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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000300_pilon:268693..274311+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_003888 ID=XLOC_003888|Name=XLOC_003888|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5619bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000300_pilon:268693..274311+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aatATGGGCCGATCCAAAAGTTATTGGTTGTCACTCGTCGCTTTACAATT
GGTATTAATGACATTGCCAACTTGGGGCTATAGCTGTTCAAAGGAGACTG
TCACTGGCTCTTTTGGCTCTTTGTCTGGTGGAAACAAATATGGTTGCTCT
AAAAAGACTTATGATATTAACCTTGGTACTACAATGGCTGTCAAAATGAC
TTGGTTGACTTTTGATAATATCCCTGGAGATATGCCTTACTGTAGCGATG
GTTATATCAAAGTTTATGCTGGGTATGTTTTAGTCTTTTGTGAGAGAGGG
TGTACGTTTtacgatacacgttttttatgtaTTGCTGTCAAAAATCTATG
ATGGTGGTGTTTTGagcattttcttaaattttttggccattttcatcatg
ggtATTCTTATATAGAGTATATTCtttttaagcatatgctaaaaCTTGAC
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AATGACAAAACCCTTTAAATGGACTTCTGAAGCATCAAGACTTTTTGCTA
TTGAAGGCTTGGGAACAAGAGtttttttCGCAtttgtgcaatgcaacatg
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GTTCTACCAATAAAACTGAAATCTcaattttgtccctgggacaagatcag
cgtgtcttttgggtatttcccacactttttgtcccatgaaacaaaaaaag
gaaaCCATGGGAAACACACTTTCTTTCTTGTGTTGGttggatagagcatg
ttgcattgcaccaacgcgaaaaaaaacttctcgtgtctccaAGCCTTAAG
TATTGAAAGTTTCATTtataaataagagtgatatcgtttgtttACTCGTC
AATtctaatttacaagctttttcacattgaattcaCAAtgttgtggagca
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aacggcaacagtaatgtaaaaataaaaccttaaaaaaaaaactttgttgt
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taccattttgggaatctttggtatgacccggctgggggttgaacccacaa
ccttgcgcaccgtagccggatgctctaccactgcactacggtcgctactA
AGTATTcacgatattcatgacgtaGTCTTTCGTATGGAAGCTCTCAAAAT
AGCCCAGGCGTTTGACActatttttattgtttggattacacgtttttttt
ttgtcataagaacaaactatataagaacacaaggctcaatgaccaaaatg
ttaagaacactttGAGGCTTTCTGGACTCAAAAACAcactatttcttagg
aaaatggtaaaaaatgctcgcaaaatggtcaaaacaaaaacatgttgaga
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GGGATAACGGCTAACGGATAGTTTGCGACCTGAAATAACTTTGGATATTC
CCTGAAAATCGAGATCTCTTGGTCCCATTGCTGCTATTAGGACCTACGTA
AATGTCATATACAttatcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttc
gttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgt
tcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcattcgttcgttcgttc
gttcgtttgttcgttcgtttgcTACCAGACTTAGATTATTTCAGATTCAA
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CCTCATCAACCGGAGTCATGGCAACACCAAACTGGCCATCATCCTCTACA
TATCCTTCAACCTGCTCCTGGAAACTTGATCGTTCAGAATCTAACGGATA
TCTTATTCACGTTATGGACATTAAAGATCAAACTTATTCTTCTTATTGTT
CCTCTAATGAGCAACAAATAACGATCAAAGGTAAGTTTTTCATACAAAAC
TCTGTTAAGTGTGTTTGGGACATCGAGGCATTTAAAACCAAACCTATTCT
ATTCTTATTGTCCCTCTAGTAAGCAACTTATAACGATCAAAggtaagttt
tttgtttttcatagaAATCTTTGTTAAGTGTGTTTGGAACATCGAGGCAA
ATGTAAAATCAAACCTTTTCTTCGTTATTGTTCCTCTTATGAACCACAAA
TAACGACCAAAGGTTAACTTTCTATACAAAACTATGTTAAGTGTACTAAA
TAAGAGATTAAACTTACGCATTTTTATCGTTATGGCGACCAACGAATGAC
GATAAAATGTGAGCTAGTGAAATTGAGGTCCAGACCAAAATATACCAAAT
ATGGTAAAATGACAAAtctaatgaaataaaatttatttaaaatcagACCA
TCGAGTCTATCTTACCGCCATAAAATACGAGGACAGTTTAATAGTGGATA
CAattcaaacttctttttttttagacGAAGACAGTTATTCCTACGGGAAA
GACATTTGCACCCGGGATAACGGGATTACTAACTATTACAAACCTACTGT
CAAAATTACCTACAAACGCGGGACTGATTGGAATAAGCGAGGCGTTGTCG
TTGGATGGGTTGCTTTCAATAACCCTTATTACAGTAAGTAAAcccaaaca
aaaagattttaatattttcgttTGTATGTCCTATCTTAGCCTGTACCAAC
CCcagaccactgacctttatataccgtGGACCAAGTTtttcaatcccggc
caagcaaaattctttgatcggagttttttgaaaagtggtaccctaatggc
ggcactactcaatagcggtgtataTGCATcaagagcgctagatctacttt
ccctcgaaaacttttgatgatgtagcgccgttagatgttaatttttaaca
ctgcaatggcttctttacggataccaattcaaaaaaaacttcgatcaaag
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GCACATGGGCGATTTTCGCTTTTTGGTTGTCGTGTGTCGGTCTCTTACGg
ttagataatttttttttcgcgctAGTACCAGTCGAAAAACAGGTGCGTGG
GAGTGTTCTTTTGAAAGCCGCAAGAATTCATGGCACTGAGGTAATATCAC
TTTATTTAACGGGATTTGCTTGTTAAAAATAGAACACCACTCCACTGCAG
AAGAAACAAGAGACTGAGAATATATCTCAGTTACAGAATGGTGCCTAACC
GTTACAAACCGCACTTcgaagttgtttttttttacgaaaaagagGTTGGC
AGAGACTACTAATTTTATTTTAGATATGTGTCTAAAATAAAATTAGTATA
GTATAAAATGCCTAATATTGTAAAAGATTTATATTGAATTGTAAAATTTA
AGGTGCTTTCACGACCTGtctttttacacattttttataagaacgaacta
tataaggctttgatggcaaaaaatgttaagaacaggttaagaacattttg
atgCTTTGAGGACTCTCAAaacactttatttcttaggaaaatggacaaaa
aatactcccaaaacgagaaaaaaaaacatgttagtAACACTtttgggctt
gaaactcaaatgACACAATTAGAAATTTATGTTTGTTACCAGTTCAGTAC
CATGCTGAGCTGCCTAAAAGCTCAGTCGTTATTGTcagggttcgaaatac
cgttttcccgttaAAAACCTTTGCttaatcccggaatcccgaaaattgaa
aaaaaatgataacaccgtcacaccggtttatagaggttcaaataccggca
taatgacaaaaaataaggctaaataccgtcaccgtctaattttaaaatac
cgttttcccgtctattttttcgtcaaatcccataataccgtactaaaaaa
gagCCAATCCCATCACTTTTACGGAAGTACAAACCCCCATTCCCACTTAA
AATATTAGTCATTATTTTTATACTATTATTAAAGTTacgaacatcccaag
gcttcaaaaaaattttgatgttctttttttcattccAGCTAACTATGGAT
CTATCGGAGGGTATATTGCTGCCGGAATTCTTATTCCTTTGGTCCTTATT
TGTATCATCGTGTGTGTTTGCTTGAAACAGAAGCGAGGCTATGTGTTCAG
CCAAAGAGCCGCTTTTAATAACATGACACCACAAGGGAACAACATGACTG
TCGTCAACAACCAAACAGGTATTTCCATTGATTCTTTTTtataacaaata
aaataaaacttaatcCTAATAAGCTCATCTTCTTGATTTCGgcattcaaa
atacaaaaaagagaGAGATGGTGAAATTTCTGAATATTTCGACTTCTTTA
TCGAGTCATTGTCAACACTGTCAAAATAGTCGAAATATTCATAAATTCCC
tctcttttttgtattttgaatgtcGAAATCATTAATTCGGATTAAGTTTT
CTTTTGCTATGAAGTGCCCTGGAGTTAGCAAGTATTTACCTCGCCAAAAG
CCGTGATTTTTTCCATTCCGTTTTTTGGCGAGTTACACTTTTGCACATTA
ACCatattattcattttattttttgaatatcttttcctTAGCAACGAATA
CAACTTCTCTTAATGAGGGAGCGAAGAATTATCCCGCCCAACAATATGTT
CCACCACCCCAGCAAGGATATCCACCTCAACAACCAGCTTACCCACCACC
CCAACAAGGTGCTTACCCACCCCAAGGTTATGCCCCGCCACCTGGAGCTT
ATCCTCCACCAGGAGCATATCCACCGCCCATGCAAGGATATCCGCCCGTC
TCTCAACAAGGATATGCTCAACCACCCTCCTACCAAGAATCTGTACCAGC
TCAACCACCTGCTcaataa Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000300_pilon:268693..274311+ >XLOC_003888 ID=XLOC_003888|Name=XLOC_003888|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2568bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000300_pilon:268693..274311+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aatATGGGCCGATCCAAAAGTTATTGGTTGTCACTCGTCGCTTTACAATT
GGTATTAATGACATTGCCAACTTGGGGCTATAGCTGTTCAAAGGAGACTG
TCACTGGCTCTTTTGGCTCTTTGTCTGGTGGAAACAAATATGGTTGCTCT
AAAAAGACTTATGATATTAACCTTGGTACTACAATGGCTGTCAAAATGAC
TTGGTTGACTTTTGATAATATCCCTGGAGATATGCCTTACTGTAGCGATG
GTTATATCAAAGTTTATGCTGGaatATGGGCCGATCCAAAAGTTATTGGT
TGTCACTCGTCGCTTTACAATTGGTATTAATGACATTGCCAACTTGGGGC
TATAGCTGTTCAAAGGAGACTGTCACTGGCTCTTTTGGCTCTTTGTCTGG
TGGAAACAAATATGGTTGCTCTAAAAAGACTTATGATATTAACCTTGGTA
CTACAATGGCTGTCAAAATGACTTGGTTGACTTTTGATAATATCCCTGGA
GATATGCCTTACTGTAGCGATGGTTATATCAAAGTTTATGCTGGATGTGG
ACAATATTCATGGGACAGAACAGAGATCGCAGAATTTTGTTCAGGAAACA
TGATTTCATCTCTTCCTCACGACATTTATGCGTATACAAATTGTTTGAGA
TTGGAATTGAAAAGTCCTTACAGTTACTCACCGAAAGGGACATTCTCAGT
GACTTGGAGTCAATATTCGTATGGTTTAAGCTCATGCACGACAGGCTTAG
AATGTGGACAATATTCATGGGACAGAACAGAGATCGCAGAATTTTGTTCA
GGAAACATGATTTCATCTCTTCCTCACGACATTTATGCGTATACAAATTG
TTTGAGATTGGAATTGAAAAGTCCTTACAGTTACTCACCGAAAGGGACAT
TCTCAGTGACTTGGAGTCAATATTCGTATGGTTTAAGCTCATGCACGACA
GGCTTAGATACTAAAACCTCATCAACCGGAGTCATGGCAACACCAAACTG
GCCATCATCCTCTACATATCCTTCAACCTGCTCCTGGAAACTTGATCGTT
CAGAATCTAACGGATATCTTATTCACGTTATGGACATTAAAGATCAAACT
TATTCTTCTTATTGTTCCTCTAATGAGCAACAAATAACGATCAAAGTACT
AAAACCTCATCAACCGGAGTCATGGCAACACCAAACTGGCCATCATCCTC
TACATATCCTTCAACCTGCTCCTGGAAACTTGATCGTTCAGAATCTAACG
GATATCTTATTCACGTTATGGACATTAAAGATCAAACTTATTCTTCTTAT
TGTTCCTCTAATGAGCAACAAATAACGATCAAAGacGAAGACAGTTATTC
CTACGGGAAAGACATTTGCACCCGGGATAACGGGATTACTAACTATTACA
AACCTACTGTCAAAATTACCTACAAACGCGGGACTGATTGGAATAAGCGA
GGCGTTGTCGTTGGATGGGTTGCTTTCAATAACCCTTATTACAacGAAGA
CAGTTATTCCTACGGGAAAGACATTTGCACCCGGGATAACGGGATTACTA
ACTATTACAAACCTACTGTCAAAATTACCTACAAACGCGGGACTGATTGG
AATAAGCGAGGCGTTGTCGTTGGATGGGTTGCTTTCAATAACCCTTATTA
CACTAACTATGGATCTATCGGAGGGTATATTGCTGCCGGAATTCTTATTC
CTTTGGTCCTTATTTGTATCATCGTGTGTGTTTGCTTGAAACAGAAGCGA
GGCTATGTGTTCAGCCAAAGAGCCGCTTTTAATAACATGACACCACAAGG
GAACAACATGACTGTCGTCAACAACCAAACAGCTAACTATGGATCTATCG
GAGGGTATATTGCTGCCGGAATTCTTATTCCTTTGGTCCTTATTTGTATC
ATCGTGTGTGTTTGCTTGAAACAGAAGCGAGGCTATGTGTTCAGCCAAAG
AGCCGCTTTTAATAACATGACACCACAAGGGAACAACATGACTGTCGTCA
ACAACCAAACAGCAACGAATACAACTTCTCTTAATGAGGGAGCGAAGAAT
TATCCCGCCCAACAATATGTTCCACCACCCCAGCAAGGATATCCACCTCA
ACAACCAGCTTACCCACCACCCCAACAAGGTGCTTACCCACCCCAAGGTT
ATGCCCCGCCACCTGGAGCTTATCCTCCACCAGGAGCATATCCACCGCCC
ATGCAAGGATATCCGCCCGTCTCTCAACAAGGATATGCTCAACCACCCTC
CTACCAAGAATCTGTACCAGCTCAACCACCTGCTcaataaCAACGAATAC
AACTTCTCTTAATGAGGGAGCGAAGAATTATCCCGCCCAACAATATGTTC
CACCACCCCAGCAAGGATATCCACCTCAACAACCAGCTTACCCACCACCC
CAACAAGGTGCTTACCCACCCCAAGGTTATGCCCCGCCACCTGGAGCTTA
TCCTCCACCAGGAGCATATCCACCGCCCATGCAAGGATATCCGCCCGTCT
CTCAACAAGGATATGCTCAACCACCCTCCTACCAAGAATCTGTACCAGCT
CAACCACCTGCTcaataa
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000300_pilon | genome | sc0000300_pilon:268693..274311 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1012-1287:5344 |
| Aaloc | 832-1008:4791 |
| Aaloc | 673-828:3227 |
| Aaloc | 484-669:2544 |
| Aaloc | 277-480:1277 |
| Aaloc | 4-273:1 |
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