XLOC_004372 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_004372
Unique NameXLOC_004372
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000234_pilon:508435..520746-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_004372 ID=XLOC_004372|Name=XLOC_004372|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12312bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000234_pilon:508435..520746- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TTGTATTACAGGCAATATTGAACTGAAATATCAAACGACTCTATCTCAAT TGCTTAAAGACTCAGATATGGTATGAAACCAGTATTAATTTTCATTTTTT GGTCTCAAAATTAATTTTTTGACTCTTTATTTAACTTTTAATGGTCATTA CACTTTCTGCCCCTTTCTGGGTTAAATCAAGAGTCAAAATGCCAAGTCGT TGTCACAGCATGACGTCAGGGTTTTGGGTGAAAAAAGATCACTACTTGTT AAAACTCACTGAATGTTCTATTGAGAAGCCATATTTTTCCCTTTGTTTTG AATTGAGTGAATCTTGTAATAATAATCATAAAAAAGTTATTCTTTTTTTT CTCTCTGGAAAACCATGGTCTGCTACTAAAAGCAGTAAAATAGACATCAA AGACCGTTCTTTTTCTTTGTTTCCAATAGGCAAATTGGCATAATCTAACG CATATCATGAATTGGGGCTATTATTGCACTAATGATCCATGTCAGTTAAC CTTAATGTTCTGATTTGTTTTATTATTATCAGCATAAAGAGGTTCGTGAG GCGATTTGTAACATGGAATCAGTCAAAATGGCTGATGGCTCAAGTCAACA ATACGGTTATGTTGTGTATGAGACGGTGGTTACTAAGGGCGCTAAACTCC ATATCAAAAATGCTCGTGATTTTGTATTCGTAAGTGCCATTTTATTTGGA CCTTTTTCTATTTTCTAATGTTTAGATATTGTATTACCTCGAATAATCGC CCCTCCCTCCTCGAATAAACACCCCTCCTAAAAATAAAAAAAGATAATAA AACGCCCGGGGCGTTTATTCGAAGTAATACGTATACAGTATTGACGGTTT CTGGGAAAAATTGCACGTTTTCGCCTTATAAAAGACTTCTTTTTTTCCCG AATCTGTTTTTTAGAAGTCTGTTTTTGCTTGAAAACTTGTAAACTATTGA 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TTTACAGTTGGCTCAATAGAACTTGCAAAGCACGTGGGCTTGTAGGGCGC TTAATTTAATAGGCTTGGAAAAATATCACGGAAAATCCAATAAAGATATT GAGATTCTGTTTAAAATTCTTTAACATAGTTGTCGGTTTTGTATTTTTCA TTAAGATTTTTCGTTAAAATCTATGCTGAAAATGAGTAAAATTTTCAAAA TTTGATGACGTCGTAAATGATGACGTCGTAAATGATGACGTCATTCATTT CAAAATTTTTTGTAATTTCTTTTGATTCACATTGTTAATACCTATCACCT GTCAAAATTTGAATATGATTGGATCAACATTTCAGAAGTTATCGCAATTT TAAAATTTTGAGTTTTAAGCGATTTTAGCTTGGTTTTATGTCATGTTTCA CAATAAAGTCATAAAACCTGATTTTGAAGACCTATGACCCTAAGAATTTG CACAAGTACTCTTAATAAGATTTTATAAAAAGTCAGAAAGTTTCAGATCG TTTCTAAAATTTTTCTCCGTGATATACACAATAGAACACCAGCGTGGTAG ATTCTACCCCCCCCCCCGACTGAGGTTAAAAGGGTTAAGAAAAGTAAAAC AAAGAAGTTTGATTTAGACAACTATTATTTGACCGGGAAACTCTGAAGTA ATATGTGTTATAGAATATGTTAATATATTATATTTAAGAAAATAAATTCT TAAGGATTAAACAATGCCTTGGAGTGGATATACGTGGCATACGTCATCTT ACCAGTGCGACAAAAGTGAGACAAAAATGACATCGAGATGAAATTTTGCA CAGACGCCCAGGAACATGTTAGAAAATTATCATCCGAAAATCCTGGCGAA CTTAGTACTTTTTCTATGACTTATTTAAGGGGTAAGACTTTTTGAAGACC TGGTCAAGGGTGATAATGAATACACGAATTGCAAAATTAAAATATGAAGC CAAATCAGGCTTTTAGTCGAACATAAACCTTAATAAAACATAACCTTTAA TACTGATTGGTTGAAATTTATCGACAATGATAAAGTTATTAACTGTAAGT TTTACAACAGGTAACATTGGAGTAAAATCACGTGAACTTTTTCGAGTAAT CACATTTTTTGACTACACTGCTATAATTTTGCAACCCGTGTATTGTAGAA AATGGGTAGGTACCGAGTTCAGGGTGTGTGCCCTTATTTCCTAAAAGTGA GGACACCTCATTGTGCCTCTGAACCAAATTTCATCTCAACAACATTTTTG TTTCGCAATGTGCAATTCTACTTGATTCCAAAACATTTCATTATTTTCCC ATGAAAATGATTTGGCAGTCAGTTTTTAATTCAAATGAATGTTTATAACG CTTCTTCGATACACTGATAAACAGGAATCATAACAGTAAAGGGAAAGCAC CAATCCTTGTTTAAGCATAATTCTTTTTGTTGGTTTTCGTAACGTATGAC TTTGCAATTTCTGATGCTGGTCAACATAGTATTACGATTGGTAGCAATAG CATTTACTTTTACAATAGTATTTTCAACTTCGTCCGCCATTGGGATTGCA GTTGTTGATAGCTTTGTTTCTTCATGCCTTGCTCTCTCTGTTTTCAACGT TAAACCACTTTTGATCACAGGGCTCGACATTACCATTGTTACAATGAGTA CGAAAAACACAAGTAGAAATCTCATTTGAGATCTGAAGACGAAATTGTAT TTCATTTTTTTTGCTAGAACAATGAAGACATTCTATAAAATTTCTGTCAA TACATTCCTTAACCAGGTTTCTTTGTGATGAATTACAAACCCTTTGTTTT AATTGTTATTTATAAGGAATTGACGTTATCAAGTCAAATATCTGAAGAAT TTTATAGGCAATGAATAAAACATTGAAAAACTAATGACAACCTAATTTAT GTGGAATGCATTACCCTTTTTTATAGGGAACACGTTTATAAGAAACTTGA GGCTGAAAATGTTCTGAAAAATAGGGAATTACTAAGGAACTGTTCGGGCT GAGAATAAGAAACAAGTTAAGAAACATTAAGTTTCAAACTTGAACTCGCA CACATTTACAAAAACCTAAAAAAAAAGTTTTAAAAATATTCATGAAACAA CGTTCAATAAACGTTATTTTCAGTATTTTAGTCAGTTGTTTAACAAAGCA TCAAATCAGTCCAAGCCTAGCAGCTAAGTGAATAAGGAACTCGATTAGGA ACTTTGAAGTTGAAATTATCTGGAAAAATAAGGAGCTCCAGGCTCGGAGC CAAGTTCAGGTTCCTTTAAAAAAAAAAGACGTGTATGTATCTGACATGAG AAAAGTGTTTAGTGGGAGCGCTTATGACAAGGCTTCTAGCGCAACTAACC AATGGGAAATACCGTCAACTGCTCTAACTTGGGACAAAACATGGGACGGC AATTCGGCCACCATTTCACCGAACTTCCAAAGTCATTTGATTTCACTTAA TAAACGGCGTGTTAAAAAATACACGATTTCTCTTTCGCATCGAGTAGAAA ATAGAAAAAAAATATAAAAAAATCCTTAGTGGAACAATCGCGAATGTCTG GAACGAAGAAGACCAAATTAGTGGCAAAACGATGGAGCGTTTGACGTCAC TCGGGCGGCAAGTTACACACTCATTATTTGTTAATCCCATTCGGCGATAG GCGGTTAGGCGGCGGGTGTTCTCTAATTCTCCAGTCTGGAAATTAAATAG GCCTGAAATAGGCCTTTTCATTAATTATTTTGCTTGCACGACTGCCTTGT TTTGAAATCATTACCAAGATGATCAAATCTCTTGTTTATTCAAGTGTTAC TTTTTAAATAGAGTGAACTTATTTTGAATCGCCGTGAACTTCTCTGGGAA TCAATTAACAACGAGGTAACCGTTTTCCATGACGTAATTTATGAAAAGGT CTATTTAGAGGGAAGATGAAAATATCGTCCATTACTTTCGAGATATTATT TTCGCAACATTTTGCTTTAACACTATCTCCCCCGATGTAACAAGGAAAAA AGTATTGCAAAAATTATCATAATGAGCTTACCCACTGCACTGTAGGCATC CCCTCTGATATGTTTTGATATAGATGATGCGTATCGTGTATACAATTCCT GTCTGACAGTTACTGCTTCATTTTTCTTAAAAAGGCTCAGAAATCCAATG ATTGTATTAACCCCTAGTCATTCAAATTTTCAATTCAAATTTAATGAAAT TTAAAGATTTCTCATATAATAAAACTTACTAATCAAGCTAATCAAGTTTC TAAAAGTCAAAAATATAAAGATGGGGTAACTCTCAGACGGGAATTTTTTA CACGATACGCATTCCCTATATCAAAACATTTCAGAGGAGATACGCGCAGC CTAGTCATACTTCTCACTTCATCGGAATCTAAAAGTGAAATAAGATATGT GTCCCACAAAAACAAATACACGACCTCATTTTGATATTAGCAAATCTGAA TATTTAGCACAGCAATTTCCACCTGATGTTTTGGAACATTGAATTTCCCT GTGAAACCAATTTTTAACTGATTAACGTGAGAGAAGGTTTGTTGCCAATT AACCCTTGCCAATTCGAATTCGAACGAAGTCCAATTTCTTCTAATTACAA AGAGATTCAGAGCAATGGGCTTTTCCAGAAAAAAAACCGTGCACCCCCTG TTGAGGAGTCCATTTCCATTCCAAGGGGGTATGGTTTGAAATGCAGTGGA ATTCCATAGTAGTAGACAAAAATCCGTCAAAAATAAGTGGAATTCCATGG AGGTAATGAATGAAAATCTGTAAAAATTCGGAATTCTAGAGGGGTGTGAT CCTAAAATTGCCTGGAATTCCAAAAGGGTAGTTTACAAAAGATTGGAGCT CCTCAACAGGGGGTGTACGGTTTTTTCTGGAAAAGCCCAATATATATCAC TTTTTGATTTTCTTGATATCTTGGATGCTATCAGAATCATTAAAAAGTGT ACTTAGGCACTTGGTAACAAGCTTGAGTAAATGGAGGACAAGAATCTAAG GATATCTTCTCGCTTTCTTTCTGATTATAAAAAAAGATTTCCCTTTGATG GGGACTGGGAATTAGTTCAAGTTATAGAAAGGCTCCAATAAAAGAACTTT ATATCGGATAAAACCAGTCCGAATTAGTGATAGTCTACTGTAATAGCTCA CCCGGATCCTTTGTTAAGATTCAGTTTAAGGTAACGCTTGAGTTATGGGG CAAGCTTCTTTCGTTCAAAAAAAAAGTAATGTCGAAAGTCTTTTAATCAA CAACTGTTTGGACTAGTCGCTTTTGATTTACTCGGAAGCTGAGATATAGT ACTATGTAATCACTTAGATATTTAAAGTGATTTAAATGGCGTTAATTTCG GAATATTGCTTTTCTTCTTTACACGAAAATAAAGCTGGACTTTCCCAAGA TGATAATCATCATCATAATCATATTTTCAAATCACAAAAAAATATGTTAA ATGCTGCAACCTACGCCGCGCCCACACACTTAAAAAATTATACAAAACTC AAAAGAGTCCTCTCTCCTATATCTGTTGCTTCAACCAAAAGGTGTTATCT GATAACCAATCCTGTTTGGTGAAAAAAATTAATAATCTTTTTTATAATAT TTTCTTTTTTCGACCTACCTGGAGGTCCTATAAATTAAACGTTGTTCGTT CGTTCGTTCGTTCATTTTTGCACAATGATTCAAAATGGCAATTACCCAAA ATGTGACGGAAAAAGATTTTCGAAAAATAACTTCCCTACTTGAGCTCTAA CTTTAATCATCAGGTAGGTCCAATCAGCATTCCGACTTGTTTACTTCATT CTCTTAATATTTTTTTGCTTCGTAGGAATTCTTGGTGGAGTGACATTAGA TAATAGTGACGCGACTGGATGGACCATATACCCTTTACAATTTGACGAAG ATCTTGTTTCAAAGTGAGAATTTTTTCGAGTTGCTTACGTAGAAATCTTA TTAAAGTTTGTGGAAAAATAAAGAGACATAACGTGTACAAATTCTCAGTA CGGGGGATCAAATTTCTTTTTACATGGGACCAAAATTCGGGGGGGGTCAA CCCCTGAAGAAGATTTAAAGATGTTACATCCTCCACCTCTATGTAATATC TTTATGGAAGAGTTAGCTATTTGTTTTTTAACAAACCAACATTTCTTTTT TTTAGGCTTGAGAATAATCCAACACTATGGGAGCCATCGGATGGTGAAAA GGAGAACTCACAACCTACACTTTATAAAGGTTTCCTAAACATTGATGGTC CTCCGAAAGATACATACTTTAAAACGAGGGTAAGTTGTTTACCAATGAAT CTCCACAAATGAACCCGAGTTTAGTGTCAAATGCTTGATGATTTATCATA TTAAGTAACAAAAAGTTATCAAATGGTACAAAGAATGTCAGCTCAATTTC ATTTGAAAATTTATTTCAATTTTGTCAAACAGCTCTCTAAATCATTTATC ATGTATAAGAGAGAATTTAAGTTGACATTTTCTCTCTTTTTTACCAGGGT TGGTTCAAGGGTGTTATTTTCGTTAACGGTAAAAATCTTGGTCGTTATTG GAAACGTGGTCCTCAATTTACACTTTACGTTCCAAAACAGTGGTTGAAGA GTGGGATTAATACTGTTCTGGTCTTTGATTTGCACGGTGAGCAGTCCCAT CACTGTGACGGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000234_pilon:508435..520746-

>XLOC_004372 ID=XLOC_004372|Name=XLOC_004372|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3888bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000234_pilon:508435..520746- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AACAGAATAGTAATAACAATAAAATCTAATCAAATAACAAAAATGTTACA
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GTCTTGGAAGGTAAACCATTTCAGATTCTCTGTGGTGCAATACATTATTT
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CTGGAATCTACATGAACCCCAGCCTGGGAAATTCTCAACAACATATGCAA
AGCAATTAAGAATGTTTATGGACCTGCTCAAATCTAATGACATGTATGCA
GTAATGAGACCTGGACCTTACATTTGCTCAGAATGGGATCTTGGTGGTCT
TCCAAGAATGTTTATGGACCTGCTCAAATCTAATGACATGTATGCAGTAA
TGAGACCTGGACCTTACATTTGCTCAGAATGGGATCTTGGTGGTCTTCCA
AGCTGGCTGTTATCTGATGATAGTATGAAGATAAGGTCATTATATTCTGG
TTTTACAACAGCTGTTACTCGCTATTTCAATCATTTGCTCCCTATACTAG
AGCCATATCAGCTGGCTGTTATCTGATGATAGTATGAAGATAAGGTCATT
ATATTCTGGTTTTACAACAGCTGTTACTCGCTATTTCAATCATTTGCTCC
CTATACTAGAGCCATATCAGCATTCAAAGGGAGGTCCAATCATAGCTTTC
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AAAATGAGTATGGCTCATTTGGCACAGATGGGAAGTATATGGATTTCATT
CAAAACGAATTCAGACGACATGGACTTCATGAACTGCATTTCATTTGTGA
TAATATGGAGGGAATTGGGAATTACGAAATGAAAGAGCAAGGAATTCAGA
CGACATGGACTTCATGAACTGCATTTCATTTGTGATAATATGGAGGGAAT
TGGGAATTACGAAATGAAAGAGCAAGTTTTCCAGACAATCAACTTTATGA
CAAAAGCAGAAGAAGCTGTTGGAAAACTGTTGGAAATACAGTTTTCCAGA
CAATCAACTTTATGACAAAAGCAGAAGAAGCTGTTGGAAAACTGTTGGAA
ATACAGCCGAACAAACCAGTGTTTGTGACGGAATTTTGGGATGGTTGGTT
CACTCATTGGGGAGAGCAATACCATTATGTTGGTGCTGAAAGGTTAACAA
AAACATTGGATTACATGCTGAAACATGGATACTCTGTTAACTTCTATATG
TTTCATGCCGAACAAACCAGTGTTTGTGACGGAATTTTGGGATGGTTGGT
TCACTCATTGGGGAGAGCAATACCATTATGTTGGTGCTGAAAGGTTAACA
AAAACATTGGATTACATGCTGAAACATGGATACTCTGTTAACTTCTATAT
GTTTCATGGAGGGACGAATTTCGGATTTTATAACGGTGCAAATGCCAATG
ACGATGGATCTAATTACCAATGTGATATCACCAGTTATGGAGGGACGAAT
TTCGGATTTTATAACGGTGCAAATGCCAATGACGATGGATCTAATTACCA
ATGTGATATCACCAGTTATGATTACGATGCACCAGTATCTGAAGGAGGCG
ATTTAAACACCAAGAAATATAACCTCTTCAAGAAAACCATTCAACATTAT
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CAAGAAATATAACCTCTTCAAGAAAACCATTCAACATTATACCACGAAAG
AACCTGAGAAACAGTCCTTTGATGAGAATTATAAACATAATTATGAACCT
GAGAAACAGTCCTTTGATGAGAATTATAAACATAATTATGGCAATATTGA
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CAATATTGAACTGAAATATCAAACGACTCTATCTCAATTGCTTAAAGACT
CAGATATGCATAAAGAGGTTCGTGAGGCGATTTGTAACATGGAATCAGTC
AAAATGGCTGATGGCTCAAGTCAACAATACGGTTATGTTGTGTATGAGAC
GGTGGTTACTAAGGGCGCTAAACTCCATATCAAAAATGCTCGTGATTTTG
TATTCCATAAAGAGGTTCGTGAGGCGATTTGTAACATGGAATCAGTCAAA
ATGGCTGATGGCTCAAGTCAACAATACGGTTATGTTGTGTATGAGACGGT
GGTTACTAAGGGCGCTAAACTCCATATCAAAAATGCTCGTGATTTTGTAT
TCGTTTTGATTAACGATCGATTGGTCGAAACGGTGTTGAATATTCAGAAA
GCAATTACCGTCAACGTTGAAGGTTATATACGGGTTTTGATTAACGATCG
ATTGGTCGAAACGGTGTTGAATATTCAGAAAGCAATTACCGTCAACGTTG
AAGGTTATATACGGACTGGGTCAGCAAACAACATCAAGATTCTAGTGGAA
AATGCAGGACGTGTTAATTATGGAAAAGATATTGGAAATCAACGAAAAGA
CTGGGTCAGCAAACAACATCAAGATTCTAGTGGAAAATGCAGGACGTGTT
AATTATGGAAAAGATATTGGAAATCAACGAAAAGGAATTCTTGGTGGAGT
GACATTAGATAATAGTGACGCGACTGGATGGACCATATACCCTTTACAAT
TTGACGAAGATCTTGTTTCAAAGAATTCTTGGTGGAGTGACATTAGATAA
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TTGTTTCAAAGCTTGAGAATAATCCAACACTATGGGAGCCATCGGATGGT
GAAAAGGAGAACTCACAACCTACACTTTATAAAGGTTTCCTAAACATTGA
TGGTCCTCCGAAAGATACATACTTTAAAACGAGGGCTTGAGAATAATCCA
ACACTATGGGAGCCATCGGATGGTGAAAAGGAGAACTCACAACCTACACT
TTATAAAGGTTTCCTAAACATTGATGGTCCTCCGAAAGATACATACTTTA
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GGTCGTTATTGGAAACGTGGTCCTCAATTTACACTTTACGTTCCAAAACA
GTGGTTGAAGAGTGGGATTAATACTGTTCTGGTCTTTGATTTGCACGGTG
AGCAGTCCCATCACTGTGACGGAGGTTGGTTCAAGGGTGTTATTTTCGTT
AACGGTAAAAATCTTGGTCGTTATTGGAAACGTGGTCCTCAATTTACACT
TTACGTTCCAAAACAGTGGTTGAAGAGTGGGATTAATACTGTTCTGGTCT
TTGATTTGCACGGTGAGCAGTCCCATCACTGTGACGGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_004372XLOC_004372-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000234_pilongenomesc0000234_pilon:508435..520746 -
Properties
Property NameValue
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