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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000412_pilon:65221..74853- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_003721 ID=XLOC_003721|Name=XLOC_003721|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9633bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000412_pilon:65221..74853- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGAAATTGAGCTATCATAATAGTTGTTTGGATGAACAAGACATTGTACT
TTTAAATGATGGATGTTGGTTAAATGATAAAGTTATTGGCTTCATGTTCG
AGTAAGCATTTATTTCAACTAAACTTATTGTAAGACTTAAGAATATCTTT
TGAGAACTTTTTTTTGCGAAAACTAATTTTTTCGAGGACGCATAATTATA
AAGAAAATTAATTTGTTAAATTTATTCTGGCGAGTAACGTAATCCTTTTA
TTTCGACGTGTAGTACTTTTTTACTTCAATTTTCGCGAATAGCATAATAA
AATCAGTTTCTTTTTCAAAATGAATGTTTTGGGGAAAATTGAGTGTCAAT
TTCGCAAAAAACATAAAAAGTTAATTTGGTGGGAACTGATTTTGGCAAAT
TTTGACAAAACAGTCCCCCTAAATTCTGCGGCTGTGTACTTAGTAATTTA
ACAAAGAAAATCCTGAATAATTATAACTGGTGAGGCTGGGTGAAGAGGCA
AACCTTAGGTTACTTAAAACCTTGTATTTGACAAAGTCCGACAGAGATCC
AAATATCAACAAAATTGGCAAAAAAGAACCAACTTCAAAGTGCTATTATA
AGGGGGGGATAGGTGACAAAAGAGAGGTTTATTTGGGACCAAAGATGCAT
TAAGGTTTGTTCCTACTTTAGTCATCACAGTACTTGTTGTTGTTTATACC
AACATTTTATTTCTTTTAAAGATATTTCGAAAATGATGTTTTCAAAGAAT
TGGAAGAAAGAGTTTCATTCGTATCACCTGAAGTATCACAATTTATCAAA
TTGGTTTCAGGTACCTTACAATTGATTTTTGATATACGTTTTTACTGAAC
TTTATTTCAAGATCAAAATTTGTGTTTATTAATGATGATCCGATGCTGAT
TTTCCGAGGATTGTCCAGTTGCTTATTATTCTGAAGCTAACTAACTATTT
TAAAGGAAAAATAACTTAGCGGGGTTTACTCGAAATCTGCAAAATTAAGT
CCTCGCCAGTTTAAAAAAAAATCTAGCCATCCACCATATTGAATTCCCTT
TGAAAAAAACTTTTTCGGTCATCCGGCCATTTAAATTCCCGCTTAAATTT
TTTTCCTTTTAATCATTCCGGTTATATTTTACCTGAAAGAATAGTCCTTA
GCTTATTTTTAATATTTTGAGATTTAGTTTATTTTTGATTTTATTTTCCA
ATTGATTCATAGATCCGCAAGAAGTATCCATATTTTTGGATCCATTAGAT
TTGAGAAACAAGGAATATATTTTCATGGCAGTCAATGATAATGAAGAAAA
TAGCTGTGGTGGTTCTCATTGGTACGTGTTGCATATGTGTTCACCGTTAA
TTGGTATTCATGATATGCACCATTGCAATGTCTTCCACGCACCCGACAGC
TGATTGGTTGAAAGTGACGTATTGGGCTGATTTTACGTCACTTATAACCA
ATCAGCTATTAGGTCCGTGATGTAATGCCAAAGACATCGCAATGGTGCAT
ATTAGCGAGTTTATGTATGTGTGTTTTTCAGCGACGGAGACGGTAAGGTT
CTAATTTGACTAGATCCTGACCAGCTGAGGACGACGGTAAATCAGCACTT
TTACCGTCCTCGATTTTGCGGGGCGGAATTGCGGGTTTTTCCAAATCGCT
TCAGTCACTCTACCGTCCTCAAAAGTGCAAATACATAAACTCGGTATTAT
GAACAGTGTCGGTAACCTTCTCCTACCTACGTCATACTTTACTGATAGGA
ACAATGAAATGAGACGCAAGTAGATAGGAAAAATCTTTCTATTCCATTAG
TTTATCCGGCAAATTCTTTTATTAGCTCTAAAGAAGTGACACAGGGCTAG
ACTAGTAAACTAGTCGGTTATTACTTATAATAAAACTGTCAATCAAATAA
TGTAAGCACTAATTAAATATTCAGCGCGCGTGAGAGAAAAGGAAAATAAC
CGATTAGAATCTACTTCCAACGCCTTTTTTTCTTCACCTAAAATCGTAAG
GAGAGACGTACAGATTTCTGTATGTCTGACCCGTGCGGGATTTCATTTAT
TTTTCTTTCTGTTTATTGTGTTTTTGGAAATACTTATTTATTTATACGTT
CCCAAGTTTAATGTCGAGACTCGGAAAACACGAGTTAAAAAACACGAGTT
AAAAAACACGAGTTGCAAAAAACACGAGTTAAAAAACACGAGTTAAAAAA
CACGAGTTGCAAAAAACACGAGTTACGTTAAATGTGACGTCATCAATGGG
AAATTATGACGTCACAAGTAGATAATTTAACTCGTCAATTTATGGTGCAC
CTTAAACTGACGAGTTAATTAACTCGTCAATTTATGGTGCACCATAATCT
TACGAGTTAATTAACTCGTCAATTTATGGTACACCTTAATCTTACGAGTT
AATTAACCCCGGGGGGGGGTACTACCCTTGTCGACCGACAGGGGTGCTCC
GCTGAGGTTCGAAAAATGGACCCTACGTGGGACTCGAAATTTGCGAAAAA
AGTGACCCTGAATGGGACTGAAATTCCAAAATGTTCTCAAATTTTCTACT
TTTTCCCCAAATTTTCCAAAAATAGGCACCCTACGAGGGACTGATTTTTC
TATTTTGGTGTTTTTACGACCCTGCCTGGGACTCGTGGAGGTTAAAAAAG
GTACCCTGACCAGCGGAGCATCCCCGTAACCCATTTTGCCCTAGTACCCC
CCGGGTAATTAACTCGTCAATTTATGGTGCACCTTAAACTGACGAGTTAA
ATTTTCATGAAACCAAGTTGGTCAAAAATTCTAAAATGGCGGTTAAATTA
TTTTTTGTGCCTATTTTTAGTTTAAAACTATTGGAATGGTAATTTTCTCT
CATAATATTCTATAGTCTTTAACTGAGACAGAAGTTGACAAAAAGTATTT
AGGCTGGCTCAAATGCTAAGGGGAAATGCAAAAAATAGAACTTTAACAAA
GAGGTTACGATTCCTGAAAATATTCTTTTTTAGCAAAACATTTTAAAACT
TTTTCGTACAATTATTTCTAAATTGTACTCGTAATGAACCTATTTTGACT
ACTAATAATTTTCAATTCAATAATATATTGAATGTATGCCTATTTTAATC
TGAATTTCAGAATTTTTGACCAACTTGGTTTCATGAAAATTTAACTCGTC
AGAGTTAATTAACTCGTAAGATTAAGGTGCACCATAAATTGACGAGTTAA
GGTTTTGAAGATGAAAATTGCCCGATAAAGGTAACAATCTGAGCCTTCGA
TTTTCTGGAATTACATAGAAAATACTGATTGAAAAGTCCTCGCTTTACAA
GAAGATCTAGCAAGTTCGAAGTGGAAAGGCATCTTTGCAAGAAACAATAA
CCTCTATCATTTCACAGGAGTTTGCTGGTATACTACAGATTATCATCATC
TTTCATACATTACGATTCTTGCGGTTCGTTTAACAATAAAGCAGCTCTTT
CATTAGCTACCAAAGTTTACAGTTCCATTCAGAAAGGTATACCTAAACTT
TGTTTTTTAATATTTTCATTGTTCAAATCTATTTAAGTCTATGTAGGTAG
AATTTGCCTTACCAGATGGGCACATCATTTTGTCGACATATTATAACTAT
TTAGAGTGTTGAATTTTGTGAATATAAAAGCTTTGGTACCACAAAGAATT
CTTCATTAAGAGAGTTTTCACTTCAGAAGGCATAAAAACTAAATCGGGAG
AAATTCAAGAAAAATCTCTAATCGTTTGAAAGCAAGTACACCCGTTCTTC
TTGCATGTGGCTCCATCAGCTAAACAGAGACGGAAAAAAGTTTTGATAAG
GTTCTGTAATTTTATGCTACCACGATAACATTTTATTCTAGACACCAGAG
AAGAGTTAAATGTCATCCAAGGAAAATGTTCACGTCAAAACAATGGTAAA
AAATGAGTTTTAATCCAGGGGGGGGGGTACCAAGTCAGTGTACTGGACCA
TAGGGTACTAACTTGATTTTTGGATTTTTTTCCAAAAAATTAGACCACCA
CCCTTTTTAGTACACTGTACTAACTTTTTTTCACGGTCGGGGCTTTGACA
CCACCCTTTTAGTACACTGTACTAACTTTTTTTCACGGTCGGGGCTTTGA
CACCACCCTTTTAGTACACTGTACTAACTTTCTTCCACAGCCGGAGCTTT
GATACCACCCTTTTAATACACTGTACTGATGTTTTTCCACAACTAGATTT
TTATTACCACCCTTTCAGTACACTGTACTGACTTCTCCATGACCGGATTT
TTGATACCACCCTTTTAGTACACTGTGTTAGCTGTTTTTTCGATCAGATA
AGTTTAGAAACCATCCCTTATAGTGCACTGTTCTAATTTCTTCTTGGCCA
GATAAGTTTAATTGCCACCATATACAGAAGGTTTTGAAGCATTTTGCTAA
GAAAAGCACCAAATTATATTAAAGGAAAGATTTGATTATTAAAATACTTG
AATCCTTATATACAGTAGTACAAACACTGAAACAATGAAACAAACAAAGC
AAAGTCAATCAAATACAATGAAATTAGCTGAAATTAGCACGTCAAAACAC
TCAAAACCAACTTTGAGTTATTTCCCTTCTTGTGACTTGATTTCTGGTTG
TCTGGCAAGCTGTAGCAGTTTTTCTTTTTTGAAAAATAAAAATAAAAGAC
TTATTAACATTGTACACAAACTGAAATGGAAAATCAAATGTAATACTATA
CAAAATATATAAAAAGGTGCTTTTCCTGGGGGGGGGGACTCCAGGTAAGT
GACCTACCGAACGTGCGGCCCTTAAGGGTAGGTTTTTTGAACTTTGGAAA
GTGCACTGTAAGGGTTGATTTGTGAGAAAGTGGGAAAAAGTGCACTGTAA
AGGTGTAAAATTTTATAAAATACCAAATTTTGAGGTAAAAATTTGAGAAA
TTTCAAAAGATTTTGCCCTGAAAAGGGCAAAAATTCGAAAAATTACACTG
TAAGGGTCGATTTTCAGCCAAATTTTTCCTGCACTGTAAGGGACCGATTT
TAGAGACCTGATTTTTGCCCGAACGTACGGTCGTTTTCACCCCCTCCCCC
CAGTGATTTCACTTATATACAATTTTTTTTCAATGAACAATCCAACAAGG
TTACTAAAAGACATAAAACAATAGAGCAGATTTGTTTTTATAAAACTTGA
AAGCTTCGATTCGAACATTTACACATGTAGATAAGGCCTTAAAGAAAACG
TAAACAAGATTGGACTTAAGGCCGGTCTCCACTTGCGCATGCTGCGACTC
TGAAACAAATCCAATCAAGTAAACAGGAAACATTGGGAGAAAATCAGTGT
ACCAATTTGTATAGCTTAACCAGCCTTGACTTGAAGGTCTCGGACCAGCT
TGGACCTAGCAAATTAGGGCAAATATACATGGAAATTCACTGGGTTTGTG
TTTTTACCACTGCAATTAGTACAATGTACTAACTTCTCAGTGTGTATCAA
TTCAGAACACCACCCTTTTTAGTACAGTGTACTAACTTTTTCATTGTATT
TTTCTCAGAGGACCACCCTTTTAGTACACTGTACTAACTTTTTCATTGTA
TTTTTCTCAAAGGACCACCCTTTTAGTACACTGTACTAACTCAATTTAAC
CTAAAAAATACACCACCCCACCAGCTATGGGCCAGTACACTGACTCGATA
CCCCCCCCTGTTTAATCCCCAAAAGGATCAACTGAGGTTGGGGTTGCTTA
TGCACGGTTACCTTCAATTTGGTTTCAAAAAACCAAGCAATAATAGGTCC
TAGAAACATGAATATTGCAATTTACTTGCTCAAAGAATTGCAATTTTAAT
TTGTTAAAAATCTCTCTCCTAAATATGTAAAAAATGTCGGTTCTTGATTT
TTGATTTGAAATCTGGTTAGTCCGGGAGCCAAATCCTATATCTCCTTAAA
TAAGCACTTTTGATTAACCCAAGATTCTACAGGATAAACTATACATTTTT
GGAATCTTCAACTATCCTAGTTTAAGAAATGGTCGGTCCCCAACCCTAAT
TCCTGGTCAATTTTTCATACTGGGCCCGAGTTTAGGGGGTACTTTTTACC
CTTTGTAAGGATTTGTTAAGGAAAATATCTTTCCATGTATGATATAATTT
GCTATATCTCATTAATGAATTGACCAATTGCTTTGAAACTTTGCAAACAG
TTTCAAGATAGATTGGTGATCATCATTTGCAAAAGATTTTTGCGAAAAAT
TATTTTTTGGGGTTTCCCTGGGGGAAAATAGGGAAAATTTGGGTATGTTC
ACTGAATTTTGACACTTTTATAAGACTGGGACCTACCAAAACAACTTTTA
ATGAGGCACAAACATTGTGTTATGATAAAATTTGATGCGATTCACCAGAA
AAATTTCTTGTCAACTGCATTTAGTATCATTTTCGACGCTTAAGGGGGTA
AAAATGCCCTTTTTTCACTGTTTATCTCGCCTAAAATATCTTCGAAAAAT
AGTTTTAACTTAATCTTTGCGATTATACACTAGAAAATTACAATGCTGAC
TTGAAACTTTCACATACAGGGTGCAGTTTGAGAAACCAGGGGGTAAAATT
GCCAATTTTAGACAATTTTTATTGTTTTTATTGATTTTTGATCCCATTTG
ACCCATATAACAGTGTTAAGCTGTGCAAAGTTTGATTTCTAACTGCTAAA
CTTTAGTGACAACGCGAGGGCCAACCATGATTTGGCCCGAGGGGAAAATT
TTGAAAATTTGAGCTCTAGATAGCTTGAAAATGCACTCAAAACATGCACT
TATAAGACAATTTTGTAAAATTAAAAAAGAAAAACTTTGCATTTTGCAAA
ATAACCATTTTTGAAAAAACTATTGGAGGCATAGCCCCCCTTGCTCACCC
AGTTGCTACGGCACTGCAGATAATATATTAGATACCAAATTGTCAGTTTA
ATTAATATAAGATGAGAAAGTGCCAACCTATGGTCTGGTAGGCTGCTTAC
AATTTATCACCAAACATAGAATCTAGCCCCCAGGTCCATCTGAAAAAATT
TAGATGACCCCTAACAGGGTTAGTCCCCCCTAGCCACAGGCTAAAATCAG
GTACCAATTGCTGCTCGACCTTTTAGCCCGCCCCCCTCAGGGGGGGGGGT
TCCAGCCATGGTAAGCAATAGTAGAGGAAAGCAATTTATGTGGTTTTCAT
TATCCGTAATCAGGGATACAGGTGGTAAATCAGGGGTAAATAATATGTCA
TTTCTAGTTCGCAGTCGCCTGAGTTTGGATGTTTTTCTTGAGAAGTTTCC
TCAAAAACCTAAATTTTTAGGATGGAAACCAGCTCTAACAAACTTTAAAC
TACCATTCTATCATTTCTTAGTCCTTTTGATGACAACTAAACAACAAAGA
TTTCGATGCTTTTAACTGAAGTTATGGCTGCATAGTTATTGACTTAGTGT
AACTTTGTTAGCTTTTGCTCTGAAATTTCATGTATTGCTTCTCAGAACCT
CCCGAAATGACCCCTACTAGCAGTGTTTTAAGTACAATTATTATCTGGAG
TCTGGTACTTGATAAATAATTGCTAGAAGGTGTAGAAATAAAAGTGATAT
TTTGCAGGTTAGGGGGATACGGCCTGCCTGATGAATAAAGGCAAATCATC
TTCGATGAAAGTAGATCTTGATATCCTCTATAAGGTCATGCTTTGAGGTG
ACTTCTCTTTTTTTTCCGCCATTTTACTTTCCTTTTAACAGTAGCTTAAG
CCTCAAAATAAGTTCTACTTAAAAACCGGCAGTAATGGGCGCCAGTAATG
ACCGTTTCGAGAATTAAAAGCTGACAAAATCACGCTAAATCACTGTAACT
ATGCAGCCATAACTTCATCAAAAGTACTAAGAAATGATGAAATGGTAATT
TAAAGTTTGTTAGAGCTGGTTTCCATCCGAAAAATTTAGGTTTTTGAGGC
AATTTCTCAAGAAAAACATCCAAACTCAGGCAACTGCGAACTAGAAATTT
GCATATTTACCCCCTAATTTGCCATCTGTATCCCTGATGCCAGATAATGA
AAACCACATAAATTGCTTTCCTCTATTGCCTACCAAAAATATCCACGTTT
CCAGCAGTTAGAAATCAAACTTTGCACAGCTTAACACTGTTTTATGGGTC
CAATGGGCCCAAGAATCAATAAAAATCGATAAAAATTCACTAAAATGGGC
ATTTTTACCCCGTAGTTTGTCCAGTTGCACTCTGAATGTGATAGTTTCAA
GTCAGAATTGTAATTTTCTAGAGTATATTACACTAAAATCAAATTAAAAC
TATTTTTAAAAATATTTTAGGCGAGATAAACAGTGAAAATTGCTCAAATT
ATGTAAAAATTCGATAAAATGGGCATTTTTACCCACTGAAGCGTCAAAAT
GATACTAAATACAGTTGACAAGAAATTTTTCTGGTGTATCGCATAAAATT
TTATCATAACACAATGTTTGTGCCTCATTAAAAGTTTTTTGGTAGGTCCC
AGTCTTATAAAGTGTCAAAATTCAGCGAAAATACCCAAATTTTCCCTATT
TTTCCCCAGGTAAACCCCTAGAAATAATTTCTCGCAAAATTCTTTGCAAA
TGATGATCACCAATCTATCTTGAAACTGTTTGCAAAGTTTCAAAGCAATT
GGTCAATTCATTAATGAGATATAGCAAATTATATCATACATGGAAAGATA
TTTTCCTTAACAAATCCTTACAAAGGGTAAAAAGTACCCCCTAAACTCGG
GCCCAGTTTGAAAAATTGACCAGGAATTAGGGTTGGGGACCGACCATTTC
TTAAACTAGGATAGTTGAGGATTCCAAAAATGTATAGTTTATCCTGTAGA
ATCTTGGGTTAAGCAAAATGCCATTTTTCAGGTTTGGCTCCTGGACTAGG
TGGTGAGTTGAGTCAAGTCTCAACCAAATATTACATACAAATAATGCTCT
GTTAGTGTTATTAGTTTTTATTGGAGTGTAGGGAGCATTGTTTATGAGGG
TTTCTTGTTGACAGCGATTTTCAATATCATCGATAAATGAAGCATAACGT
ATAGCAGAACGTCCAATTAGAGAGTGTCAACTGTATTTGCCATGACATAC
ACCGCACATACATTTGTTCCTAAACCATAGGCAAGATAGCCTGTACCACC
CCGCAACCACAGGCCTTTTTTAAATTTTGAAAAATTTGCCGTGTGTCGGT
CTGCTACGGTTAGCGGGGTTCTGTGTCTCAGTTTGTCCCAGTTTTCGGGG
ACGAAATCCGAGAAAACACAAGCGCAGGAGTGCTCTTTTTAGAAATGAAA
GATACCATTTTGTTGACGCGTTAAAAGTAACGTCACTTTAGTTGAGCTAG
ATTGAATGCTAAAAATAGCTACGCTCCACCGCAGAGATATTCAGAGATTT
CTGGAGAAAAATATGAGACACGTAATGTTGCCTAACCGTAACAAACTGAA
CTTCGTGTTATCTTTTGAAGAAGAGTTTGGTACAGACAAGGAGGTTTTTC
GAATTTTTTTTTCCAGGTTACGATTGCGGGGTTTATGCAATTTCATTCGT
GGAAGAATTATGTAATCTCATCAAAGAAACGGACAAAATAGAGATCGAGC
AATTATTGGATATTCCAGTCAGTAGAATTCTCGAACAACGAAACCGCATG
AAAGACATCATTCAATCATTGATGAAACAATGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000412_pilon:65221..74853- >XLOC_003721 ID=XLOC_003721|Name=XLOC_003721|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1278bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000412_pilon:65221..74853- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGAAATTGAGCTATCATAATAGTTGTTTGGATGAACAAGACATTGTACT TTTAAATGATGGATGTTGGTTAAATGATAAAGTTATTGGCTTCATGTTCG AATGAAATTGAGCTATCATAATAGTTGTTTGGATGAACAAGACATTGTAC TTTTAAATGATGGATGTTGGTTAAATGATAAAGTTATTGGCTTCATGTTC GAATATTTCGAAAATGATGTTTTCAAAGAATTGGAAGAAAGAGTTTCATT CGTATCACCTGAAGTATCACAATTTATCAAATTGGTTTCAGATATTTCGA AAATGATGTTTTCAAAGAATTGGAAGAAAGAGTTTCATTCGTATCACCTG AAGTATCACAATTTATCAAATTGGTTTCAGATCCGCAAGAAGTATCCATA TTTTTGGATCCATTAGATTTGAGAAACAAGGAATATATTTTCATGGCAGT CAATGATAATGAAGAAAATAGCTGTGGTGGTTCTCATTGATCCGCAAGAA GTATCCATATTTTTGGATCCATTAGATTTGAGAAACAAGGAATATATTTT CATGGCAGTCAATGATAATGAAGAAAATAGCTGTGGTGGTTCTCATTGGA GTTTGCTGGTATACTACAGATTATCATCATCTTTCATACATTACGATTCT TGCGGTTCGTTTAACAATAAAGCAGCTCTTTCATTAGCTACCAAAGTTTA CAGTTCCATTCAGAAAGGAGTTTGCTGGTATACTACAGATTATCATCATC TTTCATACATTACGATTCTTGCGGTTCGTTTAACAATAAAGCAGCTCTTT CATTAGCTACCAAAGTTTACAGTTCCATTCAGAAAGACACCAGAGAAGAG TTAAATGTCATCCAAGGAAAATGTTCACGTCAAAACAATGACACCAGAGA AGAGTTAAATGTCATCCAAGGAAAATGTTCACGTCAAAACAATGGTTACG ATTGCGGGGTTTATGCAATTTCATTCGTGGAAGAATTATGTAATCTCATC AAAGAAACGGACAAAATAGAGATCGAGCAATTATTGGATATTCCAGTCAG TAGAATTCTCGAACAACGAAACCGCATGAAAGACATCATTCAATCATTGA TGAAACAATGAGTTACGATTGCGGGGTTTATGCAATTTCATTCGTGGAAG AATTATGTAATCTCATCAAAGAAACGGACAAAATAGAGATCGAGCAATTA TTGGATATTCCAGTCAGTAGAATTCTCGAACAACGAAACCGCATGAAAGA CATCATTCAATCATTGATGAAACAATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000412_pilon | genome | sc0000412_pilon:65221..74853 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 475-639:166 |
| Aaloc | 421-471:5791 |
| Aaloc | 301-417:6266 |
| Aaloc | 193-297:8420 |
| Aaloc | 103-189:8912 |
| Aaloc | 1-99:9634 |
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