTAATCGCGATAGTCGGGTTTGATTTCCCGATCTTCCCGGTTTGTTT TCCCGATTTGGTTTGCGTTTGCGCTTGCACTTACTAGGATATACTCTTTT AAATTTTATGTTAGATATATTAAGAAAGGCTGACCACGATAAAGATGTTT GCGTAATGGTTTGCTATTTAAAAATGAGAATTACCGGAGTTTGCAGCCAG 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CTGTTTCTTCTTATTCATGTTTTCATGTAACAGAGAGCTGTATGTTCACT AGAAAATGGTGGGTTACCCTATTTTTGTTGGAGGATTTCTCCACGCCATG TAGATCGGCCCTTTCGGCTTTAGCAAAGTGAGCGCAAGCAAGCGGACTGC ATTCTGATCTAAGAATGCAAATTGCTCTAGGGAGACCAGGCTGTAAACCA GAACGTAAAATATCTAAAACTAGACTGTGAAATAGTTTACAGCCTGGATA TCCAGGCTATCTAATTATCTGATCCCCTTGAAAAGATAAAAAGGTTAGTC ATTTCATGCCTATTGTGAATGCAGGACGGATATGTTTTGAATAATTTGAC TGGTCGAAATATCTCAGTTTTAGCCGAAAAAAAGGAATCTACGAAACCAA ACAGAAATCGTCAAAAGCAAATGCACCAATTCTTGAACTTATTTAAACAA ACCTACAAATTCAAAAAGAACTGAAAATACAGCGACGATAATAAATTAAG CTTTAATAAAACACACCTCTTACACACAGGATACTCACTCACGTCTCTCA GTGTTGAACTGATTTCTATGTACAAATTACAGTTTATAAATATACCCTAA TCTCCCTAGAGAATTGGTAAATGACGTATTAAAAGAACATGATTTGGGAA TACAAAACTGACTACTGGGTGGTTGTTTGCATGTACCTGCCTCTTTATTG TTATTTTAGGCAGTTTTGTTTAATGTATAATGTTAAGTTGATTATGTGCA TATTTTGCTTGTCTGCCTGGGTTTCCAAGAAAGTTTTAAGCTTCTGTCAA CAAGGGTTCACTCACAGACAGTATCAAACAAACTGTATCAGGCTGTGCAC TAAAGTATCACAGGAAAAAATTTTCGATTTCCAAGGTTGGAAATTCAATA TTTTTGGGTTGGAAATTTTGGTTTTATAATTGAAGGTTGGAAATTTGAGC GATTACCTTAAGCTGATTTGGAAAACGTAAATTACCCATAGGTTTTGTAG AATAAACCAATGCCCTTGAAAAATCAAGTGAAAAAAACCCATGTAGAAAT GACAATTTTCCAAGGCTGGTTGGAAAACATGACTTTTTGGGTGGGAAATT TTTATTTTCCAAACAGTTTGGGAATTGAAAAAAAAGGTCAAAAATGGATG TGAAAATACATATTTTTGTAAATTTGATACCTCAATTTGAAAAACTAGAC TTTTTGGGTCGGAAATTTGTGTTTGTCCCAAACAGTTTGGAAAACGTTAA AAATCCATGTGGAAATTACATTTTTCTAAGATTGAGATCCTTTCTTGGAA AACTAGACTTTTTGGGTTGGAAATTTGTGTTTCTCCAAACAGTTTGGAAA ACGTTAAAAATCCATGTGGAAATTACATTTTTCTAAGATTGAGATCCTTT CTTGGAAAACTAGACTTTTTGGGTTGGAAATTTGTGTTTCTCCAAACAGT TTGGAAAACGTTAAAAATCCATGTGAAAATTACATTTTTGTGAAATTGAA ACTCTTTCGATTGGAAAACTAGACTTTTTGGGTTGGAAATTTGTGTTTCT CCAAACAGTTTGGAAAACGTTAAAAATCCATGTGGAAATTACGTTTTTCT AACCATTTTCTGCGCATGTCCTTGGGAAAACCACAAGCGATTTTTCGCTC AAAACTGTTTTGATGTATAGCTAACCAAGATATTAACGTCTATTCACGAT AAGTGTGCACTCTTTTTTCATTTACCTATAACTTTCGAAGGAATTCTTCA ATCTTTATAAATTTGGTATCATTGGAAAGATATTAGTTAGTGGAACAATT TGAAATAAAAAAATCTTTAAAATAATTCTAAAAATGAAGATGAAAATGAA GAAGAAAAAAATGAAGATCTTATAGAAAAGTGCTATAACTATCATTTTCA CTGAAGTGAAACCTTGATTATCGAACGTCATCACTGTGAAAAAATTTCTC AAAAATAATCATTCAGTCAAAAGATATCAAACAAAGTTATAAGCTAATTG ACGTCTAAAAACGCTGTTTTCTGCTGTTTTCTGCTATTTTTTGGGGTCAA TCACTTATCAACTTTGTATCATAACTTTGTATTGAATAAATATTTTAGTG AAATTTCTTCACAGTGATGACCTCCAAAGATCAAAAAATCTCTCCAGTGA AAATAAAGGTTATAGCACTTTTCTACAAGATCTTCATTTTTTTCTTCTTC ATTTCATCTTCATTTTAAGAATTCTTTTGAAGATTTTTTTATTTCAAATT GTTCCACTCACAAATATCTCTCCAACGATACCAAATTTATGAAGATTGAA GAATTCCTTCAAAAGTTATAGGTAAAAGAAAAAAGAGTGCACACTTATCG TGAATAGACTTTAGGCTATAGTGTGAGCAGTCAAGCTGTAAGTTTCCGTC AGGTGAGGCGTCTCTTCGGAGCGGCCTCGGTCAATCGCAGTGAGTTCGCA CAGTGAAGCACATAGGGTACTTGTGTCATAGTTTCAAATAGTGCCCTGCT GAGCTGTGTGAGTGATCTAAGATCTACCACGTATCTGTGCGAACAATAAC GAGAGATTGACCGGGAGCCATCGAGCCTAGGCTAGCGAGTGACTGTTCAT AAAAACAAAAACCTTGTTTAAGATCTCTTTTCCACATCTCTGCCATCACT TTTTGGATTTTGGCTTTTTCAACCTGAATTTTCGAAATTTCCAACCTTGC TTAGCTTGGATTTTGGCTTTTTTCCAACTGAATTTACAAAAATTCCAACC TTGTATTTCGGCTATTTTCCACCTGGATTTTTGAAAATTCAAACCTTATT AAATTTGGATTTTGGCTTTTTTCCAACTGAATTTTAAAAAATTCCAACCT GGTTAAATTTGGATTTTGGCTTTTTTCAACCTGGATTTTTGAAAATTACA AGCCATGGAAAATGCAAAATTTCCAACCTTGGAGAATGTCCCACATTTTC AGGTTGGATTTTCCATTGGATTTTATCTTTTTTCCAACTAAGAAAACTTG AAGTTTCCAACCTTGGAAATCGAAAATTTTTTCCTGTGTATGTCTCAATA TAATTTGCAGCGGAGACAAAAAAGACTAACTTTTGATAGGATTTGAATTA GATAGCAGTTTTTCGCTTGTTGAAAAGACAAACAGGAGTGGAATATTATC ATAAAGAAAAAACTTAAAAAATATCGGAAAATGAAGATTGAAAATGAAGA ATAAGAAAATCAACTCCTTTAATAATCGTTCTATAATTATCATTTTTACA TGAGTGATTCTTGGATCTTAGAACGTCATTAATGTGAAAAAATCATTCAA AGAAATTTGTTACATCGAAAGATACAGTCCAAAATTTATCACTGATTGAC TTCAAAAACAATCAAAAAACAACAAAAAAGAGCCCTTTTTCAAGTTAACC AGAGCAAAGTTTTAAGCTGTAATTTTTGACTGAATGAAAATTTCATAATT TTTTTTCGCATTTATAACGTTCTAAGATTAAAGAATTTCTGATATAAAAA TGAAAACCATAGCATTGTTCTACGAGAAGTTGAGTTTCTTTCTTCTTCAT TTTTCATCTACGTTTTTCGATTCTTTAATTTATTTTCTTTTTTGACAACA TTCCACTCCGGATTACCTTTTGAACAAGCACAAAACCGCCATCTAATTCT ATCAAAAGTTATAGCCTTTTTGTCTCCACTGCAAATTATATTGAGACATA CTTTAGTGCACAGCCTGATACAGTTTGTTTGATACTGTCTGTGAGTGAAC CCTTGTTGACAGAAGCTTAAAACTTTCTTGGAAACCCAGGCAGACAAGCA GAATATGCACATAATCAACTTAACATTATACATTAGACTATAATTTTAGA ACTTTGTATATTGAGGACAACCAGGCTAGTCTTTTCCATCTTAAAACACA GGGAACACAATACGACACAACGCGTAACTTCCCATCCACTTCTACACTGA TAACTCTTCCAAAAATGCAAATTACAAACAAACTCATATTTAATTTTAAT TCATTTAATAATGAGATAATGAGTTTTATAAACGAGCCTGTTATGCATTT TCCCAAAGGGAGAGACTTCACAAATACGAATAAAATTTGGATAATGCATT TCCATTGGTCCAAATCACAATTAATTGTTACAATAATTACTTTTTTCCGC TGTGAAAGTGGATTGTACTGATCACCTCCTGATCTACCGCACGCACTGTT TAAGTTTAAATGACAATGCATCCTGGGAAAGTTGTTAAAGATAACAGTTT AAGAGTGGTGCATGCTTTTTCTTTTTATAAAAATGGTGTTTTTCCATTTC ATCATGAATATTCTTCACTTTTTGGGAAAAGTCATCCTGAAATATTCTTA CGGGATTCTTAGATTTGGATGCAAACCCAACCTAAACCTAGCATGCGATA CATACGTCAAGCAAGGAATTTACATTACTTGCATTACATTAGAACGCGCT TTTGAAAATAGAGTTCATATTTTACGTAAAAAACCCCAGTTATGTAGACT GTTAGAAAGTCCACGAGCTCAGAGGGAAGGTCCGGGTATTCGAGCCAAGG TCCGGGTATTCGAGCCAAGGTCCACTGGTTTCTGACACCTTGAACCACTC GGTAATCGCGTTATCGCTCTATCGAAGATTCACTAGAAAGTTTTTTTGTT TCACATCTTTTTTCAAACTTTTTCTTTTGTAGGATGTGGACTTTTTATCG ACGGAATTGGATCGAAATTCGAAAGCAAATACACCATCTTCCTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000292_pilon:327428..341672-

>XLOC_006270 ID=XLOC_006270|Name=XLOC_006270|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1446bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000292_pilon:327428..341672- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTGAAAGACTTGAAACGGCAACTGAAAGGTGAACAGAAAAGAGCAGATCA
ACTACAAACCAAATTACAAGACTTTATCCAAGAAATTAAAGTCAAACAAA
GTGAAAGACTTGAAACGGCAACTGAAAGGTGAACAGAAAAGAGCAGATCA
ACTACAAACCAAATTACAAGACTTTATCCAAGAAATTAAAGTCAAACAAA
CATACGACGAGATCTTTAATCCCGAATCGTTACAACTCAAAACAGCAGCC
ATGACTCACAAGAGGACAGATTCAGGCATACGACGAGATCTTTAATCCCG
AATCGTTACAACTCAAAACAGCAGCCATGACTCACAAGAGGACAGATTCA
GGAAGTCACATGTCGGTTATCTCCTCAACCAGTGGAATTGGTTTTGAAGT
GGATGCACCAGCCGAAACTTCTTCCGCGACCGCAAACTCTTCCAGCACAC
CGAAAGTCTCCGCTCTAAGGAAGTCACATGTCGGTTATCTCCTCAACCAG
TGGAATTGGTTTTGAAGTGGATGCACCAGCCGAAACTTCTTCCGCGACCG
CAAACTCTTCCAGCACACCGAAAGTCTCCGCTCTAAGGGCGAGTAGCCCA
GCGGAAAGTGCGTCAAGTTTAACAGGTCTAACTGACGAAACTATGGACCT
AATAAGTCGAATCGCTGATCTCCAACAAGAAAAATGGAAACTAGAGGAAA
AGGCGAGTAGCCCAGCGGAAAGTGCGTCAAGTTTAACAGGTCTAACTGAC
GAAACTATGGACCTAATAAGTCGAATCGCTGATCTCCAACAAGAAAAATG
GAAACTAGAGGAAAAGGTTCGACATTTAGAAGAAAATGGAGCTGTCATGG
CGGATGATTTGATGCAAAAAGCATTGATCATACAGACTTACGTCATGGAA
AATAAGTCAGGTTCGACATTTAGAAGAAAATGGAGCTGTCATGGCGGATG
ATTTGATGCAAAAAGCATTGATCATACAGACTTACGTCATGGAAAATAAG
TCAGTTGATCCATCAATGAACCGACAACGCACTCAGACGCTTAAGGAGAA
GATGATCGACAAATTGAAACTTGGAAATAGCGAAGAATTGAACAGAGAAA
TAAACAATAAAATGCAAAGGATGTTGGAAGAATCGCTAGCCAGGAATGCA
CAACTACAAAAATTGATCCATCAATGAACCGACAACGCACTCAGACGCTT
AAGGAGAAGATGATCGACAAATTGAAACTTGGAAATAGCGAAGAATTGAA
CAGAGAAATAAACAATAAAATGCAAAGGATGTTGGAAGAATCGCTAGCCA
GGAATGCACAACTACAAAAAGATGTGGACTTTTTATCGACGGAATTGGAT
CGAAATTCGAAAGCAAATACACCATCTTCCTAAGATGTGGACTTTTTATC
GACGGAATTGGATCGAAATTCGAAAGCAAATACACCATCTTCCTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_006270XLOC_006270-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000292_pilongenomesc0000292_pilon:327428..341672 -
Properties
Property NameValue
Aaloc661-723:64
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Aaloc1-99:14246