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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000339_pilon:235637..241174+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_004889 ID=XLOC_004889|Name=XLOC_004889|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5538bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000339_pilon:235637..241174+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGACAAAATCATGGGCTTATGGCTTTTACATCATCGTTGCAGTTCTAGT
TTTCTTGAACTATAGTCTTTTAAAACTGAGAGGAATCGCACTATCGCAGA
GGCAAAAGGAGATTACTTATCCACCGTTGTTGGATAAAAGACGTGGCTTG
AAAGAAGGTATCCAATCTTGTTGTAATGCTTTATTGTGTCCGATTGAAGG
TGAATGGCATATGAAAAACCGGACATCTATTAAGCAATTCAGTTATGTTG
AACATACAAATATGCaattacgcatgcgtaaagGTTGGCCTGCGCAGCTT
TATCATGGTGATTTAAGATGTGGGACCATGTATCCTTTACCAAGACTTGT
ACGAAAACAAAATACACAAATTTTCATGTCAGATATTATTTCCCAATGTA
ATAGTTATAGTCAAGCACCATGTTGTCGGAACGATATCGGATGGTGCGGT
GAAGGTGAATTTTTCTGCCGGTGTGAAACGTGCTTAAATTATCGAAACAT
AATTCAAACAGAGCTTTATGATTGGAAACATAAATTGAAATGTATTAAAC
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TCAGTGACTTTTATTGGTGATTCTCTAGTCCGTCATGTTTTCTCATCGTT
ACTTATTCAACTGACCGAGGACCCTCAAACTGGCGCTTTGAAGCCGAATT
TACATCAAACAGAGAAGCAATATTGTAGCGACGAAAATCAGTTTGTTGAT
AGTGCTTGTCATTCTAAACTTTCAATCGATTGGCATGAAGTGAACGCACA
CCCTGAGTATTGTAACACGTCTATTTCTAAACCGAAAGTATTTTTTATAC
AGGCTTATGCTTCTCATTTGGGTGGAATGGCGTATGAGAAAGTTAACAAG
ATCCTATCCGAACAGCGACCTTTAATCTTGATTGGGATTGGCATACATGA
TAATTTTAACCACGATAAAGTTATTGACGAATATCTTGCCCCGCTGATAC
AACTTCGAAACGAGAGAATCGGATACAGTAATCCTGTCATTGTTTGGTTA
AATACACACGCAGCGGGGCTTTTAAAACCGATTGGCTACCAGAAAACTCA
AGGAAACGAAAGGATATTAAAATTCAATTCTGTCTTGTATGATTATTGCA
GAAGGAATTCTATTTTTGTTTTCGATACTTTCAATATGACAAAAGGTGTT
CATAGTTTTGATGGCACACATTATGGAAAAACGCTGAATCAGCTAAAAGT
TGAGATACTTTTGAATTCATTGAGAATGCTGAAGGATTGGTGAGTTACTT
TGCCTTAAACAATTATATGTAAATTAAAAACCGGTAAGCCTTTTCCGTGT
CAATTTAAAGTGAATACCacgtactcttgtctcccgaatagacggggggt
ccgaataagcaggggggtaggaaaattttctaaattctaataagcggggg
ggatggaataagaGggggggggtagtttaaagacagatttttttctaact
ggtatcaatttcaacaacaaaaaagaaactttaacaaataaacacgtaaa
ataagaaccaataccaacaaaaaggaaaatttaaacaagtttaaggtcta
tctacactgtaataaaatattgaatcattcgaatttaattagcggggggg
gggtcttaataagagcggggggatggaCTTTTTTGtatcttaacaattag
cggggggacgtttattcgggagacaagagtacgtACTTCCACTCTAGGAt
ttcaaaaattgctttttacTACGCTTCATTAAGATGGGATAAATCCAAAA
TGGTCAAACGTTTTAAATTACTTTACAAACATGAACGTTTTCAGGAGTTT
AAAAACTTGTACGCATTGTCTGACGTCTGACATACTCGACAACGGCAAAT
AATACTACCATACAATGAACCCCGTGCGGGGAGGGGCAAAGGGCGGTGAT
CTTTTATCGGATTTATCGGATTTATCGGATTAAAAATGCTTATCTTATTA
AGttgcaaagaaaaattgatgatgTTTAAAgacaggaattttttttttct
gatggaGAACGGAGAACATTTAAACAAATATccagtgaaaatttcagaac
tCTAGTCTTTCCCAATCGGTCACTATTTTGATTCCGATTTTGAGGCATGT
GGATGGGACTTAAGATGAATGATGATATCTATAAGATGAAACATTCccaa
aatttataaattattgAATCAAAGAATGGGGTCCTTTTAAAAAGCAGTAC
TGTACTCATTACAAAAACAAAGTTTAGGTTTTTAAGCAATACTCTAAAGA
TTGACGTGAGGGGAGGGTACATGACTATGGTGGCCCATCGTTGTCAacgt
gtttttttcttcaaatagaAAGTAGTAcgaaaagtaattaaaaaaagaaa
aacatttttttatttctgaataaaaattttaaaaatcattttaaaaataa
aaaaaataataaaaaaataaaaaatagttaaaaaaagagacaataaaaaa
aatttaattaaaaaagaaaaaatttaaaatttaaaaaatttaaaagacgt
aaaaaaaTCACGTAGCCCAGCGTTGTCATTGTCATTTTTATCTCCCTAGT
ATTTGGAGTTTGGGAATACgttcaagaaaaattacaaagtggAGAATGAA
GAACGAGTGTATTCTAGAGTCACAGATCATCATTTACTTATTCCGCTTAA
CTTACGGGCACTGCGCTGCAACCTTAATCCGTGGCGTATTTGGCGGAGGC
CACCCACGTTAAAGCAATAATGGGGGCCAGCATCCCATCAAAGGTGTTTA
AAAATAGGAAGATTACGCAGTAGTCGGAATCGACTGACGGCTCAAATGAG
GTAGTAGCAGTGGACTTTAATGTGCCAACAAAACTAGGAAACTCATCCGG
ACGTGTGTTTAAAATATAGGAAAATTACAGTAGTCGGACTCGTGCGTGTA
CGCTGTGTCAACTGCAAGAACAAGATTCCCCTCTCTTGAGACTTTAAAGG
AGATTGGAGTGTCCTATAGATTGAGAATTCTCATTTTATAGGCACTTGTA
GGGTTTACACCCAGGATTGGAATGAGAATCGGTCTTCGACTAAAGAGTCC
GGGAGTCCTGAGAGTGATATCGGCTTTCGCATGTCGGGAACAATTTATGA
CAACTGATCacagtatttttgttttcaatttagtttttataatTCGATTC
CCAGGGAGtgagattttcatcgaatacggTAACTTTTCGAATAACGGAAC
GTCTAATTAGAGAGCCTCGACTGTACTTCGTGCACTTGTTAATTAGGACA
ATCTCGGTAATTTATTACGACGACTCAGTTCATTTACTCATTAGGTATat
taataaaaaagacaaaactttCTCTGCAAATATGATATATATATTCTGTT
gaatcaaaaatattcaaatgcaAGCAGGTTCaaaccaataaaaacaaaaa
atcgtaCTCATATGTGCTTAATCGTAggggggggtcactttgcaattttt
ggaaaatcacccCATAGCATTTTATAATGTCCCCCATTGTATGAAGTTTT
CCTgaaaaaagtgccaaaaccttcatttccctagggttttttttgggaaa
atcactcCAAAATCACTTAATAATGAACCCacccccattttatgattttt
cttccggggtacccaccccctgcttattccacgccccctacaattaagca
cagaagagtatccgaaaaatactaaaattactaCAAAAACTGAAGACCAA
AATCATAAACGACTCATTCTTTAGATAATGGGGTCTAATATGTAATAAAC
ACTTACATAACAAacattatcaaattttaattttgcattGAAAAATGCAC
ATACAGCCATAAGCTGAATTTGAAAACAAGCTATGGATGCTTATATGAAT
TTAATCATGGTAAAAGATCAAACAGTAAAGATATTGTATCCTAGTGAGAA
TTCAAATGGTTTCTGAGAAAAGTGTCATTTATGCCAAATTGTGTCACtta
tgataataataataataacaataataaaaaatttctcttttatcACACAG
AAAGGTACATCTATATACAAGCTAAAAACACACAcgcttaattttttata
agaataccttctataagaatatcagggtgaaaattggccaattcttaaga
ataccctaagaatacctccagggtgagtttcacagattttgataataata
tagtcattttctatttgttgacaaaaatgaaTGGGTTTTTTGTTCGACTT
AAATTGAAACTTATTTAAGGTAGAATACAATTTTAGCTTCAAATGTGCGC
TAAATCTGGCTAaatagaaagaaacaagaaaGAAGAACAAGATACTCTCA
AATCAAATAGGTCATTtcttatatttatatattatttcaccctcaatttc
ggccattttttttaagaatacttgaccctcagccaattcttataaaaaaa
gcgtgtaacaactaaaaatttcttttttaaaagaaaataaaaaagtaaca
aaaataaacttgaaTACACGTTAGGTTTTTATCTGACGATCCAGTACTCG
TCAAAGGTGAGCATGTTTTCTTACAACTTtgaacaaataaaacaaaagaa
atttcaacaaatGACAGTCTTTCAATAATCTACAGCGTTGACCCGTCCAC
AATCTCCACTTCCTTCAATCCAAGAAGCCTACAGAATAAGTTACATTTGT
GTGACTCGAAAAAAGAGGTGAAAGCAACCTCATTTAAATTACCAGCACAG
AAAAATCTCTCATCTTGTACATCTTTATCAAGGTCGGCTGATGTGGCGAT
CTCCGGATCGTATAGATTATAACCACTTCCTTGTAAATCTACCAACAAAA
GCTTTTCATCACTTTCTTGATAAGAAAAATGCACAAGGGCTTCAGCTTTA
TCATAAAATGTCTCTTGACCACTTTTGCGCTTGCATGGAACTCCATTATT
GTTAATATATTTGATAAAGTCTCCTTCAACATAGGGCTCAACAGTGATTG
GCTCACCATTAAGAAGAGCAAATTGGATAGTTTGATACTGAAACCAATTT
TCCCTAAAGCCTGGCTTTTTCATACACTTTGCTGTTATTGCTTTTGCTGC
AGTGTGCATTTGTACCTGCTTTCTTGTGTGTTCTTCAAGGGTCATATTAT
ACCGTGGGCCGCATACGTTCCAAGCTGACTCTTTGAACTTTTTTATGACC
CAAATTTTTGTGGTTCCATTTTCAGTTGTGTATGCTTTGAAGGCATTTCT
AAAACCTCCCTCTGCAAATTTTTCTGTTTGCATGCGAAATTTGCTAGTTT
CAccttttagccaaattttatgTTTGATGTTGAATGACTCTAGTGTCAAA
GTTACCTCATTATCCAATGTTGGAGTAACTAATTTTCCTGCTTGTAAAAT
GCCTCCAATAGAAATTGATACTGGCATATCTTCTTGCAAATGTGGTTTCT
TTGGGACCAGAATCGATGAAACCCTTTTCCTCTTGCTTTTCACAGGAATA
TAATTGTTGCTATCTGTGCTATCATTCACTCTctttga Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000339_pilon:235637..241174+ >XLOC_004889 ID=XLOC_004889|Name=XLOC_004889|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2664bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000339_pilon:235637..241174+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGACAAAATCATGGGCTTATGGCTTTTACATCATCGTTGCAGTTCTAGT
TTTCTTGAACTATAGTCTTTTAAAACTGAGAGGAATCGCACTATCGCAGA
GGCAAAAGGAGATTACTTATCCACCGTTGTTGGATAAAAGACGTGGCTTG
AAAGAAGGTATCCAATCTTGTTGTAATGCTTTATTGTGTCCGATTGAAGG
TGAATGGCATATGAAAAACCGGACATCTATTAAGCAATTCAGTTATGTTG
AACATACAAATATGCaattacgcatgcgtaaagGTTGGCCTGCGCAGCTT
TATCATGGTGATTTAAGATGTGGGACCATGTATCCTTTACCAAGACTTGT
ACGAAAACAAAATACACAAATTTTCATGTCAGATATTATTTCCCAATGTA
ATAGTTATAGTCAAGCACCATGTTGTCGGAACGATATCGGATGGTGCGGT
GAAGGTGAATTTTTCTGCCGGTGTGAAACGTGCTTAAATTATCGAAACAT
AATTCAAACAGAGCTTTATGATTGGAAACATAAATTGAAATGTATTAAAC
CGAAATTAGTGAAAAAGGAAACATGTGATTTTTTAGCAAACCAATTCACA
TCAGTGACTTTTATTGGTGATTCTCTAGTCCGTCATGTTTTCTCATCGTT
ACTTATTCAACTGACCGAGGACCCTCAAACTGGCGCTTTGAAGCCGAATT
TACATCAAACAGAGAAGCAATATTGTAGCGACGAAAATCAGTTTGTTGAT
AGTGCTTGTCATTCTAAACTTTCAATCGATTGGCATGAAGTGAACGCACA
CCCTGAGTATTGTAACACGTCTATTTCTAAACCGAAAGTATTTTTTATAC
AGGCTTATGCTTCTCATTTGGGTGGAATGGCGTATGAGAAAGTTAACAAG
ATCCTATCCGAACAGCGACCTTTAATCTTGATTGGGATTGGCATACATGA
TAATTTTAACCACGATAAAGTTATTGACGAATATCTTGCCCCGCTGATAC
AACTTCGAAACGAGAGAATCGGATACAGTAATCCTGTCATTGTTTGGTTA
AATACACACGCAGCGGGGCTTTTAAAACCGATTGGCTACCAGAAAACTCA
AGGAAACGAAAGGATATTAAAATTCAATTCTGTCTTGTATGATTATTGCA
GAAGGAATTCTATTTTTGTTTTCGATACTTTCAATATGACAAAAGGTGTT
CATAGTTTTGATGGCACACATTATGGAAAAACGCTGAATCAGCTAAAAGT
TGAGATACTTTTGAATTCATTGAGAATGCTGAAGGATTGATGACAAAATC
ATGGGCTTATGGCTTTTACATCATCGTTGCAGTTCTAGTTTTCTTGAACT
ATAGTCTTTTAAAACTGAGAGGAATCGCACTATCGCAGAGGCAAAAGGAG
ATTACTTATCCACCGTTGTTGGATAAAAGACGTGGCTTGAAAGAAGGTAT
CCAATCTTGTTGTAATGCTTTATTGTGTCCGATTGAAGGTGAATGGCATA
TGAAAAACCGGACATCTATTAAGCAATTCAGTTATGTTGAACATACAAAT
ATGCaattacgcatgcgtaaagGTTGGCCTGCGCAGCTTTATCATGGTGA
TTTAAGATGTGGGACCATGTATCCTTTACCAAGACTTGTACGAAAACAAA
ATACACAAATTTTCATGTCAGATATTATTTCCCAATGTAATAGTTATAGT
CAAGCACCATGTTGTCGGAACGATATCGGATGGTGCGGTGAAGGTGAATT
TTTCTGCCGGTGTGAAACGTGCTTAAATTATCGAAACATAATTCAAACAG
AGCTTTATGATTGGAAACATAAATTGAAATGTATTAAACCGAAATTAGTG
AAAAAGGAAACATGTGATTTTTTAGCAAACCAATTCACATCAGTGACTTT
TATTGGTGATTCTCTAGTCCGTCATGTTTTCTCATCGTTACTTATTCAAC
TGACCGAGGACCCTCAAACTGGCGCTTTGAAGCCGAATTTACATCAAACA
GAGAAGCAATATTGTAGCGACGAAAATCAGTTTGTTGATAGTGCTTGTCA
TTCTAAACTTTCAATCGATTGGCATGAAGTGAACGCACACCCTGAGTATT
GTAACACGTCTATTTCTAAACCGAAAGTATTTTTTATACAGGCTTATGCT
TCTCATTTGGGTGGAATGGCGTATGAGAAAGTTAACAAGATCCTATCCGA
ACAGCGACCTTTAATCTTGATTGGGATTGGCATACATGATAATTTTAACC
ACGATAAAGTTATTGACGAATATCTTGCCCCGCTGATACAACTTCGAAAC
GAGAGAATCGGATACAGTAATCCTGTCATTGTTTGGTTAAATACACACGC
AGCGGGGCTTTTAAAACCGATTGGCTACCAGAAAACTCAAGGAAACGAAA
GGATATTAAAATTCAATTCTGTCTTGTATGATTATTGCAGAAGGAATTCT
ATTTTTGTTTTCGATACTTTCAATATGACAAAAGGTGTTCATAGTTTTGA
TGGCACACATTATGGAAAAACGCTGAATCAGCTAAAAGTTGAGATACTTT
TGAATTCATTGAGAATGCTGAAGGATTGGAATATAATTGTTGCTATCTGT
GCTATCATTCACTCTctttgaGAATATAATTGTTGCTATCTGTGCTATCA
TTCACTCTctttga
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000339_pilon | genome | sc0000339_pilon:235637..241174 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1291-1332:5497 |
| Aaloc | 1-1287:1 |
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