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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000098_pilon:1134965..1142834- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_005199 ID=XLOC_005199|Name=XLOC_005199|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7870bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000098_pilon:1134965..1142834- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGTCGCTTACAAAAATGGTGAGTTGTATTAAAGAGAATACTTGGGCCA
CACCCCTGTCTCAACACCCTTTTGGAGATATTCCACTCCAGTATAAAGAA
TACACGTTTTTTTTTTTATTAGAACACCTAAAATTTGGCTGAGCCTGGAT
TTGCTTATTTTTTTGGCAGTTTTCAGCCTAAAATGTTCTTAAATGCGTTC
TTAATTTTTCAGACTTCTCTAAATCGGGAATATCATGCAAAATAAAGAGC
ACTTAAAATTGGTAAAATTTGGACAATATTTCACTCTCGATTTTAGAAAA
TCCATCCCTAAGTTCGGTTAAAACTGTTTGAAAAGAGGAAAAAATTATAG
TTTCTTGTCATTTTTTTCCAAACTGAGGCTGGGCATGTTCTTACGATGTT
CTTAATTTTTCGAAGAGTTTCAGCCTCGATGTTCTTATAAACTGGGTTCT
AATAAAAAATAAAACGTGTAGCGCTCCGCAATGCATACGTCATAATTATT
ACTTTTCACTTTTTTTGACATTTGTACGAGTTGCAATCCCACAATTCAAC
GCGGCTCAATTAAAGATACGTGCAAGCTGTTATATATCTTTTGTCAAACG
ATGCAATTAACGTGCAAAAGAGATTAACGCAAAGGTTGATGGGATTGGAA
CTCGTACAAACACATCGAGAGTAATGATTATGTCAAAAATAAAATCTATT
TTTAGATTCAGCGCGGTGCGCTATTAAGCAAAACTTCACATGTTTAAAGC
GTACCCCGCGCCATACTGGGAATCTTTTTTTCTGGAACCCCTTAATGACC
CCGGTGAAGGGGTGTTTTACCATTGGCAGCTCTTCACAACGTTACAAAGA
AGAAATCGCATTATTCAATTTTAAAATTGAGGTCTCTAGTCTATGATCCA
GCCCTAAATATTAAAGTGTGTTCAACCACAATGAGTGAGTTTCTCACTCA
ACAGTAATAAAATTTTCAGCGAAGTCTTTCGAGGTCACGACCAGTCTAGC
CTTCGTTCTCGAAGCAAACCTTGTAACTTCTGTTTCGAAGTGAATGAAAA
AAGCCTTATTGAACCAGTTTACTTTGCTAGCAAGTTTTTCAACAGATTTT
GCCATTTGGATTTGGATTTTGTTTTGTTATTTGCTTCTATAATTCATTAT
TGAATCTATATAGGCCTTAAAATATGATTCCAGTGAAATGAAGGAAGAAA
AAGAAATATTAAACCAAAGAAAATTAAGTCAAAGAAAAAAATTATCAAAA
TTTTGCTTCCACATTTGGTTTAGTTAAGAGATTCTAATCTGCGATATTGT
GGGTTTAGTAAAACTATAATGGCGATGAAAAACCAGGCATACGAAGAAGT
GCCATCAATTCAAACTTTGTTCAGCGTTGAAAGACTTATTGGTGTTTTAT
ACTGTATGTAAATACACACTCTTTTTTTTTATAAGAATGTCCATAATGAA
AATGGCCAAAAAATTTAGAATATGGTAAAATATCACCATCATGGAATTTA
GCAACTGAACCTAAAAATGCCATTTTTAAGGCTGTAGATTGCCAATTTCG
ATCTTAACCTAAGAATGTTGTAAGAATATCTTTGGATGATTTTCGCCAAA
AAAGTTAAGAATATCCATGATGAAAGGAAAAAACACCATTCTTATAAAAA
AAAGCGTGTATCTATGAAGCTCGTCGTGCGCCATATATATTCATTGTTCA
TTCACTGTTTTTGGACTTGTTTCGTGGGGCTAAGTTTTATTTAATGCTCG
TATATTAGAGAGCTAGAAGTCTTCAATTCTGATAATTAGAATTTTCAGAG
CAAATTTGAGTTCTGCTAAAAAGTCGTATTTCATCGGGCTTTTATAAAAG
AAATCAAAAGGTTTTAAACGATCAATTACCGGCAATTCAACTCCTTTTTT
ACTTCATACCTTCATGGGTAAACTCAAGCCAAATATCTTTATAATTTGAT
ATTTCTATTTAGACCTTTTTTACTTATCTTTTAAGGTTGGAAATATGGTA
TTTTGATTTTTGTTGCAATTTTTTTCATCGTTCTCGGCGCCGTAGGTATC
GGTGTTTCAACCTATTTCTACAATGAAGAAATGACGGATGAAGTTCAAGG
AAGATTTGGTATTGTTTTCGATGCTGGAGGGTCTGGCACGAGGATGTATA
TTTACAGTTTTGATAATAATAATCAATATGTACAGACATTGCAAGAGGAT
TGTGAGGGTAAGATTGCACACATACTCATTTTTTTCCAGTTCGCATCAGT
ACATGCATTGTTCAAGTAAGAAATTTGCAATTGCAACACAAAAGGGCTGG
TTGTTGATAACAATCAACTCATTAACAGTAACAAAGGTATCAGTAATACC
TTGAAAAATTCTTATTTTCAATTGGAAACTTTTATGATTTTAAACGTAGC
ATAACATTTTGAATCTCCGTTGTTCATTCATGATATTCATGATGTAATGT
TTTATACCGAAGCACCCAAAATAGCCCAGGCGTTTGTCACTAGTTGTATT
GTTTAGATTCGAAATTAGTGGCAAACACCCGGTCTCTTTTGGGTGCGTTT
GAAACATTACGTCATCAAAAATGAATATTTTTTTTAAAACTTACTGAATT
TGATTGTTCTTTTATTTAAACAGGTGACGGTCTATCCAAGTATGGAGGAC
GCACATCCGACCTCAAACCTTTGTTAAACAAATGTTTGGAAGATGCGTCC
ACGAATATTCCAAAAGAAGTTTCTACCTCTAATGTCCCGTTATACTTGAA
AGCTACAGCTGGTATGCGTAAACTCAGGTGCGTTTGGATTTCCCTACAAG
GCTCATCTAGAAAATTTTCGTACATGGGGGGAGGGGTCAGAGGATATAGT
GTCCGGGGGTGGAGGATATAGTGTCCGGGGGGTAGTGATAAATCTACAAA
ATTTACCTTGCCTTGGGAGTAAACTTGCTCTGTTTGGGGCAATCTCGCTC
TGTTTGAGGGTAATTTTGAATGTCCAAGGGGTCAACTGATGCTTATTCGG
GGGGTTAGACCTACCATCCGGGGATAAATTTCGCAAAAATGTTATATCCT
CACCCCATCATATTTTATTTTTTTTAGAAAAGCCAGGGTAGTGAGGTCTG
GTAGCTCATAAAAACGTAAGAATACTTCAGATGGTGATTAAAGCATGAAA
TTTGGCACAGATGATCCTTAGAGGGTCTAAAACTTAATTTTAAACAGTAA
CACCAAATTTTGCCACCTGGCCACCTGCCAGATGACGTCATCAGGTGGCT
TAGCAAAAATTTATTTTTTTGAAAATATTCAAAATCTGATGGTTCCAGCG
GAAAGAGCATGAAATGCTGATAAAAATTGAGGTATAAAACATGCCTTGAA
AATCTTCCTATCAAAAGTTATGGAGGTTGAAAGTTTTTTGATGACGTCAT
CATAAGCCTTTCCAGGCAAAACTTAAAAACCTCGTAATTTTGGTACAAAT
TGACCAAATTTCATGTTTTATACATGAATTCATATCAAAATTCATTGCTT
TTTCCGATTCCGATGTTCAAATTGAATTAAAAGCTTTAAATCCTACAGGA
TACTAAAACTTAGATTTTGAGCTTTACAAGGCAAATCGACGCAGCGTTCT
CCCTTCAGGAGCACAGTGTACAACCAACTAACTTTTTTGGATGTTTTAAG
CCTTCCTATGTTGTTTAGACCCAAGCATCAGATGGAACTTCAAATTTTGA
CATGGATTCATGTTTAAAACACTAAATTTGATCAACTAGTTCCGTTATTA
CGGGATTTTAGGTTTTGCCTGGAAAGGCTTACGATGACGTCATCACAAAA
CTTTAAACCTTCATAACTTTTGATAGGAAGATTTTGAAGGCATGTTTTAT
ACCTCGATTTTCATCAGCATTTCATGTTCTTTCCGCTGATACCATCTGAT
TTTAAATATTTTCAAAAAAATAAATTTTTGCTAAGCCACCTGATGACGTC
ATCTGGCAGGTGGCCAGGTGGCAAAATTTGGTGTTACTGTTTAAAATTAA
GTTTTAGACCCTCTAAGGATCATCTGTGCCAAATTTCATGCTTTAATCAC
CATCTGAAGTATTTTTGTGCTAACAGACCTCACTAAGGTCCGTGTATACT
CTCCTCTTAATGCATATCTACTGTCATTCATTACACCAATACGAACATAC
TATCGCTTTTATAAATAGCGGACAGTATCAAAAGTAGAAAAAATGTTTGG
GGCTAAGTTTGCTCGAATTCTAGGGCTTTTCCTACTTTCATACCTGTGCT
AGCTTTTCCTTTGTGACAATAGTGCAATACCAGATCCACTTGTGCATCTT
TTTGATTTTACTGAAGGACATGAGTGCTATAGAAATCATGAAAAAGCGAG
CTAAGACTGTGTCGACTTTTACAATAATGTAGTCTCTCGGAAACTTTATA
GCAGGGGGGAATGCAAGATTGATAGATTCGTATGTTAGAAATTCTTCATT
TTAGAGAACAAAATATGACGACTTACAATAATGTATGGAGCGCTGTTCGA
GCAATATTAAACAATGGATCGTTCCCAGTAAAAATGGCCGAAACAATGCT
TGGGATCAAAGAAGCACAATATTCATGGACGACTGTTAATCACTTATTGA
AATCTACAGACGTAAGAACTCTATTTATTTTCACGGTTTACGTGATGACG
TTATTAGGTCTCTTTGCCGTGATGCAAGATTTCAAAAACGTAACGTGTGA
TTGATGAAAGAATATCTTGATCTTAGCTCGTTTTTTATGATGCTACTATA
ACAAATTGTATCTCTTCTAGTCAGTAAATTAAGATGTGGTACAAATGGCT
CTGGATACCAGATTGTTTTGGAGTTAATATTTTTTTCCAAAAATGGCAAA
TTTACTAGGAAGCTTCACTATTACATACAAAGTACTTTTTCTGTCTTGTG
TGCAATATCTTGTAACTTTCCATTCTTAGGACACAAGCGGGTTACTAGAG
ATGGGTAGTACTTCTCTACAAGTCGCATTTGAACCACACTCGAGTAATTC
CATACCCTCAAACTACTCTGAAGAGGTTTCGCTGAATGGTAAATCGTACA
AAATATACGCCCATTCATACATGTGTTTGGGACGTGACGAATTCGGTAGA
CGCTACTACGCTAAACTTGCTGCGGTAAGTACAGAAAAATCTGATTTTCA
GTCCAAAGACTAAAGTTTAATGATGGAAAAGTCTCTCATCTCTCTCTAAT
TCGTAACTCTAAAATTAGAATCTTTCTATATCGAGCTAAAATATTGGTCC
CTTCAGCTGAAAAGTAGCATAAAATACCCTCTGTAATTCGAATCTTTCTC
CAGTCTGAAGTAAGTCCCTTGAAAATCGAATTAGAGAGAGTCAACTGTAT
GTTCGGTCCTCTACAATTTCGGAGGTTTCTATTAAAGATCAGTACAACTA
AAGCATTTATACCGAACTTGGTGGAAAATAGATATTAAATATTGAAAAAA
ATTGATTTACTGACTAACAAATTAATTCTCAGCACTTTCTTTCAATCATA
GGATAAATTCAACAACTCTGCCACCATCATGAATCCATGTGGTTTCCAAG
GATACAACGTCAGCAAAACGTATACTGATTTGTTTGAAGTGCCTTGTGTT
AAAGGCGATTTCGCTCAAGAATTATTCGGCCAATCGATAAACCCAGACTT
GTCAAGCATGAGTAAGTTTTCACTTTTTTCCATTATCGGTTAGCTAGATA
TTTTACTGAACTAATTACCAAAGCCTCGGACACAACGCTGATAATAGACA
GTGTTGACGAAACGATGCAGCCTAGTACATCATCTCAGATCAGTGAATCT
TACTATAATTTGGAATTCATCTTAAAATCGAAAGAACTATTAGAATCACT
TCATCAGCATACTTTGAATAATTCCAATATTTCCATGTTTATGACATATT
TTCAGACGCAACAGATTCATTCACATTCGTTGGTACCGGTGATTTTGACG
CGTGTAAACAACAAGTGGAATCTATGTTCAAAAAGAATTGCACACACTCA
AGTTGTGGAACCCTTGATGCTTATCAGCCTGATCTCTATGGTCATTTCAC
GGTATGCGTCTCTGAAAATATATTTCATACTATCTTTGTGTATTTCTACC
ATGTACTTCTATTCACGACTTCTCTAATTCGATCTTCAAGGGATAAAGAT
TTTATTCGGATTATAGAAATATTCGAGTTACGGAGAGTATTTCATACGGA
TTTCCAGCTGAGAAGACAAATGTTTTAGCTCGAATTACATAAAGATTCGA
ACAATAGAGGTTCGAATTAGAGCAAGTTTATCTGTAAAACAATTTAAGTA
TAGAAAAGCTTCAAAAACACCCGATAAAATGCCCGAAAACCTTAAAAATT
GATATTTTGCTCTTTGAAATCTTGCCTAAAACTGTTGAAAACTGATCAGA
CTTTCAATAGATAGCTGTGTCGATTTCCTGAATTTCACCAACTCATATTC
CTCTCATGTTTTTTATTTTTAGGGTATAGGTGGTGGTGTATATTTTGCTG
CAGAATTTTTGCAACTACCTGATGATTTCACAGAGAACGATTTCGAAAAC
AAAACGAAAGAACTATGCACAACACCTTTAAATGAGGTACAACTGCCTCT
AAACCCTTCATGAGTTTAAATCCCCTCCCAGCTTAACACTAACAGCCATA
ATGGAGGCGTTCAGTAAACTACTTCCTCTATCCTTGACCTTTACGAGTTT
GAATTAATACTCCAACTGCTTATAGTTATAAGTTTTCTTTTCCTCTCAAC
TCTGTAGCAGGATTAGGCCATTTCATATATCTCCATATATGGGGTAGACG
AATATTTCCAGGGTGTAGCACAAGAAGAATTCCCAGGGAGTCTAAAGGAG
TGCTTTTAAATTCTTTCAGCAGATAAGAAGTTATTCAAAGATTTCTCGGG
GGTAAAAGACTGATTTCAATTTGTCCACCCTCACTTTAATGCCTTTTTGC
AAATTTTGCCTTTTTCGAAGGGATGTTCACACATATCTTTTTTTTGACTC
GAAAAGGTTCGTCTACCCCCTTGTATAGTTATTTTTTGTGATCAAAGAAT
AAAGTTGCTGATAATCTATACCTGTACAACAATTAATCACTTCTCATTAA
AGCATTTTGAATGATTTGCATCCACAGGTGAAGAACCGTACCGGATTCGG
AAAATATTCATACGATTATTGCTTATCCAATACATATACTAACTTCGTTC
TTCAAAACTTGCTGAAAATTAATAAGACGGAGAAAGGCGTCATCAATTTT
GCAAGAAAGGTAAACCACGTGCTATATTTTGACAGACAGTGCGTTCTGAC
ACACCTGTGCCACAGTATTTACAAACCTGGCAGGACCCCAACCCCACTGG
AAAGATCAATTTCAGCCCTACTCGGCAAACTGGCTTTGCTTTCATCCCCA
TTGAAAATTGAATGGGAAAAACTTCTCTCAAAGCCATCCATACTGGTTGG
ACTTTTTGAGCTGAAAAACAATAGAACTTTGATCTCAATTCTTTCCTAAG
AGAAATTTGTAAATTTGTTGTAATTGCAATTAAGGTATAGTATTGCTTTT
ATCCTTAGAGTGCATACCTGTCAAATAAGCTTATTTCTACGTTAAAAACT
GAACCCTGCGCTGCTAGTAACTGAGCTCGAATAGCAATCACTTCTCATTC
TTTTTAGATTAATGATCAGAAGATAAGTTGGACTATGGGCTCCATCATTG
AAGATACTCCAGATATGTCACCAAGTGTTATGGAAGTAACTAGAGATTTA
GAGTCAACGAACTATTATGTTGTTATAGCTATCTCCGCTGTCTTGCTTGT
ACTTGGGTTGTTTTTATTTAGTTACTTATGTTTCTGTAGCAACAATAAAA
ATGGTAGTGTATCTAATAGG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000098_pilon:1134965..1142834- >XLOC_005199 ID=XLOC_005199|Name=XLOC_005199|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3024bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000098_pilon:1134965..1142834- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGTCGCTTACAAAAATGATGGTCGCTTACAAAAATGGTTGGAAATATG GTATTTTGATTTTTGTTGCAATTTTTTTCATCGTTCTCGGCGCCGTAGGT ATCGGTGTTTCAACCTATTTCTACAATGAAGAAATGACGGATGAAGTTCA AGGAAGATTTGGTATTGTTTTCGATGCTGGAGGGTCTGGCACGAGGATGT ATATTTACAGTTTTGATAATAATAATCAATATGTACAGACATTGCAAGAG GATTGTGAGGGTTGGAAATATGGTATTTTGATTTTTGTTGCAATTTTTTT CATCGTTCTCGGCGCCGTAGGTATCGGTGTTTCAACCTATTTCTACAATG AAGAAATGACGGATGAAGTTCAAGGAAGATTTGGTATTGTTTTCGATGCT GGAGGGTCTGGCACGAGGATGTATATTTACAGTTTTGATAATAATAATCA ATATGTACAGACATTGCAAGAGGATTGTGAGGGTGACGGTCTATCCAAGT ATGGAGGACGCACATCCGACCTCAAACCTTTGTTAAACAAATGTTTGGAA GATGCGTCCACGAATATTCCAAAAGAAGTTTCTACCTCTAATGTCCCGTT ATACTTGAAAGCTACAGCTGGTATGCGTAAACTCAGGTGACGGTCTATCC AAGTATGGAGGACGCACATCCGACCTCAAACCTTTGTTAAACAAATGTTT GGAAGATGCGTCCACGAATATTCCAAAAGAAGTTTCTACCTCTAATGTCC CGTTATACTTGAAAGCTACAGCTGGTATGCGTAAACTCAGAGAACAAAAT ATGACGACTTACAATAATGTATGGAGCGCTGTTCGAGCAATATTAAACAA TGGATCGTTCCCAGTAAAAATGGCCGAAACAATGCTTGGGATCAAAGAAG CACAATATTCATGGACGACTGTTAATCACTTATTGAAATCTACAGACAGA ACAAAATATGACGACTTACAATAATGTATGGAGCGCTGTTCGAGCAATAT TAAACAATGGATCGTTCCCAGTAAAAATGGCCGAAACAATGCTTGGGATC AAAGAAGCACAATATTCATGGACGACTGTTAATCACTTATTGAAATCTAC AGACGACACAAGCGGGTTACTAGAGATGGGTAGTACTTCTCTACAAGTCG CATTTGAACCACACTCGAGTAATTCCATACCCTCAAACTACTCTGAAGAG GTTTCGCTGAATGGTAAATCGTACAAAATATACGCCCATTCATACATGTG TTTGGGACGTGACGAATTCGGTAGACGCTACTACGCTAAACTTGCTGCGG ACACAAGCGGGTTACTAGAGATGGGTAGTACTTCTCTACAAGTCGCATTT GAACCACACTCGAGTAATTCCATACCCTCAAACTACTCTGAAGAGGTTTC GCTGAATGGTAAATCGTACAAAATATACGCCCATTCATACATGTGTTTGG GACGTGACGAATTCGGTAGACGCTACTACGCTAAACTTGCTGCGGATAAA TTCAACAACTCTGCCACCATCATGAATCCATGTGGTTTCCAAGGATACAA CGTCAGCAAAACGTATACTGATTTGTTTGAAGTGCCTTGTGTTAAAGGCG ATTTCGCTCAAGAATTATTCGGCCAATCGATAAACCCAGACTTGTCAAGC ATGAGATAAATTCAACAACTCTGCCACCATCATGAATCCATGTGGTTTCC AAGGATACAACGTCAGCAAAACGTATACTGATTTGTTTGAAGTGCCTTGT GTTAAAGGCGATTTCGCTCAAGAATTATTCGGCCAATCGATAAACCCAGA CTTGTCAAGCATGAACGCAACAGATTCATTCACATTCGTTGGTACCGGTG ATTTTGACGCGTGTAAACAACAAGTGGAATCTATGTTCAAAAAGAATTGC ACACACTCAAGTTGTGGAACCCTTGATGCTTATCAGCCTGATCTCTATGG TCATTTCACGACGCAACAGATTCATTCACATTCGTTGGTACCGGTGATTT TGACGCGTGTAAACAACAAGTGGAATCTATGTTCAAAAAGAATTGCACAC ACTCAAGTTGTGGAACCCTTGATGCTTATCAGCCTGATCTCTATGGTCAT TTCACGGGTATAGGTGGTGGTGTATATTTTGCTGCAGAATTTTTGCAACT ACCTGATGATTTCACAGAGAACGATTTCGAAAACAAAACGAAAGAACTAT GCACAACACCTTTAAATGAGGGTATAGGTGGTGGTGTATATTTTGCTGCA GAATTTTTGCAACTACCTGATGATTTCACAGAGAACGATTTCGAAAACAA AACGAAAGAACTATGCACAACACCTTTAAATGAGGTGAAGAACCGTACCG GATTCGGAAAATATTCATACGATTATTGCTTATCCAATACATATACTAAC TTCGTTCTTCAAAACTTGCTGAAAATTAATAAGACGGAGAAAGGCGTCAT CAATTTTGCAAGAAAGGTGAAGAACCGTACCGGATTCGGAAAATATTCAT ACGATTATTGCTTATCCAATACATATACTAACTTCGTTCTTCAAAACTTG CTGAAAATTAATAAGACGGAGAAAGGCGTCATCAATTTTGCAAGAAAGAT TAATGATCAGAAGATAAGTTGGACTATGGGCTCCATCATTGAAGATACTC CAGATATGTCACCAAGTGTTATGGAAGTAACTAGAGATTTAGAGTCAACG AACTATTATGTTGTTATAGCTATCTCCGCTGTCTTGCTTGTACTTGGGTT GTTTTTATTTAGTTACTTATGTTTCTGTAGCAACAATAAAAATGGTAGTG TATCTAATAGGATTAATGATCAGAAGATAAGTTGGACTATGGGCTCCATC ATTGAAGATACTCCAGATATGTCACCAAGTGTTATGGAAGTAACTAGAGA TTTAGAGTCAACGAACTATTATGTTGTTATAGCTATCTCCGCTGTCTTGC TTGTACTTGGGTTGTTTTTATTTAGTTACTTATGTTTCTGTAGCAACAAT AAAAATGGTAGTGTATCTAATAGG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000098_pilon | genome | sc0000098_pilon:1134965..1142834 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1300-1512:214 |
| Aaloc | 1168-1299:744 |
| Aaloc | 1054-1167:1399 |
| Aaloc | 910-1053:1964 |
| Aaloc | 748-906:2370 |
| Aaloc | 553-747:2942 |
| Aaloc | 397-552:3416 |
| Aaloc | 244-393:5246 |
| Aaloc | 22-240:5884 |
| Aaloc | 1-18:7871 |
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