XLOC_005103 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_005103
Unique NameXLOC_005103
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000245_pilon:452324..461264-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_005103 ID=XLOC_005103|Name=XLOC_005103|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8941bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000245_pilon:452324..461264- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAAAATAACTTGGTGTTGATAGGTACTTCATTTTTTTTAACTGTTCG AGGGCGTTTACTTAATGCGCGTTTTTTGTTTATAAGAACATTCAAATATT TGAAGACTTCGGATGTTCCTAACCTTTTGAGTTTTAAACCTGAAAATGAT CCTTAAAATGGTGTTAATTTTACCGTTTTGTAAGTATTTTTGCGTCTTTT CTAAGAGTAAGAAATTGGGTGTTTAGAGTCATGGTCATTACAGCCTTAAA TGTTCTTAACTTGTTCTTAATATTTTTTCCCATTGAAGTTTCATGTTATT ATAGTTTGTTCTTATGAAAAAATGTGTATATATTAATTAGGGTTATAATG AGATATGACTTATTGAGGATCTTCAAATTTTAACTTCTATCGGTATATCT TCATTTCCCATAACATTGCGTTGATGAAAGCAGTACATCTTCTTTGTAGA ATTTTTTTTTATTTGTTTGGCATTGATGGTGATTTTCATTAAAAAAACTA CAAATACATTGGACTTAAAAATAATGTTTTAATCAGAATGCTTTGTTTAA AAGGTATGTCCCTATCCAGTATGTTTTGTGGATATTAAAGTATCGAGGCT TTTAACTTTATTTATTTTTTATACTTCTTTTCATTTTCAGTGAAAAAGGC AAACACCAGATTTCAAAATGCCGGTAAGTTTTTGTAAATTTCTAAATCTT AGACTTAGTTTCCTTGTTTACATAATTATTTCATTCTCTATTTTTGAATC CCTGTTACATATATACCAAAATTAAAAAGCTAATACAGTGTTAAGAGTAC ATTGTACATATAAATAGCGAGTACCTCGCCAAAACCAGAATTTCTATCCA GTTTCTTGGTAAGTGTGAACCCATCTGGCACACAACGTTGTTACAACGTT CATCTAACGTTATATGGACGTTGTGAACATTAGATGAACGTTGAAACAAC GTCGTGTGCCAGCTGGGAAGAAGCCTTAATTGTTTTGACGTCAAAAAGTC GGATGTTTAGAGCCAGAAAACCTGTGCTCGAAACATTCAAAAAGGTCACA ATGTCACAAAAGTAGACGTTACTGTGCAGAAAGAAAACCGCGACGTTTTG TATAGATTTACATGCGAATGACTTCTTTCCAACCTAATTTCTTAATATTT AGAATCATCAAAAACGTACATTTCAATACAGTGCCAAGGAGAACAGCACA GAACGCCAGTGGTCTATGGAAAGGATCCGGTTTGGCACTCAGAGTACAGA TTGTAAGTAATAAATAAAGAATCGTTCAATAGCGAGGTTAAGCAAGTGTT TATTTACACCGTTCAATGCGATCTCGTGGGCCTGTACATAAGATTTCACT TGCATGGTTTGCTTTGGCAAGTTATGTACAGGCCTACGCTGTTGCACTGT ACGGTCAAAATAAAGCCGTGCTTAACCTCGCTAATGATCAATTCCTCCCC TCTCTCTCATGTGATTGATTGTACAGCTGAATATCTATAACTCGAACCTC TATAACTCGAACAAGTTTTCTATTCCATTTGGTTAACATTGCCTTAAAAA CCTTACTCTATATCTCTAATATCTCTATATCTCGAAATTTCCTTAACGTG CGTGCTCGATTTATGGAGACTCAACAGTAACACTCTGTAAGCTTTATAAG AGCTTAAATTTGGTTAAAAGGTTGAGATATGCGCGCGAAAACGCGAAACG ATTGGCAATTCGCAGCTTGTCTAAAAGTTTCGTTCGTTGGCTAAAGACAG GCAGAAGAATTTCTACCTAAACAATTGCTTTTTCGAGCAGACGGAGGCTT TCATTGCCAGTCGGCATAATGTATAATTTCCTTGCATAAACGTTTCCCTT CCAAGGGAGGGGTCTTGAGTGTAATTCTGGGTTTCCACGACAAGTGGGAG ACTGATAAATTTGTTTGAAGTAAAAAAAGATTTTAATATGAATTGTTCAC TTTTCTTACCTCAACAATTATCTGGCATCCAGATGATGAAATTTTCATCC GACACGCTATAAAGCTCTGAAGGTTGGGAAAATGTTCAACAAATTGAACC AGCCCTCATTTTCGGGGATTGGCGGGTCCAACCGAAATATTTTCAGGTTT ACGGGTAAGGGCTGTTGAACCCGACTGGGGGTGTGGCACATCAAAGTCCG ACTATCATTTCTCTCCGATGGGAAATTGGCCTTTAGCAGGTGGCCGCCAA TCCATCGGAATATCAGATAACCTCAATAAGATGAAGAACGATAGCAGGAG GATAAGTGACTCATCCATTGATATTGTCATAAGTCTAAACATATTATGGA GTGTTAGTCGAGTAGTCAAAGCGTGAGGGCTGTTTGAATACTAGCTTCTT CCAATGTTCAGTCCACTTCTTAGATAGCCGAGCCGGCTTGCCGTGGACCA CGTGACAATAATCGAGTAAAAAGTCCTAGATTACTGGGCTATCCACGTAA AAATTAATATCGATTCATTCTAAACTCTCTTTTCTTTCACAAGGTAGGAA CTAAACGCTCCGAAAACTCAAGCCGTCTTCAAATAGAATACTTTGTTGTA TTTAAGTTTCAAATACTTGAAACTTAAATATAAACTAGGTTACATTCTAG CCGTGTTAAGTGTCAAAAATAAAAAGTTCGGATGATTTTTATTCATTGTA AAGATTTTTGACTTTAATTAGCTCTGGCTTATTAGACGGCCCACTTTTTG CCCTGCCTATTCTTTTCGTGAATTAAAGGAATTTAGCTGTCTAAAGTCAA CGCATTGCCCTCTTTTTACGGCAATGCAATAACATTTTTAAACTTTTCCA ACAACAGAAAGATCTTAACTATCAACTTTTTGTCTTCTCATTCAATTAGA ATAGACAGGGAGAAAAAGTCGCCAGTCTAAACTAGAACTAAACAAGTCTC TAGTCGAAAAATTTCTGTTCTTTCCATATTCACAAACAAATACCTTTTTT CTTTCAGTAAAATTCTTGATATGAGAGGCTCAGTCATTATGAAGCTGATG CAGAGTGGATTCTTCTACGATACCGATCTCGGATGCGTTCAAATCCCTTT CGCTGATATCATTTATGCTTGCAAAGTAAGGATGTCTCATCTTTGTTAAG GCTGGTGTCCATTTTTTGGCGCTTTTTGTAAGGTCATTGGTCGGTTGAAA AATGAAATAATTCCATTGGTCGAAATTGATGTAACGGATGAAAAAAGTAG AACTTCCTTCAACCTTTTTTTTTGTTCGCACGAAACTTTTTTATGACGTA ATCTTTTCTTCAGGCAAAAATAGTTAAGAAAAAAACTGTCGCCCATTTCG CGCGAAATTGGAAACATGAAATATTTGTCTGATATGAAAAGAAAACACTT ATGTAAAAATGAAACCTTTAAAAGAAGACCACGGTAGAAACCTTTGTTTT CATGTAATGTCATGCTTCGAACGCTCACGGGTGATCTTTGCATTTTAAAA GAATTGCCGTATGTCGCTCTGGTTACGGTTAGAGGAGCGATTATTAGTGT CTCGCTAGTACCAACTTTATGGTACTATAAATCATCCGAAAACATGCGAG TTGAAAAATGAACGATATGGATAAAGGAACGCCACTTCAGTTGAAGCAGT TCGCATGCAAAAAAATGGAACATCACTCAACCACAGAGACTTTCAGAGAA CCTTTTTTATACAAACGCTGTATTTATGCACTCTCTTTTTTTTCAGGCAG GACCTGGCACATGGCACCCCGTATTGCAAGGCTTAAGAGAAACAGACAGC GAGCTCTTTTGTGATGCAAGATTCGAACTGCCAGGAGGTAAAAAAAAATA TTGACTACATTTTTCATAATTTTGATATTCAACGAAATTTTCATAGATTT CCTGTTGAAATATGTCCTATTTGTAAGTCTACTAGTCGGCCATGTTATAT TCTACTTAACGTTATATTTTTGAAAAAATTAAAATTTCAAAACATTCGAA TCACGCTGTTGACGACCAGAATTGAAAACAAGATAGTGGACTAGTCAGCT CGAAAACTGGGCAAGCTTCCTTTTGTACGGGAAGCCCAATCCAGTCAATA GACGATATCAGATTCACATGAAAACTCAGATTTGACCTCTGAGAACTCAC CTAGATACTTTGCGCGGAAAAAAATTTGCCGTGAACTTTTTTTCCACGTA AAAGCATTGTGGGCAAATTTCGGAGGTCAAATCTGAGTTTTCATGTGAAG CCGATATCGTCTAATAGTTAAAGATCAGTTTTCTTAAATTATTTTTCTTT TTAGACTTATCAGCTGCGGAGGAGAAAGAACTGTCCGCCAAACTGTCGGC GTTGAATAAAGTCTTAATTGACGAAGTAGAAACGCTTTCACATCAACACA AGAAAATACAGTCTGAAGGCTTCAGTCTCGCCAAGGTAGGCCTCCTCCTT ACACTTTTTCACAAACGAATCGTAATCAAAAGCTTATAACTTTGCTTTTT AATGATTTTTTATGACGCTGAGAATAAATAACATTGCTTCGTTCTCTTTT TTTACATGGCAAAAGCATATTACCTTATACTACCGGGCTACTTAATAATC GCGCCATCCAGTCTATCAAAAAGCTTTAAGTGGACCCCGGGCTTATAACT TGCCAATTACGTGAACAAATTCAAAAAACTGAATTATCCTCCTTATAATA TAAACGAATTTGAGTTAAGTTACGAATCTTTGGGGATCTCAGGAAGCCAG CAAATGCCCGGAACCTTTTTTGTGTTACGGACGTAGTAAATTCTGCAACA AATGGATGTTCTGAAAGAATAACACCTCAGATCGACGACGAAATCCAATC TTTCCCTAGTCTAGCATGCTAAGTAAGTAAATTTGTGTCCTCAGTTGGAG GCGACCCGGAGGCTTCTCTTTCGATAGCTATCTACACGAAGGTAGGGGAG GGCGCCATTCTTTCTCCTTAGATTTCTCCACTTACCCTTGACCGTTCTCT TAATTGACAAGTATTAAGCAGAGAGGCATCAAGTAGTATTTTTGTACCAA ATACGAAGTCTTTGGTATGACCCGACTGAGGGTTGAGCCCACGACCTGGT GCACCGTAGCCGGATCCTCTACCACTTCACTACGGTCGCTAGCATGCTAC ACGACTAATGCAGAGATGTTCCCCTAACTCATGTTTGTGTTACTCATGTT ACCTGAAGTACTATAAATTCATGTCAAATAACTTTACAATAAATTTTGAA AAAACCGTTATCCCGCATCTTTCCTTTTTTCTTTGCGATCTTGTAATAAT AATATCGGTTCAGGGATACTGTATCTAGTTTTCGTATTCGTTTCGTATTA CTCGCGCATCCTAACGCTCAAAAGATTCAATAAACAAATTTCATTTTTTA ATCAAAGATTTTTCTTTATTCTATCACACAAATTTAAATGAAAAATTTCC TTTTTACATATCGATACAAATTTTTTCTAGCTTATTAAATGTTTCTGATC ACGATAGCGTACAAGAGCTACCAAATCATCCAGTTTTGATTTTTAATTTA GCTCTCTGCAACTGGCAGCAAGTCACAGACTTATTGTTTTGACTTTCATC TTTTGCTAAATTCACTTGCACATTTACAATAAAGAGACCCAACACATTTG ACATACATTCGACTCTCTGATTCGACGTTCTTTTATTCGATACGATCCAT TATTCGATAATTTTGAAAGTCACCGTCAACTGTCAACAAGAAACTCTCAT AGACTAGGCTCTATTAATCGACACTCTCTATTAATATGGTCTGAAATATA CAACTGACGCTCTCTAATTCGATGTTCTACTATTCGATACGCTCAATTAT TTGATAATATCGAAAGTCAACGTCAACACGAAACTCATAAATGATGCTCT ACTGTTCGATACGCTCCCTTATTCGACGAAGTTCCCATTTCCACTTGAAA ATGGAACTAGAGAGCGTCAACAATACATTGATTGTCATATTTGCTTCGTC AGTTTTTGTTTACTATATGATGAAGAAGTAGCGAATGTTAGTTTACACTT TGATTGCCATTTTCGTTTTAACGATTTTTGGTGGCACACCCATCATAGGG TCCAGGGGTAAAAAAGTGTTCCATTTTGTGTTGATGAGAAAATCATCATT CAATGAGACGTCTGGTGAGCATGTGTCGCCGAACCACCATCCACACTGGC GGTTAGCGGCGCAATTTTTATCGACAACAAAATCTTTGTCATGGGCGGCA TGTGAGAAAAAAGTGCCAGCCAGCTGCTCAAAACCAGAGGTACCTTCTGT ATGTGATAATGATGCGTTTAATTGGTATCTATCCAATTTAGAAGCGATGG CGAAATTGCTGTATATGCCATACGCGAATTGGGCGTCGTCTGCCTCAGCG AAGATGAGCAAATCAACTGGTTTGTTTTTGGTTAGCAAGTGTATCTTCTC CAATCCAATCCACATGTCTCCTTCAAGACTTCCGAAACCGTTTTCATATT TGTCGACAGTTTTATCAAAAGTCATGCTATTAACACCGCGTTGTTGTATG ACTAGCCATGGTCCTTCTATAGAGTCCATATCACAATAGAATGACGTTAT AGGTGATTTGTTCCCTATCAGGTGGAATTTGTAGACTCCAGATTTTTCGA AACCGATCTCATACCATTCCTTACAACTGGTCGGTAAAAACTCGTAATTA TGGATGATATAGTATGGTGTATTGGTCGCTGCTTCAAATTGATCTGGATG GAAACCATAATTTTTACGTCCTTTGAATATCTCGCATTTTGATTTCTCCT CACTGATTATTTCAAAGTTGATGGAAAAGCATTCGGTTTTGTGTTGTTGA CAAAATAACTGACATTCGACCAGTGATCGAGTTTCTTTTGATGCCAATGG TGAAGCTCCAATGAACTTCATATTCTCATTTTTAAGCCTGAATACTCCTT CGTTGGTTAAAGAATGCACCAACTCCAAGCAAAATATGAAGCAGTATACG AGAAATTGATACATATTGTTTTCAACTGAACCACAAGCGAAAATAATGAT TTTTACTCGTCTAGACTCTCCAAAGACGTCTTGATTCTATCGAACCAATC TGTTACTATTTTAAATTTTCAAAAATGTTTACATTTTAATTTCAATTTTT GTTTATCTTTGTCACGTGATCTTTTCATTGATAATTCATTAGCATTTTAT TACGATTCGGTTGCAATTAAATTTTCTATTTCGAAATTTTCCGTTTTCAA TTTTTGAAAAATTTTCCACTGATGTGGTAACACAAAAGAAGTTTACGCAA TCGTGATTTAAATCATTTTCACATGCGTATTCGACACACGAGGTGTGAAA GAGAAGCCGATGTCCGCGAAAAAGGATGAATTATTTATACTGTGTGTTTT TTTAATATGTGAAATGAATTGGGAATTCCTATTTATAAAAAATGGTGGTT TCTTTTTCGGTTGTCGGAAAAGTAGTTTAAATGGCGAGTGAAGAACTAAA CTTCCATAAAAGGAAAATGGAGAAGTGCACCGCTCTTCATCGCCTTGCAT TTCTGCACTCTCTGCATCACTTATGATTATCCTTAGGGTTCCATTTCGTC TTTTTTGAAGATGGGCTTTCCTCTTTCATCTGTTGTTTTCAAGTTGTGGG TTTTAGTCTTTCTTCGATTCAACCAAGTTTGAGAATAGTCACGCGATAGG TTTTTGATGTACAGTTGATGCTTTCAAATTCAATGTTCTACTAATTCGAT ACGCTCCCTTATTCGATTAAAATCCAATTCCCCTTGAAAATCGGCCACTT GATGGCTTTGTTGTAAAAATGATCTCCTTACCACGTAAAGTTCAAGCACA GAGGCGTTTTCATTTTATTTGAATAAAATTTAAAATATTATTATATTATA ACTTTACGTTGAAAATATTCAGGAGGATCAATCAATTTAATCTCCATAAC AGTATTCAAAGTTTGAAATGCGTTATACGTCCAACCCTTCACCAGATCTA CGTCTTCTTTGACGTCAATTAATTGCTTCTGTGAACAACACTAAAAGTAG TGATCTTTCGAGAATATCAATAACTTTAAATTCATTTGAGGTAACTCTGC CCAACTTGGAGAAATGTCTGGAAATAAAATATAAAATACTCACAAAAAAA TTCAAGCAGCTCAACTGAATAGAAAAATGTGCGCCAACTATTGTAAAATA AGGGCGTTTTTTTGACACGCCCTACAATGGTCTGCATTCTCAAGTGCGAG AACGAGGCGTTTTTGCTCATTGAAACATAGGGATAACCAAATAATTTTTT CTTTAGTTCCTAACTAGTTGACTATGATCTAGGAAATGTCGTTTTTGGTC AGTGTAAAATACGAAACAGGACTTCATATTGAGAAAATTAAGACAACATT GTTTGACAGACAATGCAGGAATATTTCCAAAATGGGAACAGTTTTGAGGG GGCGGGGGTAACATTACTCGATCGGGTAACTGTTGCCGTATTGGGAAATA TACTGAACCCGTACTGATCGTGAAAGAAATTTATTATGTGATTGTTCGAC ATTCTTCGAACGATAAAGAAAATGAGGCGAATTCAAAATGATGGGAACCG GTCTAGTTACAACTATGACTATTACGTTATGAATATAAAGTAGTTTTGAT AAAATCCACTGGGAGTTAATCACCATGGAAATAACTTCAAAACGAGGCAA GTGATGTTTGTGACGTAATTCATGAAAAGGTTTATACGATACACCTTCTC ACTTGTGTTCTTTAATATTTTTTCCCAACAGCCAAAAGATGAGAATGAAG TTCAGCTGGACATTCCATCGCCAAGTGATTTGAACAATTCTGTTTTTACT GAAGATTCCATCAACGAGGAATTCATCTCTTCTGTTGAACAAGAACAAAC ATTTAATGAAAAACCTGAAGGTAGGCTCAATTATTCCTCTTTATATTCAT GGCGTTCTACAATCATGGTCAAAATCTATTCAGAATTTTAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000245_pilon:452324..461264-

>XLOC_005103 ID=XLOC_005103|Name=XLOC_005103|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1416bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000245_pilon:452324..461264- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAAAATAACTTGGTGTTGATAGATGGAAAATAACTTGGTGTTGATAG
TGAAAAAGGCAAACACCAGATTTCAAAATGCCGTGAAAAAGGCAAACACC
AGATTTCAAAATGCCGAATCATCAAAAACGTACATTTCAATACAGTGCCA
AGGAGAACAGCACAGAACGCCAGTGGTCTATGGAAAGGATCCGGTTTGGC
ACTCAGAGTACAGATTAATCATCAAAAACGTACATTTCAATACAGTGCCA
AGGAGAACAGCACAGAACGCCAGTGGTCTATGGAAAGGATCCGGTTTGGC
ACTCAGAGTACAGATTTAAAATTCTTGATATGAGAGGCTCAGTCATTATG
AAGCTGATGCAGAGTGGATTCTTCTACGATACCGATCTCGGATGCGTTCA
AATCCCTTTCGCTGATATCATTTATGCTTGCAAATAAAATTCTTGATATG
AGAGGCTCAGTCATTATGAAGCTGATGCAGAGTGGATTCTTCTACGATAC
CGATCTCGGATGCGTTCAAATCCCTTTCGCTGATATCATTTATGCTTGCA
AAGCAGGACCTGGCACATGGCACCCCGTATTGCAAGGCTTAAGAGAAACA
GACAGCGAGCTCTTTTGTGATGCAAGATTCGAACTGCCAGGAGGCAGGAC
CTGGCACATGGCACCCCGTATTGCAAGGCTTAAGAGAAACAGACAGCGAG
CTCTTTTGTGATGCAAGATTCGAACTGCCAGGAGACTTATCAGCTGCGGA
GGAGAAAGAACTGTCCGCCAAACTGTCGGCGTTGAATAAAGTCTTAATTG
ACGAAGTAGAAACGCTTTCACATCAACACAAGAAAATACAGTCTGAAGGC
TTCAGTCTCGCCAAGACTTATCAGCTGCGGAGGAGAAAGAACTGTCCGCC
AAACTGTCGGCGTTGAATAAAGTCTTAATTGACGAAGTAGAAACGCTTTC
ACATCAACACAAGAAAATACAGTCTGAAGGCTTCAGTCTCGCCAAGCCAA
AAGATGAGAATGAAGTTCAGCTGGACATTCCATCGCCAAGTGATTTGAAC
AATTCTGTTTTTACTGAAGATTCCATCAACGAGGAATTCATCTCTTCTGT
TGAACAAGAACAAACATTTAATGAAAAACCTGAAGGTAGGCTCAATTATT
CCTCTTTATATTCATGGCGTTCTACAATCATGGTCAAAATCTATTCAGAA
TTTTAGCCAAAAGATGAGAATGAAGTTCAGCTGGACATTCCATCGCCAAG
TGATTTGAACAATTCTGTTTTTACTGAAGATTCCATCAACGAGGAATTCA
TCTCTTCTGTTGAACAAGAACAAACATTTAATGAAAAACCTGAAGGTAGG
CTCAATTATTCCTCTTTATATTCATGGCGTTCTACAATCATGGTCAAAAT
CTATTCAGAATTTTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_005103XLOC_005103-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000245_pilongenomesc0000245_pilon:452324..461264 -
Properties
Property NameValue
Aaloc499-708:211
Aaloc370-498:4686
Aaloc277-366:5246
Aaloc160-276:5984
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Aaloc1-24:8942