XLOC_003721 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_003721
Unique NameXLOC_003721
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000412_pilon:65221..74853-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_003721 ID=XLOC_003721|Name=XLOC_003721|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9633bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000412_pilon:65221..74853- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAATTGAGCTATCATAATAGTTGTTTGGATGAACAAGACATTGTACT TTTAAATGATGGATGTTGGTTAAATGATAAAGTTATTGGCTTCATGTTCG AGTAAGCATTTATTTCAACTAAACTTATTGTAAGACTTAAGAATATCTTT TGAGAACTTTTTTTTGCGAAAACTAATTTTTTCGAGGACGCATAATTATA AAGAAAATTAATTTGTTAAATTTATTCTGGCGAGTAACGTAATCCTTTTA TTTCGACGTGTAGTACTTTTTTACTTCAATTTTCGCGAATAGCATAATAA AATCAGTTTCTTTTTCAAAATGAATGTTTTGGGGAAAATTGAGTGTCAAT TTCGCAAAAAACATAAAAAGTTAATTTGGTGGGAACTGATTTTGGCAAAT TTTGACAAAACAGTCCCCCTAAATTCTGCGGCTGTGTACTTAGTAATTTA ACAAAGAAAATCCTGAATAATTATAACTGGTGAGGCTGGGTGAAGAGGCA AACCTTAGGTTACTTAAAACCTTGTATTTGACAAAGTCCGACAGAGATCC AAATATCAACAAAATTGGCAAAAAAGAACCAACTTCAAAGTGCTATTATA AGGGGGGGATAGGTGACAAAAGAGAGGTTTATTTGGGACCAAAGATGCAT TAAGGTTTGTTCCTACTTTAGTCATCACAGTACTTGTTGTTGTTTATACC AACATTTTATTTCTTTTAAAGATATTTCGAAAATGATGTTTTCAAAGAAT TGGAAGAAAGAGTTTCATTCGTATCACCTGAAGTATCACAATTTATCAAA TTGGTTTCAGGTACCTTACAATTGATTTTTGATATACGTTTTTACTGAAC TTTATTTCAAGATCAAAATTTGTGTTTATTAATGATGATCCGATGCTGAT TTTCCGAGGATTGTCCAGTTGCTTATTATTCTGAAGCTAACTAACTATTT TAAAGGAAAAATAACTTAGCGGGGTTTACTCGAAATCTGCAAAATTAAGT CCTCGCCAGTTTAAAAAAAAATCTAGCCATCCACCATATTGAATTCCCTT TGAAAAAAACTTTTTCGGTCATCCGGCCATTTAAATTCCCGCTTAAATTT TTTTCCTTTTAATCATTCCGGTTATATTTTACCTGAAAGAATAGTCCTTA GCTTATTTTTAATATTTTGAGATTTAGTTTATTTTTGATTTTATTTTCCA ATTGATTCATAGATCCGCAAGAAGTATCCATATTTTTGGATCCATTAGAT TTGAGAAACAAGGAATATATTTTCATGGCAGTCAATGATAATGAAGAAAA TAGCTGTGGTGGTTCTCATTGGTACGTGTTGCATATGTGTTCACCGTTAA TTGGTATTCATGATATGCACCATTGCAATGTCTTCCACGCACCCGACAGC TGATTGGTTGAAAGTGACGTATTGGGCTGATTTTACGTCACTTATAACCA ATCAGCTATTAGGTCCGTGATGTAATGCCAAAGACATCGCAATGGTGCAT ATTAGCGAGTTTATGTATGTGTGTTTTTCAGCGACGGAGACGGTAAGGTT CTAATTTGACTAGATCCTGACCAGCTGAGGACGACGGTAAATCAGCACTT TTACCGTCCTCGATTTTGCGGGGCGGAATTGCGGGTTTTTCCAAATCGCT TCAGTCACTCTACCGTCCTCAAAAGTGCAAATACATAAACTCGGTATTAT GAACAGTGTCGGTAACCTTCTCCTACCTACGTCATACTTTACTGATAGGA ACAATGAAATGAGACGCAAGTAGATAGGAAAAATCTTTCTATTCCATTAG TTTATCCGGCAAATTCTTTTATTAGCTCTAAAGAAGTGACACAGGGCTAG ACTAGTAAACTAGTCGGTTATTACTTATAATAAAACTGTCAATCAAATAA TGTAAGCACTAATTAAATATTCAGCGCGCGTGAGAGAAAAGGAAAATAAC CGATTAGAATCTACTTCCAACGCCTTTTTTTCTTCACCTAAAATCGTAAG GAGAGACGTACAGATTTCTGTATGTCTGACCCGTGCGGGATTTCATTTAT TTTTCTTTCTGTTTATTGTGTTTTTGGAAATACTTATTTATTTATACGTT CCCAAGTTTAATGTCGAGACTCGGAAAACACGAGTTAAAAAACACGAGTT AAAAAACACGAGTTGCAAAAAACACGAGTTAAAAAACACGAGTTAAAAAA CACGAGTTGCAAAAAACACGAGTTACGTTAAATGTGACGTCATCAATGGG AAATTATGACGTCACAAGTAGATAATTTAACTCGTCAATTTATGGTGCAC CTTAAACTGACGAGTTAATTAACTCGTCAATTTATGGTGCACCATAATCT TACGAGTTAATTAACTCGTCAATTTATGGTACACCTTAATCTTACGAGTT AATTAACCCCGGGGGGGGGTACTACCCTTGTCGACCGACAGGGGTGCTCC GCTGAGGTTCGAAAAATGGACCCTACGTGGGACTCGAAATTTGCGAAAAA AGTGACCCTGAATGGGACTGAAATTCCAAAATGTTCTCAAATTTTCTACT TTTTCCCCAAATTTTCCAAAAATAGGCACCCTACGAGGGACTGATTTTTC TATTTTGGTGTTTTTACGACCCTGCCTGGGACTCGTGGAGGTTAAAAAAG GTACCCTGACCAGCGGAGCATCCCCGTAACCCATTTTGCCCTAGTACCCC CCGGGTAATTAACTCGTCAATTTATGGTGCACCTTAAACTGACGAGTTAA ATTTTCATGAAACCAAGTTGGTCAAAAATTCTAAAATGGCGGTTAAATTA TTTTTTGTGCCTATTTTTAGTTTAAAACTATTGGAATGGTAATTTTCTCT CATAATATTCTATAGTCTTTAACTGAGACAGAAGTTGACAAAAAGTATTT AGGCTGGCTCAAATGCTAAGGGGAAATGCAAAAAATAGAACTTTAACAAA GAGGTTACGATTCCTGAAAATATTCTTTTTTAGCAAAACATTTTAAAACT TTTTCGTACAATTATTTCTAAATTGTACTCGTAATGAACCTATTTTGACT ACTAATAATTTTCAATTCAATAATATATTGAATGTATGCCTATTTTAATC TGAATTTCAGAATTTTTGACCAACTTGGTTTCATGAAAATTTAACTCGTC AGAGTTAATTAACTCGTAAGATTAAGGTGCACCATAAATTGACGAGTTAA GGTTTTGAAGATGAAAATTGCCCGATAAAGGTAACAATCTGAGCCTTCGA TTTTCTGGAATTACATAGAAAATACTGATTGAAAAGTCCTCGCTTTACAA GAAGATCTAGCAAGTTCGAAGTGGAAAGGCATCTTTGCAAGAAACAATAA CCTCTATCATTTCACAGGAGTTTGCTGGTATACTACAGATTATCATCATC TTTCATACATTACGATTCTTGCGGTTCGTTTAACAATAAAGCAGCTCTTT CATTAGCTACCAAAGTTTACAGTTCCATTCAGAAAGGTATACCTAAACTT TGTTTTTTAATATTTTCATTGTTCAAATCTATTTAAGTCTATGTAGGTAG AATTTGCCTTACCAGATGGGCACATCATTTTGTCGACATATTATAACTAT TTAGAGTGTTGAATTTTGTGAATATAAAAGCTTTGGTACCACAAAGAATT CTTCATTAAGAGAGTTTTCACTTCAGAAGGCATAAAAACTAAATCGGGAG AAATTCAAGAAAAATCTCTAATCGTTTGAAAGCAAGTACACCCGTTCTTC TTGCATGTGGCTCCATCAGCTAAACAGAGACGGAAAAAAGTTTTGATAAG GTTCTGTAATTTTATGCTACCACGATAACATTTTATTCTAGACACCAGAG AAGAGTTAAATGTCATCCAAGGAAAATGTTCACGTCAAAACAATGGTAAA AAATGAGTTTTAATCCAGGGGGGGGGGTACCAAGTCAGTGTACTGGACCA TAGGGTACTAACTTGATTTTTGGATTTTTTTCCAAAAAATTAGACCACCA CCCTTTTTAGTACACTGTACTAACTTTTTTTCACGGTCGGGGCTTTGACA CCACCCTTTTAGTACACTGTACTAACTTTTTTTCACGGTCGGGGCTTTGA CACCACCCTTTTAGTACACTGTACTAACTTTCTTCCACAGCCGGAGCTTT GATACCACCCTTTTAATACACTGTACTGATGTTTTTCCACAACTAGATTT TTATTACCACCCTTTCAGTACACTGTACTGACTTCTCCATGACCGGATTT TTGATACCACCCTTTTAGTACACTGTGTTAGCTGTTTTTTCGATCAGATA AGTTTAGAAACCATCCCTTATAGTGCACTGTTCTAATTTCTTCTTGGCCA GATAAGTTTAATTGCCACCATATACAGAAGGTTTTGAAGCATTTTGCTAA GAAAAGCACCAAATTATATTAAAGGAAAGATTTGATTATTAAAATACTTG AATCCTTATATACAGTAGTACAAACACTGAAACAATGAAACAAACAAAGC AAAGTCAATCAAATACAATGAAATTAGCTGAAATTAGCACGTCAAAACAC TCAAAACCAACTTTGAGTTATTTCCCTTCTTGTGACTTGATTTCTGGTTG TCTGGCAAGCTGTAGCAGTTTTTCTTTTTTGAAAAATAAAAATAAAAGAC TTATTAACATTGTACACAAACTGAAATGGAAAATCAAATGTAATACTATA CAAAATATATAAAAAGGTGCTTTTCCTGGGGGGGGGGACTCCAGGTAAGT GACCTACCGAACGTGCGGCCCTTAAGGGTAGGTTTTTTGAACTTTGGAAA GTGCACTGTAAGGGTTGATTTGTGAGAAAGTGGGAAAAAGTGCACTGTAA AGGTGTAAAATTTTATAAAATACCAAATTTTGAGGTAAAAATTTGAGAAA TTTCAAAAGATTTTGCCCTGAAAAGGGCAAAAATTCGAAAAATTACACTG TAAGGGTCGATTTTCAGCCAAATTTTTCCTGCACTGTAAGGGACCGATTT TAGAGACCTGATTTTTGCCCGAACGTACGGTCGTTTTCACCCCCTCCCCC CAGTGATTTCACTTATATACAATTTTTTTTCAATGAACAATCCAACAAGG TTACTAAAAGACATAAAACAATAGAGCAGATTTGTTTTTATAAAACTTGA AAGCTTCGATTCGAACATTTACACATGTAGATAAGGCCTTAAAGAAAACG TAAACAAGATTGGACTTAAGGCCGGTCTCCACTTGCGCATGCTGCGACTC TGAAACAAATCCAATCAAGTAAACAGGAAACATTGGGAGAAAATCAGTGT ACCAATTTGTATAGCTTAACCAGCCTTGACTTGAAGGTCTCGGACCAGCT TGGACCTAGCAAATTAGGGCAAATATACATGGAAATTCACTGGGTTTGTG TTTTTACCACTGCAATTAGTACAATGTACTAACTTCTCAGTGTGTATCAA TTCAGAACACCACCCTTTTTAGTACAGTGTACTAACTTTTTCATTGTATT TTTCTCAGAGGACCACCCTTTTAGTACACTGTACTAACTTTTTCATTGTA TTTTTCTCAAAGGACCACCCTTTTAGTACACTGTACTAACTCAATTTAAC CTAAAAAATACACCACCCCACCAGCTATGGGCCAGTACACTGACTCGATA CCCCCCCCTGTTTAATCCCCAAAAGGATCAACTGAGGTTGGGGTTGCTTA TGCACGGTTACCTTCAATTTGGTTTCAAAAAACCAAGCAATAATAGGTCC TAGAAACATGAATATTGCAATTTACTTGCTCAAAGAATTGCAATTTTAAT TTGTTAAAAATCTCTCTCCTAAATATGTAAAAAATGTCGGTTCTTGATTT TTGATTTGAAATCTGGTTAGTCCGGGAGCCAAATCCTATATCTCCTTAAA TAAGCACTTTTGATTAACCCAAGATTCTACAGGATAAACTATACATTTTT GGAATCTTCAACTATCCTAGTTTAAGAAATGGTCGGTCCCCAACCCTAAT TCCTGGTCAATTTTTCATACTGGGCCCGAGTTTAGGGGGTACTTTTTACC CTTTGTAAGGATTTGTTAAGGAAAATATCTTTCCATGTATGATATAATTT GCTATATCTCATTAATGAATTGACCAATTGCTTTGAAACTTTGCAAACAG TTTCAAGATAGATTGGTGATCATCATTTGCAAAAGATTTTTGCGAAAAAT TATTTTTTGGGGTTTCCCTGGGGGAAAATAGGGAAAATTTGGGTATGTTC ACTGAATTTTGACACTTTTATAAGACTGGGACCTACCAAAACAACTTTTA ATGAGGCACAAACATTGTGTTATGATAAAATTTGATGCGATTCACCAGAA AAATTTCTTGTCAACTGCATTTAGTATCATTTTCGACGCTTAAGGGGGTA AAAATGCCCTTTTTTCACTGTTTATCTCGCCTAAAATATCTTCGAAAAAT AGTTTTAACTTAATCTTTGCGATTATACACTAGAAAATTACAATGCTGAC TTGAAACTTTCACATACAGGGTGCAGTTTGAGAAACCAGGGGGTAAAATT GCCAATTTTAGACAATTTTTATTGTTTTTATTGATTTTTGATCCCATTTG ACCCATATAACAGTGTTAAGCTGTGCAAAGTTTGATTTCTAACTGCTAAA CTTTAGTGACAACGCGAGGGCCAACCATGATTTGGCCCGAGGGGAAAATT TTGAAAATTTGAGCTCTAGATAGCTTGAAAATGCACTCAAAACATGCACT TATAAGACAATTTTGTAAAATTAAAAAAGAAAAACTTTGCATTTTGCAAA ATAACCATTTTTGAAAAAACTATTGGAGGCATAGCCCCCCTTGCTCACCC AGTTGCTACGGCACTGCAGATAATATATTAGATACCAAATTGTCAGTTTA ATTAATATAAGATGAGAAAGTGCCAACCTATGGTCTGGTAGGCTGCTTAC AATTTATCACCAAACATAGAATCTAGCCCCCAGGTCCATCTGAAAAAATT TAGATGACCCCTAACAGGGTTAGTCCCCCCTAGCCACAGGCTAAAATCAG GTACCAATTGCTGCTCGACCTTTTAGCCCGCCCCCCTCAGGGGGGGGGGT TCCAGCCATGGTAAGCAATAGTAGAGGAAAGCAATTTATGTGGTTTTCAT TATCCGTAATCAGGGATACAGGTGGTAAATCAGGGGTAAATAATATGTCA TTTCTAGTTCGCAGTCGCCTGAGTTTGGATGTTTTTCTTGAGAAGTTTCC TCAAAAACCTAAATTTTTAGGATGGAAACCAGCTCTAACAAACTTTAAAC TACCATTCTATCATTTCTTAGTCCTTTTGATGACAACTAAACAACAAAGA TTTCGATGCTTTTAACTGAAGTTATGGCTGCATAGTTATTGACTTAGTGT AACTTTGTTAGCTTTTGCTCTGAAATTTCATGTATTGCTTCTCAGAACCT CCCGAAATGACCCCTACTAGCAGTGTTTTAAGTACAATTATTATCTGGAG TCTGGTACTTGATAAATAATTGCTAGAAGGTGTAGAAATAAAAGTGATAT TTTGCAGGTTAGGGGGATACGGCCTGCCTGATGAATAAAGGCAAATCATC TTCGATGAAAGTAGATCTTGATATCCTCTATAAGGTCATGCTTTGAGGTG ACTTCTCTTTTTTTTCCGCCATTTTACTTTCCTTTTAACAGTAGCTTAAG CCTCAAAATAAGTTCTACTTAAAAACCGGCAGTAATGGGCGCCAGTAATG ACCGTTTCGAGAATTAAAAGCTGACAAAATCACGCTAAATCACTGTAACT ATGCAGCCATAACTTCATCAAAAGTACTAAGAAATGATGAAATGGTAATT TAAAGTTTGTTAGAGCTGGTTTCCATCCGAAAAATTTAGGTTTTTGAGGC AATTTCTCAAGAAAAACATCCAAACTCAGGCAACTGCGAACTAGAAATTT GCATATTTACCCCCTAATTTGCCATCTGTATCCCTGATGCCAGATAATGA AAACCACATAAATTGCTTTCCTCTATTGCCTACCAAAAATATCCACGTTT CCAGCAGTTAGAAATCAAACTTTGCACAGCTTAACACTGTTTTATGGGTC CAATGGGCCCAAGAATCAATAAAAATCGATAAAAATTCACTAAAATGGGC ATTTTTACCCCGTAGTTTGTCCAGTTGCACTCTGAATGTGATAGTTTCAA GTCAGAATTGTAATTTTCTAGAGTATATTACACTAAAATCAAATTAAAAC TATTTTTAAAAATATTTTAGGCGAGATAAACAGTGAAAATTGCTCAAATT ATGTAAAAATTCGATAAAATGGGCATTTTTACCCACTGAAGCGTCAAAAT GATACTAAATACAGTTGACAAGAAATTTTTCTGGTGTATCGCATAAAATT TTATCATAACACAATGTTTGTGCCTCATTAAAAGTTTTTTGGTAGGTCCC AGTCTTATAAAGTGTCAAAATTCAGCGAAAATACCCAAATTTTCCCTATT TTTCCCCAGGTAAACCCCTAGAAATAATTTCTCGCAAAATTCTTTGCAAA TGATGATCACCAATCTATCTTGAAACTGTTTGCAAAGTTTCAAAGCAATT GGTCAATTCATTAATGAGATATAGCAAATTATATCATACATGGAAAGATA TTTTCCTTAACAAATCCTTACAAAGGGTAAAAAGTACCCCCTAAACTCGG GCCCAGTTTGAAAAATTGACCAGGAATTAGGGTTGGGGACCGACCATTTC TTAAACTAGGATAGTTGAGGATTCCAAAAATGTATAGTTTATCCTGTAGA ATCTTGGGTTAAGCAAAATGCCATTTTTCAGGTTTGGCTCCTGGACTAGG TGGTGAGTTGAGTCAAGTCTCAACCAAATATTACATACAAATAATGCTCT GTTAGTGTTATTAGTTTTTATTGGAGTGTAGGGAGCATTGTTTATGAGGG TTTCTTGTTGACAGCGATTTTCAATATCATCGATAAATGAAGCATAACGT ATAGCAGAACGTCCAATTAGAGAGTGTCAACTGTATTTGCCATGACATAC ACCGCACATACATTTGTTCCTAAACCATAGGCAAGATAGCCTGTACCACC CCGCAACCACAGGCCTTTTTTAAATTTTGAAAAATTTGCCGTGTGTCGGT CTGCTACGGTTAGCGGGGTTCTGTGTCTCAGTTTGTCCCAGTTTTCGGGG ACGAAATCCGAGAAAACACAAGCGCAGGAGTGCTCTTTTTAGAAATGAAA GATACCATTTTGTTGACGCGTTAAAAGTAACGTCACTTTAGTTGAGCTAG ATTGAATGCTAAAAATAGCTACGCTCCACCGCAGAGATATTCAGAGATTT CTGGAGAAAAATATGAGACACGTAATGTTGCCTAACCGTAACAAACTGAA CTTCGTGTTATCTTTTGAAGAAGAGTTTGGTACAGACAAGGAGGTTTTTC GAATTTTTTTTTCCAGGTTACGATTGCGGGGTTTATGCAATTTCATTCGT GGAAGAATTATGTAATCTCATCAAAGAAACGGACAAAATAGAGATCGAGC AATTATTGGATATTCCAGTCAGTAGAATTCTCGAACAACGAAACCGCATG AAAGACATCATTCAATCATTGATGAAACAATGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000412_pilon:65221..74853-

>XLOC_003721 ID=XLOC_003721|Name=XLOC_003721|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1278bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000412_pilon:65221..74853- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAATTGAGCTATCATAATAGTTGTTTGGATGAACAAGACATTGTACT
TTTAAATGATGGATGTTGGTTAAATGATAAAGTTATTGGCTTCATGTTCG
AATGAAATTGAGCTATCATAATAGTTGTTTGGATGAACAAGACATTGTAC
TTTTAAATGATGGATGTTGGTTAAATGATAAAGTTATTGGCTTCATGTTC
GAATATTTCGAAAATGATGTTTTCAAAGAATTGGAAGAAAGAGTTTCATT
CGTATCACCTGAAGTATCACAATTTATCAAATTGGTTTCAGATATTTCGA
AAATGATGTTTTCAAAGAATTGGAAGAAAGAGTTTCATTCGTATCACCTG
AAGTATCACAATTTATCAAATTGGTTTCAGATCCGCAAGAAGTATCCATA
TTTTTGGATCCATTAGATTTGAGAAACAAGGAATATATTTTCATGGCAGT
CAATGATAATGAAGAAAATAGCTGTGGTGGTTCTCATTGATCCGCAAGAA
GTATCCATATTTTTGGATCCATTAGATTTGAGAAACAAGGAATATATTTT
CATGGCAGTCAATGATAATGAAGAAAATAGCTGTGGTGGTTCTCATTGGA
GTTTGCTGGTATACTACAGATTATCATCATCTTTCATACATTACGATTCT
TGCGGTTCGTTTAACAATAAAGCAGCTCTTTCATTAGCTACCAAAGTTTA
CAGTTCCATTCAGAAAGGAGTTTGCTGGTATACTACAGATTATCATCATC
TTTCATACATTACGATTCTTGCGGTTCGTTTAACAATAAAGCAGCTCTTT
CATTAGCTACCAAAGTTTACAGTTCCATTCAGAAAGACACCAGAGAAGAG
TTAAATGTCATCCAAGGAAAATGTTCACGTCAAAACAATGACACCAGAGA
AGAGTTAAATGTCATCCAAGGAAAATGTTCACGTCAAAACAATGGTTACG
ATTGCGGGGTTTATGCAATTTCATTCGTGGAAGAATTATGTAATCTCATC
AAAGAAACGGACAAAATAGAGATCGAGCAATTATTGGATATTCCAGTCAG
TAGAATTCTCGAACAACGAAACCGCATGAAAGACATCATTCAATCATTGA
TGAAACAATGAGTTACGATTGCGGGGTTTATGCAATTTCATTCGTGGAAG
AATTATGTAATCTCATCAAAGAAACGGACAAAATAGAGATCGAGCAATTA
TTGGATATTCCAGTCAGTAGAATTCTCGAACAACGAAACCGCATGAAAGA
CATCATTCAATCATTGATGAAACAATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_003721XLOC_003721-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000412_pilongenomesc0000412_pilon:65221..74853 -
Properties
Property NameValue
Aaloc475-639:166
Aaloc421-471:5791
Aaloc301-417:6266
Aaloc193-297:8420
Aaloc103-189:8912
Aaloc1-99:9634