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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000236_pilon:339635..346780- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_002296 ID=XLOC_002296|Name=XLOC_002296|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7146bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000236_pilon:339635..346780- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAAGTAACCAAATATAAATCGAGTGACAGCTCGAAACAAAAGATATGAAA
TCAAATTTAGTTTTCTTAGTTTAACACTAAGTAATTAAGATTTAAACCAT
AAAATTCAAACGGCATTATAACACCAAACTTTGGATTTTAACTTTCAGGT
TAAAAAATGCCTTATTTGTCTATCGATCGTGTTCAAAAAAGAATGACAAA
ATGAAAATTCACAAAAAACCTTAGTTTTGAGAAAATTGACATACATCAGG
GGGGGTGAAGCAGTTACTACAAGACATCATGCCGGTTAGTACCGTGGTGG
TGTGCCATATGAATTGGATAAAGTCACTTAGTACTCAGATGCACTAACTG
CAAAAAAGGGTGGTCCCCTGCTAAAAGTTTGCCAAATTTTGGTACTAACT
GTGTAAAAAATAGGATTTTGTGAGAAAATTAAAAAAAAAGACAATATTTT
ACCAAAAAAGATTTTGGGGAAGTAGATTTTTTTTTCAAATTTTCGAAATT
TTTTTTTCAAATATTAAAAACAATTTGCTGGTTGCAATAGAAATTTGATT
TTCTAAAATGTTGTTTTTTCCTATTGAAAGCTATGGAAAATTGAATCATT
TTTAAGATATTAAATTTTATTTTATTTGATTTTATTGAATTTATGAAGGT
CAAAAGCCTTTTTCAAGGCTAATTTCAGTTAGTACTAACTGTACTAAGTG
TACCAAGGTGGTGGTGTTACTAACTTCTTCCGAGAAAGCAGTTAGTAGGC
ATGATGTCTTGTACTAACTGCTTCACCCCCCCTGCATACATTAACGAAAA
ATGGGTTTGATCTTGTAAAGTTTTAGGAGAGGATTCTTTACCCTTTCACT
AAGCTGCCTGAAGCAAAACTTTTCCAAAGTGTGAATTATTGGGGCTAAAA
ATGACTCTTTTGTATGTTTATGGAAAGTTAGCCTCATTCTTACACAAAAG
CGACTATCACCAAAAGATCTATGAATTTAAGCTGAAGATGCCCCATACTA
TTGCCCAGTATAATTATGTGAAACAATTTCTGACCAAAAGTGTGAAATAT
TGTGGTGTCTTTGAAGTAAACTTAAAAATAGTTACAAAACTATCTTAACT
GATAAAAACTAAAATAGTTGTGAAAATATTATGTAAAATATGTTTCTTGA
AAGGTTATGAGGTAAGATATCAATAAACTCGAATTGAAACAAAAGACGTG
AAAAATTGTGGTTAAAATCCACTTTAAGGGTAAATTACCCTACTTTTTTA
AACTAAGCCACATCACTTCACATATCAATCACAATAACATAAACTTAGTA
GAGGGATACTAAGAAGCTGTACAAAACACATCATTGTAATTTCATAGCAA
GCTAATAGTTGTTTTGGGATTTTATGCGGCTTCATATACGAACGTTCTTT
TCAGACCTGTCAAATTATTAGCCACACTTGTGCACATTTAATTTGAGAAA
CAAAATTCTCAAGAACTGAGAAGAATAGAACAAAAGCTATCTGTTGATAT
ATTATAACACAGTTGTTGTGTAGAATATGGGTTAAAATGTGGCTAAACTC
TCTATTATCTAAAATTATCCAAAATTAGTAAAAAATCGCAAAAAATATAA
CATAAATAAGATGACGCTATGATTTACTATTAAAACAAGTTCAAAAGATG
AGAAATTTGTCATATAAAGTATTTTTAAACCTTCCACAATTAAACAAACT
CAATTGAAAAGTCTTGATAGTCATTTTGAAGGAAAAAATGTGGCTAAATG
TTTGCCAAAGACCTCAATGATTAAACAGCGACATCCTGAAATAAAAACAA
AAAAATTATCAGAAATGATTCTAAGGAATAGAAATTGTCTTTTTAAAATG
ATTTTAAAAAATCATATCACTAGAATAAAAATAAAGTGAAAAAGTGTGGC
TAAAGCTGAAAATTCTGAAAATTCTACAATTCTACTCAATACTTTTTGCT
GAGAAAATTAAATTGTCAAACTGAATGGTAATATTACAGAATTATATTAA
TGAGAATATACTCTCCACTTAAATTCACAAAATGGAATAAGAATTTACTT
CCTCAAATCCTTTGACAAACATAAAACAAAAGTTTCTAAAAGTACAGTCA
GCATAGTAATGTTTCCAATTCTAAACCAATACTGTAGATGCCTTCAAACC
TGCTTGTAAGAATATTCAATTTTAGCCACACTTAATCACTTTTATTAAAA
TAAATTGTGTGCATTGCTGCAAAAATGTTATGTGATTCTTATTTGGTTTT
AATTGAACCTTTAAGCTGGTAAGATTCTGGGAGAAATTGTGGTTTTTATT
GAAAAACATAATTTTTTGATGAAAAACCACACATTTTCACTAAGGTTTAT
AGGTAGAGAGAATATATTTGCAGTCACGTTAAAGTAGCCACCTACATTCA
CAAAATATGATAAGAATTTACTTTCTCACAATCCCTTGACAAACCAAGGT
TTCTAAAAGTAAAGTCAGGATAATAATGTTTCCAATTTTAAAGAAATGTA
GCTTATAAAAATATGTTAAATTAGCCACATATAATCACTTTTAACACCAT
AAATACAGTTGATTTAATATGTAAAAAAATGTTTGATCCTATATGTGCAA
AAATTAACTTTTAGCTCTGGCAGGATTCTGGGAAAGATAGTGGTTTTTGT
TAAAAACACCTGTTTATCATAGAAAACCACATTTTATCACTTTCTTTCAA
GAGATGTGAGAAGATGTATCGCATAAAATTTGAGTAGCCACTGAACTTCA
CTAAATCCATAAAAAAAAAAAATTTTCAACTGCTCTGATGGTTGATAAAT
TTAATTTTTTAAACTTAATGTAATACTAAATAAGCTAATATTTACTTACC
AAAGACAATGTCTTTAAAGCCACAAAATTTCACATTTTGGGTTAAATTTT
GATCAAATATCATAGTTCTATATCTGAAATGACTATTTTCCAATAATTCC
CGCTAAATTTCACATTATCCTTTAAGTAAAACATGCTTTTTGTCAAAGGT
TATTGTTTTTCAAAAATAAGCCACAAATACTCACAAATTTAATGACTTGA
GCCACAATTCTTCACAGATATGGTTTCTTCAGTCCTTTACCAGGGTATCC
CCAAAATCTTGACTTGCTTCCTTCATCCGTAAAGAAGTTATAGGGCTTTC
AAGTGGGCTTTGCATGGTTAGCCGCAGTGAAAATTAGCCGCATTTTTTCA
CACAGTTCAAACGCTTTTTAAACGCCGCTCAATTACACTACAGACTTCGT
TCTTTTCGGAACAAAAAATTTAGTATATTCCTCTTTTGGGATTTTTTTCT
TTTTTTGATAGCCACAATTTATCACAAATCATAGCTGTTTGAAATTTATC
AACAAAAAACAACAAAAATGTCATTCTTTTTTGAACACGATCTATCACAC
CAGATCACACAAATGTTATTGTTATTAATTTTTTAGGTCACCAATCTCAC
ACTTTTTCAATTACTTTTCAATAATATATTAGTTGCTCTTCATCATAGTC
GTCTATTTCATGACACAATATGAAATAACTGTTTTTGACTTGGAAACTTT
TACTACTAAAATGATGATATATAAGCCAAAACTTTGTACATATTAATTGT
ATTTAAAGCTCTTCATCTTTTTATAGGAGACTATGTCAAACTATGAGTTT
GAGATTGAACAATTGAATTTCACTTTGGAGCATGAACTTTCTATGAAGTA
AGACATTTTAAAATCTTTTCATCTTGGAGTGTAGATAAACCCAATGCGAA
CAAAACATATTCTCGTTTCTCATATCCAACACATATTTTATACCTCGTAT
TCTTTTATCGTGTTCAGACAATATATTTACTTTCCTTTTTCGTCAATCCT
TGCTCCACATCCAATCCTATTTCAGTTTGATACTCAGGAGCTTGTAATAT
TAACAAAGAAAATCAACTTAAAAAACAAAATCATCTAGCCCTTATAAATA
AAACCAGCATTGCAAAATCGCAATGTTTAATTCCTTTCTTTTTACATTTT
TGATGTTTTCCAGAAAAAATATTTCAAGGGAGAATGAAGAAATTGAGAAG
AATTTGAATTGTTTGGAAGAACAAATTGCCAGTGTTTCAAATGATCCAAA
TGGTACATAATGTCATTTATACCTTTCCAACTTAGTGCAGTCTGATCGTC
ATCTAAAGAATTGTATGAATTGTATTCAATAGAAATTCAGCATTTCCGTA
TTTTTGGTGATGGCCTGTTATTTCAAAAACATCGACCAAATTTCTTCCTT
GACTTCATAAAGCTCAATATTTATTTTTTAGACTGTGATTGGGGACGCAA
ATATTTGGCACAGTCAGAAATAAATGAAGAATTATTGAGACAGATTGATT
TAATGAGAGAAAAAATGAAACAGTTAGCCGAAATTGAACCCAATGAAACA
GGTCTGTATTTTTTTAATTCCCAAATTGATTTTTTTCGGGGTTTCATTTT
TAAGGTTTTTATGTTCTTCTTCTTCTATTTTGGAAATTAATTATTTTAAT
TTTTGTAATAACACTTACTTCTCTTTTTCAGAATTCCATTCATCACCAAA
GGCAAATGATGTAAGATTACCTGGAAACCCTATGAGGAAAACTGATTTTA
CAAATCATGAGTTACATTTTGTTCAAAAAATTATATCTATATTTGGGCAT
TTGTTAGAATGCTTGTTACTATAAAGTTGTTGTGATAAAAAAAGAGTGCA
TATATGACAATTTTTAGATCCTTAAAGATTATTTATAGAAAACCTCGACT
TTGGCAATGAATTTGGCAAAAATACCTGGAAGTTTTTCTTAATACCTTGA
AGTTTTTCTTAATACCTTGCAAGGAATCTGCGGCCAAAGATCTCAAAGCA
TCTGATCATTTCCTTAAGCTTTCGCTTTTTTTTAGACGGACCTCCGTAAT
TTGCTACGTCAACTTGAAAAAGAAAAACGAAATTTTGAAGGGAATCTTAG
AGATGTTGAATGGAGGCTGGACTCAGAATCACAGGTAACCCCTTTAAAAA
GTATCAGAACTCTTCAATCAATTATATATTGGTTTTTCGTAATTGATCAC
GCCTCTTTTAGAATTGCAATCAAAATACTGTCTCGTATTTATTCATTTAG
ATATTTTCAGGCAACTTTTTACTACGATGTTGCAACACATAGTATTAACG
ATCTCATTGAAAACAAAACATTTTAAAAATCTTGTATTTCAATGGACTTC
AGGGGTTTTCATGGAGAAGCAATATATTTTTTCTCAACCGTCATTGAAAC
ATTATCGTCATGAATTCCCTTAATAATGATTACGATGCTTTTAATAATGA
CGTCATCTTCACTTGCAGGAATTGTTTCGAATCAATGAAGAAAAAGCAAA
GTATAAGCTGGAGTTAAATAAAGTAGGTCCTTGCTTGAGCTTTTCGTTTC
ATTGATCAATAATTTGTTGCCTCTCTCTCAAGCTGGGTAGACTATTCCTC
CTTATTTCGAGAAAAATGCAATATTAACGATATCGTATTTAACTTTACAC
AATTTGTCAGCCTATTTTTAATAAAAATTCTCATTAGTAAGGCCACACTC
CCAGTAGTCTATGTGAGAAAAGGTAGGACGGAAACTTCGTTTTATTTTTC
TCGAAAAACCTATCGGAAAGAATGAGAAGAGTGATTTCCCCGTAGAAAAG
TTATTTAGAATTTTAAAACTCTCAGCAATATGCGACTAAAAATACCTACC
TCTTCTACTGTGGCAGTGAGAAAGGGGTGTGGTCAAGAAAAGTGGTCTGT
GTTGTCAAAAGAATGATTAATCAATTCTCAACGGGTGCGAAAAAATATTG
TTTGAAATTTAGTTTACTATAGCTTATGTAAAACTCAGTACTTCTTAGTG
TAACATTACTAGTGCAAATTCATACAATTTATTATTCGATAACTTTCTTA
TAGACGATATTAGATGGTAAACAATCAAGCATGACAAATTCCACCAGAGG
AAATGTAAGAAGCATCTTCCCTGTAACACATCTATAATATGTCCGTTATT
TAAAATAGTGCAAATTCTGTAATGGCTCCATTGATAGTCTGACCTGTTGG
GAAAGCCAGCGAATAACATGCAATCTGTTACTTTAATTATCTTTACTATA
TTTTCGAATTGACCACCTAAAAAGTGCTTTACGTTTACATGTTTGTAGGA
GCAATTTCATAATAGCATATGGCTAAGTCTTGGCCTCTACCTTTTCACTT
CATGAAGAGTAAGAGCAGTAGAGGCTGAACCAAGATTTGTTTATTTGAAT
TATTCAACCCCTGCTTACCATTGGACGACCCAGAATGGGAGAATAATTAG
ACGCATAATCTCTTAATTAGCAATTGGGAATGAAAAAATGAGCCAAATAC
TAATGAGAAAATGAAATTATCAGATCAGTGATGTTTTTTTCTTCCTCCAT
TTGAAGTTCAGTGTCTTCTGTTCTTTCTGAACCTTTTTCTTTTCGATGGA
GACGATTCGCTGCCATCCCGAATGGGCTTTTAAATTGACGAAATTAAAAT
TTTCTACCCTAAGGAACGATGGGTGTATATTCACATCAGTTGACAAAAGA
GATTTCAGTTAAATTTCAGTTGACAATGACTTGCAGAAAAAAAGTTATAT
ATGTGTTTGGTCATGATTAAAATTTTATATAATACTAAAATTTTCTTTAG
GTCACGATGCATGCCTGTATTTACTTGTTCTGTTTAAGGTTTCGCCATTA
CCCGGAGTAAAGTTCAGCAACAAAAGTTTCAATCATAACAACGTTAAAAA
TAGGTATGGGATTTGCTGCTGTTTGATCAAAAAATTCGAAATCTTTTTTA
CGATTTCAACAAGTTACAACTCGCAAGGATTTATTTATTGAAGCACTGCA
TTGAAAAGCCCGTCAACAAACAAAAATCAGCTGATAGTTTTTTATTTACA
ATTCATTAATATTTTCTTTTTCTTACGCACAGGCATTATGGAATACCAGA
TAACCATCGGATCCTGGATGCTCGAAAAGGCCCTGTCAAAAAAACTGCTG
CTGTAAAAATATTGCCTAAAATACAAGCAGGCTTACCGAATTCTGCTGAT
TCAGCACTCGATAAGACAAATAAAAAAAGACATTCCTTTAAGAAGAACTC
TTCATTTGATGGGAAAGATACTCGAAATGGCGCATCGACTAATTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000236_pilon:339635..346780- >XLOC_002296 ID=XLOC_002296|Name=XLOC_002296|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1668bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000236_pilon:339635..346780- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAAGTAACCAAATATAAATCGAGTGACAGCTCGAAACAAAAGAAAGTAAC
CAAATATAAATCGAGTGACAGCTCGAAACAAAAGGAGACTATGTCAAACT
ATGAGTTTGAGATTGAACAATTGAATTTCACTTTGGAGCATGAACTTTCT
ATGAAGAGACTATGTCAAACTATGAGTTTGAGATTGAACAATTGAATTTC
ACTTTGGAGCATGAACTTTCTATGAAAAAAAATATTTCAAGGGAGAATGA
AGAAATTGAGAAGAATTTGAATTGTTTGGAAGAACAAATTGCCAGTGTTT
CAAATGATCCAAATGAAAAAATATTTCAAGGGAGAATGAAGAAATTGAGA
AGAATTTGAATTGTTTGGAAGAACAAATTGCCAGTGTTTCAAATGATCCA
AATGACTGTGATTGGGGACGCAAATATTTGGCACAGTCAGAAATAAATGA
AGAATTATTGAGACAGATTGATTTAATGAGAGAAAAAATGAAACAGTTAG
CCGAAATTGAACCCAATGAAACAGACTGTGATTGGGGACGCAAATATTTG
GCACAGTCAGAAATAAATGAAGAATTATTGAGACAGATTGATTTAATGAG
AGAAAAAATGAAACAGTTAGCCGAAATTGAACCCAATGAAACAGAATTCC
ATTCATCACCAAAGGCAAATGATAATTCCATTCATCACCAAAGGCAAATG
ATACGGACCTCCGTAATTTGCTACGTCAACTTGAAAAAGAAAAACGAAAT
TTTGAAGGGAATCTTAGAGATGTTGAATGGAGGCTGGACTCAGAATCACA
GACGGACCTCCGTAATTTGCTACGTCAACTTGAAAAAGAAAAACGAAATT
TTGAAGGGAATCTTAGAGATGTTGAATGGAGGCTGGACTCAGAATCACAG
GAATTGTTTCGAATCAATGAAGAAAAAGCAAAGTATAAGCTGGAGTTAAA
TAAAGAATTGTTTCGAATCAATGAAGAAAAAGCAAAGTATAAGCTGGAGT
TAAATAAAACGATATTAGATGGTAAACAATCAAGCATGACAAATTCCACC
AGAGGAAATACGATATTAGATGGTAAACAATCAAGCATGACAAATTCCAC
CAGAGGAAATGTTTCGCCATTACCCGGAGTAAAGTTCAGCAACAAAAGTT
TCAATCATAACAACGTTAAAAATAGGTTTCGCCATTACCCGGAGTAAAGT
TCAGCAACAAAAGTTTCAATCATAACAACGTTAAAAATAGGCATTATGGA
ATACCAGATAACCATCGGATCCTGGATGCTCGAAAAGGCCCTGTCAAAAA
AACTGCTGCTGTAAAAATATTGCCTAAAATACAAGCAGGCTTACCGAATT
CTGCTGATTCAGCACTCGATAAGACAAATAAAAAAAGACATTCCTTTAAG
AAGAACTCTTCATTTGATGGGAAAGATACTCGAAATGGCGCATCGACTAA
TTGAGCATTATGGAATACCAGATAACCATCGGATCCTGGATGCTCGAAAA
GGCCCTGTCAAAAAAACTGCTGCTGTAAAAATATTGCCTAAAATACAAGC
AGGCTTACCGAATTCTGCTGATTCAGCACTCGATAAGACAAATAAAAAAA
GACATTCCTTTAAGAAGAACTCTTCATTTGATGGGAAAGATACTCGAAAT
GGCGCATCGACTAATTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000236_pilon | genome | sc0000236_pilon:339635..346780 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 622-834:214 |
| Aaloc | 556-618:459 |
| Aaloc | 505-555:1244 |
| Aaloc | 451-504:1829 |
| Aaloc | 352-450:2262 |
| Aaloc | 325-351:2614 |
| Aaloc | 205-321:2864 |
| Aaloc | 115-201:3133 |
| Aaloc | 43-111:3521 |
| Aaloc | 1-42:7147 |
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