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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000221_pilon:598728..606531- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_002773 ID=XLOC_002773|Name=XLOC_002773|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7804bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000221_pilon:598728..606531- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAATGGGCTAAAAGAAGGCTCGAGGAATACAAGGTAGGTTCTATCTA
AAATATTTATTCCGGAAAAGCATTTACCCCTCCCCAACATTAAGGAAGTC
ATATTGAAATAGGTAAGAATCCAGGGTTAAGGTCTTTGATATCTTTGATA
TCCAAGGGATGCTTGGCCCTTCAAAACGTCCCTCTCAATATAGCAGATTT
ATTTTTTGAATAGCCCAATTTTTTTGTTGTTGAGAATTCACTATCGCAAA
AAAAGAGTTCCGATTTATGACTCATTTAGATAAATCTGAAACCTTTTGAA
AATGCATGAAAGAGTTTTAACTAGGGGGAGGGAGGCTTAAAGACTTTTGT
ACGAATAATTTCATTTTACATTTTATCTAGGTGAAACATGCAGAACAGTA
CGCAAAGTTGGTTGAATTATTCCCTGATACACATTCAGTGGATGAAGAAA
TTCAAATCTTTGCAAGAAATGTCAGTAAAATTGCACCTGCCACACTTCTA
TTACCGGTTGTCAATGATTTAGCTGAAGCAATGGGAAATGAACCAGATGT
TGCTATGGTGAGTATAACGGGACTAGATTTTGGGCCAATCAGATTAATGC
ATTGTCAATCAGCCTATGAATTTCAAACATCTACATGGTGTCCGCAAAAA
AAGTATAATACTGAGGTTAAGCATACCAGGATAATCACGACGACGGACGA
AAAATGTAATAGGCTAGTGAAAATACGAAATTTGATTGGTTAAAACTCAC
TAGCCTGTTAAATTTTCGTTCGTCGTTGTGATTTTACTATATCAAAACAG
ATAAAAAAATAGAAATTTTGTGTTTCTCTCTTAGCCTTTTGTTAATAGTG
TATTGTTTCCAATACTATAATGGGATAAACCTTCGTGGGGATTAAATTTG
GCAGTTGGGCCTATCCGCGAAATTTAAAAATTTCGCAGGGACTTAATTTT
GCGGGTGGCACTATTGGGTGTCAATATTTTGACGATTTTGTGACTTTCAC
TGTCAAATCATGCACGTTGGTTGTTGAAATACACATTATTTGTGCCTCTT
AGATGCAAGTAACCATTCAAAAAGTATTTATTTGACATATTTTGAGTTTT
GTTTTGAAATATTTCGCGAATGAGGCCCTTCCAAATTTCCATTGAGACTT
AATTTCGCGGATTTTCGTGGATGACACCCAAATCCGCGAAATCCGTGAAA
TCCGCGAAATTTAATCCCCGCGAAAGTTTATCCCATTAAAGAACAATGAA
CATTAATTTATCGTTGGAAACATAATTTTGAGTGCCTTGATAAAAGATCT
AGTTAAAATTTCCTGAAAATTTGAAAGTGAAAGAGCAATAGCAATGAAAC
AGTGGTAAAACCAACAAAACATTTTCTTTGCCACTCTAAAAGCAGGTGAT
GTGCACAATGTTCAATTCGGATTCTGAAATGAACGCTCGTGATTTCTTGT
TTTGCTTGAACTTCACCATTCGACAAGCACCAAGATTCATTGGAGATGAA
AGTGAGTAAAACTAGTGGATTGGAACACCCAGCTGGCATAGCACACAACG
TTGTTTCAACGTTTATCTAATGTTCACAACGTCCATATAACCTTGGATGA
ACGTTGAAACAACGTCTTGTACTACCTTTGGCAGCCTTGGCAGTTCTTTT
GATAGTTTTTAACCAAGATTTAAGCTTATCAATACAAAACGAGGCGCCTC
TTATAGTAAGTGTGTGGGGTGTGGTCTTGTCTTTACAGATCCAGTATGTA
CAGCTAATTTCAAAATTCATTGCTGTAGAGGGTATGTTGTCATTGTCTTT
TTTCATTTGAGAGTTCTCAAACCGATCGCTGCGATGAAGTGTTGGTGAGA
GAGGGGGAGACGATGAGAGAAGTGTTTTTGCTCTCTTCAAATCATACTTC
ATCGCAGAGGTCTCCGTCAAACAGACAATGCGCACAGAGTGTACTACGAA
GCGATAACAGGGCCGGCGAAACTGGGGAGGCCGGGGGGGCCATGGCCCCC
CCACTTTTTTGCTAAGAAAAAAAAATCAACCAACCATGGTGGCACCTCCT
TAGACACTTACTATTTGGCCCCTCCACTTTCAAAATTGATTCGCCGGCCC
TGGATAAACGTGAGATACACTCTGGTACAGAGTAGGTGTGACCCTGGAAG
GTGTGGTCAGGAGTTTTCAGTTAAGGGGAAGGAGTAGGAAATGCTTTTAC
TTCTTAAAAAAAAAACACTTTTGCCGTCCTTGATGTTTTAGGTCAAAACT
GCCAGTTATTTCAATTTCCCAGAGTCCTAAAAACGTATATACATAAATTC
ATTTATAAGCTATCATAAAGACAATCTCCTAAAGTCTATTCACGATAAGT
GTGCACTAAATTTTGACTTGCTTGTTATTTCTCAACCAATGCTTCAATCT
TAAAAAATTTGGTATCGTTGGAAAGATAGGAAGGAGCTTATTAATTTACT
GTTAGCTTTTTCCGTGAAATTTGAAAAGAACATGAAGAAAAATGAAGAAG
AAAAAATTCAACTTTTTATGGATAGGTTGTATAAACGTAATTTTTACATC
TTTGGAAAGCTTAAAGCTTGGCGATTTCAAAAATATATACTTTTACTAGG
AAATATAATTTGAAATTTGCAATATTTAACATAATGTTCAGTAGATTGTG
TGTTTTTGAAAAAAATTGAGATTTGAACAAAATAGAAAAACCGGGGGTAA
TGCATTTACAAAAAACACTCTCTATAACAACATTATTGAAAAAAAGTAAT
TATCTTTCATGTTTAAGTAATTTCTAACAAATGTAACAACGCAACAATAA
CATACCGATCCAACACGTCGTTTATAAGAAATAAGATCACATAGAGAACT
CAATGTCAGGATGAAGAAGAATTGTATGATAAAGTACAATTTCAGAGGCA
AAAACCTAGAATAAGAGACACTTTAATTATTCAATTTTCACTTTCTGTTT
CACTGTCATTATCTTCCAAATCTGAGTCTGAGTCACTATCGTCGTTCGAA
TCAATCATCACCCTATCAACTGTAGGAGCAATATCCCCAAAATCAACTTT
TCGGAACGCATCTTCTACTTTGATGGTGTGCTTGATTGCTTATAATAATT
TTCAGAAACATTTTCCAAAGCTCTATCCATAAGTAACTTCACGTCTTTGA
TTTTGAAGGTGGTATTCTTTTGGGCAACTTCATTTTTGGCTTTTGCCCAT
ATCAGCTCGATTGCATTCAGCTCTGAGTGACCAACGGGTAATCTCAAAAT
GTAGATGTCCTTCTTGTTTTCCATGCAGTACTTCTTTGTTATTTCCTCAA
GACAATATTTTTTTTCAATGAAGATCTGCTTCGATTTTTGTAGAAGGATT
GGTTTGGTATCTTTCGGCAGATAAGTGATTTTATTTTTATTTAACCATGC
TTAAATCTCTGTCTTGCGCCATTGGGTTGTTGGCTTTTTGCTCTCCTCGG
TTTGGCGAGAGTGATACTTCGCATTATCAATGACAACAACAGATCGATCG
GGTAACGCTGGGAGCACCTTTACTTCCCACCAATTTTCAAAATGTGCTGC
GTTCATCTCGTGATGGTAGTCAGCTGATTTTTTGTTTCCTACAAAAACTT
CACCGCAGTCCTTGAGGAAACCATTTTCCGATCCAATGTGGTTGATGATT
AATCGTTTTCCGCTTCCTGATGGAACATTTAACCCGCCATGCCACTTTGT
GTTTGCAATTAAGTCCTTTGGATCGTCGTCATTCTCCATTTTTCAAACAT
ATTCTTTGTATGGTTTGCGTTAAACCATGTTTCGTCCTGGTAAAAAATCT
GGTATCCCGCTTCACGGAGATCTGTTAACTCCCTCAATACGCGCAACAAT
ATCCAGCCTTTGGTAGATCTCCATTTTTAAACTTCTTTTTTTAAACACAA
AGCCAAGTTTCTTGATTTCTTTGAACAGAAAAGTCCTTCCAATTTTTGGG
AAACCGGAAATTCGCACTCTCTGTGAATTTTATCTAATGTCGGTAGTTCT
GGTGAATTTCTTTTATAAAAACCAAGAATTAAGCGTGAAACAACTCGTTT
ATCAAAATCGTCGAGTATTGTTTTGCAGCGCTCTTTCCTTACAGGGACAT
ACTCTTTCTTTTGTAGATAGAACACCTCCCGTCGTGAGATCCCACAGAGC
TCAGAAACATTTGAAGCTCGATCATAAGTGGAAAAGACTTTTTCGCCATT
CTGTTCTCTTTTTTGCGCACTTTTTATCCACTCATCGACTTTCACCAGAG
TTATACTTTCATTGTCAACGTTTTTAATGCTCTTGCGACTGTGATGTTTT
TCTTTTTTTGGTCGAGTTGCTGTTTTCTGAAGAAAAAGAAGAAGCTCTTT
TCTTTGCCCTGGCAGTACTCATGGTAACATAAACATACCGATACTTTCTT
GTTATTGCAGCTTTTTTTTCCAAAATAAAATATATCATATCACCGGATTG
GTTACCGGGTGGAAATAATCTCATATCATTTCACCGGATTGGTTACCGGG
TGGAAATCGCAAATAACACCGCATAAACGGATTCACCGGAGCTGAATTTT
TCCGAAGCATCTCCTAGTTATCCTTGTCACAATAACAAGCGTACTTAGCT
GTAAAATCTAAATCCCATAGGGTTTAATAAGTTGCAGAAGTAATTAAAGT
ACCTTCATACAAGCCATCGAAATTGAATCCTAATAAATCGCATAATCAAT
TGGTGATTACTACATCTAATAAGAAACCACTTTGTAACCCCCGGTTTTTC
TATTTTGTTCAAATCTCAAATTTTTTCAAAAACACACAATCTACTGAACA
TTATTATGTTAAATATTGCAAATTTCAAATTATATTTCCTAGTAAAAGTA
TATATTTTTGAAATCGCCAAGCTTTAAGCTTTCCAAAGATGTAAAAATTA
CGTTTTTAAACGACCTATCCATAAAAAGTTGAATTTTTTTCTTCTTCATT
TTTCTTCATGTTTTTTTCAAATTTCACGGAAAAAGCTAACAGTAAATTAA
TAAGCTCCTTCCTACCTTTCCAACGATACCAATTTTTTTAAGATTGAAGC
ATCGGTTGAGAAATAACAAGCAAGTCAAAATTTAGTGCACACTTATCGTG
AATAGACTTTAGGTCTATCATTGGTTATTGATTAAATCAGCGAAACAATT
TTCATTTTCTCCATTATAGATATTCAGATCCCGGTCCCAGTTGCAGCTCT
CTTGACAAGTGCAATGGGAACACCTGGAGGTTTTGCTGGTTTCATCATGG
ATCGAATCAATGAATTATTCAAAGCTATTTTGGACGATTATGGAATGTAT
TTGACAACTTACGCATCAACTAACGTCTTAACGGAGGATCCAGAGGTCGT
CGGTAAGTTGAAATGGAGTGGAGTCTCTATAACCTGAACCTTATTAACAA
AAAAACTTTCTAGGTTACACCTATAGTAAGTTTGCGATCGAAGTCGAAGG
CGACCGGAAGGCTCTTTTTTCTCTAGCTGTCTACCTGAAGGTAGGGAGGA
CGCCCCTCCTTCCCTGGATTTTTCTACTTACCCTTGATCATCACAGCATC
GAGGTATAAAGTATCTTTTTGGGAATCATTGGTATGACCCACAACCTTGG
GCACTGTAGCTCTATCTTCATGCTACATCCATAATCTACATAATAATCTA
CATAACACTGTAGCCCGAACAAATTTTCAGACCCCTTTATGAAACTTGAG
TCATAAATGGGAACTAGTTAACTCCAAAACAAATCAACATATGACAAGAT
GGTTGGTCAAGTACGAGCTGACGTTGACAGTGAAGAAAGTATATGAAACC
TTCAACTATTCAAAATGGAAACATAGAGAACTAAACCAACAATAAAACAA
AATACAAGACAAATTACAACAAATATCTATCCATCTATCCACAAGTAAAG
CTATCAGGTTTGTTAAGAAATGTTAAAATTTCCTTGAACTAAATTGTATT
CTTCTTTTAGGTGGTTGGTTTACTCCAGCAGCTTTGAATGAGATGCCAAA
CTTTGCTGAAACCTTTGTGTGCAAACCTGATGATCCAAGAGGACATTGGG
GTTTTAACTCATTTGACGATTTTTTCACTCGGAATTTGGTAGAGGGACCA
GCTGACCGACGTCCTATTGCATCTCCAGATAACGATTTGGTTGTTGTCAA
TGCGTGTGAAAATGCTCCCTACAAAGTTGCTTATTCAGTTCATAGACATG
ATGCTTTTTGGATCAAATCACAACCCTATTCATTGCAACACATTTTGAAG
GGAGCTGAAAAATACGTTGAAAGATTTGTTGGTGGGACTGTTTATCAAGG
ATTTTTGAGCCCCCAAACCTATCATCGTTTCCATGCCCCCGTCTCCGGTG
AAGTTAAAGTTTCTAAGGTAAATAATGGAATTTTACGAACACCTTTGTTG
TGGCTCTTCACGCCGGCTCTTATTGGCGTTATTTTCAGGCATGTGGTAGA
AAGAGCAGAGCGATGGGAAAAAGTCGATGTCAAAAGGGTCGTAAGCTTTC
AATTTTGAGCCTAAAATCAGTGATAAAATTTTTCAAATTTTAATAAGCGG
TTAGGCTACCCCAATGACGTATAAGCCCGAAGGGCTAGAATCGAATCTCT
AACCTTTCTAAAGCAAGAAAAAGTGAAGCCTTGGAATATGCGCCGTATTT
TTGATGACGGATTGAATCTAGCAAATCTTTTGTTTTGAATGATATTTTTT
TCGAAATTTTGCGGTAAATTTTAGTTTTAATGTACAATTTGTTTAAAACC
CAGGCGGGCTGCGTCAGGCCATGCAACTTTGGTAGGATTTGTTGGCTTCA
AATCCTACCAGGGAGATTCGATTCTAGCCCTTCGGGCTTATACTTCATTG
GGCTACCCTGAGTATCAGAGGTTGAGAATATTTCAACCTCTGAAGACCAA
TAATAGAAATTTTATCGCGCATGTGTCAATCTAATCACTGTCGAAAAAAT
CTAATATGAAGAGCAAATATTACCATATTAATGTCTAGCAGAGTGTATCA
GTATGCAGTTTACTATTTACGAATTCCCCAGAAACCTCCAAGTGTAATTG
AAATGAGTTTCTTTCAAAATAAATCTTTTACATGATCCCCAAATGTATAA
CAGTAATTACTAAACTTTTAATTATGGAAATGTCACTTTAGTTGAATGGT
CGAAATAATAGACATACTTTATGTTATGATTCTCTATCACTGACTCTTTT
TAGAAAGCACTTATGACATTTTTGAGTTGTGTTTTCAACGACGGGAATAA
AAATATCAACTTTGAACTTCATCCAAGATCTTGGATGGTCGTCATGGTTA
CTTTTGTCTTCGTTGATTCCGCGCTGAATAGAATCTGTATTGGTCGGCAC
AGCGTCGATATATGATTTAGACCTGTGCTTTTCACGGTACGGTTAGGCTG
CTTGCATCCACTAAATGATTCGTGCTCCTTATGCTACCGGTGGTTTTGAT
GGTATGCAATTCAGACTGATAAAGGGTTGGAGCCTAAAAGCTATGGGAGG
GGGGTAATTTAATTTAGCTGGAAGCTAAAAAAAGTTCTTTCTCGAATGGA
ATTTAATCTGAATTTCTTCTTTCTTGAAAAGTTATTCTTCAAATGGAATT
ACATTTTTGCCTAAATTTAAGAACATTGCAGTAAATTAATCCCCGCGAAG
TTCGATCCACTAAAGGGACAGACAGACTTTGTTTGAATACAAAAACATTG
GCGAACCGAGACAAAAAAACATTAATTGTTATCCAATATTGCTTTTTTAG
GTTGTCCCTGGAAACTTACTTTTCGCAACCCTACTACACAGACAGTCAAG
CTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000221_pilon:598728..606531- >XLOC_002773 ID=XLOC_002773|Name=XLOC_002773|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1926bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000221_pilon:598728..606531- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAATGGGCTAAAAGAAGGCTCGAGGAATACAAGATGAAATGGGCTAA
AAGAAGGCTCGAGGAATACAAGGTGAAACATGCAGAACAGTACGCAAAGT
TGGTTGAATTATTCCCTGATACACATTCAGTGGATGAAGAAATTCAAATC
TTTGCAAGAAATGTCAGTAAAATTGCACCTGCCACACTTCTATTACCGGT
TGTCAATGATTTAGCTGAAGCAATGGGAAATGAACCAGATGTTGCTATGG
TGAAACATGCAGAACAGTACGCAAAGTTGGTTGAATTATTCCCTGATACA
CATTCAGTGGATGAAGAAATTCAAATCTTTGCAAGAAATGTCAGTAAAAT
TGCACCTGCCACACTTCTATTACCGGTTGTCAATGATTTAGCTGAAGCAA
TGGGAAATGAACCAGATGTTGCTATGGTGATGTGCACAATGTTCAATTCG
GATTCTGAAATGAACGCTCGTGATTTCTTGTTTTGCTTGAACTTCACCAT
TCGACAAGCACCAAGATTCATTGGAGATGAAAGTGATGTGCACAATGTTC
AATTCGGATTCTGAAATGAACGCTCGTGATTTCTTGTTTTGCTTGAACTT
CACCATTCGACAAGCACCAAGATTCATTGGAGATGAAAATATTCAGATCC
CGGTCCCAGTTGCAGCTCTCTTGACAAGTGCAATGGGAACACCTGGAGGT
TTTGCTGGTTTCATCATGGATCGAATCAATGAATTATTCAAAGCTATTTT
GGACGATTATGGAATGTATTTGACAACTTACGCATCAACTAACGTCTTAA
CGGAGGATCCAGAGGTCGTCGATATTCAGATCCCGGTCCCAGTTGCAGCT
CTCTTGACAAGTGCAATGGGAACACCTGGAGGTTTTGCTGGTTTCATCAT
GGATCGAATCAATGAATTATTCAAAGCTATTTTGGACGATTATGGAATGT
ATTTGACAACTTACGCATCAACTAACGTCTTAACGGAGGATCCAGAGGTC
GTCGGTGGTTGGTTTACTCCAGCAGCTTTGAATGAGATGCCAAACTTTGC
TGAAACCTTTGTGTGCAAACCTGATGATCCAAGAGGACATTGGGGTTTTA
ACTCATTTGACGATTTTTTCACTCGGAATTTGGTAGAGGGACCAGCTGAC
CGACGTCCTATTGCATCTCCAGATAACGATTTGGTTGTTGTCAATGCGTG
TGAAAATGCTCCCTACAAAGTTGCTTATTCAGTTCATAGACATGATGCTT
TTTGGATCAAATCACAACCCTATTCATTGCAACACATTTTGAAGGGAGCT
GAAAAATACGTTGAAAGATTTGTTGGTGGGACTGTTTATCAAGGATTTTT
GAGCCCCCAAACCTATCATCGTTTCCATGCCCCCGTCTCCGGTGAAGTTA
AAGTTTCTAAGGTGGTTGGTTTACTCCAGCAGCTTTGAATGAGATGCCAA
ACTTTGCTGAAACCTTTGTGTGCAAACCTGATGATCCAAGAGGACATTGG
GGTTTTAACTCATTTGACGATTTTTTCACTCGGAATTTGGTAGAGGGACC
AGCTGACCGACGTCCTATTGCATCTCCAGATAACGATTTGGTTGTTGTCA
ATGCGTGTGAAAATGCTCCCTACAAAGTTGCTTATTCAGTTCATAGACAT
GATGCTTTTTGGATCAAATCACAACCCTATTCATTGCAACACATTTTGAA
GGGAGCTGAAAAATACGTTGAAAGATTTGTTGGTGGGACTGTTTATCAAG
GATTTTTGAGCCCCCAAACCTATCATCGTTTCCATGCCCCCGTCTCCGGT
GAAGTTAAAGTTTCTAAGGTTGTCCCTGGAAACTTACTTTTCGCAACCCT
ACTACACAGACAGTCAAGCTAAGTTGTCCCTGGAAACTTACTTTTCGCAA
CCCTACTACACAGACAGTCAAGCTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000221_pilon | genome | sc0000221_pilon:598728..606531 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 910-963:55 |
| Aaloc | 505-909:1843 |
| Aaloc | 322-501:2634 |
| Aaloc | 214-318:6410 |
| Aaloc | 37-213:7425 |
| Aaloc | 1-36:7805 |
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