XLOC_005484 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_005484
Unique NameXLOC_005484
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000270_pilon:412386..428819+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_005484 ID=XLOC_005484|Name=XLOC_005484|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=16434bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000270_pilon:412386..428819+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAGGGCTTTAATACTATTGTGGATTATTTTGACCATGGTCGTGTGAC CGAGGAGAGGGTGTGTTTATTACCAAAACACCCTTTACCTTCACCTTCAG CATTCTATCATAATTATGGGGTAAGGATTAGCCAAATTTGTTGTGCACCC TTGGATGAATACTTGCCTTGGTAGTTTTATATTACAAATAAATTTTATGT GACAATATGGCATTATAAAATTACAATTATGTGTAAAAATGgaagaatta aaaaagaaaacgcaCCAAATGCATAATGTTGGGTTCATTATACAgtcaag aaattttttaacttcCAATTCGgttttttagccaaaaaaagaagaaattg gcAAAGTTTTTGAGAGGAATGGTGAGAAATTTTGAGAAAGGGTTTGGTAA CGAGGTCATCAAAACAAGGTAATACTTGATGTTTGTATAATAATATTGGG ttcaattttacatttttattgtttcttttatttcaggGTGGCGTTGAGTT GGGTGGTATTTACGTGAAAGGGCTTTTACCTGGTGGGTCAGCTGATAACA GTCGCAAAATTGTGAAAGGTAGGTAACAATCGCAAATTATTATACTGTTT GAGAGGAAATTATTCTAAACGTAACTGACTGGTGAAATCTTCTGCACGAA AACTTCACAGACCAAGTtttatttaatgttttttttacgaaattttAGTT GATTCAACACTGATCTTTATAAACCAAGTCGTCATCTTTGATTGGGGTTT TTGGTAGTGTTATAAATTAACGTCTAGGCGCTACATCACCAAAAGATGGC CGACATAAACCCTTGTAGAAGGCTGATTTCAAATTATCTCTATTTTGAAA TCCACATTTTCTTTCTGAACATCTTCCATAGGTGATCGTTTGTTAGAAGT CAATGGAATCAGTGTGGAAGCTCTTTCAAAGAAACAAGCCAACGATCAAC TACGAAAAGCTACTCAAGTGTCTAACTTCATTTTGGAACATAACACTGTT TACGATAATCTCATATTGCCAGAATCGGTAAGCTATTttgttaatttctt tttttatgattcaaaaaacatttcggCAAATATTTTTCAGTATAAGCTTT TCGTTTcataaatttttattaattaattgatgatgtttttttaataaaac gaaACGCTTATGCAGAAAAGTATTTgtcgaaatgttttttgaatcataat tttaactttctggctattttattataacaataatttctttttataaccCA CTAAATGGCCTTACTCTGTAACTTCaacttttcaaatatatttataCTTA ATTCTTTATTCGTGTGGGCTaaaaaaaaCAGGACGATAAGGGTCCAGACC TACCGGTTGAAATTGAGCGATTTCATAAGAAGCCAGTGGCCTCTAACGGG TTAACCATTACATAATGTTTAACGTTATTGTTTGAATTGAAGTCAATTTC ATgctaaagtctgttccaaaaaataCCTTGTTggacagggggggggtcgg tgtaccagaaggtggcatgtatcctggggtgggtgggtgtttgagaaaaa aatttgtcatgtactacctgtgtactataagcggggtgttgggtccaaaa tcgattttgatttttactacctgtgtaccaaaataggggtgttaggtcca aaatcgattttgatttttactacatgtgtaccaaaataggggtgttgggt ccaaaatcgattttgatttttactacctgtgtaccaaaataggggtgttg ggtccaaaatcgattttgatttttactacctgtgtaccaaaataggggtg ttgggtccaaaatcgatgttaacagtgtggaaacaaaaaggttaagaaat tatctgctaaaatagaaatgtaaagttgttctattataaattgatcaagc caagtttgtccaagcaagatcattcttccaaacttcttggaatgaattga aatcctaccagatcccactgaaatgaaggtttatcgagtcaatgtaaaca ttcgaacatttgaattcaaacattcaacattcgtacattagaggtgccaa ctctcacgcattgagTGTGAGACTCATGCATTTCTACATGGTctcacgta atttttgaaaagtttgatttctcacccattttggatttttaagaaaaatt ttcctgtttttccgatttttggaaaaaagttttctcaatttcccgatttc ccgatttcccgatttttggaaaaatgtttacccgattttccgattttcgg aaaaaagtttctctattttCCGGATTTTTCAAGGTAGTACCCGGTAGTAA ATGGGgagtatggggtggttttggtttTTTACCAGGTACTACCTGGGTAG AAaatagggggtatggggtggttttaggatttttccatgtagtatggtgt acttcaggggtgggtgggtgtcaagttttgaaaaataccttgtagtacac atacatgccgtcttctagtacactgaccccccccctgtgtTGGAAGATAA TCTTAAGATTATTTTAAGTTTCCAAAAtctttcataaattttgcaaatGA ATATAaagaatgaagatgaaaaaactgattttttttctactgggccaaag actttattttttattttcagaaatttgaacttgagctgatttcaaatata ttttcagaCCTGTCATATGTCTTTCTTGGATaaaaaaaCAGCTCTAAAAA GTTGGCTGTAAGTGGCCAAAAACGACCAAAAATCGGAGGGCTGTAAATGT GCGGACAGGCAAATCTTTTGGAACAGACTTCATAGAGAATTTTTAGTAGA CTGTatacatttattttttcatcttttgaatTTAAGGAATTCTTCACAGT AGAAAtccaaaagaaacaaaatggaTATGGCTTGAGTTTGACTGTAAGAA TATACCTAGCTGTTTAGCTTTGAATTTAGAACTAtaacaaaatcttttat aaTGGCGAAGTGCAgagtcaaaagaaaaaacacacTACCCACGACACTTT AAGTTGGTTTTTCATTCAGTTTGAAATTCCAAGGGGATTTTTATGgttta tttttagaatcattTAAACAATATTACTCATCAACTTTAATTCTAATATA CATTTGCATTgtcattcttatgaaaaaagtctTGACGTCCAGTAAAGGCT AAGAACCATCGTTCAAATTATATAACTGTACTCATCTGCTGTTGTTTTTT AGGGTGGACCCGAGATTGATGGAGTATACGTGAAACAGGTGCAAAGAGAT AGCGCTGCTGAGCATGACGGAAGGatcaaaaaaggtttaaaaactgtttt tgatTACTTATCTAGACGGGTCTGGTGGtttttatgatattcatgacgta gtGTTTTATATGGAATCACCCataaagctaaggctacactgatagttttt tctggcggctgcaatgcaattaacctttccagcgcgcaactttttaaatt ttcacgctgtcagcgcgcaacattttttcagaaaatagacatgttcagtt atttgatcataactcaagaactaggaatctttagaaaaaaagtaaggtat ccctgaaaagctacttaaattctacaacttttagaccaagtaccaatcca aataaaatattccaacaaaaatggtagcatcacgtaaaccacagtttttt ttcacgttttgcggtaatatcactttttttgcatttttcacttctagagc aaaaaaaagtggggggaagttaattaaaaaatctgtcttcggctatttat caatctatacatcattttgaagtaatataccaaaaatcagcatccagaaa aatctgtatgtgtcacaccagcctcccaaatatcggtcacttttgccaaa aatcacgattttcggctaaagaaatccaatatatacaattttgaagtatt ttgatgataatgtgTTCCCAGAAGCAGTtacaacatcaaaaatggtgtaa aagtattccccaactatctaaacaacactttcagtcagtattcttagctc ctgaagcttttgaagggtatcggctaccgtgaaactagatggcatagtcg gcgacagttgcaaagtttccaaaaaccgtAAGCCTTTTGAGGCAAACTCA TTGCTATCAAATCTGGTCTCTTTTGCCCGTAAGGAATGCTAAATGTcatc ataataattccatgtggcTGCTATGTGGCTCCTGCTATCATTTTGATCCA TATAAGCTGTAATGAGGTgtagaaaacacttttgcattgaatttgtccac tttccatgctccaacctgaataaaaagtaaaaactaCTGTAAGTTTAGGT CGACTCCGATGGTTTGTCGAGAAAAGTGGTCATAATGacaaataaatgga atttttatgctaaaaacaaaacacaaaatataagatatacttactggatg ttttgccattataaaaacaatgtttccatgaagaaaagtggcctaaacca gtcaaaaaatccaagaactttagcagtaagtttgaaaaacccatttcttg gtcgccatcttgattcagtgtttttctctaccttttctccgaaatctgct gcctcaccacgtgatcaaaacattacatcaccatatatcaaaagaaagct tagaacctctactttccgtttctctttacttatacggctagcaaagaagc caatgggagaaatatagcttagaagatcACTATGTCaaaaaaaCGACTAT ACACGTCTGCCGGAACGTATGCTCGACGACTATACTCGTCCGCCGGgctg aaaaggttaaaaaactatcagtgtagccttagcttaaTACCCCTGGCGTT TGATTTAAATTCAAATGCCAGTGGcaaaaccaatgaagtataagcctgaC GAGCTAGAAGAGAATCTCCTTgttaggatttgaagccaacaaatcctacc aaagttgcgcggtctAGCGCGGCCTACCTACACAAATACcagattgaaat taaaatttaccggtaagtttcgaaaaaaataacacttgaaaacaaaggaa tcgctagatGCAATCCCtttttttttGAGAGAGGTGagtttccgtataaa acattgcGCCATTAATATAATAAATTATAGCTTTCACCTGTTTACATTGT GCTGGGTGGCTTGCATTTTAAACTGTCTATGGTTAAAACCTTCTGAGAAG AAATCTAGCACGTATTCGAACCAAATTAGACTTCAATATctgcaaaataa taaaatactttTCCAGCAATAATGGTCAAACCTTTGGGTGTGTTTAAAGT TTGATAGGCCGGGACTTTGTAGCTCATATTTGTTTTAATAATTGTCGCGA AGTTAATGTTTTTATTCtctgttttactttttcaggGGATCGCTTGATAA CTATTAATGGACGTAACGTAGAAAATTCCACACGACAACAGGTACCTGGG CACTGTTATCTTATCTTGTTAGGTTATCTAATAAGGGGCTGTAACAGTTT CTATCTAGACAGGAACTGTTGATGAATTTTTcgagacattttttttttca gaaatcgatttgtttataatttcttttcatcttttgagGTGGGGCATATA GcaactttttcttcaaaatgaaactttttgcGTGTTTTAGCGATGGCTAA GTGATCAAAGGCGATAGCATCACAAACCAGGGTTTCGTGATTCGAACCCC ACTACTGTTCTGTTCTGTTAATGAACAACCCAGCCGGCTATCCCTGCCCT AAAGGACCccatgaaaaatatcaaaaagaatGTCTACAAATCTTAGATTA CTGAGCTATCCACATATTTTGCAgatctattgacctctatgaaacagaac ttttgcTTGTACTCAAAAATCGCCATTTTCGCCCGCTGGAAAGCCTGGAC CGGCCCAGGACCGGGCCACCGGGGGTAAAAAAGGGTTGGTTTCtgatatg gaaattttttttgtttttttttgcagtgtACCAGTATGTTGAAGTTATCT CAAGATATTGTTGTACTTCATTTGGAACGGTGTGTCGTTGGTGATGACCT ACCTCCTCTAGATACTGTATGTAAATTCTTTACAAATTAGTTCTCCCTCA GAGGAGTTAGAACATCGGAATATCTGGCTTTATATAAGATTGTCAAAAAA GACAAAGATAGATAGATGTTAGATGTTGTAACTTTAACACTTGTTTTGTC GCTCCAAGACAAGGGTATCTTACCTTTTCACAAGAGCACTCCTACACTTG TGATTTCGACAACGTCATCGAGAAGAATTTTCCTTGCATTTTCGTTACCA ATCTCCGTTAAGGGTTAATAGGTGTGTTAACGTTTACTTCCACTTCTTAC AGGTGCTGACAGTGGTAGAGTTGATGAAGGATGGAACTGGTTTTGGAATG AGTTTAACGGTAAGCTCTTAATCAAAAGGCTAATTTCCCGCCTCGCCTAA TTTTGTAGAATCTACCCGTAAAATCTCTGTCGAGTATTTGCtactaaaaa tatcaaaaaaaatcattcattaACGGACTTTAATGGACTTTGTCTATTGC atatttttttgcgattcgACTTTAAAAACCACGGGATTGAAATCTCAAAT CTCACATCTCTTATAATCTACACAACACCATTTATTTCCTCCATTTAACA ATCATCCAAACATTTGTTTTAAAGGGTGGACCTGAAATTGGTGGCATCTT TGTTAAAGCATTAATGCCTGAAGGAGTAGCTGAGAAAGATGGACGTGTTA ATATTGGTAAGCTGTCAATGTAAATAAACCTTTACATAGATTATGTCAAA AACAACGCTTACCTCTCCTTCAAAGTATTGCTATGGTGATTGATTACCAG AGGAGTTTATTAGAAGTTGACTCTATTCATAAAAGTAACATTTGAAGACA CgagggatttaatcaccttggtaattatttcaaaacaaggcGATCGAATT TATGAATCCTGAATCCTGAAAAAACAGATACCTATATACGTTACACATGC TCAAGGATGTCAAGTAATGAGTCActtgaaggttttatttttacaagagt gtttctgtttcatatcaggacagtgtattcgtattgttatattatgctga tataagcaaaaaaatattttctcttcatCTTTCTCATCAATGTTGCTCCA CATActtgtcaatccaatgtgaaaaagcttttgatttaaaattgacgagt aagcaaacgatatcactcttatttaaaaacaaaacctttgatactatttc aatctcaaatttCGTTCTTTTAGGTGATCGTGTCGTTGAAATGAACAGTT CATCCCTTGATGGATACACGCGACAACAAGCTACTGAACTGTTGAAAAAC AGCCCACCCAAAGCAACCTTCATCTTGGAGCGATATAAACAGAATCGAGC TAATCTGGTAAGGTTCATTCAATTTAGAATTTAGGGAGCTGAGTTTTTGC AGAAAGAAAACTCCTCTCGTCCGTTTTTGTTATGTACTCTCTAAACAGGG GAGACTTTTAAGTCAAGACCTCTGTAACTCGAATTTCTCCTTAACTCGGA CAAAttttctggtcccttcagttatttgacaatgccttataagctttact ccataactcgaaattttcataaatcgtacaaatttgtgttccccttaCAT GTTCGAGTTATCGAGACTCCATTGTAGACTccatttataagaacatttga aattttgaaaccttaagatgttctttagcttttgaattttaagcctacga tatgttcttaacatgttcttattttcaccattttgtgagcatttttaact tgttcttaacattttggccatcaaagttttatgttcttatatagtatgtt cttataaaaaacgtgtacctatTCGTCACCTACTCTCCCAAACCTGACGA ATTATGTTTCCTTAGTAGCTTTCTATTTTATTCTGCGGTTTTCCACAACC AGCCGCAATGAATGTCTTTGTTTTAATTGATTTGAAATgttctattgtta tttttagGATGAAGAACCGATAACCAATTAAAGTTAATGACTTAAATGAT acttttaaaacttaaaatataACTTATAATGTCTTATTATTGTTAACATA TTCAAACATATAAAGataaataagtaaaaaaaaaaataacttaaaccaac gatgtaaaaataatagataaccaactacctctagaaggcacttctcccaa gagaacaaccattgttttcctattgaaatgagcactctattaaaaagctc tgtgtgcagtgcgtgttatgcttttagctagattttgacacactttttga catccactgaattgagagaaaattgaattgttatttactgcaaattttgg aatttttttcaaaagataaaggtaccaatctttagacaaattgactacgg atcggcctgataccacttaatcttcatctggataaataaacgctcataaa atgctgttatctgaaaaatatatgtgtgatttgaaatgcgatatctcacg tatgaaaagtgcatgaaggttgcatgatacaaaataaacagatgaatgtt tatagaacaataatatctaattaaaaaattttctctgtgaggctgcctac aggaaaatacactttttctaacccaaattttggaaaaatatacatcacgt gatcgattttgtccaatagaaggttgcaaatgaagcaagtttttatttaa ttgccttttttacgatgcaaaatgtcattaatatttttacatccgtaaca cggatgttttttgagaatcaaggcaagttggttatctattatttttacat cgttgcttaaaccagggatatgttatagcggagctggatgaaggacgaga actccttagcggattgcttctttgtcttttctattgtaaactgttgataa tagaaatccatctctgtctgcttgagtgttctgtttttgtaagaaaaatg aAGTAGACAAAGTAtccatgcagtacgtttgcacatattttgctacgATG TTCccacttttcatcaaaataatatttgtagaagatatgttaatgttaat gttaatgtgtatattctttaaagtcgaaaaaaagtgtacaaaaatgtact agctttaaagctaatagagttcgactgcctattttacaaaatgaatcatt catcaccatctgttgatgcccaatcgctgacgatttcttctgtagagtat tttggtttataatttgaagatattttttgtttggttttgtaattttttaa cgattcgtagttttgttcttgggcttcctctaACGCGCCAGTTGAAGTCT TTATTGTTAAagtctttgttaagtttctttgcttgttcgtgcatctcctt tatctttttccgttcgttgattgtgaaatcttccgtgatacttacctgaa agaaacaagtttctttcagcatgtgtaaattcttcatgataagatatttg tcatgctgactttgtagggtgactttaagaggacggccgttttttgtttt tctgtttcctaatctgtggtgagtaacatttatttctggaacattgatgt cctccaggagttctcggaaccgaaatatgtcatatttttcccattttctt ctttttccttatctgggcctgaatattcgagaaacccgtgaacgatgata ttcagttttctagagtctatgtctttCttttcactttcttccTtCCGTTT TTGTTGTTCGGCAGATCTTAAGTCTTCTTTGTGCTTCTTAGTAATttcgg cgtatgttttctttgatgtctccgtcattatttctgttgtgtgcttgatt tcttcctttatcatggttcttgtcttttcttccatttcttgtaggtttcc tgccagaaaaattttgagatcatttttgatggaatcacgggttttggtgt tggtgttgacctcgttgttcagtttttgtatgacgtcgtctttcttttta agttaattttgcataatatgttgagtgtttttccccactttatttcttag gttcttCGTTATTCGGACCCTTTGATACAAAGGtagctgtgtgcactcat aatgaactgatcttttacattttttgcattccaagcgatccaggtcttcg TCATTGGTACATCTTGAaggcgtgcaagcttgaggtggtgaggctgcttc gaaaggctgatctttatccattttgatgttattttcatgaattttgatgt ttttgtttgttttcagccatttttccgaagagcgttgcaaaagcgtctta tctaattgacgtcaataaaaaacaagataccccaaaagcttccttgtaaa tgaaatctatttttatcagcgtgtgttatgaatttgagaagctttcatga tttctttttaaaaattttggatgtaaatattttgacaaatattgtttcaa ttgacttgaatttttttccataatcagacaataccgacttgctatctgaa aatatcagttagaaagtgaggcaccccgcggtgtaccgcggtatttcaaa tgaaaaagtactatttataatcttacagaagaaatttcttataactttac taatgaaaacaatgtttttcatttttttaaattgtcatttcaccaatgtt ttacagaccctcttgataattaaaagtttttaatcgtgaacgataaatgc agcagcagaatcattggctaagaggaaatccaaatttcacgagtttgtaa ttaaaaaagttaaatttcatatcaaattttaatgtcagggacagagatag aacaagtcttttttaaatgtgcgttatccagcttcgctataacatatccc tgcttAAACTAACTTTACTCATTAATAAAAGTATGTAGGGTTAGGGTCAA AAGgctttttcaggcaaaatatctcatgTCACATGCGATAATAAAGAACG GAAAAATGCGTTTGTAATTTCTTCCTCGGGCCTTTTATAAAACACATGTA CAGTCAAATCTCTCTagttcgaacctctattattcgaatcttcctgtaat tcgaactaaaatattgatccCCCAGCTGGAATGGTTTTAAATTAATCTCT GTAATTCGCATCTTtaaataattcgaataaaatttgTAGTCCCTTGAAGA TTGAATTAGAGAGGTCGACTGTATCAATTATCAATGTAATAtaaaaattt tgtagaaattaaagttttaaaatgtagattttttataaattattgtaagt aaattCCTTAAAAATAACTTCTCTTAATTACTTCATAACAAAACCCGCAT CACTAAATACTTTTAACCCATCATTTTTAAACATACTTTTAAAGCCTTTA ATTTTGTCGTCCCAGTTAGTGTTTCAAAGATCTCAATTGTTTTTGTTCTA TATGAATTCTGCAAGCAAATTTAATAAATAGGTTTATCCTCGAATATATC TAACGTTTACCCCAGCTGACatgcaacgttgtttcaacgtttatctaacg ttcacaacgtccatataacgttagatgaacgttgagacaacgttgtgtgc ttGCTGTGACGCCATCATTAAAAATGAAGTCAACAACCGCTTTTTATACT CAGAACGTATCTCAAATTATTAATcgtttatttataaaaaaagcaaaatg aatGTTTCCATCACATCCTTGTGAGGGAAAAATGAGAGTAGCACTTGAAT ATTACTTAGACAAGGGAGCTTTTCGAGGCTTGATTTTTCAGAAAGGGCtt tttttGATAAgatcaattttataagaacacgaggctgaaaattcgccaaa attctAGAGACAATTAAGAACAAGCCTTAAATTAAGAACAGTCTGAACCT CACATCTCAGGAATTACGAAGATAGTACTGGTTTTATTAAACCTATTTTA AATTTATAATcaaagaaactaagcgtatgGAGAACCTCGTAAGAACATat gcctgaaaatttcaaataattaagaacagcccagcatGAGCCATAATtta atggttcttataaaaaagcgtgtatttataTTCCTTTAACGTTCATTACA GCGGCGTAACCGTATCAATGCGGCCACATCAAATGGGCAGTTACAAACAC TGGTTGAAGAGAACACCTCTGATCAACCTTTCTCATTTCCCTTATACAAT GGTGCTGCACCCTCGGTTccaccaagacatcaaaaccaacaacaaactat tcaacaaaatcaccatcacattcaacaaaacaacatgctacaaaaccaac aaaacaatatgctgaatcaacaaaataatatgctgaatcagcagaatcCA CTACAAAGCCAACAAAATATCCCATCTCGTGAAAGTGCTTTTAAACAACT ACAGCTTCAACAACATCAACTTCAGCAGCAACAGAATCAATTGATGAATC CTTCTAATCAACAACAAACTAATCTGttgaatcaacaaaaacaaagcGTT GGACAACCACCACAGAATTTTCATcaacaacacttacaacaacagcaaca attgttattaagacaacagcagcagttgcaacagcaaAGGTACGTTCTTC CCCATTCCCTATACCACTCTTTGTATAACGTGACTGACAGAACCGACTAA TGTTTCCCCTTAAAGTAGTGGCTATAAGCAGTCGCGGTTTGAGAGCTTGA TTCTTTTCCCTCATGTCAAACCCATATTTTAGCGATACATTATGCATACT CTTAACCTGacgtttttgttcattttacaGTCTTGGAGCGGGCCAACCAC AATCACTTCCTATGGGCACGCATCAACAATCGCGAGACTTGCAAGTAGAA CAGCTACCTCAGATGCAACATAACACTCATCAGGGAAACTCTATATCAAG CCGTATTCCCTCGCTCATTCAACGTCAGCAATCACTAGACCGTGGAAGTG AAAATTCTCAAGCTCAGCTCAATCATGGACAACATTCTCAAAGCCAATTC CGTCCATCACAGCCCATACACCAACACCAAGGAGCTTCACAACAGCAAAA CGTACATGGATCGCATCAAACACAGATTGCTCAGAACTCTGGCCCTGACC CTCAAACTGGTGGCATGGACCTCGAAATAGGTCCACTGAACATAATTGAA CAGCCCATGCGACGCCATTTAGTCGCAAACAACGAACTGGCTGAAGACTC tccacaaaaatttttaaagcaattCTCAAAGTCAGTCAATACGCCCGGTG CGGCTCCATCTTCTTCTCGTCTCCCCCTCGGCCCCATAGCGTCAGTCATA TTTGGTAATAATACGAACGCGAGAGGTGTTCATGAGATCACAGACATAAG TGAGGATGCTTTACCCGAAGATGTTCAAAAGGTTCAAGAGGACATCCGTG ACTTGAGAATATTACGTGACACTATGTATAAACCGGCAGAAACGTCTAAA CCAGCCGGCTCGTTTATAGGGATCGGGCCGATATTACCTCCACCGCGAAG TATAGACTCTAACAAAACGGACAAATTCAATCAAGATACAGTTGTTCGGT TACAAAACGGGAAATTGAATACTCAAGTTTTGACGCCCACCACGGGCGGT ACTTCATTGAACACGAACCGTTCGCCTGGTTCGCATCCTTCAAGTCTCTC AGCTACACCCGGTAACATGGTTTACACGGAAGACTTACGACCATCAATAT ACGCCCCAGTCAATAAGAAATCCGTCTCACCTAACGCTCAACCTGAAGTA ATAGACCTTGATAAACGCCCTCCTGTACGAGGGCCCGCCCAACGTTCAGG AATGGCagatcaaaatcagaaaaagacgCCCTCAGCTGGAGTTGGAGGGG GCGGTGGTGGTTTAAAATGGATGAGCTTAAATGACGATAGCAGTTGTAGT CCTGTAGTTTCACCGCGTAACTCAATCAAACATAGAGGGGAAAGTCCTAA ACAACAACGGGAAAATCCAAAACAGCAGCCACAATCTTTTTCGAATCCGA TTTATTCGACTGCCTCGATTCCTACATCGACGGTGAGTAGCTCACAAACG AACTTTAACACACCGTTATATAGTCGGGGTGGTACTTCAGGCTTGATTAA CATTACTCAAGACTCAAGACAGGTCGATCCGAGATCAACACACCGACAAC CGCAgctgcaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaaaacaactCG TTGGCGAGTCATTCATCTTATTCAGCGAGTAACGCAACTCGCCAACCATC GCACAGTTTACCGAAAACCAAACCGGCGAGCTCGGTAATTCCAGTTCCGT TGGCATCAAGGTTTAACCAGAATCCCCATAAAAGTCCTTTGGACGGTAAG TGATCAGCTTCCGGTGTTAAATGGATAATCAGATCtattattttcagaaa aactaataaaatctTTGCCTAAATATTTCCAGTATTGAGATTTGAATATT TTAGGGTCTCCTTCATATGCTGCAATATCTAAAAGATATTCAACTCCTGC AACTTTgaccaaaagatttttaaatataatttttttgttgcatTTGAAAG GGTTGCATTGATCAATAGTTTCCTTCCCTCTAACGGTTCTTCTATtgttt tcctgctcaaaatcaAAACTGTTTTACAAATCCCAATACACGATTTTTAA GCAGCttggggttgcttagcattctagctcatcttctgaaaaatttgctt tgagcCCCCCTGATATTATACAATATAATTGGCAAGTTTGCACCCTCGAG CTTTAGCCACCAGGTTGGTTAAAAAATGTATACTTTCTATGTAAACGAAC ATTGCTTACAATCGATACGCTTCCAAAATAaatatattgacttattttat aGGCGGTGATTACATATTTGAGGTGACGCTCTTTAAAGGAACATATGGTC TGGGTATGAACCTAGCTGGTGGAGGCTCTGACGACAGTAAGTTGTTACCA CTGATCTCCAACTGTTCGACTGGATCGGGCTTTCTATAAATAGGGAGCGT GTCTAGTGATAAAGCTACTGACTAATATATTGGTTATATACCCTGGTCGC tacgaatgttttgaaattgaagcgttcgaaaatctaacgtACTTAGAAAA CAATTAGGCGCCTTTATCACTGGACACAATTCCATTGGAAATCAGTAGGA CAGTATCTGGGGTGTGCAAAGGAATATCATAAGTTGAAATGAGGTTTTTG GGCCTCCAGTTAAGCTTGAATAAGACATGACATGGGTCTATATCAATGAA AACATTAGTTTTTCAACAATGGGTCAAAAATTCTACTTCAGCGCCGAAAT ACGTTATTACCCTATTAAATAAATATTATGAGACATGTAATTAACACGAA TGGAAAATGATTTTTGTATAATTACTGTGCCATAAAAAATCTGCTTTCCT TCACAAACTTTGccccccccTTATTGTCTACATTACTGCCCGCTAATTCT TGAAGGCTCGCTTTAAATTTCAAACCTTCTCGTTCGTGTTGATTTGACAT TAATTACTtcccgtcaactgctctaacttgggacgaatggtcgaaacatg ggactggttgatatctggtctgtgttttcacttactgttaaatctcttta acaacaaatttgttttgataactccaccaagtttatcaatcatacttctt cgttcctcttagagtgcacaaACACTTGCGTGTGtcccactacggatttt tttcaaatttcgatttaaaagcctactcggtgcgaaagagaaatcgtgta ttttttaatacgccgtttattaactcaaatcaaatgactttggaggttcg gtgaaatggtggccgaattgccgtcccatgttttgtcagatagtcccaag ttagagcagttgacggtccATACtaatattcatgtaataaggtatgtTCT ACttttgcttctttcttctgCAGACCCTGTGGTGATAAAGAAGATAGCGG TAGGAACTGCTGCTGACGAATCTGGACAACTTCGCGTCGGTGATATTCTA CTAGAGGTATTTTTTATCACCACctaatcttcatttttatgataGTTCCT TCCTAGTCTAGAGATCTCGAGTAAGATTGTAGATAAATAGTTGGTTGGAA CGTTGGAGctgaatagatcttatcggagtttttttatttttctaaaaaag cgatgcattgtgggaatGTTTCggaagtattacaatagaaatctcttagg aattcctcgcgGGAATCCctcaatgcatcgctttttttagAATAATCTTA AACTCCGTTAAGATCTATTAAAAACGCCTTTAAAACGCGGATAACTCAAG AATACTACTGTAATGCATCTTGTCCTTGTGAATCTGGGTTAGATTAATCA TGCTAGTTCTGTGAATATTagtttattttcaacatttagtGAGTATTTTG GCCTATTTGTTTTTCTCAGGTCAATGGAAAACCAGTGTCTCACCTTCAAG CTAAAGAAGTCATCGCATTATTGCGTGCATGTCCGTCCGAGGTGCAACTC CTTGCTAAACGACCGGCATTCGAAGTACAAGCACAGAAAAATGTGACGGG AGGTTCAAATTTGAATTACAACGTTGGTCTATGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000270_pilon:412386..428819+

>XLOC_005484 ID=XLOC_005484|Name=XLOC_005484|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=6582bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000270_pilon:412386..428819+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAGGGCTTTAATACTATTGTGGATTATTTTGACCATGGTCGTGTGAC
CGAGGAGAGGGTGTGTTTATTACCAAAACACCCTTTACCTTCACCTTCAG
CATTCTATCATAATTATGGGATGAAGGGCTTTAATACTATTGTGGATTAT
TTTGACCATGGTCGTGTGACCGAGGAGAGGGTGTGTTTATTACCAAAACA
CCCTTTACCTTCACCTTCAGCATTCTATCATAATTATGGGgGTGGCGTTG
AGTTGGGTGGTATTTACGTGAAAGGGCTTTTACCTGGTGGGTCAGCTGAT
AACAGTCGCAAAATTGTGAAAGgGTGGCGTTGAGTTGGGTGGTATTTACG
TGAAAGGGCTTTTACCTGGTGGGTCAGCTGATAACAGTCGCAAAATTGTG
AAAGGTGATCGTTTGTTAGAAGTCAATGGAATCAGTGTGGAAGCTCTTTC
AAAGAAACAAGCCAACGATCAACTACGAAAAGCTACTCAAGTGTCTAACT
TCATTTTGGAACATAACACTGTTTACGATAATCTCATATTGCCAGAATCG
GTGATCGTTTGTTAGAAGTCAATGGAATCAGTGTGGAAGCTCTTTCAAAG
AAACAAGCCAACGATCAACTACGAAAAGCTACTCAAGTGTCTAACTTCAT
TTTGGAACATAACACTGTTTACGATAATCTCATATTGCCAGAATCGGAAT
TCTTCACAGTAGAAAtccaaaagaaacaaaatggaTATGGCTTGAGTTTG
ACTGAATTCTTCACAGTAGAAAtccaaaagaaacaaaatggaTATGGCTT
GAGTTTGACTGGTGGACCCGAGATTGATGGAGTATACGTGAAACAGGTGC
AAAGAGATAGCGCTGCTGAGCATGACGGAAGGatcaaaaaagGGTGGACC
CGAGATTGATGGAGTATACGTGAAACAGGTGCAAAGAGATAGCGCTGCTG
AGCATGACGGAAGGatcaaaaaaggGGATCGCTTGATAACTATTAATGGA
CGTAACGTAGAAAATTCCACACGACAACAGgGGATCGCTTGATAACTATT
AATGGACGTAACGTAGAAAATTCCACACGACAACAGtgtACCAGTATGTT
GAAGTTATCTCAAGATATTGTTGTACTTCATTTGGAACGGTGTGTCGTTG
GTGATGACCTACCTCCTCTAGATACTtgtACCAGTATGTTGAAGTTATCT
CAAGATATTGTTGTACTTCATTTGGAACGGTGTGTCGTTGGTGATGACCT
ACCTCCTCTAGATACTGTGCTGACAGTGGTAGAGTTGATGAAGGATGGAA
CTGGTTTTGGAATGAGTTTAACGGTGCTGACAGTGGTAGAGTTGATGAAG
GATGGAACTGGTTTTGGAATGAGTTTAACGGGTGGACCTGAAATTGGTGG
CATCTTTGTTAAAGCATTAATGCCTGAAGGAGTAGCTGAGAAAGATGGAC
GTGTTAATATTGGGTGGACCTGAAATTGGTGGCATCTTTGTTAAAGCATT
AATGCCTGAAGGAGTAGCTGAGAAAGATGGACGTGTTAATATTGGTGATC
GTGTCGTTGAAATGAACAGTTCATCCCTTGATGGATACACGCGACAACAA
GCTACTGAACTGTTGAAAAACAGCCCACCCAAAGCAACCTTCATCTTGGA
GCGATATAAACAGAATCGAGCTAATCTGGTGATCGTGTCGTTGAAATGAA
CAGTTCATCCCTTGATGGATACACGCGACAACAAGCTACTGAACTGTTGA
AAAACAGCCCACCCAAAGCAACCTTCATCTTGGAGCGATATAAACAGAAT
CGAGCTAATCTGCGGCGTAACCGTATCAATGCGGCCACATCAAATGGGCA
GTTACAAACACTGGTTGAAGAGAACACCTCTGATCAACCTTTCTCATTTC
CCTTATACAATGGTGCTGCACCCTCGGTTccaccaagacatcaaaaccaa
caacaaactattcaacaaaatcaccatcacattcaacaaaacaacatgct
acaaaaccaacaaaacaatatgctgaatcaacaaaataatatgctgaatc
agcagaatcCACTACAAAGCCAACAAAATATCCCATCTCGTGAAAGTGCT
TTTAAACAACTACAGCTTCAACAACATCAACTTCAGCAGCAACAGAATCA
ATTGATGAATCCTTCTAATCAACAACAAACTAATCTGttgaatcaacaaa
aacaaagcGTTGGACAACCACCACAGAATTTTCATcaacaacacttacaa
caacagcaacaattgttattaagacaacagcagcagttgcaacagcaaAG
CGGCGTAACCGTATCAATGCGGCCACATCAAATGGGCAGTTACAAACACT
GGTTGAAGAGAACACCTCTGATCAACCTTTCTCATTTCCCTTATACAATG
GTGCTGCACCCTCGGTTccaccaagacatcaaaaccaacaacaaactatt
caacaaaatcaccatcacattcaacaaaacaacatgctacaaaaccaaca
aaacaatatgctgaatcaacaaaataatatgctgaatcagcagaatcCAC
TACAAAGCCAACAAAATATCCCATCTCGTGAAAGTGCTTTTAAACAACTA
CAGCTTCAACAACATCAACTTCAGCAGCAACAGAATCAATTGATGAATCC
TTCTAATCAACAACAAACTAATCTGttgaatcaacaaaaacaaagcGTTG
GACAACCACCACAGAATTTTCATcaacaacacttacaacaacagcaacaa
ttgttattaagacaacagcagcagttgcaacagcaaAGTCTTGGAGCGGG
CCAACCACAATCACTTCCTATGGGCACGCATCAACAATCGCGAGACTTGC
AAGTAGAACAGCTACCTCAGATGCAACATAACACTCATCAGGGAAACTCT
ATATCAAGCCGTATTCCCTCGCTCATTCAACGTCAGCAATCACTAGACCG
TGGAAGTGAAAATTCTCAAGCTCAGCTCAATCATGGACAACATTCTCAAA
GCCAATTCCGTCCATCACAGCCCATACACCAACACCAAGGAGCTTCACAA
CAGCAAAACGTACATGGATCGCATCAAACACAGATTGCTCAGAACTCTGG
CCCTGACCCTCAAACTGGTGGCATGGACCTCGAAATAGGTCCACTGAACA
TAATTGAACAGCCCATGCGACGCCATTTAGTCGCAAACAACGAACTGGCT
GAAGACTCtccacaaaaatttttaaagcaattCTCAAAGTCAGTCAATAC
GCCCGGTGCGGCTCCATCTTCTTCTCGTCTCCCCCTCGGCCCCATAGCGT
CAGTCATATTTGGTAATAATACGAACGCGAGAGGTGTTCATGAGATCACA
GACATAAGTGAGGATGCTTTACCCGAAGATGTTCAAAAGGTTCAAGAGGA
CATCCGTGACTTGAGAATATTACGTGACACTATGTATAAACCGGCAGAAA
CGTCTAAACCAGCCGGCTCGTTTATAGGGATCGGGCCGATATTACCTCCA
CCGCGAAGTATAGACTCTAACAAAACGGACAAATTCAATCAAGATACAGT
TGTTCGGTTACAAAACGGGAAATTGAATACTCAAGTTTTGACGCCCACCA
CGGGCGGTACTTCATTGAACACGAACCGTTCGCCTGGTTCGCATCCTTCA
AGTCTCTCAGCTACACCCGGTAACATGGTTTACACGGAAGACTTACGACC
ATCAATATACGCCCCAGTCAATAAGAAATCCGTCTCACCTAACGCTCAAC
CTGAAGTAATAGACCTTGATAAACGCCCTCCTGTACGAGGGCCCGCCCAA
CGTTCAGGAATGGCagatcaaaatcagaaaaagacgCCCTCAGCTGGAGT
TGGAGGGGGCGGTGGTGGTTTAAAATGGATGAGCTTAAATGACGATAGCA
GTTGTAGTCCTGTAGTTTCACCGCGTAACTCAATCAAACATAGAGGGGAA
AGTCCTAAACAACAACGGGAAAATCCAAAACAGCAGCCACAATCTTTTTC
GAATCCGATTTATTCGACTGCCTCGATTCCTACATCGACGGTGAGTAGCT
CACAAACGAACTTTAACACACCGTTATATAGTCGGGGTGGTACTTCAGGC
TTGATTAACATTACTCAAGACTCAAGACAGGTCGATCCGAGATCAACACA
CCGACAACCGCAgctgcaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaaa
acaactCGTTGGCGAGTCATTCATCTTATTCAGCGAGTAACGCAACTCGC
CAACCATCGCACAGTTTACCGAAAACCAAACCGGCGAGCTCGGTAATTCC
AGTTCCGTTGGCATCAAGGTTTAACCAGAATCCCCATAAAAGTCCTTTGG
ACGTCTTGGAGCGGGCCAACCACAATCACTTCCTATGGGCACGCATCAAC
AATCGCGAGACTTGCAAGTAGAACAGCTACCTCAGATGCAACATAACACT
CATCAGGGAAACTCTATATCAAGCCGTATTCCCTCGCTCATTCAACGTCA
GCAATCACTAGACCGTGGAAGTGAAAATTCTCAAGCTCAGCTCAATCATG
GACAACATTCTCAAAGCCAATTCCGTCCATCACAGCCCATACACCAACAC
CAAGGAGCTTCACAACAGCAAAACGTACATGGATCGCATCAAACACAGAT
TGCTCAGAACTCTGGCCCTGACCCTCAAACTGGTGGCATGGACCTCGAAA
TAGGTCCACTGAACATAATTGAACAGCCCATGCGACGCCATTTAGTCGCA
AACAACGAACTGGCTGAAGACTCtccacaaaaatttttaaagcaattCTC
AAAGTCAGTCAATACGCCCGGTGCGGCTCCATCTTCTTCTCGTCTCCCCC
TCGGCCCCATAGCGTCAGTCATATTTGGTAATAATACGAACGCGAGAGGT
GTTCATGAGATCACAGACATAAGTGAGGATGCTTTACCCGAAGATGTTCA
AAAGGTTCAAGAGGACATCCGTGACTTGAGAATATTACGTGACACTATGT
ATAAACCGGCAGAAACGTCTAAACCAGCCGGCTCGTTTATAGGGATCGGG
CCGATATTACCTCCACCGCGAAGTATAGACTCTAACAAAACGGACAAATT
CAATCAAGATACAGTTGTTCGGTTACAAAACGGGAAATTGAATACTCAAG
TTTTGACGCCCACCACGGGCGGTACTTCATTGAACACGAACCGTTCGCCT
GGTTCGCATCCTTCAAGTCTCTCAGCTACACCCGGTAACATGGTTTACAC
GGAAGACTTACGACCATCAATATACGCCCCAGTCAATAAGAAATCCGTCT
CACCTAACGCTCAACCTGAAGTAATAGACCTTGATAAACGCCCTCCTGTA
CGAGGGCCCGCCCAACGTTCAGGAATGGCagatcaaaatcagaaaaagac
gCCCTCAGCTGGAGTTGGAGGGGGCGGTGGTGGTTTAAAATGGATGAGCT
TAAATGACGATAGCAGTTGTAGTCCTGTAGTTTCACCGCGTAACTCAATC
AAACATAGAGGGGAAAGTCCTAAACAACAACGGGAAAATCCAAAACAGCA
GCCACAATCTTTTTCGAATCCGATTTATTCGACTGCCTCGATTCCTACAT
CGACGGTGAGTAGCTCACAAACGAACTTTAACACACCGTTATATAGTCGG
GGTGGTACTTCAGGCTTGATTAACATTACTCAAGACTCAAGACAGGTCGA
TCCGAGATCAACACACCGACAACCGCAgctgcaacaacaacaacaacaac
aacaacaacaacaaaacaactCGTTGGCGAGTCATTCATCTTATTCAGCG
AGTAACGCAACTCGCCAACCATCGCACAGTTTACCGAAAACCAAACCGGC
GAGCTCGGTAATTCCAGTTCCGTTGGCATCAAGGTTTAACCAGAATCCCC
ATAAAAGTCCTTTGGACGGCGGTGATTACATATTTGAGGTGACGCTCTTT
AAAGGAACATATGGTCTGGGTATGAACCTAGCTGGTGGAGGCTCTGACGA
CAGCGGTGATTACATATTTGAGGTGACGCTCTTTAAAGGAACATATGGTC
TGGGTATGAACCTAGCTGGTGGAGGCTCTGACGACAACCCTGTGGTGATA
AAGAAGATAGCGGTAGGAACTGCTGCTGACGAATCTGGACAACTTCGCGT
CGGTGATATTCTACTAGAGACCCTGTGGTGATAAAGAAGATAGCGGTAGG
AACTGCTGCTGACGAATCTGGACAACTTCGCGTCGGTGATATTCTACTAG
AGGTCAATGGAAAACCAGTGTCTCACCTTCAAGCTAAAGAAGTCATCGCA
TTATTGCGTGCATGTCCGTCCGAGGTGCAACTCCTTGCTAAACGACCGGC
ATTCGAAGTACAAGCACAGAAAAATGTGACGGGAGGTTCAAATTTGAATT
ACAACGTTGGTCTATGAGTCAATGGAAAACCAGTGTCTCACCTTCAAGCT
AAAGAAGTCATCGCATTATTGCGTGCATGTCCGTCCGAGGTGCAACTCCT
TGCTAAACGACCGGCATTCGAAGTACAAGCACAGAAAAATGTGACGGGAG
GTTCAAATTTGAATTACAACGTTGGTCTATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_005484XLOC_005484-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000270_pilongenomesc0000270_pilon:412386..428819 +
Properties
Property NameValue
Aaloc3127-3291:16270
Aaloc3046-3126:15776
Aaloc2962-3042:14705
Aaloc1396-2958:12632
Aaloc907-1392:11952
Aaloc775-906:7226
Aaloc691-771:6625
Aaloc634-690:6303
Aaloc544-633:5927
Aaloc490-543:5338
Aaloc406-486:3203
Aaloc349-405:2837
Aaloc205-348:884
Aaloc121-201:487
Aaloc1-120:1