XLOC_002280 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_002280
Unique NameXLOC_002280
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000295_pilon:216978..227999-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_002280 ID=XLOC_002280|Name=XLOC_002280|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11022bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000295_pilon:216978..227999- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTAAACCGAGTTTTAAGAGTAAGTACTTGCTTTTTCAATGTTTATCT CTATTAGAAACTATTAAAAAGACCCCCCTGTGTCACAGACCCGCTGGACC CTAGCCCCAATGAAAAATTTGGTAAAAATTTTGTCCATGGTAGGAAAATA CCCTGAAATTTCAGCCCCACTGGGAAATTGACTTTGATTTCATCCCCACT CGAAATTCAATGTTTACGAATTACAATCCAAAACCACAACCTCACTAAAT TCTTAACCTTTGGACAATAGAATTGCTATCCCCATTGGAATTTCAATAGG AATTTTTATCCCCAAAATGGAAAAAAATCCCACCGGGGCTGTGAGACAGG GGTGTAAAGAGGAAATACGCAGTGTGAATCCCTTTTTACATTCAGTTACA TAAAGTGGATTAATTTTCGCGTGGAGTTTTATTCGTGAATCTAGATTCTA AAATTTTCGTGGGGCCTCTTTTTCAATTAATTTCTTTAATTTTCCTAGGG TATTTGGCGGAAATTCGGATTTTTAATCTCACGATTGAAATTCGATTGAC GTTTTTACTTACCTTAATTTGTAATTTCCCGGAATTGTTAGAATTTCAAT CCAAACCATGAGATTAACCAGGAAACCCATGCTTGTTTCCGTGAAATTCT GGATAAATTACCCTCGGTCAAATTTCGAAATGTTTTAAATTTCAAAAAAT TTCAAAATTTACCTCAGGAAATTTATCCCCAATTTCCCTCATAACCATGA GATTACTAGTACAAATTTTTCGTGAGGACTGATTTTCGCAAAAAATGACC AAAATTCCATACGAAATGTAATCCATTAAAGATAATAGGGATATGTTCTT CGCGGGGGAGGTAAAGATACTGATCTACTTGCAAAAAATGTCGGCAGACA TTGCACAGATGAAGGGTGGTAAAGTCATAAGCAAGAAAATGTCTCTCATT 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GAGGAAGCAATTTTTTACGTCGAATCTCATCAACATCCTCACCGAAGCGT GCCTTACCTTCCATTGATCCAGGGATTGAAGAAAGTCCTTCCTTACCTGT CGTTAATGCTCACAATGAATGGGATCCGCTTGAAGAGGTCATAGTCGGCC GCGCGGAGAATTCAGTGGTGCCAAATTTCACGACGGAAGTCAAAGCCAAC ACGTACGAATACCATTGGGATTTTTATAAAGCAAACAACGGAGAATATTT CCCAGCTGAGCATCTAAAGAAAGCAGTTGCCGAGATCGAGGAATTTTGTC GCATTTTAGAACACGAGGGTGTGGTCGTTCAAAGGCCTGACATTATTGAT CACAAGAAGGTTTGTGTGTTTAGAAGGATTTGTATCTTTATAATTTTTTT TTTTTGATAATTAGGCCTAATCTTGTTTAGGTGGGATTTAATGAAGAAAA AACTTTTTTTGGTGCAAGAAAGCTCATTTTTTGTTGCAGAGGTACTTTAA AGCCTCTTTATTTCAACTAACAACTCAATTTAATCCAGTCTCATCCTTGG AAGAAGATTAGTTCAAAAAGCAATAATATTTAATATTAATTATTTAATAA TAGTTCACAGTTCGCAAGCTTTTTACTTTTCCATATATTTAGAAATATGC TACTCCTGACTTTGAGTCAACTGGTCTGTATGCAGCTATGCCACGTGATA TACTTATCACCATTGGCAACGAGATAATCGAGGCACCGATGGCATGGAGA TCAAGATTCTTCGAATATCGTGCCTACAGGAAATTGATGAAGGAATATTT CCGTGCGGGCGCCAAATGGACCACAGCTCCAAAACCTTTCATGTCTGACG ATCTTTATGATATGGTAGGAAGAGTCGATTTCTGATTACAAATTTTTACT CGGTTCTTTCACGGCTGCAGGGCTCAGAACCTCTATTGATTCTAGAATTT ATAGGGCTTTTCAGGGCATTGAAGGAGAAAAGTCCTTTGCTAATAATAAT TTCATTTTGGCGGTAATTTTGATATTCTTATTTTTTTACTTCATTTTTGG TCACTACTGCTCGCTCAGGATGGCTCGGGAACTTAATGTAAATTAGGAAA AATGACAATTGAAATCGATCATTTATAAACGCTTAGTAAGGAAATTGCAT GAGTTATTATTTAAGATAATTTTCAGCCTCTGTTTTTTAGGACTATCCGA TGAAGAATGTGGAGGAAAGACATCAACTTGCTTCAGAGAATCGTTTCGTG ACAACCGAATTCGAACCGTGTTTTGATGCAGCGGATTTCATGAGGGCTGG TACCGACATTTTCGCCCAACGTAGTCAGGTTTGTTACGTGTAATCTGTTT CCCTCTCTCTGTTTTTTCATCCTATTTTTCAAAATATTTTTTCTTTTGAA AATTTACCTAACCCTTATTACCTTAAGGGAATAAACTTTCGCGAAAATTT ACAATCGAAGTTAGTCGCGAAAATAAGTCCCGCGAAAATTGAATTATTTT GCGAGGGAAGCTGTCTCGCGAAAATTAGTTGCCGCGAAAATTAATTCCCT TAAGTTACCTACCCTCCCTTTATAAGACACATTGCTCGTACCCTTCCCTG CGATTTTAGAGAAAACTGCGCCCTAGAAGGGCGGGTGGTTCACACCATTG AGTTTGAAGCCCCGAAACGGCTAGAGATCTTCAACCTCTCTCAAGCAAGA AAAAGGGAAGCGTTAAGTTTGCCCTGCACTTGAAAAACACACGGGTTACT AAATACAGGAGTTTCTAGCCCCTTTGATACTTTGAAATCAATAGTTCAAA CAATCTGTTTTCTTTCGATTTCTCTGATAAAAGATATTTAGTAATAAAAA TTCGGAGTTTGAGAGCTACTCAAAAATACACTTGAATCATCATTGAATTT GAAATCCGCCAAATTTAATTTTTTCGGCCATCCGCCAAATTAAATTCCGG CCAAAATTTCAAGATGAATGGACGAAAAATCAATTTTCCTTTTCATTCCC AGGTCACCAACTTGATGGGTATTGAGTGGATGAGGCGCCATTTGGGAGAT AATTACAATGTTCATCTACTGTCATTCAAAGATCCTAATCCTATGCATAT TGATGCTACCTTCAATATTATCGGACCCGGGCTAGTCATTGTGAATCCTG AACGACCTTGTGAACAACGTGATATGTTTGAGAAAGCAGGATGGAGGCTA GTGGAAGCGGCTTATCCAACAATTTCCGATGCGCATCCTCTTTGGATGAG CTCCAAATGGTTGAGTATGAATGTCTTGATGTTGGACGAGAAACGTGTTG TAGTGGATGCCCACGAAATACCAACACAGAAGGTACTTTTTCTCGTTTTT CAAATAAGGGTTATTACAGTGTGTAGAAAATGAAATCACTCAAGTTTTAG GGAAAGGGATCTTTGGTTCGGTTTGAATCACCCCTTCCTATTTAATTTAT GATACAGCAGGGGGTACAAAGTTGGGGTACTGTGTCGAAAATGTGTTCTG ACTTGTTGGATTTTTCACCACCATTAGGTACAAAGTTCAAATACCGCGAT TGCCAGGTTCTGGAAATTTTTGCGTGTATTATTAAGTTTCGCGATTCACT AAAGTCTGCCTCAAAATAATTTGCAGCTGAGACAAAAATGGCTGTAACTT TTGATAGAATTCGAATCAAGTTGCGATTTTGTGCTCATTGAAAAGATATT TGTGAGTGGGATATTATCGAGCCAAAAAAAATTGGAAAAAAAAAGAAAAA TGAAAACGAAAGATGAAGAAGAAAAAAATCAACTTCTTATAGAAATGTGG TATGAGTACCATTTTCACAGGAGTGATTTTTCAATCTTAGATCCTCATCA CTGTGAAAAAATTTTTCAAAAATATTCATTCAATCAAAAGATAACAAACA AAAATTATTGCTGTTGGACTCTATAAAAGAGTAAAAAATGACAAAAAAAA CAGCCTATTGTCCGGGGGGGATACTTAGGCAAATGGAGGGTACGGTATGT GCCGCCCTTAAGGGTACCTTTTTTGGACTTCCAAAGTCCCGCTAAGGGTC GGAAAAATCAGAAAATCAAATTTCAGTCCCACTAAGGGTCGGAAAAATAG GAAAATTTCAACTTACCCCCTGAAAGAGCAAAATATGGTCAAAATTGTAC CCGCTAAGGGTCGTAAAATTCCCGACATTTTCCTTTGTTTTTTCCTTTTT AGTCCCAGTAAGGGTCCAAAGTTCGAAAGCCGGGCGGCACCTCCCCCCCC CGTCAGCTCGAAACCCTAGTACCCCCCGGGGGGCCTATTGTCAATCAACC AATAGCAAACTTTGTGCGATATTTTTTTATATCAATTAACCTTTAGACAT CGCTGTTTTTAAAAACAGCGCGCGCTGCTGCCGCTGTTTTTTTCATGAAA ATGGAGGTTTCGCGGAAAATGTCATAAAATCTGAACCGCTAAAGCTTAAG TAAAAAGTAAACCCATTTTGAAAAGCTAAGGATCTATTTTTTCAGATAAT ACCAAAAAGACGCCTCATCACCCTTTTAAACCTGACTACACAGCCTCAAA TCAAAACAGTAAAAATTCCATGTTTACGATTTTTTCACTTTTTTTCTTTT TTTTGACAAATTGAATGAAAAAAGTGGGTACAAGGTAAAGATTGGTCCCA GAAAAATTATTTTGTTTTAGTTTATGTTATAAGCCACCATTGTGTGAAAT TTCAGGGCTGAAGAAGCTCATTTCATCTCAGAATCTAAGTTCGGTGAAGC ACACTTTTCCACCAAAATCGACACTCTGGCCACAACAGGTAAAAATAAGT GGTCCCGTTGCTCTAAAATTGGGCCCTGCACTTACCCTAAGCCTGTAAAA TTACTACAATAATCATATCAGACTCTCTATCATGTAAATTCAAGCAATAA AACACCAGAATAGTGGAAAAACTGAGGCAAAACAGCCCTGAGTTGTTGGA GCTAGAGATAGGCATGTATGTCAGGAAATACCCCCTAAAAACCCCTTCAA ACCACATAGAAACTGCCAATAAAGGTTCTCTATCTCATATAATGATATTT ATATGCTGAAACCAAGAAAAAACCAGACATAAACATGACTTTTCAGTCCA AAAATCCATCAAACACCCTCTGTCCACCACTAAAACGATGTTTTGTTGAC ATTTGAAAAATACACCGACATTGAGTTCCGATATCTCGAGATGTATAAAA GCAGGACCCGTAAAATTTTTAAAAAATGAACCTTCACCCCTATCCTGTCT GCTAAATTTTACAGAATAGAAAAATTCAAACTGGTCTTTATTTTATTAAA CTTTGAAAGGACCCCAGTATCAAAACGTACGTGGTACGTCTCTCGGCCTG TATATATGACGTACGTGGTACGTCTCTCGGCGGCTAAAGGTTAATACCAT TATGCCTTTAATGAAGATGAACCACCCCTAAATTACTCATTATTACTGAC GATGATTTTGAAAAGGGAAATTTGTTTTATAGAAAAGTTTCGTCAGTTTG ATTTGAACATGATCTGACGTTGCAATGGACTTCTCATAAGAAAGTGACGT CAGAATAAATCTAAGAAAATATTGGGTAAAAAAGAAACGAAAAAATCATG GAAAATGAGTGGAAAATGCATTTTTTTGGCCAGAAACACACAAAGATTGT TCACCAGTTAATAAACACAATAATACTAGCAAGTAGTTGTCGCTAAGAAT GCCCCGCAGAGCTTCCTTTCGAAATATCCCTAAGTAAGCAAAATAACGCA TGTGTAGATTTTAAATTCGTTTTATCGATAAAATTTAAGTCGAGGGAAGA AGGATTAGTTTCAACTTTACTTTTGAGATGACATGCGATAGACGGTCGCT CACATCTCTAAAAGAGAAGTTATCGCTCACATGTAATCAGAGTTTGGAAA CTATTCTAGTCGCGAGTTAGGGAGTTGCTAGTTTCGAGTTGGGGAGTTGC TAGTTTCGAGTTGGGGAGTTGCTAGTTTCGAGTTGGGGAGTTAAAAAATT ACCGGCTACCGAAAAAGAATAACATACATCAAAAGTACGATTTTGAAAGT AAATGTGATATGAGAGTAATATATAACACATATAATACGTATAATACATA TACCACCTGTAATAAGCTTATTTGCCTTAAACACGTGCGCTGAGAGCATG GAAAGCTATTTTCTACTGTCAATTCATATCCATTTATATTTCCTGTATCA CATTGAGTATAAATATAATTCTTGATTAAAGTGACTTTAGAACCATTGTA TTTTATAATGTGATCAAAATTTTTATTAAAAAGTGTCAATTCCAATGATA AAATGACAAAAGAAAGTTATATCCTTTTATACAATAAGCATCACTTGCAG TATGATCAATATTTTTTTGGGAATTTGTTTGACAATCATTGTATTTAAAG ATTTTGTCAATATTTTTACAAGGACGTGTCATGTTATCAGCATTGTGACA ATGACATAACAGTACTAAGTATTTTGGCTTTGCTAGCCAGCACATTACCA TTTTCATGATCTTAAAGTCAATAATATATTTGGTACTGGCTAATTTGAAA TTTGTACTTTTGGGCTACATTAGTTTAAATTAGAAAATTTTCGGTCGCCG TAAAGTTTTACGAACTCCCCAACTCGAAACTAGCAACTCCCCAACTCACC AACTAGAACATTACCTAGACTCATGTTATCACAGTGGAAACGCCAAAATA TCTTTTGATTGATTTGATTCTTATAAAGTAGACACTTATAATAAAAATAA ATATGCTCATCTTTTTCGCCATCCTTTGTTTACTTTCTAATAACTAATTA CCGAAAGATATATTGCCTTCAATCAAGAGTTATTGATTTGATTCTTATAA AAAAATGCTGATAATAAAAATAAATATGCTCATCATTTTCACCATCCATT GTTTACTTTGTAAGAACTAATTACCGAAAGGCATATTGCCTTCAATCAAG AGTTATTGATTTGATTCTTATAAAGTAGATGCTTATAATAAAAATAAACA TGCTCATCTTTTTCGCCATCCTTTGTTTACTTTGTAAGAACTAATTACCG AAAGGCATATTGCCTACAATCAAGAGTTATTGATTTGATTCTTATAAAGT TGATGCTTATAATAAAAATAAATATGCTCATCTTTTTCGCCATAATTTGT TTACTTTGTAAGAACTAATTACCGAAAGGCATATTGCGTTCAATCAAGAC ATATTGATTTGATTCTTATAAAGTAGATGCTTATAATAAAAATAAATATG CTCAATTTTTTCGCCATCCTTTGTTTACTTTCTAAGAACTAATTACCGAA AGGTATATGGCCTTCAATCAAGAGTTATTGATTTGAAGTAGCAACAAAAG AGATATAATATTAGGTGCGCGCGAACATTTTTTAACCGCGGGGGCCCGCT CAGAATCGGAAGAAACAACATGAACATGAATATTTTTCTGGCGAGCAAGT CCGCTACGTGAAGCAACAAAAGCCCCTGCGGGGCAATAACTGGTTTGGAG GTCAATACGGTAAAATCTCGCAAGCTCTGTCTGTACTTCGGCTGGGGTCA ATATTTTACCGTATTGACCTCCAAACCAGTTATTATTGTATTAGAAATGA CCGTTTAAATCCTGATATTTTGGTGGGAAAGTAAAGTACAGTACCATCCC AAAAATACATATTGTAAATTTCTTATAAAGTAAAATTATCAAGCCCGGTA CCAAAAATATCCTAATTTTTACTTCCCTTGAAATTTTTTAACAGTTTCTA AGCCATTGGATGCCGAGGTTTGTTAATGGACCGTTTCCTCGCCGATCTAA AATCTTTTGGTCATGAGTGCCTTTTTAGTCTAAATTTGCACGAGTTGAAA GTCAGCTTTGAAGTGCATTTACAGCTTTACTGGTTTTTGACTTGCCACTC TTGACCTCCAACCCGGCAGTTCCCTAAAACTTAGTGTACAGACCACTGGC TCACGATACATTTGACGCTCTCTAATCTGATTTTCACGGTGACTTTCCAC AATGATATTAACGAATAATGGAGCTTCTCTATATTAAGTTAGAAAGCATA GCTAGCAAGAATCTCTAACCTTTCAATTGTTCTTTTTTCAATTTAGATGT TTGAATCGTTGGGTATCAAATGTGTGAAAGTTGACATTCGTTACGCGAAT TCTCTCGGTGGTGGATTCCATTGCTGGACGTGTGACGTCAGAAGACGTGG TGAACTAAAAAGCTATTTCTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000295_pilon:216978..227999-

>XLOC_002280 ID=XLOC_002280|Name=XLOC_002280|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2418bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000295_pilon:216978..227999- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTAAACCGAGTTTTAAGAATGTTAAACCGAGTTTTAAGAAATCAAGC
ACTCAGAGGAAGCAATTTTTTACGTCGAATCTCATCAACATCCTCACCGA
AGCGTGCCTTACCTTCCATTGATCCAGGGATTGAAGAAAGTCCTTCCTTA
CCTGTCGTTAATGCTCACAATGAATGGGATCCGCTTGAAGAGGTCATAGT
CGGCCGCGCGGAGAATTCAGTGGTGCCAAATTTCACGACGGAAGTCAAAG
CCAACACGTACGAATACCATTGGGATTTTTATAAAGCAAACAACGGAGAA
TATTTCCCAGCTGAGCATCTAAAGAAAGCAGTTGCCGAGATCGAGGAATT
TTGTCGCATTTTAGAACACGAGGGTGTGGTCGTTCAAAGGCCTGACATTA
TTGATCACAAGAAGAATCAAGCACTCAGAGGAAGCAATTTTTTACGTCGA
ATCTCATCAACATCCTCACCGAAGCGTGCCTTACCTTCCATTGATCCAGG
GATTGAAGAAAGTCCTTCCTTACCTGTCGTTAATGCTCACAATGAATGGG
ATCCGCTTGAAGAGGTCATAGTCGGCCGCGCGGAGAATTCAGTGGTGCCA
AATTTCACGACGGAAGTCAAAGCCAACACGTACGAATACCATTGGGATTT
TTATAAAGCAAACAACGGAGAATATTTCCCAGCTGAGCATCTAAAGAAAG
CAGTTGCCGAGATCGAGGAATTTTGTCGCATTTTAGAACACGAGGGTGTG
GTCGTTCAAAGGCCTGACATTATTGATCACAAGAAGAAATATGCTACTCC
TGACTTTGAGTCAACTGGTCTGTATGCAGCTATGCCACGTGATATACTTA
TCACCATTGGCAACGAGATAATCGAGGCACCGATGGCATGGAGATCAAGA
TTCTTCGAATATCGTGCCTACAGGAAATTGATGAAGGAATATTTCCGTGC
GGGCGCCAAATGGACCACAGCTCCAAAACCTTTCATGTCTGACGATCTTT
ATGATATGAAATATGCTACTCCTGACTTTGAGTCAACTGGTCTGTATGCA
GCTATGCCACGTGATATACTTATCACCATTGGCAACGAGATAATCGAGGC
ACCGATGGCATGGAGATCAAGATTCTTCGAATATCGTGCCTACAGGAAAT
TGATGAAGGAATATTTCCGTGCGGGCGCCAAATGGACCACAGCTCCAAAA
CCTTTCATGTCTGACGATCTTTATGATATGGACTATCCGATGAAGAATGT
GGAGGAAAGACATCAACTTGCTTCAGAGAATCGTTTCGTGACAACCGAAT
TCGAACCGTGTTTTGATGCAGCGGATTTCATGAGGGCTGGTACCGACATT
TTCGCCCAACGTAGTCAGGACTATCCGATGAAGAATGTGGAGGAAAGACA
TCAACTTGCTTCAGAGAATCGTTTCGTGACAACCGAATTCGAACCGTGTT
TTGATGCAGCGGATTTCATGAGGGCTGGTACCGACATTTTCGCCCAACGT
AGTCAGGTCACCAACTTGATGGGTATTGAGTGGATGAGGCGCCATTTGGG
AGATAATTACAATGTTCATCTACTGTCATTCAAAGATCCTAATCCTATGC
ATATTGATGCTACCTTCAATATTATCGGACCCGGGCTAGTCATTGTGAAT
CCTGAACGACCTTGTGAACAACGTGATATGTTTGAGAAAGCAGGATGGAG
GCTAGTGGAAGCGGCTTATCCAACAATTTCCGATGCGCATCCTCTTTGGA
TGAGCTCCAAATGGTTGAGTATGAATGTCTTGATGTTGGACGAGAAACGT
GTTGTAGTGGATGCCCACGAAATACCAACACAGAAGGTCACCAACTTGAT
GGGTATTGAGTGGATGAGGCGCCATTTGGGAGATAATTACAATGTTCATC
TACTGTCATTCAAAGATCCTAATCCTATGCATATTGATGCTACCTTCAAT
ATTATCGGACCCGGGCTAGTCATTGTGAATCCTGAACGACCTTGTGAACA
ACGTGATATGTTTGAGAAAGCAGGATGGAGGCTAGTGGAAGCGGCTTATC
CAACAATTTCCGATGCGCATCCTCTTTGGATGAGCTCCAAATGGTTGAGT
ATGAATGTCTTGATGTTGGACGAGAAACGTGTTGTAGTGGATGCCCACGA
AATACCAACACAGAAGATGTTTGAATCGTTGGGTATCAAATGTGTGAAAG
TTGACATTCGTTACGCGAATTCTCTCGGTGGTGGATTCCATTGCTGGACG
TGTGACGTCAGAAGACGTGGTGAACTAAAAAGCTATTTCTAAATGTTTGA
ATCGTTGGGTATCAAATGTGTGAAAGTTGACATTCGTTACGCGAATTCTC
TCGGTGGTGGATTCCATTGCTGGACGTGTGACGTCAGAAGACGTGGTGAA
CTAAAAAGCTATTTCTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_002280XLOC_002280-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000295_pilongenomesc0000295_pilon:216978..227999 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1084-1209:127
Aaloc754-1083:5221
Aaloc616-753:6033
Aaloc394-615:6581
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Aaloc1-21:11023