XLOC_005199 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_005199
Unique NameXLOC_005199
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000098_pilon:1134965..1142834-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_005199 ID=XLOC_005199|Name=XLOC_005199|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7870bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000098_pilon:1134965..1142834- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTCGCTTACAAAAATGGTGAGTTGTATTAAAGAGAATACTTGGGCCA CACCCCTGTCTCAACACCCTTTTGGAGATATTCCACTCCAGTATAAAGAA TACACGTTTTTTTTTTTATTAGAACACCTAAAATTTGGCTGAGCCTGGAT TTGCTTATTTTTTTGGCAGTTTTCAGCCTAAAATGTTCTTAAATGCGTTC TTAATTTTTCAGACTTCTCTAAATCGGGAATATCATGCAAAATAAAGAGC ACTTAAAATTGGTAAAATTTGGACAATATTTCACTCTCGATTTTAGAAAA TCCATCCCTAAGTTCGGTTAAAACTGTTTGAAAAGAGGAAAAAATTATAG TTTCTTGTCATTTTTTTCCAAACTGAGGCTGGGCATGTTCTTACGATGTT CTTAATTTTTCGAAGAGTTTCAGCCTCGATGTTCTTATAAACTGGGTTCT AATAAAAAATAAAACGTGTAGCGCTCCGCAATGCATACGTCATAATTATT ACTTTTCACTTTTTTTGACATTTGTACGAGTTGCAATCCCACAATTCAAC GCGGCTCAATTAAAGATACGTGCAAGCTGTTATATATCTTTTGTCAAACG ATGCAATTAACGTGCAAAAGAGATTAACGCAAAGGTTGATGGGATTGGAA CTCGTACAAACACATCGAGAGTAATGATTATGTCAAAAATAAAATCTATT TTTAGATTCAGCGCGGTGCGCTATTAAGCAAAACTTCACATGTTTAAAGC GTACCCCGCGCCATACTGGGAATCTTTTTTTCTGGAACCCCTTAATGACC CCGGTGAAGGGGTGTTTTACCATTGGCAGCTCTTCACAACGTTACAAAGA AGAAATCGCATTATTCAATTTTAAAATTGAGGTCTCTAGTCTATGATCCA GCCCTAAATATTAAAGTGTGTTCAACCACAATGAGTGAGTTTCTCACTCA ACAGTAATAAAATTTTCAGCGAAGTCTTTCGAGGTCACGACCAGTCTAGC CTTCGTTCTCGAAGCAAACCTTGTAACTTCTGTTTCGAAGTGAATGAAAA AAGCCTTATTGAACCAGTTTACTTTGCTAGCAAGTTTTTCAACAGATTTT GCCATTTGGATTTGGATTTTGTTTTGTTATTTGCTTCTATAATTCATTAT TGAATCTATATAGGCCTTAAAATATGATTCCAGTGAAATGAAGGAAGAAA AAGAAATATTAAACCAAAGAAAATTAAGTCAAAGAAAAAAATTATCAAAA TTTTGCTTCCACATTTGGTTTAGTTAAGAGATTCTAATCTGCGATATTGT GGGTTTAGTAAAACTATAATGGCGATGAAAAACCAGGCATACGAAGAAGT GCCATCAATTCAAACTTTGTTCAGCGTTGAAAGACTTATTGGTGTTTTAT ACTGTATGTAAATACACACTCTTTTTTTTTATAAGAATGTCCATAATGAA AATGGCCAAAAAATTTAGAATATGGTAAAATATCACCATCATGGAATTTA GCAACTGAACCTAAAAATGCCATTTTTAAGGCTGTAGATTGCCAATTTCG ATCTTAACCTAAGAATGTTGTAAGAATATCTTTGGATGATTTTCGCCAAA AAAGTTAAGAATATCCATGATGAAAGGAAAAAACACCATTCTTATAAAAA AAAGCGTGTATCTATGAAGCTCGTCGTGCGCCATATATATTCATTGTTCA TTCACTGTTTTTGGACTTGTTTCGTGGGGCTAAGTTTTATTTAATGCTCG TATATTAGAGAGCTAGAAGTCTTCAATTCTGATAATTAGAATTTTCAGAG CAAATTTGAGTTCTGCTAAAAAGTCGTATTTCATCGGGCTTTTATAAAAG AAATCAAAAGGTTTTAAACGATCAATTACCGGCAATTCAACTCCTTTTTT ACTTCATACCTTCATGGGTAAACTCAAGCCAAATATCTTTATAATTTGAT ATTTCTATTTAGACCTTTTTTACTTATCTTTTAAGGTTGGAAATATGGTA TTTTGATTTTTGTTGCAATTTTTTTCATCGTTCTCGGCGCCGTAGGTATC GGTGTTTCAACCTATTTCTACAATGAAGAAATGACGGATGAAGTTCAAGG AAGATTTGGTATTGTTTTCGATGCTGGAGGGTCTGGCACGAGGATGTATA TTTACAGTTTTGATAATAATAATCAATATGTACAGACATTGCAAGAGGAT TGTGAGGGTAAGATTGCACACATACTCATTTTTTTCCAGTTCGCATCAGT ACATGCATTGTTCAAGTAAGAAATTTGCAATTGCAACACAAAAGGGCTGG TTGTTGATAACAATCAACTCATTAACAGTAACAAAGGTATCAGTAATACC TTGAAAAATTCTTATTTTCAATTGGAAACTTTTATGATTTTAAACGTAGC ATAACATTTTGAATCTCCGTTGTTCATTCATGATATTCATGATGTAATGT TTTATACCGAAGCACCCAAAATAGCCCAGGCGTTTGTCACTAGTTGTATT GTTTAGATTCGAAATTAGTGGCAAACACCCGGTCTCTTTTGGGTGCGTTT GAAACATTACGTCATCAAAAATGAATATTTTTTTTAAAACTTACTGAATT TGATTGTTCTTTTATTTAAACAGGTGACGGTCTATCCAAGTATGGAGGAC GCACATCCGACCTCAAACCTTTGTTAAACAAATGTTTGGAAGATGCGTCC ACGAATATTCCAAAAGAAGTTTCTACCTCTAATGTCCCGTTATACTTGAA AGCTACAGCTGGTATGCGTAAACTCAGGTGCGTTTGGATTTCCCTACAAG GCTCATCTAGAAAATTTTCGTACATGGGGGGAGGGGTCAGAGGATATAGT GTCCGGGGGTGGAGGATATAGTGTCCGGGGGGTAGTGATAAATCTACAAA ATTTACCTTGCCTTGGGAGTAAACTTGCTCTGTTTGGGGCAATCTCGCTC TGTTTGAGGGTAATTTTGAATGTCCAAGGGGTCAACTGATGCTTATTCGG GGGGTTAGACCTACCATCCGGGGATAAATTTCGCAAAAATGTTATATCCT CACCCCATCATATTTTATTTTTTTTAGAAAAGCCAGGGTAGTGAGGTCTG GTAGCTCATAAAAACGTAAGAATACTTCAGATGGTGATTAAAGCATGAAA TTTGGCACAGATGATCCTTAGAGGGTCTAAAACTTAATTTTAAACAGTAA CACCAAATTTTGCCACCTGGCCACCTGCCAGATGACGTCATCAGGTGGCT TAGCAAAAATTTATTTTTTTGAAAATATTCAAAATCTGATGGTTCCAGCG GAAAGAGCATGAAATGCTGATAAAAATTGAGGTATAAAACATGCCTTGAA AATCTTCCTATCAAAAGTTATGGAGGTTGAAAGTTTTTTGATGACGTCAT CATAAGCCTTTCCAGGCAAAACTTAAAAACCTCGTAATTTTGGTACAAAT TGACCAAATTTCATGTTTTATACATGAATTCATATCAAAATTCATTGCTT TTTCCGATTCCGATGTTCAAATTGAATTAAAAGCTTTAAATCCTACAGGA TACTAAAACTTAGATTTTGAGCTTTACAAGGCAAATCGACGCAGCGTTCT CCCTTCAGGAGCACAGTGTACAACCAACTAACTTTTTTGGATGTTTTAAG CCTTCCTATGTTGTTTAGACCCAAGCATCAGATGGAACTTCAAATTTTGA CATGGATTCATGTTTAAAACACTAAATTTGATCAACTAGTTCCGTTATTA CGGGATTTTAGGTTTTGCCTGGAAAGGCTTACGATGACGTCATCACAAAA CTTTAAACCTTCATAACTTTTGATAGGAAGATTTTGAAGGCATGTTTTAT ACCTCGATTTTCATCAGCATTTCATGTTCTTTCCGCTGATACCATCTGAT TTTAAATATTTTCAAAAAAATAAATTTTTGCTAAGCCACCTGATGACGTC ATCTGGCAGGTGGCCAGGTGGCAAAATTTGGTGTTACTGTTTAAAATTAA GTTTTAGACCCTCTAAGGATCATCTGTGCCAAATTTCATGCTTTAATCAC CATCTGAAGTATTTTTGTGCTAACAGACCTCACTAAGGTCCGTGTATACT CTCCTCTTAATGCATATCTACTGTCATTCATTACACCAATACGAACATAC TATCGCTTTTATAAATAGCGGACAGTATCAAAAGTAGAAAAAATGTTTGG GGCTAAGTTTGCTCGAATTCTAGGGCTTTTCCTACTTTCATACCTGTGCT AGCTTTTCCTTTGTGACAATAGTGCAATACCAGATCCACTTGTGCATCTT TTTGATTTTACTGAAGGACATGAGTGCTATAGAAATCATGAAAAAGCGAG CTAAGACTGTGTCGACTTTTACAATAATGTAGTCTCTCGGAAACTTTATA GCAGGGGGGAATGCAAGATTGATAGATTCGTATGTTAGAAATTCTTCATT TTAGAGAACAAAATATGACGACTTACAATAATGTATGGAGCGCTGTTCGA GCAATATTAAACAATGGATCGTTCCCAGTAAAAATGGCCGAAACAATGCT TGGGATCAAAGAAGCACAATATTCATGGACGACTGTTAATCACTTATTGA AATCTACAGACGTAAGAACTCTATTTATTTTCACGGTTTACGTGATGACG TTATTAGGTCTCTTTGCCGTGATGCAAGATTTCAAAAACGTAACGTGTGA TTGATGAAAGAATATCTTGATCTTAGCTCGTTTTTTATGATGCTACTATA ACAAATTGTATCTCTTCTAGTCAGTAAATTAAGATGTGGTACAAATGGCT CTGGATACCAGATTGTTTTGGAGTTAATATTTTTTTCCAAAAATGGCAAA TTTACTAGGAAGCTTCACTATTACATACAAAGTACTTTTTCTGTCTTGTG TGCAATATCTTGTAACTTTCCATTCTTAGGACACAAGCGGGTTACTAGAG ATGGGTAGTACTTCTCTACAAGTCGCATTTGAACCACACTCGAGTAATTC CATACCCTCAAACTACTCTGAAGAGGTTTCGCTGAATGGTAAATCGTACA AAATATACGCCCATTCATACATGTGTTTGGGACGTGACGAATTCGGTAGA CGCTACTACGCTAAACTTGCTGCGGTAAGTACAGAAAAATCTGATTTTCA GTCCAAAGACTAAAGTTTAATGATGGAAAAGTCTCTCATCTCTCTCTAAT TCGTAACTCTAAAATTAGAATCTTTCTATATCGAGCTAAAATATTGGTCC CTTCAGCTGAAAAGTAGCATAAAATACCCTCTGTAATTCGAATCTTTCTC CAGTCTGAAGTAAGTCCCTTGAAAATCGAATTAGAGAGAGTCAACTGTAT GTTCGGTCCTCTACAATTTCGGAGGTTTCTATTAAAGATCAGTACAACTA AAGCATTTATACCGAACTTGGTGGAAAATAGATATTAAATATTGAAAAAA ATTGATTTACTGACTAACAAATTAATTCTCAGCACTTTCTTTCAATCATA GGATAAATTCAACAACTCTGCCACCATCATGAATCCATGTGGTTTCCAAG GATACAACGTCAGCAAAACGTATACTGATTTGTTTGAAGTGCCTTGTGTT AAAGGCGATTTCGCTCAAGAATTATTCGGCCAATCGATAAACCCAGACTT GTCAAGCATGAGTAAGTTTTCACTTTTTTCCATTATCGGTTAGCTAGATA TTTTACTGAACTAATTACCAAAGCCTCGGACACAACGCTGATAATAGACA GTGTTGACGAAACGATGCAGCCTAGTACATCATCTCAGATCAGTGAATCT TACTATAATTTGGAATTCATCTTAAAATCGAAAGAACTATTAGAATCACT TCATCAGCATACTTTGAATAATTCCAATATTTCCATGTTTATGACATATT TTCAGACGCAACAGATTCATTCACATTCGTTGGTACCGGTGATTTTGACG CGTGTAAACAACAAGTGGAATCTATGTTCAAAAAGAATTGCACACACTCA AGTTGTGGAACCCTTGATGCTTATCAGCCTGATCTCTATGGTCATTTCAC GGTATGCGTCTCTGAAAATATATTTCATACTATCTTTGTGTATTTCTACC ATGTACTTCTATTCACGACTTCTCTAATTCGATCTTCAAGGGATAAAGAT TTTATTCGGATTATAGAAATATTCGAGTTACGGAGAGTATTTCATACGGA TTTCCAGCTGAGAAGACAAATGTTTTAGCTCGAATTACATAAAGATTCGA ACAATAGAGGTTCGAATTAGAGCAAGTTTATCTGTAAAACAATTTAAGTA TAGAAAAGCTTCAAAAACACCCGATAAAATGCCCGAAAACCTTAAAAATT GATATTTTGCTCTTTGAAATCTTGCCTAAAACTGTTGAAAACTGATCAGA CTTTCAATAGATAGCTGTGTCGATTTCCTGAATTTCACCAACTCATATTC CTCTCATGTTTTTTATTTTTAGGGTATAGGTGGTGGTGTATATTTTGCTG CAGAATTTTTGCAACTACCTGATGATTTCACAGAGAACGATTTCGAAAAC AAAACGAAAGAACTATGCACAACACCTTTAAATGAGGTACAACTGCCTCT AAACCCTTCATGAGTTTAAATCCCCTCCCAGCTTAACACTAACAGCCATA ATGGAGGCGTTCAGTAAACTACTTCCTCTATCCTTGACCTTTACGAGTTT GAATTAATACTCCAACTGCTTATAGTTATAAGTTTTCTTTTCCTCTCAAC TCTGTAGCAGGATTAGGCCATTTCATATATCTCCATATATGGGGTAGACG AATATTTCCAGGGTGTAGCACAAGAAGAATTCCCAGGGAGTCTAAAGGAG TGCTTTTAAATTCTTTCAGCAGATAAGAAGTTATTCAAAGATTTCTCGGG GGTAAAAGACTGATTTCAATTTGTCCACCCTCACTTTAATGCCTTTTTGC AAATTTTGCCTTTTTCGAAGGGATGTTCACACATATCTTTTTTTTGACTC GAAAAGGTTCGTCTACCCCCTTGTATAGTTATTTTTTGTGATCAAAGAAT AAAGTTGCTGATAATCTATACCTGTACAACAATTAATCACTTCTCATTAA AGCATTTTGAATGATTTGCATCCACAGGTGAAGAACCGTACCGGATTCGG AAAATATTCATACGATTATTGCTTATCCAATACATATACTAACTTCGTTC TTCAAAACTTGCTGAAAATTAATAAGACGGAGAAAGGCGTCATCAATTTT GCAAGAAAGGTAAACCACGTGCTATATTTTGACAGACAGTGCGTTCTGAC ACACCTGTGCCACAGTATTTACAAACCTGGCAGGACCCCAACCCCACTGG AAAGATCAATTTCAGCCCTACTCGGCAAACTGGCTTTGCTTTCATCCCCA TTGAAAATTGAATGGGAAAAACTTCTCTCAAAGCCATCCATACTGGTTGG ACTTTTTGAGCTGAAAAACAATAGAACTTTGATCTCAATTCTTTCCTAAG AGAAATTTGTAAATTTGTTGTAATTGCAATTAAGGTATAGTATTGCTTTT ATCCTTAGAGTGCATACCTGTCAAATAAGCTTATTTCTACGTTAAAAACT GAACCCTGCGCTGCTAGTAACTGAGCTCGAATAGCAATCACTTCTCATTC TTTTTAGATTAATGATCAGAAGATAAGTTGGACTATGGGCTCCATCATTG AAGATACTCCAGATATGTCACCAAGTGTTATGGAAGTAACTAGAGATTTA GAGTCAACGAACTATTATGTTGTTATAGCTATCTCCGCTGTCTTGCTTGT ACTTGGGTTGTTTTTATTTAGTTACTTATGTTTCTGTAGCAACAATAAAA ATGGTAGTGTATCTAATAGG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000098_pilon:1134965..1142834-

>XLOC_005199 ID=XLOC_005199|Name=XLOC_005199|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3024bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000098_pilon:1134965..1142834- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTCGCTTACAAAAATGATGGTCGCTTACAAAAATGGTTGGAAATATG
GTATTTTGATTTTTGTTGCAATTTTTTTCATCGTTCTCGGCGCCGTAGGT
ATCGGTGTTTCAACCTATTTCTACAATGAAGAAATGACGGATGAAGTTCA
AGGAAGATTTGGTATTGTTTTCGATGCTGGAGGGTCTGGCACGAGGATGT
ATATTTACAGTTTTGATAATAATAATCAATATGTACAGACATTGCAAGAG
GATTGTGAGGGTTGGAAATATGGTATTTTGATTTTTGTTGCAATTTTTTT
CATCGTTCTCGGCGCCGTAGGTATCGGTGTTTCAACCTATTTCTACAATG
AAGAAATGACGGATGAAGTTCAAGGAAGATTTGGTATTGTTTTCGATGCT
GGAGGGTCTGGCACGAGGATGTATATTTACAGTTTTGATAATAATAATCA
ATATGTACAGACATTGCAAGAGGATTGTGAGGGTGACGGTCTATCCAAGT
ATGGAGGACGCACATCCGACCTCAAACCTTTGTTAAACAAATGTTTGGAA
GATGCGTCCACGAATATTCCAAAAGAAGTTTCTACCTCTAATGTCCCGTT
ATACTTGAAAGCTACAGCTGGTATGCGTAAACTCAGGTGACGGTCTATCC
AAGTATGGAGGACGCACATCCGACCTCAAACCTTTGTTAAACAAATGTTT
GGAAGATGCGTCCACGAATATTCCAAAAGAAGTTTCTACCTCTAATGTCC
CGTTATACTTGAAAGCTACAGCTGGTATGCGTAAACTCAGAGAACAAAAT
ATGACGACTTACAATAATGTATGGAGCGCTGTTCGAGCAATATTAAACAA
TGGATCGTTCCCAGTAAAAATGGCCGAAACAATGCTTGGGATCAAAGAAG
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ACAAAATATGACGACTTACAATAATGTATGGAGCGCTGTTCGAGCAATAT
TAAACAATGGATCGTTCCCAGTAAAAATGGCCGAAACAATGCTTGGGATC
AAAGAAGCACAATATTCATGGACGACTGTTAATCACTTATTGAAATCTAC
AGACGACACAAGCGGGTTACTAGAGATGGGTAGTACTTCTCTACAAGTCG
CATTTGAACCACACTCGAGTAATTCCATACCCTCAAACTACTCTGAAGAG
GTTTCGCTGAATGGTAAATCGTACAAAATATACGCCCATTCATACATGTG
TTTGGGACGTGACGAATTCGGTAGACGCTACTACGCTAAACTTGCTGCGG
ACACAAGCGGGTTACTAGAGATGGGTAGTACTTCTCTACAAGTCGCATTT
GAACCACACTCGAGTAATTCCATACCCTCAAACTACTCTGAAGAGGTTTC
GCTGAATGGTAAATCGTACAAAATATACGCCCATTCATACATGTGTTTGG
GACGTGACGAATTCGGTAGACGCTACTACGCTAAACTTGCTGCGGATAAA
TTCAACAACTCTGCCACCATCATGAATCCATGTGGTTTCCAAGGATACAA
CGTCAGCAAAACGTATACTGATTTGTTTGAAGTGCCTTGTGTTAAAGGCG
ATTTCGCTCAAGAATTATTCGGCCAATCGATAAACCCAGACTTGTCAAGC
ATGAGATAAATTCAACAACTCTGCCACCATCATGAATCCATGTGGTTTCC
AAGGATACAACGTCAGCAAAACGTATACTGATTTGTTTGAAGTGCCTTGT
GTTAAAGGCGATTTCGCTCAAGAATTATTCGGCCAATCGATAAACCCAGA
CTTGTCAAGCATGAACGCAACAGATTCATTCACATTCGTTGGTACCGGTG
ATTTTGACGCGTGTAAACAACAAGTGGAATCTATGTTCAAAAAGAATTGC
ACACACTCAAGTTGTGGAACCCTTGATGCTTATCAGCCTGATCTCTATGG
TCATTTCACGACGCAACAGATTCATTCACATTCGTTGGTACCGGTGATTT
TGACGCGTGTAAACAACAAGTGGAATCTATGTTCAAAAAGAATTGCACAC
ACTCAAGTTGTGGAACCCTTGATGCTTATCAGCCTGATCTCTATGGTCAT
TTCACGGGTATAGGTGGTGGTGTATATTTTGCTGCAGAATTTTTGCAACT
ACCTGATGATTTCACAGAGAACGATTTCGAAAACAAAACGAAAGAACTAT
GCACAACACCTTTAAATGAGGGTATAGGTGGTGGTGTATATTTTGCTGCA
GAATTTTTGCAACTACCTGATGATTTCACAGAGAACGATTTCGAAAACAA
AACGAAAGAACTATGCACAACACCTTTAAATGAGGTGAAGAACCGTACCG
GATTCGGAAAATATTCATACGATTATTGCTTATCCAATACATATACTAAC
TTCGTTCTTCAAAACTTGCTGAAAATTAATAAGACGGAGAAAGGCGTCAT
CAATTTTGCAAGAAAGGTGAAGAACCGTACCGGATTCGGAAAATATTCAT
ACGATTATTGCTTATCCAATACATATACTAACTTCGTTCTTCAAAACTTG
CTGAAAATTAATAAGACGGAGAAAGGCGTCATCAATTTTGCAAGAAAGAT
TAATGATCAGAAGATAAGTTGGACTATGGGCTCCATCATTGAAGATACTC
CAGATATGTCACCAAGTGTTATGGAAGTAACTAGAGATTTAGAGTCAACG
AACTATTATGTTGTTATAGCTATCTCCGCTGTCTTGCTTGTACTTGGGTT
GTTTTTATTTAGTTACTTATGTTTCTGTAGCAACAATAAAAATGGTAGTG
TATCTAATAGGATTAATGATCAGAAGATAAGTTGGACTATGGGCTCCATC
ATTGAAGATACTCCAGATATGTCACCAAGTGTTATGGAAGTAACTAGAGA
TTTAGAGTCAACGAACTATTATGTTGTTATAGCTATCTCCGCTGTCTTGC
TTGTACTTGGGTTGTTTTTATTTAGTTACTTATGTTTCTGTAGCAACAAT
AAAAATGGTAGTGTATCTAATAGG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_005199XLOC_005199-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000098_pilongenomesc0000098_pilon:1134965..1142834 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1300-1512:214
Aaloc1168-1299:744
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Aaloc1-18:7871