XLOC_002771 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_002771
Unique NameXLOC_002771
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000221_pilon:567981..578490-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_002771 ID=XLOC_002771|Name=XLOC_002771|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10510bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000221_pilon:567981..578490- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTATTTTTATCAACGATTAAAAAACTTATACTAATTTTGAAACACATTGC TGATCAGGCTGGCAAAGGAAAAGTCAATGTTCAAGATCATCACAACAGAA CACCGCTGGTAGGCTATCCTCATTCTTTCCTTTGTTATTCCTTTAACCCT AAAGAACTGTTCCTTGATATTATAGGATAGGTTAAGAAATTTAGGTTAAA GGTGTCAAAGAGTTTGCAAAATGCTTGCTGAGCCTCATACTATTGTAAGG GTAGACTGTCGATAAATGCAAAGAAAATGACTATCAAACATTCTACCGCT CCTGCTTTTCTTTTTCTTTTTTCAGTACATGGCTGTCGATAAAAATCACA TGAAGGTTGCCGAGTTCTTGGTAAAAGGTGGAGCAAATATTTTCTGTCAG GTAAACATTTCATAATTTTAAAGTTTTTTTCGATTTTCAAGGTTTTGCTA GCAACTAAATGTGATTTTCATCTTTTGTTTTTAAGACAACTGAAGGCACA AATCTACTTCATGTTGCATCTCGAAGAGGCAATCTCTTGGCTGTCAAATG GTTGATCAAGCTAGGTGTTCCGGCTAACCAGCAGGTTAGAAATTTTACTT AGAAGTATAGTTAAATCTGAGGAGGTTGTGGATCAGGCAAACGTCTTGTA CTTTCTACTTTTTATTAATTTATATTATGATCAAGATTCGTATCAACTAT ATTTTAGTACTGATTTTGCTAGGAGACGAAAATAACTCTAATAGCTGGAT AAAAGAATACCTTTTGAACTTTCAAGGACAATTTCGGATGGACAGCCTTA ATGTGGTGTGCAGAGTCGGACAATAACAGCTGCATAATACGTTATTTAAT CAAGCAAGGAGCTTTAACCAACCTACTAGATAACGTAAGTTTTCACTAAT TATTATTTTCAACAATCTACTTATTAAGACCCTTTTACTCAACCTAAAAC 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CATGATTCCGTTTGCAAAACTAACTACTGCAGCATTGGAGCTATATTTTC CATTCATAGCCACAGCATGGCACCCTTTATGCCACCACGGTCCAAATGAT TGTGCGCAATTCATAGTCGGGTGAATGTCATTTTCAACTTGCGCTGTGGA GAATTTGGAGCCGTGCATACTGCCCATCCCGTACGGATAGTTTGGACTGA ACTCTGTCAATTCCTCTTCGAAAGTGATCATATAACCTTGGGACTCATCC TCCACTCTTACGCCTAGCATTTTCTTCATGGCTTCAACACCATCATAACT TTTTGCCCAGACAAGATAATCATACTTTTCTGAGGTAGTGAGTAAATTCA ACCATTTGTTTCCTAGCCAAAACTCATTCTCAACGTCACCAAATCCCTCT CTATATGCAGCCCATTCTTCGTTAAAAAAGTCCACGCTGCCGTCAAATCT TCTTTGAAAGATCATCCAACCACCTCCATCTAGAACCATATTACAACGAA CTTTCTTCCGAAACTTGCCCAATAAGTTGACTTCATACACACCGCTGGTA CGCTCTCCTAATTGGTACCACTCAGCGCAATCTTTTGGTAGAGCAATCGA ATAGTACCTCACACCCGGATTATCAAGCAATGGTAACAAGGTGTTGTAGA TCTGCTGGTAGAAACGACAACCAGTGAAAATTGTAGATTGCCAGACTTCA AATGAAAAGCATTTTGATGAATAATGACAAACACTAAAGCATTTTTGATA TGGAGCACCTTCAATAGAGTGGTATGGTGTCCCCGATATTGATTTCCCTG TTGCAATTAAGTCGTAGATTTCTCCGGATATTTTCCCAAGAAGGAGAAAC AGCTTTAGAAACAGTAGAATTGCCATACGTTTGCTCCTCATTTCGCTAAT GAAATTTTTCCACCTATCTTTAACATGTTTATTTTCGAACTGTTTAAGAG AAAACCATAATTTTGTTATCACCTTGACAGTTCAATACCCTTTTGCTTTT ACTATGAATCGGTCTAAAATAGATTCTAGTCCCCCACTATTTATTAAGTA TTTATGAGTCATTAGATAACCCCCTGTTTGTGCAGGTTTGTGTCAATAGT TAAAACAAACTGAATTTTAAATGAAGTATCGCTGATTGAGATCTGTATGT GTGAATAAATTCATAGAATGGGCTTTTCCAGAAATAGTCCGTGCCCTCTG TTGAGGATATCGGATATCCAGGGGGTTAACGGTTTTTGTTCAAAAGTGGA TATCCAGGGGGTTAAATATCGACAAGGGAGCAGATATCCAGGGGGTAAAG TGTCTTTACAAGTAAAAAGTACGATATCCAGGGGTAAGTATCTTTATAAG AGAGGATATACAGGGGGTTGAGCATAATTTTAAGAGTGGATAAAGAAGGA TATCCAAGGGGTTCGATACTTCGAAAAATCAATATCCTCAACAGTGGGGG TAAAATTCTTTTTTGGGAAAGCCCAATTTCTGTACAACTATCTTCTCAGG AGATTTGAGTGGCAGAGCAGCATATGCATTTCGTCCTTATTAGGACTCTT TAGCACTGCATACTGCACCCTAGCTAGGCAGATGCCTACCATCTCTATAT ATTATTTTACCATATAAACTATAACTAGAATATGAGTCAAGCCCTACTCA TCAAAAAATTGTTAGGAAAAAAAATCACTATTTCATATCTTCTAAGTTTA TAAATCTGTCGATAGTCAAATGGTTATCTGACAACACCTGCTCTAGAAGA GAGGGATTTGTTTTTCCGACTTTGTGATATTTATCAGAATTAAACATTAA TTTTTTTAAACACGGTGATCCACGACATTCGAACGACATGTCCTGCATAA TTATTTTGCTGTTTTCGAATGAAACTACTGACGTCTTCAGTGTGGCAAAA 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AAATAAATATTTACCGGTTCTTAAAAAATACCTTCTCGGGGAAAACTTCG TCGTGGAAAAGTGACTAAATTTTGGCCAAGTGACGAATATTTTTCCCCGA CGAAAATTTTCCCCGGCCTTAATGCGTTTACCAACTACCATCAAGTGACT AGTCTAGCAAGCTAGATGACTAATTTGTACATAGTAGAAATACAACAAAA AGTAATGAATGGAACAATTTTAGTCGTCTAGAAACCTTTGTGCACTAACT CCAAACAAAAGAAAAGTGTCAATAGTGACGAGTTCGACATGATTTTGACA CAACTCTTTTTTGTTACAGGTCTGTCCATCGAGTTCCAAAACATTTCATT GTATTCGGATACGTACTGAAGTTGGTCAAGAGAAAATCAAACCGTATATG TACTTGAGGTGCCTGATTTTTTTAATAGCACTTCATATTTCACTCTCAGT CCTAATTCTAGAAAGAATTTTGTGTCTTATCATCATAGGGTCCATCCCCC AGAAATTTTGGGGTACCTCAAAAAAAAATGTTAAAAAAGCCAGGTACCTG GAAGTATTCTTAAATTTAGGGGATACCTGATATGTTTGGGGGTACCTGCA TTTTCACAAGTGGGGGCGGGGTTGTTGTGTTTGTATGAAGTCACGGTGGC CAGCGACCCTTGAAACTTTATACCCTTGAAACCCTTGAAATGCCAAATTT TGTGGCCATTTTCAGCCATTTTATCTTTCAGAAATACAATTTTCCCATTG CGTGGGATACAAACATCAGTGAATTAAATGAGAAAACATACTTTTGGAAC CCCTGAGATTAAAGGGGATATTCCACGCTCATTCTTAAGGGGTTTACCCT TTAACCCGTTAAGTGCAACTAGAATTATATGAGATCGGCAGGTCTGGGTG ATAGAATGGGTGGTTGTAAATATGTCAATTTATCAGCCAATTTAAAGCAC TGAAAATCAAAGATTTTCTCCATCAGGCGGCCTTTACCACAACTATAAAG AAAGTATCTGTTGAAAAATGATTGGGGCTACCTAATTATTTTAGGGGTAC ATGAACCCTGGAGTACCCTATGCTTATTTATTGGTTAAGGTACTTCATCT TTTAAAAAAGAATCTTTGTCGACTGATTTTGGTCGATTAACTGGTCAAGC AATTTCTTTTTCAGCAAATACACTGAACTACAGGCAAAAGATCTATTCAG CTGATCTGCTACCATAGCTTTTCCCATAGTTTTTCCTTAATCAGTGTTGC AACTTTTCCGTCTGTAGACGGATATCCGTCCAGTTGAGATACAAATATAT CATTTCCGGGTTTTTGGTTCAAATGACCATCTAATCCTAAGGTTTCCGTC CATATTCACAAAACCTAGTTGCAACACTCCTTAATAATAAGTTTTGGTCA TATTTTTTAATAACCAGCAAAGATACTGTAGTATTTTCAGGTGCTTAAAC CATTATGATTTTGAATTCGCTTTCATTTACAATTTCAGCGACATTTCAAT GGGGAAGGAGAAAATTCCAGTCAGTTGTTTAAACGAGGTAAAAATTATCT ATTCACCCAGATTCACCTGCCCTTTTTAGAAACTGCAAAATTGACCAGGC AAAATATTTGAATTTAACAGGCTCATATTACTTGAGTTTTCTTTAAACAT CAAAATTGGCTTAAGTTTTTGACCATTTTAACTCAATTTTTAAGTTGATA AAAGTTAACTTGAAAGAAGAAATTTGACGATTTTTATGCTCGTTATCCAA AATTAACAAAGCCTTGATCTTCAATGAAATTGTTATGAAATTTCAGAACT GTATCTCCATGTTTTTCTCCTCTAACTAACTATCATCGTTTATTGTTCAT TAAGGTTGACGACGAATCTTTTCCTCAAGATTTCATTTACGTTGTCCACC CTGAAGAATCGAAGAACGTATCTGTGAAACGTGGTTTCTCTACCGTTAGT GTAAGTCACATGACCCTTGTTTAACATTTCCTTAAAATGTATAGGGTAGG AGACTCGGGCCAGACCGGCACACTCTTGATAAAATGACCTTTTTTCATCC TCCTTTTAAAAGATTTTCCATTATTTGTAATCTGTGTAATTATTGAAAAT CTCATTTCTCGACAGTCCTACCATCGGTTCATTTATGGGTTGATTTATTC TTAACTTTTTTAGCCATGTAAAATAAATCACTCGTACAATTATTCTCGAA TTGCACTCGTTATCATGTGATTACATATACTAATTTATTCTTCACTTTTT TTAGCCATGTAAATGCAGTGGGACGTGTACAGCGGAGTGTAAATGTGTCA TACTGTCAGAGAAAAATAAATTATGGTATTCAGAGGTAACTCTAAAAAAG ATCCTTGATCTGCTTATATATTTTACAGCTTCAATTTACGACAGGTTTGA TCTGGTTTATAAGATCTTTTACATACACAATAGCAATATATTGTCAGGTA TAGTTGTGAGTACCGGCAATATATTATAAAGTGCTTACAGTAGTATGTCG AAAAAGTGTCCGCAATATATATTACAAGCTCGATATTGCAATATCCAACA ATATAGGGAGATTGCTTACAGAAGGCAACTTCTTTCTTTTAGGTTTACTT CGTACATTAAGGTCTGCAAACTATATTATTGTTTGCTAAGTCTAAAAAGC CCTGAAAAAAATACTGCTAGATTCTCGAAATATCAATTTCTTTTTGTTTA TAATTTTTATTCTTCTAGGATGGAATACTTGATGTTTCGATATTCGATGA AGAGTCGCCAGTCCTTTACGAATGTACACCTTTGTGTTCCTGTTGGAGTT ATTGTCCCAACAGGGTGGCTCAAAAAGGCATCAGATTTCCTTTGCAAGTC TTTAAAACCAGGACTAAAGGTATTTGCTCATTTGAAAAAATTGAAATAAT AACCAATTCAACCGGACTTAAACCACAACTTCTTAACATCGCTAGATTTG GCAAATTATCCCGGAAAACAGCATGTTTGTACGTACTAAAATATACATCT CAAATAATCTTCAACAACGTTGTTTATTCATTACAGTCTCCATAAATTGA ACCTCCATAACTCGAAGTCTCCCTAACTTGATAAAAATATTTCTGGTCCC TTATCAGTAAACAAACAGATTGCCTTTAACTCGAATTTCCATAACTGGAA CGCATTTCGATTCAAGAAGCCGTTTCTGGTAATGAAGACTGTATCGTACT TTCCGCTTTCAGGTTGGGGATTGCGAACATTAACACCAATCACACAAGGC TCCTTCATTTTATCATACATCGGGGAACTGATCACAGACGAAGAAGCCGA AAAACGAGAAGACACGTACCTCTTCAATCTTGATTTGAAGGTAACAACTC AAGGATTGCTTTTGACTTTTTTACAGTCATTCTAGGGTATTCAATCTGAT TTCACGTGCTTGGTAAAAGATACGTTTTTATAAGAACATACCGCTTAGAC ATAAAAAATTAATCTCAAGAACCTATATTTTCAGGCTGGAAAGTGAAAAT ATTCAAAGACTGGTAAATTTCTTGACGTCCTTAAATAAAAAAACGCATAA TTAAAGTAACCTGGGCAATAGACCTGTTTTTACTTTTACATAGACTTCAG GAGACGAACCAAATTGTATGGATGCGCTAAGGATCGGTAATTGTGGACGG TTTATCAATCATTCTTGTGATGCCAATATGAAAGCTGTTAAGCTCTTCAC ACACCATAGGGTAAAGAAATGTTTAACTTTTTTTGCTGTTTAAGTCAATA CTAAACTTGCGTGTGTCAAAGTAGCTTAACATTGACGAACTTGAGAATTC TTGAAAGTACTTTTTAAAAATATTGCTCAATAATAAGTCTGTGACTTGGA TTATTTAGTATGGACCAGCCAGGGGAGACAGTTCATCTTAACGTTTCCAG ACCATCTAAAAAGAACGACAAATAACTGTTAAAATGTAACAAAAAGAACG ACAAACCGTAACCCTAACTATCAAAGAACGACATTTTTACGCATTTTATA AGCATGCATATAAGTCTCTATTTAAGTGAGCTAGAAACATAGGATGAACT AACTCAGGGACAACCCACTACTTTGTGCACCACAACGGAATGCCCCACCT TTTCACGACGGCCCAAAGATTTCATAAGAATACAACTCTTCTCTTCTGTT TCACAGGATGTGTCTTTTCCAGAAGTGGCCTTCTTTGCTTGTGTTGATAT CCAAGGAAAAGAAGAATTATGGTAAACCACGTTCGTTATGTATATACTGT TTCCCACCTCCTCCGCTGAGCAAGAATCTCAGAATGTCTGTCTGTCTGTT CTGGTAGTCTCATTGTAACGGGTGCACCAAAAATAACTATACCGGTTTGT CAAGATACTTTGAGTTCACGAATACGAATTTTGTGTTGGTTCTTTTTTTA TTATACACAGAAAAAAACCTAACCTAAATTTCGGAGTATAAAACTTTAAA ATCGGTTTCGTCAATCAAGAGTTATGTTTAAAATTCTTGGAATTTTGACC TACTCAAATCTCAAAATGGGCTTTTCCAGAAAAAATTTGAATATGGGGGG TTGGAGGATATAACATTTTTTTTTAGAAATTTACCCCCATTACGACTTTT GACTTTTGGCCCCTGGACATTTAAAATTTCCCTCAAACAGAGCGGAATTA CCCTCAAACAGAGCAAGTTCATCCCCGGGAACAAGACAAATTTTGTGAAT GAATATCGCTCTCCTTCGTTTTCAGTTTCAATTATGGAGACACTTTTTGG GACGTTAAAAATGAGAACGGGCAGTATTGTAAATGCATGTCCGAAAACTG TCAATATAGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000221_pilon:567981..578490-

>XLOC_002771 ID=XLOC_002771|Name=XLOC_002771|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2952bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000221_pilon:567981..578490- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTATTTTTATCAACGATTAAAAAACTTATACTAATTTTGAAACACATTGC
TGATCAGGCTGGCAAAGGAAAAGTCAATGTTCAAGATCATCACAACAGAA
CACCGCTGTTATTTTTATCAACGATTAAAAAACTTATACTAATTTTGAAA
CACATTGCTGATCAGGCTGGCAAAGGAAAAGTCAATGTTCAAGATCATCA
CAACAGAACACCGCTGTACATGGCTGTCGATAAAAATCACATGAAGGTTG
CCGAGTTCTTGGTAAAAGGTGGAGCAAATATTTTCTGTCAGTACATGGCT
GTCGATAAAAATCACATGAAGGTTGCCGAGTTCTTGGTAAAAGGTGGAGC
AAATATTTTCTGTCAGACAACTGAAGGCACAAATCTACTTCATGTTGCAT
CTCGAAGAGGCAATCTCTTGGCTGTCAAATGGTTGATCAAGCTAGGTGTT
CCGGCTAACCAGCAGACAACTGAAGGCACAAATCTACTTCATGTTGCATC
TCGAAGAGGCAATCTCTTGGCTGTCAAATGGTTGATCAAGCTAGGTGTTC
CGGCTAACCAGCAGGACAATTTCGGATGGACAGCCTTAATGTGGTGTGCA
GAGTCGGACAATAACAGCTGCATAATACGTTATTTAATCAAGCAAGGAGC
TTTAACCAACCTACTAGATAACGACAATTTCGGATGGACAGCCTTAATGT
GGTGTGCAGAGTCGGACAATAACAGCTGCATAATACGTTATTTAATCAAG
CAAGGAGCTTTAACCAACCTACTAGATAACGAAATGAATATTTGTTTGCA
TTGGTCAGCGATAGCTGGTTCATTCGAATGTGCTAGAGAACTCGTCTCTG
GTTCTTCTGATCCGCAAATCAACGCAAAAAATAAATTCGGAGAAACACCT
CTGAAATGAATATTTGTTTGCATTGGTCAGCGATAGCTGGTTCATTCGAA
TGTGCTAGAGAACTCGTCTCTGGTTCTTCTGATCCGCAAATCAACGCAAA
AAATAAATTCGGAGAAACACCTCTTCATGTTGCAGCGAAAGGTGATCATT
TCAATGTGGCACATCATGTTGCAGCGAAAGGTGATCATTTCAATGTGGCA
CAATTTCTTTTACTGAATGGGGCAGATCCGAATATTAAAAACAAACAAAA
TTGCACTGCTCTGGATATTTCTTTTACTGAATGGGGCAGATCCGAATATT
AAAAACAAACAAAATTGCACTGCTCTGGATGTCTGTCCATCGAGTTCCAA
AACATTTCATTGTATTCGGATACGTACTGAAGTTGGTCAAGAGAAAATCA
AACCGTATATGTACTTGAGGTCTGTCCATCGAGTTCCAAAACATTTCATT
GTATTCGGATACGTACTGAAGTTGGTCAAGAGAAAATCAAACCGTATATG
TACTTGAGCGACATTTCAATGGGGAAGGAGAAAATTCCAGTCAGTTGTTT
AAACGAGCGACATTTCAATGGGGAAGGAGAAAATTCCAGTCAGTTGTTTA
AACGAGGTTGACGACGAATCTTTTCCTCAAGATTTCATTTACGTTGTCCA
CCCTGAAGAATCGAAGAACGTATCTGTGAAACGTGGTTTCTCTACCGTTA
GTGTTGACGACGAATCTTTTCCTCAAGATTTCATTTACGTTGTCCACCCT
GAAGAATCGAAGAACGTATCTGTGAAACGTGGTTTCTCTACCGTTAGTCC
ATGTAAATGCAGTGGGACGTGTACAGCGGAGTGTAAATGTGTCATACTGT
CAGAGAAAAATAAATTATGGTATTCAGAGCCATGTAAATGCAGTGGGACG
TGTACAGCGGAGTGTAAATGTGTCATACTGTCAGAGAAAAATAAATTATG
GTATTCAGAGGATGGAATACTTGATGTTTCGATATTCGATGAAGAGTCGC
CAGTCCTTTACGAATGTACACCTTTGTGTTCCTGTTGGAGTTATTGTCCC
AACAGGGTGGCTCAAAAAGGCATCAGATTTCCTTTGCAAGTCTTTAAAAC
CAGGACTAAAGGATGGAATACTTGATGTTTCGATATTCGATGAAGAGTCG
CCAGTCCTTTACGAATGTACACCTTTGTGTTCCTGTTGGAGTTATTGTCC
CAACAGGGTGGCTCAAAAAGGCATCAGATTTCCTTTGCAAGTCTTTAAAA
CCAGGACTAAAGGTTGGGGATTGCGAACATTAACACCAATCACACAAGGC
TCCTTCATTTTATCATACATCGGGGAACTGATCACAGACGAAGAAGCCGA
AAAACGAGAAGACACGTACCTCTTCAATCTTGATTTGAAGGTTGGGGATT
GCGAACATTAACACCAATCACACAAGGCTCCTTCATTTTATCATACATCG
GGGAACTGATCACAGACGAAGAAGCCGAAAAACGAGAAGACACGTACCTC
TTCAATCTTGATTTGAAGACTTCAGGAGACGAACCAAATTGTATGGATGC
GCTAAGGATCGGTAATTGTGGACGGTTTATCAATCATTCTTGTGATGCCA
ATATGAAAGCTGTTAAGCTCTTCACACACCATAGGACTTCAGGAGACGAA
CCAAATTGTATGGATGCGCTAAGGATCGGTAATTGTGGACGGTTTATCAA
TCATTCTTGTGATGCCAATATGAAAGCTGTTAAGCTCTTCACACACCATA
GGGATGTGTCTTTTCCAGAAGTGGCCTTCTTTGCTTGTGTTGATATCCAA
GGAAAAGAAGAATTATGGATGTGTCTTTTCCAGAAGTGGCCTTCTTTGCT
TGTGTTGATATCCAAGGAAAAGAAGAATTATGTTTCAATTATGGAGACAC
TTTTTGGGACGTTAAAAATGAGAACGGGCAGTATTGTAAATGCATGTCCG
AAAACTGTCAATATAGATTTCAATTATGGAGACACTTTTTGGGACGTTAA
AAATGAGAACGGGCAGTATTGTAAATGCATGTCCGAAAACTGTCAATATA
GA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_002771XLOC_002771-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000221_pilongenomesc0000221_pilon:567981..578490 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1393-1476:85
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