XLOC_002698 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_002698
Unique NameXLOC_002698
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000320_pilon:317006..330780-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_002698 ID=XLOC_002698|Name=XLOC_002698|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13775bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000320_pilon:317006..330780- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CTATCTCATAAAAAAATTGAGTAATTTGACTAAGAACATTGATGTAGGAT TTCAATGGAATTGAAAATACAGACTAGTAATATAAACAATTTTCTTACAG TGAATATAAACTCAAACATATCGTCCATATTGAAGAAAATAAGGAAACAA AGCAACTCAAACGATATTTCATAGAAGTTGACGTAAACAAACATGGTAGC GAAGCACTATATCGATACAGTGGATGGATCATTGTTAAAGAAGATGAATC TAGTGAAATTTGTCAGCCACGTGGTTATAAATGGAAGAGGGATGAAAAGA TTTATTTGATCACACCAGTGAAGAATCAAGCCAGATGGGTCAGATTTATG ATTAAGCATCTAAATGGTAAGACAACTCACAGCCCTGGTGGAATTTATTC CCAAAGCAGGGATGAAAATTTCCTTTAGATAGATGGATAGACATTTTATG TTCCCAGGTCGAAAAAACCAGTGGGATTGTTTTGGAGTGCAATTTCTCTC TATTGAATTTTAAATACGGATGAAAAAAATTTCCAGTCGATTTTTCTACC GAAATTAGCGAAATTTCCAGTGGGTAGGGGGTCCCCCCCAGGTCTGTGTC ACACGGTTGTGGTAAATCTATACGTCTATATACAACAGATTTATTTTTTA ACTCCATAATGTATAATGATGAAAGGCAGCTGGGTTATTGAACTATTATA ATAAATTAACCCCAAAGGGAATAGAAATCGCTTCGAATAACTGAAGTTCG AACAATGTAAAGTATTTTTACCTAGTTGGGTAACAGATCCAATAGAAACA CTATCTCAATTCGAATAACCGAATTATTCGAATAAGTACAAGTTCGTATA GCCAGGAGTCTACTGTATACGGTATACTAACAATTCCCTAACAATTTTAG TCCAGAAGTATCAAAATTCCTGATCAGAAAGCCGTTTACAACAAAGCTTC AGATGGCATCAGTTATATTCTCACTTTCACTTTCATCATTTTCAGACATA ATGGCACACACGAATGAAAGACATATCCACCTGATACTATACGATTTCGG AAGTACAGATGCCAACTTGAAAGAGATTTTACAACAAGCAACATTCGAGC ATTCTTACATGAGAAACGAACAAAAATTCAGCAAAGTGATTGGTTTAAAC AGAGCAGTCAGTTCTATCCAAGAGGAAGACCCCATCATTTTTATTTTGGA TTTACAACTTCAACTACCGATATTCCTGTTTGATTATATTAGAAAGGTGA GTACTCTCAGGCAGGAATGTCGCGGTTTGACTGAGCCTGGGGAGACAGAT CGAAAAAATCAGTATTTTAGTAACACTGTTATTTTTTAGGCTTAAATAGA AAACAGGTGAACAACTAGTGATATTAGAGCATTTTGTTCCCCATAAAAAT CGACAGTACTTACCCCTTCAACCACTCTCAGGTACTTTCTTATACCCTTT CAACAGTGTTCCGCTGGGAAGAACCTCTTAATACCTCAATATATTTTTAA GAACATCTGTAAGATACATGAACGATTTTTTTTTAATTGAAAATTTGTTG ATAAAGTTGGTCATTATTCGAAAAAAATTCAATTTTACGTTAAAGTTTTG GCGATTTACTTTTTAGTAGATAATTTCTAGGTTTTCAAAACGTGGTGCCA TGTTTGTGAAATGGGGTGCTTTTGATTTATATGATATTATATACATTTCT TTTTAGCATACATTCCGTGAAAAGACAGTTTACGTTCCAATTCTATTACG ATTGGGTTGCGGCGAACATACGGCATTCACAAAGCTAACTGACCAATCAA TTTGGCAAGAAATTGGTTATGGGATGATCGCTCTATTCAAATCTGATTGG TTAAAAATTGGAGGTGCGAAAATTTTTATTTTAGCATGTCACTCCTTTTA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000320_pilon:317006..330780-

>XLOC_002698 ID=XLOC_002698|Name=XLOC_002698|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3876bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000320_pilon:317006..330780- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AATTTGGTCTTTACAAAGGACAATTGCAAGCCGAAAAGAATACAAACAAA
CCGGGAAAAGTTTACACGGTGACTAGCCATGAGATTTTGTTACAAAAAGG
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TACGTTTAAAATGGAAGTGTAAAAAAGAAGAACACTATATGAAAATCGAT
CCATCTCTTCTCACAACTTTATATTCGAAACCAAAAGTAACTGATATTTT
ACCTAACGTGAAATACGATGTAAGAGTGACAGAGAAATCTGAGTTATTGG
CAAAAGACAGGCGTCTTATGTTTCATCAGCTTCAAAATATTGAACAGAAA
ATGGTAAAAGAATGTGAATACTGGGCTAGTTATATTCCGGACCGGTTTCC
ACCTGATCATGGTGTAGCTTATGTGGTAGTTGATAAAGTGTACCCGAAAG
ATGTGTTGATAGAACACCATGATCCCAGGGGTTATTATGATTTATATATT
GATGAAAAAACAGCAATGAAAGTAGCGAAGAAATTTATGGGAACTTTAAG
CAGATGAATATCATTTTTGGAAAAATAATTTCAATGATATTGACATTTCT
GATCATATGGAACGTATGGATTTTAATGACACAAAAAGATGACCAGAAAA
AACCGTCCGAAAAAGATATATTCATTGATCGTTTCGATGAATTTCTTGCA
CAACAGGACCACGATAAAAAGAATATTATGAACGGAAGACAAGGAAAATT
AGATTCAAGAGTAGGGTCTATAGGCAAAAACACTTTTCTTGATTCCACGC
ATTTAAAGCGCGGTTACATAAACGTGTACTATTATATCGATATATGTCAT
AATTATGATAATTATGCAACAAAATGGAATATCCTATTTCCGGAATTTCC
TGCTAAAGCTGAACTCCAGGAAAACTTTTACGATGAAAGAATTGTAAATT
CTGAAAGAGTCTCGAGAAGAATGATTGCATTTTTGCAACCGGATCTAACC
GAAAATTATAGCTTTCGTATTGAAAGTCAAACTGGATGTGAAGTCCGTAT
TATAGAGGGCCCATATTTCGGTAAAGAAAGACATTATGATACGTTTATGC
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AGGTAAAAAATACTTAATTGACGTTCTTCATGCGCTACCCGGTAAAGGAT
TCTTACGTTTAAAATGGAAGTGTAAAAAAGAAGAACACTATATGAAAATC
GATCCATCTCTTCTCACAACTTTATATTCGAAACCAAAAGTAACTGATAT
TTTACCTAACGTGAAATACGATGTAAGAGTGACAGAGAAATCTGAGTTAT
TGGCAAAAGACAGGCGTCTTATGTTTCATCAGCTTCAAAATATTGAACAG
AAAATGGTAAAAGAATGTGAATACTGGGCTAGTTATATTCCGGACCGGTT
TCCACCTGATCATGGTGTAGCTTATGTGGTAGTTGATAAAGTGTACCCGA
AAGATGTGTTGATAGAACACCATGATCCCAGGGGTTATTATGATTTATAT
ATTGATGAAAAAACAGCAATGAAAGTAGCGAAGAAATTTATGGGAACTTT
AAGCAGTGAATATAAACTCAAACATATCGTCCATATTGAAGAAAATAAGG
AAACAAAGCAACTCAAACGATATTTCATAGAAGTTGACGTAAACAAACAT
GGTAGCGAAGCACTATATCGATACAGTGGATGGATCATTGTTAAAGAAGA
TGAATCTAGTGAAATTTGTCAGCCACGTGGTTATAAATGGAAGAGGGATG
AAAAGATTTATTTGATCACACCAGTGAAGAATCAAGCCAGATGGGTCAGA
TTTATGATTAAGCATCTAAATGTGAATATAAACTCAAACATATCGTCCAT
ATTGAAGAAAATAAGGAAACAAAGCAACTCAAACGATATTTCATAGAAGT
TGACGTAAACAAACATGGTAGCGAAGCACTATATCGATACAGTGGATGGA
TCATTGTTAAAGAAGATGAATCTAGTGAAATTTGTCAGCCACGTGGTTAT
AAATGGAAGAGGGATGAAAAGATTTATTTGATCACACCAGTGAAGAATCA
AGCCAGATGGGTCAGATTTATGATTAAGCATCTAAATGACATAATGGCAC
ACACGAATGAAAGACATATCCACCTGATACTATACGATTTCGGAAGTACA
GATGCCAACTTGAAAGAGATTTTACAACAAGCAACATTCGAGCATTCTTA
CATGAGAAACGAACAAAAATTCAGCAAAGTGATTGGTTTAAACAGAGCAG
TCAGTTCTATCCAAGAGGAAGACCCCATCATTTTTATTTTGGATTTACAA
CTTCAACTACCGATATTCCTGTTTGATTATATTAGAAAGACATAATGGCA
CACACGAATGAAAGACATATCCACCTGATACTATACGATTTCGGAAGTAC
AGATGCCAACTTGAAAGAGATTTTACAACAAGCAACATTCGAGCATTCTT
ACATGAGAAACGAACAAAAATTCAGCAAAGTGATTGGTTTAAACAGAGCA
GTCAGTTCTATCCAAGAGGAAGACCCCATCATTTTTATTTTGGATTTACA
ACTTCAACTACCGATATTCCTGTTTGATTATATTAGAAAGCATACATTCC
GTGAAAAGACAGTTTACGTTCCAATTCTATTACGATTGGGTTGCGGCGAA
CATACGGCATTCACAAAGCTAACTGACCAATCAATTTGGCAAGAAATTGG
TTATGGGATGATCGCTCTATTCAAATCTGATTGGTTAAAAATTGGAGCAT
ACATTCCGTGAAAAGACAGTTTACGTTCCAATTCTATTACGATTGGGTTG
CGGCGAACATACGGCATTCACAAAGCTAACTGACCAATCAATTTGGCAAG
AAATTGGTTATGGGATGATCGCTCTATTCAAATCTGATTGGTTAAAAATT
GGAGGTATGAATGAGACTCGATTCTCACAGAAATGGGGCGGGGAGGATTG
GGAATTTGTGGATCGTGTATTGATTAATAAAATGGAAGTCATTCACCATC
GGTTACCTGGTTATTATCATATCTACCATTCCAATAAAAATACATGGGAT
GGAACCAAAAACTGAGTATGAATGAGACTCGATTCTCACAGAAATGGGGC
GGGGAGGATTGGGAATTTGTGGATCGTGTATTGATTAATAAAATGGAAGT
CATTCACCATCGGTTACCTGGTTATTATCATATCTACCATTCCAATAAAA
ATACATGGGATGGAACCAAAAACTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_002698XLOC_002698-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000320_pilongenomesc0000320_pilon:317006..330780 -
Properties
Property NameValue
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