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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000245_pilon:452324..461264- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_005103 ID=XLOC_005103|Name=XLOC_005103|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8941bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000245_pilon:452324..461264- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGAAAATAACTTGGTGTTGATAGGTACTTCATTTTTTTTAACTGTTCG
AGGGCGTTTACTTAATGCGCGTTTTTTGTTTATAAGAACATTCAAATATT
TGAAGACTTCGGATGTTCCTAACCTTTTGAGTTTTAAACCTGAAAATGAT
CCTTAAAATGGTGTTAATTTTACCGTTTTGTAAGTATTTTTGCGTCTTTT
CTAAGAGTAAGAAATTGGGTGTTTAGAGTCATGGTCATTACAGCCTTAAA
TGTTCTTAACTTGTTCTTAATATTTTTTCCCATTGAAGTTTCATGTTATT
ATAGTTTGTTCTTATGAAAAAATGTGTATATATTAATTAGGGTTATAATG
AGATATGACTTATTGAGGATCTTCAAATTTTAACTTCTATCGGTATATCT
TCATTTCCCATAACATTGCGTTGATGAAAGCAGTACATCTTCTTTGTAGA
ATTTTTTTTTATTTGTTTGGCATTGATGGTGATTTTCATTAAAAAAACTA
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AAGGTATGTCCCTATCCAGTATGTTTTGTGGATATTAAAGTATCGAGGCT
TTTAACTTTATTTATTTTTTATACTTCTTTTCATTTTCAGTGAAAAAGGC
AAACACCAGATTTCAAAATGCCGGTAAGTTTTTGTAAATTTCTAAATCTT
AGACTTAGTTTCCTTGTTTACATAATTATTTCATTCTCTATTTTTGAATC
CCTGTTACATATATACCAAAATTAAAAAGCTAATACAGTGTTAAGAGTAC
ATTGTACATATAAATAGCGAGTACCTCGCCAAAACCAGAATTTCTATCCA
GTTTCTTGGTAAGTGTGAACCCATCTGGCACACAACGTTGTTACAACGTT
CATCTAACGTTATATGGACGTTGTGAACATTAGATGAACGTTGAAACAAC
GTCGTGTGCCAGCTGGGAAGAAGCCTTAATTGTTTTGACGTCAAAAAGTC
GGATGTTTAGAGCCAGAAAACCTGTGCTCGAAACATTCAAAAAGGTCACA
ATGTCACAAAAGTAGACGTTACTGTGCAGAAAGAAAACCGCGACGTTTTG
TATAGATTTACATGCGAATGACTTCTTTCCAACCTAATTTCTTAATATTT
AGAATCATCAAAAACGTACATTTCAATACAGTGCCAAGGAGAACAGCACA
GAACGCCAGTGGTCTATGGAAAGGATCCGGTTTGGCACTCAGAGTACAGA
TTGTAAGTAATAAATAAAGAATCGTTCAATAGCGAGGTTAAGCAAGTGTT
TATTTACACCGTTCAATGCGATCTCGTGGGCCTGTACATAAGATTTCACT
TGCATGGTTTGCTTTGGCAAGTTATGTACAGGCCTACGCTGTTGCACTGT
ACGGTCAAAATAAAGCCGTGCTTAACCTCGCTAATGATCAATTCCTCCCC
TCTCTCTCATGTGATTGATTGTACAGCTGAATATCTATAACTCGAACCTC
TATAACTCGAACAAGTTTTCTATTCCATTTGGTTAACATTGCCTTAAAAA
CCTTACTCTATATCTCTAATATCTCTATATCTCGAAATTTCCTTAACGTG
CGTGCTCGATTTATGGAGACTCAACAGTAACACTCTGTAAGCTTTATAAG
AGCTTAAATTTGGTTAAAAGGTTGAGATATGCGCGCGAAAACGCGAAACG
ATTGGCAATTCGCAGCTTGTCTAAAAGTTTCGTTCGTTGGCTAAAGACAG
GCAGAAGAATTTCTACCTAAACAATTGCTTTTTCGAGCAGACGGAGGCTT
TCATTGCCAGTCGGCATAATGTATAATTTCCTTGCATAAACGTTTCCCTT
CCAAGGGAGGGGTCTTGAGTGTAATTCTGGGTTTCCACGACAAGTGGGAG
ACTGATAAATTTGTTTGAAGTAAAAAAAGATTTTAATATGAATTGTTCAC
TTTTCTTACCTCAACAATTATCTGGCATCCAGATGATGAAATTTTCATCC
GACACGCTATAAAGCTCTGAAGGTTGGGAAAATGTTCAACAAATTGAACC
AGCCCTCATTTTCGGGGATTGGCGGGTCCAACCGAAATATTTTCAGGTTT
ACGGGTAAGGGCTGTTGAACCCGACTGGGGGTGTGGCACATCAAAGTCCG
ACTATCATTTCTCTCCGATGGGAAATTGGCCTTTAGCAGGTGGCCGCCAA
TCCATCGGAATATCAGATAACCTCAATAAGATGAAGAACGATAGCAGGAG
GATAAGTGACTCATCCATTGATATTGTCATAAGTCTAAACATATTATGGA
GTGTTAGTCGAGTAGTCAAAGCGTGAGGGCTGTTTGAATACTAGCTTCTT
CCAATGTTCAGTCCACTTCTTAGATAGCCGAGCCGGCTTGCCGTGGACCA
CGTGACAATAATCGAGTAAAAAGTCCTAGATTACTGGGCTATCCACGTAA
AAATTAATATCGATTCATTCTAAACTCTCTTTTCTTTCACAAGGTAGGAA
CTAAACGCTCCGAAAACTCAAGCCGTCTTCAAATAGAATACTTTGTTGTA
TTTAAGTTTCAAATACTTGAAACTTAAATATAAACTAGGTTACATTCTAG
CCGTGTTAAGTGTCAAAAATAAAAAGTTCGGATGATTTTTATTCATTGTA
AAGATTTTTGACTTTAATTAGCTCTGGCTTATTAGACGGCCCACTTTTTG
CCCTGCCTATTCTTTTCGTGAATTAAAGGAATTTAGCTGTCTAAAGTCAA
CGCATTGCCCTCTTTTTACGGCAATGCAATAACATTTTTAAACTTTTCCA
ACAACAGAAAGATCTTAACTATCAACTTTTTGTCTTCTCATTCAATTAGA
ATAGACAGGGAGAAAAAGTCGCCAGTCTAAACTAGAACTAAACAAGTCTC
TAGTCGAAAAATTTCTGTTCTTTCCATATTCACAAACAAATACCTTTTTT
CTTTCAGTAAAATTCTTGATATGAGAGGCTCAGTCATTATGAAGCTGATG
CAGAGTGGATTCTTCTACGATACCGATCTCGGATGCGTTCAAATCCCTTT
CGCTGATATCATTTATGCTTGCAAAGTAAGGATGTCTCATCTTTGTTAAG
GCTGGTGTCCATTTTTTGGCGCTTTTTGTAAGGTCATTGGTCGGTTGAAA
AATGAAATAATTCCATTGGTCGAAATTGATGTAACGGATGAAAAAAGTAG
AACTTCCTTCAACCTTTTTTTTTGTTCGCACGAAACTTTTTTATGACGTA
ATCTTTTCTTCAGGCAAAAATAGTTAAGAAAAAAACTGTCGCCCATTTCG
CGCGAAATTGGAAACATGAAATATTTGTCTGATATGAAAAGAAAACACTT
ATGTAAAAATGAAACCTTTAAAAGAAGACCACGGTAGAAACCTTTGTTTT
CATGTAATGTCATGCTTCGAACGCTCACGGGTGATCTTTGCATTTTAAAA
GAATTGCCGTATGTCGCTCTGGTTACGGTTAGAGGAGCGATTATTAGTGT
CTCGCTAGTACCAACTTTATGGTACTATAAATCATCCGAAAACATGCGAG
TTGAAAAATGAACGATATGGATAAAGGAACGCCACTTCAGTTGAAGCAGT
TCGCATGCAAAAAAATGGAACATCACTCAACCACAGAGACTTTCAGAGAA
CCTTTTTTATACAAACGCTGTATTTATGCACTCTCTTTTTTTTCAGGCAG
GACCTGGCACATGGCACCCCGTATTGCAAGGCTTAAGAGAAACAGACAGC
GAGCTCTTTTGTGATGCAAGATTCGAACTGCCAGGAGGTAAAAAAAAATA
TTGACTACATTTTTCATAATTTTGATATTCAACGAAATTTTCATAGATTT
CCTGTTGAAATATGTCCTATTTGTAAGTCTACTAGTCGGCCATGTTATAT
TCTACTTAACGTTATATTTTTGAAAAAATTAAAATTTCAAAACATTCGAA
TCACGCTGTTGACGACCAGAATTGAAAACAAGATAGTGGACTAGTCAGCT
CGAAAACTGGGCAAGCTTCCTTTTGTACGGGAAGCCCAATCCAGTCAATA
GACGATATCAGATTCACATGAAAACTCAGATTTGACCTCTGAGAACTCAC
CTAGATACTTTGCGCGGAAAAAAATTTGCCGTGAACTTTTTTTCCACGTA
AAAGCATTGTGGGCAAATTTCGGAGGTCAAATCTGAGTTTTCATGTGAAG
CCGATATCGTCTAATAGTTAAAGATCAGTTTTCTTAAATTATTTTTCTTT
TTAGACTTATCAGCTGCGGAGGAGAAAGAACTGTCCGCCAAACTGTCGGC
GTTGAATAAAGTCTTAATTGACGAAGTAGAAACGCTTTCACATCAACACA
AGAAAATACAGTCTGAAGGCTTCAGTCTCGCCAAGGTAGGCCTCCTCCTT
ACACTTTTTCACAAACGAATCGTAATCAAAAGCTTATAACTTTGCTTTTT
AATGATTTTTTATGACGCTGAGAATAAATAACATTGCTTCGTTCTCTTTT
TTTACATGGCAAAAGCATATTACCTTATACTACCGGGCTACTTAATAATC
GCGCCATCCAGTCTATCAAAAAGCTTTAAGTGGACCCCGGGCTTATAACT
TGCCAATTACGTGAACAAATTCAAAAAACTGAATTATCCTCCTTATAATA
TAAACGAATTTGAGTTAAGTTACGAATCTTTGGGGATCTCAGGAAGCCAG
CAAATGCCCGGAACCTTTTTTGTGTTACGGACGTAGTAAATTCTGCAACA
AATGGATGTTCTGAAAGAATAACACCTCAGATCGACGACGAAATCCAATC
TTTCCCTAGTCTAGCATGCTAAGTAAGTAAATTTGTGTCCTCAGTTGGAG
GCGACCCGGAGGCTTCTCTTTCGATAGCTATCTACACGAAGGTAGGGGAG
GGCGCCATTCTTTCTCCTTAGATTTCTCCACTTACCCTTGACCGTTCTCT
TAATTGACAAGTATTAAGCAGAGAGGCATCAAGTAGTATTTTTGTACCAA
ATACGAAGTCTTTGGTATGACCCGACTGAGGGTTGAGCCCACGACCTGGT
GCACCGTAGCCGGATCCTCTACCACTTCACTACGGTCGCTAGCATGCTAC
ACGACTAATGCAGAGATGTTCCCCTAACTCATGTTTGTGTTACTCATGTT
ACCTGAAGTACTATAAATTCATGTCAAATAACTTTACAATAAATTTTGAA
AAAACCGTTATCCCGCATCTTTCCTTTTTTCTTTGCGATCTTGTAATAAT
AATATCGGTTCAGGGATACTGTATCTAGTTTTCGTATTCGTTTCGTATTA
CTCGCGCATCCTAACGCTCAAAAGATTCAATAAACAAATTTCATTTTTTA
ATCAAAGATTTTTCTTTATTCTATCACACAAATTTAAATGAAAAATTTCC
TTTTTACATATCGATACAAATTTTTTCTAGCTTATTAAATGTTTCTGATC
ACGATAGCGTACAAGAGCTACCAAATCATCCAGTTTTGATTTTTAATTTA
GCTCTCTGCAACTGGCAGCAAGTCACAGACTTATTGTTTTGACTTTCATC
TTTTGCTAAATTCACTTGCACATTTACAATAAAGAGACCCAACACATTTG
ACATACATTCGACTCTCTGATTCGACGTTCTTTTATTCGATACGATCCAT
TATTCGATAATTTTGAAAGTCACCGTCAACTGTCAACAAGAAACTCTCAT
AGACTAGGCTCTATTAATCGACACTCTCTATTAATATGGTCTGAAATATA
CAACTGACGCTCTCTAATTCGATGTTCTACTATTCGATACGCTCAATTAT
TTGATAATATCGAAAGTCAACGTCAACACGAAACTCATAAATGATGCTCT
ACTGTTCGATACGCTCCCTTATTCGACGAAGTTCCCATTTCCACTTGAAA
ATGGAACTAGAGAGCGTCAACAATACATTGATTGTCATATTTGCTTCGTC
AGTTTTTGTTTACTATATGATGAAGAAGTAGCGAATGTTAGTTTACACTT
TGATTGCCATTTTCGTTTTAACGATTTTTGGTGGCACACCCATCATAGGG
TCCAGGGGTAAAAAAGTGTTCCATTTTGTGTTGATGAGAAAATCATCATT
CAATGAGACGTCTGGTGAGCATGTGTCGCCGAACCACCATCCACACTGGC
GGTTAGCGGCGCAATTTTTATCGACAACAAAATCTTTGTCATGGGCGGCA
TGTGAGAAAAAAGTGCCAGCCAGCTGCTCAAAACCAGAGGTACCTTCTGT
ATGTGATAATGATGCGTTTAATTGGTATCTATCCAATTTAGAAGCGATGG
CGAAATTGCTGTATATGCCATACGCGAATTGGGCGTCGTCTGCCTCAGCG
AAGATGAGCAAATCAACTGGTTTGTTTTTGGTTAGCAAGTGTATCTTCTC
CAATCCAATCCACATGTCTCCTTCAAGACTTCCGAAACCGTTTTCATATT
TGTCGACAGTTTTATCAAAAGTCATGCTATTAACACCGCGTTGTTGTATG
ACTAGCCATGGTCCTTCTATAGAGTCCATATCACAATAGAATGACGTTAT
AGGTGATTTGTTCCCTATCAGGTGGAATTTGTAGACTCCAGATTTTTCGA
AACCGATCTCATACCATTCCTTACAACTGGTCGGTAAAAACTCGTAATTA
TGGATGATATAGTATGGTGTATTGGTCGCTGCTTCAAATTGATCTGGATG
GAAACCATAATTTTTACGTCCTTTGAATATCTCGCATTTTGATTTCTCCT
CACTGATTATTTCAAAGTTGATGGAAAAGCATTCGGTTTTGTGTTGTTGA
CAAAATAACTGACATTCGACCAGTGATCGAGTTTCTTTTGATGCCAATGG
TGAAGCTCCAATGAACTTCATATTCTCATTTTTAAGCCTGAATACTCCTT
CGTTGGTTAAAGAATGCACCAACTCCAAGCAAAATATGAAGCAGTATACG
AGAAATTGATACATATTGTTTTCAACTGAACCACAAGCGAAAATAATGAT
TTTTACTCGTCTAGACTCTCCAAAGACGTCTTGATTCTATCGAACCAATC
TGTTACTATTTTAAATTTTCAAAAATGTTTACATTTTAATTTCAATTTTT
GTTTATCTTTGTCACGTGATCTTTTCATTGATAATTCATTAGCATTTTAT
TACGATTCGGTTGCAATTAAATTTTCTATTTCGAAATTTTCCGTTTTCAA
TTTTTGAAAAATTTTCCACTGATGTGGTAACACAAAAGAAGTTTACGCAA
TCGTGATTTAAATCATTTTCACATGCGTATTCGACACACGAGGTGTGAAA
GAGAAGCCGATGTCCGCGAAAAAGGATGAATTATTTATACTGTGTGTTTT
TTTAATATGTGAAATGAATTGGGAATTCCTATTTATAAAAAATGGTGGTT
TCTTTTTCGGTTGTCGGAAAAGTAGTTTAAATGGCGAGTGAAGAACTAAA
CTTCCATAAAAGGAAAATGGAGAAGTGCACCGCTCTTCATCGCCTTGCAT
TTCTGCACTCTCTGCATCACTTATGATTATCCTTAGGGTTCCATTTCGTC
TTTTTTGAAGATGGGCTTTCCTCTTTCATCTGTTGTTTTCAAGTTGTGGG
TTTTAGTCTTTCTTCGATTCAACCAAGTTTGAGAATAGTCACGCGATAGG
TTTTTGATGTACAGTTGATGCTTTCAAATTCAATGTTCTACTAATTCGAT
ACGCTCCCTTATTCGATTAAAATCCAATTCCCCTTGAAAATCGGCCACTT
GATGGCTTTGTTGTAAAAATGATCTCCTTACCACGTAAAGTTCAAGCACA
GAGGCGTTTTCATTTTATTTGAATAAAATTTAAAATATTATTATATTATA
ACTTTACGTTGAAAATATTCAGGAGGATCAATCAATTTAATCTCCATAAC
AGTATTCAAAGTTTGAAATGCGTTATACGTCCAACCCTTCACCAGATCTA
CGTCTTCTTTGACGTCAATTAATTGCTTCTGTGAACAACACTAAAAGTAG
TGATCTTTCGAGAATATCAATAACTTTAAATTCATTTGAGGTAACTCTGC
CCAACTTGGAGAAATGTCTGGAAATAAAATATAAAATACTCACAAAAAAA
TTCAAGCAGCTCAACTGAATAGAAAAATGTGCGCCAACTATTGTAAAATA
AGGGCGTTTTTTTGACACGCCCTACAATGGTCTGCATTCTCAAGTGCGAG
AACGAGGCGTTTTTGCTCATTGAAACATAGGGATAACCAAATAATTTTTT
CTTTAGTTCCTAACTAGTTGACTATGATCTAGGAAATGTCGTTTTTGGTC
AGTGTAAAATACGAAACAGGACTTCATATTGAGAAAATTAAGACAACATT
GTTTGACAGACAATGCAGGAATATTTCCAAAATGGGAACAGTTTTGAGGG
GGCGGGGGTAACATTACTCGATCGGGTAACTGTTGCCGTATTGGGAAATA
TACTGAACCCGTACTGATCGTGAAAGAAATTTATTATGTGATTGTTCGAC
ATTCTTCGAACGATAAAGAAAATGAGGCGAATTCAAAATGATGGGAACCG
GTCTAGTTACAACTATGACTATTACGTTATGAATATAAAGTAGTTTTGAT
AAAATCCACTGGGAGTTAATCACCATGGAAATAACTTCAAAACGAGGCAA
GTGATGTTTGTGACGTAATTCATGAAAAGGTTTATACGATACACCTTCTC
ACTTGTGTTCTTTAATATTTTTTCCCAACAGCCAAAAGATGAGAATGAAG
TTCAGCTGGACATTCCATCGCCAAGTGATTTGAACAATTCTGTTTTTACT
GAAGATTCCATCAACGAGGAATTCATCTCTTCTGTTGAACAAGAACAAAC
ATTTAATGAAAAACCTGAAGGTAGGCTCAATTATTCCTCTTTATATTCAT
GGCGTTCTACAATCATGGTCAAAATCTATTCAGAATTTTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000245_pilon:452324..461264- >XLOC_005103 ID=XLOC_005103|Name=XLOC_005103|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1416bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000245_pilon:452324..461264- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGAAAATAACTTGGTGTTGATAGATGGAAAATAACTTGGTGTTGATAG TGAAAAAGGCAAACACCAGATTTCAAAATGCCGTGAAAAAGGCAAACACC AGATTTCAAAATGCCGAATCATCAAAAACGTACATTTCAATACAGTGCCA AGGAGAACAGCACAGAACGCCAGTGGTCTATGGAAAGGATCCGGTTTGGC ACTCAGAGTACAGATTAATCATCAAAAACGTACATTTCAATACAGTGCCA AGGAGAACAGCACAGAACGCCAGTGGTCTATGGAAAGGATCCGGTTTGGC ACTCAGAGTACAGATTTAAAATTCTTGATATGAGAGGCTCAGTCATTATG AAGCTGATGCAGAGTGGATTCTTCTACGATACCGATCTCGGATGCGTTCA AATCCCTTTCGCTGATATCATTTATGCTTGCAAATAAAATTCTTGATATG AGAGGCTCAGTCATTATGAAGCTGATGCAGAGTGGATTCTTCTACGATAC CGATCTCGGATGCGTTCAAATCCCTTTCGCTGATATCATTTATGCTTGCA AAGCAGGACCTGGCACATGGCACCCCGTATTGCAAGGCTTAAGAGAAACA GACAGCGAGCTCTTTTGTGATGCAAGATTCGAACTGCCAGGAGGCAGGAC CTGGCACATGGCACCCCGTATTGCAAGGCTTAAGAGAAACAGACAGCGAG CTCTTTTGTGATGCAAGATTCGAACTGCCAGGAGACTTATCAGCTGCGGA GGAGAAAGAACTGTCCGCCAAACTGTCGGCGTTGAATAAAGTCTTAATTG ACGAAGTAGAAACGCTTTCACATCAACACAAGAAAATACAGTCTGAAGGC TTCAGTCTCGCCAAGACTTATCAGCTGCGGAGGAGAAAGAACTGTCCGCC AAACTGTCGGCGTTGAATAAAGTCTTAATTGACGAAGTAGAAACGCTTTC ACATCAACACAAGAAAATACAGTCTGAAGGCTTCAGTCTCGCCAAGCCAA AAGATGAGAATGAAGTTCAGCTGGACATTCCATCGCCAAGTGATTTGAAC AATTCTGTTTTTACTGAAGATTCCATCAACGAGGAATTCATCTCTTCTGT TGAACAAGAACAAACATTTAATGAAAAACCTGAAGGTAGGCTCAATTATT CCTCTTTATATTCATGGCGTTCTACAATCATGGTCAAAATCTATTCAGAA TTTTAGCCAAAAGATGAGAATGAAGTTCAGCTGGACATTCCATCGCCAAG TGATTTGAACAATTCTGTTTTTACTGAAGATTCCATCAACGAGGAATTCA TCTCTTCTGTTGAACAAGAACAAACATTTAATGAAAAACCTGAAGGTAGG CTCAATTATTCCTCTTTATATTCATGGCGTTCTACAATCATGGTCAAAAT CTATTCAGAATTTTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000245_pilon | genome | sc0000245_pilon:452324..461264 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 499-708:211 |
| Aaloc | 370-498:4686 |
| Aaloc | 277-366:5246 |
| Aaloc | 160-276:5984 |
| Aaloc | 61-156:7788 |
| Aaloc | 28-57:8300 |
| Aaloc | 1-24:8942 |
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