XLOC_003190 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_003190
Unique NameXLOC_003190
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000179_pilon:441646..450084+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_003190 ID=XLOC_003190|Name=XLOC_003190|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8439bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000179_pilon:441646..450084+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGACAAAGTTTCTAGCTCAGGTTTGAAATAACAAAGTAAACCAGTATA TTGAATCTCCGGATGGATGTAAAAAGTTCCCGTATTTTTCTCAACTGAAA ACCACACCATAGACgacaactttcaaaacaaaacataaacaaactttaga aaaaaaggggaagaaaagaaaattcctgaaaaaacatgctgtagggaaaa actaaatcatgaaaTGGCTAACATCCTGGTAAACTAAGTAGAATTATAGA ATTATAAAAAAGGGGGATTTTTGTTTATCAGTTGAtatgttgttttattt tttttactgttATTTTCTAGGTGCTACTAACATCATGGCTGGGTTAGTCA AACCAGATTCTATTTCAACTCTTGGATTCggtatggatttttttcatttc aataagatttgataattttttggacctacctcagaGGTTCTTtaagttcg ttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgtt cgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcg ttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgtt cgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcg ttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgtt cgttcgttcgttcgttttgtCTTGAAAAATATCGAACAGGACTGGTAAAG AGAAAAACCTTCACAATTTATGCCAAAATGTAATGACCTAACTGGattga ctttttttgaattgttttaaatacacaggttgcaaaaataaagtttgaag tTAAATCATGCTTTTACTCGAATTTTCATGTGCTTATTACACGACCTtca tttctgattggttcgaattcaTTAATACGAATAAAGTAATTAAATGTGAG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000179_pilon:441646..450084+

>XLOC_003190 ID=XLOC_003190|Name=XLOC_003190|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1362bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000179_pilon:441646..450084+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGACAAAGTTTCTAGCTCAGATGGACAAAGTTTCTAGCTCAGGTGCTA
CTAACATCATGGCTGGGTTAGTCAAACCAGATTCTATTTCAACTCTTGGA
TTCgGTGCTACTAACATCATGGCTGGGTTAGTCAAACCAGATTCTATTTC
AACTCTTGGATTCgCAAATGCAAGTGCTTCCAAGTTGATGATGATAGCAA
CTGGGATAGGATCAGTTAGCGTATATTTCTTGCCAACCAAATATTATCAG
AGGTTGACGTTAAATCTAACAGATATTATCAATCAGGGACAGCAAATGCA
AGTGCTTCCAAGTTGATGATGATAGCAACTGGGATAGGATCAGTTAGCGT
ATATTTCTTGCCAACCAAATATTATCAGAGGTTGACGTTAAATCTAACAG
ATATTATCAATCAGGGACAGGTTTGGCGACTGTTGAGCTCACAATTCATG
GGAGAATATTTGTTGACAGATACAGTATCCACTTTGTTTCTGATCTATCA
CTTCCGTATACTGGAACGAAGATGGGGTACTTCTAAATTTATGGTTTGGC
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TACTTCTAAATTTATGTCACACCTTCTATCTAGCTGGTCGCTGTCACTAT
CACTTTACTATGCTATTTACAAAAGCAGATTACTTGAACACACTGGGCTG
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CTGTCACTATCACTTTACTATGCTATTTACAAAAGCAGATTACTTGAACA
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TTGCAACCTTCGTTCACTTTCTATTGGACATTCCACCTTCATCGGATGCA
CGAGCAACAAACACAAACAGATTGTCCCTTCCCACTGGCAACACCTGGCT
TGTCTGCCTGATCATGTTAAAGATATGGCCCATTATTTGCAACCTTCGTT
CACTTTCTATTGGACATTCCACCTTCATCGGATGCACGAGCAACAAACAC
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TGTTAAAGATGCTGATTTCACTTGATAGTCCGAAGGTACCACTCCTATCG
CTATGTGGAATTATGCTGATTTCACTTGATAGTCCGAAGGTACCACTCCT
ATCGCTATGTGGAATTGTAGCTGGCATACTGCAAAGATCCAATTTCCTTG
GTGTTCAAAGTTGgGTAGCTGGCATACTGCAAAGATCCAATTTCCTTGGT
GTTCAAAGTTGg
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_003190XLOC_003190-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000179_pilongenomesc0000179_pilon:441646..450084 +
Properties
Property NameValue
Aaloc634-681:8392
Aaloc580-633:6351
Aaloc445-579:5959
Aaloc334-441:5070
Aaloc211-333:4781
Aaloc85-210:1250
Aaloc25-81:323
Aaloc1-21:1