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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000045_pilon:983708..992593- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_006075 ID=XLOC_006075|Name=XLOC_006075|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8886bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000045_pilon:983708..992593- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATTTTAACAGTCACTCGTTCATACCATACGCTTATCCTGCACAAGAACAT
GAAGATTTTCGTGGTTTTACTCCTTTTCGTTGGCTCGGCATTTGCAGGTT
TGGAATTTTTTTGAGAAAAATTGACTAAAACCCACCAATTTTTATACAAA
ACTTATCTTTATTCAAAATTACTTTAGAACTACAAGGGTATAAATTAAAG
AGTGCGGTCTATGTTAAAATTAATAGTCACAGACTACAGCTTTTCTTTCG
TACACAAGCGCGACTTCGATCAGTTTTCACTAGAATTTATTGATGAGACT
GTCAATATAAAATTTAAATAAAGTAGGCTTCGAAAGACTTTTAATCAGTC
GTTTCTCTTCTTTATTTTTAGAAAATGACCAAAGCAAAGTAAGTATGTTT
CAGTTATTTTTCATTCTCGATTTTTAGCATAAAACACTCAAACGTTCTGA
GAGTAGGGTTACATAGAAGACGATCTGGGGAACATTAAAATCAGCTTCGA
CAGCTTCGAAATCTCCAAAAAAGACGCAAAACTAGACAAATTCCACATAT
GCTAATTTAGCTCGTTTGATTTTCACTGCAACTTGATTCTTACTGATTCT
TGAGCATCCTATGCATCGGTGTTGTTTTGAAAGATCGAAAAATTAGAATT
TTGATTTTGGCGATTGATGTAATTTTCTAATGATGTAAGAACTAACTTCG
GTTGTTTGTTTTTGTTTTTGTTGCCAAAAAATTTGCCAGAGGCTTATATT
TTGAAAATTATAAATCTATGATAAAAACTTGTCGTACAGTTGATTAATTT
AAGCGAAATAGTGATTTTTTTTTCATTCTGTCGAAAAATAATCTTTCCGC
GCGGAAGTTAGTTTCTCTCATTCTTCCTTCTTCTAGTGTGACAATGTGTA
CAAGGACTGCGTATATCATAATGGTCCACATGTATTTGTGAAACTTGACT
GTAAACTCAAAGAATTGAAATGCAGACGAGATCAATTGAACCCTTTTTCA
AGAGATGAAGAAGAAGTTCAAGATCAATATCTTAATGTAATTATTTGTAA
TGATTCATTTTCTTTCAAAATCATATCAGAGCACAAGGTCAAATGCAACC
TCCTCCCTTTGTATCCCAGGCTTTATATACGTTACTGATTGACGCCAGAG
AATTATCTAGCGCAATCAGTAAGCATCGAAAGGCTTATAATACGCAGGGA
ACGAGGTTGGGTTCAATCCAAATAGCGTATGCAGAATAATCATATACAAT
CATATACATTTCAAACAATGACTCAGTCGCTTAGGAGGGGGGGGGTACTT
AGGCAAAATGGGTGCCGGGTATGTGCGAGCGAAAGTCCCTCGGTACAAAT
ACCATTAAAAAGCAATTGAGTCTCTGTAAGGGTTGCAAAATTACTTAAAT
CAAAATTGAGTCCCTCAGAAGGTCATGATTCTTGAAATTTTGGGGAAATA
GTTCCTTTAAGGGTGGCAAAAACCTAAAAAAATGGACAACATTTTCGAAA
TTCAGTCTCTCTAAGGATCGATTTTCGAAATTCTCGCAAATCTGGTACCC
CCCCTGTGCATAGCACTACTTCGTCACATATCCTTACTTTGTCTCCTATT
GTTATTTTCTTTTCTACGTCATAATTTATGCTTAAATATTAAACAGCTGA
ATATACATGGTTTCTACTAGATTATTGTTAATCATTTAAACATGACGTAA
CATATGCTATTATGCAAGCTAAGAAGTTGATTGACAGATATCTTTGAATA
AAATATGGCAAATTGATTGACAGATATATTTTTCTAGAATACATAAAATA
ATTACCTTTAGGTGTGAAAATGATGGGCGCAGAGGTAAATAAAAAACATA
TTTCGACATTATACATTTCTTTAACCATGAACATATAAACGACTGCACAT
ATCTTTTATTATCTCTTTGAAGCGAGCTTCGTTGCCGCCTGTATTTCAAA
ATTGGTATGAAAAATCCGATAATATTCCGTCATAATTTTATTTCTTTGAA
TTATTTAGGTAAAAGGATTGATATAGCTTGAAAATTACTCCTAATGCACA
AAAAATTATTTTCGAATTTTTTCGCAAGTTTGCAATATATTTGATGAACA
TTTTCAACTCTGAAATGCAGAATTTCAACTGCGTGTATACTTTTGAATCT
CTTTTGTCACTCCAATAATTTTTTTTTGACTTGAAAAAAAATAGCTTGCC
AACGTTGAGAGCCTGTACCATAAGAATATCTAAATTAGAATGTGACACTT
TCTAAAATTATAAGACACTTTAAGTCAAAATTTAGAAATAAAGAACAACA
TAGACTTTTGTCGAAGTTTTGACGTTGTTGGCAAGGTATTCCCAAGTGGT
ATATCACCAAAATCTATTGTTTCATTTTATGCTATTAACGAGGCGGCAAC
GAAGCTAGCAGTCTTTCTAAAAAAAGACAAAGGAGATGGATGTCCAGTCG
TTTATATGTTCATGCTTTAACTGACCAATCAAATCACTACTATACATGTA
ACATTTTGAAGAGTGAATGCACGATGAACAATCGTGATTTAAATTCTAAA
GAAATGTCTCGAAGAAACCATAATACACATGCGCAGGTGCTCTACACATG
ATGACATGACTTGAAAGTTAGATTTTGCAGATCAGTCAAAAAAATTCATA
TCCTTACTTGGTCACCATTCATTGCGTAAGAGTTCTTTAAAACTTTCACA
AAAATTTATATTCCCACTACACGGTCACGTGATTTAAAAGTTAGATTTTA
CAGATTAGTCAAAAAATTTATCCTTGCTTGGTCACAATTCATTGCGTAAA
AGTTCTTAAAAACTTTCACAAAAATTTATATTCCCATTACACGGTCACGT
GATTTAAAAGTTAGATTTTGAAGATTAGTCAAAAAAAATTGTCCTTACTT
GGTCACATGACTGGAAAGTTAGATTTTGCAGACCAGGCAAAAATATTTAT
CCTTACTTGGTCACATGACTTGAAAGTTAGATTTTGCAGATAAGTCAAAA
AAGTTTATCCTTACTTGGTCACATGACTTGAAAGTTAGATTTAGCAGACC
AGGCAAAAGAATTTATCCTTACTTGGTCACATGATTTAAAAGTTAGATTT
TACAGATTAGTCAAAAAATTTATCCTTACTTGGTCACCATTCATTGCGTA
AGAGTTCTTTAAAACTTTCACAAAAATTTATATTCCCACTACACGGTCAC
GTGATTTAAAAGTTAGATTTTACATATTAGTCAAAAAAAATTTCATTACT
TGGTCACATGATTTGAAAGTTAAATTTTGCATATCAGTCAAAATATTTGT
CCATACTTGGTCACATGACTTGAAAGTTAGATTTTGCAGACCAGGCAGAA
ATATTTATCCTTACTTGCTCACATGGCTTGAAAGTTAGATTTTTGCAGAT
AAGTCAAAAAAGTTTATCCTTACTTGGTCACATGACTTGAAAGTTAGATT
TAGCAGATAAGTCAAAAAAGTTTATCCTTACTTGGTCACATGACTTGAAA
GTTAGATTTAGCAGACCAGGCAAAAGAATTTATCCTTACTTGGTCACATG
ATTTAAAAGTTAGATTTTACAGATTAGTCAAAAAATTTATCCTTACTTGT
TCACCATTCATTGCGTAAGAGTTCTTTAAAACTTTCACAAAAATTTATAT
TCCCACTACACGGTCACGTGATTTAAAAGTTAGATTTTACATATTAGTCA
AAAAAATTTTCATTACATGGTCACATGACTTGAAAGTTAAATTTTGCATA
TCAGTCAAAAAATTTTCATTACTTGGTCACATGACTTGAAAGTTAGATTT
CACAGATTATGCAAAAGAATTTATCCTTAATTGGTCACGATGCATTGCGT
AAGAGTTCTTCAATAATTTCACGAAAATTTATATTCTCATTACACGGTCA
CGTGATTTAAAAGTTAAATTTTACATATTAGTCAAAAAAAATTATCCTTA
CTCGGTCACATAACTTGAAAGTTAGAATTTACAGATCAGTCAAAAAAATT
TATCCTTACTTGGTCACATGACTTGAAAGTTACATTTTGCAGATCAGTCC
TGATCAGTCGAAAAAATGTATCCTTATTTGGTCACATGACTTGAAAGTTA
GAGTTTACAGATTAGTCAAAAAAATTTTCATTACATGGTCACATGACTTG
AAAGTTAGATTTTGTAGATCAGTCAAAAAAATTTATCCTTACTTGGTCAC
ATGACTTGAAAGTTAGATTTTGTAGATAAGTCAAAAAGATTTATCCTTAC
TTGGTCACATAACTTGAAAGTTAGATGTTGCAGATCAGTCAAAAAATTTT
ATCCTTACTCGGTGACATGACTTAAAAGTTAGATTTTCCAGATCAGTCCT
GATCAGTCAAAAAGAATTATCCTTAGTTGGTCACGATGCATTGTGTAAGA
GTTCTTTAAAAATTTTGCAAAATATTATATTCTCACTACACGGTCACGTG
ATTTAAAAGTTAGATTTTACAGATTAGTCAAAAAAATTATTCTTACTTGG
TCACCATTCATTGCGTAAGAGTTCTTTAAAAATTTCGCAAAAATTCATAT
TTCCACTACACGGTCACGTGATTTAAAAATTAGATTTTAAAGATTAGTCA
AAAAAATTATCCTTACTTGGTCACATGACTTTAAAGTTAGATTTCGCAGA
TCAGGCAAAAAAATTTATCTTACTTGGTCACGGGGTATTGTCGGAGCGTT
CTTTAAAAATCTCGCAAAACTTTATATTCCCACTACACGGTCACGTGATT
TAAAAGTTAGGTTTTGCATATTAATTCAAAAAAATTTTATTACATGGTTA
CATGGCTTGAAAGTTAGATTTTGTAGATCAGTCAAAAAAACTTGTCCTTA
CTTGGTCACCATGAATTGCGTAAAAGTTCTTTAAAAATTTAGCAAAAATT
TATATTTCCACTACATGGTCACGTGATTTAAAAGTTAGATTTTGCAGATT
AATTCAATATTTATCATTACTTGGTTACATGACTTGAATGTTAGATTTTG
CAGATTAGTCAAAAGAATTCATCCTTACTTGGTCATGTTTACATCAAACA
CTACTTGGTCACGTTTTTTCATTCACTAGAAATGTTCATAACTTCGACCA
ACAACTCCAAACACTACTTGGTCAAGCCTTTTTACTCATAAGAAATTTTC
CTAATTTGGACCAAAAACTCCAAACTCTAATTGGTCAAATTTTTTCATCC
TTAAAAATGCTCATATTTTGCACCAAAACACCAAACACTACTCGGTCACG
CCTTTTCACATATAAGAAATGTTCATTATTTAGACCATAAACCACGCCTT
TTTACTCATAAAAAGTGTTCATAGTTTGGTCCAAAGACATCAAACACTAC
TTGGTTACGCGTTTTTTATCATTAGAAATGTTCATAGTTTGGACCAAAAA
GACCAAACACTACTTTGTCTCGCCAATTCACTCATAAGAAATATTCCAAA
TCTGGATCGAAAACACAAAATACTACTTCGTCATGCTTTTTCACTCATAA
GAAATGTTCATAATTTTGATCAAACAAACCAAACACTACTCCGTCGCGCG
TTTTTCCTCATCAGAAATGTTCATAGTTTGGATAAAAAATACCAAACACT
ACTTGGTCGCGACTCTTCACTCCTTAAACATTCAGATATTTTTCACATAA
AAACCCCACCAAATGTTACTTAATCATATCTTTCATTAAAAGCTCTCCTC
ACTTCCATTATTCGTCCAAAAATTGACGTCGATATTTAAAGAATTTTACG
AAAGTTCAGGTGAAGAGGAGATGCTAACTTGCACTTTTAGTACATTTGCG
GCCGAAACGCCCGACGAGACAGAATGAGATATACCTTTTTCTATTGAGAT
TTGTTTTGAATCTTAACCCTAAAAACATTATTGAAATTTTTACGGCGATC
TTTAACCGGTATGACCGATTTTAAGGGATCCCAACCGTGATCAGGATAGG
ATAGAGTGATCTGTTGAAAACGAAAGTGTCCCAGAAATTGTGACCTGGTT
GATGTATGTATCAAAAACTTCTTTCTTCTACATTTTGACTTGTTATAAGG
AGACTTTATCATTACTTTTAGAGATACTAAAGAAACGCTAGTTGAAAAAA
TTTCGATTTTTAAAACTTCCACAGATAGTGATCTGTGAAAACTAATTTAT
TTAAAATTATTTAAAAAATAATGTCAAATTTGATTCCATTATTTTATAAA
TTTTCTTGTGCCGCTTCTTAGAAGCCGTATACTGTACAGTACGTTCTTTA
TAAAGTTTTTGACATTGAGATTTCAACCTTTACTTTTTGCTAGACGGAAC
AAGAAAGCGATCTTCCATTCACTTTTTTAATAGTTTGTTTGTTAACACCT
TTAAAAAAAGAGAGATCAACCATAGACTATTTATTGTTTCATTTGTTTAT
TAGCACCTTCACATGAAAGAACAATTTTCTTGTTTAATTTCAACAGCTAT
AAAGGTGTTACAGAACAATACAATTAAAAAAAAAGCAAGTAGAAACCACC
TCTAATCTCAAGATCAATCAGAAATAATTTATGCGGTTATTCATGCATAT
ATTATGACGTAAAAGAGAAAATAACAATAGGAGACGAAGTAAGGATATGT
GACGAAGTAGTGCTATGCACACCCCCCCCCCAACCGGGGTCGGGTGTGCC
GGAATCACTCTGACAATTTGAAATATGGTAGAGCCATTTGTATTTCATAG
CCCTATATTTTGAAAAAAATATCCGGAAATCCGATCGTCGGATATTGGAT
TCAGGACGAAAGTACCGACATGAAAATTCTTAAGCATGCGCTATAAAATC
CAAATTTCTCCGAGCCATTAATTGTTAATGTTTGGAATTTTGTGTACTGA
TAAGGAGGAAAAGTTAAGATATAAATGCATGCAGATATTTTTTTCCAGTG
TGATGGTTTATTCAAATGTTTATGGAGAGAAAGAAAAGGTGGCAAGAAAG
CATGGCTTCAATGTTTGGAAGACAAAGCAAATTGTGGTGCACTGGCCAGT
GTTAAATTAATTGGTTGTTTTGGAATGGTAAGCTCATATACAGTGGCCAC
TTACTAACTCAAATTTCTGGTATTCGAGTCTTTTCTATAATTCGAACAAA
TTCTCAGTCCCTATCAAGGAAAAACATTCCATATATTATTCTATGATTCG
AATTTCAAAGAGAGTCTATCAACTGTTAGAGATGGGGTTACGCATTGTTT
TACGATCACCTCGTTTTGAAAAATTCTATATAAATAAAATTAACAATATT
TTGGAAAGATAGTCCTAAGTGGACGATTTTAAGGATCGAAGTTTTCAAAA
AGTTTCGTAAAATACTAAAATCTTCACTTATGTTATATTATAGTACAGTA
AAACCTCTAATTAACGGACACTCTAAAAGGCGGACACCTCTGATTAGCGG
ACAATTTCATTTTCCCCGGCCGTTTCCTAGTCAAATCCTCATAAATAAGT
TTCTAAAAGGCGGACACTCAATTAGCGGACCCTCTGATTAGCGGACAAAT
ATTTTCGCACGAAATGGCCAAAACCCCTATTTTAGCTCTCCAATTAGCGG
ACATTGAATATCAAACGAGTCACAGACGTCCAAAATCGAAAAAAGATTTT
TTAGATATTTTTATTTCAAGCACTTATTATTCAAATTATTTCTACAAATT
TCCGTACCCACCACCTCCATTTTACCTCTTGCCAGTCACTCGAGCTCTTC
TATGGCCTAGTGTCTGCAGATAAGTACTTTAGACCCTAATTTTGTATTTT
CGACACCCTGGAATGGCCTAATTTCAAAATTGGAGCTCCGAGATTAAAAG
TTTCTAAAAAGCGGACACTTTTAAATAGCGGACACTAACCCTTTTCCCCG
ATGGTGTTAATCTGGCACCCGATGTGAAATTTTCTTCCGACACGCTAAAG
TTCTGAAGGTCGGGAAAATCTTGAACATCTGGAAGAAATGCATTACGGAA
TTTCGCCTGACCGCGTAATTATTTTAGAAAAATGGGCCCGAGTTCAATTT
GGACAGGGAAGGTGTCATGGCCGACAAAATTTGGGTCAGAAAAAACTTCA
AAAGGTTTAACGAAATAAATTCAAATAAAAAACTTTTTGGAGAAGGAATC
ATGCAAAATATTATCATTCTTTTCACAAGGAGGGCATGTAGAAATACTCA
AATAAGTATTTTTCCTTCTTTAAACCATAGTATGCTTTATACTATGTTTA
AACTGATCACAGAAGCAAAAACCAAATAGAAATAACATTGTACACAAAAA
AGCCTGAAAAAATCCATCAAATAAAATGAAAAGCAACCATACAGCACACA
TTTTTTGAAAATTACATCAGCCATGTTGTTTGTAATTTTTGCCGACATAC
TCATGACGTGGTAACTAACGACAGTGATTTGACGGTCTGTTTGATGCGCC
AGATCTCAAAAAATCAATTTTTAAGCGTTCGGCACGGCCCTCAAAATGAG
GGCTAGACTTATGTCGGCATATCAATGGACGACTACTTTTCCTCTCCGAT
GGGATATTGGCCCGCTCCTTTAGAGCTTTAGCGTGGGCGGCCGCCAATAC
GCCATCGGAATATCAGATAACGATGGTGTCCGCTAATTAGAGGTTCCACG
GTACTTATATTTTCTGAATCTTTGAATTTTCTTTTCAAAAATGTATTTGG
AATTGTGATTCTTATATAAAGTTATAAAGTTTCAGCTCTAAAGTAGGTTA
AAAATAGCCAAAATTGGGTGAAATAGGCCCACTCTGGAGGGTCGTGGATG
TACTTATAATATCATTTCTATTTTAATTTTTTTATAGTGCTCTGACAAAC
ATGCTACTTGCCAGAAAGGGACAATTTCCTGCTCATATGATATTCTCAAG
TGCGTGCGACATTGCGTGAAAACACAAGAGTTGTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000045_pilon:983708..992593- >XLOC_006075 ID=XLOC_006075|Name=XLOC_006075|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=984bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000045_pilon:983708..992593- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATTTTAACAGTCACTCGTTCATACCATACGCTTATCCTGCACAAGAACAT
GAAGATTTTCGTGGTTTTACTCCTTTTCGTTGGCTCGGCATTTGCAGATT
TTAACAGTCACTCGTTCATACCATACGCTTATCCTGCACAAGAACATGAA
GATTTTCGTGGTTTTACTCCTTTTCGTTGGCTCGGCATTTGCAGAAAATG
ACCAAAGCAAAAAAATGACCAAAGCAAATGTGACAATGTGTACAAGGACT
GCGTATATCATAATGGTCCACATGTATTTGTGAAACTTGACTGTAAACTC
AAAGAATTGAAATGCAGACGAGATCAATTGAACCCTTTTTCAAGAGATGA
AGAAGAAGTTCAAGATCAATATCTTAATTGTGACAATGTGTACAAGGACT
GCGTATATCATAATGGTCCACATGTATTTGTGAAACTTGACTGTAAACTC
AAAGAATTGAAATGCAGACGAGATCAATTGAACCCTTTTTCAAGAGATGA
AGAAGAAGTTCAAGATCAATATCTTAATTGTGATGGTTTATTCAAATGTT
TATGGAGAGAAAGAAAAGGTGGCAAGAAAGCATGGCTTCAATGTTTGGAA
GACAAAGCAAATTGTGGTGCACTGGCCAGTGTTAAATTAATTGGTTGTTT
TGGAATGTGTGATGGTTTATTCAAATGTTTATGGAGAGAAAGAAAAGGTG
GCAAGAAAGCATGGCTTCAATGTTTGGAAGACAAAGCAAATTGTGGTGCA
CTGGCCAGTGTTAAATTAATTGGTTGTTTTGGAATGTGCTCTGACAAACA
TGCTACTTGCCAGAAAGGGACAATTTCCTGCTCATATGATATTCTCAAGT
GCGTGCGACATTGCGTGAAAACACAAGAGTTGTGATGCTCTGACAAACAT
GCTACTTGCCAGAAAGGGACAATTTCCTGCTCATATGATATTCTCAAGTG
CGTGCGACATTGCGTGAAAACACAAGAGTTGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000045_pilon | genome | sc0000045_pilon:983708..992593 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 394-492:100 |
| Aaloc | 265-393:1989 |
| Aaloc | 115-264:8001 |
| Aaloc | 100-114:8514 |
| Aaloc | 1-96:8887 |
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