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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000018_pilon:2384891..2391343+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_005302 ID=XLOC_005302|Name=XLOC_005302|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6453bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000018_pilon:2384891..2391343+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atggaaaacaaaaaactattaTCACCAACACGGCAGAGTTTGTTTCGAGC
ATGCAAGTCTCCTGCTAAACAAGAAGATATCAGAATTCCAGAGCCAGGTA
AAACGTATTTTATGTTATACTCAAGGCTGAATTTCACGACTAGTCTTGTC
ATCCAGATCAGACTCAatcaaactgaaaataattaattcatTGACttaaa
cacatgattttcaaacacattgtcttttttattcaaaattgtaGAGAAGA
AGATCAAACTTGGAGCTGATTTGCTCAATGCTTTTCCAGAGATCgctgaa
aattttgatattatcAAGAAGGTTGGAGAGGgtaattattaaatatttca
agtGAAACAATTGACCATCAAGGACTTGCAGCTAGCAGGTTCACTGGTCC
TCTGATAAAAAATTGGGCTTTTTTAACTTTCGAATTTTGCTCCAAAAACA
CTCCAACACTAGTTTTCTCTGGAGTAGAGCCAAATGATCAGTGAATGGCT
AACACAGGTCATTTAAAGTATAATCTCAAAGTTTATATAAGAtttaattg
tttaaaaaaggtATTTATTTTTAGCACTGCTTAGCAAGACTAAtccagga
aaatattttttgcattattagttttcattttcactttctaagctttcaaa
aatttcatatatacccgtgacctgtgacctgtgttttacactaaccgtac
AATCCCTATCATAAGTtattttttactgtcagactaaTACTAGATTATCA
TTCAATTCATACAAAATAATAAAGGAAATAATCTTAATAAATCTTATCAA
CTTAAGCTTTTGATTGATTTATTAATTAATAATCATTAACTAATGAAATA
ATACTTTagattaatttcattttctagGTACATTTAGCAAAGTGTTTCTT
GCCAAAATGAAATGTGATTCATCCAAAAAGGTTGCTTTTAAACATCTAGT
TCCAACAAGCTCGCCTGGTCGCAtagaaaatgaattaaaatgCTTACAAG
AGCTAGGGTAAGTTTTATCATTCTATCCTTTTTTCTGTATAACGAAATTG
GTAATATTGTGCTATCTCAGCCTACTATCACAGCCGCcgtagatttataa
agcccgaagggttagatgtcatgctttaagcttttccaagcaacaaaaat
tgaaaatcgcaaaaaatattgttgctattgtttttgaacACCTGCgaggc
ttctgattggtcaagggttgaaattcttttgtaatgtcacttgacctagg
taggatttacTACATAGATAAgtcacacttttcagccaaagcacaaTACT
CAGCTGTTCTGATAACAAAGTTTTAGAAAGTGTAAAATAATTTCTGATTT
cagtttgaatatttttctcTCTAGAATTTTGATTGGCAACTTGaaaatta
acatattaataaattattaataaattattaattattttcCAGTTGTctca
tctttttctttttatagtaATAAGAATAATGTTCTTGGCATCAAGACAAC
ACTGCGAAGGAACGATCACATTGTATTCGTCCTGCCTTACTTTCCATACA
GAAAATTTAATGTGAGCTATTAAGATTATTTGCATGttcctaaaaaaaat
ttaatctgtGAAATGCATGATAAtaatagtgaggtctgttagcacataaa
aacgtaagaatacttcagatggtgattaaagcatgaaatttggcacagat
gatccttagagggtctaaaacttaattttaaacagtaacaccaaattttg
ccacctggccacctgccagatgacgtcatcaggtggctgggcaaaaaatt
aattttttgaaaatattcaaaatctgatggttccagctgaaagagcatga
aatgctgataaaaattgaggtataaaacatgccttgaaaatcttcctatc
aaaagttatggaggttgaaagttttttgatgacgtcatcataagcctttc
caggcaaaaattaaaaacctcgtaattttggtacaaattgAccaaatttc
atgttttatacatgaattcatatcaaaattcattgctttttccgattccg
atgttcaaattgaattaaaagctttaaatcctacagaatactaaaactta
gattttgagctttacaaggcaaatcaacgcagcgttctcccttcaggagc
acagtgtacaaccaaataatttctttggatgttttaagccttcctatgtt
gtttagatccaagcatcagatggaacttcaaattttgacatggattcatg
tataaaacactaaatttggtcaactagttccgttattacgggattttagg
ttttgcctggaaaggcttatgatgacgtcatcacaaaactttaaaccttc
ataacttttgataggaagattttgaagacatgttttatacctcaattttc
atcagcatttcatgctctttccgctgataccatcagattttaaatatttt
caaaaaaataaatttttgctaagccacctgatgacgtcatctggcaggtg
gccaggtggcaaaatttggtgttactgtttaaaattaagttttagaccct
ctaaggatcatctgtgccaaatttcatgctttaatcaccatctgaagtat
ttttgtgctaacagacctcactataaagtctgttccaaaaattcaacata
agaagacaaaataaccccagcgagatcgctcaatgtttcaatttcagtct
aaaaaggctgattttttccgattctgggtagcaaagtGCATGAAAGcagg
ggttattttgtctttttatgttgaatattagtacaagacaccttTTAGCA
ACCATTTTGCCCTTTTCCTGCCCATTCATGGCCTTAGAATGGgcaaaaaa
atgccatttttactcatttttcccTTTAGTGAGAATCAAAGACCTCCCTG
GGaaatgctggattttttatctaggaggttaaaaattgagcaaaatgtTT
TACAATAGATttttactttcacaaaaaaatactacactttgaattttttg
acttcgcatttgacgatctaccctattGTTATTCACTTAACAAAAAAGGA
AGCAAAAGTATTGCAAAcgataattttcatttttaattgaatTGCTTATT
GCTTATCAGCTCAGTTgatagagcattcgccttacactCCAAGGGTTGTG
AGTTTAATCCCCGGTCATCGCCAATtcagcgaatgagtagcttagattgg
gtaatttGTTCTAAGCAGTAAGTTACTGGgggctgagagtaggtgtggcg
ctccacctcagtaTTCGATTTCCCTGGtctagaaaaggggatagactccg
tCATTCCTGGCTCCGCTGACACCCACCAGATGAATAAACTCACTTTACTT
TCCTTATAATTGCAGGATGTGATGGACCGTATGAGTGCAAATGATATTCA
GAATTACATGAGAAACTTATTGATAGCTTTGAAGCATGTTCactcttata
aaattattcacCGGGATATCAAACCAAGTAATTTCCTTTATTGCCAAGAA
ACAGACAGGTACAATTATCGATATCATTTGAATtcataaaatatttaaag
attaattaatcctttttgAACCTCTATACTTTGCTTTATTCTGGAAAATC
TGTTTATATAGCTATATTCAGCTTTTGTACCTAATTCTACCccttgaatt
ttttatttttttctctcaacattttccacccagaacCCAGGCGGAATGCT
TACTATGCCAGGGAATTTTAACTTGTGACGACTCCATTCACCATTTCTGC
AATGGAGCCACTGAAACCTAGTTTTGGATTCACAGTTTACTTTCAAATAT
AGTATCTAACTGTTTGTGTTTTTCAGCTATGCATTGATCGACTTTGGTCT
AGCCATGCCTGTCCCTGGAACAAAAGGATGTTTCCTTTCAGGTGAATAGA
AGTTTCTCATTGGTTCATTTACTGTACAATGCTCACACTTTTCCATCTCA
AATGTGGATTTTCTTTActtactttcaaattttgaaggattCGAATCATT
CACTAATTCTACCTAAAAATTACTTACATAATTAGTTATTTTCTGGGAAA
GCCAAATCCGGGCGAATTCATTACAGTTCTACTTTGTCTTTCCTTAAAAC
ATAGTTAATATAAGAAGTagaagatttttcaatattattaATGGTTTTCT
TTCAGATTACACTGCAACTGTTGTGGGAATGTCAGACAATAAGAAGCCTT
CTTCATCAAAAGCTTATGCTAAACCATGCAAGCACCCGAGACTTGATACA
TGTAACATCTGTAGAAATAGGTGACTATACTTTATATTGTAcacaaattt
catgtttaacCTTTGGAAACTACTTGTTACACTCATTGCAATATATCGAG
TTAATTTTCTTCCCAGTTTTTGTAGCGTCATTTCTCTACTTTGCATTATG
TAACATAAACTTTCTTACGGAAAAAcggtggtaaaaaagtgcttgaaaaa
tacCTTGCAATGTGTCCGCAGGGTGGTCTGCAAATTTGTTAAACTGAATC
ATAATAAAAACAACGACAAAGAAAAGCTTTCAGTCGGGGTACCAAAATac
cttcaaatttcaaaaaatgtttgttttcctTGATGTTTTATAGACCACGT
CAAAAAGCACCGAGGGCAGGCACTCCAGGTTTTCGTTCACCAGAGGTATT
GATGAGGTATCCTAACCAAACGACAGGTATTTGAATTATCTTATCCTAAA
CCCTTTTGGAAAGAGCTGAGTAGAAGCTGTAGCAGGGTTGTTTAACATGG
TTTTAAGTGAATAAGTAAGTtttcgaccgcagtcgagggtcacccaaagg
ctcccttttctctagctgtctacctTTCTTTGGATATCCCTTGATCAGTC
ACTTTAGCTGATAACCATCAATCAGAAAAGCATCAAGtatcattttggga
atcttaAGTATGACCCAACCCACAACTTTGTGCACGGCAgttggatgctc
taccttcatgctacggctTTATGGTAGTTAAATTTCTATACAGGCATTTA
AGATCGACGTCAAATTTTGTGTAAATTATTATCGAACTGGCAGTAGAACT
CAAACTTTGATCTGAAATTgacctttgaaattttttacccTATCTTTGTT
TCTACTATCTTGCCTGTAACTTTAGACATTTgcccataattttttttgcc
aggCCTTAGCAGCGAACTTCTATACAAAAATGACTTCAAACAcattaaac
ttttgaaaagaattattttaatGATGTCCTAGAAAAGATTTCATGGATAC
TAAGGTTTGACCCTTACTCTCGtggaatttttagtttttgatatGTTTCG
TCACTCTGTTTGTAGTGTTTTATGTTATCAACTTTGATTATTTCAGCTGT
AGATATGTGGGCTGCTGGTGTTGTTTTCTTATGTTTGTTATCAAGACGTT
ATCCATTCTTCAAAGCTAAAGACGATATGGAAGCCCTCTCTCAAATCATT
GTCCTCTTTGGCAgtaagaaaattaagaaaatggcTGACTCGATTGGTAA
GGTCTCCTTCTGTTTCAGGACATCAATCTGCCTGACTCAGAGAAATTAAG
CCCTTGCATAGATAAAAGTCTACTTctgactaaattttgaaaaaatgcaa
tttaGAACGGAAAACCGACATCGATGACCTATCAATAATTTCCCAATTAT
CGTTCACTTTCCAAAGAGTAGCGCGAAATCTGATTATCTGTTTTTGATCA
TCTTCACCAAAGAGAAATCAATATGGCACGATACTCTCGGGCCACTTAAA
CAATGTCTTCCAGTATATCTCATTGAGTGGTTTTCACACTAGCCTTTACT
CAACCTTACGTTAAGCATTTACAGCTAAGAtacttcattttttgaattcg
cATGCTATGAATAATTCTAAACATAATAAATTTGTGCTACTTAGAAACTT
TTATAGTTTAAGGTTTGTGACTTCACTTGATCAAAATCCATGTCAGAGAA
TGGTTAATAAATTTGGGGAAGCCTTATAAACCATCGTCaatgaaactttt
gaatttccctttttttctacAGGAAAAACTTTCGATTGTTCACCTCCAGT
AGAGAATCCGGACACTTTGAAAGTTATCTGTGAAAAATTAGCTCGCAGAC
AATGCTCTTTACATAGAGACTACAAAGAAGGATCTGCAAAACGAAAACTT
AGTGATCCAAGTGCAGCAGCCACTAATAGTCCAAACAAGAAACAAGTAAG
CGAGACAATAATTAAAGACTATAATCAAAGTAATCGAATCTTAGCCGACA
TAACATTGGATAAGAACCGACTGACTCAATCAGAATCGACCTCAAAATGT
ACGAGTTCTAATTCAAAGtctaaaaaatctaaacaaCCAGTTTGTGCTTG
TATACCTGAAAGTGCGTATGATTTATTGGGGAAACTACTTGAACTGAACC
CTGATGATCGAATCAGTGCATCTGATGGTTTAAAACATCCGTTTATCACA
CAT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000018_pilon:2384891..2391343+ >XLOC_005302 ID=XLOC_005302|Name=XLOC_005302|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2790bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000018_pilon:2384891..2391343+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atggaaaacaaaaaactattaTCACCAACACGGCAGAGTTTGTTTCGAGC
ATGCAAGTCTCCTGCTAAACAAGAAGATATCAGAATTCCAGAGCCAGatg
gaaaacaaaaaactattaTCACCAACACGGCAGAGTTTGTTTCGAGCATG
CAAGTCTCCTGCTAAACAAGAAGATATCAGAATTCCAGAGCCAGAGAAGA
AGATCAAACTTGGAGCTGATTTGCTCAATGCTTTTCCAGAGATCgctgaa
aattttgatattatcAAGAAGGTTGGAGAGGAGAAGAAGATCAAACTTGG
AGCTGATTTGCTCAATGCTTTTCCAGAGATCgctgaaaattttgatatta
tcAAGAAGGTTGGAGAGGGTACATTTAGCAAAGTGTTTCTTGCCAAAATG
AAATGTGATTCATCCAAAAAGGTTGCTTTTAAACATCTAGTTCCAACAAG
CTCGCCTGGTCGCAtagaaaatgaattaaaatgCTTACAAGAGCTAGGGT
ACATTTAGCAAAGTGTTTCTTGCCAAAATGAAATGTGATTCATCCAAAAA
GGTTGCTTTTAAACATCTAGTTCCAACAAGCTCGCCTGGTCGCAtagaaa
atgaattaaaatgCTTACAAGAGCTAGGtaATAAGAATAATGTTCTTGGC
ATCAAGACAACACTGCGAAGGAACGATCACATTGTATTCGTCCTGCCTTA
CTTTCCATACAGAAAATTTAATtaATAAGAATAATGTTCTTGGCATCAAG
ACAACACTGCGAAGGAACGATCACATTGTATTCGTCCTGCCTTACTTTCC
ATACAGAAAATTTAATGATGTGATGGACCGTATGAGTGCAAATGATATTC
AGAATTACATGAGAAACTTATTGATAGCTTTGAAGCATGTTCactcttat
aaaattattcacCGGGATATCAAACCAAGTAATTTCCTTTATTGCCAAGA
AACAGACAGGATGTGATGGACCGTATGAGTGCAAATGATATTCAGAATTA
CATGAGAAACTTATTGATAGCTTTGAAGCATGTTCactcttataaaatta
ttcacCGGGATATCAAACCAAGTAATTTCCTTTATTGCCAAGAAACAGAC
AGCTATGCATTGATCGACTTTGGTCTAGCCATGCCTGTCCCTGGAACAAA
AGGATGTTTCCTTTCAGCTATGCATTGATCGACTTTGGTCTAGCCATGCC
TGTCCCTGGAACAAAAGGATGTTTCCTTTCAGATTACACTGCAACTGTTG
TGGGAATGTCAGACAATAAGAAGCCTTCTTCATCAAAAGCTTATGCTAAA
CCATGCAAGCACCCGAGACTTGATACATGTAACATCTGTAGAAATAGATT
ACACTGCAACTGTTGTGGGAATGTCAGACAATAAGAAGCCTTCTTCATCA
AAAGCTTATGCTAAACCATGCAAGCACCCGAGACTTGATACATGTAACAT
CTGTAGAAATAGACCACGTCAAAAAGCACCGAGGGCAGGCACTCCAGGTT
TTCGTTCACCAGAGGTATTGATGAGGTATCCTAACCAAACGACAGACCAC
GTCAAAAAGCACCGAGGGCAGGCACTCCAGGTTTTCGTTCACCAGAGGTA
TTGATGAGGTATCCTAACCAAACGACAGCTGTAGATATGTGGGCTGCTGG
TGTTGTTTTCTTATGTTTGTTATCAAGACGTTATCCATTCTTCAAAGCTA
AAGACGATATGGAAGCCCTCTCTCAAATCATTGTCCTCTTTGGCAgtaag
aaaattaagaaaatggcTGACTCGATTGCTGTAGATATGTGGGCTGCTGG
TGTTGTTTTCTTATGTTTGTTATCAAGACGTTATCCATTCTTCAAAGCTA
AAGACGATATGGAAGCCCTCTCTCAAATCATTGTCCTCTTTGGCAgtaag
aaaattaagaaaatggcTGACTCGATTGGAAAAACTTTCGATTGTTCACC
TCCAGTAGAGAATCCGGACACTTTGAAAGTTATCTGTGAAAAATTAGCTC
GCAGACAATGCTCTTTACATAGAGACTACAAAGAAGGATCTGCAAAACGA
AAACTTAGTGATCCAAGTGCAGCAGCCACTAATAGTCCAAACAAGAAACA
AGTAAGCGAGACAATAATTAAAGACTATAATCAAAGTAATCGAATCTTAG
CCGACATAACATTGGATAAGAACCGACTGACTCAATCAGAATCGACCTCA
AAATGTACGAGTTCTAATTCAAAGtctaaaaaatctaaacaaCCAGTTTG
TGCTTGTATACCTGAAAGTGCGTATGATTTATTGGGGAAACTACTTGAAC
TGAACCCTGATGATCGAATCAGTGCATCTGATGGTTTAAAACATCCGTTT
ATCACACATGAAAAACTTTCGATTGTTCACCTCCAGTAGAGAATCCGGAC
ACTTTGAAAGTTATCTGTGAAAAATTAGCTCGCAGACAATGCTCTTTACA
TAGAGACTACAAAGAAGGATCTGCAAAACGAAAACTTAGTGATCCAAGTG
CAGCAGCCACTAATAGTCCAAACAAGAAACAAGTAAGCGAGACAATAATT
AAAGACTATAATCAAAGTAATCGAATCTTAGCCGACATAACATTGGATAA
GAACCGACTGACTCAATCAGAATCGACCTCAAAATGTACGAGTTCTAATT
CAAAGtctaaaaaatctaaacaaCCAGTTTGTGCTTGTATACCTGAAAGT
GCGTATGATTTATTGGGGAAACTACTTGAACTGAACCCTGATGATCGAAT
CAGTGCATCTGATGGTTTAAAACATCCGTTTATCACACAT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000018_pilon | genome | sc0000018_pilon:2384891..2391343 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 967-1395:6025 |
| Aaloc | 817-963:5349 |
| Aaloc | 733-813:4595 |
| Aaloc | 619-729:4158 |
| Aaloc | 553-615:3828 |
| Aaloc | 409-549:3366 |
| Aaloc | 316-408:1469 |
| Aaloc | 187-312:880 |
| Aaloc | 100-183:247 |
| Aaloc | 1-96:1 |
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